Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-07-15T14:37:50Z No. of bitstreams: 1 DIAS VS DISSERTAÇÃO 2012.pdf: 1103761 bytes, checksum: ffcba12822bcc9c62dadf27947c6e861 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Valéria de Jesus Moura (anavaleria_131@hotmail.com) on 2016-06-21T16:46:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DIAS VS DISSERTAÇÃO 2012.pdf: 1103761 bytes, checksum: ffcba12822bcc9c62dadf27947c6e861 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-21T16:46:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIAS VS DISSERTAÇÃO 2012.pdf: 1103761 bytes, checksum: ffcba12822bcc9c62dadf27947c6e861 (MD5) / Fapesb / A seleção sexual pode conduzir populações ao isolamento reprodutivo pré-zigótico mediante a evolução da preferência por características sexuais específicas (Ritchie, 2007). Uma possível explicação para esse processo considera a evolução conjunta entre a preferência de acasalamento da fêmea e características secundárias do macho (Lande, 1981, 1982). Nos animais, em geral, as fêmeas podem escolher machos de melhor qualidade (good genes sexual selection, ver detalhes em Möller & Alatalo, 1999 e Alcock, 2011) ou mais estimulantes (seleção runaway, Fisher, 1930). Todavia, quando tais escolhas conduzem a uma discriminação entre espécies de um grupo aparentado (raças geográficas), elas podem contribuir para o reconhecimento das espécies (Ryan &Rand, 1993). O reconhecimento de parceiro sexual pode ser definido como uma resposta comportamental indicando que um indivíduo considera outro como parceiro apropriado, não estando vinculado à ideia de preferência, já que não exige comparação (Ryan & Rand, 1993). A ideia de preferência, comumente associada às fêmeas, está relacionada à “vantagem que certos indivíduos têm sobre os outros do mesmo sexo e espécie unicamente em relação à reprodução” (Darwin, 1871), originalmente o conceito de seleção sexual. Dentre os mecanismos pela qual a seleção sexual ocorre, a escolha de parceiro sexual (seleção intersexual) é caracterizada pelo favorecimento de caracteres em um dos sexos que atraem o outro (Krebs & Davies, 1996). Ryan e Rand (1993) descreveram inicialmente a relação entre a escolha de parceiro sexual e o reconhecimento de parceiro, ressaltando as semelhanças entre ambos os processos, afirmando que sua interação pode resultar em acasalamentos associativos dentro e entre espécies. Algumas das possíveis causas para a ocorrência de acasalamentos associativos podem ser extraídas dos mecanismos de isolamento pré-zigótico definidos por Dobzhansky (1951) como, por exemplo, a ocupação de diferentes hábitats (isolamento ecológico); diferentes horários ou estações de acasalamentos e floração (isolamento temporal); assim como a falta de atração mútua entre machos e fêmeas (isolamento sexual ou comportamental). Ainda segundo ele, há também os mecanismos pós-zigóticos de isolamento como inviabilidade, esterilidade ou desmoronamento do híbrido. Um excelente modelo para investigar os mecanismos de isolamento reprodutivo é a Anastrepha fraterculus, considerada um complexo de espécies crípticas, e não uma entidade biológica singular, por estudos moleculares, genéticos, morfométricos e bioquímicos (Stone, 1942; Steck, 1991; Selivon & Perondini, 1998; Selivon et al., 2004, 2005; Cáceres et al., 2009). No Brasil, alguns desses estudos apontam para a hipótese de pelo menos três grupos diferentes desta espécie no País, denominados Anastrepha sp.1 aff. fraterculus, A. sp.2 aff. fraterculus e A. sp.3 aff. fraterculus (Selivon & Perondini, 1998; Selivon et al., 2004, 2005). Apesar de todos os estudos direcionados à caracterização das populações do complexo A. fraterculus oriundas do Brasil, pouco se sabe sobre a compatibilidade sexual das mesmas. Este conhecimento é importante para auxiliar na resolução do status taxonômico, no maior conhecimento dos fatores envolvidos no isolamento reprodutivo do complexo, bem como no seu controle, já que esta é considerada uma praga agrícola. A urgência de métodos de controle complementares da A. fraterculus, como a Técnica do Inseto Estéril (TIE), é evidente diante do extensivo uso de defensivos agrícolas e das perdas significativas associadas à produção de maçã no Rio Grande do Sul e Santa Catarina (Sugayama et al., 1997; Kovaleski et al., 1999). A TIE consiste na produção massal de insetos para posterior esterilização e liberação na natureza (Knipling, 1955). Logo, ocorrendo o acasalamento entre o macho liberado e a fêmea selvagem, a população alvo tende a diminuir. Visando fornecer subsídios para o controle populacional da A. fraterculus no Brasil através da TIE (relevância prática), bem como contribuir para o entendimento da influência do comportamento sexual no isolamento reprodutivo do complexo A. fraterculus (relevância teórica), o presente estudo foi realizado. Para isto, a compatibilidade sexual e as frequências dos comportamentos de corte de populações do Sul (Vacaria-RS, Pelotas-RS, Bento Gonçalves-RS, São Joaquim-SC) e do Sudeste (Piracicaba-SP) do Brasil foram avaliadas através de experimentos em gaiola de campo e filmagem, respectivamente. A compatibilidade de acasalamento foi avaliada mediante os seguintes cruzamentos: Pelotas versus Vacaria, Vacaria versus São Joaquim, Vacaria versus Bento Gonçalves, Piracicaba versus Vacaria, Piracicaba versus Bento Gonçalves e Piracicaba versus São Joaquim. Os resultados sugerem que há compatibilidade de acasalamento entre as populações do Sul e certo grau de incompatibilidade destas quando comparadas com a população do Sudeste. Nenhuma diferenciação foi encontrada quanto ao pico de atividade sexual e formação de leks; entretanto os experimentos de filmagem mostraram que estas diferiram em relação às frequências das unidades comportamentais associadas ao sucesso de acasalamento. Houve clara distinção quanto às populações selvagens em relação às criadas em laboratório. Nossos resultados sugerem uma possível explicação para a incompatibilidade de acasalamento encontrada entre as populações do Sul e Sudeste, servindo de alerta para possíveis programas de liberação de insetos estéreis nessas áreas. É importante ressaltar que não basta utilizar populações classificadas no mesmo grupo dentro do complexo A.fraterculus, mas, acima disso, os machos das populações utilizadas em tais programas de controle devem ser aptos a competirem com os insetos selvagens para o sucesso da TIE. / Salvador

O gênero Coleodactylus está distribuído pelo norte da América do Sul e reúne cinco espécies de lagartos de tamanho reduzido que habitam o folhiço da mata. A maioria dos estudos acerca do gênero não trata das variações morfológicas entre as espécies, tendo sido o trabalho de Vanzolini (1967) a última revisão feita para o grupo. Suas espécies são reconhecidamente crípticas, e com exceção das diferenças mais evidentes que separam C. amazonicus das demais do gênero, os caracteres diagnósticos estão principalmente relacionados à folidose da cabeça. Recentemente foi publicado um estudo baseado em dados moleculares que propõe hipótese de relacionamento entre as espécies e indica que a diversidade do grupo está subestimada (Geurgas e col., 2008). Guiado pela análise molecular, foi realizada aqui o estudo taxonômico do gênero, considerando dados de morfologia externa. A avaliação de 3904 exemplares, amostrados em quase toda a distribuição geográfica do gênero, indicou forte similaridade morfológica entre os clados de Coleodactylus e que estes apresentam morfologia externa conservada, apesar da acentuada diferenciação genética. O resultado do estudo, de maneira geral, é corroborado pela análise de Geurgas e col (2008), sendo as espécies diagnosticadas morfologicamente congruentes com os agrupamentos monofiléticos encontrados no estudo molecular. As variações morfológicas encontradas aqui permitiram o reconhecimento de quatro novas espécies, duas hoje alocadas em C. septentrionalis e duas em C. meridionalis, elevando para nove o número de espécies do gênero. Devido à homogeneidade de morfologia externa e tamanho reduzido dos animais, sugere-se fortemente que estudos de outra natureza (osteológica, ecológica, etc.) e de microestruturas sejam realizados a fim de se conhecer a diversidade real do gênero. / Coleodactylus genus is widespread among the north of South America and assembles five species of dimunitive lizards that live in forests leaf-leather. The majority of studies regarding this genus do not consider morphological variations between species. Vanzolini (1967) made the last revision about this group. Species from this genus are known for being cryptical. Except for more evident differences that separate C. amazonicus from other species of this genus, diagnostic characters are mainly related to the number of scales in the head. Recently, a work based on molecular data was published. It hypothesized the relationship between species and indicated that diversity in this group is underestimated (Geurgas et al., 2008). Herein we performed the taxonomic revision of the genus, guided by molecular analysis, considering external morphological data. The evaluation of 3904 specimens, which were sampled in almost the entire geographical distribution of the genus, indicated strong morphological similarity among Coleodactylus clades, showing also conserved external morphology, despite the accentuated genetic differentiation. Results from this work, in general terms, corroborated the analysis of Geurgas et. al (2008). Diagnosed species were morphologically congruous with monophyletic groups found in this molecular work. Morphological variations found here will allow the recognition of four new species, two of them allocated in C. septentrionalis and another two in C. meridionalis, increasing to nine the number of species in the genus. Due to their external morphology homogeneity and diminutive size, we strongly suggest that studies of different nature (osteological, ecological, etc) should be made in order to unravel the real diversity of the genus.

Orientador: Luciane Alarcão Dias-Melicio / Resumo: A paracoccidioidomicose é uma micose granulomatosa sistêmica, prevalente na América Latina, e que até recentemente acreditava-se ser causada apenas por uma espécie de fungo, o Paracoccidioides brasiliensis (P. brasiliensis). No entanto, em 2006, pesquisadores descreveram três espécies crípticas: S1, PS2, PS3 e, posteriormente o PS4. Em 2009, o Paracoccidioides lutzii (Pb01-like) foi descrito, e ano passado, em 2017, uma nova nomenclatura foi proposta para esses agentes etiológicos distintos: P. brasiliensis (S1), P. Americana (PS2), P. restrepiensis (PS3) e P. venezuelensis (PS4). Todos esses agentes são fungos termodimórficos que crescem como levedura in vivo, no hospedeiro, em tecidos ou em culturas in vitro a 37°C e como micélio à temperatura ambiente (4 a 28°C). As espécies não são uniformemente distribuídas pela América Latina, sendo algumas mais proeminentes em algumas regiões do que em outras. O Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu é polo de estudo da paracoccidioidomicose e situado na região centro-oeste do estado de São Paulo, considerada uma área endêmica. Devido à existência de espécies crípticas de Paracoccidioides, análises mais detalhadas nas amostras de pacientes tornaram-se necessárias para uma melhor compreensão de distribuição e ocorrência das espécies recentemente descritas nessa região, favorecendo uma possível correlação entre os grupos genéticos e características micológicas e clínicas. Os objetivos foram obtenção de dados epidemiol... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Paracoccidioidomycosis is a chronic granulomatous mycosis prevalent in Latin America, that until recently it was believed to be caused only by Paracoccidioides brasiliensis (P. brasiliensis). However, in 2006, researchers described cryptic species: S1, PS2, PS3, and PS4. In 2009, Paracoccidioides lutzii (Pb01-like) was described, and now, a new nomenclature was proposed for the other different agents: P. brasiliensis (S1), P. Americana (PS2), P. restrepiensis (PS3), and P. venezuelensis (PS4). All these agents are thermodimorphic fungi that develop as yeast in vivo, in host tissues or in vitro cultures at 37°C in culture media. It also grows as mycelium at room temperature ranging from 4 to 28°C. These species are not uniformly distributed throughout Latin America, some are more prominent in some regions than in others. The Hospital of Medical School of Botucatu - UNESP, which is a paracoccidioidomycosis study pole, is in São Paulo state midwest region, that is classified as an endemic area. Due to the existence of cryptic species of Paracoccidioides, further analyses of patient samples are needed for a better understanding the distribution and occurrence of these recently described species in Botucatu region, that could favor a possible correlation between genetic groups and mycological and clinical characteristics. Given the importance of this disease to the region, the aims of this study were to perform a retrospective epidemiological, geographical and clinical study gathe... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-04-13T13:09:37Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Amanda Gabriela Monteiro.pdf: 790791 bytes, checksum: 3eff4891262b8390bd95b7e68ff4d165 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-13T13:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Amanda Gabriela Monteiro.pdf: 790791 bytes, checksum: 3eff4891262b8390bd95b7e68ff4d165 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-01-09 / A família Drosophilidae abriga mais de 4.200 espécies de pequenas moscas, sendo considerada uma das maiores da ordem Diptera, com destaque para o grupo willistoni do gênero Drosophila, composto por 23 espécies. Nos estudos ecológicos realizados recentemente pelo grupo de pesquisa do Laboratório de Genética da UFPE/CAV, destacamse as espécies crípticas Drosophila willistoni, D. paulistorum e D. equinoxialis e a espécie não críptica Drosophila nebulosa. Merece destaque o fato de D. paulistorum ser constituída de seis semiespécies (Andino-Brasileira, Amazônica, Centro-Americana, Interior, Orinocana e Transicional) o que ilustra os diversos níveis de especiação que existem dentro do grupo, e sua importância para estudos evolutivos. Foi objetivo deste trabalho investigar a variabilidade genética dos genes PlexinB e Ankyrin, presentes no elemento cromossômico F de Müller. Este cromossomo recombinante é resultante da fusão entre o cromossomo dot ancestral da família Drosophilidae (Elemento F) e cromossomo III (Elemento E), evento que ocorreu em todas as espécies do grupo willistoni. De posse dos dados de sequenciamento foram estabelecidas as relações filogenéticas entre as espécies e também entre as semiespécies de D. paulistorum. Fizeram parte dos estudos 28 amostras, coletadas recentemente nos biomas Floresta Amazônicas (Pará e Rondônia), Floresta Atlântica (Pernambuco) e Caatinga (Pernambuco, Ceará e Bahia), ou linhagens de stock centers. O gene PlexinB se destacou como o mais conservado dentro das espécies, enquanto Ankyrin foi bastante variável. Foi detectada uma deleção de 9 pares de bases em todas amostras de D. willistoni e outra de 3 pb em todas D. equinoxialis. Tanto PlexinB quanto Ankyrin permitiram a construção de um bem fundamentado fenograma, com maior similaridade genética entre as amostras de D. paulistorum e D. equinoxialis, depois com D. willistoni ou D. tropicalis, e então com D. nebulosa. A maior diversidade foi observada dentro da superespécie D. paulistorum. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo e entendimento da dinâmica da especiação, dentro do grupo willistoni de Drosophila.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-31T15:06:37Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:09:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Candidemia is a bloodstream infection caused by Candida. Its incidence varies between 1.27 and 3.9 cases per 1000 admissions in Brazil and from 0.29 to 1.95 cases per 1,000 admissions in the world. C. albicans is the main agent with an incidence ranging from 25.9 % to 59 %. This study aimed to determine the incidence of candidemia in 11 Hospital Units Manaus (public and private) and to determine the genetic diversity among isolates of Candida albicans and identify the existence of cryptic species Candida parapsilosis complex. The C. albicans isolates were subjected to molecular typing technique for multilocus sequencing (MLST) and identified as C. parapsilosis, were subjected to PCR/RFLP. Altogether 101 isolates were studied of the genus Candida. The overall incidence was found to be 2.31 cases per 1,000 admissions and 0.61 cases per 1000 patients/day. The genus Candida was the second cause of bloodstream infections in the studied hospitals, representing 8.6 % of all cases. The most prevalent species was Candida albicans representing 35.64 % of the cases followed by Candida tropicalis with 30.69 %. The male (68,24 %) was most affected by these infections than females (31,76 %). The overall mortality rate was 37.21 % and the species with the highest mortality rates Candida tropicalis was 53.85%. 58 different alleles were identified by the technique of MLST and one allele for the gene SYA1 has been set as a new allele. Their combinations represented 25 different genotypes, of which 15 were identified as new genotypes and sent to the curator for analysis. Of the 22 isolates originally described as C. parapsilosis, three were reidentified as C. orthopsilosis and C. metapsilosis. Of the 25 genotypes found for C. albicans was the main STD 90 and this data differ from the data found in Brazil and in the world , pointing DST 69 as the most common . Were identified for the first time in our region , blood stream infections by C. parapsilosis cryptic species complex with three cases of C. orthopsilosis and one case of C. metapsilosis. / Candidemia é a infecção de corrente sanguínea causada por leveduras do gênero Candida. Sua incidência varia entre 1,27 e 3,9 casos por 1000 internações no Brasil e 0,29 a 1,95 casos por 1000 internações no mundo. C. albicans é o principal agente etiológico com uma incidência que varia entre 25,9% a 59%. Este trabalho teve como objetivo verificar a incidência de candidemia em 11 Unidades Hospitalares de Manaus (públicas e privadas), bem como determinar a diversidade genética entre os isolados de Candida albicans e identificar a existência de espécies crípticas do complexo Candida parapsilosis. Os isolados de Candida albicans foram submetidos à técnica de tipagem molecular por sequenciamento de multilocus (MLST) e os identificados como C. parapsilosis, foram submetidos à PCR/RFLP. Ao todo foram estudados 101 isolados do gênero Candida. A incidência geral encontrada foi de 2,31 casos por 1000 internações e 0,61 casos por 1000 pacientes/dia. O gênero Candida foi o segundo causador das infecções de corrente sanguínea nas unidades hospitalares estudadas, representando 8,6% de todos os casos. A espécie mais prevalente foi Candida albicans representando 35,64% dos casos seguida por Candida tropicalis com 30,69%. O gênero masculino (68,24%) foi mais acometido por essas infecções do que o gênero feminino (31,76%). A taxa de mortalidade geral foi de 37,21% e a espécie que apresentou maiores taxas de mortalidade foi Candida tropicalis com 53,85%. Foram identificados 59 alelos diferentes pela técnica de MLST sendo que um alelo para o gene SYA1 foi configurado como novo alelo. Suas combinações representaram 25 genótipos diferentes, sendo que 15 foram identificados como novos genótipos. Dos 22 isolados inicialmente descritos como C. parapsilosis, três foram reidentificados como C. orthopsilosis e uma como C. metapsilosis. Dos 25 genótipos encontrados para C. albicans o principal foi o DST 90 e esse dado diverge dos dados encontrados no Brasil e no mundo, que apontam o DST 69 como o mais comum. Foram identificadas pela primeira vez em nossa região, infecções de corrente sanguíneas por espécies crípticas do complexo C. parapsilosis, com três casos de C. orthopsilosis e um caso de C. metapsilosis.

O gênero Coleodactylus está distribuído pelo norte da América do Sul e reúne cinco espécies de lagartos de tamanho reduzido que habitam o folhiço da mata. A maioria dos estudos acerca do gênero não trata das variações morfológicas entre as espécies, tendo sido o trabalho de Vanzolini (1967) a última revisão feita para o grupo. Suas espécies são reconhecidamente crípticas, e com exceção das diferenças mais evidentes que separam C. amazonicus das demais do gênero, os caracteres diagnósticos estão principalmente relacionados à folidose da cabeça. Recentemente foi publicado um estudo baseado em dados moleculares que propõe hipótese de relacionamento entre as espécies e indica que a diversidade do grupo está subestimada (Geurgas e col., 2008). Guiado pela análise molecular, foi realizada aqui o estudo taxonômico do gênero, considerando dados de morfologia externa. A avaliação de 3904 exemplares, amostrados em quase toda a distribuição geográfica do gênero, indicou forte similaridade morfológica entre os clados de Coleodactylus e que estes apresentam morfologia externa conservada, apesar da acentuada diferenciação genética. O resultado do estudo, de maneira geral, é corroborado pela análise de Geurgas e col (2008), sendo as espécies diagnosticadas morfologicamente congruentes com os agrupamentos monofiléticos encontrados no estudo molecular. As variações morfológicas encontradas aqui permitiram o reconhecimento de quatro novas espécies, duas hoje alocadas em C. septentrionalis e duas em C. meridionalis, elevando para nove o número de espécies do gênero. Devido à homogeneidade de morfologia externa e tamanho reduzido dos animais, sugere-se fortemente que estudos de outra natureza (osteológica, ecológica, etc.) e de microestruturas sejam realizados a fim de se conhecer a diversidade real do gênero. / Coleodactylus genus is widespread among the north of South America and assembles five species of dimunitive lizards that live in forests leaf-leather. The majority of studies regarding this genus do not consider morphological variations between species. Vanzolini (1967) made the last revision about this group. Species from this genus are known for being cryptical. Except for more evident differences that separate C. amazonicus from other species of this genus, diagnostic characters are mainly related to the number of scales in the head. Recently, a work based on molecular data was published. It hypothesized the relationship between species and indicated that diversity in this group is underestimated (Geurgas et al., 2008). Herein we performed the taxonomic revision of the genus, guided by molecular analysis, considering external morphological data. The evaluation of 3904 specimens, which were sampled in almost the entire geographical distribution of the genus, indicated strong morphological similarity among Coleodactylus clades, showing also conserved external morphology, despite the accentuated genetic differentiation. Results from this work, in general terms, corroborated the analysis of Geurgas et. al (2008). Diagnosed species were morphologically congruous with monophyletic groups found in this molecular work. Morphological variations found here will allow the recognition of four new species, two of them allocated in C. septentrionalis and another two in C. meridionalis, increasing to nine the number of species in the genus. Due to their external morphology homogeneity and diminutive size, we strongly suggest that studies of different nature (osteological, ecological, etc) should be made in order to unravel the real diversity of the genus.

Orientador: Rogério Caetanos da Costa / Coorientador: Mariana Terossi Rodrigues Mariano / Resumo: Espécies crípticas constituem um desafio ao conhecimento da biodiversidade e tem sido tema de um número cada vez maior de estudos nos últimos anos. O gênero Xiphopenaeus por 90 anos teve reconhecidamente duas espécies, Xiphopenaeus kroyeri no Atlântico e Xiphopenaeus riveti, no Pacífico. Contudo, nos últimos 20 anos, a taxonomia do gênero tem passado por grandes reviravoltas, com a sinonimização das duas espécies em 1997 com base em dados morfológicos, tornando o gênero monotípico, com X. kroyeri como a única espécie válida. E nos últimos dez anos além da revalidação de X. riveti baseada em dados moleculares, a existência de na verdade, duas espécies crípticas no Atlântico, veio a tona. Assim, o presente estudo averiguou utilizando ferramentas moleculares (os genes mitocondriais Citocromo c Oxidase Subunidade I e 16S rDNA) e morfológicas, o possível número de espécies constituintes do gênero Xiphopenaeus, e quais caracteres morfológicos podem ser utilizados na identificação destas. Foram analisados indivíduos provenientes de 16 localidades nos oceanos Atlântico e Pacífico. Foi detectada a divisão dos indivíduos analisados em cinco grupos, três no Atlântico, aqui denominadas a principio de A1, A2 e A3 e dois no Pacífico, P1 e P2, os quais pelas divergências genéticas observadas em ambos os marcadores empregados, mostraram-se constituir cinco diferentes espécies. Tal divisão foi suportada pelas demais análises empregadas (análises filogenéticas, Amova, rede de haplótipos). As f... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cryptic species comprise a challenge to the knowledge of biodiversity, and they have been increasingly studied in past recent years. For 90 years, the genus Xiphopenaeus had recognized two species: Xiphopenaeus kroyeri, in the Atlantic, and Xiphopenaeus riveti, in the Pacific. In the last 20 years, however, the taxonomy of the genus has been changed; the synonymization of the species in 1997, based on morphological characters, turned the genus monotypic, with X. kroyeri as the only valid species. In the last decade, besides the revalidation of X. riveti based on molecular data, the existence of two cryptic species in the Atlantic came to light. Thus, the present study aimed to verify, using molecular (the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase Subunit I and 16S rDNA) and morphological tools, how many species comprise the genus Xiphopenaeus, and which morphological characters can be used for their reliable identification. Individuals from 16 localities in Atlantic and Pacific oceans were analyzed. A structuration of the analyzed individuals into five groups was observed, three from the Atlantic (A1, A2 and A3) and two from the Pacific (P1 and P2). The genetic divergence observed indicates the existence of five different species. Such structuration was also supported by the phylogenetic analyzes, AMOVA and haplotype network. The images obtained by scanning electronic microscopy of secondary sexual characters of males showed morphological differences reliable enough to discrimin... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

The subfamily Phryninae (Arachnida: Amblypygi) has not been recently revised, which causes many difficulties for species identification. Thus far, no phylogenetic hypothesis has been proposed for this subfamily. The nomenclature of diagnostic characters is not uniform, and most illustrations are poorly detailed. We reviewed the subfamily Phryninae, redescribed all known species, and described six new species. We proposed a unified nomenclature for teeth of chelicerae and pedipalpal spines. We performed a phylogenetic analysis using total evidence and direct optimization in the program POY. We built a morphological matrix of 92 terminals and 174 characters, and a molecular matrix with 1557 pb (markers COl, 12s and 16s). Both sets of information were analyzed separately to understand their influence over the total evidence analysis. The results of the three analyses were different: the morphological analysis did not recover the subfamily Phryninae as monophyletic, this analysis produced 90 equally parsimonious topologies, however, the strict concensus tree had good resolution. The molecular analysis did not recover the family Phrynidae as monophyletic, but Phryninae was recovered. Total evidence analysis allowed for obtain just one more parsimonious hypothesis which included all species of Phrynidae, and resolved the politomies obtained with the analysis using morphology only, in this hypothesis Phrynidae and its subfamilies are monophyletic. ln all results, the genera of Phryninae were polyphyletic. We selected the tree of total evidence analysis to build a new taxonomic proposal, we decided to keep Acanthophrynus, Phrynus, and Paraphrynus and to create five new genera: Caicedophrynus gen. nov., Cronopiophrynus gen. nov., Gabophrynus gen. nov., Gentiloprynus gen. nov., Girondophrynus gen. novo Accordingly, we proposed 44 nomenclatural changes. Our results showed that the diversity of this group could be greater, therefore, we highlight that populational and phylogeographic studies of Phryninae are important / A subfamília Phryninae (Arachnida: Amblypygi) não possui uma revisão recente. Isso traz muitas dificuldades na identificação das espécies. Nenhuma hipótese filogenética para a subfamília foi proposta. A nomenclatura dos caracteres diagnósticos não é uniforme e a maioria das ilustrações não é suficientemente detalhada. Aqui, nós revisamos a subfamília Phryninae, redescrevemos as espécies conhecidas e seis espécies novas, e propomos uma nomenclatura uniforme para os dentes das quelíceras e espinhos dos pedipalpos. Nós realizamos uma análise filogenética usando evidência total e otimização direta no programa POY. Construímos uma matriz morfológica de 92 terminais e 174 caracteres, e uma matriz molecular usando 1557 pb (marcadores COI, l2S e 16S). Os dois conjuntos de informação foram analisados separadamente para perceber a influência de cada um deles na análise de evidência total. Os resultados das três análises foram diferentes. A análise morfológica não recuperou a subfamília Phryninae como monofilética, resultando em 90 topologias igualmente parcimoniosas, Porém, a árvore de consenso estrito teve uma boa resolução. A análise molecular recuperou Phryninae como monofilética, embora não tenha recuperado a família Phrynidae. A análise de evidência total permitiu obter uma única hipótese mais parcimoniosa a qual inclui todas as espécies de Phrynidae, e permitiu resolver as politomias obtidas na análise morfológica. Nesta hipótese, tanto Phrynidae como suas subfamílias se mantiveram monofiléticas. Em todos os resultados, os gêneros de Phryninae são polifiléticos. A árvore da análise de evidência total foi selecionada para elaborar uma nova proposta taxonômica. Mantivemos os gêneros Acanthophrynus, Phrynus e Paraphrynus e criamos cinco gêneros novos: Caicedophrynus gen. nov., Cronopiophrynus gen. nov., Gabophrynus gen. nov., Gentilophrynus gen. nov., e Girondophrynus gen. novo Propusemos 44 mudanças nomenclaturais, Nossos resultados sugerem que a diversidade do grupo é maior do que a conhecida. Isso nos faz considerar importante análises populacionais e filogeográficas em Phryninae

A família Tephritidae congrega várias espécies de moscas-das-frutas que utilizam frutos como substrato alimentar no estágio larval, adquirindo o status de inseto-praga quando esses frutos são de valor comercial. O gênero Anastrepha é endêmico do Continente Americano e compreende cerca de 212 espécies descritas, das quais 109 ocorrem no Brasil. A espécie nominal Anastrepha fraterculus representa um complexo de espécies crípticas e se encontra distribuída pela Região Neotropical e sul dos Estados Unidos. No Brasil, através do estudo de diversas características biológicas e do marcador molecular ITS-1 (espaçador ribossômico nuclear), identificou-se a existência de três espécies crípticas no complexo fraterculus, a Anastrepha sp.1 affinis fraterculus, A. sp.2 aff. fraterculus e A. sp.3 aff. fraterculus. Marcadores gênicos presentes no DNA mitocondrial, como o gene cytochrome oxidase I (COI), são ferramentas amplamente utilizadas em análises filogenéticas, pois esta molécula apresenta características distintas do DNA nuclear, como o fato de possuir herança predominantemente materna, apresentar ausência ou baixíssima taxa de recombinação na maioria dos táxons, além de altas taxas mutacionais. Estas características possibilitam a obtenção de dados importantes na interpretação das relações entre as espécies. Amostras do complexo fraterculus (A. sp.1, A. sp.2, A. sp.3) de 14 localidades (média de 5 indivíduos / localidade) no sudeste do Brasil, uma amostra de A sp.4 do Equador e dois grupos externos (A. grandis e A. striata) foram utilizados. Fragmentos de 1139bp do gene COI foram amplificados e sequenciados, 45 haplótipos foram identificados: 30 em A. sp.1, 5 em A. sp.2 e 17 em A. sp.3. A distância média entre as espécies foi de 0,021 e o Fst médio foi 0,347 indicando estruturação populacional muito alta e pequena distância entre os haplótipos, que não apresentaram diferenças fixadas entre as espécies. Os testes de desvio de neutralidade apresentaram valores significativamente negativos. Os testes de seleção evidenciaram a atuação de seleção purificadora com baixos valores de Ka/Ks e significância no Z-teste de seleção. A análise filogenética mostrou fortes evidências de introgressão e não separou as diferentes entidades em clados distintos. Houve a formação de dois ramos principais, um constituído quase que exclusivamente por amostras de A. sp.1, e apenas duas amostras de A. sp.3, e outro que reuniu todas as espécies do complexo. Os dois principais grupos de haplótipos também foram visualizados na rede de haplótipos que mostrou indícios de expansão populacional. Quando somado ao estudo sequências depositadas em bancos de dados por outros autores, a espécie nominal A. fraterculus apresentou em sua distribuição 5 grupos de haplótipos mitocondriais. Dois deles ocorrem no Brasil, um com amostras do México e Costa Rica, um na Guatemala e Venezuela (baixa latitude) e um com indivíduos da Colômbia e Venezuela (alta latitude), sendo que os grupos Brasileiros também reuniram amostras da Argentina e do Equador. Assim, as sequências de COI não permitem a caracterização das entidades do complexo fraterculus apesar de indicar a estruturação populacional e a hipótese mais provável é a de que tenha havido introgressão da molécula mitocondrial entre as espécies do complexo com posterior expansão / The Tephritidae family comprises fruit flies species whose larvae feed and develop in fruits, many of which are commercial varieties and thus the species assume economic significance. Anastrepha genus is distributed throughout the Neotropical region and Southern United States. Analyses of biological characteristics and of the internal transcribed spacer (ITS-1) of the nuclear ribosomal DNA allowed the characterization of three cryptic species of the fraterculus complex in Brazil: Anastrepha sp.1 affinis fraterculus, Anastrepha sp.2 aff. fraterculus and Anastrepha sp.3 aff. fraterculus. Mitochondrial markers as gene cytochrome oxidase I (COI) are largely used in phylogenetic analyses because they have maternal inheritance, none or low recombination and high mutation rates compared to the nuclear DNA. Hence, analyses of the complex based in this marker will offer a divergent perspective from nuclear DNA for inferences on the evolutive relationships between different species. Samples from the fraterculus complex (A. sp.1, A. sp.2, A. sp.3) from 15 localities (average of 5 individuals/ locality) in southeastern Brazil, one sample of A. sp.4 from Ecuador and two outgroups (A. grandis and A. striata) were employed and COI sequences of 1139bp were amplified and analyzed. We identified 45 haplotypes: 30 in A. sp.1, 5 in A.sp.2 and 17 in A. sp.3. The mean distance between the haplotypes was 0.021 and mean Fst 0.347, indicating high population structure and low mitochondrial distance. The neutrality tests had significantly neutral values. The selection tests revealed the action of purifying selection with low values of Ka/Ks and significance in the Z-test selection. Phylogenetic analysis showed strong evidences of introgression and did not separate the various entities in distinct clades grouping the three species in a single branch; there was also the formation of another main branch formed almost exclusively by strains of A. sp.1 and only two samples of A. sp.3. The two main groups of haplotypes were also seen in the haplotype network that showed evidence of population expansion. The analysis of the philogenetic tree based on mitochondrial COI showed strong evidence for introgression. No fixed differences between species were found though mtDNA marker shows a lot of polymorphism. When added sequences deposited in databases by other authors the nominal species A. fraterculus presented in its distribution five groups of mitochondrial haplotypes, two of them in Brazil, one with samples from Mexico and Costa Rica, one in Guatemala and Venezuela and one with individuals from Colombia. The Brazilian groups also collected samples from Argentina and Ecuador. Therefore, the COI sequences do not allow the characterization of the entities of the fraterculus complex, although structure among the species is shown. The most likely hypothesis is that introgression has happened in the mitochondrial molecule among the species with further expansion

A taxonomia de foraminíferos planctônicos é fonte de discussões desde o início de sua utilização na paleoceanografia, havendo discordância tanto na sua classificação como identificação. Estudos genéticos em foraminíferos planctônicos identificaram a presença de mais de uma espécie dentro das espécies aceitas atualmente. Estas espécies possuem diferenças ecológicas entre si, tendo implicações para interpretações paleoceanográficas. A morfometria e isótopos de carbono e oxigênio foram escolhidos como uma alternativa mais acurada e reproduzível para identificação de variações morfológicas e para explorar a ecologia dos indivíduos estudados, respectivamente. Foram utilizadas amostras de sedimento da margem continental brasileira para explorar o potencial da morfometria como ferramenta paleoceanográfica. Foi possível observar a dominância do genótipo pink de Globigerinoides ruber na margem continental brasileira. Para Globigerinoides sacculifer, foi possível identificar comportamentos de migração vertical distintos entre os morfotipos identificados. Em Globorotalia menardii observa-se que as relações morfométricas-ambientais para o grupo todo se mantém quando a análise é feita separadamente em cada morfotipo, confirmando o potencial da correlação direta da morfometria com variáveis ambientais. Já em Globigerinella siphonifera, a diferença morfológica é atribuída a presença de diferentes espécies e não a influências do ambiente sobre a morfologia. / Although taxonomy in planktonic foraminifera has been subject of debates since the beginning of its use in paleoceanography, disagreement in their classification and identification remains. Genetic investigations have identified the presence of more than one species for some of the species accepted nowadays. Hence, these species display ecological differences among them, resulting in implications for paleoceanographic interpretations. Morphometry and carbon and oxygen stable isotopes were chosen as a more precise and reproducible alternative to identify morphological variations and to explore the ecology of the specimens, respectively. Sediment samples from the Brazilian Continental Margin were used to explore morphometry\'s potential as a paleoceanography tool. It was possible to observe the dominance of the pink genotype in Globigerinoides ruber at Brazilian continental margin. For Globigerinoides sacculifer, it was possible to identify distinct vertical migration behaviour in each identified morphotype. In Globorotalia menardii it is possible to observe that the morphometric-enviromental relations for the whole group is maintained when each morphotype is analysed separately, confirming the potential of direct correlations between morphometry and environmental variables. Meanwhile, in Globigerinella siphonifera the morphological difference is attributed to the presence of two different species and not to the influence of the environment on the morphology.