Made available in DSpace on 2014-12-17T15:18:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 InailsonMCC.pdf: 709825 bytes, checksum: 7064e0fcd96dff67a498094dbfde1451 (MD5) Previous issue date: 2008-05-20 / The fauna of Brazilian reef fishes comprises approximately 320 species distributed along the coast of the mainland and islands ocean. Little is known about the levels of connectivity between their populations, but has been given the interest in the relations between the offshore and the islands of the Brazil, in a biogeographical perspective. The oceanic islands Brazilian hosting a considerable number of endemic species, which are locally abundant, and divide a substantial portion of its reef fish fauna with the Western Atlantic. Among the richest families of reef fish in species are Pomacentridae. This study analyzed through analysis of sequences of the mitochondrial DNA control region (D-loop), the standards-breeding population of C. Multilineata in different areas of the NE coast of Brazil, involving both oceanic islands (Fernando de Noronha Archipelago and of St. Peter and St. Paul) and continental shelf (RN and BA). To this aim, partial sequences were used in the region HVR1 of mtDNA (312pb). The population structure and parameters for the estimates of genetic variability, molecular variance (AMOVA), estimation of the index for fixing (FST) and number of migrants were determined. The phylogenetic relationships between the populations were estimated using neighbor-joining (NJ) method. A group of Bayesian analysis was used to verify population structure, according to haplotype frequency of each individual. The genetic variability of populations was extremely high. The populations sampled show moderate genetic structure, with a higher degree of genetic divergence being observed for the sample of the Archipelago of St. Peter and St. Paul. At smaller geographical scale, the sample of Rio Grande do Norte and the Archipelago of Fernando de Noronha do not have genetic differentiation. Three moderately differentiated population groups were identified: a population group (I), formed by the Rio Grande do Norte (I') and the archipelago of Fernando de Noronha (I''), and two other different groups formed by the island population of the archipelago of Saint Peter and St. Paul (II) and Bahia (III). The genetic patterns found suggest that the species has suffered a relatively recent radiation favoring the absence of shared haplotypes. C. multilineata seems to constitute a relatively homogenous population along the West Atlantic coast, with evidence of a moderate population genetic structure in relation to the Archipelago of St. Peter and St. Paul. These data supports the importance of the dispersal larvae by marine current and the interpopulation similarity this species. / A fauna de peixes recifais brasileiros compreende aproximadamente 320 esp?cies distribu?das ao longo da costa continental e das ilhas oce?nicas. Pouco se conhece sobre os n?veis de conectividade entre suas popula??es, embora tenha sido constante o interesse nas rela??es entre o continente e as ilhas oce?nicas brasileiras, numa perspectiva biogeogr?fica. As ilhas oce?nicas brasileiras abrigam um consider?vel n?mero de esp?cies end?micas, as quais s?o localmente abundantes, e repartem uma consider?vel por??o de sua fauna de peixes recifais com o Atl?ntico Ocidental. Entre as fam?lias de peixes recifais mais ricas em esp?cies est?o os pomacentr?deos. O presente trabalho analisou, atrav?s de an?lises de seq??ncias da regi?o controle do DNA mitocondrial (D-loop), os padr?es gen?tico-populacionais de C. multilineata em diferentes ?reas do litoral NE do Brasil, envolvendo tanto ilhas oce?nicas (Fernando de Noronha e Arquip?lago de S?o Pedro e S?o Paulo) como plataforma continental (RN e BA). Para isso, foram utilizadas seq??ncias nucleot?dicas parciais da regi?o HVR1 do MtDNA (312pb). A estrutura populacional e os par?metros para as estimativas da variabilidade gen?tica, vari?ncia molecular (AMOVA), estimativa do ?ndice de fixa??o (FST) e n?mero de migrantes foram determinados. As rela??es filogen?ticas entre as popula??es foram estimadas utilizando-se o m?todo de neighbour-joining (NJ). A an?lise de agrupamento Bayesiano foi utilizada para a verifica??o de estrutura??o populacional, segundo a freq??ncia haplot?pica de cada indiv?duo. A variabilidade gen?tica das popula??es de C. multilineata se mostrou extremamente elevada. As popula??es amostradas revelam moderada estrutura??o gen?tica, com maior grau de diverg?ncia gen?tica sendo observado para a amostra do Arquip?lago de S?o Pedro e S?o Paulo. Em menor escala geogr?fica, a amostra do Rio Grande do Norte e do Arquip?lago de Fernando de Noronha n?o apresentam diferencia??o gen?tica. Tr?s grupos populacionais moderadamente diferenciados foram identificados: um grupo populacional (I), formado pelo Rio Grande do Norte (I ) e o Arquip?lago de Fernando de Noronha (I ); e outros dois grupos distintos formados pela popula??o insular do Arquip?lago de S?o Pedro e S?o Paulo (II) e pela Bahia (III). Os padr?es gen?ticos encontrados sugerem que a esp?cie sofreu uma radia??o relativamente recente favorecendo a aus?ncia de hapl?tipos compartilhados. C. multilineata parece constituir uma popula??o relativamente homog?nea ao longo costa do Atl?ntico Ocidental com ind?cios de uma moderada estrutura??o gen?tico-populacional em rela??o ao Arquip?lago de S?o Pedro e S?o Paulo. Estes dados subsidiam a import?ncia das correntes marinhas na dispers?o de larvas e na similaridade interpopulacional desta esp?cie.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-05-08T23:59:12Z No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-05-09T00:09:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T00:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) Previous issue date: 2014-12-15 / A esp?cie Hancornia speciosa Gomes ? nativa do Brasil com ampla distribui??o no territ?rio nacional. Seu fruto ? bastante apreciado pelas popula??es locais, sendo utilizado para fabrica??o de doces, sorvetes e polpas. O crescimento urbano e a expans?o agr?cola favoreceram ? fragmenta??o das ?reas florestais onde a esp?cie ocorre, com a consequente redu??o do tamanho populacional, podendo ocasionar s?rias implica??es para a manuten??o da esp?cie a longo prazo. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade gen?tica remanescente em sete popula??es de H. speciosa do estado do Rio Grande do Norte, ap?s selecionar marcadores de DNA entre repeti??es de sequ?ncias simples do genoma (ISSR). Na avalia??o da qualidade do DNA, o material gen?tico obtido a partir do caule apresentou pureza semelhante ao extra?do da folha, obtendo valores para a raz?o entre as absorv?ncias (A260/A280) de 1,46 para o caule e de 1,42 para a folha, ficando, ambos, um pouco abaixo do valor considerado ?timo que ? entre 1,5 e 2,5. O tecido caulinar apresentou DNA de qualidade para an?lises moleculares da esp?cie. Foram testados 19 primers ISSR onde seis foram selecionados (UBC 808, UBC 810, UBC 826, UBC 827, UBC 841, UBC 842) por apresentarem locos n?tidos, inequ?vocos e em maior n?mero, totalizando 63 locos, sendo que 30 (47,62%) apresentaram polimorfismo. O valor de PIC (conte?do de informa??es polim?rficas) para os primers selecionados atingiu a m?dia de 0,37, variando de 0,26 a 0,44, indicando que s?o ?teis para avaliar a diversidade gen?tica da esp?cie. Para o total das popula??es, o n?mero de locos polim?rficos foi de 57 (81,43%), com o n?mero total de alelos efetivos (Ne) 1,493. A diversidade gen?tica de Nei (He) foi de 0,287 e o ?ndice de Shannon (I) o valor de 0,429. Entre as popula??es o n?mero de locos polim?rficos foi considerado baixo, variando de 29 (41,43%) na popula??o Cotovelo, ? 33 (47,14%) em Maca?ba. Os ?ndices de diversidade He e I para cada popula??o variou respectivamente de 0,161 e 0,237 na popula??o Parque das Dunas ? 0,206 e 0,294 na popula??o Maca?ba. De acordo com a an?lise bayesiana os gen?tipos foram divididos em cinco grupos distintos (K = 5). Os padr?es observados para diversidade al?lica indicam a ocorr?ncia de gargalo gen?tico em todas as popula??es, de acordo com o modelo de passos de muta??o. O modelo de alelos infinitos revelou desequil?brio entre muta??o e deriva gen?tica apenas na popula??o Parque das Dunas. Os ?ndices de fluxo g?nico (Nm) revelaram troca de alelos entre todas as popula??es. Os resultados obtidos sugerem que a diversidade gen?tica est? distribu?da em diversas popula??es, sendo essencial a conserva??o das ?reas de sua ocorr?ncia para a manuten??o da diversidade gen?tica da esp?cie. / The Hancornia speciosa Gomes is a native of Brazil with wide distribution in the country. Its fruit is well appreciated by local people and is used for the manufacture of sweets, ice creams and pulps. Urban growth and agricultural expansion led to fragmentation forest areas where the species occurs, with a consequent reduction in population size, which can cause serious implications for the maintenance of long-term species. The objective of this study was to evaluate the remaining genetic diversity in seven populations of H. speciosa at Rio Grande do Norte state. In DNA's quality evaluation, the genetic material obtained from stems showed similar purity to the extracted sheet, obtaining values for the ratio between the absorbance (A260/A280) of 1.46 for the stem and 1.42 for the sheet, both were slightly below the value considered optimal which is between 1.5 and 2.5. The stem tissue showed DNA quality for molecular analyzes of the species. For the selection, 19 ISSR primers were tested, six of them were selected (UBC 808, UBC 810, UBC 826, UBC 827, UBC 841, UBC 842), for presenting clear locus, unambiguous and in great numbers, totaling 63 locus, and 30 (47.62%) showed polymorphism. The PIC value (polymorphic content information) for the selected primers averaged 0.37, ranging from 0.26 to 0.44, indicating that they are useful to evaluate the genetic diversity of the species. For the total population, the number of polymorphic locus was 57 (81.43%), with the total number of effective alleles (Ne) 1.493. The genetic diversity of Nei (He) was 0.287 and the Shannon index (I) was 0.429. Among populations the number of polymorphic locus was considered low, ranging from 29 (41.43%) in Cotovelo's population, to 33 (47.14%) in Maca?ba. The diversity indices He and I for each population ranged respectively 0.161 and 0.237 in Parque das Dunas's population to 0.206 and 0.294 in Maca?ba's population. According to the Bayesian analysis, the genotypes were divided into five groups (K = 5). The patterns observed in allelic diversity indicate the occurrence of bottleneck in all populations, according to the model of mutation steps. The infinite alleles model revealed imbalance between mutation and genetic drift only in the Parque das Dunas's population. The gene flow rates (Nm) revealed an exchange of alleles between all populations. The results suggest that genetic diversity is distributed among different populations, it is essential to conservation of areas of its occurrence to maintain the genetic diversity of the species.

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:56:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2005- Juliana Muller Freire.pdf: 826620 bytes, checksum: f7f3878211e26134428516a4db9f4737 (MD5) Previous issue date: 2005-03-15 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The aim of this work was to estimate the level and distribution of genetic variation within and among five Schizolobium parahyba (guapuruvu) populations and to evaluate the morphometric traits and dormancy of seeds of two populations of these species. The collect was carried out at coastal and mountain regions in the south of Rio de Janeiro. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers were used in order to estimate the similarity of the genotypes and to indicate the genetic distance among individuals and populations. The following morphometric traits of seeds was assessed: width, lenght, thickness and weight. Variation in dormancy level was tested in seeds of two populations comparing the performance of scratching and not scratching seeds. Germination porcentage, germination and emergency speed index, normal seedling porcentage and death porcentage was assessed and compared among individual plant and populations by using ANOVA test. The polymorphic loco was 97%, as expected for a wide distributed specie. Of the total genetic diversity, 89% was atributtable to differences within populations and 11% to differences among populations, indicating a low amount of populations differentiation. The estimative of gene movement among populations revealed a high value (3,18 migrant per generation). Correlations among genetic and geographic distance were not found, indicating the lack of spatial structure of the specie. All morphometric traits differed significantly among individual within each of the population. The individuals plants from the mountain region presented the highest seed size. The major morphometric variation ocurred within population. The seed lenght responded with 60.87% of the total morphometric variation, followed by width (26,58%) and thickness (11,193%). Four groups were created by cluster analysis, with no origin relationship. Dormancy level differed significantly among and within populations and the highest dormancy level was presented by the coastal population. The germination speed index and death porcentage expressed better the dormancy levels than the other variables, differing significantly in the most of individuals trees. Seeds not scratched from mountain population presented better performance than the coastal one. Morphometrical and germination traits were not correlated. There were a high death percentage, specially for the scratched seeds. The role of biotics and abiotics factors in the selection of germination behavior are discussed based in the results and field observations. / Os objetivos deste estudo foram estimar o n?vel e a distribui??o da varia??o gen?tica entre e dentro de cinco popula??es de Schizolobium parahyba (guapuruvu), analisar a diversidade morfom?trica e a dorm?ncia de sementes considerando duas popula??es desta esp?cie. As popula??es estudadas est?o localizadas na regi?o litor?nea e serrana do sul do Estado do Rio de Janeiro. A an?lise gen?tica foi realizada utilizando-se marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) que resultou na estimativa de similaridade dos gen?tipos, indicando a dist?ncia gen?tica entre indiv?duos e entre as popula??es. A an?lise morfom?trica foi realizada em sementes colhidas em duas popula??es, tendo sido avaliadas: largura, comprimento, espessura e peso das sementes. No estudo de germina??o foi avaliado o n?vel de dorm?ncia das sementes, comparando matrizes de duas popula??es. Foram calculados a porcentagem de germina??o, ?ndice de Velocidade de Germina??o (IVG), n?mero de pl?ntulas normais e anormais, ?ndice de Velocidade de Emerg?ncia (IVE) e mortalidade. A diferen?a entre tratamentos e locais foi feita atrav?s da ANOVA. A propor??o de locos polim?rficos foi de 97%, valor considerado compat?vel para uma esp?cie de ampla distribui??o geogr?fica. Da varia??o gen?tica total observada, 89% ocorreu dentro das popula??es e 11% entre as popula??es, indicando um baixo n?vel de diferencia??o entre as popula??es. A estimativa de fluxo g?nico entre popula??es (NM) foi alto, alcan?ando 3,18 migrantes por gera??o. N?o foi encontrada correla??o entre dist?ncia gen?tica e geogr?fica (r=0,036), evidenciando a falta de estrutura??o espacial da esp?cie. A diversidade morfom?trica indicou diferen?a significativa entre matrizes de uma mesma regi?o para todas as vari?veis morfom?tricas analisadas. As matrizes de Miguel Pereira apresentaram maior tamanho de semente do que as de Paraty, sendo esta diferen?a significativa para todas as vari?veis, exceto comprimento. A maior varia??o no tamanho da semente ocorreu a n?vel intra-populacional, sendo significativo para todas as vari?veis. O comprimento respondeu com 60.87% da varia??o total do tamanho da semente, seguido da largura (26,58%) e da espessura (11.193%). A an?lise de agrupamento permitiu a forma??o de quatro grupos, n?o sendo poss?vel associ?-los ? regi?o de origem. A dist?ncia morfom?trica e gen?tica aparentemente n?o apresentaram correla??o. O n?vel de dorm?ncia das sementes variou entre e dentro de popula??es. Paraty apresentou maior diferen?a entre os tratamentos (sementes escarificadas e n?o escarificadas), evidenciando seu maior grau de dorm?ncia. Os par?metros que melhor expressaram a dorm?ncia foram o ?ndice de Velocidade de Germina??o e a taxa de mortalidade. As sementes n?o escarificadas de Miguel Pereira se mostraram superiores as de Paraty em praticamente todos os par?metros germinativos. N?o houve correla??o entre as vari?veis morfom?tricas e germinativas. Houve alta mortalidade das sementes por fungos, principalmente em rela??o ?s sementes escarificadas. A influ?ncia dos fatores bi?ticos e abi?ticos (precipita??o) no comportamento germinativo s?o discutidos com base nos resultados obtidos e observa??es de campo.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:17:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RodrigoFS_DISSERT.pdf: 1032742 bytes, checksum: 297b239b5ca1673f55e18c42d7327117 (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Copernicia prunifera (Arecaceae), popularmente conhecida como carna?ba, ? nativa da regi?o nordeste do Brasil, com ocorr?ncia ao longo das margens de rios e ?reas alagadi?as. Por ser vers?til em rela??o ?s formas de usos, essa palmeira ficou conhecida como ?rvore da vida , sendo o p? cer?fero o principal produto extra?do da C. prunifera. Este estudo teve como objetivos investigar aspectos etnoecol?gicos e etnobot?nicos da C. prunifera em uma comunidade extrativista, selecionar primers ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) para estudos de gen?tica de popula??es, e estudar a diversidade e a estrutura gen?tica de uma popula??o natural no Estado do Rio Grande do Norte, Brasil. Foram entrevistados 11 moradores considerados informantes-chaves na regi?o de Ipangua?u/RN, onde 73% dos informantes relataram a ocorr?ncia de um morfotipo diferente de carna?ba, conhecida como carna?ba branca . Dos entrevistados, 82% afirmaram que a esp?cie possui dispers?o realizada por morcegos. Na etnobot?nica, o p? cer?fero foi citado por todos como o produto mais importante extra?do da C. prunifera e a folha a parte mais usada (45%), seguida dos frutos (29%), caule e raiz (ambas com 13%). Na sele??o de primers ISSR, dos 17 que foram testados, 12 amplificaram o DNA e, destes, sete foram selecionados para caracterizar a estrutura gen?tica de 37 indiv?duos remanescentes. O primer que obteve a maior porcentagem de locos polim?rficos (LP%) foi UBC 841 (16,36%), j? o primer que teve a menor LP% foi UBC 827 (8,18%). No estudo de diversidade e estrutura gen?tica dos indiv?duos de uma popula??o natural (regenerantes = 62, jovens = 20, adultos = 19) foram utilizados sete iniciadores ISSR que permitiram a visualiza??o de 93 locos, com 100% de polimorfismo. Os regenerantes foram os que mais se destacaram em rela??o ? diversidade gen?tica (He = 0,411 e Ho = 0,599), seguido pelos jovens (He = 0,394 e Ho = 0,579) e adultos (He = 0,267 e Ho = 0,427). A AMOVA mostrou que a maior varia??o gen?tica ocorre dentro dos est?gios de vida (93,42%) quando comparado entre eles (6,58%). O dendograma (UPGMA), com base na identidade gen?tica de Nei, mostrou maior semelhan?a genot?pica entre os jovens e regenerantes (0,979). No teste de hip?tese para o gargalo gen?tico (bottleneck) foi observado elevado n?mero de locos com excesso de heterozigosidade para os dois modelos utilizados (IAM = 92 e SMM = 91), indicando redu??o do tamanho efetivo populacional. Todos os est?gios de desenvolvimento apresentaram estrutura??o gen?tica espacial (EGE), com valores de coancestrias positivos e significativos, sendo os valores de Sp de 0,04 para os regenerantes, 0,093 para os jovens, 0,15 para os adultos e 0,53 para a popula??o geral. Essa EGE ocorre, provavelmente, devido ? dispers?o restrita de sementes