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Filogeografia de cinco espécies de DYCKIA (BROMELIACEAE) endêmicas de uma região do centro-oeste brasileiro, que compreende os biomas cerrado, pantanal e chaco, em comparação com uma congênere, amplamente distribuída

Melo, Camila de Aguiar January 2016 (has links)
A Família Bromeliaceae abriga espécies de plantas epífitas, saxícolas ou terrestres, que se distribuem do sul dos Estados Unidos até a Patagônia, compreendendo 58 gêneros e em torno de 3140 espécies. É uma das famílias mais diversas ecológica e morfologicamente, tendo surgido no escudo das Guianas há aproximadamente 100 milhões de anos (Ma), e se espalhado por outras regiões das Américas tropical e subtropical em torno de 15 e 10 Ma. O gênero Dyckia apresenta aproximadamente 160 espécies, sendo muitas destas raras e endêmicas. Este gênero é caracterizado pela ausência de ―tanque‖ que acumula água, possibilitando a essas espécies habitar ambientes com condições de seca extrema, como a diagonal seca no centro da América do Sul. O estado do Mato Grosso do Sul, inserido na diagonal seca, tem na sua composição fitogeográfica quatro biomas (Cerrado, Pantanal, Chaco e Mata Atlântica), sendo uma área muito interessante para estudos filogeográficos. Esta dissertação é composta por um manuscrito que busca entender a diversidade genética e a história evolutiva de cinco espécies de Dyckia restritas e endêmicas de uma região que compreende diferentes biomas em comparação com uma congênere de ampla distribuição. No Capítulo II, através de uma abordagem filogeográfica, utilizando dois marcadores plastidiais (cpDNA) e um nuclear (nuDNA), foi estimada a diversidade genética dentro e entre cinco espécies de Dyckia de distribuição restrita (D. grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa e D. exserta), endêmicas do Cerrado e do Pantanal/Chaco, em comparação com a congênere de ampla distribuição (D. leptostachya). Os resultados do cpDNA revelaram que as espécies de distribuição restrita apresentaram uma baixa diversidade genética intra populacional em comparação com a congênere de ampla distribuição, entretanto a diversidade apresentada pelas populações da espécie amplamente distribuída não foi considerada alta, sendo que somente quatro populações apresentaram variação genética. Quando levado em consideração a diversidade total das espécies, os índices de diversidade nas espécies de distribuição restrita variaram de zero à 0,7355 (h) e 0,000988 (π), e quando comparadas com a espécie amplamente distribuída apresentaram menor diversidade, com exceção de Dyckia excelsa, sendo que a alta diversidade desta espécie pode estar relacionada a sua característica de auto incompatibilidade. Os resultados obtidos a partir do nuDNA mostraram uma rede de haplótipos levemente estruturada e uma alta diversidade genética em comparação ao cpDNA, devendo-se provavelmente a alta taxa de recombinação, à alta dispersão via pólen ou ainda à retenção de polimorfismo ancestral. Os resultados de cpDNA apresentaram um baixo compartilhamento de haplótipos e uma alta estruturação, sendo que os haplótipos compartilhados entre D. grandidentata, D. pottiorum e D. divaricata (H1, H3), e entre as populações de D. leptostachya (H5) são provavelmente consequência da retenção de polimorfismo ancestral. O relacionamento genético apresentado pela rede haplotípica do cpDNA evidencia três haplogrupos, um formado pela espécie amplamente distribuída, e os outros dois pelas espécies que ocorrem no Cerrado e no Pantanal/Chaco, indicando que a história biogeográfica destes biomas pode ter influenciado em processos de especiação deste grupo de espécies. A Serra de Maracaju e a diferença na elevação do solo do Cerrado em relação à planície do Pantanal, foram propostas como a principal barreira geográfica que gerou a alta estruturação entre os haplogrupos formados pelas espécies ocorrentes no Cerrado e Pantanal/Chaco. Assim, a preservação dos biomas é vital para a conservação tanto das espécies de Dyckia de distribuição restrita quanto das amplamente distribuídas, garantindo a manutenção da exclusiva diversidade destas populações. / Bromeliaceae family harbors species of epiphytic, saxicol or land plants, which are distributed from the southern of United States to Patagonia, comprising 58 genera with about 3140 species. It is one of the most diverse ecological and morphologically families that arose in the Guiana Shield about 100 milion years ago (Ma), and spread to other regions of the tropical and subtropical Americas around 15 to 10 Ma. Dyckia genus has about 160 species, many of these rare and endemic. This genus is characterized by the absence of a "tank" that accumulates water, enabling these species to inhabit environments with extreme drought conditions, such as ―the dry diagonal‖ in the center of South America. The state of Mato Grosso do Sul, located on dry diagonal, comprises four biomes (Cerrado, Pantanal, Chaco and Atlantic Forest), being one interesting area for phylogeographic studies. This dissertation is composed by one manuscript that seeks to understand the genetic diversity and evolutionary history of five restricted and endemic species from Dyckia genus in a region comprising different biomes, compared with a wide distributed congener. In Chapter II, through a phylogeographic approach, using two plastid markers (cpDNA) and one nuclear (nuDNA), we estimated the genetic diversity within and among Dyckia grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa and D. exserta (restricted species endemic to the Cerrado and the Pantanal / Chaco), comparing with a congener with wide distribution (D. leptostachya). The results from cpDNA showed that restricted distributed species had low intra-populational genetic diversity in comparison with the species widely distributed. However, the diversity presented by the widely distributed species was not considered high, since only four populations showed genetic variation. Considering the total diversity, the restricted distribution species ranged from zero to 0,7355 (h) and 0,000988 (π) , and when compared with widespread species showed minor diversity. The exception was Dyckia excelsa that showed high diversity, fact that could be related with its self incompatibility. The results obtained from nuDNA showed a slightly structured network and a high genetic diversity compared to cpDNA, which may be probably due to high recombination rates, the high dispersion via pollen or the retention of ancestor polymorphism. Also, the cpDNA results showed a low haplotype sharing and high structure, and shared haplotype between D. grandidentata, D. pottiorum and D. divaricata (H1, H3) and populations of D. leptostachya (H5) may be consequence of retention of ancestral polymorphism. The genetic relationship presented by cpDNA haplotype network reveals three haplogroups, one formed by widespread species, and the others by species that occur in Cerrado and in Pantanal / Chaco, indicating that biogeographic history of these biomes may have influenced speciation of this group of species. Serra de Maracaju and the differences in landscape elevation between Cerrado and Pantanal lowland was proposed as the main geographical barrier that generated the high structure between the haplogroups formed by species from Cerrado and Pantanal/Chaco. Thus, the preservation of biomes is imperative for the conservation of Dyckia species, ensuring the maintenance of that exclusive diversity encountered in these populations.
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Filogeografia de cinco espécies de DYCKIA (BROMELIACEAE) endêmicas de uma região do centro-oeste brasileiro, que compreende os biomas cerrado, pantanal e chaco, em comparação com uma congênere, amplamente distribuída

Melo, Camila de Aguiar January 2016 (has links)
A Família Bromeliaceae abriga espécies de plantas epífitas, saxícolas ou terrestres, que se distribuem do sul dos Estados Unidos até a Patagônia, compreendendo 58 gêneros e em torno de 3140 espécies. É uma das famílias mais diversas ecológica e morfologicamente, tendo surgido no escudo das Guianas há aproximadamente 100 milhões de anos (Ma), e se espalhado por outras regiões das Américas tropical e subtropical em torno de 15 e 10 Ma. O gênero Dyckia apresenta aproximadamente 160 espécies, sendo muitas destas raras e endêmicas. Este gênero é caracterizado pela ausência de ―tanque‖ que acumula água, possibilitando a essas espécies habitar ambientes com condições de seca extrema, como a diagonal seca no centro da América do Sul. O estado do Mato Grosso do Sul, inserido na diagonal seca, tem na sua composição fitogeográfica quatro biomas (Cerrado, Pantanal, Chaco e Mata Atlântica), sendo uma área muito interessante para estudos filogeográficos. Esta dissertação é composta por um manuscrito que busca entender a diversidade genética e a história evolutiva de cinco espécies de Dyckia restritas e endêmicas de uma região que compreende diferentes biomas em comparação com uma congênere de ampla distribuição. No Capítulo II, através de uma abordagem filogeográfica, utilizando dois marcadores plastidiais (cpDNA) e um nuclear (nuDNA), foi estimada a diversidade genética dentro e entre cinco espécies de Dyckia de distribuição restrita (D. grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa e D. exserta), endêmicas do Cerrado e do Pantanal/Chaco, em comparação com a congênere de ampla distribuição (D. leptostachya). Os resultados do cpDNA revelaram que as espécies de distribuição restrita apresentaram uma baixa diversidade genética intra populacional em comparação com a congênere de ampla distribuição, entretanto a diversidade apresentada pelas populações da espécie amplamente distribuída não foi considerada alta, sendo que somente quatro populações apresentaram variação genética. Quando levado em consideração a diversidade total das espécies, os índices de diversidade nas espécies de distribuição restrita variaram de zero à 0,7355 (h) e 0,000988 (π), e quando comparadas com a espécie amplamente distribuída apresentaram menor diversidade, com exceção de Dyckia excelsa, sendo que a alta diversidade desta espécie pode estar relacionada a sua característica de auto incompatibilidade. Os resultados obtidos a partir do nuDNA mostraram uma rede de haplótipos levemente estruturada e uma alta diversidade genética em comparação ao cpDNA, devendo-se provavelmente a alta taxa de recombinação, à alta dispersão via pólen ou ainda à retenção de polimorfismo ancestral. Os resultados de cpDNA apresentaram um baixo compartilhamento de haplótipos e uma alta estruturação, sendo que os haplótipos compartilhados entre D. grandidentata, D. pottiorum e D. divaricata (H1, H3), e entre as populações de D. leptostachya (H5) são provavelmente consequência da retenção de polimorfismo ancestral. O relacionamento genético apresentado pela rede haplotípica do cpDNA evidencia três haplogrupos, um formado pela espécie amplamente distribuída, e os outros dois pelas espécies que ocorrem no Cerrado e no Pantanal/Chaco, indicando que a história biogeográfica destes biomas pode ter influenciado em processos de especiação deste grupo de espécies. A Serra de Maracaju e a diferença na elevação do solo do Cerrado em relação à planície do Pantanal, foram propostas como a principal barreira geográfica que gerou a alta estruturação entre os haplogrupos formados pelas espécies ocorrentes no Cerrado e Pantanal/Chaco. Assim, a preservação dos biomas é vital para a conservação tanto das espécies de Dyckia de distribuição restrita quanto das amplamente distribuídas, garantindo a manutenção da exclusiva diversidade destas populações. / Bromeliaceae family harbors species of epiphytic, saxicol or land plants, which are distributed from the southern of United States to Patagonia, comprising 58 genera with about 3140 species. It is one of the most diverse ecological and morphologically families that arose in the Guiana Shield about 100 milion years ago (Ma), and spread to other regions of the tropical and subtropical Americas around 15 to 10 Ma. Dyckia genus has about 160 species, many of these rare and endemic. This genus is characterized by the absence of a "tank" that accumulates water, enabling these species to inhabit environments with extreme drought conditions, such as ―the dry diagonal‖ in the center of South America. The state of Mato Grosso do Sul, located on dry diagonal, comprises four biomes (Cerrado, Pantanal, Chaco and Atlantic Forest), being one interesting area for phylogeographic studies. This dissertation is composed by one manuscript that seeks to understand the genetic diversity and evolutionary history of five restricted and endemic species from Dyckia genus in a region comprising different biomes, compared with a wide distributed congener. In Chapter II, through a phylogeographic approach, using two plastid markers (cpDNA) and one nuclear (nuDNA), we estimated the genetic diversity within and among Dyckia grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa and D. exserta (restricted species endemic to the Cerrado and the Pantanal / Chaco), comparing with a congener with wide distribution (D. leptostachya). The results from cpDNA showed that restricted distributed species had low intra-populational genetic diversity in comparison with the species widely distributed. However, the diversity presented by the widely distributed species was not considered high, since only four populations showed genetic variation. Considering the total diversity, the restricted distribution species ranged from zero to 0,7355 (h) and 0,000988 (π) , and when compared with widespread species showed minor diversity. The exception was Dyckia excelsa that showed high diversity, fact that could be related with its self incompatibility. The results obtained from nuDNA showed a slightly structured network and a high genetic diversity compared to cpDNA, which may be probably due to high recombination rates, the high dispersion via pollen or the retention of ancestor polymorphism. Also, the cpDNA results showed a low haplotype sharing and high structure, and shared haplotype between D. grandidentata, D. pottiorum and D. divaricata (H1, H3) and populations of D. leptostachya (H5) may be consequence of retention of ancestral polymorphism. The genetic relationship presented by cpDNA haplotype network reveals three haplogroups, one formed by widespread species, and the others by species that occur in Cerrado and in Pantanal / Chaco, indicating that biogeographic history of these biomes may have influenced speciation of this group of species. Serra de Maracaju and the differences in landscape elevation between Cerrado and Pantanal lowland was proposed as the main geographical barrier that generated the high structure between the haplogroups formed by species from Cerrado and Pantanal/Chaco. Thus, the preservation of biomes is imperative for the conservation of Dyckia species, ensuring the maintenance of that exclusive diversity encountered in these populations.
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Revisão taxonômica do complexo ARICORIS CONSTANTIUS (FABRICIUS, 1793) (LEPIDOPTERA: RIODINIDAE)

Lemes, José Ricardo Assmann January 2018 (has links)
Aricoris Westwood, 1851 é um gênero Neotropical cujas larvas são mirmecófilas e que até o presente momento é constituído por 27 espécies. Dentro do gênero, o grupo constantius é representado por borboletas de médio a pequeno porte, de coloração marrom e facilmente confundidas com Satyrinae (Nymphalidae). Por formarem um complexo de espécies crípticas, apresentam uma história taxonômica confusa e tortuosa. Dessa maneira, aqui é proposta uma revisão taxonômica com abordagem integrativa, utilizando-se um gene mitocondrial (citocromo c oxidase subunidade I -COI) aliado a análise morfológica. O complexo constantius é recuperado como uma linhagem monofilética constituída de seis espécies: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais, São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul e Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brasil: Bahia e Minas Gerais). As espécies novas aqui descritas eram tratadas até então como A. tutana.Os resultados moleculares corroboram com os caracteres morfológicos. Neótipos são designados para Papilio constantius Fabricius, 1793 e Erycina tutana Godart, [1824], cujos tipos foram perdidos. Todas as espécies podem ser identificadas através de uma combinação de características de padrão alar e genitálias. Para auxiliar na identificação destas espécies, foram elaboradas diagnoses, ilustrações dos caracteres diagnósticos e uma chave de identificação. Os indivíduos adultos apresentam óleo em suas asas, indicando hábitos afitófagos no estágio larval. Além disso, A. constantius foi observada na natureza se alimentando de honeydew de hemípteros atendentes de formigas. Esse trabalho contribui com o conhecimento de Riodinidae, uma das famílias de borboletas menos estudadas, e ilustra a necessidade de uma abordagem integrativa na taxonomia deste grupo. / Aricoris Westwood, 1851 is a Neotropical genus whose larvae are myrmecophilous and, until the present moment, is constituted of 27 species. Within the genus, the group constantius is represented by medium to small butterflies of brown color and easily confused with Satyrinae (Nymphalidae). Because these butterflies form a complex of cryptic species, they present a confusing and tortuous taxonomic history. Thus, a taxonomic revision with an integrative approach is proposed herein, using a mitochondrial gene (cytochrome c oxidase subunit I – COI) allied to the morphological analysis. The complex constantius is recovered as a monophyletic lineage consisting of six species: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais and São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul and Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brazil: Bahia and Minas Gerais). The new species described herin were previously treated as A. tutana. The molecular results corroborate with the morphological characters. Neotypes are assigned to Papilio constantius Fabricius, 1793and Erycina tutana Godart, [1824], whose types were lost. All species can be identified through a combination of characteristics in the wing pattern and of genitalia. To assist in the identification of these species, diagnoses, illustrations of the diagnostic characters and an identification key were elaborated. Adult individuals have greasy in their wings, indicating aphytophagy in the larval stage. Furthermore, A. constantius was observed in nature feeding on honeydew produced by ant-tended Hemiptera. This work contributes to the knowledge of Riodinidae, one of the less studied butterfly families, and illustrates the need for an integrative approach in the taxonomy of this group.
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Revisão taxonômica do complexo ARICORIS CONSTANTIUS (FABRICIUS, 1793) (LEPIDOPTERA: RIODINIDAE)

Lemes, José Ricardo Assmann January 2018 (has links)
Aricoris Westwood, 1851 é um gênero Neotropical cujas larvas são mirmecófilas e que até o presente momento é constituído por 27 espécies. Dentro do gênero, o grupo constantius é representado por borboletas de médio a pequeno porte, de coloração marrom e facilmente confundidas com Satyrinae (Nymphalidae). Por formarem um complexo de espécies crípticas, apresentam uma história taxonômica confusa e tortuosa. Dessa maneira, aqui é proposta uma revisão taxonômica com abordagem integrativa, utilizando-se um gene mitocondrial (citocromo c oxidase subunidade I -COI) aliado a análise morfológica. O complexo constantius é recuperado como uma linhagem monofilética constituída de seis espécies: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais, São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul e Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brasil: Bahia e Minas Gerais). As espécies novas aqui descritas eram tratadas até então como A. tutana.Os resultados moleculares corroboram com os caracteres morfológicos. Neótipos são designados para Papilio constantius Fabricius, 1793 e Erycina tutana Godart, [1824], cujos tipos foram perdidos. Todas as espécies podem ser identificadas através de uma combinação de características de padrão alar e genitálias. Para auxiliar na identificação destas espécies, foram elaboradas diagnoses, ilustrações dos caracteres diagnósticos e uma chave de identificação. Os indivíduos adultos apresentam óleo em suas asas, indicando hábitos afitófagos no estágio larval. Além disso, A. constantius foi observada na natureza se alimentando de honeydew de hemípteros atendentes de formigas. Esse trabalho contribui com o conhecimento de Riodinidae, uma das famílias de borboletas menos estudadas, e ilustra a necessidade de uma abordagem integrativa na taxonomia deste grupo. / Aricoris Westwood, 1851 is a Neotropical genus whose larvae are myrmecophilous and, until the present moment, is constituted of 27 species. Within the genus, the group constantius is represented by medium to small butterflies of brown color and easily confused with Satyrinae (Nymphalidae). Because these butterflies form a complex of cryptic species, they present a confusing and tortuous taxonomic history. Thus, a taxonomic revision with an integrative approach is proposed herein, using a mitochondrial gene (cytochrome c oxidase subunit I – COI) allied to the morphological analysis. The complex constantius is recovered as a monophyletic lineage consisting of six species: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais and São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul and Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brazil: Bahia and Minas Gerais). The new species described herin were previously treated as A. tutana. The molecular results corroborate with the morphological characters. Neotypes are assigned to Papilio constantius Fabricius, 1793and Erycina tutana Godart, [1824], whose types were lost. All species can be identified through a combination of characteristics in the wing pattern and of genitalia. To assist in the identification of these species, diagnoses, illustrations of the diagnostic characters and an identification key were elaborated. Adult individuals have greasy in their wings, indicating aphytophagy in the larval stage. Furthermore, A. constantius was observed in nature feeding on honeydew produced by ant-tended Hemiptera. This work contributes to the knowledge of Riodinidae, one of the less studied butterfly families, and illustrates the need for an integrative approach in the taxonomy of this group.
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Filogeografia de cinco espécies de DYCKIA (BROMELIACEAE) endêmicas de uma região do centro-oeste brasileiro, que compreende os biomas cerrado, pantanal e chaco, em comparação com uma congênere, amplamente distribuída

Melo, Camila de Aguiar January 2016 (has links)
A Família Bromeliaceae abriga espécies de plantas epífitas, saxícolas ou terrestres, que se distribuem do sul dos Estados Unidos até a Patagônia, compreendendo 58 gêneros e em torno de 3140 espécies. É uma das famílias mais diversas ecológica e morfologicamente, tendo surgido no escudo das Guianas há aproximadamente 100 milhões de anos (Ma), e se espalhado por outras regiões das Américas tropical e subtropical em torno de 15 e 10 Ma. O gênero Dyckia apresenta aproximadamente 160 espécies, sendo muitas destas raras e endêmicas. Este gênero é caracterizado pela ausência de ―tanque‖ que acumula água, possibilitando a essas espécies habitar ambientes com condições de seca extrema, como a diagonal seca no centro da América do Sul. O estado do Mato Grosso do Sul, inserido na diagonal seca, tem na sua composição fitogeográfica quatro biomas (Cerrado, Pantanal, Chaco e Mata Atlântica), sendo uma área muito interessante para estudos filogeográficos. Esta dissertação é composta por um manuscrito que busca entender a diversidade genética e a história evolutiva de cinco espécies de Dyckia restritas e endêmicas de uma região que compreende diferentes biomas em comparação com uma congênere de ampla distribuição. No Capítulo II, através de uma abordagem filogeográfica, utilizando dois marcadores plastidiais (cpDNA) e um nuclear (nuDNA), foi estimada a diversidade genética dentro e entre cinco espécies de Dyckia de distribuição restrita (D. grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa e D. exserta), endêmicas do Cerrado e do Pantanal/Chaco, em comparação com a congênere de ampla distribuição (D. leptostachya). Os resultados do cpDNA revelaram que as espécies de distribuição restrita apresentaram uma baixa diversidade genética intra populacional em comparação com a congênere de ampla distribuição, entretanto a diversidade apresentada pelas populações da espécie amplamente distribuída não foi considerada alta, sendo que somente quatro populações apresentaram variação genética. Quando levado em consideração a diversidade total das espécies, os índices de diversidade nas espécies de distribuição restrita variaram de zero à 0,7355 (h) e 0,000988 (π), e quando comparadas com a espécie amplamente distribuída apresentaram menor diversidade, com exceção de Dyckia excelsa, sendo que a alta diversidade desta espécie pode estar relacionada a sua característica de auto incompatibilidade. Os resultados obtidos a partir do nuDNA mostraram uma rede de haplótipos levemente estruturada e uma alta diversidade genética em comparação ao cpDNA, devendo-se provavelmente a alta taxa de recombinação, à alta dispersão via pólen ou ainda à retenção de polimorfismo ancestral. Os resultados de cpDNA apresentaram um baixo compartilhamento de haplótipos e uma alta estruturação, sendo que os haplótipos compartilhados entre D. grandidentata, D. pottiorum e D. divaricata (H1, H3), e entre as populações de D. leptostachya (H5) são provavelmente consequência da retenção de polimorfismo ancestral. O relacionamento genético apresentado pela rede haplotípica do cpDNA evidencia três haplogrupos, um formado pela espécie amplamente distribuída, e os outros dois pelas espécies que ocorrem no Cerrado e no Pantanal/Chaco, indicando que a história biogeográfica destes biomas pode ter influenciado em processos de especiação deste grupo de espécies. A Serra de Maracaju e a diferença na elevação do solo do Cerrado em relação à planície do Pantanal, foram propostas como a principal barreira geográfica que gerou a alta estruturação entre os haplogrupos formados pelas espécies ocorrentes no Cerrado e Pantanal/Chaco. Assim, a preservação dos biomas é vital para a conservação tanto das espécies de Dyckia de distribuição restrita quanto das amplamente distribuídas, garantindo a manutenção da exclusiva diversidade destas populações. / Bromeliaceae family harbors species of epiphytic, saxicol or land plants, which are distributed from the southern of United States to Patagonia, comprising 58 genera with about 3140 species. It is one of the most diverse ecological and morphologically families that arose in the Guiana Shield about 100 milion years ago (Ma), and spread to other regions of the tropical and subtropical Americas around 15 to 10 Ma. Dyckia genus has about 160 species, many of these rare and endemic. This genus is characterized by the absence of a "tank" that accumulates water, enabling these species to inhabit environments with extreme drought conditions, such as ―the dry diagonal‖ in the center of South America. The state of Mato Grosso do Sul, located on dry diagonal, comprises four biomes (Cerrado, Pantanal, Chaco and Atlantic Forest), being one interesting area for phylogeographic studies. This dissertation is composed by one manuscript that seeks to understand the genetic diversity and evolutionary history of five restricted and endemic species from Dyckia genus in a region comprising different biomes, compared with a wide distributed congener. In Chapter II, through a phylogeographic approach, using two plastid markers (cpDNA) and one nuclear (nuDNA), we estimated the genetic diversity within and among Dyckia grandidentata, D. pottiorum, D. divaricata, D. excelsa and D. exserta (restricted species endemic to the Cerrado and the Pantanal / Chaco), comparing with a congener with wide distribution (D. leptostachya). The results from cpDNA showed that restricted distributed species had low intra-populational genetic diversity in comparison with the species widely distributed. However, the diversity presented by the widely distributed species was not considered high, since only four populations showed genetic variation. Considering the total diversity, the restricted distribution species ranged from zero to 0,7355 (h) and 0,000988 (π) , and when compared with widespread species showed minor diversity. The exception was Dyckia excelsa that showed high diversity, fact that could be related with its self incompatibility. The results obtained from nuDNA showed a slightly structured network and a high genetic diversity compared to cpDNA, which may be probably due to high recombination rates, the high dispersion via pollen or the retention of ancestor polymorphism. Also, the cpDNA results showed a low haplotype sharing and high structure, and shared haplotype between D. grandidentata, D. pottiorum and D. divaricata (H1, H3) and populations of D. leptostachya (H5) may be consequence of retention of ancestral polymorphism. The genetic relationship presented by cpDNA haplotype network reveals three haplogroups, one formed by widespread species, and the others by species that occur in Cerrado and in Pantanal / Chaco, indicating that biogeographic history of these biomes may have influenced speciation of this group of species. Serra de Maracaju and the differences in landscape elevation between Cerrado and Pantanal lowland was proposed as the main geographical barrier that generated the high structure between the haplogroups formed by species from Cerrado and Pantanal/Chaco. Thus, the preservation of biomes is imperative for the conservation of Dyckia species, ensuring the maintenance of that exclusive diversity encountered in these populations.
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Revisão taxonômica do complexo ARICORIS CONSTANTIUS (FABRICIUS, 1793) (LEPIDOPTERA: RIODINIDAE)

Lemes, José Ricardo Assmann January 2018 (has links)
Aricoris Westwood, 1851 é um gênero Neotropical cujas larvas são mirmecófilas e que até o presente momento é constituído por 27 espécies. Dentro do gênero, o grupo constantius é representado por borboletas de médio a pequeno porte, de coloração marrom e facilmente confundidas com Satyrinae (Nymphalidae). Por formarem um complexo de espécies crípticas, apresentam uma história taxonômica confusa e tortuosa. Dessa maneira, aqui é proposta uma revisão taxonômica com abordagem integrativa, utilizando-se um gene mitocondrial (citocromo c oxidase subunidade I -COI) aliado a análise morfológica. O complexo constantius é recuperado como uma linhagem monofilética constituída de seis espécies: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais, São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brasil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul e Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brasil: Bahia e Minas Gerais). As espécies novas aqui descritas eram tratadas até então como A. tutana.Os resultados moleculares corroboram com os caracteres morfológicos. Neótipos são designados para Papilio constantius Fabricius, 1793 e Erycina tutana Godart, [1824], cujos tipos foram perdidos. Todas as espécies podem ser identificadas através de uma combinação de características de padrão alar e genitálias. Para auxiliar na identificação destas espécies, foram elaboradas diagnoses, ilustrações dos caracteres diagnósticos e uma chave de identificação. Os indivíduos adultos apresentam óleo em suas asas, indicando hábitos afitófagos no estágio larval. Além disso, A. constantius foi observada na natureza se alimentando de honeydew de hemípteros atendentes de formigas. Esse trabalho contribui com o conhecimento de Riodinidae, uma das famílias de borboletas menos estudadas, e ilustra a necessidade de uma abordagem integrativa na taxonomia deste grupo. / Aricoris Westwood, 1851 is a Neotropical genus whose larvae are myrmecophilous and, until the present moment, is constituted of 27 species. Within the genus, the group constantius is represented by medium to small butterflies of brown color and easily confused with Satyrinae (Nymphalidae). Because these butterflies form a complex of cryptic species, they present a confusing and tortuous taxonomic history. Thus, a taxonomic revision with an integrative approach is proposed herein, using a mitochondrial gene (cytochrome c oxidase subunit I – COI) allied to the morphological analysis. The complex constantius is recovered as a monophyletic lineage consisting of six species: A. constantius (Fabricius, 1793), A. monotona (Stichel, 1910), A. tutana (Godart, [1824]), A. sp. 1 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais and São Paulo), A. sp. 2 sp. nov. (Brazil: Distrito Federal, Mato Grosso do Sul and Paraná) e A. sp. 3 sp. nov. (Brazil: Bahia and Minas Gerais). The new species described herin were previously treated as A. tutana. The molecular results corroborate with the morphological characters. Neotypes are assigned to Papilio constantius Fabricius, 1793and Erycina tutana Godart, [1824], whose types were lost. All species can be identified through a combination of characteristics in the wing pattern and of genitalia. To assist in the identification of these species, diagnoses, illustrations of the diagnostic characters and an identification key were elaborated. Adult individuals have greasy in their wings, indicating aphytophagy in the larval stage. Furthermore, A. constantius was observed in nature feeding on honeydew produced by ant-tended Hemiptera. This work contributes to the knowledge of Riodinidae, one of the less studied butterfly families, and illustrates the need for an integrative approach in the taxonomy of this group.
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Desvendando a fauna do bioma pampa no Rio Grande do Sul : inventário da fauna de Drosophilidae (Insecta, Diptera)

Poppe, Jean Lucas January 2013 (has links)
Resumo: A família Drosophilidae teve sua primeira espécie descrita em 1787 quando Fabricius descreveu Musca funebris, que mais tarde foi reclassificada como Drosophila funebris, espécie tipo da família que atualmente é composta por cerca de 4.170 espécies descritas. Os drosofilídeos são popularmente conhecidos como ―mosca da fruta‖, mas além de frutos em decomposição, também podem ser encontrados em flores, guano de morcego, cladódios de cactos, carcaças de insetos e outros animais, fluxos de seiva e material vegetal em decomposição, e em muitos outros recursos. Por estas moscas serem muito abundantes, apresentarem curto ciclo de vida, e serem facilmente coletadas, tornaram-se bons modelos em estudos de genética, e nas décadas mais recentes estão também se tornando bons modelos ecológicos. Embora muito estudadas nos diversos biomas do mundo, poucos estudos foram desenvolvidos nos Campos Sulinos, ambiente que tem sofrido com a degradação em decorrência da agricultura e pecuária no estado do Rio Grande do Sul. Nos últimos anos o bioma Pampa vem recebendo maior atenção do Ministério do Meio Ambiente, com isso espera-se que este seja mais valorizado e receba maior atenção científica, contribuindo para sua conservação. No presente estudo, mostragens sazonais de drosofilídeos foram realizadas em uma área natural, na região do município de Bossoroca (28° 45’024‖S 54° 56’729‖W) entre Abril de 2011 e Abril de 2012, com iscas de banana e recursos naturais encontrados em campo. Nas coletas foram considerados os ambientes de campo aberto, borda e interior das manchas de mata que compõem o Pampa Além do acompanhamento da variação sazonal das populações de Drosophilidae, também foi analisada a variação de medidas de diversidade como, por exemplo, o índice de heterogeneidade de Shannon-Wiener (H’) e o de equitabilidade de Smith-Wilson (Evar),entre campo, borda e interior de mata ao longo das estações. Novas espécies foram propostas para o gênero Rhinoleucophenga: R. pampeana sp. nov., R. missionera sp. nov. e R. pampeana sp. nov. Através de uma ampla revisão da literatura, também foi realizado um levantamento das espécies de Drosophilidae registradas no Bioma Pampa, incluindo toda sua extensão, entre Brasil, Uruguai e Argentina. Como resultado das novas amostragens, Drosophila briegeri Pavan & Breuer, D. fuscolineata Duda, Rhinoleucophenga obesa Loew, R. punctulata Duda, R. subradiata Duda e Zygothrica orbitalis Sturtevant foram pela primeira vez registradas neste bioma, e dentre as mais abundantes estiveram Drosophila simulans Sturtevant, D. willistoni Sturtevant, D. mediopunctata Dobzanhsky & Pavan, D. buzzatii Patterson & Wheeler, D. mercatorum Patterson & Wheeler, D. maculifrons Duda, D. immigrans Sturtevant, D. hydei Sturtevant e Zaprionus indianus Gupta. De uma maneira geral, tanto espécies neotropicais quanto exóticas foram mais concentradas na borda e no interior das manchas de mata, sendo esta tendência influenciada pela variação sazonal. Consequentemente, medidas de diversidade também variaram ao longo das estações entre o campo aberto e o interior das manchas de mata. Logo, a sazonalidade parece ser o principal componente capaz de explicar a variação da diversidade de Drosophilidae no Pampa durante o período amostrado, sendo as manchas de mata fundamentais para a manutenção dessa diversidade. O Pampa brasileiro revelou uma grande riqueza de Drosophilidae, mais do que o dobro dos registros atuais para o Pampa uruguaio e argentino. Apesar disso, os três países apresentam amplas áreas do bioma Pampa ainda totalmente desconhecidas quanto a fauna de Drosophilidae. O conjunto dessas informações ressalta a importância e a necessidade de mais estudos para desvendar a fauna de Drosophilidae no bioma Pampa.
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Desvendando a fauna do bioma pampa no Rio Grande do Sul : inventário da fauna de Drosophilidae (Insecta, Diptera)

Poppe, Jean Lucas January 2013 (has links)
Resumo: A família Drosophilidae teve sua primeira espécie descrita em 1787 quando Fabricius descreveu Musca funebris, que mais tarde foi reclassificada como Drosophila funebris, espécie tipo da família que atualmente é composta por cerca de 4.170 espécies descritas. Os drosofilídeos são popularmente conhecidos como ―mosca da fruta‖, mas além de frutos em decomposição, também podem ser encontrados em flores, guano de morcego, cladódios de cactos, carcaças de insetos e outros animais, fluxos de seiva e material vegetal em decomposição, e em muitos outros recursos. Por estas moscas serem muito abundantes, apresentarem curto ciclo de vida, e serem facilmente coletadas, tornaram-se bons modelos em estudos de genética, e nas décadas mais recentes estão também se tornando bons modelos ecológicos. Embora muito estudadas nos diversos biomas do mundo, poucos estudos foram desenvolvidos nos Campos Sulinos, ambiente que tem sofrido com a degradação em decorrência da agricultura e pecuária no estado do Rio Grande do Sul. Nos últimos anos o bioma Pampa vem recebendo maior atenção do Ministério do Meio Ambiente, com isso espera-se que este seja mais valorizado e receba maior atenção científica, contribuindo para sua conservação. No presente estudo, mostragens sazonais de drosofilídeos foram realizadas em uma área natural, na região do município de Bossoroca (28° 45’024‖S 54° 56’729‖W) entre Abril de 2011 e Abril de 2012, com iscas de banana e recursos naturais encontrados em campo. Nas coletas foram considerados os ambientes de campo aberto, borda e interior das manchas de mata que compõem o Pampa Além do acompanhamento da variação sazonal das populações de Drosophilidae, também foi analisada a variação de medidas de diversidade como, por exemplo, o índice de heterogeneidade de Shannon-Wiener (H’) e o de equitabilidade de Smith-Wilson (Evar),entre campo, borda e interior de mata ao longo das estações. Novas espécies foram propostas para o gênero Rhinoleucophenga: R. pampeana sp. nov., R. missionera sp. nov. e R. pampeana sp. nov. Através de uma ampla revisão da literatura, também foi realizado um levantamento das espécies de Drosophilidae registradas no Bioma Pampa, incluindo toda sua extensão, entre Brasil, Uruguai e Argentina. Como resultado das novas amostragens, Drosophila briegeri Pavan & Breuer, D. fuscolineata Duda, Rhinoleucophenga obesa Loew, R. punctulata Duda, R. subradiata Duda e Zygothrica orbitalis Sturtevant foram pela primeira vez registradas neste bioma, e dentre as mais abundantes estiveram Drosophila simulans Sturtevant, D. willistoni Sturtevant, D. mediopunctata Dobzanhsky & Pavan, D. buzzatii Patterson & Wheeler, D. mercatorum Patterson & Wheeler, D. maculifrons Duda, D. immigrans Sturtevant, D. hydei Sturtevant e Zaprionus indianus Gupta. De uma maneira geral, tanto espécies neotropicais quanto exóticas foram mais concentradas na borda e no interior das manchas de mata, sendo esta tendência influenciada pela variação sazonal. Consequentemente, medidas de diversidade também variaram ao longo das estações entre o campo aberto e o interior das manchas de mata. Logo, a sazonalidade parece ser o principal componente capaz de explicar a variação da diversidade de Drosophilidae no Pampa durante o período amostrado, sendo as manchas de mata fundamentais para a manutenção dessa diversidade. O Pampa brasileiro revelou uma grande riqueza de Drosophilidae, mais do que o dobro dos registros atuais para o Pampa uruguaio e argentino. Apesar disso, os três países apresentam amplas áreas do bioma Pampa ainda totalmente desconhecidas quanto a fauna de Drosophilidae. O conjunto dessas informações ressalta a importância e a necessidade de mais estudos para desvendar a fauna de Drosophilidae no bioma Pampa.
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Comunidade bacteriana de uma área do bioma pampa

Vargas, Rafael da Silveira January 2014 (has links)
As pastagens naturais do Bioma Pampa têm sido tipicamente utilizadas em sistemas extensivos de criação de bovinos de corte, com pouco ou nenhum aporte de insumos externos. Em ambientes naturais ou com pouca intervenção antrópica, como os sistemas pastoris tradicionais do Bioma Pampa, a microbiota do solo assume um papel no funcionamento do ecossistema. A presente pesquisa teve como objetivo avaliar o impacto de diferentes pressões de pastejo sobre a atividade microbiana e a diversidade de bactérias do solo. Foi avaliado um experimento de longa duração, localizado em Eldorado do Sul, Brasil, avaliando-se três níveis de pressão de pastejo: alta pressão de pastejo (HP), com 4% de oferta de forragem (OF); pressão de pastejo moderada (MP), com 12% de OF e baixa pressão de pastejo (LP), com 16% de OF. Foram avaliadas ainda duas áreas de referência, sendo uma área de vegetação nativa nunca pastejada (NG) e outra de vegetação regenerada após dois anos de pastejo (RG). As amostras de solo foram avaliadas quanto à biomassa microbiana, atividades de β-glucosidase, arilsulfatase e urease, adotados como indicadores bioquímicos de qualidade do solo. Avaliou-se ainda a estrutura da comunidade bacteriana e da população de bactérias diazotróficas por meio de RFLP dos genes 16S rRNA e o nifH, respectivamente. A diversidade de bactérias diazotróficas foi avaliada por meio de sequenciamento parcial do gene 16S rRNA. A presença de animais em pastejo favoreceu a comunidade microbiana do solo, de modo que a média geométrica geral dos atributos bioquímicos foi significativamente maior nos tratamentos com maior intensidade de pastejo, MP e HP. As estruturas da comunidade bacteriana e das populações de diazotróficos foram alteradas pelos diferentes manejos da pastagem, observando-se uma maior diversidade de bactérias diazotróficas culturáveis no tratamento LP. Considerando-se o conjunto das características bioquímicas e microbiológicas avaliadas no presente trabalho e o histórico da área, a adoção do tratamento MP parece o mais adequado visando à produção animal e à conservação do Bioma Pampa. / The grasslands of the Pampa biome have been typically used in extensive breeding systems of beef cattle, with little or no contribution of external inputs. In natural environments or with little human intervention, such as traditional grazing systems of the Pampa biome, the soil microbiota plays a role in the ecosystem functioning. This study aimed to evaluate the impact of different grazing pressures on the activity and diversity of soil bacteria. We performed one long-term experiment in Eldorado do Sul, Brazil, which assessed three levels of grazing pressure: high grazing pressure (HP), with 4% herbage allowance (HA); moderate grazing pressure (MP), with 12% HA; and low grazing pressure (LP), with 16% HA. Two reference areas were also assessed, an area of never-grazed native vegetation (NG) and an area of regenerated vegetation after two years of grazing (RG). Soil samples were evaluated for microbial biomass; β-glucosidase, arylsulfatase and urease activities; and biochemical indicators of soil quality. The structure of the bacterial community and the population of diazotrophic bacteria were also evaluated by RFLP of the 16S rRNA and nifH genes, respectively. The diversity of diazotrophic bacteria was assessed by partial sequencing of the 16S rRNA gene. The presence of grazing animals favored the soil microbial community, and consequently, the overall geometric mean of the biochemical characteristics was significantly higher in MP and HP. The structures of the bacterial community and the populations of diazotrophic bacteria were changed by the different grazing managements, with a greater diversity of culturable diazotrophic bacteria observed in the LP treatment. Considering all the biochemical and microbiological characteristics evaluated in this study and the history of the area, adoption of the MP treatment seems the most appropriate for animal production and conservation of the Pampa biome.
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Cultivo e caracterização de membros do domínio Archaea a partir de sedimentos límnicos do Cerrado

Ambrósio, Deborah Vasconcellos 27 April 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós Graduação em Biologia Molecular, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-02-01T16:02:21Z No. of bitstreams: 1 2016_DeborahVasconcellosAmbrósio.pdf: 3329953 bytes, checksum: e66459c673c7c9890002220c0a4f0bf5 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-01T21:11:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_DeborahVasconcellosAmbrósio.pdf: 3329953 bytes, checksum: e66459c673c7c9890002220c0a4f0bf5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-01T21:11:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_DeborahVasconcellosAmbrósio.pdf: 3329953 bytes, checksum: e66459c673c7c9890002220c0a4f0bf5 (MD5) / A classificação dos organismos em três domínios, proposta por Woese e colaboradores em 1990, revelou a importância do domínio Archaea e desde então, vários trabalhos têm sido realizados a fim de melhor entender este grupo que se encontra amplamente distribuído no nosso planeta, sendo importante para vários processos ecológicos incluindo os ciclos do Carbono e Nitrogênio. A maior parte do conhecimento deste domínio, incluindo a sua diversidade no bioma Cerrado, está descrita principalmente por métodos independentes de cultivo devido à grande dificuldade de obtenção de culturas em laboratório. Este trabalho propõe a obtenção de culturas laboratoriais de archaeas mesófilas do Cerrado, a partir de sedimentos de um córrego da reserva ecológica do IBGE, localizada em Brasília-DF. Os micro-organismos foram cultivados em meios sólido e líquido, confeccionados a partir da mistura de água e sedimentos deste córrego. O meio de cultura foi adicionado de cloreto de amônio, para favorecer o crescimento de oxidantes de amônia, bem como diferentes agentes antimicrobianos. As amostras foram incubadas em estufa a 28ºC e analisadas semanalmente quanto ao crescimento, sendo realizados repiques quando necessário. As análises de microscopia revelaram colônias compostas por células diminutas, de diferentes formatos e tamanhos que variam de 0,5 a 3μm. Porém, não foi possível relacionar os aspectos morfológicos às archaeas presentes no cultivo. O DNA das colônias obtidas foi submetido a ensaios de PCR com iniciadores específicos para os genes que codificam o rRNA 16S de Archaea e Bacteria e o gene amoA de Archaea, seguido de análises de bioinformática. O resultado das análises revelou um co-cultivo entre diferentes archaeas dos filos Euryarchaeota, Thaumarchaeota e Bathyarchaeota (Miscelaneous Crenachaeotic Group-MCG) com bactérias de quatro gêneros distintos, pertencentes às famílias Brucellaceae e Burkholderiaceae, sendo a maioria das sequências de Archaea afiliadas ao grupo MCG. As sequências de DNA referentes ao gene amoA, obtidas a partir das culturas laboratoriais, se afiliaram a um grupo relacionado ao grupo I.1b do filo Thaumarchaeota, não se associando a qualquer representante previamente cultivado. O sequenciamento dos fragmentos de DNA relativos aos genes de rRNA 16S e amoA de Archaea obtidos a partir das amostras do sedimento revelaram a presença de organismos dos mesmos filos encontrados no cultivo. As análises de α-diversidade das sequências do gene rRNA 16S indicam que a comunidade do córrego Roncador pode ser considerada rica, com uma cobertura estimada de 58,33% para o nível de espécie. / The classification of living organisms in three domains, proposed by Woese and collaborators in 1990, revealed the importance of Archaea and since then, a number of studies were developed in order to better understand this widely distributed group, with important roles in many ecological processes including the nitrogen and carbon cycles. The knowledge of this domain, including its diversity in the Cerrado biome, is mostly described by culture independent methods due to the difficulty of obtaining cultures in artificial media. This work describes the cultivation and characterization of Cerrado’s mesophilic archaea, from a stream sediment of the IBGE ecological reserve located in Brasília-DF. The microorganisms were cultivated in solid and liquid media prepared with a mixture of stream’s sediment and water. In order to improve the growth of ammonia oxidizers, ammonium chloride was added to the media. Antimicrobial agents were also added to prevent bacterial and fungal growth. The samples were incubated at 28ºC and analyzed weekly for growth. Microscopy analyses showed small cells with different shapes and sizes, from 0,5 to 3μm, which were submitted to DNA extraction procedures and subjected to PCR assays with primers directed to the 16S rRNA gene of Archaea and Bacteria, as well as the archaeal amoA gene. The amplicons were submitted to automatic DNA sequencing procedures, and the results revealed that all colonies consisted in co-cultures of different types of archaea from the Euryarchaeota, Thaumarchaeota and Bathyarchaeota (Miscelaneous Crenachaeotic Group-MCG) phyla and Bacteria from four distinct genres of the Brucellaceae and Burkholderiaceae families. The majority of the archaeal 16S rRNA sequences were affiliated to the MGG group. The sequences of the archaeal amoA gene from the cultures were affiliated to a group associated to the I.1b Thaumarchaeal group, and showed no affiliation to any previously cultured members. Archaeal rRNA 16S and amoA gene sequences from the stream sediment were analyzed and the results showed the presence of organisms from the same phyla found in the cultures. α-diversity analysess of the rRNA 16S sequences showed that the archaeal community of the stream can be considered rich with an estimated coverage of 58,33% for the species level.

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