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Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica / Canalization: phenotype robustness as consequence of characteristics of the gene regulatory network

Vitor Hugo Louzada Patricio 20 April 2011 (has links)
Em sistemas biológicos, o estudo da estabilidade das redes de regulação gênica é visto como uma contribuição importante que a Matemática pode proporcionar a pesquisas sobre câncer e outras doenças genéticas. Neste trabalho, utilizamos o conceito de ``canalização\'\' como sinônimo de estabilidade em uma rede biológica. Como as características de uma rede de regulação canalizada ainda são superficialmente compreendidas, estudamos esse conceito sob o ponto de vista computacional: propomos um modelo matemático simplificado para descrever o fenômeno e realizamos algumas análises sobre o mesmo. Mais especificamente, a estabilidade da maior bacia de atração das redes Booleanas - um clássico paradigma para a modelagem de redes de regulação - é analisada. Os resultados indicam que a estabilidade da maior bacia de atração está relacionada com dados biológicos sobre o crescimento de colônias de leveduras e que considerações sobre a interação entre as funções Booleanas e a topologia da rede devem ser realizadas conjuntamente na análise de redes estáveis. / In biological systems, the study of gene regulatory networks stability is seen as an important contribution that Mathematics can make to cancer research and that of other genetic diseases. In this work, we consider the concept of ``canalization\'\' as a consequence of stability in gene regulatory networks. The characteristics of canalized regulatory networks are superficially understood. Hence, we study the canalization concept under a computational framework: a simplified model is proposed to describe the phenomenon using Boolean Networks - a classical paradigm to modeling regulatory networks. Specifically, the stability of the largest basin of attraction in gene regulatory networks is analyzed. Our results indicate that the stability of the largest basin of attraction is related to biological data on growth of yeast colonies, and that thoughts about the interaction between Boolean functions and network topologies must be given in the analysis of stable networks.
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A reinserção dos cursos de água em áreas urbanas. Estudo de caso: Microbacia do Córrego Jataí - Uberlândia /MG / The reinsertion of the watercourses in urban areas. Case study: the Stream watershed Jataí - Uberlândia/MG

Calderari, Elaine Saraiva 18 January 2012 (has links)
The main objective of this work is to promote the reinsertion of urban water in the context of physical and territorial planning, in the cities, through the study of the watershed of Jataí stream in Uberlândia-MG. Pursuiting the rebalancing of the waters with the urban environment, this work promote the connectivity and physical strengthening of the relations between man and environment / nature. The study analyzed the environmental impacts generated in the watershed with the process of urbanization and infrastructure works carried out in the stream and surrounding areas. Simulation of 4 (four) scenarios were proposed and hydrological parameters were raised in a natural conditions (before the urbanization process), as far as current urbanization, complete urbanization and ideal urbanization. To develop this ideal scenario, direct and preventive urban interventions were proposed, through the inclusion of an ecological and sustainable urban design, with the use of green infrastructure, such as parks and green areas, based on the principles of an environmental planning and structured in an Ecological-Economic Zoning (EEZ) of the watershed of Jataí stream. The results were compared and evaluated in an integrated manner, with the use of remote sensing techniques and the guidelines adopted showed a positive result in the hydrological simulations, with the significant increase in permeability, time of concentration and reduction of peak flows, showing, respectively, in the scenarios A, B, C and D the following values: 2,81 m3/s, 19,70 m3/s, 51,24 m3/s, and 15,15 m/3s.Thus, it is understood that, through the control of the permeation rates, considering only the areas of public use, such interventions are sufficient to promote significant effects on the control of direct runoff and flooding, allowing the minimization of environmental impacts. / O objetivo principal deste trabalho foi promover a reinserção das águas urbanas no contexto do planejamento físico-territorial nas cidades, por meio do estudo da microbacia do córrego Jataí, na cidade de Uberlândia-MG, com a busca do reequilíbrio das águas com o meio urbano, promovendo a conectividade e o fortalecimento das relações físicas e ambientais entre homem/natureza. O estudo analisou os impactos ambientais gerados na microbacia com o processo de urbanização e as obras de infraestrutura realizadas no córrego e no entorno. Foram propostas as simulações de 4 (quatro) cenários e levantados os parâmetros hidrológicos na condição natural (anterior ao processo de urbanização), urbanização atual, urbanização completa e urbanização ideal. Para elaboração do cenário ideal, foram propostas diretrizes para intervenções urbanas preventivas e diretas, por meio da inserção de um desenho urbano ecológico e sustentável, com a inserção de parques e áreas verdes e a utilização de infraestruturas verdes, baseadas nos princípios de planejamento ambiental e estruturadas em um Zoneamento Ecológico-Econômico (ZEE) da microbacia do córrego Jataí. Os resultados foram comparados e avaliados de forma integrada com a utilização de técnicas de sensoriamento remoto, e as diretrizes adotadas apresentaram um resultado positivo nas simulações hidrológicas, com o aumento significativo das taxas de permeabilidade, aumento no tempo de concentração e a diminuição dos picos de vazões, apresentando respectivamente nos cenários A, B, C e D, os seguintes valores: 2,81 m³/s, 19,70 m³/s, 51,24 m³/s e 15,15 m³/s. Assim entende-se que por meio do controle da taxa de permeabilidade considerando apenas as áreas destinadas ao uso público, são suficientes para promoverem efeitos significativos no controle do escoamento superficial direto e inundações, permitindo a minimização dos impactos ambientais. / Mestre em Engenharia Civil

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