A seleção de genitores para cruzamentos é uma das etapas mais importantes em programas de melhoramento, onde a predição do potencial genético das combinações híbridas permite ao melhorista canalizar recursos humanos e financeiros em populações superiores. Neste sentido, objetivou-se com o presente trabalho, estimar a capacidade geral (CGC) e específica de combinação (CEC) de sete genótipos de soja em duas gerações (F1 e F2), segundo a metodologia de Griffing (1956), sem os recíprocos, a fim de indicar genitores e combinações híbridas promissoras. Os híbridos F1, populações F2 e os genitores foram avaliados em Gurupi-TO, sendo a geração F1, com os respectivos genitores, avaliada em casa de vegetação e a geração F2 em campo. Os atributos mensurados foram número de dias para florescimento e maturação, número de sementes por vagens, número de vagens por planta, massa de cem grãos e produtividade de grãos por planta. Para todos os atributos foi detectado efeito significativo para CEC, nas duas gerações. Os resultados da análise dialélica foram concordantes nas gerações F1 e F2. Os genitores M-8360 e A-7002 reúnem alelos favoráveis à diminuição do número de dias para florescimento e número de dias para maturação em soja. A hibridação M-8360 x BRS Valiosa é promissora à obtenção de linhagens de soja com ciclo precoce. Os genitores M-8360 e M-8867 são promissores como genitores em programas de melhoramento populacional voltados a incrementos nos componentes de produção, bem como a hibridação entre os mesmos para obtenção de populações segregantes superiores / The parent selection for crossings is one of the most important steps in breeding programs where the prediction of the genetic potential of hybrids allows the breeder to channel human and financial resources at higher populations. In this sense, the objective of this study was to estimate the general (GCA) and specific combining ability (SCA) of seven soybean genotypes, in two generations (F1 and F2), according to Griffing (1956) without the reciprocals, in order to indicate parents and hybrid combinations that are promising to achieve new favorable combinations. The F1 hybrids, F2 populations and the parents were evaluated in Gurupi-TO, being the generation F1 evaluated in greenhouse and the F2 generation in the field. The measured parameters were number of days to flowering and of number days to maturity, number of seeds per pod, number of pods per plant, weight of hundred seeds and grain yield per plant. For all attributes was detected significant effect for SCA. The results of the diallel analysis were concordant in the F1 and F2 generations. The M-8360 and A-7002 parents gather alleles favorable to reducing the number of days to flowering and number of days to maturity in soybean. Hybridization M-8360 x BRS Valiosa is promising to obtain early cycle soybean strains. The M-8360 parent is promising for population improvement programs. Hybridization M-8867 x M-8360 is promising for formation of superior segregants.

Dengue é uma doença infecciosa não contagiosa causada pelo vírus da dengue (gênero Flavivirus, família Flaviviridae), transmitida pela picada de artrópodes do gênero Aedes, principalmente Aedes aegypti, e sendo atualmente um importante problema de saúde pública em todo o mundo. Segundo a Organização Mundial de Saúde, cerca de 50 a 100 milhões de pessoas se infectam anualmente em mais de 100 países de todos os continentes. A dengue apresenta-se em três formas clínicas principais; doença febril indiferenciada, febre clássica do dengue (DF) e dengue hemorrágico com ou sem choque (DHF/DSS). Recentemente, viu-se um dramático aumento do número de casos de DHF/DSS nas Américas, e este aumento coincidiu com a introdução do dengue tipo 3, genótipo III. Neste trabalho, caracterizamos completamente o genoma de um vírus brasileiro de dengue tipo 3 (D3BR/RP1/2003) isolado de um paciente com dengue clássica. O genoma viral possui um tamanho de 10707 nucleotídeos e contém uma única região codificadora (posição 95 a 10264) flanqueada por duas regiões não codificadoras (RNC5, 1 a 94; RNC3, 10268 a 10707). A comparação do genoma viral com outros vírus isolados de pacientes com DF e DHF não mostrou diferenças significativas que sugerissem a presença de um fator genético associado à virulência. A analise filogenética baseada no genoma completo, mostra que a cepa D3BR/RP1/2003 pertence ao genótipo III e encontra-se proximamente relacionada a outro vírus isolado no Rio de Janeiro em 2002. Entretanto, quando essa análise filogenética é realizada com as regiões codificadoras das proteínas E e NS5 individualmente, a cepa D3BR/RP1/2003 encontra-se mais proximamente relacionada a um vírus isolado na Ilha de Martinica no Caribe. Este achado sugere que o isolado D3BR/RP1/2003 pode ter sido originado através de um evento de recombinação entre duas cepas virais distintas antes ou após sua introdução no Brasil. Dados sugestivos de recombinação foram observados também quando analisada a relação filogenética entre vírus isolados na Ásia. / Dengue is an infectious disease caused by dengue virus (genus Flavivirus, family Flaviviridae), transmitted by the bite of arthropods of the Aedes genus, mainly Aedes aegypti, and being currently an important problem of public health worldwide. According to the World Health Organization, about 50 the 100 million people are infected annually in more than 100 countries of all continents. Dengue can be presented in three main clinical forms; undifferentiated febrile illness, classic dengue fever (DF) and hemorrhagic dengue fever with or without shock (DHF/DSS). Recently, a dramatically increase of DHF/DSS cases in the Americas have been seen, and this increase coincided with the introduction of the dengue type 3, genotype III. In this work, we have completely characterized the genome of a Brazilian dengue type 3 (D3BR/RP1/2003 strain) isolated from a DF patient. The viral genome possesses a size of 10707 nucleotides and has a unique open reading frame (position 95 to 10264), flanked by two untranslated regions (UTR5\', 1 to 94; UTR3\', 10268 to 10707). The comparison of the viral genome with other viruses isolated from patients with DF and DHF did not show significant differences to suggest the presence of a genetic factor associate with virulence. Phylogenetic analysis based on the complete genome showed that D3BR/RP1/2003 strain belongs to genotype III and is close related to another virus isolated in Rio de Janeiro in 2002. However, when the phylogenetic analysis was based on the individual coding regions of E and NS5 proteins, D3BR/RP1/2003 strain was closely related to a virus isolated in the Island of Martinique in the Caribbean. This finding suggests that D3BR/RP1/2003 strain could have been originated through an event of recombination between different virus strains before or after its introduction to Brazil. Data supporting recombination events between viruses isolated in Asia have also been observed.

Orientador: Arlene Cristina Aguilar / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Física, 2012

CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Este trabalho tem como objetivo mostrar que o conjunto dos nÃmeros reais à um corpo ordenado completo e que, a menos de um isomorfismo, à Ãnico. Este trabalho à voltado para todos aqueles que tenham interesse em MatemÃtica, sobretudo, para os professores de MatemÃtica do ensino mÃdio que utilizam as propriedades do conjunto dos nÃmeros reais sem conhecer a teoria matemÃtica envolvida. Para tanto, à necessÃrio caracterizar o conjunto dos reais a fim de provar suas propriedades. Aqui, utilizamos duas construÃÃes, a saber: os reais via sequÃncias de Cauchy devido a Cantor e os reais via Cortes de Dedekind. A partir dessas caracterizaÃÃes, conseguimos construir um corpo K munido das operaÃÃes de soma e multiplicaÃÃo onde mostramos que ele cumpre as condiÃÃes da definiÃÃo de corpo. Definida uma relaÃÃo de ordem em K, mostramos que tal corpo à ordenado e, alÃm disso, conseguimos mostrar que todo subconjunto de K admite supremo, o que quer dizer que tal corpo à completo. Finalmente, mostramos que qualquer outro corpo ordenado completo que possa, por ventura, existir à uma mera caracterizaÃÃo de ℝ, o que quer dizer que ℝ à Ãnico, a menos dessas possÃveis outras caracterizaÃÃes. Tal caracterizaÃÃo serà chamada de isomorfismo que à uma funÃÃo bijetora de ℝ para K. / This work aims to show that the set of real numbers is a complete ordered field that, within an isomorphism, is unique. This work is aimed at all those who are interested in mathematics, especially for that high school math teacher who uses the real numbers of the set of properties without knowing the mathematical theory involved. Therefore, it is necessary to characterize the set of the real in order to prove their properties. Here, we use two buildings, namely: the real via Cauchy sequences due to Cantor and the real via Dedekind cuts. From these characterizations, we can build a field K equipped with the addition and multiplication operations which show that it meets the definition of field conditions. Set an order relation in K, we show that such a body is ordered and in addition, we show that every subset of K admits supreme, which means that such a field is complete. Finally, we show that any complete ordered field that can, perchance appear is a mere characterization of ℝ, which means that ℝ is unique, unless these possible other characterizations. This characterization will be called isomorphism which is a function bijetora of ℝ to K.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-08-28T17:49:12Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Numeros Reais Um Corpo Ordenado Completo.pdf: 4328358 bytes, checksum: 5062827ca2822fd04229310850171740 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-28T17:49:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Numeros Reais Um Corpo Ordenado Completo.pdf: 4328358 bytes, checksum: 5062827ca2822fd04229310850171740 (MD5) Previous issue date: 2013-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This paper aims to expand knowledge about the real numbers, providing a new perspective on their conceptual construction. Initially, covers up some historical facts that were of utmost importance in the process of conceptual evolution of the real numbers. Secondly, through the development of theories of abstract algebra, sets and mathematical analysis, is used a axiomatic method to expose the complete ordered field of real, stating and proving some of its properties. Finally, we discuss some relevant aspects of the correspondence between the real field and line, and also the correspondence between the real field and decimals. / Este trabalho tem como objetivo ampliar os conhecimentos sobre os números reais, proporcionando uma nova perspectiva sobre sua construção conceitual. Inicialmente, aborda-se alguns fatos históricos que foram de maior importância no processo da evolução conceitual dos números reais. Posteriormente, por meio do desenvolvimento das teorias de álgebra, de conjuntos e de análise matemática, utiliza-se de um método axiomático para expor uma construção do corpo ordenado e completo dos reais, enunciando e provando algumas de suas propriedades. Finalmente, abordam-se alguns aspectos relevantes da correspondência entre o corpo dos reais e a reta, e ainda da correspondência entre o corpo dos reais e os decimais.

Due to the changes in the business atmosphere, it is necessary to apply business concepts to the agricultural activities with the purpose of becoming the primary production economically viable. Before that, to analyze different production systems in the complete cycle of bovine culture slaughter is necessary so the producers can take decisions in their economical activity. Based on the scenery that is the complete cycle bovine cattle breeding, it was realized a multicase study in three properties, located in Rio Grande do Sul Central Depression, with different production systems (traditional, intensive and integrated with farming). In this context, the aim of this study was to verify the current profitability, to verify the items that more participate in the costs of each property, to compare the results among the different production systems, to simulate new situations with different productive indexes, to identify the points that limit the profitability and to suggest alternatives to increase the profitability. The simulations were made based on a stable flock, using the indexes and prices observed in the multicase study. It follows that no system was economically viable to the extent of generating a minimum remuneration of the capital invested in the soil. The integrated system was the one that presented better result, followed by the intensive one, and the only that presented positive result in 2004. In the traditional, the work force item was the one that more influenced the costs; while in the other two systems were the feeding. However, the farming and cattle breeding integration was essential to the cost reduction with feeding and administrative expenses dilution. The reduction of one year in the slaughter age, among the simulated parameters, would be what more affects the profitability positively, if additional costs were not considered to be reached. In the three production systems, the simulated results with the one year reduction in the couple age or the capacity increase in 30 kilograms of live weight for hectare, without considering additional costs, would present increase at the same profitability magnitude. / Devido às mudanças no ambiente de negócios, faz-se necessário aplicar conceitos empresariais às atividades agropecuárias com a finalidade de tornar a produção primária economicamente viável. Diante disso, analisar diferentes sistemas de produção, na bovinocultura de corte ciclo completo, é necessário para que os produtores possam tomar decisões frente à sua atividade econômica. Baseado no cenário que se encontra a pecuária bovina de ciclo completo, realizou-se um estudo de multicaso em três propriedades, situadas na Depressão Central do Rio Grande do Sul, com diferentes sistemas de produção (tradicional, intensivo e integrado com lavoura). Neste contexto, o objetivo deste estudo foi constatar a lucratividade atual, verificar os itens que mais participam nos custos de cada propriedade, comparar os resultados entre os diferentes sistemas de produção, simular novas situações com diferentes índices produtivos, identificar os pontos que limitam a lucratividade e sugerir alternativas para aumentar a rentabilidade. As simulações foram feitas com base num rebanho estável e utilizando os índices e preços observados no estudo de multicaso. Concluiu-se que nenhum sistema foi economicamente viável a ponto de gerar uma remuneração mínima do capital investido na terra. O sistema integrado foi o que apresentou melhor resultado, seguido do intensivo, e o único que apresentou resultado positivo no ano de 2004. No tradicional, o item mão de obra foi o que mais influiu nos custos, enquanto que nos outros dois sistemas foi a alimentação. Entretanto, a integração lavoura-pecuária foi essencial para a redução dos custos com alimentação e diluição das despesas administrativas. A redução de um ano na idade de abate, dentre os parâmetros simulados, seria o que mais afetaria positivamente a rentabilidade, se não forem considerados custos adicionais para ser alcançado. Nos três sistemas de produção, os resultados simulados com a redução de um ano na idade de entoure ou aumento da carga animal em 30 quilogramas de peso vivo por hectare, sem considerar custos adicionais, apresentariam aumento na mesma magnitude da rentabilidade.

Introduction: Bioceramics have been studied for their ability to emit long infrared radiation producing non-thermal and thermal effects, with several biological activities. Objective: To evaluate the effects of bioceramics on peripheral inflammation in mice, as well as to analyze the possible neurobiological mechanism involved in this effect. Methods: Swiss male mice injected with CFA in the paw were submitted to bioceramic treatments by means of contact with a ceramic impregnated pad that, under paw heat, radiates far infrared. Six groups (n = 8) of animals were randomly distributed into naive, control group and treated by exposure (radiation) to the bioceramics for 30, 60, 120 minutes or by continuous exposure. Edema formation, Mechanical and thermal hyperalgesia were analyzed using behavioral tests, i.e., the von Frey test, a hot plate and a micrometer (paw thickness), respectively. In the biochemical analyzes the local tissue (paw) concentrations of pro and anti-inflammatory cytokines were measured by the ELISA method. In the oxidative stress analyzes, parameters related to oxidative damage (TBARS and carbonylated proteins), antioxidant defense (SOD and CAT) and inflammation (myeloperoxidase and nitrite / nitrate concentrations) were analyzed by spectrophotometry. Intraplantar administrations of AM281 or AM630 (cannabinoid), caffeine and DPCPX (adenosine), naloxone (opioid) were used to investigate the endogenous pain control systems involved in the antihyperalgesic activity of bioceramics. Results: Bioceramic treatment reduced edema, as well as mechanical and thermal hyperalgesia. In addition, it decreased TNF-α and IL-1β concentrations and increased IL-10. The treatment also decreased oxidative damage and increased the activity of antioxidant enzymes. Activation of μ-opioid receptors, A1, CB1 and CB2 appear to mediate the antihyperalgesic effect of bioceramics. Conclusion: Material impregnated with bioceramics has anti-hyperalgesic and antiedematogenic activity in vivo. This antihyperalgesic effect seems to be related to its antioxidant and anti-inflammatory activities, as well as its ability to activate endogenous pain control systems. / Submitted by Ralph Fernando Rosas (ralph.fernando@unisul.br) on 2018-01-10T19:19:10Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5) Tese Ralph.pdf: 2333014 bytes, checksum: 4f908be9d81a609616c758dde27e1f72 (MD5) / Approved for entry into archive by Silvane Cauz (silvane.cauz@unisul.br) on 2018-02-06T12:45:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5) Tese Ralph.pdf: 2333014 bytes, checksum: 4f908be9d81a609616c758dde27e1f72 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-06T12:45:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5) Tese Ralph.pdf: 2333014 bytes, checksum: 4f908be9d81a609616c758dde27e1f72 (MD5) Previous issue date: 2017 / Biocerâmicas têm sido estudadas por sua capacidade de emitir radiação de infravermelho longo que produz efeitos não-térmicos e térmicos, com diversos efeitos biológicos. Objetivo: Avaliar os efeitos da biocerâmica na inflamação periférica, bem como analisar o possível mecanismo neurobiológico envolvido nesse efeito. Métodos: O modelo de inflamação periférica persistente usado foi induzido por CFA. Foram utilizados camundongos Swiss de ambos os sexos. Foi injetado 20 μl desta solução na pata direita de cada animal. O tratamento foi realizado com uma almofada de PVC de milho (colocada abaixo da maravalha) impregnada com cerâmica que, sob estímulo térmico, irradiava infravermelho. Para os testes comportamentais, os animais foram distribuídos nos grupos (n=8): naives, controles, animais submetidos ao CFA e expostos à biocerâmica por 30, 60 e 120 minutos e exposição contínua. A hiperalgesia mecânica foi avaliada utilizando monofilamentos de von Frey; a hiperalgesia térmica ao calor utilizando o teste da placa quente; o edema da pata com micrômetro e pletismômetro digital; a análise das concentrações de citocinas utilizou-se o método de ELISA. Para as análises bioquímicas, as superfícies ventrais (pele) das patas posteriores direitas dos animais foram utilizadas. Para avaliação do dano oxidativo e sistema antioxidante de defesa foram avaliadas a peroxidação lipídica endógena, determinadas as atividades das enzimas superóxido dismutase, catalase, a concentração nitrito/nitrato, a atividade da enzima mieloperoxidase e o dano oxidativo a proteínas carboniladas. O envolvimento dos sistemas canabinoidérgico, adenosinérgico e opioidérgico, no efeito da biocerâmica foram investigados. Conclusão: Os resultados demonstraram que a biocerâmica reduz a dor de origem inflamatória, pois diminuiu a hiperalgesia mecânica juntamente com a hiperalgesia térmica e o edema de pata. Além disso, diminuíram-se os níveis das concentrações das citocinas pró-inflamatórias (TNF-α e IL-1β) e aumentaram-se da anti-inflamatória (IL-10). Também, houve diminuição do dano oxidativo com aumento da atividade das enzimas antioxidantes. Os sistemas citados estão envolvidos no efeito anti-hiperalgésico. Neste sentido, estes dados fornecem à literatura essenciais subsídios do efeito terapêutico da biocerâmica para o direcionamento de futuros ensaios clínicos.

Os rotavírus do grupo A (RVA) são importantes causadores de diarreias virais em crianças e animais jovens de diferentes espécies, com impactos na saúde pública e animal. Visando contribuir para o entendimento e prevenção das rotaviroses assim como suas possíveis relações zoonóticas, caracterizou-se os 11 segmentos de dsRNA de rotavírus codificadores das proteínas estruturais e não estruturais presentes em amostras fecais positivas de suínos coletadas nos anos de 2012-2013, em 2 estados brasileiros. Mediante o emprego de RT-PCR, sequenciamento nucleotídico e análises filogenéticas, todos os segmentos genéticos oriundos de 12 amostras de RVA detectados em suínos foram analisados e comparados com os de outras amostras descritas previamente. As sequências obtidas para os genes codificadores das proteínas NSP2, NSP3 e VP6 contemplaram a open reading frame (ORF) completa do gene, enquanto que a ORF parcial foi determinada para os genes codificadores das proteínas VP1, VP2, VP3, VP4, VP7, NSP1, NSP4, NSP5 e NSP6. Os genotipos de rotavírus suíno provenientes das regiões amostradas concordam com os mais frequentemente descritos nesta espécie animal, apresentando, assim, uma matriz genética suína com a maioria dos segmentos pertencentes à constelação genotípica 1, com exceção dos genes codificadores das proteínas VP6 e NSP1, os quais foram os genotipos I5 e A8, respectivamente. Apesar de predominar o genotipo 1 (Wa-like) nas sequências deste estudo, a análise genômica sugere a existência de uma variação intragenotípica no genoma do rotavírus do grupo A atualmente circulante nas populações suína amostradas dos estados de São Paulo e Mato Grosso. Adicionalmente, buscou-se identificar os aminoácidos relacionados com a adaptação dos rotavírus no hospedeiro e assinaturas genéticas que distinguissem RVA suíno e humano. Para isso, as sequências obtidas neste estudo foram comparadas com outras cepas de RVA detectadas nestas duas espécies e pertencentes ao genotipo 1 (Wa-like) disponíveis no Genbank. Como resultados foram encontrados mais de 75 sítios de mudanças deaminoácidos que diferenciam RVA suíno e humano além de sítios de substituiçãopresentes em algumas proteínas virais que frequentemente covariaram entre elas. Estes resultados proporcionam um maior entendimento da diversidade viral circulante em unidades de produção suína e uma melhor compreensão dos animaiscomo reservatórios genéticos de cepas de rotavírus emergentes em humanos. / Group A rotaviruses (RVA) are leading causes of viral diarrhea in children and in the young of many animals species with impacts on public and animal health. To contribute to the understanding and prevention of rotaviruses as well as its possible zoonotic relationships, it was characterized the 11 segments of dsRNA rotavirus encoding the structural and nonstructural proteins present in positive fecal samples from pigs collected in the years 2012-2013 in 2 Brazilian states. Using RT-PCR, nucleotide sequencing, and phylogenetic analyses, all gene segments from 12 RVA samples detected in pigs were analyzed and compared with the other samples as described previously. The sequences obtained for the NSP2, NSP3, and VP6 coding genes covered the complete open reading frame (ORF), while the partial ORF was determined for the VP1, VP2, VP3, VP4, VP7, NSP1, NSP4, NSP5 and NSP6 coding genes. The genotypes of porcine rotavirus from the sampled regions agree with the most frequently reported in this species, presenting thus a porcine-RVA-like backbone with most segments being designated as constellation genotype 1, with the exception of the VP6 and NSP1 coding genes, which were genotypes I5 and A8, respectively. Although genotype 1 (Wa-like) sequences were predominant in this study, the genomic analysis suggests the existence of a intragenotypic variation in group A rotavirus genome currently circulating in swine populations sampled in the states of São Paulo and Mato Grosso. In addition, we sought to identify the amino acids related to the adaptation of rotavirus in the host and genetic signatures that distinguish RVA pig and human. For this, the sequences obtained in this study were compared with other strains of RVA detected in these two species, belonging to genotype 1 (Wa-like) available in Genbank. The following results were found more than 75 sites of amino acid changes that differentiate RVA pig and human as well as substitution sites present in some viral proteins that often covaried between them. These results provide a greater understanding of the current viral diversity in swine production units and a better understanding of animals as genetic reservoirs emerging rotavirus strains in humans.

Johnsongrass mosaic virus (JGMV) é uma espécie do gênero Potyvirus. A sua distribuição geográfica, até o início da década de 1990, estava limitada à Austrália e aos Estados Unidos, onde causa doença em sorgo, milho e várias gramíneas. Em 2001, o JGMV foi detectado pela primeira vez no Brasil em amostras de híbridos e variedades de milho provenientes da região de Ribeirão Preto, SP mediante análise sorológica (DAS-ELISA), e em 2013 foi detectado mediante RT-PCR em amostras de Pennisetum purpureum provenientes do Estado da Bahia. Em Fevereiro de 2012 a Clínica Fitopatológica da ESALQ/USP recebeu amostras de Panicum maximum cv. Mombaça, com sintomas de mosaico, de São Luiz do Paraitinga, SP. Exames preliminares de contrastação negativa em microscópio eletrônico de transmissão indicaram a presença de partículas virais características de potyvirus. Diante disso, o principal objetivo deste trabalho foi caracterizar o agente etiológico associado às plantas doentes de capim Mombaça mediante testes biológicos, sorológicos e moleculares. Extratos foliares de plantas sintomáticas de capim Mombaça foram inoculados mecanicamente em 69 genótipos da família Poaceae. As avaliações foram feitas com base nos sintomas e por PTA-ELISA usando antissoro policlonal contra a proteína capsidial do potyvirus produzido nesse trabalho, após purificação do isolado viral. As espécies susceptíveis foram Brachiaria brizantha, B. decumbens, B. plantaginea, Cenchrus echinatus, Echinochloa colona, E. crus-galli, E. cruspavonis, Melinis minutiflora, Panicum maximum cv. Colonião, Pennisetum setosum, Rhynchelytrum repens, Rottboellia exaltata, Sorghum bicolor BRS 332, S. bicolor BRS 509, S. bicolor x S. sudanense BRS 802 e S. verticilliflorum. Espécies cultivadas como arroz, aveia, cana-de-açúcar, centeio, milho e trigo não foram infectadas com esse isolado. O peso molecular da proteína capsidial deste potyvirus foi estimado em cerca de 33 kDa por meio de Western blot. Sequência de nucleotídeos do genoma completo (9.885 nt) obtida neste estudo revelou identidade de 82,03% com a única sequência completa do genoma de um isolado do JGMV da Austrália, depositada no GenBank. A partir dessa sequência foram obtidos oligonucleotídeos iniciadores específicos para a detecção do isolado de SP do JGMV mediante RT-PCR. / Johnsongrass mosaic virus (JGMV) is a species of the genus Potyvirus. The geographical distribution, until the early 1990s, was limited to Australia and the United States, where it causes disease in sorghum, corn and various grasses. In 2001, JGMV was first detected in Brazil in samples of hybrids and varieties of corn from the region of Ribeirão Preto, São Paulo State by serological analysis (DASELISA), and in 2013 it was detected by RT-PCR in samples of Pennisetum purpureum from the State of Bahia. In February 2012, the Disease Diagnostic Clinic ESALQ/USP received samples of Panicum maximum cv. Mombaça, exhibiting mosaic symptoms, from the region of São Luiz do Paraitinga, SP. Preliminary examination of negatively stained sap in a transmission electron microscope indicated the presence of potyvirus-like particles. Therefore, the main objective of this study was to characterize the etiologic agent associated with P. maximum cv. Mombaça diseased plants by biological, serological and molecular tests. Leaf extract from Mombaça infected plants was mechanically inoculated in 69 genotypes of the Poaceae family. Evaluations were done based on symptoms expression and PTAELISA using polyclonal antiserum against the capsid protein of the potyvirus produced in the preset work virus purification. Susceptible species were Brachiaria brizantha, B. decumbens, B. plantaginea, Cenchrus echinatus, Echinochloa colona, E. crus-galli, E. crus-pavonis, Melinis minutiflora, Panicum maximum cv. Colonião, Pennisetum setosum, Rhynchelytrum repens, Rottboellia exaltata, Sorghum bicolor BRS 332, S. bicolor BRS 509, S. bicolor x S. sudanense BRS 802 and S. verticilliflorum. Cultivated species such as rice, oats, sugarcane, rye, corn and wheat were not infected with this isolate. The molecular weight of the coat protein of this potyvirus was estimated at about 33 kDa by Western blot. The nucleotide sequence of the complete genome (9885 nt) obtained in this study showed 82.03% identity with an unique sequence for the complete genome of an isolate of JGMV from Australia, deposited in GenBank. From this nucleotide sequence, specific pair of primers was designed for the detection of the São Paulo isolate of JGMV by RT-PCR.

Dengue é uma doença infecciosa não contagiosa causada pelo vírus da dengue (gênero Flavivirus, família Flaviviridae), transmitida pela picada de artrópodes do gênero Aedes, principalmente Aedes aegypti, e sendo atualmente um importante problema de saúde pública em todo o mundo. Segundo a Organização Mundial de Saúde, cerca de 50 a 100 milhões de pessoas se infectam anualmente em mais de 100 países de todos os continentes. A dengue apresenta-se em três formas clínicas principais; doença febril indiferenciada, febre clássica do dengue (DF) e dengue hemorrágico com ou sem choque (DHF/DSS). Recentemente, viu-se um dramático aumento do número de casos de DHF/DSS nas Américas, e este aumento coincidiu com a introdução do dengue tipo 3, genótipo III. Neste trabalho, caracterizamos completamente o genoma de um vírus brasileiro de dengue tipo 3 (D3BR/RP1/2003) isolado de um paciente com dengue clássica. O genoma viral possui um tamanho de 10707 nucleotídeos e contém uma única região codificadora (posição 95 a 10264) flanqueada por duas regiões não codificadoras (RNC5, 1 a 94; RNC3, 10268 a 10707). A comparação do genoma viral com outros vírus isolados de pacientes com DF e DHF não mostrou diferenças significativas que sugerissem a presença de um fator genético associado à virulência. A analise filogenética baseada no genoma completo, mostra que a cepa D3BR/RP1/2003 pertence ao genótipo III e encontra-se proximamente relacionada a outro vírus isolado no Rio de Janeiro em 2002. Entretanto, quando essa análise filogenética é realizada com as regiões codificadoras das proteínas E e NS5 individualmente, a cepa D3BR/RP1/2003 encontra-se mais proximamente relacionada a um vírus isolado na Ilha de Martinica no Caribe. Este achado sugere que o isolado D3BR/RP1/2003 pode ter sido originado através de um evento de recombinação entre duas cepas virais distintas antes ou após sua introdução no Brasil. Dados sugestivos de recombinação foram observados também quando analisada a relação filogenética entre vírus isolados na Ásia. / Dengue is an infectious disease caused by dengue virus (genus Flavivirus, family Flaviviridae), transmitted by the bite of arthropods of the Aedes genus, mainly Aedes aegypti, and being currently an important problem of public health worldwide. According to the World Health Organization, about 50 the 100 million people are infected annually in more than 100 countries of all continents. Dengue can be presented in three main clinical forms; undifferentiated febrile illness, classic dengue fever (DF) and hemorrhagic dengue fever with or without shock (DHF/DSS). Recently, a dramatically increase of DHF/DSS cases in the Americas have been seen, and this increase coincided with the introduction of the dengue type 3, genotype III. In this work, we have completely characterized the genome of a Brazilian dengue type 3 (D3BR/RP1/2003 strain) isolated from a DF patient. The viral genome possesses a size of 10707 nucleotides and has a unique open reading frame (position 95 to 10264), flanked by two untranslated regions (UTR5\', 1 to 94; UTR3\', 10268 to 10707). The comparison of the viral genome with other viruses isolated from patients with DF and DHF did not show significant differences to suggest the presence of a genetic factor associate with virulence. Phylogenetic analysis based on the complete genome showed that D3BR/RP1/2003 strain belongs to genotype III and is close related to another virus isolated in Rio de Janeiro in 2002. However, when the phylogenetic analysis was based on the individual coding regions of E and NS5 proteins, D3BR/RP1/2003 strain was closely related to a virus isolated in the Island of Martinique in the Caribbean. This finding suggests that D3BR/RP1/2003 strain could have been originated through an event of recombination between different virus strains before or after its introduction to Brazil. Data supporting recombination events between viruses isolated in Asia have also been observed.