Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000437736-Texto+Completo-0.pdf: 1457817 bytes, checksum: bdde27fe7d092198d722bf49a1924aa8 (MD5) Previous issue date: 2011 / Franciscana (Pontoporia blainvillei) is the only extant representative of the Pontoporiidae family. This species occurs along the Atlantic coast of South America from Itaunas, Espirito Santo in Brazil to Golfo Nuevo, Valdes Peninsula in Argentina. The most important threat to the species is the accidental by-catch that in some places reached the number of 1000 related events per year. In recent years an increasingly number of studies had revealed the existence of considerable genetic variation along the geographical distribution of P. blainvillei. In this study, looking to collaborate towards a better comprehension of such existing structure, we analyzed new molecular data, including the sequencing of mitochondrial DNA control region and 11 microsatellite loci from 253 individuals along the Brazilian, Uruguayan and Argentine coast. For the mitochondrial DNA analysis, we added sequences previously deposited in GenBank, totalizing 512 sequences. Results obtained based on the two molecular markers revealed a clear differentiation of the species in three main groups: (1) Rio de Janeiro / Espirito Santo, (2) Sao Paulo and north of Santa Catarina, and (3) south of Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Uruguay and Argentina. The study also shows alarming estimates in reference to the effective size of some populations, mainly from Rio de Janeiro/Espirito Santo which will probably reflect on its conservation status. These results supports the definition of the four management areas (Franciscana Management Area - FMAs) previously suggested by Secchi and associates in 2003, and point out the importance of this definition to the conservation of the genetic diversity of the species. / A toninha, Pontoporia blainvillei é o único representante atual da família de odontocetáceos Pontoporiidae. Esta espécie ocorre ao longo da costa atlântica da América do Sul, entre Itaúnas, Espírito Santo e o Golfo Nuevo, Península Valdés, Argentina. A principal ameaça à espécie são as capturas acidentais em redes de pesca, que em algumas localidades chegaram a atingir o número de 1000 capturas anuais. Nos últimos anos, um número crescente de estudos tem revelado a existência de variações genéticas consideráveis ao longo da distribuição geográfica de P. blainvillei. Visando colaborar para uma melhor compreensão dessa estruturação existente, novas informações moleculares foram analisadas, incluindo o sequenciamento da região controladora do DNA mitocondrial e 11 loci de microssatélites de 253 indivíduos ao longo da costa brasileira, uruguaia e argentina. Para as análises do DNA mitocondrial foram incluidas sequências previamente depositadas no GenBank, totalizando 512 sequências. Os resultados obtidos a partir dos dois marcadores moleculares revelam uma clara diferenciação da espécie em três grupos principais: 1) Rio de Janeiro/Espírito Santo, 2) São Paulo/Paraná e norte de Santa Catarina, e 3) Sul de Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Uruguai e Argentina. O estudo também apontou estimativas preocupantes no que se refere ao tamanho efetivo de algumas populações, em especial à do Rio de Janeiro/Espirito Santo e consequentemente ao seu status de conservação. Os resultados corroboram a definição das quatro áreas de manejo (Franciscana Management Areas – FMAs) previamente sugeridas por Secchi e colaboradores em 2003, e ressaltam a importância desta definição para a Conservação da diversidade genética da espécie.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000434266-Texto+Completo-0.pdf: 1493110 bytes, checksum: fe183a4f7fd0785e8214bb44897309bd (MD5) Previous issue date: 2011 / Epizooties affecting primates have been reported in several regions of the world. The sylvatic yellow fever is an example that has impacted populations of neotropical primates, especially Alouatta spp. From October 2008 to April 2009 an outbreak of sylvatic yellow fever hit the state of Rio Grande do Sul, Brazil, causing the death of over 2000 howler monkeys (Alouatta caraya and Alouatta guariba clamitans). To estimate the impact of the outbreak on the conservation status of the species, this research compared the structure of black-and-gold howler monkey (A. caraya) populations inhabiting a region where there is no recent report of the disease (Alegrete) with a region where there were confirmed deaths by yellow fever (Bossoroca). Population surveys were conducted in 55 forest fragments and a gallery forest in Alegrete and in 83 forest fragments and a gallery forest in Bossoroca. In Alegrete howler monkeys were found in 31 fragments and four social groups were seen in the gallery forest, whereas in Bossoroca howlers were found in only 10 fragments and three social groups were identified in the gallery forest. The recent rate of extinction of isolated fragment populations in Bossoroca was estimated at 80%, caused mainly by yellow fever, whereas this rate was estimated at 14% in Alegrete. These local extinctions increased the distance between the remaining populations, probably compromising gene flow and reducing the long-term viability of populations and the survival of the species in the region. Finally, the size and structure of the remaining groups of Bossoroca were similar to those of the groups of Alegrete and the groups mentioned in the literature, suggesting that there is no age-sex difference in susceptibility to the yellow fever virus and in the selectivity by the vector mosquito. / Epizootias envolvendo primatas têm sido documentadas em várias partes do mundo. A febre amarela silvestre é um exemplo que vem causando impactos nas populações de alguns primatas neotropicais, especialmente Alouatta spp. De outubro de 2008 a abril de 2009 ocorreu um surto de febre amarela silvestre no estado do Rio Grande do Sul, Brasil, levando ao óbito mais de 2000 bugios (Alouatta caraya e Alouatta guariba clamitans). A fim de estimar o impacto do surto no estado de conservação das espécies, esta pesquisa comparou a estruturapopulacional de bugios-pretos (A. caraya) habitantes de uma região sem relatos recentes da doença (Alegrete) com uma região onde ocorreram mortes comprovadas por febre amarela (Bossoroca). Foram realizados levantamentos populacionais em 55 fragmentos florestais e uma mata ciliar em Alegrete e em 83 fragmentos florestais e uma mata ciliar em Bossoroca. Em Alegrete foram encontrados bugios em 31 fragmentos e avistados quatro grupos na mata ciliar, enquanto em Bossoroca foram encontrados bugios em apenas 10 fragmentos e avistados três grupos na mata ciliar. A taxa de extinção recente de populações isoladas em fragmentos em Bossoroca foi estimada em 80%, a qual foi causada principalmente pela febre amarela, enquanto em Alegrete essa taxa foi estimada em 14%. Estas extinções locais aumentaram a distância entre as populações remanescentes, provavelmente dificultando o fluxo gênico e reduzindo a viabilidade das populações e a sobrevivência da espécie em longo prazo na região. Por fim, os grupos remanescentes em Bossoroca apresentaram tamanho e estrutura semelhante aos grupos de Alegrete e àqueles citados na literatura, o que sugere que não há diferença sexo-etária na resistência ao vírus amarílico e na seletividade do mosquito vetor.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000402507-Texto+Completo-0.pdf: 1091814 bytes, checksum: 6a25739d4ec8e40376ad8113b472df93 (MD5) Previous issue date: 2007 / Bycatch in demersal coastal gillnets is the main conservation problem faced by the franciscana, Pontoporia blainvillei. The highest rates of mortality for this species in Brazil are found on Rio Grande do Sul’s coast area. This thesis presents the results of three different research works related to the conservation and population biology of franciscanas in Rio Grande do Sul: a study on the bycatch mortality, an abundance estimation, and a critical essay on the conservation perspectives fo the species. Between January 2002 and December 2004, the fisheries communities of Torres and Tramandaí were visited during 350 days in order to obtain data about the fishery, to select the fishery vessels that could collaborate with the project, to interview the fishermen and to distribute logbooks to the vessels´ masters. In addition, 33 onboard observations were carried out to obtain direct information on the fishery-franciscana interactions. Data from 823 fishery operations and thirteen fishery vessels were collected. During this study, the bycatch of 99 franciscanas in 74 fishery operations were recorded. The annual mortality estimate extrapolated for 31 fishery vessels that operate in Torres and Tramandaí, utilizing CPUE in the calculations, is 429 animals (CI 95%: 168 – 853). When the mortality rate is utilized in the calculations, the annual estimate is 353 animals (CI 95%: 171 – 629). The estimates presented here confirm the high rates of bycatch faced by the species in Rio Grande do Sul, with very similar estimates with those presented for the 1992-97 period in the same region. The results of this paper do not point out fast and easy solutions for the fishery-franciscana problematic in Rio Grande do Sul, thought the restrictions of areas, seasons or fishery gear. Franciscana bycatch occurs in water depths varying from nine to 40 meters, with a slight decrease in the catches as the water depth increases.Demersal gillnets present higher bycatch rates than surface gillnets. Nevertheless, it was not detected statistical differences in the franciscana catchability between the gillnet set for croakers and the one set for weakfishes and hake, the two kinds of nets more employed in Rio Grande do Sul. Two peaks were noticed in total mortality estimates: one in winter and another in summer. Nevertheless, regarding the relative mortality, the winter is the season presenting the highest mortality estimates. In spite of the remarkable increase in the fishery effort in the last 15 years in Rio Grande do Sul (e. g. about 500% in nets length), the franciscana mortality rates remained almost unaltered, corroborating that the population that inhabits this region is declining in size. The estimation of the species abundance has been systematically recommended as a highest research priority. The results of the second aerial survey carried out in March 2004 for franciscana abundance in Rio Grande do Sul, southern Brazil, are presented. Linetransect with a zigzag pattern were followed between the shoreline and a mean distance of 24 km offshore. The overall surveyed area comprised 13. 341 km2. Abundance was estimated using Distance sampling assuming g0 = 0. 304. During the 48 transects and a total effort of 1256,8 km, 31 franciscanas were observed in 25 groups. The corrected density is 0. 51 franciscanas/km2, resulting in an abundance estimation of 6,839 franciscanas (CV = 32%; 95% CI = 3,709-12,594) for the surveyed area in Rio Grande do Sul. The encounter rate for franciscana groups was 0. 020 groups for each km surveyed. The abundance estimate presented is restricted only to the area covered in the survey and extrapolation for the whole species distribution range is not recommended. Although franciscana abundance studies have been showing recent progresses, there is still much room for improvement.The critical points to be improved are: (a) a perception bias value should be firstly estimated; (b) the parameters influencing availability bias should be improved; (c) sample size should be increased. While the lack of factors to correct for perception bias and group size underestimation in aerial surveys leads to an underestimation of franciscana abundance, the use of surfacing and diving time data from boat and land-based surveys to correct for availability bias is likely to cause its overestimation. Since the magnitude of both errors is unknown, it should not be assumed that one error balance the other. The present knowledge on the the franciscana and its threats frequently raises the following question: when management action on the fishery should take place. However, the pertinent question now in not when, but how management actions should be implemented. In my view, the franciscana bycatch problem requires an adaptive management model characterized by a program of continual monitoring of indicators that measure progress toward goals. Four management propositions for the fishery that affect the franciscana are critically comented: the use of acoustic alarms, the criation of marine protected areas, the restriction of fishery effort and the modification of fishery gear. / A toninha, Pontoporia blainvillei, é a espécie de pequeno cetáceo mais ameaçada na América do Sul, devido às capturas acidentais em redes de pesca em toda sua distribuição geográfica. Na costa do Brasil, a região onde a espécie sofre os mais altos níveis de mortalidade acidental é o Rio Grande do Sul. A presente tese apresenta os resultados de três trabalhos distintos relacionados a aspectos populacionais e da conservação da espécie: um estudo sobre a mortalidade causada pelas capturas acidentais em redes de pesca, uma estimativa de abundância populacional, e um ensaio crítico sobre perspectivas de conservação, recomendações de políticas públicas e medidas de manejo para a pesca. Com os objetivos de apresentar estimativas de mortalidade atualizadas, identificar épocas do ano, tipos e tamanho de rede de pesca e faixas de profundidades com maior risco de captura, foi realizado entre 2002 e 2004, no litoral norte do Rio Grande do Sul, um estudo sobre as interações da pesca e a toninha. As comunidades de pesca de Torres e Tramandaí foram monitoradas durante 350 dias para seleção das embarcações colaboradoras, condução de entrevistas com pescadores e distribuição dos cadernos de bordo e embarques acompanhando as operações de pesca. No total, foram coletados dados relativos a 823 operações de pesca realizadas pelas treze embarcações monitoradas. Foram registradas as capturas acidentais de 99 toninhas em 74 eventos de captura.A mortalidade anual de toninhas foi extrapolada para as 31 embarcações da pesca comercial costeira que atuam em Torres e Tramandaí, resultando em duas estimativas, dependendo do índice empregado: 429 animais (IC 95%: 168 – 853) utilizando CPUE e 353 toninhas (IC 95%: 171 – 629) utilizando taxa de captura. Os resultados desse trabalho não apontam soluções rápidas e fáceis para a mitigação das capturas acidentais da toninha através de restrições de áreas, artes e épocas de pesca. As capturas acidentais de toninhas ocorreram em profundidades variando de 9 a 40 m, havendo uma leve propensão das capturas diminuírem à medida que a profundidade aumenta. Não foram detectadas diferenças significativas entre as redes de corvina e brota/pescada, as duas redes de espera mais empregadas na região. O inverno é a estação do ano com maior mortalidade relativa de toninhas. Apesar do notável aumento no esforço de pesca nos últimos 15 anos, as taxas de capturas de toninhas se mantiveram praticamente inalteradas, reforçando que a população de toninhas do Rio Grande do Sul está declinando em tamanho. A estimativa da abundância para espécie tem sido sistematicamente recomendada como uma alta prioridade de pesquisa para a espécie. Os resultados de um segundo levantamento aéreo realizado em março de 2004 no Rio Grande do Sul é apresentado. Transectos lineares com padrão de zig-zag foram seguidos desde a linha da costa até uma distância média de 24 km em direção à mar aberto. A área total monitorada compreendeu 13. 341 km2. Abundância foi estimada utilizando o programa Distance sampling assumindo g0 = 0. 304. Durante 48 transectos e um esforço total de 1256. 8 km, foram registradas 31 toninhas em 25 grupos. A densidade corrigida é 0. 51/toninhas/km2, resultando em uma estimativa de abundância de 6. 839 toninhas (95% CI = 3,709-12,594) para a área coberta.A taxa de encontro para grupos de toninha é de 0. 02 grupos por cada km sobrevoado. A estimativa de abundância apresentada aqui é restrita apenas para a área monitorada e extrapolações para a distribuição restante da espécie são fortemente desaconselhadas. Embora estudos de abundância de toninha tenham mostrado progressos recentes, ainda há muitos pontos a ser melhorados. Os aspectos críticos são: (a) um valor de erro de percepção deve ser estimado; (b) os parâmetros influenciando o erro de disponibilidade devem ser melhorados; (c) tamanho amostral deve ser aumentado. O atual grau de conhecimento sobre a toninha e suas ameaças tem direcionado a pergunta de quando terá início alguma ação concreta para a conservação da espécie? No entanto, a questão mais importante agora não é quando, mas sim como o manejo deve ser implementado. Em minha opinião, o problema das capturas acidentais da toninha requer um modelo de manejo adaptativo caracterizado por um monitoramento contínuo dos indicadores que aferem o progresso das medidas propostas. Quatro proposições de manejo para a pesca que exerce impacto sobre as populações de toninha são comentadas criticamente: o uso de alarmes acústicos em redes, a criação de áreas marinhas protegidas, a redução do esforço de pesca, a modificação das redes de pesca.As seguintes recomendações relativas à implementação de medidas de manejo são propostas e discutidas: (1) ações de manejo não devem ser vistas como uma solução final; (2) o sucesso das ações de manejo devem ser monitoradas a longo prazo; (3) ações de manejo não devem ser inviáveis logisticamente para fiscalização; (4) ações de manejo devem contar com ampla disseminação de informação; (5) ações de manejo devem contar com a concordância e participação de parte das comunidades de pesca envolvidas; (6) ações de manejo devem ter uma abrangência nacional; (7) o impacto econômico das medidas de manejo deve ser previamente estudado; (8) ações de manejo devem ser acompanhadas de pesquisa.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-02-21T17:07:17Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2502287 bytes, checksum: fa539899420129979854d9e1c7e4d6d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-21T17:07:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2502287 bytes, checksum: fa539899420129979854d9e1c7e4d6d2 (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O Cerrado tem sido severamente degradado e Unidades de Conservação protegem uma pequena parte do seu território. As abelhas da tribo Meliponini são endêmicas das regiões tropicais e o gênero Melipona é o mais rico do Brasil. Melipona rufiventris Lepeletier (1836) ocorre no Cerrado brasileiro e está ameaçada de extinção. Essa espécie integra um grupo de espécies conhecido como grupo rufiventris, que possui morfologia semelhante e distribuição em quase todo território do Brasil. O programa de conservação de M. rufiventris deve conter informações sobre a sua distribuição geográfica e dados moleculares para o desenvolvimento de populações de conservação. O objetivo deste trabalho foi estimar área potencial de ocorrência de M. rufiventris, identificar genótipos promissores para compor uma população de conservação e estudar as relações filogenéticas entre algumas espécies do grupo rufiventris. Mapas contendo os pontos de presença da espécie e características principais para sua conservação foram elaborados utilizando o software QGis. A área potencial da espécie foi estimada com base na adequação climática do ambiente. Duas regiões do DNA, o gene Citocromo C oxidase I (COI) e o Espaçador Intergênico Transcrito 1 (ITS1) foram utilizadas em amplificações via PCR para os estudos de inferência filogenética e elaboração da rede de haplótipos. Os mapas mostraram que a área de ocorrência de M. rufiventris é ampla, mas está altamente degradada e os fragmentos remanescentes são rodeados de areas cujo uso do solo foi convertido em agropecuária e pastagens. As áreas prioritárias para conservação do Cerrado não contemplam toda distribuição da espécie e as Unidades de Conservação existentes são muito poucas e isoladas, dificultando a identificação de áreas que possam receber populações de M. rufiventris. Os modelos gerados indicam uma grande área potencial de ocorrência, porém ela se encontra em uma região degradada com várias interferências antrópicas. Existe adequabilidade climática para a espécie em regiões de Mata Atlântica, mas essas áreas não são vistas como áreas naturais de M. rufiventris. Os resultados das análises moleculares mostram a relação próxima existente entre as populações de uruçu-amarela do sudeste do Brasil e revela que a espécie ainda não descrita encontrada no noroeste e no norte de Minas Gerais é mais intimamente relacionada com Melipona flavolineata do que com M. rufiventris. Oito haplótipos foram identificados e todos eles devem compor as populações de conservação que serão manejadas para os locais indicados para conservação da espécie. / The Cerrado have been severely degraded and Conservation Units protect a small part of its territory. The bees of the tribe Meliponini are endemic from the tropical regions and the genus Melipona is the richest in Brazil. Melipona rufiventris Lepeletier (1836) occurs in the Brazilian Cerrado and is endangered. This species integrates a group of species known as the rufiventris group, which has similar morphology and distribution in almost all Brazilian territory. The M. rufiventris conservation program should contain information on its geographical distribution and molecular data for the development of conservation populations. The aim of this work was to estimate the potential occurrence area of M. rufiventris, to identify promising genotypes to compose a conservation population and to study the phylogenetic relationships between some species of the rufiventris group. Maps containing the presence points of the species and the main characteristics to its conservation were elaborated using the QGis software. The potential area of the species was estimated based on the climatic suitability of the environment. Two regions of the DNA, the Cytochrome C oxidase I (COI) gene and the Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) were used in PCR amplifications for the phylogenetic inference studies and elaboration of the haplotype network. The maps showed that the occurrence area of M. rufiventris is broad, but is highly degraded and the remaining fragments are surrounded by areas whose land use was converted into agriculture and pasture. The priority areas for conservation of the Cerrado do not include all distribution of the species and the existing Conservation Units are very few and isolated, making it difficult to identify areas that can receive populations of M. rufiventris. The generated models indicate a large potential area of occurrence, but it is in a degraded region with several anthropic interferences. There is climatic suitability for the species in regions of the Atlantic Forest, but these areas are not seen as natural areas of M. rufiventris. The results of the molecular analyzes show the close relationship between uruçu amarela populations in the southeast of Brazil and reveals that the species not yet described in the northwest and north of Minas Gerais is most closely related to Melipona flavolineata than to M. rufiventris. Eight haplotypes were identified and all of them must compose the conservation populations that will be managed to the places indicated for conservation of the species.