Os cloroplastos são organelas exclusivas de plantas e algas fotossintetizantes, e desempenham funções essenciais na fisiologia e metabolismo vegetal, principalmente a fotossíntese e outras rotas biossintéticas. Além do núcleo e das mitocôndrias, os plastídios possuem seu próprio genoma (plastoma), envolvido na coordenação destes três distintos mas interdependentes sistemas genéticos das células vegetais. O DNA cloroplastidial existe como moléculas circulares fechadas de aproximadamente 150 kb (±30), geralmente apresentando sequências repetidas invertidas, separando duas regiões de cópia única. Através da construção de bibliotecas shot-gun a partir do DNA cloroplastidial e do sequenciamento automático de 6266 clones, o plastoma de cana-de-açúcar (híbrido SP 80-3280) foi completamente sequenciado e as regiões codificadoras anotadas por homologia a outros sistemas vegetais. Por análises comparativas entre o plastoma de cana-de-açúcar e os de outras espécies, observou-se que todos os grupos funcionais de genes cloroplastidiais de milho foram localizados no plastoma de cana-de-açúcar, como também ycf's deste plastoma e de outras espécies, embora estas sequências não tenham função conhecida. Verificou-se, ainda, maior identidade entre os plastomas de cana-de-açúcar e milho do que entre cana- de-açúcar e arroz com base na organização estrutural e na regulação da expressão gênica (edição de mRNA). Os resultados sugerem uma evolução comum entre os plastomas das gramíneas C4, gerando novos elementos para a pesquisa deste tipo de fotossíntese e metabolismo dos plastídeos, assim como para a tecnologia de transformação de cloroplastos de cana-de-açúcar. / not available

Na região de Piracicaba, grande parte dos pequenos produtores cultivam cana-de-açúcar em áreas de alta declividade, mas a mecanização da colheita tem inviabilizado seu cultivo nesta condição. Sistemas agroflorestais (SAFs) podem ompatibilizar a produção da cultura neste cenário, com a conservação de recursos naturais, porém, há falta de pesquisa sobre seu cultivo nestes sistemas. Portanto, o uso de modelos de simulação e avaliações de campo da interface árvore-cultura podem desempenhar importante papel para investigar seus potenciais e restrições. Assim, identificamos e selecionamos terras e árvores para cultivo dos SAFs e avaliamos o crescimento e produção de plantas dos SAFs cana-de-açúcar x seringueira e cana-de-açúcar x eucalipto. Realizamos dois experimentos de campo e utilizamos o modelo WaNuLCAS e um modelo que simula a disponibilidade de radiação para culturas intercalares, acionando-o com a produção de matéria seca da cultura. SAFs em aléias em contorno são alternativa viável para cultivo de cana-de-açúcar no município de Piracicaba, havendo diversas espécies arbóreas exóticas e nativas que podem compor estes SAFs, destacando-se seringueira e eucalipto. Luz e água são limitantes ao crescimento da cultura e há aumento da competição de acordo com o crescimento das árvores. A importância relativa entre competição abaixo e acima do solo depende da distância das árvores. Contudo, o SAF cana-de-açúcar x eucalipto tem produção semelhante ao monocultivo de cada espécie. Os modelos permitiram avaliar os SAFs e orientar experimentos, mas suas indicações devem ser verificadas em experimentos de campo. A recomendação dos SAFs deve ser feita após análise econômica dos mesmos. / In Piracicaba, many smallholders grow sugarcane in areas of high solpe, but the mechanization of the harvest process has made inviable its cultivation under this situation. Agroforestry systems (AFs) are an alternative that may join the cultivation of the crop under this scenario with conservation of natural resources. However, there is lack of research of its cultivation in AFs. Therefore, the use of simulation models and evaluation of on-farm tree-crop interfaces may play an important role to investigate its potentials and restrictions. Thus, we identified and selected lands and trees to the cultivation of the AFs and assessed plant growth and yield of sugarcane x rubber and sugarcane x eucalyptus AFs. We did two field experiments and used the WaNuLCAS model and another one that simulates the available irradiance for intercrops, related with their dry matter production. Contourhedgerows are a feasible alternative for sugarcane cultivation in Piracicaba, where many tree species may be part of it, especially rubber and eucalypts. Light and water are limiting factors for crop growth and competition increases with tree growth. The relative importance of each variable depends on the distance from the trees. However, the sugarcane x eucalyptus AF has similar production of the monocropping of each specie. The models allowed to assess the AFs and to drive field trials, but their results should be verified in experiments. The recomendation of the AFs should be done after their economic analysis.

Orientador: Marcelo Menossi Teixeira / Texto em português e inglês / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T15:47:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Farani_TiagoLuz_D.pdf: 5590005 bytes, checksum: 5a826906d504777afc8a4763b6863d0c (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A cana-de-açúcar é uma das mais importantes culturas vegetais do mundo, sendo o Brasil o principal produtor. A relevância mundial desta planta tem aumentado e muito tem sido investido na obtenção de variedades de cana-de-açúcar com maiores teores de sacarose e mais resistentes a estresses bióticos e abióticos. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar funcionalmente o gene ScCIPK8, relacionado ao acúmulo de sacarose em cana-de-açúcar. Com a finalidade de elucidar as redes de interação da proteína ScCIPK8, ensaios de duplo-híbrido em leveduras foram realizados. Foi identificado que a proteína ScCIPK8 interage com as proteínas ScCBL1, ScCBL3 e ScCBL6, mas não interage com as proteínas ScCBL2, ScCBL9 e ScCBL10. As interações identificadas em leveduras foram confirmadas in planta por ensaios de BiFC. No intuito de identificar alvos de interação diferentes das proteínas CBLs, foram realizados screenings de duas bibliotecas de cDNA transformadas em leveduras. Foram identificadas a interação da proteína ScCIPK8 com as porções C-terminal de uma provável proteína do tipo PP2C e de uma provável proteína MYC2. Avaliamos adicionalmente a resposta à seca do gene ScCIPK8 e dos seus alvos de interação através de ensaios de PCR em tempo real. O gene ScCIPK8 é induzido em uma variedade de cana-de-açúcar tolerante à seca após dois dias de estresse hídrico e é induzido após quatro dias de estresse hídrico, tanto na variedade sensível quanto na tolerante à seca. Por outro lado, o gene ScPP2C-1 é induzido apenas na variedade tolerante à seca após dois dias de estresse hídrico. As expressões dos genes ScCBL1 e ScCBL6 não foram alteradas de forma significativa nas condições testadas. Por outro lado, a expressão do gene ScCBL3 foi reprimida nas plantas da variedade tolerante sob quatro dias de seca e manteve-se inalterado em todas as outras condições testadas. Por fim, plantas transgênicas de Arabidopsis thaliana transformadas com o gene ScCIPK8 foram obtidas e avaliadas quanto à resistência a estresses hídrico e salino. Não foi verificada diferença significativa na tolerância das plantas transformadas com o gene ScCIPK8 em relação aos controles utilizados / Abstract: Sugarcane is one of the most important crop plants in the world and Brazil is the leading manufacturer. The world importance of sugarcane is increasing and much has been invested on obtaining better plants with increasing sucrose content and resistance to biotic and abiotic stresses. The present work aims to characterize the sugarcane ScCIPK8 gene involved in sucrose accumulation. To gain insights on the ScCIPK8 protein-protein interaction network, yeast two-hybrid assays were conducted. It was shown that ScCIPK8 protein interacted with ScCBL1, ScCBL3 and ScCBL6, but not with ScCBL2, ScCBL9 and ScCBL10. BiFC assays were conducted to confirm in planta the interactions observed in yeast cells. Yeast two-hybrid screenings using two different cDNA libraries were conducted to identify unknown targets of ScCIPK8 protein. It was shown that ScCIPK8 interacted with the C-terminal portions of a putative PP2C and a putative MYC2 protein. We also performed qPCR assays in order to evaluate the drought response of ScCIPK8 gene and its target genes. ScCIPK8 gene expression was induced in a tolerant sugarcane variety after two days of drought stress and was induced in both the sensitive and tolerant sugarcane varieties after four days of drought stress. On the other hand, ScPP2C-1 gene expression was induced in the tolerant variety after two days of drought stress. The expression of ScCBL1 and ScCBL6 was not significantly changed under the tested conditions, while ScCBL3 expression was repressed in the tolerant variety after four days of drought stress. Finally, Arabidopsis thaliana transgenic plants overexpressing ScCIPK8 were obtained and evaluated for their resistance to drought and salinity stresses. We could not observe any significant difference regarding drought tolerance between control and transgenic plants transformed with ScCIPK8 / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Orientador: Angela Antonia Kageyama / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Economia / Made available in DSpace on 2018-08-01T11:27:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Osakabe_Erika_M.pdf: 23082382 bytes, checksum: 1e9584fa7441bb5c48259c1c7e8dacaf (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo / Resumo: A região de Ribeirão Preto é conhecida como a principal produtora de açúcar e álcool do Estado de São Paulo, fato este que vem impulsionando a economia dos municípios que compõem a microrregião. Por muitos anos houve grande demanda de mão-de-obra para a colheita do produto, mas com a aceleração do processo de modernização das lavouras de cana-de-açúcar observado em meados dos anos 80, muitos trabalhadores passaram a perder seus postos de trabalho e conseqüentemente a garantia de seu sustento e dos membros de sua família.-Este trabalho teve como objetivo principal analisar as possibilidades de inserção desta mão-de-obra em atividades agrícolas e não-agrícolas dentro da própria região, além de analisar a participação de entidades públicas e privadas no encaminhamento profissional dos trabalhadores. A pesquisa verificou que o mercado de trabalho local vem reduzindo as chances de emprego setor agrícola e existem poucas chances de emprego para a mão-de-obra rural em atividades urbanas em função de seu baixo grau de instrução e de qualificação profissional. . Para que estes trabalhadores possam encontrar maiores e melhores oportunidades de emprego está havendo uma mobilização mais efetiva por parte de instituições públicas e privadas que estão procurando não somente dinamizar as economias locais a fim de gerar empregos, como também ofertar cursos de reeducação e requalificação profissional ao trabalhador rural. O esforço isolado ou em conjunto destas entidades pode permitir uma inserção mais rápida desta mão-de-obra no mercado de trabalho da região de Ribeirão Preto / Mestrado / Economia Agricola e Agraria / Mestre em Desenvolvimento Econômico

Orientador : Paulo Sergio Graziano Magalhães / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-02T06:23:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pagnano_NatashaBiagi_D.pdf: 2620910 bytes, checksum: 935521de60ba127a39d85c1173cf7366 (MD5) Previous issue date: 2001 / Doutorado

Orientadores : Anete Pereira de Souza, Antonio Augusto F. Garcia / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-02T11:28:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Meza_AndreiaNavarro_M.pdf: 5830431 bytes, checksum: 57161f50f0b38b6bfa7d29c79a1337eb (MD5) Previous issue date: 2002 / Mestrado

Orientador: Maria do Carmo Santos Guedes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-02T15:40:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leite_RosileyAlmeida_M.pdf: 28326494 bytes, checksum: a9cd6a2e553daf8e006c78b95ff437e1 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: A colheita de cana-de-açúcar crua mecanizada implica na inclusão de diversas impurezas como folhas, bainhas e palmito ao caldo extraído, cuja conseqüência é o aumento da cor do caldo e possível agregação dos compostos responsáveis por tal efeito nos cristais de açúcar. O presente trabalho teve por objetivos caracterizar os compostos fenólicos e flavonóides presentes nas folhas, bainhas e palmitos responsáveis pelo escurecimento; estimar a contribuição à cor da inclusão desses materiais ao caldo em termos de cor ICUMSA (lnternational Commission for Uniform Methods of Sugar,Analysis); e expor algumas reflexões sobre as conseqüências sociais da técniêa da colheita mecânica através de material da literatura e entrevistas. A fim de estudar a contribuição à cor pela incorporação de extratos de bainha, folha e palmito, realizou-se dois tratamentos com o caldo de cana misto: nas proporções de % (Tratamento I) e 1/3 (Tratamento 11)do teor fenólico presente no caldo observou-se uma variação de -1,47 %, 44,22 % e 98,87%, e 39,46 %, 75,02 e 110,47%, respectivamente, na cor ICUMSA do caldo misto (14°Brix). Após a clarificação do caldo, estas mudanças foram de 23,13 %,15,20 % e 62,31 % (Tratamento I) e 26,88 %, 37,12 % e 38,28 % (Tratamento 11), respectivamente, em relação ao controle ¿Observação: O resumo, na íntegra poderá ser visualizado no texto completo da tese digital. / Abstract: The mechanical harvesting of sugarcane implies in the inclusion of imputities such as leaves, sheaths and tops in the cane juice extracted, and consequent increase in the juice colour and possible aggregation of the compounds responsible for such an effect in the sugar crystals. The present work had the objectives of characterizing the phenolic compounds and fIavonoids present in the leaves, sheaths and tops responsible for the browning; to estimate the contribution to the colour from the inclusion of these materials into the cane juice in terms of ICUMSA colour; and to reflect on some of the social consequences of mechanical harvesting basead on articles available in the literature and from interviews. The incorporation of extracts from leaves, sheaths and tops in the proportion of % and 1/3 of the phenolic content present in the cane juice gave a variation of- 1.47 %, 44.22 % and 98.87% in Treatment I, and 39.46 %, 75.02 and 110.47% in Treatment II,respectively, of the ICUMSA colour of the mixed juice (14°Brix). After clarification, these changes were 23.13 %, 15.20 % and 62.31 % (Treatment I), and 26.88 %, 37.12 % and 38.28 % (Treatment II],respectively, as compared to the control ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations. / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Orientador : Luiz Antonio Viotto / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-02T21:46:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Costa_JosedeRibamarMacedo_M.pdf: 9679073 bytes, checksum: fb939fe9a8dad8e902bd2c782417f42c (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Caldo filtrado do lodo decantado da usina açucareira foi ultrafiltrado à temperatura de 40°C, até o fator de concentração FC2 em uma unidade piloto, utilizando uma membrana tubular de poli (fluoreto de vinilideno) da Ultraflow, modelo UFMl SP70, massa molar de corte 70 kDa, área efetiva de aproximadamente 0,12 m2, pressão máxima de 7,09x1O5Pa e temperatura máxima de 44,5°C. Amostras do material de alimentação, do retentado e do permeado a fatores de concentração FC1,5 e FC2 foram tomadas para análise de composição química e medidas de propriedades fisicas. Para as condições operacionais de pressão transmembrana na faixa de 0,91x1O5Pa e 1,62xl05 Pa e de velocidade tangencial entre 2,85 m/s e 3,4 m/s foi possível avaliar, através do planejamento experimental, o efeito destes parâmetros sobre a porcentagem de variação da cor do caldo filtrado, da turbidez, do teor de dextranas e sobre o fluxo global de permeado, também até fator de concentração FC2, obtendo-se uma redução de cor e de turbidez do material tratado de até 92% e 98,34%, respectivamente. Foi observada ainda uma redução do teor de dextranas no caldo processado de até 86,66%. Foi possível verificar que o aumento da pressão transmembrana e da velocidade tangencial melhorou o fluxo de permeado, sendo que à pressão de 1,62x1O5Pa e velocidade tangencial de 3,4 m/s foi obtido o maior fluxo global de permeado (17,33 kg/(h.m2». Para as condições operacionais estudadas, o teor de sólidos totais, açúcares totais, açúcares redutores e cinzas no permeado, não apresentaram mudanças significativas com relação ao material de alimentação / Abstract: Sugar mill filtered juice was ultra filtred within the temperature of 40°C, up to the concentration factor FC2 in a pilot unit, using a polivinilidene difluoride tubular membrane ITomUltraflow, model UFMl SP70, molecular weight cutt-off 70 kDa, permeation area of 0,12 m2, maximum pressure of7,09x1O5 Pa and maximum temperature of 44,5°C. Feeding material samples, retentate and permeate to concentration factors FC1,5 e FC2 were taken for chemical composition analyzes and physical properties measurements. For the operational conditions of transmembrane pressure on the 0,91x1O5Pa and 1,62x1O5Pa range and tangential velocity between 2.85 m/s and 3.4 m/s it was possible to evaluate, using the experimental design, the effects of these parameters over the percentage of color variation of the filtered juice, of the dextrans content, and over the permeated global flux, up to the concentration factor FC2 too, obtaining a color and turbidity reduction of the treated material up to 92% and 98,34%, respectively. It was also observed a reduction of dextrans within the processed juice up to 86,66%. It was possible to verify tOOtthe transmembrane pressure rising and tangential velocity improved the permeated flux, at the pressure rate of 1,62xl05 Pa and tangential velocity of3,4 m/s the highest permeated global flux was obtained (17,33 kg/(h.m2)). For the suited operational conditions, the total solid content, total sugar, sugar reductors, and ashes on permeate, did not presented significative changes when related to the feeding material / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos

Orientador: Roberto Herminio Moretti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-03T20:02:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Prati_Patricia_D.PDF: 12048386 bytes, checksum: 80275fe6548a12f5c9ac519595ad4c7e (MD5) Previous issue date: 2004 / Doutorado / Doutor em Tecnologia de Alimentos

Orientadores: Lucia Helena Innocentini Mei, Nelson Eduardo Duran Caballero / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:02:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camargo_FranciscoAdaode_M.pdf: 3870739 bytes, checksum: 8b29280a89ca929d036f6d26922403f0 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: A enorme quantidade de plásticos sintéticos, anualmente descartada, torna difícil prever um futuro da Humanidade sem uma política global para diminuir o impacto deste tipo de lixo no meio ambiente. Dessa maneira, muitos grupos de pesquisa têm buscado soluções que garantam um desenvolvimento sustentável, onde o Homem e o meio possam conviver sem causar prejuízos entre si. Com este princípio, buscamos neste trabalho o desenvolvimento de blendas biodegradáveis de polímeros naturais, com potencial para substituir alguns dos plásticos convencionais, contribuindo para o binômio produção versus preservação ambiental. Uma biomolécula natural utilizada foi a Lignina, uma macromolécula do bagaço de cana de açúcar, disponível em grande quantidade nos países tropicais como o Brasil. O outro componente da blenda, o copolímero de poli(hidroxibutirato-co-hidroxivalerato) ou PHBV, é um termoplástico natural, biodegradável e biocompatível. Blendas de Lignina: PHBV foram processadas num misturador Haake, e preparadas em várias porcentagens (m/m); isto é: (20:80)%, (40:60)%, (50:50)%; (60:40)%; (80:20)% e (0:100) %, respectivamente. A porcentagem (50:50)% foi escolhida para os estudos de propriedades mecânicas por apresentar boas características de resistência, sendo processada no misturador Haake, extrusora monorosca e injetada para a confecção dos corpos de prova. Foi estudada a biodegradação das amostras, em meio líquido e sólido, por ação dos fungos Trametes versicolor e Phanerochaete chrysosporium. A caracterização da Blenda 50:50% foi feita por infravermelho com transformada de Fourier(FT-IV); Calorimetria Diferencial Exploratória (DSC); Análise Dinâmico Mecânica (DMA); Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV); Análise Elementar e Ressonância Magnética Nuclear de Próton (RMN- H). Através dos resultados pode-se constatar que o material obtido foi susceptível à biodegradação com Trametes versicolor e Phanerochaete chrysosporium e apresenta um bom potencial pela rigidez apresentada para utilização na área de Engenharia, especificamente na área de ciências de materiais / Abstract: The great amount of synthetic polymers discharged every year in the urban solid waste is growing fast and makes difficult to see the future without a global politics to solve this environmental problem. In this way, many groups of researchers are studying solutions that may guarantee a sustainable development, where Man and Environment can live in a good balance. With this principle, the aim of this work was the development of biodegradable blends , using two natural polymers, with potencial to substitute some of those conventional polymers, contributing to the balance Production versus Environment. In this work, we used a natural biomolecule called Lignin, a macromolecule from sugar-cane bagasse that is abundant in tropical countries like Brazil. The other component of the blend was a copolymer of poly(hydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate) or PHBV, a natural biodegradable polyester, from polyhydroxyalKanoates¿ family (PHAs). Blends of Lignin:PHBV were processed in a mechanical mixer and prepared in several percentages (w/w) : (20:80)%, (40:60)%, (50:50)%; (60:40)%; (80:20)% e (0:100) % , respectively. The blend corresponding to (50:50)% was chosen for the studies of mechanical properties for presenting appropriate characteristics for the study, than the other mixtures, being processed in a single screw extruder and injected to obtain ASTM (D 638) specimens for mechanical tests. The samples biodegradation was studied in liquid and solid medium, in the action of Trametes versicolor and Phanerochaete chrysosporium, a kind of fungi. The blend (50%:50%) characterization was done by Infrared spectroscopy (FT-IR), Differential Scanning Calorimetric (DSC), Mechanical Dynamic Analysis (DMA); Scanning Electron Microscopy (SEM), Nuclear Magnetic Resonance of Proton (H-NMR,) elementary analysis and Thermogravimetry. Through the results it may be seen that the material obtained is susceptible to biodegradation by Trametes versicolor and Phanerochaete chrysosporium, a kind of whiterot fungi, and it presents a good potential for application in the engineering field / Mestrado / Mestre em Engenharia Química