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Antibióticoterapia para la Prostatitis Crónica con falla en el tratamiento, mediante Inyección Intraprostática Transperineal, utilizando cloranfenicol más dexametasona vs. Tratamiento por vía oral-Hospital Nacional Hipólito UnanueDelucchi Lagos, Claudia Carmen January 2005 (has links)
La prostatitis crónica bacteriana y abacteriana es una patología difícil de curar, por la baja penetración de los antibióticos al estroma glandular prostático, por la barrera hematoprostática que está relacionada al gradiente de solubilidad del pH plasmático, liposolubilidad, ionización y enlaces proteínicos. De eso resulta que no existe el antibiótico ideal. (4)
El estudio donde se realizó el presente trabajo fue en el Servicio de Urología del Hospital Nacional Hipólito Unanue, donde la prostatitis crónica es una de las patologías más frecuentes en la población de adultos jóvenes del distrito del Agustino.
Como se sabe es una patología que altera la calidad de vida del paciente y que frecuentemente no evidencia una mejoría real a pesar del largo tratamiento instaurado ocasionando además gasto económico.
En el presente trabajo se consideró analizar los pacientes tratados con antibióticoterapia por 3 a 6 meses, o con otros fármacos, sin evidenciar mejoría.
Por otro lado, la vía transuretral para el tratamiento de prostatitis crónica bacteriana y abacteriana.(15) se utiliza para la inyección intraprostatica de antibióticos ,habiendo utilizado en estudio anteriores trimetropim-sulfametoxazol , pero teniendo el inconveniente de los altos costos y no accesibilidad en nuestro medio de la aguja que se incorpora al Cistoscopio para poder punzar la próstata a través de esta vía (34).
Teniendo en cuenta todo lo mencionado anteriormente; el presente estudio tiene por finalidad evaluar la eficacia del tratamiento de la prostatitis crónica con inyección intraprostática transperineal mediante una sola aplicación de Cloranfenicol más Dexametasona,constituyendo el objetivo del trabajo . Ya que esta patología amerita un tratamiento para la cura en una sola sesión, evita la pérdida de recursos en los largos tratamientos que ésta demanda, disminuyendo costos económicos y haciendo más asequible a gran número de pacientes.
Con la realización del presente estudio, y con los resultados obtenidos, se dará una solución viable a esta patología; ya que al utilizar la mezcla de antibiótico y corticoides según las evidencias se observa que, como potentes antiinflamatorios, mejoran la difusión del antibiótico en la próstata, ya que disminuye la inflamación. También se ha observado que la inflamación produce estrés oxidativo, con aumento de prostaglandinas E2 que inhiben la actividad de las endorfinas beta, que se cree interviene de manera importante para explicar el clásico dolor abdominal bajo, perineal o al eyacular de este tipo de pacientes.(2)
Al realizarse por vía transperineal, logramos que el antibiótico y el esteroide ingresen en el tejido prostático; lográndose asì la eficacia de este manejo por el fácil acceso, por la fácil ejecución, bajos costos, lo que lo haría reproducible y asequible en cualquier hospital de nuestro país, creando así una cura accesible para esta patología, en beneficio de nuestros pacientes a quienes nos debemos.
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Aspectos clínicos, microbiológicos e da regulação da imunidade inata na vaginose bacteriana /Marconi, Camila. January 2012 (has links)
Orientador: Márcia Guimarães da Silva / Banca: Ana Katherine da Silveira Gonçalves / Banca: Rodrigo Paupério Soares de Camargo / Banca: Andrea da Rocha Tristão / Banca: Geraldo Duarte / Resumo: A vaginose bacteriana (VB) é a alteração de microbiota vaginal mais frequente em mulheres em idade reprodutiva.Inúmeras complicações ginecológicas e obstétricas são associadas à VB, como doença inflamatória pélvica, aumento do risco de aquisição de Doenças Sexualmente Transmissíveis (DSTs), corioamnionite clínica e histológica e baixo peso ao nascimento. A VB se caracteriza pela substituição dos lactobacilos da microbiota vaginal por outras espécies bacterianas, na sua maioria anaeróbias. Estudos recentes demonstraram que várias espécies até então raramente ou nunca isoladas em laboratório são associadas à VB como Atopobium vaginae, Leptotrichia sp. e Megasphaera sp. Essas espécies têm como característica comum a produção de ácido lático. Dessa forma, tem sido observado que mulheres assintomáticas podem apresentar ausência de lactobacilos na microbiota vaginal e predomínio de tais espécies. Portanto, alguns autores sugerem que elas possam contribuir para o equilíbrio do meio vaginal. Tendo em vista que os casos de VB apresentam grande heterogeneidade quanto à composição microbiológica, considera-se que a resposta imune também possa ser variável. A amplificação da resposta imune local na VB é um dos mecanismos que levam a maior suscetibilidade da mucosa vaginal à aquisição de DSTs, dentre as quais a infecção clamidiana que, é bastante frequente em nossa população. Embora estudos tenham demonstrado associação da infecção por Chlamydia trachomatis (CT) com a VB, poucos trabalhos avaliaram o perfil da resposta imune inata local nesses casos. O objetivo deste estudo foi avaliar parâmetros da imunidade inata e atividade de sialidases nos casos de VB em relação a maior ou menor participação das espécies de A. vaginae, Leptotrichia sp. e Megasphaera sp., além de comparar os níveis de citocinas pro-inflamatórias nos casos de VB de acordo com o status ... / Abstract: Bacterial vaginosis (BV) is the most frequent type of abnormal vaginal flora in women in childbearing age. Several gynecological and obstetrical complications are associated with BV, such as pelvic inflammatory disease, increased risk for acquisition of sexually transmitted infections (STIs), clinical and histological chorioamnionitis and low birth weight. Bacterial vaginosis is characterized by the replacement of the vaginal lactobacilli by other bacterial species, mostly anaerobes. Recent studies show that many species, rarely or never isolated by culture, are highly associated with BV, such as Atopobium vaginae, Leptotrichia sp. and Megasphaera sp. In common, these bacteria have the characteristic of producing lactic acid. Study of the vaginal flora of asymptomatic women showed that these species may replace the lactobacilli, dominating the vaginal environment. Thus, some authors suggest that A. vaginae, Leptotrichia sp. and Megasphaera sp. may contribute to a balanced vaginal flora. Considering that BV cases are microbiologically heterogeneous, the immune response is also likely to differ among the women. An imbalanced local immune response is one of the mechanisms leading to increased acquisition of STIs, such as chlamydial infection, which is very frequent in our population. Although studies demonstrated a significant association of BV with Chlamydia trachomatis (CT), few studies evaluated the associated innate immune response. The objective of this study was to evaluate parameters of the innate immunity and sialidase activity in BV, in relation to the larger or samaller participation of A. vaginae, Leptotrichia sp. and Megasphaera sp., and to compare the levels of pro-inflammatory cytokines in BV cases according to the status of CT infection. We evaluated women that presented BV in the period of the study and the control group was composed by women with normal vaginal flora pattern. Vaginal ... / Doutor
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Análisis de la Biodiversidad de Bacterias en Procesos de Biolixiviación Mediante TRFLPAlcaíno Reyes, Eloísa del Carmen January 2008 (has links)
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Caracterización in silico de una cepa de Streptomyces sp. del Desierto de AtacamaBoisier Salinas, Dagoberto Andrés January 2019 (has links)
Memoria para optar al título de Ingeniero Civil en Biotecnología / La creciente tendencia por parte de bacterias patógenas de volverse resistentes a los antibióticos ha llevado al campo de la ciencia a una incansable búsqueda por nuevas moléculas capaces de acabar con estos microorganismos. Una tendencia ha sido buscar compuestos naturales desarrollados por bacterias de ambientes extremos. En esa búsqueda, científicos hallaron una cepa de Streptomyces en el Salar de Huasco, región de Tarapacá, Chile, con propiedades antibióticas y citotóxicas.
Con el fin de poder comprender de mejor manera el metabolismo de esta cepa, se realizó un modelo metabólico in silico de tal cepa, denominada HST28, en base al genoma secuenciado de ésta. La primera fase fue determinar la filogenia de la cepa mediante comparación de rRNA 16S, lo cual reveló una cercanía del 97% con Streptomyces avermitilis. Posteriormente, usando la información disponible en la base de datos KEGG, se elaboró el modelo metabólico en base a la comparación entre HST28 y S. avermitilis mediante BLAST usando la extensión de Python COBRApy en Jupyter para armar metabolitos y reacciones.
Se generó una serie de funciones destinadas a facilitar el trabajo de elaboración del modelo, junto con un protocolo para encontrar errores en el modelo terminado.
El modelo final cuenta con 804 reacciones, 627 metabolitos y 594 genes, lo que constituye un modelo de tamaño promedio para este tipo de estructuras. El análisis al modelo determinó que el HST28 debería crecer mejor con sacarosa como fuente de carbono, y amonio como fuente de nitrógeno. Las tasas de crecimiento en medios mínimos fueron altas en comparación a otros Streptomyces.
Finalmente, queda destacar que el procedimiento para generar y curar el modelo tiene la potencialidad de ser útil en otras investigaciones que impliquen el desarrollo de un modelo metabólico.
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Modelación molecular de una serie de compuestos fenilfuranoxibenzamidas; síntesis y evaluación de la actividad antibacteriana de una serie de compuestos intermediarios de núcleo químico 5-fenilfuranoParra Flores, Pablo Ignacio January 2014 (has links)
Memoria para optar al título de Químico Farmacéutico / La Resistencia Bacteriana es un problema de salud pública mundial que ha ido mermando la eficacia de muchos de los antiobióticos actualmente utilizados, reduciendo enormemente las posibilidades de tratar las enfermedades infecciosas severas de manera efectiva, lo que sumado a la tendiente disminución de la investigación y desarrollo (I+D) de agentes antibacterianos con nuevos mecanismos de acción por parte de la Industria Farmacéutica, conllevaría a una escasez de alternativas terapéuticas en un futuro cercano. Por esto surge la urgente necesidad de promover la investigación hacia nuevos blancos moleculares entre los que se destaca la proteína FtsZ (del inglés Filamentous Temperature-Sensitive Z) cuyo papel es fundamental en la citocinesis celular bacteriana, pues polimeriza en protofilamentos para ensamblar el anillo Z en medio de la bacteria, permitiendo así el reclutamiento de proteínas necesarias para formar el complejo divisor que lleva a cabo el proceso de la división celular, convirtiéndose en un blanco atractivo para el diseño agentes antimicrobianos. Al respecto se han desarrollado diversos Inhibidores de FtsZ entre los que se destaca PC190723 (1) que presenta una potente y selectiva actividad antiestafilocócica con eficacia en modelos in vivo de infección y con un perfil farmacocinético muy parecido al de un fármaco. Con el objetivo de generar nuevos ligandos capaces de inhibir esta proteína se diseñaron los compuestos fenilfuranoxibenzamidas (2), que son análogos estructurales de 1 y que incluyen el núcleo 5-fenilfurano que tiene potencial actividad biológica, a los cuales se les llevó a cabo un estudio de docking molecular en el sitio de unión de PC190723 a la FtsZ de S. aureus, cuyas soluciones señalan que el modo de unión y las interacciones generadas en el bolsillo son favorables para cada uno de estos compuestos ya que son similares a las de 1 obtenidas por cristalografía de rayos-X, y con puntajes docking semejantes en magnitud a las del patrón de 1 relacionados con el volumen o lipofilia por sobre la polaridad del sustituyente aceptor de electrones. Posteriormente se sintetizaron las series 3 y 4, que contienen el núcleo 5-fenilfurano. Primeramente se empleó la reacción de arilación de Meerwein sobre el furfural (obtención de la serie 3), seguido por la reducción del aldehído utilizando borohidruro de sodio (obtención de la serie 4). Se evaluó la actividad antibacteriana para todos los derivados sobre cocáceas Gram-positivas y se encontró actividad sólo para el compuesto 3c contra S. aureus resistente a meticilina, un auspicioso resultado que establece un primer paso para investigar el desarrollo de derivados con potecial actividad antiestafilocócica incluyendo cepas resistentes. Aunque la serie 4 no presentó actividad biológica, distintos antecedentes indicarían que contribuirían a la actividad antibacteriana de la serie 2 y a la unión en el bolsillo de la FtsZ / Bacterial Resistance is a worldwide public health problem that has been weakening the effectiveness of many of the antibiotics currently used, greatly reducing the chances of treating severe infectious diseases effectively, which joined the aimed decrease of the research and development (R&D) of antibacterial agents with new mechanisms of action on the part of the Pharmaceutical Industry, would lead to a shortage of therapeutic alternatives in the near future. This prompts the urgent need to promote research toward new molecular targets the most significant of which is the FtsZ (Filamentous Temperature-Sensitive Z) protein whose role is crucial in the bacterial cell cytokinesis, because polymerizes in protofilaments to join the Z ring in the middle of the bacterium, thus allowing the recruitment of proteins needed to form the complex divisome that carried out the process of cell division, becoming an attractive target for the design antimicrobial agents. In this regard have developed various inhibitors of FtsZ prominent among them being PC190723 (1) which provides a potent and selective antistaphylococcal activity with effectiveness in vivo models of infection and with a pharmacokinetic profile very similar to that of a drug. With the aim of generating new ligands capable of inhibiting this protein were designed phenylfuranoxybenzamides compounds (2), which are structural analogues of 1 and to include the core 5-phenylfuran which has the potential biological activity, all of which have been carried out a study of molecular docking at the site of union of PC190723 to the FtsZ of S. aureus, whose solutions indicate that the mode of union and interactions generated in your pocket are favorable for each one of these compounds because they are similar to those of 1 obtained by X-ray crystallography, and docking scores similar in magnitude to 1 pattern related to the volume or lipophilicity by on the polarity of the substituent electron acceptor. Subsequently, the series 3 and 4, containing the core 5-phenylfuran were synthesized. First the Meerwein arylation reaction of furfural (obtaining serie 3), followed by reduction of the aldehyde using sodium borohydride (obtaining serie 4) was used. The antibacterial activity was assessed for all derivatives on coccus Gram-positive and activity was found only for the compound 3c against S. aureus resistant to methicillin, an auspicious result that provides a first step to investigate the development of derivatives with skimming antistaphylococcal activity including strains resistant. Although the 4 series did not present biological activity, different background would indicate that would contribute to the antibacterial activity of the series 2 and to the union in the pocket of the FtsZ
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Avaliação do efeito dos leites materno, de vaca e de cabra sobre a fermentação e síntese de polissacarídeos extracelulares na placa dentária humana. Estudo "in vitro" / Evaluation of the effects of human, cow and goat milk on the fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides in human dental plaque in vitro studyPrestes, Marcelo Pires 07 April 2003 (has links)
Na espécie humana, são usados vários leites, além daquele que lhe é próprio, tais como o leite de vaca e o leite de cabra dentre outros. Em meio a seus diversos componentes encontramos a lactose que é um dissacarídeo que se desdobra em glicose e galactose. A cárie dentária como uma doença multifatorial, necessita de um substrato cariogênico para o seu desenvolvimento além das bactérias presentes na placa dentária, que utilizam carboidratos da dieta para seu metabolismo. Tendo em vista a característica de alto consumo e os relatos clínicos nos quais é sugerida a participação do leite no desenvolvimento da cárie, este trabalho avaliou o efeito in vitro" de três tipos de leite in natura"; materno, de vaca e de cabra, sobre o metabolismo da placa dentária humana, com relação à capacidade de fermentação e síntese de polissacarídeos extracelulares. Por meio da coleta de placa dentária de 50 crianças e adolescentes entre 10 e 15 anos de idade, procedente de uma Instituição da cidade de Bauru, um pool" de placa foi tratado em laboratório, e submetido a estudos bioquímicos específicos para fermentação e síntese de polissacarídeos extracelulares. Os resultados obtidos foram submetidos ao teste de Análise de Variância (ANOVA) a um e dois critérios com nível de significância de 5% e utilizou-se o teste de Tukey-Kramer para comparação entre os diferentes tipos de substratos. Concluiu-se com este estudo que, quando utilizados os leites testados, ocorre, in vitro", a fermentação e a síntese de polissacarídeos extracelulares. O leite de cabra apresentou a menor fermentação seguido pelo leite bovino e depois o leite materno. Para a síntese de polissacarídeos o maior resultado foi obtido pelo leite de cabra, seguido pelo leite de vaca e pelo leite materno. / Several types of milk are consumed by human beings besides human milk, such as cow milk, goat milk, and others. Among several other components, the milk contains lactose, which is a disaccharide composed of glucose and galactose. Dental caries, as a multifactorial disease, requires a cariogenic substrate on which to develop, in addition to the bacteria present in dental plaque, which employ the dietary carbohydrates in their metabolism. Considering the high intake of milk by mankind and the clinical reports that suggest its participation in caries development, the present in vitro study evaluated the influence of three types of whole milk, namely human, cow and goat milk, on human dental plaque metabolism as to the capacity of fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. A pool" of dental plaque obtained from 50 children aged 10 to 15 years old attending an institution in the city of Bauru was laboratory treated and submitted to biochemical studies specifically for the fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. The obtained results were submitted to one and two-way variance analysis (ANOVA) at a significance level of 5% and the Tukey-Kramer test was employed to compare the different types of substrates. It was conc luded that all three types of milk demonstrated in vitro fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. Goat milk presented the smallest level of fermentation, followed by cow milk and human milk. Concerning the synthesis of polysaccharides, the highest outcome was achieved for goat milk, followed by cow milk and human milk.
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Seguimento de usuarias de dispositivo intra-uterino com e sem vaginose bacterianaDoria, Raquel Ferreira Ferraz do Lago 10 August 2003 (has links)
Orientadores: Jose Antonio Simões, Luis Guillermo Bahamondes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-11-07T17:28:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Doria_RaquelFerreiraFerrazdoLago_M.pdf: 1889089 bytes, checksum: 1dd9fd40e55ccf4cafa28a2b88903b47 (MD5)
Previous issue date: 2003 / Resumo: O objetivo deste estudo foi verificar a prevalência da vaginose bacteriana e outras infecções cervicovaginais em novas usuárias de dispositivo intra-uterino. Foram incluídas no estudo 223 mulheres que solicitaram e inseriram um DIU T com cobre como método contraceptivo. Após a inserção foram agendadas duas visitas para estas mulheres: ao primeiro e sexto mês pós-inserção, quando foram entrevistadas e submetidas a exame pélvico, coletadas amostras da vagina e endocérvix para avaliar a presença ou não de infecção. O critério de Nugent foi utilizado para o diagnóstico de vaginose bacteriana. Para os demais diagnósticos foram utilizados: exame a fresco para Trichomonas vaginalis e Candida albicans; imunofluorescência direta para Chlamydia trachomatis e cultura específica para Neisseria gonorrhoeae. As mulheres também foram avaliadas quanto à presença de complicações relacionadas à inserção e ao uso do dispositivo intra-uterino (sangramento exacerbado, dismenorréia, expulsão, doença inflamatória pélvica). A prevalência de infecções cervicovaginais foi de 29,1%, sendo a vaginose bacteriana a mais freqüente (19,7%). A dismenorréia foi mais freqüente em mulheres com vaginose bacteriana do que nas mulheres sem (p=0,03). Em conclusão, a vaginose bacteriana, após um mês de inserção do dispositivo intra-uterino, não foi significativamente associada às suas complicações, com exceção da dismenorréia / Abstract: The aim of this study was to assess the prevalence of bacterial vaginosis (BV) and other cervicovaginal infections among new users of intrauterine device (IUD). A total of 223 women who had inserted a TCu-380A IUD as a contraceptive method were included in the study. After the insertion all participants were scheduled for 2 additional visits: after the first and sixth month post insertion, when they were interviewed and had a pelvic examination performed and collected specimens from the vagina and the endocervix for laboratory testing. The Nugent's criteria was used for the BV diagnosis. The others diagnosis were made as follow¿s: a wet mount in order to identify Trichomonas vaginalis and Candida albicans; fluorescent¿labeled monoclonal antibody method for Chlamydia trachomatis and culture for Neisseria gonorrhoeae. They were also evaluated with regard to complications possibly related to IUD insertion and use (abnormal bleeding, dysmenorrhea, expulsion, and pelvic inflammatory disease). The prevalence of cervicovaginal infections was 29.1%, with BV being the most frequent (19.7%). The dysmenorrhea was more frequent among women with BV than among those without BV (p=0.03). In conclusion, BV after one month of IUD insertion was not associated to IUD complications, with the exception of dysmenorrhea / Mestrado / Tocoginecologia / Mestre em Tocoginecologia
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Recuperação de níquel e outros metais a partir de diferentes fontes (rejeitos minerais de processo industrial e pentlandita '(Ni,Fe)IND. 9' 'S IND. 8' ) mediante lixiviação ácida e bacterianaBlandón, Nury Alexandra Muñoz [UNESP] 15 July 2010 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2010-07-15Bitstream added on 2014-06-13T20:41:04Z : No. of bitstreams: 1
blandon_nam_dr_araiq.pdf: 1604539 bytes, checksum: 04a560f1fafec8780368e656b90e1e36 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Uma possibilidade para a recuperação de metais a partir de minerais com baixos teores ou de rejeitos industriais é a utilização da lixiviação com micro-organismos. A biolixiviação é o processo de oxidação bacteriana de sulfetos metálicos contendo metais de valor (por exemplo, níquel, cobre ou zinco), os quais são liberados para a solução, seguida da recuperação por técnicas metalúrgicas convencionais. Estudos de biolixiviação de concentrados de sulfetos minerais em tanques agitados e, sobretudo em pilhas, têm sido desenvolvidos em escala piloto e comercial. Entretanto, poucos trabalhos têm sido realizados sobre o aproveitamento de rejeitos minerais de processos convencionais, tais como flotação ou fusão em forno “flash”, por rotas biotecnológicas. O objetivo deste trabalho foi recuperar níquel e cobre de rejeitos industriais, provenientes de processo de flotação e de fusão, utilizando bactérias, especialmente da espécie Acidithiobacillus ferrooxidans ou pelo uso de soluções ácidas, em escala de laboratório. Também foram realizados experimentos de biolixiviação de um sulfeto de níquel (pentlandita) para avaliar o processo de solubilização do metal. Conjuntamente, outros experimentos foram realizados com a finalidade de se obter novas linhagens isoladas a partir destes rejeitos minerais. Suas diferenças fisiológicas foram avaliadas. A partir dos experimentos com os rejeitos encontrou-se que com a escória foi possível obter 13% de níquel e 8 % de cobre em solução após 14 dias de lixiviação biológica. Com soluções ácidas, em pH 0,5 e 1,0, as recuperações foram de 56% de níquel e 24% de cobre em pH 0,5 enquanto que em pH 1,0 as concentrações foram de 21% e 12% de niquele e cobre, respectivamente. Para a recuperação de níquel e cobre deste rejeito sugere-se a lixiviação ácida e não bacteriana. Com a lama as porcentagens... / Bacterial leaching is a feasible to recover metals from minerals with low grade or from mine wastes using microorganisms. The bioleaching process is the bacterial oxidation of valuables metals bearing sulphide minerals (e.g. nickel, copper or zinc), which are released to the solution, followed by conventional recovered by metallurgical techniques. Studies on bioleaching of sulphide minerals concentrates in stirred tanks and, particularly, in heaps, have been developed on pilot and commercial scales. However, few studies have been undertaken on using of mineral wastes from conventional processes such as flotation or flashing smelting through biotechnological routes. This work aims at recovering nickel and copper from industrial wastes such as flotation tailings and slag using bacteria, especially Acidithiobacillus ferrooxidans species, or using acid solutions at laboratory scale. Experiments were also accomplished for nickel sulfide bioleaching to evaluate the metal dissolution process, for comparison purpose. Other experiments were also carried out to obtain new strains isolated from mineral waste to study the physiological differences between them. After 14 days of bioleaching of slag it was possible to extract 13% of nickel and 8% of copper in solution while with acid solutions the extractions were 56% of nickel and 24% of copper at pH 0.5 and 21% and 12% at pH 1.0, respectively. For the metals solubilization from the slag it is suggested the acid leaching instead of bioleaching. With the flotation tailings the recoveries of nickel and copper were 23% e 16% at pH 0.5 or 1.0 while after 14 days with bioleaching the concentrations in solution were 46 % and 17% for nickel and copper. These results show that the flotation tailings can be treated with biological leaching for a higher recovery of metals. The studies of nickel sulfide bioleaching with different bacterial species reached only... (Complete abstract click electronic access below)
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Estudo de genes envolvidos no processo de adesão do Acidithiobacillus ferrooxidans em calcopirita (CuFe'S.IND.2')Henao, Diana Marcela Ossa [UNESP] 26 July 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2010-07-26Bitstream added on 2014-06-13T19:19:53Z : No. of bitstreams: 1
henao_dmo_dr_araiq.pdf: 3174604 bytes, checksum: 225a4ef35be95bb55bec3d13550ee90d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A bactéria acidofílica Acidithiobacillus ferrooxidans é encontrada em ambientes inorgânicos e ácidos tais como depósitos minerais e drenagem ácida de minas, sendo a principal bactéria envolvida na biolixiviação, um processo pelo qual o metabolismo microbiano causa a solubilização do metal contido em minérios que possuam sulfetos metálicos. A adesão da bactéria à superfície do mineral com a subseqüente formação de biofilme é um pré-requisito para a dissolução do sulfeto metálico. Apesar de existirem pesquisas sobre a biogênese, a bioquímica e a regulação da formação de biofilme, o processo primário de adesão e os genes que participam destes processos têm sido pouco estudados nessa espécie bacteriana. O objetivo do presente trabalho foi analisar a adesão e o reconhecimento de grupos tióis na linhagem A. ferrooxidans LR em presença do sulfeto de cobre calcopirita (CuFeS2). Para este fim, foram selecionados onze genes descritos no genoma de A. ferrooxidans ATCC 23270, disponibilizado pela TIGR. Os genes selecionados para este trabalho são: cluster tad (tadA, tadB e tadC) envolvidos na formação de pilus e fimbrias; genes que codificam pilinas do tipo IV; genes pertencentes ao cluster Fe-S e o gene msrA que codifica uma metionina -Ssulfóxido redutase. A análise da expressão destes genes foi realizada por PCR em tempo real. Foi feita uma análise de bioinformática com o objetivo de conhecer o grau de conservação das seqüências das proteínas codificadas pelos genes e a busca de domínios conservados nessas proteínas. Além disso, foi clonada, purificada e caracterizada por métodos biofísicos uma proteína ligante de cluster Fe-S, com o objetivo de avaliá-la futuramente no processo global de biolixiviação. Os resultados de expressão a partir de PCR em tempo real de células livres e aderidas incubadas em presença de calcopirita mostraram... / The acidophilic bacterium Acidithiobacillus ferrooxidans is capable of causing dissolution of metals have been identified in acid mine water and mineral processing plants. Usually this microorganism is found in those places and they have been widely studied in bacterial oxidation and lixiviation in which use inorganic electron donors and fixed carbon dioxide. For this reason has been utilized for enhancing the extraction rates of metals in the ores. The mineralassociated bacteria, adhesion and biofilm formation are critical steps for colonization and subsequent mineral solubilization. Despite research of biogenesis, biochemistry and regulation of biofilm formation has been reported, adhesion process through pilus assembly mechanisms is not studied in this bacterium in spite of related genes involved in the formation of a type IV pilus and tight adherence were identified in thus genome. The objective of this work was to analysis tight adherence, type IV pilus and possibly thiol recognition cluster Fe-S genes expression for time real PCR in planktonic and adhered cells of A. ferrooxidans strain LR incubated in the presence of chalcopyrite. As well, In Silico analysis was realized for genes selected to conservation and conserved domains research. Finally, the Fe-S cluster-binding protein codified by locus Afe_0551 was cloned and expresses to characterize for spectroscopic methods. The results of gene expression revealed to level expression differences in planktonic and adhered cells incubated with chalcopyrite. The genes were unaltered or repressed after 24 h of incubation, however, the expression changed to induction after 20 dyes. Probably, the process of adhesion in first hours of incubation is favored. In the other hand, the Fe-S cluster-binding protein codified by locus Afe_0551 showed high thermal resistance and stability in widen pH range. Far-UV CD measurements showed a high structure... (Complete abstract click electronic access below)
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Estudio de la Dinámica de Poblaciones Bacterianas en Procesos de Biolixiviación Mediante CARD-FISHMora Matus, Alejandra Francisca January 2010 (has links)
El objetivo principal del estudio fue estudiar la dinámica de las distintas
poblaciones bacterianas presentes en el cultivo utilizado a lo largo de la biolixiviación de
la pirita. Con este fin se decidió implementar la técnica de identificación molecular
CARD-FISH, para evaluar tanto la población en la solución de biolixiviación como la
adherida al mineral. En particular, se estudiaron las siguientes cepas bacterianas:
Acidithiobacillus ferrooxidans, Leptospirillum ferrooxidans, Acidithiobacillus thiooxidans
y Sulfobacillus thermosulfidooxidans.
El trabajo aquí presentado consistió en analizar la biolixiviación de una muestra
de pirita pura, durante 600 hrs a 30ºC, utilizando un cultivo de microorganismos mixto
proveniente de un proceso de biolixiviación de Minera Escondida. Para esto, se
monitorearon distintos parámetros de la biolixiviación, como el pH, Eh, Fe(II) en
solución, fierro total, sulfato en solución y recuento directo de bacterias en solución.
Los principales resultados obtenidos en este estudio son la determinación de la
alta capacidad de adherencia de cultivo (90% de adherencia) y la alta eficiencia
extractiva del cultivo utilizado medida como el fierro y azufre recuperado. Además, por
medio de CARD-FISH fue posible conocer la abundancia relativa de cada cepa, y así
establecer que el microorganismo con mayor capacidad de adherencia, con mayor
crecimiento en solución y más abundante hacia al final de la experiencia fue At.
ferrooxidans, siendo por estos motivos catalogada como la cepa más eficiente el el
proceso de biolixiviación de pirita a 30ºC. Del mismo modo se determinó que la bacteria
menos eficiente en este experimento fue S. thermosulfidooxidans.
Basándose en los resultados obtenidos y en las discusiones propuestas se
concluye que la técnica de CARD-FISH fue posible comprender la dinámica de las
poblaciones presentes en el proceso de biolixiviación de la pirita, por lo que se
recomienda la utilización de esta técnica para el monitoreo de este tipo de operaciones.
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