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Predição do Desfecho Clínico por Leptospirose Baseado na Análise de Expressão Gênica em Casos Hospitalizados

Nery Júnior, Nivison Ruy Rocha 09 May 2017 (has links)
Submitted by Mayara Nascimento (mayara.nascimento@ufba.br) on 2017-06-22T10:24:10Z No. of bitstreams: 1 2017.06.17_Dissertacao_Nivison.pdf: 11864411 bytes, checksum: a479ab92d8893463bed31d083c4e01f4 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Reis (vanessa.jamile@ufba.br) on 2017-06-29T11:25:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017.06.17_Dissertacao_Nivison.pdf: 11864411 bytes, checksum: a479ab92d8893463bed31d083c4e01f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T11:25:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017.06.17_Dissertacao_Nivison.pdf: 11864411 bytes, checksum: a479ab92d8893463bed31d083c4e01f4 (MD5) / A leptospirose é uma doença febril aguda, negligenciada, que atinge populações de diversas regiões tropicais do planeta. São aproximadamente 1 milhão de casos anuais de leptospirose no mundo, sendo que 5-15% destes casos podem desenvolver a forma grave, alcançando quase 60.000 óbitos. As principais causas que levam a óbito os indivíduos doentes por leptospirose com as mesmas características clínicas dos sobreviventes ainda não foram identificadas. No entanto, estudos recentes indicam que a resposta imunológica difere entre indivíduos sobreviventes e mortos. A técnica de microarranjos em amostras de pacientes hospitalizados com desfechos de cura e óbito tem sido utilizada com a finalidade de identificar possíveis associações dos genes ao desfecho clínico. Isso demanda tempo por parte dos especialistas para analisarem a expressão gênica. Adicionalmente, os riscos de erro humano na análise empregada estimulam ainda mais a adoção de técnicas computadorizadas para o auxílio destas atividades. Neste sentido, o presente trabalho propôs o desenvolvimento de modelos de predição baseado em dados clínicos e epidemiológicos para auxiliar no diagnóstico da leptospirose. Uma metodologia para análise do conjunto completo de expressão gênica foi proposta com o intuito de predizer o desfecho clínico. Os resultados obtidos foram avaliados como relevantes por especialistas e podem contribuir para o desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas para o tratamento de casos graves da leptospirose. Assim, os modelos resultantes deste trabalho podem auxiliar os profissionais de saúde na rotina diária do hospital, especialmente em áreas endêmicas de leptospirose, acelerando o tratamento e minimizando a exacerbação e mortalidade da doença.
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An instrument for reviewing the completeness of experimental plans for controlled experiments using human subjects in software engineering

FONSECA, Liliane Sheyla da Silva 21 December 2016 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2017-11-29T17:23:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TeseDoutorado_lssf.pdf: 10022088 bytes, checksum: da65676610d3186199f2a0ed06e7f8f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-29T17:23:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TeseDoutorado_lssf.pdf: 10022088 bytes, checksum: da65676610d3186199f2a0ed06e7f8f1 (MD5) Previous issue date: 2016-12-21 / FACEPE / It is common sense in software engineering that well made experimental plans are recipes for successful experiments, and they help experimenters to avoid interferences during experiments. Although a number of tools are available to help researchers with writing experiments reports for scientific publications, few studies focus on how to assess study protocols with respect to completeness and scientific quality. As a result, designing controlled experiments using subjects has been a challenge for many experimenters in software engineering because of a large variety of factors that should be present in it to avoid introducing bias in controlled experiments. The main aim of this thesis is to define an instrument to help experimenters, specially beginners, to review their experimental planning for assessing whether they produced an experimental plan that is complete and includes all possible factors to minimize bias and issues. The instrument is a checklist whose design is based on experimental best practices and experts’ experience in planning and conducting controlled experiments using subjects. To collect the best practices, a systematic mapping study was conducted to identify support mechanisms (processes, tools, guidelines, among others.) used to plan and conduct empirical studies in the empirical software engineering community, and an informal literature review was carried out in order to find which support mechanisms are generally used in other fields. Moreover, we performed a qualitative study for understanding how empirical software engineering experts plan their experiments. The instrument has been evaluated through four empirical studies. Each one was explored from different perspectives by Software Engineering researchers at different levels of experience. The instrument was assessed regarding items that they find useful, inter-rater agreement, inter-rater reliability, and criterion validity using fully crossed design. Two controlled experiments were performed to assess if the usage of the instrument can reduce the chance of forgetting to include something important during the experiment planning phase compared to the usage of ad hoc practices. Additionally, the acceptance of the instrument was assessed by the four studies. In total, we had 35 participants who participated in four different kinds of assesment of the instrument. In the first study, 75.76% of the items were judged useful by two experts. The remaining items were discussed and adjusted. The second study revealed that the usage of the instrument helped beginners to assess experimental plans in the same way as the experts. We found a strong correlation between the overall completeness scores of the experimental plans and the recommendation that the experiment should proceed or not, and whether it is likely to be successful. In Studies 3 and 4, the proportion of the correct items found by participants using the instrument was greater than the results from participants using the ad hoc practices. The instrument has high acceptance from participants. Although the results are positive, performing more assessments including different settings is required to generalize these results. The usage of the instrument by experimenters, specially beginners, helps them to review the key factors included in the experimental plan, thus contributing to reduce potential confounding factors in the experiment. Revising an experimental plan is not a direct evaluation of the quality of the experiment itself but it allows changes to be made to improve the experiment before it is performed. / É comumente aceito pela comunidade de engenharia de software que planos experimentais bem planejados são receitas para experimentos bem sucedidos. Isso se deve ao fato que planos experimentais auxiliam experimentadores a evitarem interferências durante a execução dos experimentos. No entanto, embora existam ferramentas disponíveis para ajudar os investigadores a reportarem seus experimentos para publicações científicas, poucos estudos tem o objetivo de avaliar os protocolos de estudo no que diz respeito à completude e qualidade científica. Desta forma, planejar experimentos controlados utilizando participantes tem sido um desafio para muitos experimentadores em engenharia de software devido a grande variedade de fatores que devem estar presentes em um plano experimental a fim de evitar a introdução de viés nos experimentos controlados. O principal objetivo dessa tese de doutorado é definir um instrumento que auxilie experimentadores, principalmente inexperientes, a revisarem seus planejamentos experimentais a fim de avaliar se eles produziram um plano experimental completo, incluindo todos os possíveis fatores para minimizar viés e problemas. O instrumento é uma lista de verificação baseado nas melhores práticas experimentais e na experiência dos especialistas em engenharia de software experimental no planejamento e condução de experimentos controlados utilizando pessoas. Para coletar as melhores práticas, um mapeamento sistemático foi realizado para identificar os mecanismos de apoio (processos, ferramentas, guias, dentre outros) utilizados para planejar e conduzir estudos empíricos na comunidade de engenharia de software e uma revisão da literatura foi realizada para identificar mecanismos de apoio que são geralmente utilizados em outras áreas. Além disso, foi realizada um estudo qualitativo a fim de entender como os especialistas em engenharia de software experimental planejam seus experimentos. O instrumento foi avaliado por meio de quatro estudos. Cada estudo foi explorado através de diferentes perspectivas por pesquisadores de engenharia de software em diferentes níveis de experiência. O instrumento foi avaliado com relação a utilidade dos itens, a concordância e a confiabilidade entre os avaliadores e validade de critério. Dois experimentos controlados foram realizados para avaliar se o uso do instrumento pode reduzir a chance de esquecer algo importante durante a fase de planejamento do experimento em comparação com as práticas comumente usadas pelos pesquisadores. Além disso, os quatro estudos avaliaram a aceitação do instrumento para revisar planos experimentais de experimentos controlados utilizando participantes. No total, 35 participantes avaliaram o instrumento através de quatro diferentes tipos de objetivos. No primeiro estudo, 75,76% dos itens foram julgados uteis pelos dois especialistas envolvidos no estudo. Os itens restantes foram discutidos e ajustados. O segundo estudo revelou que a utilização do instrumento auxiliou iniciantes a avaliarem planos experimentais da mesma forma dos especialistas. Os resultados mostraram uma forte correlação entre os escores da completude global dos planos experimentais e as recomendações se o experimento deveria prosseguir e a probabilidade do experimento ser bem-sucedido. Nos estudos 3 e 4, a proporção dos itens corretos encontrados pelos participantes utilizando o instrumento foi significantemente maior do que os resultados utilizando as práticas comumente utilizadas pelos participantes. O instrumento teve alta aceitação por parte dos participantes. No entanto, embora os resultados sejam positivos, se faz necessário a realização de mais estudos de avaliação, incluindo outras configurações de ambientes a fim de que o resultado possa ser generalizado. A utilização do instrumento pelos experimentadores, especialmente os iniciantes, auxilia a revisão dos principais fatores que devem estar incluídos no plano experimental, contribuindo assim para reduzir potenciais fatores de confusão no experimento. Revisar um plano experimental não é uma avaliação direta da qualidade do experimento, mas permite que mudanças no experimento sejam realizadas antes que ele seja de fato executado.
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Reengenharia da ferramenta Projection Explorer para apoio à seleção de estudos primários em revisão sistemática / Reengineering of projection explorer tool to support selection of primary studies on systematic review

Martins, Rafael Messias 11 April 2011 (has links)
A crescente adoção do paradigma experimental na pesquisa em Engenharia de Software visa a obtenção de evidências experimentais sobre as tecnologias propostas para garantir sua correta avaliação e para a construção de um corpo de conhecimento sólido da disciplina. Uma das abordagens de pesquisa experimental é a revisão sistemática, um método rigoroso, planejado e auditável para a realização da coleta e análise crítica de dados experimentais disponíveis sobre um determinado tema de pesquisa. Apesar de produzir resultados confiáveis, a condução de uma revisão sistemática pode ser trabalhosa e muitas vezes demorada, principalmente quando existe um grande volume de estudos a serem considerados, selecionados e avaliados. Uma solução encontrada na literatura é a utilização de ferramentas de Mineração Visual de Textos (VTM) como a Projection Explorer (PEx) para apoiar a fase de seleção e análise de estudos primários no processo de revisão sistemática. Neste trabalho foi realizada uma reengenharia de software na ferramenta PEx com dois objetivos principais: apoiar, utilizando VTM, a fase de seleção e análise de estudos primários no processo de revisão sistemática e implementar novos requisitos não-funcionais relativos à melhoria da manutenibilidade e escalabilidade da ferramenta. Como resultado foi construída uma plataforma modular para a instanciação de ferramentas de visualização e, a partir da mesma, uma ferramenta de revisão sistemática apoiada por VTM. Os resultados de um estudo de caso executado com a ferramenta mostraram que a abordagem de aplicação de técnicas VTM usada nesse contexto é viável e promissora, melhorando tanto a performance quanto a efetividade da seleção / The increasing adoption of the experimental paradigm in Software Engineering research aims at obtaining experimental evidence of the proposed technologies to ensure their proper evaluation and to build a solid body of knowledge for the discipline. One approach of experimental research is the systematic review, a rigorous, auditable and planned method to carry out the collection and analysis of experimental data available on a particular research topic. Despite producing reliable results, conducting a systematic review can be a cumbersome and often lengthy process, especially when a large volume of studies is to be considered, selected and evaluated. One solution found in the literature is the use of Visual Text Mining (VTM) tools such as the Projection Explorer (PEx) to support the selection and analysis of primary studies in the systematic review process. In this work a software re-engineering was performed on PEx with two main goals: to support, using VTM, the stage of selection and analysis of primary studies in the systematic review process and to implement new non-functional requirements related to improving the maintainability and scalability of the tool. The results were the building of a modular platform for instantiating visualization tools and, from it, the instantiation of a systematic review tool supported by VTM. The results of a case study carried out with the tool showed that the VTM approach used in this context is feasible and promising, improving both performance and the effectiveness of selection
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Requirements engineering in software startups: a qualitative investigation / Engenharia de requisitos em startups de software: uma investigação qualitativa

Gonçalves, Jorge Augusto Melegati 06 March 2017 (has links)
Software startups face a very demanding market: they must deliver high innovative solutions in the shortest possible period of time. Resources are limited and time to reach market is short. Then, it is extremely important to gather the right requirements and that they are precise. Nevertheless, software requirements are usually not clear and startups struggle to identify what they should build. This context affects how requirements engineering activities are performed in these organizations. This work seeks to characterize the state-of-practice of requirements engineering in software startups. Using an iterative approach, seventeen interviews were conducted during three stages with founders and/or managers of different Brazilian software startups operating in different market sectors and with different maturity levels. Data was analyzed using grounded theory techniques such open and axial coding through continuous comparison. As a result, a conceptual model of requirements engineering state-of-practice in software startups was developed consisting of its context influences (founders, software development manager, developers, business model, market and ecosystem) and activities description (product team; elicitation; analysis, validation and prioritization; product validation and documentation). Software development and startup development techniques are also presented and their use in the startup context is analyzed. Finally, using a bad smell analogy borrowed from software development literature, some bad practices and behaviors identified in software startups are presented and solutions to avoid them proposed. / Startups de software enfrentam um mercado muito exigente: elas devem entregar soluções altamente inovativas no menor período de tempo possível. Recursos são limitados e tempo para alcançar o mercado é pequeno. Então, é extremamente importante coletar os requisitos certos e que eles sejam precisos. Entretanto, os requisitos de software geralmente não são claros e as startups fazem um grande esforço para identificar quais serão implementados. Esse contexto afeta como as atividades de engenharia de requisitos são executadas nessas organizações. Este trabalho procura compreender o estado-da-prática da engenharia de requisitos em startups de software. Usando uma abordagem iterativa, dezessete entrevistas foram realizados em três diferentes estágios com fundadores e/ou gestores de diferentes startups de software brasileiras operando em diferentes setores e com diferentes estágios de maturidade. Os dados foram analisados usando técnicas de teoria fundamentada como codificação aberta e axial através da comparação contínua. Como resultado, um modelo conceitual do estado-da-prática da engenharia de requisitos em startups de software foi desenvolvido consistindo da suas influências do contexto (fundadores, gerente de desenvolvimento de software, desenvolvedores, modelo de negócio, mercado e ecossistema) e descrição das atividades (time de produto; levantamento; análise, validação e priorização; e documentação). Técnicas oriundas de metodologias de desenvolvimento de software e desenvolvimento de startups também são apresentadas e seu uso em no contexto de startups é analisado. Finalmente, a partir de uma analogia de maus cheiros presente na literatura de desenvolvimento de software, algumas más práticas e maus comportamentos identificados em startups de software são apresentados e algumas sugestões de solução são propostas.
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Avaliação do custo e efetividade dos critérios de teste estruturais no contexto de programas concorrentes com memória compartilhada / Evaluation of the cost. effectiveness and strength of structural testing criteria in the concurrent programs context with shared memory

Melo, Silvana Morita 11 October 2012 (has links)
O teste de programas concorrentes e uma atividade desaadora, devido a fatores que não estão presentes em programas sequenciais, como comunicação, sincronização e não determinismo. Algumas técnicas de teste têm sido propostas para o contexto de programação concorrente, mas raramente sua aplicabilidade e avaliada por estudos teóricos ou experimentais. Este trabalho contribui nesse sentido, propondo e conduzindo um estudo experimental para avaliar o custo, eficácia e aspecto complementar dos critérios de teste estruturais para programas concorrentes no contexto de memória compartilhada, implementados usando o padrão PThreads (Posix Threads). A ferramenta de teste ValiPThread e usada para auxiliar a condução do experimento. Os programas usados no experimento foram selecionados de benchmarks, como o Inspect, Helgrind e Rungta. Esses benchmarks são comumente usados no estudo de técnicas de teste para programas concorrentes. Programas que resolvem problemas clássicos da programação concorrente também foram incluídos no estudo. Com base nos resultados obtidos foi definida uma estratégia de aplicação, considerando aspectos de custo e eficácia dos critérios de teste. Além disso, todo o material utilizado e gerado durante o experimento foi reunido em um pacote de laboratório, a fim de contribuir com a comunidade de pesquisa, possibilitando replicações e comparações desses critérios com outras técnicas de teste no contexto de programas concorrentes / Concurrent program testing is a challenging activity due to the communication, synchronization and nondeterminism of this application domain. Despite that, some testing techniques for concurrent programs have been proposed, but their applicability is rarely evaluated by theoretical or experimental studies. This work contributes in this direction proposing and conducting an experimental study to evaluate the cost, effectiveness and strength of structural testing criteria for multithreaded programs, implemented using the Pthreads standard (POSIX Threads). The testing tool ValiPThread is used to support the conduction of the experiment. The programs used in this experiment were selected from classical benchmarks, such as Inspect, Helgring and Rungta. These benchmarks are commonly used to study testing techniques for concurrent programs. We also include programs that solve concurrent classical problems. Based on the obtained results, we defined an application testing strategy, considering cost and effectiveness aspects of the testing criteria. Furthermore, all material used and generated during the experiment was incorporated in a lab package, in order to contribute with further research studies making possible replications and comparisons of these testing criteria with other testing techniques in context of concurrent programs
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VIDAese: processo de visualização exploratória para apoio a estudos empíricos em verificação, validação e teste de software / VIDAese: visual exploratory process to support empirical studies in software verification, validation and test

Garcia, Rogério Eduardo 02 October 2006 (has links)
A Engenharia de Software evolui gradativamente para uma disciplina científica baseada em observação, formulação teórica e experimentação. Nesse contexto, estudos experimentais têm sido conduzidos para proporcionar evidências sobre a qualidade e a produtividade de técnicas, ferramentas e métodos de desenvolvimento de software. Porém, resultados obtidos a partir de pesquisas experimentais são úteis somente se os pesquisadores puderem consolidá-las em um contexto significativo de conhecimento. O projeto Readers: A Collaborative Research to Develop, Validate and Package Reading Techniques for Software Defect Detection aborda diversos aspectos envolvidos na construção de um corpo significativo de resultados a partir de experimentos controlados. Nesse contexto, sustenta-se que a aplicação de meios alternativos de análise e exploração de dados dos experimentos conduzidos pode colaborar para a evolução do Pacote de Laboratório, e como efeito colateral, contribuir com a formação do corpo de conhecimento almejado. Este projeto propõe mecanismos para integrar técnicas de visualização exploratória à análise de dados de experimentos controlados. Para isso, foram propostas adequações ao processo de experimentação, bem como um processo de visualização para Engenharia de Software Experimental ? V iDAESE. Para ilustrar o V iDAESE, ciclos de análises são apresentados, juntamente com as conclusões obtidas em cada um. As análises visuais apóiam o processo de consolidação de conhecimento a partir dos dados e a melhoria do Pacote de Laboratório. Adicionalmente, uma abordagem para simulação de dados experimentais foi proposta, permitindo explorar cenários que apóiem o planejamento de experimento. / A Engenharia de Software evolui gradativamente para uma disciplina científica baseada em observação, formulação teórica e experimentação. Nesse contexto, estudos experimentais têm sido conduzidos para proporcionar evidências sobre a qualidade e a produtividade de técnicas, ferramentas e métodos de desenvolvimento de software. Porém, resultados obtidos a partir de pesquisas experimentais são úteis somente se os pesquisadores puderem consolidá-las em um contexto significativo de conhecimento. O projeto Readers: A Collaborative Research to Develop, Validate and Package Reading Techniques for Software Defect Detection aborda diversos aspectos envolvidos na construção de um corpo significativo de resultados a partir de experimentos controlados. Nesse contexto, sustenta-se que a aplicação de meios alternativos de análise e exploração de dados dos experimentos conduzidos pode colaborar para a evolução do Pacote de Laboratório, e como efeito colateral, contribuir com a formação do corpo de conhecimento almejado. Este projeto propõe mecanismos para integrar técnicas de visualização exploratória à análise de dados de experimentos controlados. Para isso, foram propostas adequações ao processo de experimentação, bem como um processo de visualização para Engenharia de Software Experimental ? V iDAESE. Para ilustrar o V iDAESE, ciclos de análises são apresentados, juntamente com as conclusões obtidas em cada um. As análises visuais apóiam o processo de consolidação de conhecimento a partir dos dados e a melhoria do Pacote de Laboratório. Adicionalmente, uma abordagem para simulação de dados experimentais foi proposta, permitindo explorar cenários que apóiem o planejamento de experimento.
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Requirements engineering in software startups: a qualitative investigation / Engenharia de requisitos em startups de software: uma investigação qualitativa

Jorge Augusto Melegati Gonçalves 06 March 2017 (has links)
Software startups face a very demanding market: they must deliver high innovative solutions in the shortest possible period of time. Resources are limited and time to reach market is short. Then, it is extremely important to gather the right requirements and that they are precise. Nevertheless, software requirements are usually not clear and startups struggle to identify what they should build. This context affects how requirements engineering activities are performed in these organizations. This work seeks to characterize the state-of-practice of requirements engineering in software startups. Using an iterative approach, seventeen interviews were conducted during three stages with founders and/or managers of different Brazilian software startups operating in different market sectors and with different maturity levels. Data was analyzed using grounded theory techniques such open and axial coding through continuous comparison. As a result, a conceptual model of requirements engineering state-of-practice in software startups was developed consisting of its context influences (founders, software development manager, developers, business model, market and ecosystem) and activities description (product team; elicitation; analysis, validation and prioritization; product validation and documentation). Software development and startup development techniques are also presented and their use in the startup context is analyzed. Finally, using a bad smell analogy borrowed from software development literature, some bad practices and behaviors identified in software startups are presented and solutions to avoid them proposed. / Startups de software enfrentam um mercado muito exigente: elas devem entregar soluções altamente inovativas no menor período de tempo possível. Recursos são limitados e tempo para alcançar o mercado é pequeno. Então, é extremamente importante coletar os requisitos certos e que eles sejam precisos. Entretanto, os requisitos de software geralmente não são claros e as startups fazem um grande esforço para identificar quais serão implementados. Esse contexto afeta como as atividades de engenharia de requisitos são executadas nessas organizações. Este trabalho procura compreender o estado-da-prática da engenharia de requisitos em startups de software. Usando uma abordagem iterativa, dezessete entrevistas foram realizados em três diferentes estágios com fundadores e/ou gestores de diferentes startups de software brasileiras operando em diferentes setores e com diferentes estágios de maturidade. Os dados foram analisados usando técnicas de teoria fundamentada como codificação aberta e axial através da comparação contínua. Como resultado, um modelo conceitual do estado-da-prática da engenharia de requisitos em startups de software foi desenvolvido consistindo da suas influências do contexto (fundadores, gerente de desenvolvimento de software, desenvolvedores, modelo de negócio, mercado e ecossistema) e descrição das atividades (time de produto; levantamento; análise, validação e priorização; e documentação). Técnicas oriundas de metodologias de desenvolvimento de software e desenvolvimento de startups também são apresentadas e seu uso em no contexto de startups é analisado. Finalmente, a partir de uma analogia de maus cheiros presente na literatura de desenvolvimento de software, algumas más práticas e maus comportamentos identificados em startups de software são apresentados e algumas sugestões de solução são propostas.
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Avaliação do custo e efetividade dos critérios de teste estruturais no contexto de programas concorrentes com memória compartilhada / Evaluation of the cost. effectiveness and strength of structural testing criteria in the concurrent programs context with shared memory

Silvana Morita Melo 11 October 2012 (has links)
O teste de programas concorrentes e uma atividade desaadora, devido a fatores que não estão presentes em programas sequenciais, como comunicação, sincronização e não determinismo. Algumas técnicas de teste têm sido propostas para o contexto de programação concorrente, mas raramente sua aplicabilidade e avaliada por estudos teóricos ou experimentais. Este trabalho contribui nesse sentido, propondo e conduzindo um estudo experimental para avaliar o custo, eficácia e aspecto complementar dos critérios de teste estruturais para programas concorrentes no contexto de memória compartilhada, implementados usando o padrão PThreads (Posix Threads). A ferramenta de teste ValiPThread e usada para auxiliar a condução do experimento. Os programas usados no experimento foram selecionados de benchmarks, como o Inspect, Helgrind e Rungta. Esses benchmarks são comumente usados no estudo de técnicas de teste para programas concorrentes. Programas que resolvem problemas clássicos da programação concorrente também foram incluídos no estudo. Com base nos resultados obtidos foi definida uma estratégia de aplicação, considerando aspectos de custo e eficácia dos critérios de teste. Além disso, todo o material utilizado e gerado durante o experimento foi reunido em um pacote de laboratório, a fim de contribuir com a comunidade de pesquisa, possibilitando replicações e comparações desses critérios com outras técnicas de teste no contexto de programas concorrentes / Concurrent program testing is a challenging activity due to the communication, synchronization and nondeterminism of this application domain. Despite that, some testing techniques for concurrent programs have been proposed, but their applicability is rarely evaluated by theoretical or experimental studies. This work contributes in this direction proposing and conducting an experimental study to evaluate the cost, effectiveness and strength of structural testing criteria for multithreaded programs, implemented using the Pthreads standard (POSIX Threads). The testing tool ValiPThread is used to support the conduction of the experiment. The programs used in this experiment were selected from classical benchmarks, such as Inspect, Helgring and Rungta. These benchmarks are commonly used to study testing techniques for concurrent programs. We also include programs that solve concurrent classical problems. Based on the obtained results, we defined an application testing strategy, considering cost and effectiveness aspects of the testing criteria. Furthermore, all material used and generated during the experiment was incorporated in a lab package, in order to contribute with further research studies making possible replications and comparisons of these testing criteria with other testing techniques in context of concurrent programs
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Sistema de apoio ? interatividade em revis?es sistem?ticas em engenharia de software

Fernandes, Wellington Alexandre 04 March 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:48:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 WellingtonAF_DISSERT.pdf: 1656110 bytes, checksum: 7bb9469211799ce0b926f1de8bfbe642 (MD5) Previous issue date: 2013-03-04 / A colabora??o na pesquisa ? uma das tarefas centrais da ?rea acad?mica. Atualmente, muitos pesquisadores est?o utilizando meios modernos de troca de arquivos digitais atrav?s de ferramentas ass?ncronas e tamb?m com o uso de ferramentas mais sofisticadas, do tipo s?ncronas. Juntamente com o fato da crescente quantidade de artigos sendo gerados, mais complexos, diversificados e aumentando de forma desorganizada, o que tr?s ao pesquisador uma tarefa dif?cil para organiz?-los de forma a se extrair o melhor conte?do destes, isto ocorre porque uma sub?rea da Engenharia de Software (ES) ainda ? bastante mal aproveitada, a Engenharia de Software Experimental (ESE). Utilizando-se de um dos tipos de experimentos que a ESE oferece, as revis?es sistem?ticas entram como uma solu??o bastante robusta, na qual o pesquisador pode identificar o conhecimento existente em uma ?rea e planejar devidamente sua pesquisa, evitando a repeti??o de erros em pesquisas j? efetivadas por outros pesquisadores no passado. Contudo, estas duas abordagens, a colabora??o virtual de pesquisadores e a utiliza??o de revis?es sistem?ticas, contem problemas: na primeira, sistemas colaborativos s?o geralmente dif?ceis de configurar e usar; na segunda, apesar da robustez da metodologia de revis?es sistem?ticas, ainda se torna necess?rio uma rigorosa revis?o na literatura para se conseguir um resultado satisfat?rio. Assim, com o foco de unir estas duas abordagens, este trabalho prop?e uma maneira de produzir revis?es sistem?ticas de forma organizada e com a possibilidade de intera??o entre usu?rios, com o desenvolvimento de um sistema interativo, no qual as revis?es sistem?ticas possam ser geradas por usu?rios em colabora??o com outros e tamb?m ser avaliadas seguindo a orienta??o de um profissional da ?rea, tornando o seu conte?do mais consistente e de melhor qualidade. O sistema n?o possui n?veis de acesso, ou seja, qualquer pessoa pode se cadastrar e usufruir de seus recursos, seja na ?rea acad?mica ou mesmo na ?rea profissional
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PLAR: Uma técnica de recuperação de arquitetura de linhas de produto de software

Cardoso, Mateus Passos Soares 14 March 2017 (has links)
Submitted by Mayara Nascimento (mayara.nascimento@ufba.br) on 2017-05-31T12:41:20Z No. of bitstreams: 1 dissertacao-mateus.pdf: 2862867 bytes, checksum: 9e64fec80f4c391286f91f1b09c290c3 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Reis (vanessa.jamile@ufba.br) on 2017-06-02T14:10:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertacao-mateus.pdf: 2862867 bytes, checksum: 9e64fec80f4c391286f91f1b09c290c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:10:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao-mateus.pdf: 2862867 bytes, checksum: 9e64fec80f4c391286f91f1b09c290c3 (MD5) / Linhas de produtos de software promovem o reuso em larga escala, apoiando a criação, evolução e gerenciamento de portfólios de produtos que compartilham um núcleo comum de características e se diferenciam com base em características variáveis. Na Engenharia de Linha de Produtos de Software, a arquitetura da linha de produtos é um ativo importante, que descreve os pontos de variabilidade da linha de produtos. Se estiver desatualizada ou ausente, pode ser parcialmente recuperada a partir da arquitetura implementada nos produtos da linha. As abordagens para recuperação de arquitetura de software existentes podem ser utilizadas para recuperar a arquitetura de cada produto da linha. Entretanto, técnicas e ferramentas de recuperação, especialmente concebidas para identificar e descrever pontos de variabilidade e comunalidade na arquitetura da linha de produtos propriamente dita, ainda são incipientes. Este trabalho apresenta uma abordagem para recuperação de arquitetura de linhas de produtos de software. A abordagem proposta inclui a técnica PLAR (Product Line Architecture Recovery) e a ferramenta PLAR Tool, que implementa a técnica PLAR. A técnica PLAR permite a identificação de pontos de variabilidade e comunalidade da linha de produtos em nível arquitetural. A ferramenta PLAR Tool apóia a recuperação de arquitetura de linhas de produtos, bem como a avaliação de seu grau de reuso. A ferramenta PLAR Tool foi objeto de um estudo realizado com desenvolvedores de linhas de produtos de software, com o propósito de avaliar o resultado da recuperação, com base em visões arquiteturais geradas pela ferramenta, e coletar sugestões de melhoria. Os desenvolvedores não identificaram erros de classificação de elementos arquiteturais com pontos de variabilidade nas arquiteturas recuperadas. Por outro lado, alguns elementos que implementam a variabilidade não foram classificados, sugerindo a necessidade de melhorar a seleção de produtos da linha para uso no processo de recuperação de arquitetura. A ferramenta foi utilizada em dois estudos empíricos, um com o propósito de recuperar a arquitetura de linha de produtos de projetos de código aberto e avaliar sua qualidade, e outro com o propósito de comparar dois métodos de geração de produtos: Padrão x T-Wise. Os principais resultados destes estudos são: existe uma relação estatística entre o número de produtos da linha usados pela técnica PLAR e o grau de reuso da arquitetura recuperada e, o uso do método de geração de produtos T-Wise permitiu que um número reduzido de produtos da linha fosse usado na recuperação de arquitetura, sem comprometer a precisão da recuperação

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