Os Staphylococcus spp coagulase negativa (SCoN) são reconhecidos como agentes etiológicos importantes de infecções humanas. A maioria dos países desenvolvidos relata um aumento de infecções nosocomiais por SCoN resistentes a meticilina e outros antibióticos. A resistência a meticilina é uma característica importante destas bactérias, porém difícil de detectar pelos métodos convencionais de suscetibilidade. Esta resistência é devido à presença de um elemento genético chamado staphylococcal cassette chromosome (SCCmec), que codifica o gene mecA. A identificação dos tipos de SCCmec é relevante para epidemiologia da resistência a meticilina dos Staphylococcus spp. Este estudo prospectivo teve como objetivo determinar a prevalência do gene mecA e a distribuição dos tipos de SCCmec nos SCoN. Também foi avaliada a eficiência do teste de disco difusão com cefoxitina e oxacilina para caracterizar a resistência a meticilina mediada pelo gene mecA. Foram analisadas um total de 181 SCoN de hemoculturas. A prevalência do gene mecA entre estes isolados foi de 71,3%. A sensibilidade dos discos de cefoxitina e oxacilina para todas as espécies de SCoN foi de 100% e 98,4%, respectivamente, enquanto que a especificidade foi de 93% e 89,3%. As espécies mais prevalentes de SCoN foram S. epidermidis (64%), seguido pelo S. hominis (10%), S. haemolyticus (8,8%) e S. capitis (7,7%). A percentagem de isolados positivos para o gene mecA foi maior para S. haemolyticus (98,3%), seguido pelo S. epidermidis (75%) e S. hominis (72,2%). Entre os 129 isolados resistentes, 36 (27.9%) foram identificados com o SCCmec tipo I, 4 (3.0%) com o SCCmec tipo II, 67 (52%) com o SCCmec tipo III, 1 (0.8%) com o SCCmec tipo IV e 4 (3.0%) com os SCCmec tipos I e III. Dezessete isolados foram não tipáveis. O SCCmec tipo III foi o mais prevalente entre os isolados de S. epidermidis (52%). Entre estas cepas, 30 (23%) apresentaram um SCCmec tipo III modificado, que amplificou uma região dcs adicional. Os SCoN meticilina resistentes (MR-SCoN) mostraram um nível de resistência aos antibióticos não -lactamicos maior quando comparados aos SCoN meticilina suscetíveis (MS-SCoN). Os isolados com o SCCmec tipo III foram mais resistentes aos antibióticos não -lactamicos do que os isolados com SCCmec tipos I, II, e IV. / Coagulase negative staphylococci (CoNS) are now recognized as important etiological agents of infections in humans. Most developed countries have reported an increase in CoNS infection in hospitalized patients, which are resistant to methicillin and other antibiotics. The methicillin resistance is an important characteristic of these bacteria. Moreover, the resistance to methicillin may not be easily detected by conventional susceptibility methods. Methicillin resistance is due to the acquisition of a large DNA element termed staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), which harbored the mecA gene. The SCCmec typing is essential for understanding the molecular epidemiology of methicillin resistant Staphylococcus spp. This prospective study was aimed to determine the prevalence of mecA gene and the distribution of SCCmec types in CoNS. Also was evaluated the efficiency of the cefoxitin and oxacilin disk diffusion test to characterize the meticillin resistance mediated by the gene mecA. A total of 181 CoNS from bloodstream isolate were available for the study. The prevalence to mecA gene was 71.3%. The sensivity of oxacillin and cefoxitin disks for all CoNS species were 100% and 98.4% respectively, whereas the specificity were 93% and 89,3 %. The most prevalent SCoN species were: S. epidermidis 116 (64%) followed by S. hominis 18 (10%), S. haemolyticus 16 (8.8%) and S.capitis 14 (7.7%). The percentage of mecApositive isolates was highest for S. haemolyticus (93.8%), followed by S. epidermidis (75%) and S. hominis (72.2%). Among the 129 bloodstream isolates witch mecA gene, 36 (27.9%) harbored SCCmec type I, 4 (3.0%) harbored SCCmec type II, 67 (52%) harbored SCCmec type III, 1 (0.8%) harbored SCCmec type IV and 4 (3.0%) harbored SCCmec type I and III. Seventeen isolates were not typeable. The SCCmec type III was the most prevalent among the isolates of S. epidermidis (52%). Among these strains, 30 (23%) harbored a modified SCCmec type III, which contained, in contrast to regular type III, an additional dcs region. Methicillin resistant CoNS showed higher level of resistance to all non beta lactamics antimicrobials as compared to methicillin susceptible. The isolates with SCCmec type III were more resistant to non-beta lactamics antimicrobials than the isolates harboring SCCmec type I, II and IV.

Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Materiais. Departamento de Engenharia Metalúrgica, Escola de Minas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by giuliana silveira (giulianagphoto@gmail.com) on 2016-02-26T19:30:38Z No. of bitstreams: 1 TESE_BiolixiviaçãoCobreMicro.pdf: 2672489 bytes, checksum: 2796e47f2fe70af33d603e11e52aef86 (MD5) / Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2016-03-01T19:54:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_BiolixiviaçãoCobreMicro.pdf: 2672489 bytes, checksum: 2796e47f2fe70af33d603e11e52aef86 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-01T19:54:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_BiolixiviaçãoCobreMicro.pdf: 2672489 bytes, checksum: 2796e47f2fe70af33d603e11e52aef86 (MD5) Previous issue date: 2015 / A biolixiviação é uma tecnologia madura, amplamente utilizada na lixiviação de fontes primárias de metais (minérios, concentrados e resíduos) e também pode ser aplicada na reciclagem de metais. A primeira parte da presente tese foi voltada para a biolixiviação de dois minérios sulfetados de cobre contendo uma quantidade significativa de flúor. Uma nova abordagem para a redução da toxicidade do flúor durante os ensaios em coluna foi proposta através da utilização de sulfato de alumínio como complexante dos íons F- em solução. Isto permitiu a diminuição da concentração de HF - uma das principais espécies tóxicas para as bactérias durante o processo de biolixiviação. A recirculação da PLS (pregnant leach solution) bem como a realização de purgas também foram estudadas. As colunas foram inoculadas com micro-organismos mesófilos, a 30 oC (Acidithiobacillus ferrooxidans), o que resultou em extrações de cobre acima de 89%, em aproximadamente 250 dias. Do mesmo modo, em um segundo conjunto de colunas contendo micro-organismos termófilos moderados, a 50 oC (Sulfobacillus thermosulfidooxidans), extrações acima de 90% de cobre foram observadas no mesmo período. Os ensaios foram conduzidos em colunas com dimensões internas de 10 cm de diâmetro por 100 cm de altura e carregadas com 10 kg de minério cominuído a um “top size” de ½‟‟e previamente aglomerado. Inicialmente, concentrações de F- da ordem de 2,5 g/L foram observadas na PLS em ambas as temperaturas devido à rápida dissolução de minerais contendo flúor, o que afetou o processo de biolixiviação logo após a inoculação das colunas. No entanto, sucessivas realizações de purgas nos sistemas reduziram a concentração de flúor para 0,5 g/L–1,5 g/L. Além disso, a adição de Al2(SO4)3 juntamente com o alumínio dissolvido da ganga promoveram o crescimento microbiano, principalmente, no início dos experimentos. Da mesma forma, a produção de Fe3+ (após o crescimento microbiano) também promoveu a redução dos efeitos deletérios do fluoreto. Um parâmetro de toxidade do fluoreto (η) foi proposto para representar a proporção em massa entre fluoreto total, alumínio total e as concentrações de Fe3+ total do sistema. Baixos valores do parâmetro η, como consequência de elevadas concentrações de alumínio e de ferro férrico na PLS, resultaram em um aumento da população bacteriana nos sistemas. Apesar da ausência de ferro férrico e uma elevada concentração de flúor antes da realização da primeira purga, o parâmetro η foi menor do que 0,3 na coluna contendo adição externa de alumínio, a 30 oC. Nesta condição, como o teor de alumínio ultrapassou o de fluoreto, a população bacteriana atingiu 107 células/mL e permitiu a biolixiviação do cobre. Nos ensaios com S. thermosulfidooxidans, os valores de η estiveram próximos de 1 mesmo nas colunas em que o alumínio foi adicionado ao meio de cultura. Neste caso, como não foi observado o crescimento microbiano, um aumento no potencial da solução ocorreu apenas após a realização da primeira purga. Desta forma, a presença de minerais portadores de flúor no minério pode ser um problema importante a ser considerado, porém o conteúdo de ambos os cátions também deve ser analisado. O segundo objetivo da presente tese esteve relacionado a uma nova abordagem para a biolixiviação de cobre de placas de circuito impresso (PCI) com microrganismos termófilos moderados em um reator de tambor rotativo. Em uma etapa preliminar, a lixiviação de PCI foi realizada em erlenmeyers para se avaliar os efeitos do tamanho de partícula (− 208 μm + 147 μm), a concentração de Fe2+ (1,25 g/L−10,0g/L) e pH (1,5−2,5) na biolixiviação de cobre utilizando microrganismos mesófilos e termófilos moderados. Extrações de 100% foram alcançadas apenas com uma porcentagem de sólidos relativamente baixa (10,0 g/L), a partir do tamanho de partícula investigado. Por outro lado, elevadas extrações de cobre foram possíveis a partir de PCI (20 mm) a uma concentração de 25 g/L. Uma vez que as cinéticas de extração do cobre foram favorecidas pelo aumento da temperatura (50 °C) a S. thermosulfidooxidans foi selecionada para os ensaios em um reator de tambor rotativo com PCI a 20 mm. Em condições ótimas, a extração de cobre atingiu 85%, em oito dias de ensaio. Foi observado, através de análises de MEV-EDS, que a dissolução do metal a partir das camadas internas foi restringida devido a uma baixa exposição do cobre. Desta forma, a flexibilidade dos processos de biolixiviação de cobre a partir de fontes primárias e secundárias pôde ser demonstrada. ___________________________________________________________________________ / ABSTRACT : Bioleaching is a mature technology, which is widely employed commercially in the leaching of primary sources of metals (ores, concentrates and mine residues), but can also be applied in the recycling of metals, also known as urban mining. The first part of the current thesis was focused on the bioleaching of two copper ores containing secondary sulphides and a significant content of fluoride. A new approach to reduce fluoride toxicity during column experiments was proposed, namely the use of aluminium sulphate to complex free fluoride, decreasing HF concentration - the main toxic species to bioleaching bacteria. PLS recirculation and bleeding were also investigated. Small columns were inoculated with a strain of Acidithiobacillus ferrooxidans, at 30 °C, and resulted in copper extractions above 89%, in about 250 days. Similarly a second set of columns, containing Sulfobacillus thermosulfidooxidans was operated at 50 oC, in which above 90% extraction was observed in the same period. In each temperature the experiments were carried out in 10 cm x 100 cm height aerated columns, loaded with 10 kg of crushed and agglomerated copper ores. Initially, fluoride concentrations of up to 2.5 g/Lin the PLS (pregnant leach solution) were observed at both temperatures due to the fast dissolution of fluoride-bearing minerals, which affected bioleaching shortly after column inoculation. However, successive bleedings reduced such values to 0.5 g/L -1.5 g/L. The addition of Al2(SO4)3 along with aluminium dissolved from the ore were beneficial to microbial growth particularly in the beginning of the experiments. Likewise, Fe3+ production (as growth occurred) was also an important inhibitor of the detrimental effects of fluoride. A fluoride-toxicity parameter (η) was proposed to represent the mass ratio between total fluoride, total aluminium and total ferric iron concentrations in the system. Low values of the η parameter resulted from high ferric iron and aluminium concentrations and implied in large bacterial population in the systems. Despite the absence of ferric iron and a high fluoride concentration prior to first solution bleeding, the η parameter was lower than 0.3 in the column containing external aluminium source, at 30oC. In this condition, as the aluminium content surpassed that of fluoride the bacterial population reached 107 cells/mL and enabled copper bioleaching. In the experiments with S. thermosulfidooxidans, η values were close to 1 even in the columns in which aluminium was added to the growth medium. In this case, there was no bacterial growth, and the solution potential only increased after the first bleeding. Thus, the presence of fluoride-bearing minerals in the ore may be an important issue, but the content of both cations should be also considered. The second aim of the current thesis was to report on a new approach for copper bioleaching from Printed Circuit Boards (PCB) by moderate thermophiles in a rotating-drum reactor. In a preliminary step, leaching of PCB was carried out in shake flasks to assess the effects of particle size (− 208 μm + 147 μm), ferrous iron concentration (1.25 g/L - 10.0 g/L) and pH (1.5 - 2.5) on copper leaching using mesophile and moderate thermophile microorganisms. Only at a relatively low solid content (10.0 g/L) complete copper extraction was achieved from the particle size investigated. Conversely, high copper extractions were possible from coarse-ground PCB (20 mm-long) working with increased solids concentration (up to 25.0 g/L). Because there was as the faster leaching kinetics at 50 °C S. thermosulfidooxidans was selected for experiments in a rotating-drum reactor with the coarser-sized PCB sheets. Under optimal conditions, copper extraction reached 85%, in eight days and microscopic observations by SEM-EDS of the on non-leached and leached material suggested that metal dissolution from the internal layers was restricted by the fact that metal surface was not entirely available and accessible for the solution in the case of the 20 mm-size sheets. Therefore the flexibility to treat different copper-bearing materials of bioleaching was demonstrated.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-04Bitstream added on 2014-06-13T18:50:18Z : No. of bitstreams: 1 firmino_sm_me_araiq_parcial.pdf: 378159 bytes, checksum: 17d002ace9e2ff9f3bbdf6a3ee603f14 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-03T11:42:41Z: firmino_sm_me_araiq_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-03T11:44:08Z : No. of bitstreams: 1 000721809_20150801.pdf: 111456 bytes, checksum: b72089c1dd1d7cd2eb8953648b06cfc1 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-08-03T12:21:11Z: 000721809_20150801.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-03T12:22:23Z : No. of bitstreams: 1 000721809.pdf: 1294061 bytes, checksum: dfd6f1cb5cb714a5f9bc3f1a2ff0eacc (MD5) / A recuperação de cobre a partir de calcopirita usando bactérias é o grande desafio da indústria mineradora atualmente. A biohidrometalurgia é um processo de exploração mineral bem estabelecido para a recuperação de cobre, no entanto não existe ainda um processo sendo aplicado comercialmente no mundo para a extração de cobre a partir de mineral calcopirítico. São inúmeras as alternativas que vem sendo estudada para o aumento da recuperação de cobre neste processo, a adição de cloreto é uma destas alternativas. No entanto, uma das limitações é a reconhecida inibição dos organismos acidofilicos em meio contendo cloreto. A principal bactéria envolvida neste processo é o Acidithiobacillus ferrooxidans. Esta espécie é acidofilica, mesofilica e obtém energia a partir da oxidação de íons ferrosos e compostos reduzidos de enxofre, incluindo os sulfetos metálicos, como por exemplo, calcopirita. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi estudar as linhagens da coleção do laboratório de Biohidrometalurgia na presença de íons cloreto. Para tanto as linhagens foram avaliadas quanto à capacidade de oxidarem Fe2+, enxofre elementar e calcopirita na presença de íons cloreto. Foi observada uma variação grande quanto à cinética de oxidação de íons ferrosos na presença de diferentes concentrações de cloreto. Uma ordem crescente de halotolerância foi proposta: S < SSP < V3 < LR < PCE < ATCC < SJ22 < CMV < PCEL < AMF. Quando enxofre foi utilizado como fonte de energia, todas as linhagens foram inibidas quando a produção de ácido, com exceção da linhagem PCEL. A capacidade de oxidação de calcopirita pelas linhagens também foi verificada através de ensaios respirométricos na presença de íons cloreto. Foi possível estabelecer uma ordem crescente de porcentagem de inibição das linhagens na... / Nowadays, the biggest challenge for mineral companies is recover copper from chalcopyrite. Biohydrometallurgy is a well-established mineral process for copper recovery, however there is no commercial process been applied for copper recovery from chalcopyrite ore. A number of alternatives have been studied; the addition of chloride is one of them. Nevertheless, one of the restrictions is the recognized chloride inhibition of acidophilic organisms. The main bacterium involved in this process is Acidithiobacillus ferrooxidans. This specie is acidophilic, mesophilic and obtains energy from oxidation of ferrous ions and reduced sulphur compounds, including metal sulphides, like chalcopyrite. This work studied the strains of Biohydrometallurgy laboratory’s collection in the presence of chloride ions. The strains were evaluated for their ability to oxidize ferrous ions, elemental sulphur and chalcopyrite in the presence of chloride ions. It was observed a wide discrepancy in the kinetics of ferrous ions oxidation in the presence of different chloride concentrations. A crescent order of halotolerance was proposed: S < SSP < V3 < LR < PCE < ATCC < SJ22 < CMV < PCEL < AMF. When sulphur was utilized as energy source, all strains were inhibiting regarding acid production, with exception for PCEL strain. The capacity of chalcopyrite oxidation was evaluated in respirometric assays in the presence of chloride ions. It was possible to establish a crescent order of percentage of inhibition in the presence of 50 mmol L-1 of chloride and chalcopyrite: (AMF ≈ LR ≈ V3) < ATCC < PCEL < SJ22 < S < SSP < CMV < PCE. The exception were the strains AMF, LR and V3, the others one presented some degree of inhibition. Copper recovery, pH, Eh, Fe2+ and Fe3+ were monitored in shake flasks experiments in two different sets: in the presence of 50 mmol L-1 and with successive... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Iara Jose Taborda de Messias / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Cieêcias da Saúde / Resumo: No presente trabalho, foram investigados a ativação do complemento e a presença de complexos imunes circulantes (CIC) em um grupo de 20 pacientes com endocardite infecciosa, 15 controles valvares e 14 indivíduos normais, À ativação do complemento foi determinada através de diferentes ensaios enzimáticos (ELISA) para avaliação dos seguintes produtos de ativação do complemento : C3d, C3a desArg, TCC, Clrs-Clinh e C3bBbP, e imunoeletroforese de duplo produto foguete para determinação do fragmento C3d. Os níveis de C3 e C4 foram avaliados através de turbidimetria, Os CIC foram determinados através de ELISA para detecção de Clq e C3. Todos os pacientes com EI apresentaram aumento de pelo menos um marcador de ativação do complemento, sendo que na maioria dos casos (65%) todos os ensaios, com exceção de C3bBbP apresentaram valores significantemente maiores do que os controles (C3d p<0.00004), C3a desArg(p< 0.03), TCC(p<0.01), Clrs-Clinh(p <0.00007 ). Os níveis de C3d e C3a desArg foram significantemente maiores nos pacientes com manifestações pulmonares (C3d p=0.0268 e C3À desArg p=0.0301) e de C3d nos pacientes que evoluíram com óbito (p=0.0196). Os CIC (C3) estiveram presentes em 35% dos pacientes, sendo este resultado estatisticamente significante quando comparado com os controles (p=0.0055). Os níveis de C3 apresentaram-se diminuídos nos pacientes com EI quando comparados aos controles valvares (p=0.048) e os níveis de C4 se relacionaram negativamente com a presença de CIC (p=0.037). Não houve correlação entre os níveis de CIC e os produtos de ativação do complemento. Estes achados demonstram que na EI ocorre ativação do complemento, principalmente pela via clássica mediada possivelmente por complexos imunes e sugerem que os marcadores C3d e C3a desArg possam ser possíveis indicadores de lesão de órgãos e gravidade da doença. / Sem abstract

Os Staphylococcus spp coagulase negativa (SCoN) são reconhecidos como agentes etiológicos importantes de infecções humanas. A maioria dos países desenvolvidos relata um aumento de infecções nosocomiais por SCoN resistentes a meticilina e outros antibióticos. A resistência a meticilina é uma característica importante destas bactérias, porém difícil de detectar pelos métodos convencionais de suscetibilidade. Esta resistência é devido à presença de um elemento genético chamado staphylococcal cassette chromosome (SCCmec), que codifica o gene mecA. A identificação dos tipos de SCCmec é relevante para epidemiologia da resistência a meticilina dos Staphylococcus spp. Este estudo prospectivo teve como objetivo determinar a prevalência do gene mecA e a distribuição dos tipos de SCCmec nos SCoN. Também foi avaliada a eficiência do teste de disco difusão com cefoxitina e oxacilina para caracterizar a resistência a meticilina mediada pelo gene mecA. Foram analisadas um total de 181 SCoN de hemoculturas. A prevalência do gene mecA entre estes isolados foi de 71,3%. A sensibilidade dos discos de cefoxitina e oxacilina para todas as espécies de SCoN foi de 100% e 98,4%, respectivamente, enquanto que a especificidade foi de 93% e 89,3%. As espécies mais prevalentes de SCoN foram S. epidermidis (64%), seguido pelo S. hominis (10%), S. haemolyticus (8,8%) e S. capitis (7,7%). A percentagem de isolados positivos para o gene mecA foi maior para S. haemolyticus (98,3%), seguido pelo S. epidermidis (75%) e S. hominis (72,2%). Entre os 129 isolados resistentes, 36 (27.9%) foram identificados com o SCCmec tipo I, 4 (3.0%) com o SCCmec tipo II, 67 (52%) com o SCCmec tipo III, 1 (0.8%) com o SCCmec tipo IV e 4 (3.0%) com os SCCmec tipos I e III. Dezessete isolados foram não tipáveis. O SCCmec tipo III foi o mais prevalente entre os isolados de S. epidermidis (52%). Entre estas cepas, 30 (23%) apresentaram um SCCmec tipo III modificado, que amplificou uma região dcs adicional. Os SCoN meticilina resistentes (MR-SCoN) mostraram um nível de resistência aos antibióticos não -lactamicos maior quando comparados aos SCoN meticilina suscetíveis (MS-SCoN). Os isolados com o SCCmec tipo III foram mais resistentes aos antibióticos não -lactamicos do que os isolados com SCCmec tipos I, II, e IV. / Coagulase negative staphylococci (CoNS) are now recognized as important etiological agents of infections in humans. Most developed countries have reported an increase in CoNS infection in hospitalized patients, which are resistant to methicillin and other antibiotics. The methicillin resistance is an important characteristic of these bacteria. Moreover, the resistance to methicillin may not be easily detected by conventional susceptibility methods. Methicillin resistance is due to the acquisition of a large DNA element termed staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), which harbored the mecA gene. The SCCmec typing is essential for understanding the molecular epidemiology of methicillin resistant Staphylococcus spp. This prospective study was aimed to determine the prevalence of mecA gene and the distribution of SCCmec types in CoNS. Also was evaluated the efficiency of the cefoxitin and oxacilin disk diffusion test to characterize the meticillin resistance mediated by the gene mecA. A total of 181 CoNS from bloodstream isolate were available for the study. The prevalence to mecA gene was 71.3%. The sensivity of oxacillin and cefoxitin disks for all CoNS species were 100% and 98.4% respectively, whereas the specificity were 93% and 89,3 %. The most prevalent SCoN species were: S. epidermidis 116 (64%) followed by S. hominis 18 (10%), S. haemolyticus 16 (8.8%) and S.capitis 14 (7.7%). The percentage of mecApositive isolates was highest for S. haemolyticus (93.8%), followed by S. epidermidis (75%) and S. hominis (72.2%). Among the 129 bloodstream isolates witch mecA gene, 36 (27.9%) harbored SCCmec type I, 4 (3.0%) harbored SCCmec type II, 67 (52%) harbored SCCmec type III, 1 (0.8%) harbored SCCmec type IV and 4 (3.0%) harbored SCCmec type I and III. Seventeen isolates were not typeable. The SCCmec type III was the most prevalent among the isolates of S. epidermidis (52%). Among these strains, 30 (23%) harbored a modified SCCmec type III, which contained, in contrast to regular type III, an additional dcs region. Methicillin resistant CoNS showed higher level of resistance to all non beta lactamics antimicrobials as compared to methicillin susceptible. The isolates with SCCmec type III were more resistant to non-beta lactamics antimicrobials than the isolates harboring SCCmec type I, II and IV.

Os Staphylococcus spp coagulase negativa (SCoN) são reconhecidos como agentes etiológicos importantes de infecções humanas. A maioria dos países desenvolvidos relata um aumento de infecções nosocomiais por SCoN resistentes a meticilina e outros antibióticos. A resistência a meticilina é uma característica importante destas bactérias, porém difícil de detectar pelos métodos convencionais de suscetibilidade. Esta resistência é devido à presença de um elemento genético chamado staphylococcal cassette chromosome (SCCmec), que codifica o gene mecA. A identificação dos tipos de SCCmec é relevante para epidemiologia da resistência a meticilina dos Staphylococcus spp. Este estudo prospectivo teve como objetivo determinar a prevalência do gene mecA e a distribuição dos tipos de SCCmec nos SCoN. Também foi avaliada a eficiência do teste de disco difusão com cefoxitina e oxacilina para caracterizar a resistência a meticilina mediada pelo gene mecA. Foram analisadas um total de 181 SCoN de hemoculturas. A prevalência do gene mecA entre estes isolados foi de 71,3%. A sensibilidade dos discos de cefoxitina e oxacilina para todas as espécies de SCoN foi de 100% e 98,4%, respectivamente, enquanto que a especificidade foi de 93% e 89,3%. As espécies mais prevalentes de SCoN foram S. epidermidis (64%), seguido pelo S. hominis (10%), S. haemolyticus (8,8%) e S. capitis (7,7%). A percentagem de isolados positivos para o gene mecA foi maior para S. haemolyticus (98,3%), seguido pelo S. epidermidis (75%) e S. hominis (72,2%). Entre os 129 isolados resistentes, 36 (27.9%) foram identificados com o SCCmec tipo I, 4 (3.0%) com o SCCmec tipo II, 67 (52%) com o SCCmec tipo III, 1 (0.8%) com o SCCmec tipo IV e 4 (3.0%) com os SCCmec tipos I e III. Dezessete isolados foram não tipáveis. O SCCmec tipo III foi o mais prevalente entre os isolados de S. epidermidis (52%). Entre estas cepas, 30 (23%) apresentaram um SCCmec tipo III modificado, que amplificou uma região dcs adicional. Os SCoN meticilina resistentes (MR-SCoN) mostraram um nível de resistência aos antibióticos não -lactamicos maior quando comparados aos SCoN meticilina suscetíveis (MS-SCoN). Os isolados com o SCCmec tipo III foram mais resistentes aos antibióticos não -lactamicos do que os isolados com SCCmec tipos I, II, e IV. / Coagulase negative staphylococci (CoNS) are now recognized as important etiological agents of infections in humans. Most developed countries have reported an increase in CoNS infection in hospitalized patients, which are resistant to methicillin and other antibiotics. The methicillin resistance is an important characteristic of these bacteria. Moreover, the resistance to methicillin may not be easily detected by conventional susceptibility methods. Methicillin resistance is due to the acquisition of a large DNA element termed staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), which harbored the mecA gene. The SCCmec typing is essential for understanding the molecular epidemiology of methicillin resistant Staphylococcus spp. This prospective study was aimed to determine the prevalence of mecA gene and the distribution of SCCmec types in CoNS. Also was evaluated the efficiency of the cefoxitin and oxacilin disk diffusion test to characterize the meticillin resistance mediated by the gene mecA. A total of 181 CoNS from bloodstream isolate were available for the study. The prevalence to mecA gene was 71.3%. The sensivity of oxacillin and cefoxitin disks for all CoNS species were 100% and 98.4% respectively, whereas the specificity were 93% and 89,3 %. The most prevalent SCoN species were: S. epidermidis 116 (64%) followed by S. hominis 18 (10%), S. haemolyticus 16 (8.8%) and S.capitis 14 (7.7%). The percentage of mecApositive isolates was highest for S. haemolyticus (93.8%), followed by S. epidermidis (75%) and S. hominis (72.2%). Among the 129 bloodstream isolates witch mecA gene, 36 (27.9%) harbored SCCmec type I, 4 (3.0%) harbored SCCmec type II, 67 (52%) harbored SCCmec type III, 1 (0.8%) harbored SCCmec type IV and 4 (3.0%) harbored SCCmec type I and III. Seventeen isolates were not typeable. The SCCmec type III was the most prevalent among the isolates of S. epidermidis (52%). Among these strains, 30 (23%) harbored a modified SCCmec type III, which contained, in contrast to regular type III, an additional dcs region. Methicillin resistant CoNS showed higher level of resistance to all non beta lactamics antimicrobials as compared to methicillin susceptible. The isolates with SCCmec type III were more resistant to non-beta lactamics antimicrobials than the isolates harboring SCCmec type I, II and IV.

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2015-05-28T16:38:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Bruno Henrique Andrade Galvão.pdf: 2504824 bytes, checksum: 6daeadcfa43e3c8d892b11b71b3c2ada (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-28T16:38:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Bruno Henrique Andrade Galvão.pdf: 2504824 bytes, checksum: 6daeadcfa43e3c8d892b11b71b3c2ada (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / CNPQ / Introdução: Desnutrição e esquistossomose são problemas de saúde pública que ocorrem simultaneamente em regiões endêmicas do mundo. Nessas zonas o Schistosoma mansoni, observa-se, frequentemente, uma sobreposição de desnutrição e infecção parasitária. As lesões intestinais causadas pela infecção parasitária e o efeito de uma nutrição deficiente na resposta imunológica intestinal, como ocorre na desnutrição, podem predispor ao desenvolvimento do processo de translocação bacteriana. Objetivo: Observar se em camundongos adultos na fase crônica da esquistossomose, submetidos à desnutrição no período do aleitamento, há diferença na ocorrência de translocação bacteriana em relação ao sexo. Métodos: Camundongos fêmeas Swiss webster (n=60) foram divididos, no período de aleitamento, em 2 grupos: Nutrido (N) e Desnutrido (D) – amamentados por mães alimentadas com dieta contendo 17% e 8% de proteína à base de caseína, respectivamente. Aos 35-45 dias de vida, 15 animais de cada grupo foram infectados com, em média, 30 cercárias de S. mansoni, constituindo os grupos: Nutrido Infectado (NI), Nutrido Não Infectado (NNI), Desnutrido Infectado (DI) e Desnutrido Não Infectado (DNI). O peso corporal (PC) dos animais foi mensurado diariamente no período de aleitamento e semanalmente a partir do 22º dia. 45 dias após a exposição cercariana, foi realizada a confirmação da infecção pelo método de Kato-katz. Aos 161 dias de vida, os animais foram eutanasiados para coleta de amostras biológicas para estudo da translocação bacteriana (TB), análises da microbiota e morfometria intestinal. Para estudo da TB, foram coletados sangue periférico e da veia porta, fragmentos de órgãos e linfonodos mesentéricos. Para a microbiota, as fezes foram coletadas da região média do intestino delgado. Segmentos desta região foram seccionados transversalmente e longitudinalmente para análise morfométrica. Resultados: Os animais do grupo D apresentaram um menor ganho de PC em relação ao grupo N a partir do 3º dia, diferença observada durante todo o período experimental. Verificou-se um maior índice de TB nos animais infectados, comparando-os aos não infectados. Entre os infectados, houve uma maior incidência de TB no grupo D comparado ao N, entretanto, a diferença não foi significativa quanto ao sexo. Observou-se um maior número de ovos e vermes recuperados no grupo N, entretanto não houve diferença na maturação de ovos na mucosa intestinal. Quanto a morfometria intestinal, houve diferença entre NI e NNI para altura e área da vilosidade, e apenas na altura para NI e DNI. Observamos uma maior diversidade de colônias nos grupos de animais desnutridos, controle e esquistossomóticos. Conclusões: A desnutrição modifica a resposta imune e pode favorecer translocação bacteriana em camundongos, em ambos os sexos e é mais intensa nos animais infectados por S. mansoni.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10561_Dissertação_Geraldo da Silva Alves.pdf: 2478261 bytes, checksum: 9cd1b27b375af96d81c665a368ec6c9b (MD5) Previous issue date: 2016-11-24 / A resistência bacteriana aos antimicrobianos é uma ameaça global à saúde pública. O uso de produtos naturais derivados de plantas que tem atividade antimicrobiana em associação com antibacterianos tradicionais podem ser alternativas viáveis para a produção de novos fármacos eficazes contra micro- organismos multirresistentes. A isocumarina paepalantina e o dímero de paepalantina, isolados dos capítulos de Paepalanthus bromelioides, têm se destacado como substâncias promissoras em função de seu potencial biológico. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade antibacteriana in vitro da paepalantina e do dímero isoladamente e em associação, através do método de checkerboard, com diferentes antimicrobianos de uso clínico (vancomicina, oxacilina e meropenem) em amostras de Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa multirresistentes e avaliar por microscopia eletrônica de varredura possíveis alterações morfológicas em amostras expostas a concentrações inibitórias e subinibitórias de paepalantina e do dímero isoladamente e em associação com antibacterianos. Nas amostras de E. faecium, a paepalantina e o dímero isoladamente apresentaram concentração mínima inibitória (CMI) de 32 µg/mL. A associação com a vancomicina não apresentou aumento na atividade desse fármaco. Para S. aureus, a paepalantina e o dímero apresentam bom potencial inibitório quando testados isoladamente (CMI 16 e 8 µg/mL, respectivamente). A associação da paepalantina com a oxacilina mostrou-se indiferente em três das cinco amostras analisadas, enquanto que a associação do dímero com esse fármaco mostrou-se sinérgica em todas as amostras, com redução de até 256 vezes na CMI. Em relação aos micro-organismos Gram-negativos, K. pneumoniae e P. aeruginosa, a paepalantina e o dímero apresentaram fraco potencial inibitório (CMI > 256 µg/mL) e a associação com meropenem não apresentou aumento na atividade desses. O presente estudo demonstrou a atividade das isocumarinas paepalantina e do dímero apenas em bactérias Gram-positivas (E. faecium e S. aureus). A combinação dessas substâncias, sobretudo do dímero, com a oxacilina apresentou efeito sinérgico relevante, o que propicia perspectiva de estudos adicionais para o desenvolvimento de produtos com a associação destas substâncias. Em S. aureus, após análise por MEV, verificou-se que as substâncias vi não atuam alterando a estrutura externa desse micro-organismo nas condições utilizadas neste estudo. Palavras-chave: Resistência bacteriana; Paepalantina; Sinergismo.

Orientador: Sophie Françoise Mauricette Derchain / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-07T02:01:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Figueiredo_PriscilaGarcia_D.pdf: 2027663 bytes, checksum: 8870b21112f34b9523a25e0440c2ea6f (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Introdução: a vaginose bacteriana (VB) representa uma condição clínica caracterizada pela substituição da flora vaginal normal por bactérias predominantemente anaeróbias ou facultativas. Paralelamente, estudos têm demonstrado que a expressão da ciclo-oxigenase-2 (COX-2), enzima marcadora de inflamação, encontra-se alterada em processos neoplásicos. Objetivo: avaliar a relação entre a expressão da COX-2 e a presença de VB em mulheres portadoras de lesões escamosas intra-epiteliais cervicais. Sujeitos e métodos: para este estudo de corte transversal, foram selecionadas 228 mulheres portadoras de anormalidades citológicas compatíveis com lesões induzidas pelo Papilomavirus humano (HPV), no período de Fevereiro de 2001 a Abril de 2004. A VB foi diagnosticada através da presença de pelo menos 20% de clue cells no esfregaço de Papanicolaou. A detecção do HPV de alto risco oncogênico, foi realizada através do exame de Captura Híbrida II (CH II), sendo estas amostras colhidas antes da realização da biópsia ou da conização. O diagnóstico histológico foi compatível com colo normal ou cervicite em 11 casos (5%), neoplasia intra-epitelial cervical (NIC) grau 1 (NIC 1) em 35 (15 %), NIC 2 em 31 (14%) e NIC 3 em 151 casos (66%). A expressão citoplasmática da COX-2 foi determinada por imuno-histoquímica e avaliada no espécime de tecido que apresentava a lesão mais grave. Resultados: a VB foi diagnosticada em 38 (17%) das 228 mulheres. O HPV de alto risco oncogênico foi detectado em 192 (84%) mulheres. O diagnóstico de VB foi significativamente maior em mulheres com infecção pelo HPV (p=0,05). A distribuição da VB foi similar entre os diferentes graus histológicos da NIC (p=0,42). A presença de VB foi significativamente menor em mulheres com expressão moderada ou forte da COX-2 (p=0,02; OR=0,4 IC 95% 0,2 a 0,9). Quando se relacionou a detecção do HPV com a expressão da COX-2, observou-se uma proporção significativamente maior de mulheres infectadas pelo HPV com expressão moderada ou forte da COX-2 (p=0.04). A expressão da COX-2 não esteve significativamente associada à gravidade da NIC (p=0.24). Conclusões: a VB esteve associada com a presença de infecção pelo HPV e com a menor expressão da COX-2. A expressão da COX-2 foi maior em mulheres infectadas pelo HPV, embora não tenha havido associação entre a expressão da COX-2 e a gravidade da NIC / Abstract: Background: bacterial vaginosis (BV) is a syndrome characterized by a reduction in the normal Lactobacillus microflora and an excessive growth of microorganisms such as anaerobes and facultative. In parallel, studies suggest that COX-2 expression, an enzyme related to inflammatory response, is altered due to neoplastic processes. Objectives: to assess the relation between COX-2 expression and BV in women with cervical squamous intraepithelial lesions. Subjects and methods: a cross-sectional study enrolled 228 women due to cytological abnormalities in Papanicolaou smears, through February 2001 to April 2004. The finding of 20% or more clue cells on Papanicolaou smears was considered positive for the presence of BV. High-risk HPV detection was assessed through Hybrid Capture II (HCII). Collection of samples for Papanicolaou smears and for HCII was performed immediately before biopsy or conization. Pathological diagnoses were classified as normal/cervicitis in 11 cases (5%), cervical intraepithelial neoplasia (CIN) grade 1 (CIN 1) in 35 (15 %), CIN 2 in 31 (14%) and CIN 3 in 151 (66%). Cytoplasmic expression of COX-2, evaluated from the tissue block that harbored the most significant lesion, was ascertained through immunohistochemistry. Results: BV was rendered as positive in 38 (17%) of 228 women. High-risk HPV detection was present in 192 (84%) women. The diagnosis of BV was significantly higher in women with HPV infection (p=0.05). The prevalence of BV was similar across different grade of CIN (p=0.42). Presence of BV was significantly lower among women with moderate and strong expression of COX-2 (p=0.02; OR=0.4 IC95% 0.2 to 0.9). When analyzing HPV detection according to the COX-2 expression, a significantly higher proportion of women infected by high-risk HPV showed a moderate and strong expression of COX-2 (p=0.04). COX-2 expression was not associated with the severity of CIN (p=0.24). Conclusions: the presence of BV was related to HPV infection and negative or weak COX-2 expression. COX-2 expression was higher in HPV infected women, although no difference was observed in relation to the severity of CIN / Doutorado / Tocoginecologia / Doutor em Tocoginecologia

Na espécie humana, são usados vários leites, além daquele que lhe é próprio, tais como o leite de vaca e o leite de cabra dentre outros. Em meio a seus diversos componentes encontramos a lactose que é um dissacarídeo que se desdobra em glicose e galactose. A cárie dentária como uma doença multifatorial, necessita de um substrato cariogênico para o seu desenvolvimento além das bactérias presentes na placa dentária, que utilizam carboidratos da dieta para seu metabolismo. Tendo em vista a característica de alto consumo e os relatos clínicos nos quais é sugerida a participação do leite no desenvolvimento da cárie, este trabalho avaliou o efeito “in vitro” de três tipos de leite “in natura”; materno, de vaca e de cabra, sobre o metabolismo da placa dentária humana, com relação à capacidade de fermentação e síntese de polissacarídeos extracelulares. Por meio da coleta de placa dentária de 50 crianças e adolescentes entre 10 e 15 anos de idade, procedente de uma Instituição da cidade de Bauru, um “pool” de placa foi tratado em laboratório, e submetido a estudos bioquímicos específicos para fermentação e síntese de polissacarídeos extracelulares. Os resultados obtidos foram submetidos ao teste de Análise de Variância (ANOVA) a um e dois critérios com nível de significância de 5% e utilizou-se o teste de Tukey-Kramer para comparação entre os diferentes tipos de substratos. Concluiu-se com este estudo que, quando utilizados os leites testados, ocorre, “in vitro”, a fermentação e a síntese de polissacarídeos extracelulares. O leite de cabra apresentou a menor fermentação seguido pelo leite bovino e depois o leite materno. Para a síntese de polissacarídeos o maior resultado foi obtido pelo leite de cabra, seguido pelo leite de vaca e pelo leite materno. / Several types of milk are consumed by human beings besides human milk, such as cow milk, goat milk, and others. Among several other components, the milk contains lactose, which is a disaccharide composed of glucose and galactose. Dental caries, as a multifactorial disease, requires a cariogenic substrate on which to develop, in addition to the bacteria present in dental plaque, which employ the dietary carbohydrates in their metabolism. Considering the high intake of milk by mankind and the clinical reports that suggest its participation in caries development, the present in vitro study evaluated the influence of three types of whole milk, namely human, cow and goat milk, on human dental plaque metabolism as to the capacity of fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. A “pool” of dental plaque obtained from 50 children aged 10 to 15 years old attending an institution in the city of Bauru was laboratory treated and submitted to biochemical studies specifically for the fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. The obtained results were submitted to one and two-way variance analysis (ANOVA) at a significance level of 5% and the Tukey-Kramer test was employed to compare the different types of substrates. It was conc luded that all three types of milk demonstrated in vitro fermentation and synthesis of extracellular polysaccharides. Goat milk presented the smallest level of fermentation, followed by cow milk and human milk. Concerning the synthesis of polysaccharides, the highest outcome was achieved for goat milk, followed by cow milk and human milk.