Orientadora: Daniele Ribeiro Araujo. / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Biossistemas.

Orientadora: Daniele Ribeiro Araujo. / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Biossistemas.

Orientador: Marcelo Augusto Christoffolete / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2012

Orientador: Tiago Rodrigues / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2014

Orientadora: Profa. Dra. Iseli Lourenço Nantes / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2014. / Citocromo c é uma proteína formada por uma única cadeia polipeptídica, e em humanos, possui 104 resíduos de aminoácidos, estando associada à membrana interna mitocondrial, sintetizada no citosol como uma apoproteina. Os principais papeis biológicos de citocromo c são, atuação na cadeia de transporte de elétrons, papel oxidante e contribuição na apoptose, quando liberado no citosol. O citocromo c esta sujeito a modificações pós-traducionais que podem estar relacionados à sinalização, como, fosforilação ou agentes pró-oxidantes como é o caso da nitração. O SIN-1 é o principio ativo da Molsidomine (SIN-10), uma droga vasodiladora, estudos demonstraram que a incubação de SIN-1 com citocromo c produz uma espécie modificada de citocromo c. O superóxido reage com o óxido nítrico produzindo peroxinitrito, podendo, portanto, mimetizar essas condições. Os objetivos do trabalho foram investigar melhor essas espécies modificadas e caracterizar sua atividade através de técnicas espectroscópicas. Nas condições estudadas no presente trabalho é possível inferir que a presença da histidina 26 é fundamental para a formação da espécie modificada. A fosforilação das tirosinas 48 e 97 podem ter contribuído para a proteção contra o estresse nitroativo. Houve o desaparecimento da banda de absorção em 695 nm, o que pode indicar que o átomo de Fe perdeu a sexta coordenação com a metionina 80. Estudos posteriores devem ser realizados com o objetivo de avaliar a atividades biológicas dessas espécies modificadas.

Orientador: Prof. Dr. Luciano Puzer / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2015.

Orientadora: Profa. Dra. Maria Aparecida Sperança / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2016. / O arbovírus Mayaro (MAYV), pertence ao gênero Alphavirus, família Togaviridae e grupo sorológico A. Como parte do projeto de pesquisa sobre "Arboviroses Emergentes na Amazônia Ocidental", foi isolada uma estirpe de um alphavirus Mayaro a partir de um indivíduo febril de Acrelândia, Acre. O MAYV ocorre no ambiente silvestre ou rural em áreas próximas a florestas e seu ciclo de transmissão envolve a participação de primatas não humanos, aves e mosquito Haemagogus ssp. As características patogênicas do vírus MAY em humanos são pouco compreendidas e o potencial de dispersão desses vírus e a possibilidade de participação de espécies de mosquitos do gênero Aedes em seu ciclo de transmissão fazem desse vírus um importante organismo para estudos biológicos e epidemiológicos. Devido à natureza não específica dos sinais e sintomas de doenças febris agudas causadas por MAYV, o diagnóstico clínico é difícil e pode ser confundido com outras doenças febris, como: a febre da dengue, febre do chikungunya, febre amarela e a malária. Já o diagnóstico laboratorial por isolamento viral é laborioso e depende de infraestrutura e pessoal especializado, disponível em poucos laboratórios brasileiros. O diagnóstico imunoenzimático possui limitações quanto à utilização de partículas virais infecciosas e também por produzirem reações cruzadas com vírus da mesma família. Sendo assim, com o intuito de obter antígeno recombinante específico para detecção de MAYV, este projeto teve por objetivo expressar a glicoproteína E2 do vírus em células de insetos utilizando baculovírus recombinante como vetor. A glicoproteína E2 dos alphavirus tem a função de se ligar a receptores presentes na membrana plasmática da célula alvo para a entrada do vírus através de uma vesícula endossomal. Como resultado, foi obtido o baculovírus recombinante para a glicoproteína E2 de MAYV, e a mesma foi expressa pela primeira vez em células de inseto High-FiveTM. Apesar de utilizar vetor com sinal de exportação da proteína recombinante para o meio extracelular, a glicoproteína recombinante E2 de MAYV não foi exportada, permanecendo na fração celular da cultura. Análises da estrutura tridimensional da E2 homóloga de alphavirus indicaram que esta glicoproteína apresenta um domínio transmembrana, o que justifica sua permanência na bicamada fosfolípidica da célula hospedeira. / The arbovirus Mayaro (MAYV), belongs to the genus Alphavirus, family Togaviridae and serological group A. As part of the research project on "Emerging Arboviroses in the Western Amazon", a strain of Mayaro alphavirus was isolated from a febrile individual of Acrelândia, Acre. MAYV occurs in the wild or rural environment, in areas near to forests and its life cycle includes the participation of non-human primates, birds and mosquito Haemagogus ssp. The pathogenic characteristics of MAYV in humans are poorly understood and the dispersal potential of these viruses and the possibility of participation of species of Aedes mosquitos in its transmission cycle make this virus an important organism for biological and epidemiological studies. Because of the nonspecific nature of the signs and symptoms of acute febrile illness caused by MAYV, clinical diagnosis is difficult and can be confused with other infectious diseases, such as dengue fever, chikungunya fever, yellow fever and malaria. Moreover laboratory diagnosis by viral isolation is laborious and depends on infrastructure and trained personnel available in a few Brazilian laboratories. The enzyme immunoassay diagnosis has limitations on the use of infectious viral particles and also for producing cross-reactions with other virus from the same group. Thus, in order to obtain recombinant antigen for specific detection of MAYV, this project aimed to express the MAYV E2 glycoprotein in insect cells using recombinant baculovirus as vector. The E2 glycoprotein of the alphaviruses has the function of binding to receptors in the plasma membrane of the target cell for viral entry through an endosomal vesicle. The recombinant baculovirus was obtained for the MAYV E2 glycoprotein, and this protein was expressed for the first time in High- FiveTM insect cells. Despite using a vector with signal to exportation of the recombinant protein to the extracellular medium, the MAYV E2 glycoprotein was not exported, remaining in the cell fraction of the culture. Structural analyses of alphavirus E2 homologous protein indicated that the glycoprotein has a transmembrane domain, which justifies its permanence in the host cell phospholipid bilayer.

O tratamento de efluentes por digestão anaeróbia tem sido amplamente modelado via ADM1 (Anaerobic Digestion Model No. 1) desenvolvido pela IWA (International Water Association). Tal modelo é dinâmico de modo que concentrações das espécies químicas no interior do reator variam com o tempo, sendo matematicamente regidas por equações diferenciais ordinárias ou algébricas conforme a respectiva cinética química. Este trabalho teve como objetivo adaptar o modelo ADM1 para tratamento e posterior aproveitamento de efluentes agroindustriais, com interesse futuro ao tratamento anaeróbio da vinhaça de cana de açúcar. O presente trabalho considerou biorreatores contínuos de mistura perfeita (CSTR - Continuously Stirred Tank Reactor) e a solução numérica das equações governantes foi programada em linguagem Python. O modelo computacional implementado se mostrou aplicável e pode ser utilizado em demais pesquisas que se baseiam no modelo ADM1 de digestão anaeróbia para tratamento de efluentes agroindustriais, considerando possíveis adaptações devido à especificidade de cada tipo de efluente. / The wastewater treatment by anaerobic digestion has been extensively modelled by ADM1 (Anaerobic Digestion Model No. 1) developed by IWA (International Water Association). This model is dynamic so that chemical species concentrations within the reactor vary over time, being mathematically governed by either ordinary differential equations or algebraic equations according to their chemical kinetics. This research aimed at adapting the ADM1 model for treatment and subsequent use of agroindustrial effluents, with future interest in the anaerobic treatment of sugarcane vinasse. The present research considered Continuously Stirred Tank Reactor (CSTR) and the numerical solution of the governing equations was programmed in Python language. The computational model implemented was applicable and can be used in other studies that are based on the ADM1 model of anaerobic digestion for the treatment of agroindustrial effluents, considering possible adaptations due to the specificity of each type of efluente.

Este trabalho apresenta os resultados obtidos na comparação - através da contabilidade em emergia, em termoeconomia e em análise econômico financeira - de sistemas energéticos agropecuários. O objetivo deste estudo é o de reunir em um único trabalho três métricas distintas de atribuição de custos, considerando suas limitações e seus indicadores. Comparam-se três configurações: o primeiro utiliza um sistema de geração de energia instalado em uma usina autônoma no Estado de São Paulo; o segundo um motorgerador alimentado com biogás produzido em um biodigestor de dejetos bovinos, integrado à usina, e o terceiro sistema um motorgerador alimentado com biogás produzido em um biodigestor de dejetos suínos que, para efeito do estudo também é integrado aos sistemas anteriores. Realiza-se a análise em emergia, termoeconomia e economia financeira, comparando-se as configurações com a finalidade de possibilitar uma visão multimétrica sobre as interações. Verifica-se que ao integrarmos os biossistemas, utilizando suas biomassas residuais como insumo de geração de eletricidade, o custo da eletricidade gerada é reduzido. A metologia empregada neste trabalho possibilita uma visão por três aspectos dos biossistemas: a visão ambiental por parte da emergia, a visão termodinâmica interna através dos rendimentos da primeira e segunda lei da termodinâmica por parte da termoeconomia e por fim a visão do investidor, que apresenta os resultados econômics financeiros da integração dos biossistemas. / This work shows the results obtained when compairing the account in emergy, in Thermoeconomy and in an economic analysis of energy farming energy systems. The goal of this study is to assemble in an unique work three different ways of attributing costs, considering their restrictions and indexes. Three configurations are compaired: the first one uses an energy generation system installed in a sugar-ethanol plant in São Paulo. The second operates with a generator fed with biogas from a biodigestor of cattle manure that is integrated to the plant.The third system operates with a generator that receives pig slurry that is also integrated to the plant. The goal of quantifying the emergy on these systems, the thermoeconomic and the economic analysis in to make possible a wide view about the implications on these integrations.It is shown that when the biosystems are integrated, using their residual biomass as an input to electricity generation, the electricity cost is reduced. The methodology of this work makes possible seeing three aspects of the biosystems: the environmental sight by emergy, the inner thermodynamic sight given by the first and the second thermodinamic laws by the thermoeconomy and the investor sight that presents the economic financial results of the biosystems integration.

O presente projeto de pesquisa foi desenvolvido no ano de 2015 in loco em 109 nascentes da Sub Bacia de Posses no município de Extrema, MG que está inserida na Bacia Hidrográfica do Rio Jaguari. Entendeu-se que o Biossistema da Nascente é composto por um conjunto de funções biológicas, ecológicas e geológicas que se interagem entre si e se completam com a ação antrópica e o ciclo hidrológico. Objetivou-se neste trabalho apresentar uma ferramenta prática de gestão, que seja objetiva e eficiente para análise da qualidade do Biossistema das Nascentes, baseado no estudo e análise dos indicadores que envolvem a sua dinâmica, valorizando as interações entre as dimensões ecológica, social e antrópica, organizando os aspectos de forma quantitativa e qualitativa com o objetivo de identificar o nível de conservação em que se encontra o Biossistema da Nascente de forma que esta ferramenta de análise denominada Protocolo de Campo venha a ser utilizada por gestores da qualidade das águas das bacias hidrográficas. Para isso foi utilizado o Protocolo de Campo composto por 11 indicadores, também foi feito uma análise exploratória dos parâmetros de qualidade dos Biossistemas das nascentes da Sub Bacia de Posses em Extrema - MG, para isso foram coletadas amostra de águas das nascentes, medição da vazão e análise do número mais provável de coliformes. Os dados obtidos pelo Protocolo de Campo demonstraram que dos 109 Biossistemas de Nascentes analisados, 64 se enquadraram como Perturbado, 41 como Conservados e apenas 4 atingiram a pontuação para se enquadrar como Preservado, sendo que nenhum dos Biossistemas das Nascentes estudados se enquadraram na categoria Degradada, porém notou-se que o entorno das nascentes é ocupado em sua grande maioria por pastagem sendo 92,66%, seguido por Eucalipto com 7,34%, apresentaram fisionomia herbácea 43,12%, fisionomia arbustiva entre 1 a 5 metros 43,12% e 13,76% fisionomia arbustiva acima de 5 metros, contudo mais de 90% dos Biossistemas das Nascentes analisados apresentaram ausência de lixo, ausência de fogo e ausência de assoreamento. / This research was developed in 2015 at 109 water springs of the sub basin from Posses, Extrema, MG, that are inserted at Jaguari\'s River basin. The result is that the water spring\'s biosystem is composed by a group of biological, ecological and geological functions, and they interact with each one and they are completed with antropic action and the hydrological cycle. The objective of this research was to present a practical tool of management, and that must be objective and efficient to analyze the quality of water spring\'s biosystem, based on studies and analysis of the indicators that involves it\'s dynamic, doing the interaction between ecological, social and anthropical dimensions very important, organizing the aspects in a quantitative and qualitative form and the objective must be identify in each level of conservation is the water spring\'s biosystem analized, after that the analyzis tool named by \"Protocolo de Campo\" will be used by water quality managers. To get this, the \"Protocolo de Campo\" was composed by 11 indicators and a research of the quality parameters of the water spring\'s biosystems from Posses in Extrema - MG was made too, for this were collected water samples at the water springs, flow measurement and analysis of the most probable number of coliforms. The data obtained in the field by the \"Protocolo de Campo\" revealed that of the 109 water spring\'s biosystems analized, 64 are in the \"disturbed group\", 41 are in the \"conserved group\" and only 4 are in the \"preserved group\". None of them is in the \"degraded group\", but the research has noticed that the surroundings of the water springs is ocuppied in the most by pasture, being 92,66%, eucalyptus, being 7,34%, they represent 43,12% of herbaceous physiognomy, 43,12% represent shrub physiognomy between 1 and 5 meters and 13,76% represent shrub physiognomy above 5 meters, even more than 90% of the water spring\'s biosystem analized presented absence of rubbish, absence of fire and absence of silting.