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Vers une amélioration de l’analyse des données et une optimisation des plans d’expérience pour une analyse quantitative du risque en écotoxicologie / Towards an improvment of data analysis and experimental design optimisation for ecotoxicology risk assessment

Dubuc, Carole 27 March 2013 (has links)
En écotoxicologie, les effets des substances toxiques sur les organismes vivants sont classiquement mesurés au niveau individuel, en laboratoire et selon des normes, ce qui assure la reproductibilité des bioessais et le contrôle des facteurs environnementaux. Ces tests standardisés, en toxicité aiguë ou chronique, portent généralement sur la survie, la reproduction et la croissance d'organismes modèles de laboratoire ; leur analyse statistique conduit à l'estimation de concentrations critiques d'effet. Ce sont ces concentrations qui sont utilisées en analyse quantitative du risque en écotoxicologie. Cependant, pour l'estimation d'un même type de concentration critique d'effet, différentes méthodes/modèles peuvent être utilisés qui sont plus ou moins adaptés en fonction du type de jeux de données. Le premier objectif de ce travail de thèse est donc de sélectionner les méthodes/modèles les plus adaptés afin d'améliorer l'analyse des données issus des tests de toxicité et donc l'estimation des concentrations critiques d'effet. Habituellement, les jeux de données sont construits à partir de tests standards en fonction de l'organisme étudié : la durée du test est généralement fixée et des recommandations sont faites, par exemple sur le nombre minimal d'organismes à exposer à un nombre minimal de concentrations. Il est donc légitime de penser que ces recommandations ne sont pas forcément les plus adaptées pour toutes les concentrations critiques d'effet et les méthodes/modèles les plus adaptés. C'est pourquoi, le deuxième objectif de cette thèse est d'optimiser les plans d'expérience afin d'aller soit vers une amélioration des estimations des concentrations critiques d'effet à coût constant soit pour un même niveau de qualité des estimations, d'éviter le gaspillage en temps et en organismes / In ecotoxicology, the effects of toxic compounds on living organisms are usually measured at the individual level, in the laboratory and according to standards. This ensures the reproducibility of bioassays and the control of environmental factors. Bioassays, in acute or chronic toxicity, generally apply to survival, reproduction and growth of organisms. The statistical analysis of standardized bioassays classically leads to the estimation of critical effect concentrations used in risk assessment. Nevertheless, several methods/models are used to determine a critical effect concentration. These methods/models are more and less adapted to the data type. The first aim of this work is to select the most adapted methods/models to improve data analysis and so the critical effect concentration estimation. Usually, data sets are built from standard bioassays and so follow recommendations about exposure duration, number and range of tested concentrations and number of individuals per concentration. We can think that these recommendations are not the most adapted for each critical effect concentration and each method/model. That’s why, the second aim of this work is to optimize the experimental design in order to improve the critical effect concentration estimations for a fixed cost or at least to reduce the waste of time and organisms
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On the coupling of membrane transport to hydrodynamics and bulk mass transfer in reverse osmosis : numerical modeling and experimental studies / Couplage du Transport Membranaire à l’Hydrodynamique et au Transfert de Matière en Osmose Inverse : Modélisation Numérique et Études Expérimentales

Lopes, Gustavo Henndel 10 December 2014 (has links)
La prédiction des performances des séparations membranaires barométriques, fortement affectées par la polarisation de concentration, serait une avancée importante pour le dimensionnement et l’optimisation des procédés. Dans ce contexte, les équations couplées de Navier-Stokes et de conservation du soluté adimensionnées sont résolues numériquement dans le cas d’un écoulement stationnaire laminaire en filtration tangentielle. Le canal plan bidimensionnel comporte des parois perméables soumises à des conditions aux limites du type solubilisation-diffusion. Le flux de perméat, le taux de rétention et le débit, la concentration et la chute de pression du rétentat sont déterminés localement. Les simulations soulignent l’influence des perméabilités membranaires au soluté et au solvant sur la polarisation de concentration et la dépendance non-asymptotique du taux de rétention avec la pression appliquée. Le modèle est validé pour des modules plans et spiralés d’osmose inverse et de nanofiltration dense en comparant les calculs à des résultats expérimentaux tirés de la littérature et de nos propres essais pilotes de dessalement. Aussi, une méthode à l’échelle de la paillasse permettant de déterminer les perméabilités au soluté et au solvant par des expériences d’osmose et diffusion est développée et appliquée à des membranes d’osmose inverse et de nanofiltration. La divergence des mécanismes de transfert engendrés sous l’influence de la pression ou sous l’influence d’un gradient osmotique est mise en évidence. Le modèle numérique et la méthode expérimentale sont des outils prometteurs d’applicabilité immédiate dans le domaine des membranes. / The prediction of the performance of pressure-driven membrane separations, deeply affected by concentration polarization, would be an important advance for process design and optimization. In this context, the dimensionless coupled Navier-Stokes and solute conservation equations are solved numerically for a steady laminar cross-flow filtration. The two-dimensional flat channel consists of permeable walls subject to solution-diffusion boundary conditions. The permeate flux, the rejection rate and the retentate’s flow rate, concentration and pressure drop are determined locally. The simulations highlight the influence of the membrane solute and solvent permeabilities on concentration polarization and the non-asymptotic dependence of the rejection rate on the applied pressure. The model is validated for reverse osmosis and tight-nanofiltration plate-and-frame and spiral-wound modules by comparison to experimental results from the literature and from our own pilot desalination tests. Furthermore, a bench-scale method enabling the determination of solute and solvent permeabilities from osmotic-diffusive experiments is developed and applied to reverse osmosis and nanofiltration membranes. The divergence between the transport mechanisms engendered by pressure and by an osmotic gradient is evidenced. The numerical model and the experimental method are new promising tools with immediate applicability in the membrane field.
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Chemical properties of continental aerosol transported over the Southern Ocean : Patagonian and Namibian sources / Caractérisation chimique de l’aérosol continental transporté sur l’Océan Austral : sources patagonienne et namibienne

Qu, Zihan 25 January 2016 (has links)
Patagonie et la Namibie sont deux sources importantes d'aérosol minéral qui alimente la section Atlantique Sud de l'océan Austral avec les micronutriments.L'objet de ma thèse est d'étudier 1) la concentration atmosphérique et la variation temporel de la poussière en Patagonie, 2) l'hétérogénéité spatiale de composition élémentaire de poussière en Patagonie et en Namibie, et 3) la solubilité élémentaire de poussière en Patagonie et en Namibie. Ces trois aspects sont les principaux enjeux pour modéliser les inventaires des émissions de micronutriments biodisponibles à partir de sources de poussière.La concentration en poussière mesurée en Patagonie montre une variation saisonnière avec un niveau plus bas en hiver. Les données météorologiques suggèrent que cette variation saisonnière est associée à la variation de l'humidité du sol dans les zones source plutôt qu'à la vitesse du vent. Des échantillons d'aérosol minéral ont été générés à partir des sols de Patagonie et de Namibie. La composition élémentaire des poussières diffère de celles des sols parents, en particulier en Namibie en raison de l'effet de dilution par le quartz dans les sols. Des compositions élémentaires varient spatialement aux échelles continentale et régionale en Patagonie et Namibie. Les variations de Ca et Mg sont les principales raisons conduisant à l'hétérogénéité spatiale de la composition élémentaire des poussières. Les solubilités élémentaires des aérosols minéraux de Patagonie et de Namibie augmentent avec l'acidité de la solution altérante. Les poussières riches en calcium présentent une solubilité plus élevée pour les éléments les plus solubles (Ca, etc.) en raison de la présence de carbonate. Le suivi de la concentration en poussières obtenu en Patagonie peut aider à mieux en quantifier les émissions dans la région subantarctique et ainsi à mieux contraindre les modèles. La base de données que nous avons obtenue sur les poussières et leur solubilité contribue également à l'évaluation des émissions d'éléments solubles dans la région Australe. / Mineral dust is considered to be an important supplier of micronutrient for the Southern Ocean where the primary production is limited by insufficient supply of micronutrients. Patagonia (South America) and Namibia (Southern Africa) are two main dust sources for the South Atlantic section of the Southern Ocean. Emission inventories of bioavailable micronutrients from these two regions regulate the final biological impact on marine ecosystem in the South Atlantic Ocean. This thesis is mainly focused on the investigation of 1) the atmospheric dust concentration and its temporal pattern in Patagonia, 2) the spatial heterogeneity of dust elemental composition in Patagonia and Namibia, and 3) the pH dependence of elemental solubility in Patagonian and Namibian dust. These three aspects are the key issues to model the emission inventories of bioavailable micronutrients from dust sources. Dust concentration measurements were conducted in Patagonia-Atlantic Coast and revealed a seasonal pattern of dust concentration with lower dust level in winter than the other three seasons. Meteorological records suggest that this seasonal pattern is associated with the variation of soil moisture in source areas rather than the recurrently high wind speed. Dust samples were generated from Patagonian and Namibian soils to investigate the elemental composition and the elemental solubility of source dust. Dust elemental composition differs to different degrees from their parents soils, particularly in Namibia due to the dilution effect of quartz in soil. Spatial variability of dust elemental composition was observed at both continental scale and regional scale in Patagonia and Namibia. Variations in Ca and Mg content are the main reasons for the spatial heterogeneity of dust elemental composition. Elemental solubility of Patagonian and Namibian dust increased with acidity of leaching solution. More soluble elements namely Ca, K, Mg, Mn, Sr and Ba showed much higher solubility in calcium-rich dust due to the presence of carbonate. The dust concentration record obtained in Patagonia may help to better quantify the dust emission in subantarctic region and to constrain dust models. Database of dust elemental composition and elemental solubility in Patagonia and Namibia also contributes to the evaluation of emission inventories of soluble elements from dust sources to the Southern Ocean.
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Contribution à l'étude de la télévision au Brésil : propriétaires, concentration et contenus / Contribution to Broadcasting TV study : owners, concentration et contents

De Oliveira Maues, Eva 18 December 2018 (has links)
RESUMENotre travail s’intéresse au secteur des médias télévisés au Brésil, qui présente une forte concentration à mettre en rapport avec la domination économique et politique de certains groupes parmi les groupes de médias, comme le groupe dominant Globo. Le chapitre 1 est un chapitre introductif, qui, après avoir présenté l’économie brésilienne et le paysage médiatique au Brésil, développe la problématiqueAu cours du chapitre 2 nous avons établi une typologie des principales propriétaires des médias télévisés au Brésil, en faisant un classement des propriétaires des chaînes en familles (F), politiques (P), groupes religieux (R), état (E), global players ou majors (M), commerciales (C), chaines diverses (O). Nous étudions ensuite dans ce chapitre la concentration dans le secteur de la télévision brésilienne, suivie d’études de cas sur certains groupes de média télévisés au Brésil, dont notamment la chaîne Record News, qui appartient à Rede Record.Le chapitre 3 complète notre travail du point de vue théorique, en transposant la théorie de l’électeur médian et celle du duopole de Hotelling et en généralisant la théorie au cas d’entreprises de médias avec des contenus n-dimensionnels. Nous esquissons une application aux chaines de télévision dominantes du Brésil.Le chapitre 4 expose les résultats d’une enquête de terrain par questionnaire qui permet d’explorer la manière dont les contenus des chaînes de télévision brésilienne sont perçus par les téléspectateurs. La conclusion générale, qui fait l’objet du chapitre 5.Enfin, la thèse se termine par des annexes avec, d’une part le détail de notre questionnaire et des réponses à celui. / This work is concerned with the industry of TV media enterprises in Brazil, a sector which is highly concentrated, this concentration being related with the economic and political role of some dominant media groups, such as the Globo group. Chapter 1 deals with the introduction of our study, presenting first the economy of Brazil and the Brazilian media sector, and then developping the questions this work is concerned with.In Chapter 2, we propose to study media concentration in Brazil’s television industry; more precisely, we propose a classification of ownerships of the main TV channels, including families (F), politicians (P), religious groups (R), state and public-service companies (E), global players and majors (M), and miscellaneous ownerships (O). This is followed by a study of concentration in the TV sector based on HHI calculations since 1996, and by case studies. Chapter 3 completes our work from a theoretical economics standpoint, adapting the median voter theory and the Hotelling spatial duopoly theory to the case of media enterprises, with n-dimensional contents, and with a tentative application to dominant TV channels of Brazil.Chapter 4 deals with the results of a field questionnaire survey which enables us to have some idea of how the contents of Brazilian TV channels are received by some audiences. Chapter 5, which concludes our work, deals with a synthesis of our results, and with the research prospects it raises.Finally, our dissertation ends up with some appendixes, with, on the one hand, the detail of our questionnaire and of the results of our survey, together with some of our publications and articles related to this work.
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Courbure de Ricci grossière de processus markoviens / Coarse Ricci curvature of Markov processes

Veysseire, Laurent 16 July 2012 (has links)
La courbure de Ricci grossière d’un processus markovien sur un espace polonais est définie comme un taux de contraction local de la distance de Wasserstein W1 entre les lois du processus partant de deux points distincts. La première partie de cette thèse traite de résultats valables dans le cas d’espaces polonais quelconques. On montre que l’infimum de la courbure de Ricci grossière est un taux de contraction global du semigroupe du processus pour la distance W1. Quoiqu’intuitif, ce résultat est difficile à démontrer en temps continu. La preuve de ce résultat, ses conséquences sur le trou spectral du générateur font l’objet du chapitre 1. Un autre résultat intéressant, faisant intervenir les valeurs de la courbure de Ricci grossière en différents points, et pas seulement son infimum, est un résultat de concentration des mesures d’équilibre, valable uniquement en temps discret. Il sera traité dans le chapitre 2. La seconde partie de cette thèse traite du cas particulier des diffusions sur les variétés riemanniennes. Une formule est donnée permettant d’obtenir la courbure de Ricci grossière à partir du générateur. Dans le cas où la métrique est adaptée à la diffusion, nous montrons l’existence d’un couplage entre les trajectoires tel que la courbure de Ricci grossière est exactement le taux de décroissance de la distance entre ces trajectoires. Le trou spectral du générateur de la diffusion est alors plus grand que la moyenne harmonique de la courbure de Ricci. Ce résultat peut être généralisé lorsque la métrique n’est pas celle induite par le générateur, mais il nécessite une hypothèse contraignante, et la courbure que l'on doit considérer est plus faible. / The coarse Ricci curvature of a Markov process on a Polish space is defined as a local contraction rate of the W1 Wasserstein distance between the laws of the process starting at two different points. The first part of this thesis deals with results holding in the case of general Polish spaces. The simplest of them is that the infimum of the coarse Ricci curvature is a global contraction rate of the semigroup of the process for the W1 distance between probability measures. Though intuitive, this result is diffucult to prove in continuous time. The proof of this result, and the following consequences for the spectral gap of the generator are the subject of Chapter 1. Another interesting result, using the values of the coarse Ricci curvature at different points, and not only its infimum, is a concentration result for the equilibrium measures, only holding in a discrete time framework. That will be the topic of Chapter 2. The second part of this thesis deals with the particular case of diffusions on Riemannian manifolds. A formula is given, allowing to get the coarse Ricci curvature from the generator of the diffusion. In the case when the metric is adapted to the diffusion, we show the existence of a coupling between the paths starting at two different points, such that the coarse Ricci curvature is exactly the decreasing rate of the distance between these paths. We can then show that the spectral gap of the generator is at least the harmonic mean of the Ricci curvature. This result can be generalized when the metric is not the one induced by the generator, but it needs a very restricting hypothesis, and the curvature we have to choose is smaller.
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A comparative study of the minimum inhibitory and mutant prevention concentrations of florfenicol and oxytetracycline for animal isolates of Pasteurella multocida and Salmonella Typhimurium

Wentzel, Jeanette Maria 11 July 2013 (has links)
This study was undertaken to compare the MIC (minimum inhibitory concentration) and MPC (mutant prevention concentration) values for oxytetracycline and florfenicol against strains of Pasteurella multocida isolated from cattle and pigs, and for enrofloxacin against strains of Salmonella Typhimurium isolated from horses. Isolates of P. multocida from cattle and pigs, and S. Typhimurium from horses were obtained from specimens or isolates from contributing laboratories. All the equine isolates and 50% of the cattle and pig isolates were from clinically sick animals. All isolates were tested in duplicate with both the MIC and the MPC methods. The MIC method used was the standardized microdilution method performed in microtitre plates. The MPC method used was according to the method described by Blondeau. This method was modified, to make use of smaller plates and lower volumes of antimicrobials, but retaining a final bacterial concentration of 109 colony-forming units per ml. The antimicrobials were dissolved as described in the certificates of analyses. Enrofloxacin and oxytetracycline were dissolved in water, and florfenicol was dissolved in alcohol. For the MPC method, an additional control was added to one quadrant of a four-quadrant 90mm plate/petri dish. The antimicrobials were tested as individual antimicrobials and not as combinations. Both the MIC and MPC methods included ATCC (American Type Culture Collection) strains as control organisms and were evaluated according to the guidelines of the CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). The MIC50 values for enrofloxacin against Salmonella Typhimurium isolates from horses was 0.25 ìg/ml and the MPC50 values 0.5 ìg/ml. A comparative reference range was not available as enrofloxacin is not registered in South Africa for use in horses, and is used extra-labelly. The results for florfenicol against P. multocida yielded an MIC50 value of 0.5 ìg/ml and an MPC50 value of <2 ìg/ml. The close relationship of these two concentrations is an indication of the effectiveness of florfenicol when used against P. multocida. The PD/PK data with a value of 141.78 for AUC/MIC provided additional support for the efficacy of florfenicol against P. multocida. The PD/PK value of >125, is an effective parameter for treatment of Gram-negative bacteria. The corresponding results for oxytetracycline were above the MIC value but fell within the mutant selection window. The results point to the fact that the use of oxytetracycline against P. multocida may not be effective in preventing the appearance of first step mutant strains when used at current recommended dosages. The PK/PD data, using AUC/MIC, yielded a value of 56. Some of the isolates (55.17%) had an MPC value of 16 ìg/ml. Whereas the MIC method is used routinely in diagnostic laboratories, the MPC method can be employed to generate data that can be applied where antimicrobial treatment of certain bacteria is problematic and standard treatment may lead to the development of resistance. Data obtained from such studies will enable manufacturers of antimicrobial drugs to adapt antimicrobial therapy where practical and feasible to prevent the development of first step mutants. / Dissertation (MSc)--University of Pretoria, 2012. / Veterinary Tropical Diseases / unrestricted
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Name Concentration Risk and Pillar 2 Compliance : The Granularity Adjustment

Torell, Björn January 2013 (has links)
A credit portfolio where each obligor contributes infinitesimally to the risk is said to be infinitely granular. The risk related to the fact that no real credit portfolio is infinitely granular, is called name concentration risk. Under Basel II, banks are required to hold a capital buffer for credit risk in order to sustain the probability of default on an acceptable level. Credit risk capital charges computed under pillar 1 of Basel II have been calibrated for a specific level of name concentration. If a bank deviates from this benchmark it is expected to address this under pillar 2, which may involve increased capital charges. Here, we look at some of the difficulties that a bank may encounter when computing a name concentration risk add-on under pillar 2. In particular, we study the granularity adjustment for the Vasicek and CreditRisk+ models. An advantage of this approach is that no vendor software products are necessary. We also address the questions of when the granularity adjustment is a coherent risk measure and how to allocate the add-on to exposures in order to optimize the credit portfolio. Finally, the discussed models are applied to real data
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A Physiologically-Based Pharmacokinetic Model for the Antibiotic Ertapenem

Joyner, Michele L., Forbes, Whitney, Maiden, Michelle, Nikas, Ariel N. 01 February 2016 (has links)
Ertapenem is an antibiotic commonly used to treat a broad spectrum of infections, which is part of a broader class of antibiotics called carbapenem. Unlike other carbapenems, ertapenem has a longer half-life and thus only has to be administered once a day. A physiologically-based pharmacokinetic (PBPK) model was developed to investigate the uptake, distribution, and elimination of ertapenem following a single one gram dose. PBPK modeling incorporates known physiological parameters such as body weight, organ volumes, and blood ow rates in particular tissues. Furthermore, ertapenem is highly bound in human blood plasma; therefore, nonlinear binding is incorporated in the model since only the free portion of the drug can saturate tissues and, hence, is the only portion of the drug considered to be medicinally effective. Parameters in the model were estimated using a least squares inverse problem formulation with published data for blood concentrations of ertapenem for normal height, normal weight males. Finally, an uncertainty analysis of the parameter estimation and model predictions is presented.
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Comparative Activity of Telavancin and Other Antimicrobial Agents Against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Isolates Collected From 1991 to 2006

Shams, Wael, Walker, Elaine S., Levy, Foster, Reynolds, Scott A., Peterson, Shalena M., Sarubbi, Felix A. 01 October 2010 (has links)
Background: Increasingly frequent reports of vancomycin treatment failures for serious methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) infections provide impetus for comparative in vitro studies to assess the activity of newer antimicrobial agents against a range of MRSA isolates. Methods: A sample of 168 MRSA derived from a long-term MRSA collection was subjected to susceptibility testing to telavancin, daptomycin, linezolid, tigecycline and vancomycin by broth micro-dilution. Data were reviewed for sporadic occurrence of isolates with reduced susceptibility. Analyses were performed to test for temporal trends toward decreasing susceptibility and to compare susceptibility of isolates from different infection sites. Results: No MRSA isolate from any time period was resistant to test antibiotics. For daptomycin, linezolid and tigecycline, there were no susceptibility differences between the pre- and postclinical availability periods. All newer agents here active against MRSA isolates with minimum inhibitory concentrations (MICs) of vancomycin >1 mg/l, but there were significant correlations in susceptibility among several pairs of antibiotics. Conclusions: Telavancin and other newer antistaphylococcal agents were fully active against MRSA from various infection sites including isolates with vancomycin MIC >1 mg/l.
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Rationalizable economic behavior and strategic choice

Bernheim, Bert Douglas. January 1982 (has links)
Thesis: Ph. D., Massachusetts Institute of Technology, Department of Economics, 1982 / Includes bibliographies. / by Bert Douglas Bernheim. / Ph. D. / Ph. D. Massachusetts Institute of Technology, Department of Economics

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