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Depressão endogâmica em uma população de pepino japonês (Cucumis sativus L.) /Santacruz Oviedo, Victoria Rossmary, 1968- January 2004 (has links)
Orientador: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Banca: Noberto da Silva / Banca: Keigo Minami / Resumo: Foram conduzidos dois experimentos na FCA/UNESP, objetivando avaliar a depressão causada por endogamia com sucessivas gerações de autofecundação em uma população de pepino do tipo japonês. No primeiro experimento foram avaliadas características de produção de frutos imaturos no período de 21/08/2002 à 29/11/2002 em ambiente protegido. No segundo experimento foram avaliadas características de produção e qualidade de sementes no período de 12/03/2003 à 13/06/2003 em condições de campo. A partir do intercruzamento entre plantas do híbrido Natsu suzumi foi obtida a geração F2, considerada como população S0. Obtiveram-se progênies S1, S2, S3, S4 e S5, através de autofecundações sucessivas pelo método do SSD ('Single Seed Descent'). Ao partir da mistura ao acaso de sementes de progênies com igual número de autofecundações sucessivas foram obtidas cinco populações denominadas de população S1 a população S5. Foram sete tratamentos (híbrido Natsu suzumi, populações S0 a S5) e o delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com seis e quatro repetições no primeiro e segundo experimento, respectivamente e cinco plantas por parcela nos dois experimentos. No primeiro experimento (frutos imaturos) foram avaliados, número de folhas, comprimento da haste principal, número e massa de frutos, total e comercial, número de nós e porcentagem de brotações. No segundo experimento (frutos maduros) avaliaram-se características relacionadas com produção (número e massa de sementes por planta e por fruto) e qualidade de sementes (teste padrão de germinação, primeira contagem de sementes, índice de velocidade de germinação, massa de 100 sementes). Foram realizadas as análises de variância para cada característica, e as médias dos tratamentos foram comparadas pelo teste de Tukey (%). Também foram realizados análises de variância apenas com as seis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Two experiments were set up at FCA/UNESP. The objective of this work was to evaluate the inbreeding depression with successive generations of self pollination in a cucumber Japanese population. It was studied one population F2 obtained from a commercial hybrid (Natsu suzumi) considered as S0 population. In the first experiment were appraised characteristics of production of immature fruits in the period of 21/08/2002 to 29/11/2002 in protected cultivation. In the second experiment were appraised seed production and quality in the period of 12/03/2003 to 13/06/2003 in open field conditions. It was obtained progenies S1, S2, S3, S4 and S5 through the 'Single Seed Descent' methodology. It was used randomized blocks with seven treatments (different generations of self pollination - S0 to S5 and the hybrid Natsu suzumi) six and four replicates in the first and second experiment and five plants per plot in both. In the first experiment (immature fruits) were evaluated number of leaves, length of the main stem, number and weight of fruits, total and commercial, number of nodes and vines percentage. In the second experiment (mature fruit) characteristic related with production were evaluated (number and weight of seeds per plant and per fruit) and quality of seeds (germination test, first counted of seeds, index of germination speed and weight of 100 seeds). The variance analyses were accomplished each characteristic and the averages of the treatments were compared by the test of Tukey (%). Also accomplished just with the six inbreed generations to evaluate the possible inbreeding depression (without including the commercial hybrid). In the comparison among the population differences were not observed for the characteristics appraised showing there were not production loss for inbreeding in this population. However, for the characteristics length of the main stem, number of total fruit, weight of seeds per fruit and seed number per fruit the commercial. / Mestre
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O uso de benzodiazepínicos em populações paraibanos: a influência das relações de parentescoWanderley, Thyago da Costa 08 April 2014 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-09-09T14:04:14Z
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Previous issue date: 2014-04-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Inbreeding is a tradition in populations of northeastern Brazil and is associated with the manifestation of psychiatric disorders such as anxiety disorders, usually treated with benzodiazepines. In this dissertation, two integrative reviews of the literature on use of psychiatric drugs and benzodiazepines in different populations were performed. From these findings and a pilot study, we developed a structured interview schedule to investigate, in a population of 4,543 inhabitants, if there was a higher prevalence of benzodiazepine users in the offspring of consanguineous couples. The users prevalence within the population was estimated to be 4.2%. Within the benzodiazepine users group (n=151), 107 (70.9%) were children of unrelated couples and 44 (29.1%) were consanguineous, whereas in the non-users group (n=251), these values were 177 (70.6%) and 74 (29.4%), respectively; therefore, a significant difference was not observed between the two groups (p=0.94). The users profile was made of women (70.9%), elderly (43.7%) and retired individuals (52.3%). Insomnia (25.8%), "nervousness" (21.9 %) and anxiety (20.5 %) were the main motivations for early usage of these drugs. The majority (97%) of users does not have a clinical diagnosis report and have used such drugs for 8.2 ± 8 years; and a quarter of them did not have an appointment with a physician in the past twelve months. The dependence was observed in 24.5% of the users and 35% of the elderly use these drugs inappropriately, considering the Beers criteria. In the state of Paraíba, it was estimated that R$30 million per year were used to finance the purchase of these drugs; and the users of this medication have not lost their labor capability. / A endogamia é uma tradição mantida em populações do nordeste brasileiro e está associada à manifestação de distúrbios psiquiátricos como os transtornos de ansiedade, usualmente tratados com benzodiazepínicos. Nesta dissertação, foram realizadas duas revisões integrativas da literatura sobre uso de psicofármacos e benzodiazepínicos em diferentes populações. A partir desses achados e de um estudo-piloto, foi desenvolvido um roteiro de entrevista estruturado para investigar, em uma população de 4.543 habitantes, se havia maior prevalência de usuários de benzodiazepínicos na prole de casais consanguíneos. Estimou-se que 4,2% dessa população eram usuários desses medicamentos; sendo que, neste grupo (n=151), 107 (70,9%) eram filhos de casais não consanguíneos e 44 (29,1%) tinham pais aparentados; já no grupo de não usuários (n=251), esses valores foram 177 (70,6%) e 74 (29,4%), respectivamente; não sendo observada, portanto, diferença significativa entre os dois grupos (p=0,94). O perfil dos usuários era de mulheres (70,9%), idosas (43,7%) e aposentadas (52,3%). A insônia (25,8%), o ―nervosismo‖ (21,9%) e ansiedade (20,5%) foram as principais motivações para o início da utilização desses medicamentos. A maioria (97%) dos usuários não possui laudo com diagnóstico clínico e faz uso crônico com média de utilização de 8,2 ± 8 anos; um quarto deles não realizou nenhuma consulta médica nos últimos doze meses. A dependência foi verificada em 24,5% dos usuários e 35% dos idosos fazem uso impróprio desses medicamentos, considerando o critério Beers. Estimou-se que no Estado da Paraíba, anualmente, sejam investidos trinta milhões de reais para financiar a aquisição desses medicamentos; e que o uso desses medicamentos não está relacionado à perda da capacidade laboral.
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Estudo genômico populacional e de associação ampla com características de eficiência alimentar e crescimento em frangos de corte /Marchesi, Jorge Augusto Petroli. January 2016 (has links)
Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Marcos Eli Buzanskas / Coorientador: Mônica Corrêa Ledur / Coorientador: Rodrigo Pelicioni Savegnago / Banca: Claudia Cristina Paro de Paz / Banca: Nedenia Bonvino Stafuzza / Resumo: Galinhas são responsáveis por significativa parcela da produção de proteína para o consumo humano no mundo, movimentando a economia de diversos países. Com desenvolvimento de tecnologias de genotipagem de polimorfismos com painéis de alta densidade tornou-se possível a realização de estudos de associação ampla do genoma (GWAS) com características de importância econômica para a indústria avícola e também sua incorporação como ferramenta em estudos de conservação genética e de estrutura populacional em frangos de corte. No presente estudo objetivou-se avaliar a estrutura populacional de uma linhagem de frangos de corte por meio da análise conjunta de informações do desequilíbrio de ligação (DL), tamanho efetivo populacional (Ne), coeficiente de endogamia e segmentos de homozigose (ROH) e realizar GWAS com características de eficiência alimentar e crescimento. Para isso foram utilizadas 1.433 aves provenientes da expansão de uma linha paterna de frangos de corte genotipadas com o painel 600K Affymetrix® Axiom® HD (Affymetrix®). No controle de qualidade, foram excluídos SNPs com "call rate" abaixo de 98%, desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (p-valor ≤ 10-6) e cuja frequência do alelo raro foi inferior a 2%, utilizando-se apenas os cromossomos GGA1 ao GGA28 para o estudo da estrutura populacional. Para o estudo de GWAS foram utilizados os cromossomos autossômicos e grupos de ligação (programas SNP1101 e QxPak) e cromossomo sexual Z (programa QxPak). O control... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Chickens are responsible for a significant portion of protein production for human consumption in the world, moving the economy of many countries. The development of high-density arrays made possible the genome-wide association study (GWAS) for economic important traits to the poultry industry as well as its incorporation as a tool for genetic conservation and population structure studies in broilers. The present study aimed to evaluate the population structure of a broiler line of through the joint analysis of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding coefficient and runs of homozygosity (ROH), and performing GWAS with growth and feed efficiency traits in a population from a male broilers line. A total of 1,433 birds were used from an expansion population of a paternal broiler line genotyped with 600K Affymetrix® Axiom® HD array (Affymetrix®). The genotype quality control considered the exclusion of single nucleotide polymorphisms (SNPs) with call rate below 98%, based on the deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (p ≤ 1x10-6), and minor allele frequency was lower than 2%, using only Gallus gallus autosomes (GGA1 to GGA28) for the population structure study, and all autosomes, linkage groups and Z chromosome sex for GWAS. Quality control samples considered the exclusion of individuals who had SNPs call rate below 90%. The LD was calculated by Plink v.1.9 software using the correlation between two consecutive SNPs (r²). From the LD data was calculated Ne up to 200 generations ago using SNP1101 v.1.0 software. The ROH were identified using Plink v.1.9 software, which considered segments of at least 100 SNPs with a minimum length of 1,000 kb, and allowed the presence of a heterozygous SNP and the absence of one SNP in a window 100 SNPs. The GWAS analysis was performed using SNP1101 v.1.0 and QxPak 5.0 softwares ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Biologia reprodutiva e diversidade genética de Dyckia distachya Hassler (Bromeliaceae) como subsídio para conservação e reintrodução de populações extintas na naturezaWiesbauer, Manuela Boleman 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2008 / Made available in DSpace on 2012-10-24T02:12:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
274349.pdf: 6531095 bytes, checksum: 04a27b54c0f42f3e252e44027b68ed89 (MD5) / Dyckia distachya Hassler é uma bromélia exclusiva de ambientes reofíticos, como ilhas ou margens rochosas de corredeiras, ao longo do Rio Uruguai, fronteira entre Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Dentre as nove populações naturais conhecidas no Brasil, oito foram extintas localmente devido à construção das hidrelétricas de Itá, Machadinho e Barra Grande, em 2000, 2003 e 2005, respectivamente. Anteriormente ao enchimento das barragens, amostras das populações naturais foram resgatadas gerando diversas coleções e foram feitas algumas relocações experimentais. A partir do fato consumado, com a demanda de estabelecer uma estratégia de conservação para a espécie, foram realizados estudos de biologia reprodutiva e diversidade genética nas coleções das populações extintas na natureza. Os estudos de biologia reprodutiva indicaram que a espécie é auto-incompatível, possui floração anual desde setembro a janeiro; possui floração do tipo disponibilidade regular; sua morfologia floral é generalista, sendo polinizada por diversas guildas, incluindo beija-flores, abelhas e borboletas; e a polinização foi efetiva na maior parte dos locais de conservação, havendo a produção de sementes viáveis. Os indivíduos provenientes de Itá, Machadinho e Barra Grande apresentaram variações na morfologia floral, possuindo flores mais campanuladas e de coloração amarelada para Itá, flores tubulosas e avermelhadas para Barra Grande e flores de morfologia intermediária em Machadinho. A guilda de polinizadores também foi variável entre os diferentes locais de conservação e morfologias florais. Os estudos de diversidade genética indicaram que as coleções provenientes de Itá sofreram as maiores derivas genéticas, refletindo efeitos do processo histórico, em que o conhecimento técnico e as exigências de coleta foram crescentes à medida que foram sendo construídas as novas hidrelétricas. As plantas da região de Itá apresentaram as maiores divergências genéticas com relação à Machadinho e Barra Grande, que coincidiram com os dados de biologia floral. De acordo com os resultados obtidos, concluiu-se que as coleções de cada região (Itá, Machadinho e Barra Grande) não devem ser misturadas, devido à grande diferenciação natural entre elas, que poderia gerar efeitos negativos de exogâmia. As coleções de Itá e Encanadinhos (de Barra Grande) devem ser enriquecidas com coleções dos mesmos locais, visando diminuir a endogamia e aumentar a diversidade nas coleções. / Dyckia distachya Hassler is a bromeliad exclusive from rheophytic environments such as islands or rocky shores of rapids along the Uruguay River, the boundary between Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Among the nine known natural populations in Brazil, eight were locally extinct due to the construction of the hydroelectrics of Itá, Machadinho and Barra Grande in 2000, 2003 and 2005, respectively. Prior to the filling of dams, samples of natural populations were rescued generating several collections that were used to make some experimental relocations. From the "fait accompli", with the demand to establish a conservation strategy for the species, studies were performed about reproductive biology and genetic diversity in collections of populations that were extinct in the wild. Studies of reproductive biology indicated that the species is self-incompatible, has annual flowering from September to January, has flowering type of regular availability, its floral morphology is general, pollinated by several guilds, including hummingbirds, bees and butterflies, and pollination was effective in most places of conservation with the production of viable seeds. Individuals from Ita, Machadinho and Barra Grande showed variations in floral morphology, having more campanulate and yellowish flowers at Itá, tubular and red flowers at Barra Grande and intermediate flower morphology in Machadinho. The guild of pollinators also varied between the different conservation sites and floral morphologies. The genetic diversity studies indicated that the collections from Itá suffered the greatest genetic drift, reflecting effects of the historical process in which technical knowledge and gathering requirements were increasing as the new plants were being built. The plants in the region of Itá showed the largest genetic differences in relation to Machadinho and Barra Grande, which coincided with the floral biology data. According to the results, it was concluded that the collections of each region (Itá, Machadinho and Barra Grande) should not be mixed because of the large natural differentiation between them, which could generate negative effects of exogamy. Collections from Itá and Encanadinhos (Barra Grande) should be enriched with collections of the same locations in order to reduce inbreeding and increase diversity in the collections.
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Mirando el bosque en su conjunto La endogamia académica y la renovación docente en las universidades públicasMori, Jorge 10 April 2018 (has links)
La aprobación de la nueva Ley Universitaria, Ley N° 30220, generó diversos debates. Uno de los puntos controversiales fue la inclusión del límite de 70 años para la docencia en las universidades públicas. En el presente artículo, se enmarca este límite de edad dentro de un conjunto de medidas que están dirigidas a impulsar la renovación docente y frenar así la endogamia académica en las universidades públicas. Esta endogamia se coloca como causa central de la problemática de la mala calidad docente en las universidades públicas, por medio de la cual las universidades contratan mayoritariamente a los egresados de sus postgrados para la docencia y se generan grupos hostiles a la exigencia académica y la producción científica.
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Estudo da longevidade de vacas zebu?nasOliveira, Diana Carla Fernandes 18 October 2016 (has links)
Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-09-28T00:08:27Z
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diana_carla_fernandes_oliveira.pdf: 1785085 bytes, checksum: d17d274bbea7e02f58960e76d1bbefd1 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-10-09T14:14:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2
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Previous issue date: 2016 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / O Brasil ? um pa?s que se destaca pela produ??o de leite, ocupando a quinta posi??o mundial, segundo o Instituto Brasileiro de Geografia e Estat?stica (IBGE, 2015). O rebanho leiteiro brasileiro ? composto em sua maior parte por animais zebu?nos e mesti?os (cruzamento entre ra?as europeias e zebu?nas). Dentre as ra?as zebu?nas, o Gir e o Guzer? se destacam pela produ??o de carne ou leite, al?m de serem animais que se adaptam bem as condi??es do clima. Por muitos anos os programas de melhoramento gen?tico de gado de leite tinham como principal preocupa??o as caracter?sticas de produ??o. Todavia, o sucesso econ?mico da pecu?ria leiteira n?o est? associado apenas ? efici?ncia produtiva, mas tamb?m ? efici?ncia reprodutiva, sa?de e longevidade do rebanho. Contudo, os ganhos em produtividade levaram a redu??o na efici?ncia das caracter?sticas reprodutivas e ao decl?nio na longevidade. A longevidade ? uma caracter?stica altamente desej?vel em rebanhos leiteiros, em raz?o da sua rela??o com a lucratividade, pois em rebanhos com vacas mais longevas, tem-se uma redu??o com o custo de animais para reposi??o. Entretanto, a longevidade ? uma caracter?stica complexa influenciada por diversos fatores, como produ??o de leite, bem estar, endogamia e objetivos de cria??o. Al?m disso, a maioria das medidas de longevidade s?o obtidas tardiamente na vida da vaca ou at? mesmo ap?s a sua morte. Este fato, faz com que a sele??o direta para a longevidade seja impratic?vel devido ao tempo necess?rio para se obter a medida, bem como o longo intervalo de gera??es, sendo uma caracter?stica de baixa herdabilidade. Portanto, a sele??o indireta para longevidade tem sido utilizada por meio da sele??o de outras caracter?sticas de interesse econ?mico, expressas precocemente, como a idade ao primeiro parto, podendo contribuir para obten??o de ganhos gen?ticos. Sendo assim, o estudo das caracter?sticas de longevidade e as outras caracter?sticas de import?ncia econ?mica s?o indispens?veis para inclus?o da longevidade em programas de melhoramento gen?tico para produ??o de leite. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / Brazil is a country that stands out for milk production, ranking fifth in the world, according to the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE, 2015). The Brazilian dairy herd is mostly composed of zebu and mestizo animals (crossbreeding between European and zebu breeds). Among the zebu breeds, the Gir and Guzer? stand out for the production of meat or milk, besides being animals that adapt well the conditions of the climate. For many years the genetic improvement programs of dairy cattle had as main concern the production characteristics. However, the economic success of dairy farming is not only related to the productive efficiency, but also to the reproductive efficiency, health and longevity of the herd. However, gains in productivity led to a reduction in the efficiency of reproductive traits and a decline in longevity. Longevity is a highly desirable characteristic in dairy herds, because of its relation to profitability, since in livestock with longer cows, there is a reduction with the cost of replacement animals. However, longevity is a complex feature influenced by many factors, such as milk production, well-being, endogamy and creation goals. In addition, most longevity measures are obtained late in the life of the cow or even after death.This fact makes the direct selection for longevity impractical due to the time required to obtain the measure, as well as the long generation interval, being a characteristic of low heritability. Therefore, indirect selection for longevity has been used through the selection of other characteristics of economic interest, expressed early, such as age at first calving, and may contribute to obtain genetic gains. Thus, the study of longevity characteristics and other characteristics of economic importance are indispensable for inclusion of longevity in genetic breeding programs for milk production.
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Avaliação de tipos de acasalamento em populações selecionadas, utilizando-se dados simulados / Evaluation of mating designs in selected populations using simulated dataCunha, Elizângela Emídio 09 August 2001 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-07-04T11:57:19Z
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Previous issue date: 2001-08-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Para avaliar o efeito de tipos de acasalamento entre reprodutores escolhidos para pais da geração seguinte em populações selecionadas, em longo prazo, foram utilizados dados simulados por meio do programa GENESYS. A partir de um genoma constituído por 20 pares de cromossomos autosssômicos, com 250 loci quantitativos e dialélicos, e permitindo apenas efeitos aditivos de genes, simulou-se uma população-base, com característica quantitativa de herdabilidade 0,10. Com essa população foi obtida uma população inicial, que deu origem às populações de seleção, nas quais os indivíduos escolhidos foram acasalados, em todas as gerações, segundo um dos tipos de acasalamento: acasalamentos preferenciais de meios -irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos de meios-irmãos e irmãos completos. As populações selecionadas com base na melhor predição linear não-viesada (BLUP) do valor genético tiveram, no estudo dos tipos de acasalamento, a seguinte estrutura de dados: valores de razão sexu al (d): 10, 20, 25 e 50, para os quais foramselecionados, por geração, os seguintes números de machos (N m ): 10, 5, 4 e 2, respectivamente. Esses valores originaram, respectivamente, os tamanhos efetivos de população (N e ): 36,36; 19,05; 15,38; e 7,84, bem como as intensidades de seleção dos machos (i m ): 2,23; 2,49; 2,56; e 2,82. O número de fêmeas selecionadas por geração foi constante e igual a 100. Cada casal produziu seis descendentes, totalizando 600 indivíduos por geração. Para estudo comparativo dos m étodos de seleção individual e baseada no BLUP, simulou-se um genoma com características idênticas às do genoma do primeiro estudo, a partir do qual se obteve uma população-base, com característica de herdabilidade 0,10. As populações selecionadas apresentaram, desta vez, a seguinte estrutura de dados: valores de razão sexual (d): 10 e 50 e números correspondentes de machos selecionados (N m ): 10 e 2, por geração. O número de fêmeas selecionadas, por geração, foi de 100 e a intensidade de seleção das fêmeas (i f ): 1,09. Todas as populações tiveram 600 indivíduos por geração. Em ambos os estudos, a seleção foi conduzida por 50 gerações consecutivas, com 20 repetições por geração, para reduzir os efeitos de flutuação gênica. Os parâmetros genéticos avaliados em todas as populações, ao longo das gerações, foram: valores fenotípicos médios; consangüinidade média; perdas, em percentagem, por fixação de alelos desfavoráveis; e limite da seleção. Observaram -se os maiores valores fenotípicos nos tipos de acasalamento excluindo acasalamentos entre irmãos, que foram os mais efetivos em controlar a endogamia, em todas as gerações, embora não tivessem impedido seu aumento e acúmulo. Quanto menor a razão sexual, melhor o desempenho de todos os tipos de acasalamento, e também o dos métodos de seleção, no sentido de proporcionar maiores valores para o fenótipo, menores aumentos nos valores da consangüinidade e das perdas por fixação, bem como decréscimos mais suaves no limite da seleção, em todas as gerações. Dentre os métodos de seleção, o BLUP forneceu melhores resultados de valores fenotípicos até, pelo menos, 30 gerações, a partir da primeira geração, em cada valor de razão sexual, em todos os tipos de acasalamento; porém, acarretou maior endogamia, maiores perdas por fixação e queda mais acentuada nos valores do limite da seleção. Verificou-se, contudo, que o nível de endogamia em todas as populações, no decorrer das gerações, foi mais afetado pelos valores de razão sexual do que pelos métodos de seleção e tipos de acasalamento propostos. / In order to evaluate the effect of mating designs, in selected populations, for a long term result, it was used simulated data. A base population with quantitative trait of heritability of 0,10 was simulated from a genome, which consisted of 20 pairs of autosomal chromosomes with 250 diallelic quantitative loci, with only additive effects of gene. An initial population was obtained from the former one that generated the populations of selection, in which the selected individuals were mated in all generations, according to one of the mating: mating allowed for full and half sibs, mating allowed among half sibs, random mating, excluding full sibs mating and excluding half and full sibs mating. The selected populations based on the best linear unbiased prediction (BLUP) of breeding value had, in the study of mating designs, the following data structure: mating ratio values (d): 10, 20, 25, and 50, for which has been selected, by generation, the following numbers of males (N m ): 10, 5, 4 and 2, respectively. These data generated, in sequence, the population sizes (N e ): 36,36; 19,05; 15,38 and 7,84, and also the male selection intensity (i m ): 2,23, 2,49, 2,56, and 2,82. The number of female selected by generation, was constant and equal 100. Each femaleproduced six offspring, totalizing six hundred animals by generation. In order to study the comparison between methods of phenotypic selection and based on BLUP, a genome with the identical trait from the former one was simulate d, resulting in a base-population, in which the quantitative trait also has heritability of 0,10. The selected populations presented at this time, had the following data structure: mating ratio values (d): 10 and 50, and corresponding numbers of selected males (N m ): 10 and 2, by generation. The number of selected females, by generation, was 100 and the female selection was (i f ): 1,09. All the populations had six hundred individuals by generation. In both studies, the selection was made by 50 consecutive generations, with 20 replications by generation in order to reduce the genetic drift effects. The genetic parameters evaluated in all populations, along the generations, were: average phenotypic values, average inbreeding, percentage loss by fixation of unfavorable alleles and selection limit. It was observed the greatest phenotypic values for the mating designs excluding those between sibs, which were the most efficient in the inbreeding controlling, in all generations, although they didn’t avoid their increasing and accumulation. The less the mating ratio, the best will be the performance of all mating designs and also the selection methods, in order to provide greater phenotypic values, and lower increase in inbreeding values and losses by fixation, and slighter decreases in the selection limit, in all generations. Among the selection methods, the BLUP provided better results of phenotypic values in at least 30 generations, from the beginning, to each mating ratio level, in all kinds of mating designs. However, it resulted in higher inbreeding, more loss by fixation and an accentuated reduction in the limit selection values. It was observed, however, that the inbreeding level in all populations, during the generations, was more affected by the mating ratio values, and in lower extension by the selection methods and mating designs proposed. / Dissertação importada do Alexandria
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Qualidade fisiológica de sementes na obtenção de linhagens e híbridos de milhoNerling, Daniele January 2017 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-10-03T04:17:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2017 / A utilização de sementes de qualidade garante rápida e uniforme germinação, com estabelecimento de plântulas vigorosas em uma ampla faixa de ambientes. A qualidade fisiológica, como um dos atributos da qualidade de sementes, é importante fator que precisa ser considerado pelos programas de conservação e de melhoramento de milho. O trabalho teve como objetivo verificar as alterações na qualidade fisiológica durante a obtenção de linhagens e o quanto as características de viabilidade, vigor e composição bioquímica podem ser controlados geneticamente. O trabalho foi desenvolvido com uma variedade de polinização aberta crioula (CRI), duas variedadeS de polinização aberta comerciais (VPA1 e VPA2) e dois híbridos simples comerciais (HIB1 e HIB2). As populações foram submetidas a sucessivas autofecundações até a quinta geração (S5). Para o estudo avaliou-se a influência da endogamia e o controle genético na viabilidade e no vigor de sementes; a estimativa da heterose e da capacidade geral e específica de combinação; a divergência genética e o perfil bioquímico das sementes de linhagens e híbridos e sua associação com o vigor de sementes; a influência da hidrólise e mobilização de proteínas, fósforo total, ácido fítico, fósforo inorgânico, amido e açúcares solúveis sobre o vigor das plântulas no estabelecimento inicial; e, a atividade das enzimas fitase e a-amilase durante a germinação associadas a plântulas com maior vigor. As populações apresentam comportamento distinto quanto aos efeitos da endogamia, de modo geral, todas apresentaram redução na viabilidade e vigor de sementes. Os híbridos apresentaram maior qualidade fisiológica em função da manifestação da heterose. A qualidade fisiológica das sementes está associada a mobilização e hidrólise de reservas. O padrão de hidratação, a maior hidrólise de proteínas de reserva e a maior mobilização de proteína solúvel explicaram o maior vigor de sementes. A maior hidrólise de amido e a maior mobilização de açúcares solúveis está associada a sementes de maior vigor, assim como a maior atividade das enzimas fitase e a-amilase, que apresentaram aumento gradual ao longo do processo germinativo.<br> / Abstract : The use of seeds with quality ensures rapid and uniform germination, with establishment of vigorous seedlings in wide environments. Physiological quality, one aspect of seed quality, is important for maize conservation and breeding programs. The objective of this work was to verify changes in physiological quality during inbred lines obtainment and how much the characteristics of viability, vigor and biochemical composition can be controlled genetically. The work was developed with a landrace (CRI), two commercial open pollinated varieties (VPA1 and VPA2) and two commercial single hybrids (HIB1 and HIB2). Populations were submitted to successive self-pollination up to a fifth generation (S5). For the study, influence of inbreeding and genetic control on the viability and vigor of seeds was evaluated; estimative of heterosis and general and specific combining ability; genetic divergence and biochemical profile of inbred lines and hybrids seeds and their association with seed vigor; influence of hydrolysis and mobilization of proteins, total phosphorus, phytic acid, inorganic phosphorus, starch and soluble sugars on the vigor of the seedlings in the initial establishment;and, phytase and a-amylase activity during germination associated with seedlings with higher vigor. Populations are different behavior in terms of the effects of inbreeding, in general, all populations reduced viability and seed vigor. The hybrids showed higher physiological quality due the heterosis manifestation. Physiological seeds quality was associated with mobilization and hydrolysis of reserves. Hydration pattern, higher hydrolysis of proteins and higher mobilization of soluble protein explained higher seed vigor. Higher starch hydrolysis and higher mobilization of soluble sugars were associated with seed vigor as well as higher activity of phytase and a-amylase enzymes, which also showed a gradual increase throughout the germination process.
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Estrutura populacional e parâmetros genéticos da característica classe de tempo em corridas de equinos da raça Quarto de Milha / Population structure and genetic parameters of trait time class in race of Quarter horsesFaria, Ricardo António da Silva [UNESP] 29 February 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A raça Quarto de Milha (QM) teve seus primeiros exemplares criados no Brasil em 1956, cujos pais foram importados dos Estados Unidos, com fundação da associação dos criadores em 1969, totalizando mais de 415 mil animais registrados e destes 45% são puros. A raça apresenta-se como versátil para trabalho, conformação e corrida, atributos que a tornam como de escolha entre os criadores e de maior população equina nacional. Apesar disto, poucos estudos foram realizados na raça, particularmente acerca da variabilidade genética. Os objetivos do estudo foram obter informações da estrutura populacional da raça QM no Brasil e estimar os parâmetros genéticos da característica Classe de Tempo (CT), relacionada com a performance em corridas de equinos em diferentes distâncias. O escore aplicado a CT, classifica os animais baseado na comparação percentual de tempo do vencedor de cada páreo. Os dados avaliados foram provenientes da Associação Brasileira de Criadores do Cavalo Quarto de Milha e do hipódromo do Jockey Clube de Sorocaba em São Paulo. A preparação da base de dados e estatística inicial foi realizada no programa SAS, os parâmetros populacionais com o programa ENDOG e os componentes de (co) variâncias e parâmetros genéticos com o programa THRGIBBS1F90. A característica CT foi estabelecida nas corridas com distância de 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) e 402 (CT420) metros e analisada por meio de modelo animal limiar. Os parâmetros populacionais obtidos foram 0,49% de endogamia, 0,29% de parentesco, 9,3 anos de intervalo gerações, a probabilidade de origem dos genes com valor igual a 333 de número efetivo de fundadores, a variabilidade genética total apresentou-se explicada por 7.254 ancestrais, com 161 ancestrais explicando 50%. As estimativas a posteriores da herdabilidade e da repetibilidade, obtidas em análise multicaracterística, foram de 0,52±0,04 e 0,85±0,04 (CT301), 0,48±0,06 e 0,97±0,01 (CT320), 0,56±0,04 e 0,88±0,06 (CT365) e 0,45±0,06 e 0,78±0,04 (CT420), respectivamente. Os valores obtidos indicam que a característica CT pode ser utilizada como critério de seleção e obter rápido ganho genético. A baixa variabilidade genética na raça Quarto de Milha foi evidenciada, sugerindo aos criadores inserção de reprodutores no rebanho. / The Quarter Horse (QH) had its first specimens bred in Brazil in 1956, whose parents were imported from the United States, with its breeder association founded in 1969, totaling more than 415,000 registered animals and of these 45% are purebred. The breed is versatile in what concerns performance, conformation and racing, attributes that make the QH the breed of choice among breeders and makes it the largest national equine population. In spite of that, few studies have been conducted about the breed, particularly on the genetic variability of strains. The aim of this study was to gather information about the population structure and estimate the genetic parameters of the trait class time (CT) related to performance in different QH racing distances, contributing with results that enable their use in the design of animal breeding programs aimed at maintaining the variability of the breed and decreasing race times. The score applied to CT, ranks animals based on comparing percentage winning time of each match. The analyzed data originates from the Brazilian Association of Breeders of Quarter Horse and Jockey Clube de Sorocaba’s hippodrome, in Sao Paulo. The preparation of the initial data and statistical base was done using SAS software, the population parameters with the ENDOG software and the (co) variances and genetic parameters components with the THRGIBBS1F90 software. The CT characteristic was established in racing with 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) and 402 (CT420) meters distances and analyzed by threshold animal model. The obtained population parameters were 0.49% of inbreeding, 0.29% of kinship, 9.3-year generation interval, The probability of origin of genes with value 333 related to effective number of founders, the total genetic variability is explained by 7,254 ancestors, with 161 ancestors responsible for 50%. The estimates later heritability and repeatability obtained in multi-trait analysis were 0.52 ± 0.04 and 0.85 ± 0.04 (CT301), 0.48 ± 0.06 and 0.97 ± 0, 01 (CT320), 0.56 ± 0.04 and 0.88 ± 0.06 (CT365) and 0.45 ± 0.06 and 0.78 ± 0.04 (CT420), respectively. The values obtained indicate that CT feature can be used as selection criteria and obtain rapid genetic gain. The low genetic variability in the Quarter Horse breed was evidenced, suggesting to breeding insertion breeders in the herd.
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Top crosses de linhagens S2 de milho shrunken-2 em função da endogamia do testadorFaria, Felipe Vitório de Castro [UNESP] 02 September 2013 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2013-09-02Bitstream added on 2014-06-13T19:13:50Z : No. of bitstreams: 1
000752878.pdf: 1449886 bytes, checksum: 7b2b2c5857d165735c5e2031e8bfde65 (MD5) / O objetivo neste trabalho é avaliar a capacidade geral de combinação de linhagens S2 obtidas de duas populações de milho shrunken-2 visando identificar linhagens que possam originar híbridos simples competitivos com o padrão de mercado. Foram produzidos híbridos top crosses de 22 linhagens parcialmente endogâmicas de geração S2 da população denominada “G” cruzadas com testadores de uma população contrastante denominada “M” nas seguintes gerações: S0M, S1M e S2M. Concomitantemente, fez-se o mesmo para população contrastante em que 22 linhagens parcialmente endogâmicas de geração S2 da população “M” foram cruzadas com os testadores de “G” nas seguintes gerações: S0G, S1G e S2G. Os top crosses foram semeados em março/2011 e repetidos em setembro/2011, sob delineamento de blocos ao acaso, com três repetições, juntamente com as testemunhas comerciais Tropical Plus® e AF-428, o híbrido das populações originais S0M x S0G e as próprias populações originais S0G# e S0M#. Foram avaliados os caracteres agronômicos de campo dias para florescimento masculino, altura de planta e altura de espiga. Após a colheita foi avaliada a produção total de 1ª espiga com palha por parcela, porcentagem de palha, porcentagem de espigas comerciais, produtividade de 1ª espiga comercial sem palha por parcela, peso de espiga comercial sem palha e cobertura de palha. Nas espigas comerciais avaliou-se o comprimento da espiga sem palha, diâmetro da espiga sem palha, número de fileiras de grãos por espiga, enchimento de ponta e profundidade de grãos. Foi realizada análise conjunta e desdobramentos para os quadrados médios significativos. As médias dos caracteres foram comparadas pelo teste Scott & Knott (1974) a 5% de probabilidade e estimou-se o efeito da CGC e CEC. Nos híbridos da população “G” não houve interação por épocas para a maioria das características... / The objective of this research is to evaluate the general combining ability (GCA) of partially inbred strains of two populations of maize shrunken-2 to identify strains that may lead to competitive hybrids with the industry standard. Were produced top crosses of 22 inbred strains partially generation S2 population called G crossed with a population contrasting testers called M in the following generations: S0M, S1M and S2M. Concomitantly, it was the same for opposite population in which 22 partially inbred strains generating S2 population M were crossed with testers G in the following generations: S0G, S1G and S2G. The top crosses were deployed in March 2011 and repeated in September/2011, in a randomized block design with three replications, along with commercial checks “Tropical Plus ®” and “AF-428”, the hybrid of the original populations S0M x S0G and original populations S0M#, S0G#. Parameters were evaluated for agronomic field as days to male flowering, plant height and ear height. After harvest was evaluated total production of 1st ear with straw per plot, percentage of straw, percentage of commercial ear, productivity 1st commercial ear without straw per plot, ear weight commercial without straw and straw roofs. In the commercial ears evaluated the ear length without straw, ear diameter without straw, number of kernel rows per ear, filling tip and depth of grain. Analysis was performed for the joint developments and significant mean squares. The averages of the experiments were compared by Scott & Knott (1974) at 5% probability and estimated the effect of general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA). The lines of the population G by the time there was no interaction for most traits. The interaction tester by strains were not significant for most of the characteristics of the lines G with lines 1 and 5 that showed the best GCA for most parameters ...
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