Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-01-30Bitstream added on 2014-06-13T18:54:57Z : No. of bitstreams: 1 godoy_ar_me_btofca.pdf: 727119 bytes, checksum: a07c88226e4ee013ff973e2abe507e82 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The objective of this work was evaluate the inbreeding depression with successive generations of self-pollination in a cucumber caipira population (S0, S1, S2, S3; S4 e S5), obtained by crossing Safira x Hatem hybrids. Two experiments were accomplished: one to evaluate immature fruits production and another to analyze the mature fruits production, seed quality and yield. The experimental design of both experiments were randomized blocks, in the first with seven treatments (different generations of self pollination - S0 to S5 and the hybrid Safira), six replicates and five plants per plot and in the second the same seven treatments, four replicates and five plants per plot. In the first experiment (immature fruits) was number of leaves, length of the main stem, number and weight of fruits, total and commercial, number of nodes and vines percentage were evaluated. In the second experiment (mature fruit) the following traits were evaluated characteristic: seed number and weight per plant and per fruit and seed quality (germination test, first counted of seeds, index of germination speed and weight of 100 seeds). The averages were compared by the Tukey test (5%) and the evaluation of the inbreeding depression was made with regression analysis. In the experiment 1 smaller production of fruits was observed (total and commercial) starting from population S2, demonstrating possible vigor loss. The populations S0 and S1 were similar or superiors for the characteristics number of total fruits, total weight per plant and commercial weight per plant when compared to the hybrid Safira, demonstrating the potencial of this population to obtain a new cultivar or hybrid of the caipira type. The experiment two there was no statistical difference for all the appraised characteristics, showing that the inbreeding didn`t affect the production and quality of the seeds in this population.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / La endogamia es considerada como un factor determinante en la selección de pareja y en el éxito reproductivo de animales silvestres. Sin embargo, los estudios que analizan la importancia de la selección de pareja y la evasión de endogamia en mamíferos son escasos en especies silvestres. En esta memoria de título analicé la selección de pareja que realizan las hembras de dos poblaciones alopátricas del roedor caviomorfo Octodon degus, pertenecientes a dos poblaciones de distinta distribución geográfica y condiciones climáticas, con el objetivo de determinar si las preferencias de las hembras sobre los machos para aparearse permitirían evitar apareamientos endogámicos y evaluar la existencia de variación inter-poblacional e intra-poblacional en la selección de pareja. Los experimentos fueron diseñados para controlar otros mecanismos de competencia reproductiva que no correspondieran con la selección de pareja. Cada individuo focal (i.e., hembras nacidas en cautiverio a partir de madres capturadas de Huasco (III Región) y Rinconada de Maipú (RM)) pudo seleccionar entre un macho cercanamente emparentado (hermano), y otro macho no emparentado genéticamente, pero originario de la misma población. Los experimentos se realizaron en un laberinto en forma de “Y”, que consta de un sistema de ventilación especialmente diseñado para que la hembra focal, posicionada en la base del laberinto “Y”, reciba señales olfativas de ambos machos cada uno ubicado en uno de los brazos del laberinto. Los resultados obtenidos con la prueba no paramétrica de Wilcoxon muestran que no existen diferencias significativas en la selección de pareja a nivel intra-poblacional en ambas poblaciones. La prueba de Mann-Whitney para dos muestras independientes determinó diferencias significativas en todas las variables consideradas entre las hembras de Rinconada y Huasco. Los resultados sugieren que las diferencias conductuales de las hembras de ambas poblaciones podrían ser producto de un proceso adaptativo a las condiciones ecológicas locales contrastantes, aunque se consideran necesarios estudios complementarios para corroborar esta hipótesis.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / El Terrier Chileno es una nueva raza de perros que recientemente ha sido reconocida por el Kennel Club Chile como la primera raza originada en Chile. En la actualidad hay más de cinco generaciones registradas en el pedigrí, pero no existe información sobre la estructura genética de la raza. En el presente trabajo se investigó la variabilidad genética y se estimaron los niveles de endogamia de esta nueva población. Adicionalmente, el objetivo fue validar un conjunto de marcadores del tipo microsatélites para análisis de paternidad. El ADN se obtuvo de cincuenta fundadores de la raza no emparentados, elegidos de acuerdo a datos de pedigrí. Diecisiete microsatélites fueron genotipados y todos resultaron ser altamente polimórficos, con un número de alelos que osciló entre 4 y 14. El coeficiente de endogamia estimado para cada marcador varió de -0,02 a 0,52. Nueve microsatélites mostraron desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg, probablemente causada por deficiencia de heterocigosidad. Se sugiere que este fenómeno podría ser consecuencia de un aislamiento poblacional ocurrido durante el desarrollo de la raza, pero se requiere mayor investigación al respecto para confirmar esta hipótesis. La probabilidad de exclusión combinada para todos los marcadores fue 0,9999. La información generada en este trabajo representa una herramienta importante que puede ser usada para conducir mejoras en la crianza del Terrier Chileno durante los próximos años y contribuirá con el proyecto que busca que la Federación Cinológica Internacional reconozca al Terrier Chileno como una raza canina oficial / Laboratorio de Investigaciones en Biotecnología y Genómica Animal (FAVET-INBIOGEN

Orientador: José Fernando Garcia / Banca: Joaquim Mansano Garcia / Banca: Adriana Santana do Carmo / Resumo: A pecuária bovina de corte da atualidade conta com o auxílio significativo dos programas de melhoramento genético animal para seu sucesso. O desenvolvimento de distintos métodos para realizar avaliações fenotípicas e genotípicas, tem o intuito de selecionar os rebanhos e obter animais geneticamente superiores com produção padronizada. A padronização produtiva de um rebanho deve ser resultante de acasalamentos dirigidos, que podem levar ao aumento da ocorrência de alelos homozigotos no genoma dos animais. Esse aumento da autozigosidade na população, isto é, o aumento do número de animais com alelos idênticos por descendência (IBD), provém do acasalamento entre indivíduos aparentados. Nesse contexto, a ferramenta mais robusta para identificar os fragmentos do genoma animal que são idênticos por descendência é a estimação do coeficiente de endogamia baseado nas corridas de homozigosidade (ROH), que é denominado (FROH). Eventos evolutivos, tais como: o processo de seleção natural, a deriva genética ou aleatória, e o gargalo populacional, podem ter contribuído com o aumento da autozigosidade e da ocorrência de alelos IBD no genoma de uma população resultante da reprodução entre indivíduos aparentados. Essa dissertação revisou o estado da arte do que concerne o estudo da endogamia determinada por análises genômicas (Capítulo 1), e aplicou tais conhecimentos na análise da distribuição dos níveis de autozigosidade baseado em corridas de homozigosidade (ROH) em 1.278 fêmeas da raça Nelore genotipadas para mais de 777 mil SNPs, e identificou regiões autozigotas possivelmente associadas à seleção natural, domesticação, fertilidade, evolução e adaptação dos bovinos (Capítulo 2). O presente estudo abre perspectivas para a realização de análises detalhadas que permitam a mensuração da influência da autozigosidade genômica causada pela pressão seletiva sobre alelos específicos em bovinos ... / Abstract: The current beef cattle chain has had significant help of animal breeding programs to its success. The development of different methods to perform phenotypic and genotypic evaluation has the objective of selecting flocks and producing genetically superior animals with standardized production. The productive standardization of a herd must be the result of directed matings, which can lead to increased incidence of homozygous alleles in the genome of animals. The increase of autozygosity in the population, i.e., increasing the number of animals with alleles identical by descent (IBD), is derived from the mating of related individuals. In this context, the most robust tool to identifies the animal's genome fragments that are identical by descent is the estimation of the inbreeding coefficient based on runs of homozygosity (ROH), which is called (FROH). Evolutionary events, such as the process of natural selection, random or genetic drift, and population bottleneck, may have contributed towards increasing the autozygosity and occurrence of IBD alleles in the genome of a population resulting crosses of related individuals. This thesis reviewed the state of the art with respect to the study of inbreeding determined by genomic analysis (Chapter 1), and applied this knowledge in the analysis of the distribution of autozygosity levels based on runs of homozygosity (ROH) in 1,278 Nelore females genotyped to more than 777,000 SNPs, and identified autozygote regions possibly associated with natural selection, domestication, fertility, evolution and adaptation of cattle (Chapter 2). This study open prospects for conducting detailed analysis on the influence of genomic autozygosity caused by selective pressure on specific alleles in Nelore cattle / Mestre

Orientador: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Banca: Lenira El faro Zadra / Banca: Rusbel Raul Aspilcueta Borquis / Resumo: O objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação (r2) nas distâncias de 25-50kb, 50-100kb, 100-500kb, 0,5-1Mb e o tamanho efetivo (Ne) nas gerações 0, 5, 10, 15, 20 em população da raça Gir selecionada para crescimento pós-desmama. Os animais utilizados no presente estudo foram provenientes do rebanho fechado do Instituto de Zootecnia, Sertãozinho, SP. Foram obtidos os genótipos de 155 animais com o painel BovineDL 33kb e 18 com painel HD imputado onde realizou-se controle de qualidade (CQ) para alelo de menor frequência (MAF) < 0,02 e call rate < 0,1. Depois do CQ permaneceram 27.236 SNPs e 155 animais do painel de 33 kb e 732.962 SNPs e 173 animais do painel HD Imputado. As análises de r2 foram realizadas pelo programa Plink e programa estatístico R Studio e o Ne por meio do DL. Os resultados das distâncias 25-50kb, 50-100kb, 100-500kb e 0,5-1Mb do r2 para o painel 33kb foram iguais a 0,29, 0,25, 0,16 e 0,032 respectivamente, e 0,35, 0,29, 0,18, 0,032 para o painel HD imputado demostrando que o DL permaneceu nas distâncias menores a 100kb, decaindo com o aumento das distâncias. Estes resultados foram maiores aos descritos na literatura para animais zebuínos, sugerindo como causa os segmentos longos de haplótipos que compartilham os animais aparentados. O Ne foi igual a 9, 17, 24, 30 e 30 animais nas gerações 0, 5, 10, 15, 20, observa-se que o Ne é maior na geração 20, com 30 animais, e decai drasticamente a partir da 5 geração com 17 animais, e sendo de 9 an... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this study was to estimate the linkage disequilibrium (r2) at distances of 25-50kb, 50-100kb, 100-500kb, 0,5-1Mb and the effective population size (Ne) in generations 0, 5, 10, 15, 20 in population of the selected Gir for yearling growth. The animals used in this study were from the closed herd Animal Science Institute, Sertãozinho, SP. the genotypes of 155 animals were obtained with BovineDL 33kb and 18 animals of panel HD, where quality control was held (QC) for minor allele frequency (MAF) <0.02 and call rate <0.1. After QC remained 27,236 SNPs and 155 animals to panel 33 kb, 732.962 SNPs and 173 the panel HD imputation. The r2 analyzes were performed by Plink program and R Studio statistical program and Ne through the DL. The results of r2 for distances 25-50kb, 50-100kb, 100-500kb and 0,5-1Mb were equal to 0.29, 0.25, 0.16 and 0.032, respectively, showing that the DL remained in smaller distances 100kb, decreasing with increasing distances. These results were higher than those reported in the literature for Zebu animals, suggesting a cause to long haplotype segments that share the related animals. Ne is equal to 9, 17, 24, 30 and 30 in the generations 0, 5, 10, 15, 20, it is observed that Ne is higher in generation 20 with 30 animals and decays sharply from 5 Generation 17 animals, and with 9 animals the latest generation, small size for a population. The values found in this study to DL and Ne, explain the selection system and the structure of the populatio... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

As populações de milho ESALQ-PB 2 (grãos dentados) e ESALQ-PB 3 (grãos duros ou "flint") após um ciclo de seleção massal estratificada foram submetidas a um processo cíclico de seleção recorrente com endogamia, objetivando conhecer o comportamento destas populações como tais e dos seus potenciais como fonte de linhagens endogâmicas vigorosas para utilização em esquema de produção de híbridos. Para cada uma das populações, foram avaliados os caracteres de peso de campo, peso de três espigas e peso de grãos, além de três caracteres de planta e dois caracteres de espiga, sendo que somente o caráter peso de campo foi avaliado nos três ciclos de seleção, tendo sido os demais avaliados em um ciclo. Os dados que fundamentaram esta pesquisa foram coletados a partir de três ciclos de seleção para a produção de grãos. No primeiro ciclo foram avaliadas 1000 progênies S1 em dez látices simples 10 x 10 duplicados. No ciclo seguinte avaliaram-se 400 progênies S1 em quatro látices simples 10 x 10 triplicados. E, no último ciclo foram avaliados 490 progênies S2 das referidas populações em dez látices simples 7 x 7 duplicados. Durante os ciclos de seleção, empregou-se como testemunhas a variedade"Piranão"(1º ciclo); as populações parentais, E8ALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3 (2º ciclo); e os híbridos duplos comerciais, Cargill 511 e Contimax 322 (3º ciclo). Adicionalmente, foram estudados os efeitos de irradiação no primeiro ciclo e da depressão por endogamia no segundo ciclo. Além da estimação de médias, a realização de análises de variância permitiu a obtenção de estimativas de outros parâmetros populacionais, tais como: variância genética aditiva (&#2442A); coeficientes de herdabilidade ao nível de plantas (h2) e de médias de progênies (h2x&#772;); coeficientes de variação experimental (CVe) genético (CVg); índice de variação (&theta; = CVg/CVe); e erro padrão da media (sm). Também foram elaborados histogramas de distribuição de médias para todos os caracteres estudados nas duas populações. Dentre as estimativas de interesse destacaram- se as da variância genética aditiva em (g/planta)2 para o peso de campo, que foram entre os limites (tomados sob duas hipóteses) de 114,0 a 142,5 e 125,9 a 157,4 no primeiro ciclo, 119,9 a 149,9 e 111,0 a 138,7 no segundo ciclo, e 219,2 a 246,6 e 234,4 a 263,7 no terceiro ciclo, para as populações ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Além disso, no primeiro ciclo também foram incluídas amostras irradiadas, cujas estimativas foram de 182,8 a 228,6 e 89,9 a 112,3 para ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Também foi determinada no segundo ciclo a depressão por endogamia para os caracteres peso de campo e peso de grãos cujos valores foram de 43,82% e 43,72% para ESALQ-PB 2; e 42,49% e 49,44% para ESALQ-PB 3, respectivamente. Uma análise global dos resultados mostrou evidências de progresso no comportamento das linhagens endogâmicas durante os ciclos de seleção. Além disso, uma análise da estrutura genética das duas populações nos ciclos de seleção leva a inferir que ambas apresentam um bom potencial para a obtenção de linhagens endogâmicas vigorosas, muito embora tenha sido detectada após dois ciclos de seleção com endogamia, a presença de uma acentuada carga genética potencial devida à presença de genes deletérios. / The maize populations ESALQ-PB 2 (yellow dent) and ESALQ-PB 3 (orange flint) after one cycle of stratifioted mass selection were submitted to recurrent selection under inbreeding, aiming to know the properties of these populations"per se"and their potential as source of vigorous inbred lines in hybrid programs. For each population the following traits were evaluated: field weight, weight of three ears and Kernel yield; three plant characters and two ear characters; field weight was evaluated in the three selection and the others evaluated in one cycle. The experimental data were obtained during three selection cycles for yield. At the first cycle 1000 S1 progenies were evaluated in ten double 10 x 10 lattices. In the second cycle 400 S1 progenies were evaluated in four triple 10 x 10 lattices. Finally, in the last cycle 490 S2 progenies were evaluated in ten double 7 x 7 lattices. During the selection cycles the variety 'Piranão' (1st cycle), the parental populations, ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3 (2nd cycle) and the double-cross Cargill 511 and Contimax 322 (3nd cycle) were used as checks. It was also studied the irradiation effects in the first cycle and inbreeding depression in the second cycle. Besides the means, the analyses of variance allowed the estimation of population parameters, such as: additive genetic variance (&#2442A, heretability coefficient at individual (h2) and progenies mean basis (h2x&#772;); experimental and genetic coefficients of variation (CVe and CVg); variation index (&theta;=CVg/CVe) and mean standard erros (sm). Also the distributions of progeny means were presented in histograms for alI characters studied. The estimates of additive genetic variance, in (g/plant)2, for field weight, were pointed out, that were between the limits (taken under two hypothesis): 114.0 to 142.5 and 125.9 to 157.4 in the first cyc1e; 119,9 to 149,9 and 111.0 to 138.7 in the second cycle and 219.2 to 246.6 and 234.4 to 263.7 in the third cycle, for the populations ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3, respectively. In the first cycle, it was a1so included irradiated samp1es, and the respectives estimates were 182,8 to 228.6 and 89.9 to 122.3 for ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3. At the second cycle it was also detemined the inbreeding depression effects for the characters field weight and grain yield, which were 43.82% and 43.72% for ESALQ-PB 2; and respectively. 42.49% and 49.44% for ESALQ-PB 3, respectively. An overall analysis of the results showed evidence of progress in the performance of the inbred lines during the selection cycles. An analysis of the genetic structure of the two populations in the selection cycles, showed that both populations present a good potential as source of vigorous inbred lines, though an expressive part of the potential genetic load still remained after two cycles of selection under inbreeding.

Orientador: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Banca: Noberto da Silva / Banca: Cyro Paulino da Costa / Abstract: The objective of this work was evaluate the inbreeding depression with successive generations of self-pollination in a cucumber "caipira" population (S0, S1, S2, S3; S4 e S5), obtained by crossing Safira x Hatem hybrids. Two experiments were accomplished: one to evaluate immature fruits production and another to analyze the mature fruits production, seed quality and yield. The experimental design of both experiments were randomized blocks, in the first with seven treatments (different generations of self pollination - S0 to S5 and the hybrid Safira), six replicates and five plants per plot and in the second the same seven treatments, four replicates and five plants per plot. In the first experiment (immature fruits) was number of leaves, length of the main stem, number and weight of fruits, total and commercial, number of nodes and vines percentage were evaluated. In the second experiment (mature fruit) the following traits were evaluated characteristic: seed number and weight per plant and per fruit and seed quality (germination test, first counted of seeds, index of germination speed and weight of 100 seeds). The averages were compared by the Tukey test (5%) and the evaluation of the inbreeding depression was made with regression analysis. In the experiment 1 smaller production of fruits was observed (total and commercial) starting from population S2, demonstrating possible vigor loss. The populations S0 and S1 were similar or superiors for the characteristics number of total fruits, total weight per plant and commercial weight per plant when compared to the hybrid Safira, demonstrating the potencial of this population to obtain a new cultivar or hybrid of the "caipira" type. The experiment two there was no statistical difference for all the appraised characteristics, showing that the inbreeding didn't affect the production and quality of the seeds in this population. / Mestre

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-11T12:42:21Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 305369 bytes, checksum: 62c5c1fec2e7f8371e92a1d02107c3e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-11T12:42:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 305369 bytes, checksum: 62c5c1fec2e7f8371e92a1d02107c3e9 (MD5) Previous issue date: 2003-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nos últimos anos, vem se intensificando ataques de Lepidoptera daninhos à eucaliptocultura brasileira, o que pode afetar o fornecimento de matéria prima para a indústria de papel e celulose. Os percevejos predadores da família Pentatomidae destacam-se como importantes agentes de controle biológico dessas lagartas desfolhadoras. O presente trabalho objetivou comparar o desenvolvimento ninfal e aspectos reprodutivos do percevejo predador Brontocoris tabidus (Heteroptera: Pentatomidae) de primeira e décima gerações de laboratório. Avaliou-se o efeito deletério de acasalamentos endogâmicos em gerações sucessivas, visando aprimorar-se a tecnologia de produção massal desse predador. Além do estudo das características das fases ninfal e adulta, foram elaboradas tabelas de esperança de vida e de fertilidade, para se avaliar as características reprodutivas de B. tabidus. O experimento foi conduzido em planta de Eucalyptus urophylla, próximo ao Insetário do Departamento de Biologia Animal, da Universidade Federal de Viçosa. Indivíduos de B. tabidus de primeira geração em laboratório constituíram o tratamento G1 e foram obtidos a partir da coleta de ovos e ninfas de primeiro e segundo estádios desse predador no município de Abaeté, Estado de Minas Gerais, em povoamento de E. urophylla, durante surto de Thyrinteina arnobia (Lepidoptera: Geometridae). Quando estes indivíduos atingiram a fase adulta, os mesmos foram acasalados e as posturas provenientes utilizadas no tratamento G1. Os de décima geração constituíram o tratamento G10 e foram obtidos da criação massal do Laboratório de Controle Biológico do Instituto de Biotecnologia Aplicada à Agropecuária (BIOAGRO) da Universidade Federal de Viçosa (UFV), em Viçosa, estado de Minas Gerais. A sobrevivência nos diferentes estádios e da fase ninfal, os períodos de pré- oviposição, oviposição, pós-oviposição, incubação dos ovos e intervalo entre posturas, o número de posturas por fêmea, a porcentagem de eclosão de ninfas e a longevidade de fêmeas foram semelhantes entre gerações. Indivíduos de primeira geração de B. tabidus apresentaram menor duração da fase ninfal, maior peso de ninfas de quinto estádio e de machos e fêmeas, e maior número de ovos por fêmea, de ovos por postura, de ninfas por fêmea, de ninfas por postura, além de maior longevidade de machos e da taxa líquida de reprodução (Ro), razão infinitesimal de aumento (rm) e finita de aumento (ë ) e menor duração de uma geração (DG) e do tempo necessário para a população duplicar em número de indivíduos (TD) que os de décima geração. Isto mostra ser necessário a alteração do processo de criação massal desse predador após dez gerações e uma medida recomendada no combate ao efeito endogâmico seria a renovação de populações de B. tadidus com indivíduos coletados no campo, para a manutenção da produtividade desse predador em programas de criação massal. / Problems with Lepidoptera defoliators in eucalyptus plants are increasing in Brazil what can reduce supply of wood for the paper and cellulose manufacturing. Predatory Pentatomidae are important biological control agents of defoliating caterpillars in these plantations. The objective of this research was to compare nymph development and reproduction of the predator Brontocoris tabidus (Heteroptera: Pentatomidae) after one and ten generations in laboratory. Possible deleterious effects of inbreeding were evaluated after ten successive generations aiming to increase mass production of this predator. Nymph and adult characteristics were studied and life and fertility tables were elaborated to estimate reproductive characteristics of B. tabidus. This research was carried out in a plant of Eucalyptus urophylla in a area of the Department of Animal Biology at the Federal University of Viçosa. First generation individuals of B. tabidus in laboratory were used for treatment G1 and they were obtained from eggs and nymphs of first and second instars of this predator collected in the Municipality of Abaeté, State of Minas Gerais in a plantation of E. urophylla during an outbreak of Thyrinteina arnobia (Lepidoptera: Geometridae). Adults from these individuals were mated and their eggs were used in the treatment G1. Individuals of tenth generation were used in the treatment G10 and they were obtained from the mass rearing facility of the Laboratory of Biological Control of the Institute of Applied Biotechnology to Agriculture (BIOAGRO) of the Federal University of Viçosa (UFV), in Viçosa, State of Minas Gerais. Survival at different instars and of the nymph phase, periods of pre-oviposition, oviposition, pos- oviposition, egg incubation and interval between egg mass laying, number of egg masses per female, percentage of nymph hatching and longevity of females were similar between generations. Individuals of first generation B. tabidus presented shorter duration of the nymph phase, besides bigger weight of fifth instar nymphs and of males and females and larger number of eggs per female, eggs per egg mass, nymphs per female, nymphs per egg and longer longevity of males. First generation B. tabidus showed higher liquid reproduction rate (Ro), infinitesimal increasing rate (rm) and finite rate of increase (ë ) besides shorter duration of a generation (DG) and of the time to double its population in number of individuals (TD) than those of the tenth generation. This shows the necessity of improving rearing methodologies for this predator after ten generations. Individuals of B. tadidus collected in the field should be regularly introduced to the laboratory aiming to reduce the effect of inbreeding aiming to maintain the productivity of this predator in programs of mass rearing.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-18. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:35Z : No. of bitstreams: 1 000830516.pdf: 435277 bytes, checksum: f6acf506d25f52c5bef6c02d3894fa15 (MD5) / A pecuária bovina de corte da atualidade conta com o auxílio significativo dos programas de melhoramento genético animal para seu sucesso. O desenvolvimento de distintos métodos para realizar avaliações fenotípicas e genotípicas, tem o intuito de selecionar os rebanhos e obter animais geneticamente superiores com produção padronizada. A padronização produtiva de um rebanho deve ser resultante de acasalamentos dirigidos, que podem levar ao aumento da ocorrência de alelos homozigotos no genoma dos animais. Esse aumento da autozigosidade na população, isto é, o aumento do número de animais com alelos idênticos por descendência (IBD), provém do acasalamento entre indivíduos aparentados. Nesse contexto, a ferramenta mais robusta para identificar os fragmentos do genoma animal que são idênticos por descendência é a estimação do coeficiente de endogamia baseado nas corridas de homozigosidade (ROH), que é denominado (FROH). Eventos evolutivos, tais como: o processo de seleção natural, a deriva genética ou aleatória, e o gargalo populacional, podem ter contribuído com o aumento da autozigosidade e da ocorrência de alelos IBD no genoma de uma população resultante da reprodução entre indivíduos aparentados. Essa dissertação revisou o estado da arte do que concerne o estudo da endogamia determinada por análises genômicas (Capítulo 1), e aplicou tais conhecimentos na análise da distribuição dos níveis de autozigosidade baseado em corridas de homozigosidade (ROH) em 1.278 fêmeas da raça Nelore genotipadas para mais de 777 mil SNPs, e identificou regiões autozigotas possivelmente associadas à seleção natural, domesticação, fertilidade, evolução e adaptação dos bovinos (Capítulo 2). O presente estudo abre perspectivas para a realização de análises detalhadas que permitam a mensuração da influência da autozigosidade genômica causada pela pressão seletiva sobre alelos específicos em bovinos ... / The current beef cattle chain has had significant help of animal breeding programs to its success. The development of different methods to perform phenotypic and genotypic evaluation has the objective of selecting flocks and producing genetically superior animals with standardized production. The productive standardization of a herd must be the result of directed matings, which can lead to increased incidence of homozygous alleles in the genome of animals. The increase of autozygosity in the population, i.e., increasing the number of animals with alleles identical by descent (IBD), is derived from the mating of related individuals. In this context, the most robust tool to identifies the animal's genome fragments that are identical by descent is the estimation of the inbreeding coefficient based on runs of homozygosity (ROH), which is called (FROH). Evolutionary events, such as the process of natural selection, random or genetic drift, and population bottleneck, may have contributed towards increasing the autozygosity and occurrence of IBD alleles in the genome of a population resulting crosses of related individuals. This thesis reviewed the state of the art with respect to the study of inbreeding determined by genomic analysis (Chapter 1), and applied this knowledge in the analysis of the distribution of autozygosity levels based on runs of homozygosity (ROH) in 1,278 Nelore females genotyped to more than 777,000 SNPs, and identified autozygote regions possibly associated with natural selection, domestication, fertility, evolution and adaptation of cattle (Chapter 2). This study open prospects for conducting detailed analysis on the influence of genomic autozygosity caused by selective pressure on specific alleles in Nelore cattle

As populações de milho ESALQ-PB 2 (grãos dentados) e ESALQ-PB 3 (grãos duros ou “flint”) após um ciclo de seleção massal estratificada foram submetidas a um processo cíclico de seleção recorrente com endogamia, objetivando conhecer o comportamento destas populações como tais e dos seus potenciais como fonte de linhagens endogâmicas vigorosas para utilização em esquema de produção de híbridos. Para cada uma das populações, foram avaliados os caracteres de peso de campo, peso de três espigas e peso de grãos, além de três caracteres de planta e dois caracteres de espiga, sendo que somente o caráter peso de campo foi avaliado nos três ciclos de seleção, tendo sido os demais avaliados em um ciclo. Os dados que fundamentaram esta pesquisa foram coletados a partir de três ciclos de seleção para a produção de grãos. No primeiro ciclo foram avaliadas 1000 progênies S1 em dez látices simples 10 x 10 duplicados. No ciclo seguinte avaliaram-se 400 progênies S1 em quatro látices simples 10 x 10 triplicados. E, no último ciclo foram avaliados 490 progênies S2 das referidas populações em dez látices simples 7 x 7 duplicados. Durante os ciclos de seleção, empregou-se como testemunhas a variedade"Piranão"(1º ciclo); as populações parentais, E8ALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3 (2º ciclo); e os híbridos duplos comerciais, Cargill 511 e Contimax 322 (3º ciclo). Adicionalmente, foram estudados os efeitos de irradiação no primeiro ciclo e da depressão por endogamia no segundo ciclo. Além da estimação de médias, a realização de análises de variância permitiu a obtenção de estimativas de outros parâmetros populacionais, tais como: variância genética aditiva (&#2442A); coeficientes de herdabilidade ao nível de plantas (h2) e de médias de progênies (h2x&#772;); coeficientes de variação experimental (CVe) genético (CVg); índice de variação (&theta; = CVg/CVe); e erro padrão da media (sm). Também foram elaborados histogramas de distribuição de médias para todos os caracteres estudados nas duas populações. Dentre as estimativas de interesse destacaram- se as da variância genética aditiva em (g/planta)2 para o peso de campo, que foram entre os limites (tomados sob duas hipóteses) de 114,0 a 142,5 e 125,9 a 157,4 no primeiro ciclo, 119,9 a 149,9 e 111,0 a 138,7 no segundo ciclo, e 219,2 a 246,6 e 234,4 a 263,7 no terceiro ciclo, para as populações ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Além disso, no primeiro ciclo também foram incluídas amostras irradiadas, cujas estimativas foram de 182,8 a 228,6 e 89,9 a 112,3 para ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Também foi determinada no segundo ciclo a depressão por endogamia para os caracteres peso de campo e peso de grãos cujos valores foram de 43,82% e 43,72% para ESALQ-PB 2; e 42,49% e 49,44% para ESALQ-PB 3, respectivamente. Uma análise global dos resultados mostrou evidências de progresso no comportamento das linhagens endogâmicas durante os ciclos de seleção. Além disso, uma análise da estrutura genética das duas populações nos ciclos de seleção leva a inferir que ambas apresentam um bom potencial para a obtenção de linhagens endogâmicas vigorosas, muito embora tenha sido detectada após dois ciclos de seleção com endogamia, a presença de uma acentuada carga genética potencial devida à presença de genes deletérios. / The maize populations ESALQ-PB 2 (yellow dent) and ESALQ-PB 3 (orange flint) after one cycle of stratifioted mass selection were submitted to recurrent selection under inbreeding, aiming to know the properties of these populations"per se"and their potential as source of vigorous inbred lines in hybrid programs. For each population the following traits were evaluated: field weight, weight of three ears and Kernel yield; three plant characters and two ear characters; field weight was evaluated in the three selection and the others evaluated in one cycle. The experimental data were obtained during three selection cycles for yield. At the first cycle 1000 S1 progenies were evaluated in ten double 10 x 10 lattices. In the second cycle 400 S1 progenies were evaluated in four triple 10 x 10 lattices. Finally, in the last cycle 490 S2 progenies were evaluated in ten double 7 x 7 lattices. During the selection cycles the variety 'Piranão' (1st cycle), the parental populations, ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3 (2nd cycle) and the double-cross Cargill 511 and Contimax 322 (3nd cycle) were used as checks. It was also studied the irradiation effects in the first cycle and inbreeding depression in the second cycle. Besides the means, the analyses of variance allowed the estimation of population parameters, such as: additive genetic variance (&#2442A, heretability coefficient at individual (h2) and progenies mean basis (h2x&#772;); experimental and genetic coefficients of variation (CVe and CVg); variation index (&theta;=CVg/CVe) and mean standard erros (sm). Also the distributions of progeny means were presented in histograms for alI characters studied. The estimates of additive genetic variance, in (g/plant)2, for field weight, were pointed out, that were between the limits (taken under two hypothesis): 114.0 to 142.5 and 125.9 to 157.4 in the first cyc1e; 119,9 to 149,9 and 111.0 to 138.7 in the second cycle and 219.2 to 246.6 and 234.4 to 263.7 in the third cycle, for the populations ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3, respectively. In the first cycle, it was a1so included irradiated samp1es, and the respectives estimates were 182,8 to 228.6 and 89.9 to 122.3 for ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3. At the second cycle it was also detemined the inbreeding depression effects for the characters field weight and grain yield, which were 43.82% and 43.72% for ESALQ-PB 2; and respectively. 42.49% and 49.44% for ESALQ-PB 3, respectively. An overall analysis of the results showed evidence of progress in the performance of the inbred lines during the selection cycles. An analysis of the genetic structure of the two populations in the selection cycles, showed that both populations present a good potential as source of vigorous inbred lines, though an expressive part of the potential genetic load still remained after two cycles of selection under inbreeding.