Made available in DSpace on 2016-12-23T13:49:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Geise de Aguiar Quirino.pdf: 839323 bytes, checksum: 5ff1a2735aa2271c126e6d624a6760bd (MD5) Previous issue date: 2012-02-17 / Osteogenesis Imperfecta (OI) is a genetic desease characterized by patient s bone fragility and deformity, in which severity ranges from a barely detectable connective tissue disorder to lethality in the perinatal period. The diversity of clinical variability in patients is caused by the different location or type of mutations in one of the ten genes related with the disease. This wide clinical variability difficults the perfect clinical diagnoses, due to that the use of molecular biology techniques becomes necessary to obtain a correct diagnoses and for genotype: phenotype correlation. One of the relevant genes associated with recessive forms of OI is the LEPRE-1 gene, responsible for encoding the prolyl 3 hidroxylase 1 protein. This protein and two others are components of the complex responsible for pro-collagen alfa 1 chains 3 prolyl hydroxylation. The target of this research was to analyze the LEPRE-1 gene in eight non consanguineous patients clinically diagnosed as severe Osteogenesis Imperfecta suggestive of autossomic recessive heritage by DNA sequencing of exons 1, 3, 5, 6 and 14 of the gene. In addition, the data obtained was used to analyze the efficiency of the SSCP technique by comparing the results between screening for mutations methodologies and gene sequencing methodologies. On exon 6, for instance, a mutation in one patient was found: a heterozygose base change (c.1087A>G / p.Lys363Glu), consequently, lysine was produced instead of glutamic acid. On the other exons, there was no mutation found on the patients chosen. All the results obtained in this research were compatible with datas generated by SSCP and suggest high efficient of SSCP technique for LEPRE-1 gene to recessive cases of Osteogenesis Imperfecta / A Osteogênese Imperfeita é uma doença genética caracterizada por fragilidade e deformidade esquelética, onde o quadro clínico pode variar desde simples deformidades ósseas à forma letal perinatal. A alta variabilidade clínica apresentada pelos indivíduos afetados ocorre devido ao tipo e à localização da mutação em um dos dez genes relacionados a doença. A grande heterogeneidade genética existente exige a utilização de técnicas da biologia molecular para o diagnóstico e compreensão das correlações genótipo: fenótipo da doença. Um dos genes relevantes associados com as formas recessivas da Osteogênese Imperfeita é o gene LEPRE-1 codificador da proteína prolil 3 hidroxilase 1. Esta é uma das três proteínas componentes do complexo responsável pela prolil 3 - hidroxilação das cadeias de pró-colágeno alfa 1 formadoras da molécula do colágeno tipo I, expresso, predominantemente em ossos, tendões e pele. Este projeto de pesquisa teve como objetivo analizar o gene LEPRE-1 em oito pacientes não consanguineos com Osteogênese Imperfeita tipo grave sugestivos de herança autossômica recessiva por meio do sequenciamento direto dos exons 1, 3, 5, 6 e 14 do gene. Além disso, o resultado gerado foi utilizado para avaliar a eficiência da técnica de triagem de mutações por Polimorfismo Conformacional de Fita Simples (SSCP) por meio da comparação de resultados entre as metodologias de triagem de mutações e sequenciamento direto do gene. Foi identificada, no exon 6, uma mutação de troca de nucleotídeos em heterozigose, c.1087A>G / p.Lys363Glu, levando a produção do aminoácido ácido glutâmico ao invés da lisina em um dos pacientes avaliados. Não foram encontradas mutações em nenhum dos pacientes para os demais exons analisados. Estes resultados corroboram dados gerados por meio de SSCP, e sugerem grande eficiência da técnica de triagem para o gene LEPRE-1 para formas recessivas de Osteogênese Imperfeita

The advances in molecular biology have increased the production of enormous amount of genetic information in a small period of time. This capacity of data production motivated the researchers to increase the rhythm of their researches. This necessity demands the use of efficient softwares in order to manage these data. Besides this, it also demands the development of good softwares in order to assist the researchers in the task of analyzing the data and giving them a biological meaning in a brief space of time. This work proposes a software model that will support the study of Forensic DNA, whose main repository is the autossomic DNA. This software intends to support the researchers in the identification of condemned persons or persons that are suspected of a crime. It also intends to assist the researchers in the study of paternity and the search for disappeared persons. The results of this work will be applied in the Forensic DNA Laboratory of UFAL. The software modeled here has four modules study of paternity , criminal , disappeared people and the bank of populational frequencies . The modules were modeled independently from each other, considering the specifications related to the analysis of genetic links. The software was developed using the JAVA programming language together with PostgreSQL database. Both are free software and have an excellent relationship between cost and benefit usage / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / Os avanços da biologia molecular vêm favorecendo a geração de uma enorme quantidade de informações genéticas em um tempo cada vez menor. Essa capacidade de geração de dados permite que os pesquisadores acelerem o ritmo de suas pesquisas, exigindo a utilização de ferramentas eficientes para o gerenciamento desses dados. Outra necessidade está relacionada com o desenvolvimento de ferramentas computacionais com capacidade de auxiliar na tarefa de análisar e dar um significado biológico a estes dados em um breve espaço de tempo para os pesquisadores. Este trabalho propõe a modelagem de um ambiente de apoio à análise e ao estudo do DNA Forense, cujo principal repositório seja o DNA autossômico. Este ambiente visa dar suporte a identificação de pessoas condenadas ou suspeitas de ter realizado algum tipo de crime contra a sociedade, bem como auxiliar no estudo de paternidade e na busca de pessoas desaparecidas. Este ambiente irá atender ao Laboratório de DNA Forense, da UFAL, que vêm realizando estas atividades. O modelo do ambiente aqui proposto, possui quatro módulos, estudo de paternidade , criminal , desaparecido e o banco de freqüência das populações . Os módulos foram modelados de forma que funcionem independentemente, atendendo as especificações inerentes à análise sobre vínculo genético. O sistema foi desenvolvido na linguagem de programação JAVA com banco de dados PostgreSQL. Ambas as ferramentas possuem característica de software aberto e uma relação custo/benefício excelentes