Dos models es van usar en aquest estudi. El primer optimitzar la política de reemplaçament i el segon simula una explotació de truges, es van adaptar i van crear per estimar i comparar índexs tècnics i econòmics de granges de reproductores porcines. El primer model optimitza els índexs tècnics i econòmics de les granges a través de l'optimització de la prolificitat com l'índex de major importància en la productivitat numèrica de les truges, el segon model es va dissenyar i ocupació per simular de manera global el rendiment d'una granja. Per a la optimització dels índexs tècnics i econòmics es van estimar les corbes de prolificitat de cinc poblacions pertanyents a cinc orígens genètics diferents i es van obtenir dades de 53 granges, 24 espanyoles, 19 daneses i 10 cubanes, les corbes de prolificitat per ordre de part van ser obtingudes a partir del càlcul dels paràmetres estimats pel model. Els paràmetres són obtinguts del registre dels diferents esdeveniments de les truges i inclou els següents trets: identificació de la granja, identificació de la truja, nombre de parts i nombre de garrins nascuts vius, els resultats de l'optimització dels índexs tècnics i econòmics han posat de manifest un millor rendiment tècnic per les granges procedents de Dinamarca amb un nivell de significació per a (α <0.05), així com demostrar que altes taxes de reposició serien compensades econòmicament per la taxa de garrins deslletats. El model de simulació d'esdeveniments discrets, va ser adaptat per contemplar un maneig per lots i pren en consideració les tasques quotidianes de les granges. La contribució principal del model és la flexibilitat en l'organització de la producció que va des d'una simple granja de truges fins a un grup d'elles, com en realitat es porta a terme a la pràctica. Aquestes característiques permeten que el model determini la diferència respecte a altres enfocaments i compareu diferents estratègies de maneig reproductiu i sistemes de producció d'una manera més realista. Va ser emprat per simular una granja cubana i proposar una estratègia de maneig que millori els resultats productius de la mateixa. / Dos modelos se usaron en este estudio. El primero optimiza la política de reemplazamiento y el segundo simula una explotación de cerdas, se adaptaron y crearon para estimar y comparar índices técnicos y económicos de granjas de reproductoras porcinas. El primer modelo optimiza los índices técnicos y económicos de las granjas a través de la optimización de la prolificidad como el índice de mayor importancia en la productividad numérica de las cerdas, el segundo modelo se diseñó y empleo para simular de forma global el rendimiento de una granja. Para la optimización de los índices técnicos y económicos se estimaron las curvas de prolificidad de cinco poblaciones pertenecientes a cinco orígenes genéticos diferentes y se obtuvieron datos de 53 granjas, 24 españolas, 19 danesas y 10 cubanas, las curvas de prolificidad por orden de parto fueron obtenidas a partir del cálculo de los parámetros estimados por el modelo. Los parámetros son obtenidos del registro de los diferentes eventos de las cerdas e incluye los siguientes rasgos: identificación de la granja, identificación de la cerda, número de partos y número de lechones nacidos vivos, los resultados de la optimización de los índices técnicos y económicos han puesto de manifiesto un mejor rendimiento técnico para las granjas procedentes de Dinamarca con un nivel de significación para (α<0.05), así como demostraron que altas tasas de reposición serían compensadas económicamente por la tasa de lechones destetados. El modelo de simulación de eventos discretos, fue adaptado para contemplar un manejo por lotes y toma en consideración las tareas cotidianas de las granjas. La contribución principal del modelo es la flexibilidad en la organización de la producción que va desde una simple granja de cerdas hasta un grupo de ellas, como en realidad se lleva a cabo en la práctica. Estas características permiten que el modelo determine la diferencia con respecto a otros enfoques y permita comparar diferentes estrategias de manejo reproductivo y sistemas de producción de una manera más realista. Fue empleado para simular una granja cubana y proponer una estrategia de manejo que mejore los resultados productivos de la misma. / Two models were used for this study. The first model optimizes replacement policy and the second model simulates a farms of sows and were adapted and created to estimate and compares technical and economic indices on pig breeding farms. The first model optimizes technical and economic indices of farms through optimization prolificacy as the most important index in the numerical productivity of sows, the second model was designed to simulate and employment globally farm performance.For optimization of the technical and economic indices were estimated curves prolificacy of five populations from five different genetic origins and obtained data from 53 farms, 24 Spanish, 19 Danish and 10 Cuban, prolificacy curves in order of birth were obtained from the calculation of the parameters estimated by the model. The parameters are obtained from the register of the different events of the bristles and includes the following features: farm identification, identification of the sow, parity and number of piglets born alive, the results of the optimization of the technical and economic indices have shown a better technical performance for farms from Denmark with a significance level (α <0.05), and showed that high replacement rates would be compensated financially by the rate of piglets weaned. The model of discrete event simulation, was adapted to contemplate a batch management and takes into account the daily tasks of the farms. The main contribution of the model is the flexibility in the organization of production ranging from simple sow farm to a group of them, as actually is done in practice. These features allow the model to determine the difference from other approaches and allow compare different reproductive management strategies and production systems more realistically. Was used to simulate a Cuban farm and propose a management strategy to improve the productive results of it.

Los conceptos bioeconómicos modernos invocan la importancia de definir los derechos de propiedad posibles de ser llevados a cabo dentro del contexto de gestión. La investigación pesquera debe considerar las expectativas locales, en cuanto a los investigadores, administradores, mayoristas, las industrias, el público en general, y necesita volver al nivel de comunidades o pescadores. Partiendo de ese supuesto, realizase un análisis bioeconómico de la pesquería costera de Pernambuco, Nordeste de Brasil, dirigido a las pesquerías costeras de línea y redes de fondo. Se puede considerar como parte de un proyecto de planificación regional, en virtud de las peculiaridades sociales, económicas y culturales encontradas, el bajo Índice de Desarrollo de Humano (HDI) existente en esta Región, y la importancia de inserción social de las comunidades pesqueras menos favorecidas. El objetivo principal de este estudio fue aplicar un modelo bioeconómico pesquero desarrollado para las pesquerías del Mar Mediterráneo Norte-occidental, denominado MEditerranean FIsheries Simulation TOols - MEFISTO (Herramientas de Simulación de Pesquerías Mediterráneas), justificado por algunas similitudes existentes entre las pesquerías costeras de esa Región y del Estado de Pernambuco, entre las cuales la diversidad de especies y de los artes de pesca, las variaciones estacionales de las capturas, la comercialización, la dinámica de las flotas, etc. El modelo permitió extraer importantes contribuciones para la comprensión de la dinámica de la pesca costera, haciendo posible reproducirse las condiciones generales de como ocurre la actividad, así como simular las estrategias alternativas de gestión. Fue posible también observar y analizar las condiciones económicas, que pueden contribuir para que los tomadores de decisión logren un desarrollo sostenible de la actividad, de forma que las generaciones futuras también puedan beneficiarse del recurso. Para lograr los objetivos definidos, se plantearon cuestiones que involucran estos aspectos: ¿La planificación actual y las medidas de gestión para la pesca costera son adecuadas a la realidad local?; ¿Hay necesidad de quitar la presión/esfuerzo de las pesquerías tradicionales y diversificar la actividad para otros recursos y/o áreas de pesca?; y ¿Hay alguna viabilidad para invertir en la pesca costera? Así, las hipótesis levantadas, considerando las estrategias para llevar a cabo las medidas de gestión, son: La importancia de aplicar y adecuar modelos bioeconómicos para la gestión de la actividad pesquera de pequeña escala existente; Los niveles de biomasa actual de los estocs de peces de importancia económica son preocupantes y hay una necesidad para diversificar las pesquerías existentes; y La actividad de pesca de pequeña escala debe ser una prioridad de las políticas gubernamentales para el desarrollo sostenible del sector pesquero. El estudio propuesto fue desarrollado para apoyar los procedimientos de valoración y puede ser considerado como un factor determinante en la capacidad para el desarrollo de sistemas de valoración a ser aplicados para establecer los límites potenciales en el desarrollo de la investigación científica. Ciertamente, aun se necesita mucho trabajo para perfeccionar un modelo bioeconómico de gestión para la pesquería costera de Pernambuco, pero con ajustes y un análisis cuidadoso fue posible obtener resultados importantes e informaciones para la gestión de las pesquerías. De las hipótesis levantadas se puede concluir que el uso de modelos bioeconómicos para la valoración de estas pesquerías mostró ser una herramienta muy importante para la administración, que puede tener las informaciones basadas en los conceptos científicos para la definición y aplicación de estrategias de gestión para el desarrollo de las pesquerías; para la comunidad científica, que puede mejorar el conocimiento de la dinámica poblacional de los estocs pesqueros de Pernambuco y la dinámica de las flotas; y para los pescadores, que pueden conjugar sus conocimientos empíricos con las informaciones de rendimientos del modelo para mejorar sus estrategias de pesca. De un punto de vista biológico y económico parece que las pesquerías costeras de línea y red de fondo de Pernambuco han alcanzado un equilibrio. Pero, la susceptibilidad de los estocs y la fragilidad institucional y productiva pueden indicar, que un estado crítico es evidente, llevando a la ineficacia económica, puesto que no es el resultado de una acción planeada. De los resultados obtenidos no hay evidencia del agotamiento de los estocs de peces comerciales, considerando las especies blancos de las pesquerías de línea y red, pero hay la necesidad de diversificar esas pesquería, porque cualquier aumento en el esfuerzo de pesca colapsaría esos estocs. Ese equilibrio biológico y económico debe mantenerse, con la aplicación de medidas de gestión para la reducción del nivel actual de esfuerzo, juntamente con medidas que pueden atender las demandas de los pescadores. Sin embargo, la actividad pesquera de pequeña escala debe ser una prioridad de las políticas gubernamentales para el desarrollo sostenible del sector, mostrando ser económicamente viable, deseable del punto de vista social y ecológicamente adecuada / Os conceitos bioeconômicos modernos invocam a importância para definir os direitos de propriedade possíveis de serem implementados dentro do contexto de gestão. A pesquisa pesqueira deve considerar as expectativas locais, para os pesquisadores, administradores, atacadistas, as indústrias, o público em geral, e precisa ser devolvido ao nível de comunidades ou pescadores. Seguindo este conceito, realizou-se uma análise bioeconômica da pesca costeira do Estado de Pernambuco, Nordeste do Brasil, dirigida à pesca de linha-de-mão e à de rede-de-espera. Pode-se entendê-la como parte de um projeto de planejamento regional, em virtude das peculiaridades sociais, econômicas e culturais, o baixo Índice de Desenvolvimento Humano (HDI) existente nesta Região, e a importância da inserção social das comunidades menos favorecidas. O objetivo principal deste estudo foi aplicar um modelo bioeconômico pesqueiro desenvolvido para as pescarias da região Noroeste do Mar Mediterrâneo, denominado MEditerranean FIsheries Simulation TOols - MEFISTO (Ferramentas de Simulação de Pescarias Mediterrâneas), o qual justifica-se por algumas semelhanças existentes entre as pescarias costeiras do Mediterrâneo e do Estado de Pernambuco, tais como diversidade de espécies e petrechos de pesca, variações sazonais das capturas, o processo de comercialização, a dinâmica de frotas, etc. O modelo permitiu extrair contribuições significantes para a compreensão da dinâmica de pesca litorânea, tornando possível reproduzir as condições gerais de como a atividade ocorre e simular estratégias alternativas de gestão. Também foi possível observar e analisar as condições econômicas que podem contribuir para que os tomadores de decisão alcancem um desenvolvimento sustentável da atividade, de forma que gerações futuras também possam beneficiar-se do recurso. Para alcançar os objetivos definidos, algumas perguntas considerando esses aspectos foram levantadas: O planejamento atual e as medidas de gestão para a pesca litoral são adequadas à realidade local?; Há alguma necessidade em remover a pressão/esforço sobre os estoques tradicionais e diversificar a atividade de pesca costeira para outros recursos e/ou áreas de pesca?; e Há alguma viabilidade em investir na pesca litoral? Assim, as hipóteses levantadas, considerando as estratégias para implementar medidas de gestão, foram: A importância em aplicar e adequar modelos bioeconômicos para a gestão da atividade de pesca de pequena escala existente; Os níveis de biomassa atual dos estoques de peixe de importância comercial são preocupantes e há uma necessidade em diversificar as pescarias existentes; e A atividade de pesca de pequena escala deve ser uma prioridade das políticas governamentais para o desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro. O estudo proposto foi desenvolvido para apoiar os procedimentos de avaliação, e pode ser considerado como um fator determinante na capacidade para o desenvolvimento de sistemas de avaliação a serem aplicados para estabelecer os limites potenciais no desenvolvimento da pesquisa científica. Certamente muito trabalho ainda é necessário antes que um modelo bioeconômico para a pesca costeira do Estado de Pernambuco seja aperfeiçoado, mas com alguns ajustes e análise criteriosa foi possível obter resultados importantes e informações para a gestão da pesca. Das hipóteses levantadas pode-se concluir que o uso de modelos bioeconômicos para a avaliação dessas pescarias mostrou ser uma ferramenta importante para a administração, que pode ter informações fundamentadas em evidências científicas para a definição e implementação de estratégias de gestão para o desenvolvimento de pescarias; para a comunidade científica, que pode enriquecer conhecimentos sobre a dinâmica de populações pesqueiras da costa pernambucana e a dinâmica de frotas; e para os pescadores, que podem igualmente enriquecer seus conhecimentos empíricos com os resultados do modelo e melhorar suas estratégias de pesca. De um ponto de vista biológico e econômico parece que as pescarias de linha-de-mão e de rede-de-espera alcançaram um equilíbrio. A suscetibilidade dos estoques pesqueiros e a fragilidade institucional e produtiva podem indicar, entretanto, que um estado crítico é evidente, conduzindo a ineficiência econômica, posto que não é o resultado de uma ação planejada. Dos resultados obtidos não há nenhuma evidência de que os estoques de peixes comercialmente importantes estejam esgotados, considerando as espécies alvo das pescarias de linha-de-mão e de rede-de-espera, mas há a necessidade de diversificar a pesca existente, porque qualquer aumento do esforço de pesca se colapsariam esses estoques. Esse equilíbrio biológico e econômico deve ser mantido, no entanto com a implementação de medida de conservação que encoraja a redução do nível atual de esforço, juntamente com medidas que possam atender as reinvidicações dos pescadores. Evidenciou-ser que a atividade de pesca em pequena escala deve ser uma prioridade de políticas governamentais para desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro, mostrando ser economicamente viável, desejável no ponto de vista social e ecologicamente adequado. / Modern bioeconomic concepts invoke the importance to define the property rights possible to be implemented within a management context. In conducting a fishery research, local expectancies must be achieved, as for fisheries researchers, managers, stakeholders, industries, the concerned public at large, and it need to be devolved down to the level of communities or fishermen. Following this concept, a bioeconomic analysis of the coastal fishery of Pernambuco State, North-eastern Brazil, was conducted, directed to the hand-line and gillnet coastal fisheries management, as part of a regional planning project, in virtue of the found social, economic and cultural peculiarities, the existing low Human Development Index (HDI) of this Region, and the importance of social insertion of the less favoured fishing communities. The main objective of this study was to apply a bioeconomic fishing model developed for the North-western Mediterranean Sea fisheries, named MEditerranean FIsheries Simulation TOols - MEFISTO, justified by some existing similarities among Mediterranean and Pernambuco State coastal fisheries, such as diversity of species and fishing gears, seasonal variations of the captures, commercialisation process, fishing fleet dynamics, etc. The model allowed significant contributions for the understanding of the coastal fishing dynamics, making possible to reproduce the general conditions on how the activity occurs and to simulate alternatives management strategies. Also, it was possible to observe and analyse its economic conditions, helping decision-makers to achieve a sustainable development of the activity, so that future generations can also benefit from the resource. To achieve the defined objectives, questions concerning these aspects were raised: Current planning and management measures for the coastal fishery are adequate to the local and actual reality?; Is there a necessity to remove the pressure/effort on the traditional fishing stocks and to diversify the coastal fishery activity for other resources and/or fishing areas?; and Is there any feasibility to invest in the coastal fishery? Thus, the hypotheses raised considering the strategies to implement management measures were: The importance to apply and adequate bioeconomic model for the management of the small-scale existing fishing activity; Most important commercial fish stocks are depleted, with low biomass levels, and there is a necessity to diversify the existing fishery; and The small-scale fishing activity must be a priority of governmental policies for the sustainable development of the fishery sector. The proposed study was thus developed to support assessment procedures, and may be considered as a determining factor in the capacity for the development of assessment systems to be applied to establish the potential limits in the development of scientific research. Certainly much more work is needed before a bioeconomic model of the Pernambuco coastal fishery can be perfected, but with some adjustment and careful analysis it was possible to obtain important results and informations for fisheries management. From the raised hypotheses can be concluded that the use of bioeconomic models for the assessment of these fisheries showed to be a very important tool for the administration, which may have informations based on scientific advise for the definition and implementation of management strategies for fisheries development; for the scientific community, which may improve knowledge on the population dynamics of the fishing stocks off Pernambuco and the dynamics of fishing fleets; and for the fishermen, which can join their empirical knowledge with the model outputs informations to improve their fishing strategies. From a biological and economic point of view it seems that Pernambuco State handline and gillnet coastal fisheries has reached an equilibrium. The stock susceptibility and the institutional and productive fragility may indicate that a critical state is evident, leading to economic inefficiency, since it is not the result of a planned action. From the results obtained there is no evidence of commercial fish stocks depletion, inasmuch the target hand-liners and gill-netters species are considered, but that there is a necessity to diversify these fisheries, because any increase in fishing effort would collapse these commercial stocks. Such a biological and economic equilibrium should be maintained, nonetheless with the implementation of management conservation measures that encourage the reduction of the current level of effort, jointly with measures that can bring about fishermen claim. It became clear that the small-scale fishery activity must be a priority of governmental policies for the sustainable development of the fishery sector, showing to be economic viable, desirable on the social point of view and ecologically adequate.

Tesis por compendio de publicaciones / Esta tesis doctoral, por compendio de artículos, ha sido diseñada con el fin de producir avances en la medición de biomarcadores de estrés y para desarrollar y validar un panel de biomarcadores salivares para evaluar los diferentes sistemas fisiológicos (simpático-adrenomedular (SAM), hipotálamo-pituitario-adrenal (HPA), hipotálamo-pituitario-gonadal (HPG) y sistema inmune) que participan en el mecanismo de estrés. Para ello, los objetivos de esta tesis son los siguientes: desarrollar y validar un ensayo inmunofluorométrico a tiempo resuelto (TR-IFMA) para las mediciones de cromogranina A (CgA) salivar porcina, utilizando un anticuerpo específico de la especie, y evaluar su comportamiento como posible biomarcador del sistema SAM en un modelo de estrés agudo. Además, estudiar si las concentraciones de CgA salivar exhiben un patrón circadiano durante el día, y evaluar su estabilidad bajo diferentes condiciones de almacenamiento. Por otra parte, validar inmunoensayos disponibles comercialmente para la cuantificación de cortisol (biomarcador del sistema HPA), testosterona (biomarcador del sistema HPG) e IgA (biomarcador del sistema inmune) en la saliva de los cerdos. Evaluar la respuesta de un panel de varios biomarcadores salivares tanto del sistema inmune como del sistema neuroendocrino a la administración repetida de Escherichia coli lipopolisacárido (LPS) y, por último, investigar la respuesta de todo este grupo de biomarcadores salivares después de aplicar un modelo de estrés psicosocial en cerdos basado en el aislamiento y el reagrupamiento. En cuanto a la metodología empleada, los anticuerpos policlonales específicos producidos para el desarrollo del TR-IFMA fueron obtenidos mediante la inmunización con un péptido recombinante de proteína CgA porcina. La precisión, exactitud y sensibilidad analítica del TR-IFMA desarrollado y de los inmunoensayos comerciales empleados fueron evaluadas mediante los coeficientes de variación intra- e interensayo, la linealidad bajo dilución y el porcentaje de recuperación, el límite de detección y los límites de cuantificación. Para estudiar la respuesta de los biomarcadores salivares frente al estrés se emplearon modelos en los que los animales fueron inmovilizados con un acial o transportados a matadero. Tomando muestras de saliva antes y después de aplicar dichos estímulos estresantes. Por otro lado, en el caso de la administración de LPS, los cerdos que fueron utilizados recibieron tres dosis de LPS en intervalos de 48 h. Las muestras de saliva fueron tomadas antes de la administración de LPS y 3 h después de cada una de las administraciones. Por otra parte, en el modelo de aislamiento y reagrupamiento todos los animales se adaptaron a la vida en grupo durante 5 días, después de lo cual, un grupo de cerdos fueron sometidos al procedimiento de aislamiento, donde los animales permanecieron sin contacto físico con otros cerdos durante 5 días. Después, los cerdos del ensayo se reagruparon de nuevo durante 3 días, regresando a las condiciones iniciales. Los cerdos controles permanecieron en las mismas condiciones durante todo el estudio. Las muestras de saliva se tomaron diariamente, a la misma hora, y un muestreo adicional fue realizado a los 30 min tras los procedimientos de aislamiento y reagrupado. En general, nosotros podemos concluir de este trabajo que: el TR-IFMA desarrollado permite la cuantificación de CgA en muestras de saliva porcina de una forma precisa, exacta y sensible y su concentración aumenta significativamente después de una situación de estrés agudo. Además, no ha sido detectado un patrón circadiano para la CgA salivar y este biomarcador fue bastante estable, siendo posible su almacenamiento hasta un año a -20ºC o -80ºC. Por otra parte, los inmunoensayos comerciales validados para las concentraciones de cortisol, testosterona e IgA pueden ser utilizados para su uso en muestras de saliva de cerdos con una buena precisión, sensibilidad y exactitud. En cuanto a la administración de LPS, una sola administración en cerdos produce incrementos de IgA salivar y cortisol. Sin embargo, administraciones repetidas solo producen incrementos en IgA mientras que el cortisol retorna a valores basales. No se observaron variaciones en las concentraciones de CgA ni con una sola administración ni con administraciones repetidas. Finalmente, el uso de un panel de biomarcadores salivares podría ser esencial en la investigación de estrés, ya que estos reaccionan de manera diferente a diversos tipos de factores estresantes. En el caso del aislamiento, CgA e IgA parecen ser marcadores más sensibles que el cortisol y la testosterona, mientras que después del proceso de reagrupado, el cortisol, la testosterona y la CgA parecen ser marcadores más sensibles que la IgA. / This PhD thesis, for compendium of articles, was designed in order to produce advances in the measurement of salivary biomarkers of stress and to develop and validate a panel of salivary biomarkers to evaluate the different physiological systems (sympatho-adrenomedullary (SAM), hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA), hypothalamus-pituitary-gonadal (HPG) and immune system) that are taking part in stress mechanism. To this end, the objectives of this thesis are: to develop and validate a time-resolved immunofluorometric assay (TR-IFMA) for porcine salivary chromogranin A (CgA) measurements, using a species-specific antibody, and evaluate its behaviour as a potential biomarkers of SAM system in an acute stress model. In addition, to study if salivary CgA concentrations exhibit any circadian pattern during the daytime, and to evaluate its stability under different storage conditions. Moreover, validate commercially available immunoassays for cortisol (HPA system biomarker), testosterone (HPG system biomarker) and IgA (immune biomarker) quantification on the saliva of pigs. To evaluate the response of a panel of several salivary biomarkers both of immune system as well as of the neuroendocrine system to repeated administration of Escherichia coli lipopolysaccharide (LPS) and, finally, to investigate the responses of this group of salivary biomarkers after applying a psychosocial stressor model in pigs based on isolation and regrouping. Regarding the methodology, polyclonal antibodies specific for the development of TR-IFMA were produced in rabbits immunized with a recombinant protein peptide of CgA porcine. Precision, accuracy and analytical sensitivity of the TR-IFMA developed and of the commercial immunoassays used were evaluated by the coefficients of variation intra- and inter-assay, linearity under dilution and the percentage of recovery, limits of detection and limits of quantitation. To study the stress response of salivary biomarkers, models in which the animals were immobilized with a nose-snare or transported to slaughterhouse were used. Saliva samples were taken before and after of applying these stressful stimuli. On the other hand, in the case of LPS administrations, the pigs were selected to receive three doses of LPS at 48 h intervals. Saliva samples were taken prior to any LPS administration and at time points corresponding to 3 h after each injection. Moreover, in the model of isolation and regrouping all animals were adapted to group living for 5 days, after which time, pigs in one group were subjected to the isolation procedure, where each animal had not physical contact with other pigs during 5 days. After, test pigs were regrouped again during 3 days returning to the initial conditions. Control pigs were remained in the same housing condition during the entire experimental period. Saliva samples were taken daily, at the same time, and one sampling was carried out at 30 min after of isolation and regrouping events. In overall, we can conclude of this work that: the TR-IFMA developed allows the quantification of CgA in porcine saliva samples in a precise, accurate and sensitive way and its concentrations increase after an acute stress situation. In addition, no circadian pattern has been detected for salivary CgA and this biomarker was fairly stable being able to be stored till 1 year at -20ºC or -80ºC. Moreover, the commercial immunoassays validated for cortisol, testosterone and IgA concentrations can be suitable for its use in saliva samples of pigs with a good precision, sensitivity and accuracy. In relation to LPS administrations, a single administration in pigs produces increases of salivary IgA and cortisol. However, repeated administrations only produced increases in IgA whereas cortisol returned to baseline values. No variation in CgA concentrations were observed neither in single nor in repeated LPS administration. Finally, the use of a panel of salivary biomarkers would be essential in stress research, since these react differently to various types of stressors. In the case of isolation, CgA and IgA appear to be more sensitive markers than cortisol and testosterone, whereas after the process of regrouped, cortisol, testosterone and CgA seem to be more sensitive markers than IgA.

1. Objetivos: • General: 1. Extender la vida útil de la carne cruda y cocinada de cordero, conservada en condiciones usuales de comercialización al por menor, mediante la suplementación dietética con extractos tipificados de romero compuestos por ácido carnósico y carnosol. • Específicos: 1. Optimizar el método de suplementación de la dieta considerando la época de administración, la proporción de ácido carnósico y carnosol y la dosis de extracto en el pienso. 1.1. Determinar el efecto de la época de administración (gestación, lactación y cebo) sobre la calidad y vida comercial de la carne. 1.2 Determinar el efecto del ratio ácido carnósico/carnosol sobre la calidad y vida comercial de la carne. 1.3 Establecer la dosis conservante mínima efectiva en carne con el objeto de optimizar la relación dosis-efecto de los suplementos ovinos. 2. Metodología: La investigación se realizó en tres fases. En un primer experimento se suministraron 600 mg kg-1 de un extracto de romero (ER) compuesto por ácido carnósico y carnosol (2:1) a la ovejas gestantes y lactantes, y también a los corderos de cebo. En un segundo experimento se suministraron 600 mg kg-1 de un ER enriquecido en carnosol (1:1) sólo a los corderos de cebo. En un tercer experimento se repitió el ensayo anterior reduciendo la dosis de ER 1:1 a 200 y 400 mg kg-1. La carne cruda (lomo) fue envasada en atmósfera protectora (70/30 O2/CO2) y almacenada hasta 21 días en una vitrina a 2 ºC y 800 lx. La carne cocinada (hamburguesas de pierna) fue envasada en aerobiosis hasta 4 días en una vitrina a 2 ºC y 800 lx. El deterioro de la carne se determinó en base a diversos parámetros físico-químicos (pH, color CIELAB, índice TBARS y carbonilos totales), microbiológicos (aerobios mesófilos, psicrófilos, enterobacterias y mohos y levaduras) y sensoriales (apariencia, olor, flavor y textura). 3. Conclusiones: Primera. La suplementación dietética de los corderos ternascos de raza Segureña con extractos tipificados de romero, ricos en ácido carnósico y carnosol, mejora la capacidad conservante endógena de la carne, debido a que inhibe la oxidación y, en menor medida, el deterioro microbiológico de la misma. Segunda. La extensión de dicha suplementación a las ovejas durante la gestación y lactación no mejora la capacidad de conservación de la carne, siendo aconsejable limitar el tratamiento dietético a los corderos de cebo por motivos económicos. Tercera. La carne cruda reforzada con conservantes endógenos de romero es más resistente a la decoloración, a la oxidación lipídica y proteica, y a la proliferación de microorganismos, de modo que su deterioro sensorial es más lento y su tiempo de vida comercial es más prolongado. Cuarta. La ingesta de carnosol es clave para la eficacia antioxidante de este tipo de extractos de romero, ya que al enriquecer el extracto con carnosol se consigue retrasar la oxidación y el enranciamiento de la carne cocinada, lo que a su vez indicaría cierta termorresistencia de los conservantes endógenos asimilados por los ovinos y depositados en el músculo. Quinta. Se recomienda suplementar a los corderos de cebo con al menos 200 mg de extracto enriquecido en carnosol por kilogramo de pienso para mejorar la calidad tecnológica de la carne cruda y aumentar dicha dosis a 600 mg para extender el efecto conservante a la carne cocinada. Sexta. La incorporación a través de la dieta de diterpenos de romero ha resultado ser una estrategia eficaz para mejorar la calidad tecnológica de la carne de cordero sin necesidad de añadir conservantes. / Extending shelf life of lamb meat by dietary supplementation with rosemary extract. PhD student: Rafael Serrano Espada. Thesis advisor: Sancho José Bañón Arias. 1. Objectives: • General: 1. Extending shelf life of raw and cooked lamb meat preserved at retail through dietary supplementation with typified rosemary extracts composed by carnosic acid and carnosol. • Specific: 1. Optimizing the diet supplementation method considering the administration time, the carnosic acid/carnosol ratio and the extract dose in feed. 1.1. Determining the effect of administration time (gestation, lactation and feed) on quality and shelf life of meat. 1.2. Determining the effect of the carnosic acid/carnosol ratio on quality and shelf life of meat. 1.3 Establish the minimum effective dose to preserve meat in order to optimize the dose-effect relationship of sheep supplements. 2. Methodology: The research was divided in three experiments. In a first experiment, pregnant and lactating ewes and lambs were given a feed supplemented with a rosemary extract (RE), consisting of carnosic acid and carnosol (2:1), in a dose of 600 mg per kg feed. In a second experiment, lambs were given a feed supplemented with a RE enriched with carnosol (1:1) in a dose of 600 mg per kg feed. In a third experiment, the previous test was repeated using reduced doses of RE (200 and 400 mg per kg feed). Raw meat (loin) was packaged under modified atmosphere (70/30 O2/CO2) and stored up to 21 days in a display cabinet at 2 ºC and 800 lx. Cooked meat (burger) was packaged aerobically and stored up to 4 days in a display cabinet at 2 ºC and 800 lx. Meat deterioration was determined using physical-chemical parameters (pH, CIELAB colour, TBARS index and total carbonyls), microbiological parameters (total viable counts, total psychrophilic bacteria, Enterobacteriaceae and moulds and yeasts) and sensory parameters (appearance, odour, flavour and texture). 3. Conclusions: First. The dietary supplementation of Segureña lambs with typified rosemary extracts, rich in carnosic acid and carnosol, improves the endogenous preservative capacity of meat due to oxidation inhibition and, in a lesser extent, to microbiological deterioration decrease. Second. The additional supplementation of ewes during gestation and lactation does not improve the preservative capacity of meat, being recommendable to limit the dietary treatment to lambs for economic reasons. Third. Raw meat improved with endogenous preservatives is more resistant against discolouration, lipid and protein oxidation and microorganism proliferation, therefore its sensory deterioration is slower and its shelf life is longer. Fourth. Carnosol intake is key to the antioxidant effectiveness of these rosemary extracts, considering that enrichment of the extract with carnosol retards oxidation and rancidity of cooked meat. This could indicate some thermal resistance in endogenous preservatives assimilated and deposited in sheep´s muscle. Fifth. It is recommended supplementing lambs with at least 200 mg of carnosol enriched extract per kilogram of feed to improve the technological quality of raw meat. To extend the preservative effect to cooked meat that dose must be increased until 600 mg. Sixth. The dietary incorporation of rosemary diterpenes is an effective strategy to improve lamb meat technological quality without the addition of chemical preservatives.

La industria quesera demanda el desarrollo de instrumentos de medida en línea, sencillos, sanitarios y no destructivos, que permitan la monitorización del proceso de coagulación de la leche y la predicción de parámetros de control tales como tiempo de coagulación y, en especial, tiempo de corte. La determinación objetiva del tiempo de corte mejora el rendimiento quesero y la homogeneidad del producto. El objetivo general del presente trabajo ha sido el estudio de un sensor de fibra óptica que determina dispersión de radiación en el infrarrojo próximo, como método de monitorización de la coagulación y selección objetiva del tiempo de corte. A tal fin, se realizan tres experiencias mediante el empleo de sendos diseños de bloque completamente aleatorios, con tres réplicas cada uno. En cada una de estas experiencias se seleccionan diferentes factores y niveles experimentales para estudiar su influencia sobre la coagulación y, especialmente, sobre los algoritmos de predicción del tiempo de corte. / The cheese industry demands the development of simple, sanitary and non-destructive measuring instruments in the line in order to monitor the process of coagulation in the milk and predict control parameters such as clotting time and, above all, cutting time. The objective determination of cutting time improves the cheese yield and the homogeneity of the product. The general objective of this study is to analyse the use of a fibre-optic sensor to determine light scattering of near infrared radiation in order to monitor milk coagulation and objectively select the cutting time. To this end, three experiments were carried out using completely randomised block designs. Each experiment was replicated three times. In each of them different experimental factors and levels were selected with the aim of providing information concerning the influence of the different factors on clotting and, especially, on the algorithms for predicting cutting time.

En las últimas décadas la dificultad de encontrar en el comercio cuajos naturales en pasta de cordero,así como los inconvenientes legales causados por la normativa que regula sus contenidos microbiológicos ha facilitado que las industrias queseras recurran a cuajos y coagulantes lácteos comerciales estandares con la consiguiente pérdida de sabores tradicionales en una gran variedad de quesos que se logran con los cuajos en pasta.El primer objetivo de este estudio consiste en caracterizar cuatro diferentes cuajos en pasta de cordero elaborados siguiendo distintos procedimientos de fabricación a partir de abomasos de corderos lechales llenos y vacíos de leche,a los que posteriormente, se les aplica distintas tecnologías con el objetivo de conservarlos y estudiar su viabilidad práctica y comercial.En segundo término y una vez seleccionado el cuajo en pasta idóneo que combina una actividad coagulante y lipolítica adecuada,se procede a su empleo en la elaboración de Queso de Murcia al Vino,comparándolo con aquellos obtenidos con cuajo líquido de ternera,que es el que habitualmente se utiliza en la fabricación industrial.Por último,se procede a la caracterización de los quesos experimentales mediante el análisis fisicoquímico,microbiológico,reológico y sensorial para determinar el efecto que produce este tipo de cuajo en pasta de cordero sobre los quesos de Murcia al Vino y poder compararlos con los elaborados siguiendo la técnica habitual.Se demuestra que los quesos obtenidos con el cuajo natural en pasta de cordero son diferentes a los habitualmente fabricados,principalmente por alcanzar un determinado grado de madurez en un tiempo menor,reflejado en la textura,manifestar una actividad proteolítica y lipolítica más intensas causantes de la formación de sabores diferentes a los habitualmente obtenidos,principalmente algo amargos y picantes.Los resultados del análisis sensorial del panel de cata muestran que,si bien estos quesos se diferencian de los que habitualmente se obtienen mediante el uso de cuajo comercial, ofrecen una alternativa válida y novedosa al sector quesero de la Región de Murcia. / Since last decades it is so difficult to obtain lamb rennet pastes because they are generally not available and also new rules make them be out of law specially microbial levels. It led manufacturers to get other kind of rennets or coagulants. Although they can obtain cheaper rennets easyly what they lost was one of the most important things: the natural, typical traditional flavour of the cheese.The main objective of this study is the characterization of four lamb rennet pastes obtained following different sort of manufactures. This consists in treating two groups of abomasas ones full and the other ones empty of milk before the slaughter. After that these two groups of abomasas are treated with different technics so that they can be employed lately without any problem by combining adequate renneting and lipase activity. After one of them is chosen it is employed to manufacture Queso de Murcia al Vino (Murcian wine cheese) to compare with that obtained from kid liquid rennet.Secondly, several kind of analysis are made on the cheeses in order to determine its characteristics and the differences between them.As a result of this investigation we found that it exists many differences between the two types of cheeses. For example those cheeses made with rennet paste reached an adequate grade of maturity before those made with kid liquid rennet. Also we determined higher proteolysis and lipolysis activities values in those made with natural lamb rennet paste. In addition the cheeses obtained using rennet paste had a piquant and little bitter taste which was different to those made with commercial rennet.Finally, the sensory analysis gave a so good score for the cheese manufactured with rennet paste. It means that this kind of lamb rennet paste can be employed in the cheese making industrial sector as a good new alternative one.

En la presente Tesis se ha construido un modelo informático para la simulaciónestocástica de rebaños de vacas nodrizas. El modelo ha sido validado con datosreales y utilizado para la simulación de estrategias de manejo invernal en rebaños devacas nodrizas explotadas en las condiciones de montaña del Pirineo.Para la construcción del modelo se ha descrito un submodelo de repartición de laenergía aportada por la dieta. Este submodelo ha sido utilizado para la estimación dela energía neta para mantenimiento y de la variabilidad individual de dicho parámetroen vacas de raza Parda Alpina. Para ello se utilizaron los datos individuales,productivos y de manejo nutricional, de 34 vacas en lactación y 40 vacas engestación. El valor estimado para las necesidades de mantenimiento fue de 0.55 MJEN/kg PVV0.67 y mostró una gran variabilidad entre individuos (la varianza delparámetro fue 0.015).Utilizando un modelo lineal con coeficientes aleatorios, se analizaron los pesos de318 terneros (4476 registros de peso) de raza Parda Alpina y Pirenaica, con el fin deestimar las pautas de crecimiento y variabilidad individual de los parámetros quedefinen las curvas de crecimiento predestete. El crecimiento de los terneros se puededescribir con una aproximación cuadrática (se comprobó que la utilización de unaaproximación lineal para la obtención de pesos estandarizados puede conducir asesgos importantes). Existe, por otro lado, una gran variabilidad individual en lospesos predestete de los terneros, que el modelo tiene en cuenta con un peso alnacimiento y una ganancia media diaria variables entre animales. La variabilidadestimada es suficiente como para considerar su utilización en un modelo estocástico.Las estimas sobre la variabilidad de la energía de mantenimiento de las vacasadultas, del peso al nacimimento y de la ganancia diaria de los terneros, fueronutilizadas en un modelo estocástico de simulación de lotes de animales sometidos aun manejo nutricional y reproductivo concreto. Dicho modelo fue validado utilizandolos resultados productivos de 10 lotes de entre 12 y 17 vacas. La validación delmodelo propuesto permite afirmar su adecuación a la hora de simular la media y lavariabilidad de la respuesta productiva a lo largo de un periodo de tiempo largo de unlote de vacas y terneros con alimentación restringida. / A computer model was developed in order to make stochastic simulation of sucklercows herds. The model has been validated using actual data and was used forsimulation of winter management strategies of suckler cow herds in mountainconditions.A submodel for the diet energy distribution has been described as a part of the model.This submodel has been used for estimating the net energy for maintenance and theindividual variability of that parameter in Parda Alpina cows. Productive and nutritionalmanagement individual data from 34 lactating and 40 pregnant cows have been used.The maintenance requirements estimated value was 0.55 MJ NE/kg EBW0.67 and itshowed a high variability between animals.Data from 318 Parda Alpina and Pirenaica calves (4476 weight records) wereanalysed using a lineal model with random coefficients in order to estimate the growthpattern and the individual variability of the preweaning curve parameters. Preweaningcalf growth could be described using a quadratic approximation and the use of alineal approximation for obtaining corrected weight can lead to important biases.There is, in addition, a very high individual variability in calves preweaning weights. Itwas introduced in the model allowing a between animal variable birth weight andaverage daily gain. The estimated variability was enough to take it into account in astochastic model.Variability estimations of adult cows maintenance requirements, birth weight andaverage daily gain, were used in a stochastical model for complex animal groupssimulation under a certain nutritional and reproductive management. The model wasvalidated using actual productive performance from 10 groups of animals(between 12to 17 cows per group). Validation of the proposed model confirm that it is useful forsimulating the mean and variance of long term productive response of a cows andcalves group under a restricted alimentation.Finally, the model was used for simulating the effect of some winter subnutritionstrategies in cows calving either in spring or autumn. In the conditions of simulation,autumn calving cows showed the possibility of subnutrition during postpartum period.On the other side, results from spring calving cows showed that winter subnutrition inthat case are limited.

Después de Alemania, España es el segundo mayor productor de cerdos entre los 25 países de la Unión Europea. El consumidor tiene una importancia relevante debido a la tradición cultural del consumo de carne, reflejada en la gastronomía de todas las regiones de España. Cataluña forma parte de las seis regiones Europeas más productoras de cerdos y representa aproximadamente un tercio de la producción Española. El presente trabajo analiza las características y comportamiento de varios agentes que conforman la cadena de abastecimiento porcina en Cataluña, con el objetivo de valorar si estas operan de acuerdo a los parámetros de una cadena de abastecimiento Lean. Inicialmente un modelo de cadena Lean se propone como herramienta para llevar a cabo la valoración. Los resultados llevan a determinar si la situación en la cadena porcina Catalana se asemeja a una cadena tipo Lean. / After Germany, Spain is the second largest producer of pigs in the 25 European Union countries. The domestic consumer is highly relevant due to a cultural tradition of fresh meat consumption which is reflected in the gastronomy of all the regions of Spain. None more so than in Catalonia which is one of the six main European production regions accounting for approximately one third of Spanish production. This research analyses the characteristics and the performance of the various supply chain agents which make up the Catalan pork supply chain, with the objective being to assess whether these operate according to the parameters of a lean supply chain. First a lean supply chain model is proposed as a tool to carry out this assessment. Then, the performance of the Catalan pork supply chain is assessed to ascertain whether it resembles that of a lean supply chain.