CAPES / A eucaliptocultura e sua propagação clonal têm sido empregadas no Brasil desde a década de 60, devido as características de produtividade, capacidade de adaptação e crescimento rápido, destacando-se as espécies de Eucalyptus grandis e seus híbridos, que apresentam bom rendimento para obtenção de pasta de celulose pelas indústrias do setor e, E. benthamii que possui resistência à temperaturas amenas seguidas de geadas. A análise do perfil metabólico para espécies de eucaliptos ainda não foi explorada, o que ocasiona dificuldades na identificação da expressão gênica de fenótipos de interesse comercial. Assim, o presente trabalho teve por objetivo aplicar e avaliar a metodologia normalmente utilizada para obtenção do perfil metabólico em tecido foliar em duas etapas de desenvolvimento (e.g. jovem e adulto) de E. grandis e E. benthamii em condição de campo, utilizando a técnica de cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM), a técnica demonstrou ser eficiente para obtenção de um perfil de metabólitos polares, embora tenha apresentado menor sensibilidade para compostos nitrogenados e aminoácidos. Foi observado predominância de carboidratos em tecido foliar das espécies estudas, fato que pode estar relacionado com o horário de coleta do material sob intensidade luminosa, pois açúcares não redutores como a sacarose possuem produção massiva durante o foto período sendo, então, metabolizada a outros compostos à noite. As análises de PCA (análise de componentes principais), amparadas por teste estatístico, demonstraram que existem metabólitos que contribuem mais significativamente para distinção entre as idades do tecido vegetal, sendo que os açúcares redutores são mais relevantes em tecido jovem e, açúcares não redutores, tais como a sacarose, são relevantes em tecido adulto. A presença de compostos exclusivos em tecido de E. benthamii tais como a fenilalanina, pode justificar o fato desta espécie ser mais utilizada para a obtenção de energia, já que este aminoácido está diretamente relacionado com a síntese de lignina. Ainda para a espécie de E. benthamii foram encontrados em maior abundância sacarose e derivados álcoois de açúcares que proporcionam maior resistência da planta ao frio. Não foram encontradas diferenças estatísticas entre a concentração de açúcares dentro do perfil de metabólitos estudados, que sustente a não utilização de E. benthamii para polpação de celulose. / Clonal propagation of the Eucalyptus, have been used in Brazil since the 60s, due to the characteristics of productivity, adaptability and rapid growth, especially Eucalyptus grandis and its hybrids, which have good performance to obtain paper pulp, and the E. benthamii that is resistant to mild temperatures followed by frost. The analysis of the metabolic profile for Eucalyptus species has not yet been explored, which leads to difficulties in the identification of gene expression phenotypes of commercial interest. Thus, the present study aimed to implement and evaluate the methodology typically used to obtain the metabolic profile in leaf tissue of two age stages (e.g. young and adult) of E. grandis and E. benthamii under field conditions. The metabolic profile was characterized by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS), this technique proved effective for obtaining a profile of polar metabolites, although it had less sensitive to nitrogen compounds and amino acids. The predominance of carbohydrates was observed in leaf tissue of the studied species, which may be related to the time of collection of the material under light intensity, non-reducing sugars such as sucrose have massive production during the photoperiod, and they are metabolized to other compounds during the night. The PCA, trimmed by statistical test indicated that there were significantly more metabolites that contribute to the distinction between the ages of leaf tissue, and the more reducing sugars are important in young tissue and non-reducing sugars, such as sucrose, are relevant in adult tissue. The presence of unique compounds in tissue E. benthamii such as phenylalanine, can justify the fact that this species is nominated to be used in energy, since this amino acid is directly related to lignin synthesis. Besides E. benthamii has greater abundance sucrose and sugar alcohols compounds than E. grandis, which is related to a better resistance to cold. No statistical differences were found between the concentrations of glucose and galactose which supports the non-use of E. benthamii for pulping.

CAPES / A eucaliptocultura e sua propagação clonal têm sido empregadas no Brasil desde a década de 60, devido as características de produtividade, capacidade de adaptação e crescimento rápido, destacando-se as espécies de Eucalyptus grandis e seus híbridos, que apresentam bom rendimento para obtenção de pasta de celulose pelas indústrias do setor e, E. benthamii que possui resistência à temperaturas amenas seguidas de geadas. A análise do perfil metabólico para espécies de eucaliptos ainda não foi explorada, o que ocasiona dificuldades na identificação da expressão gênica de fenótipos de interesse comercial. Assim, o presente trabalho teve por objetivo aplicar e avaliar a metodologia normalmente utilizada para obtenção do perfil metabólico em tecido foliar em duas etapas de desenvolvimento (e.g. jovem e adulto) de E. grandis e E. benthamii em condição de campo, utilizando a técnica de cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM), a técnica demonstrou ser eficiente para obtenção de um perfil de metabólitos polares, embora tenha apresentado menor sensibilidade para compostos nitrogenados e aminoácidos. Foi observado predominância de carboidratos em tecido foliar das espécies estudas, fato que pode estar relacionado com o horário de coleta do material sob intensidade luminosa, pois açúcares não redutores como a sacarose possuem produção massiva durante o foto período sendo, então, metabolizada a outros compostos à noite. As análises de PCA (análise de componentes principais), amparadas por teste estatístico, demonstraram que existem metabólitos que contribuem mais significativamente para distinção entre as idades do tecido vegetal, sendo que os açúcares redutores são mais relevantes em tecido jovem e, açúcares não redutores, tais como a sacarose, são relevantes em tecido adulto. A presença de compostos exclusivos em tecido de E. benthamii tais como a fenilalanina, pode justificar o fato desta espécie ser mais utilizada para a obtenção de energia, já que este aminoácido está diretamente relacionado com a síntese de lignina. Ainda para a espécie de E. benthamii foram encontrados em maior abundância sacarose e derivados álcoois de açúcares que proporcionam maior resistência da planta ao frio. Não foram encontradas diferenças estatísticas entre a concentração de açúcares dentro do perfil de metabólitos estudados, que sustente a não utilização de E. benthamii para polpação de celulose. / Clonal propagation of the Eucalyptus, have been used in Brazil since the 60s, due to the characteristics of productivity, adaptability and rapid growth, especially Eucalyptus grandis and its hybrids, which have good performance to obtain paper pulp, and the E. benthamii that is resistant to mild temperatures followed by frost. The analysis of the metabolic profile for Eucalyptus species has not yet been explored, which leads to difficulties in the identification of gene expression phenotypes of commercial interest. Thus, the present study aimed to implement and evaluate the methodology typically used to obtain the metabolic profile in leaf tissue of two age stages (e.g. young and adult) of E. grandis and E. benthamii under field conditions. The metabolic profile was characterized by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS), this technique proved effective for obtaining a profile of polar metabolites, although it had less sensitive to nitrogen compounds and amino acids. The predominance of carbohydrates was observed in leaf tissue of the studied species, which may be related to the time of collection of the material under light intensity, non-reducing sugars such as sucrose have massive production during the photoperiod, and they are metabolized to other compounds during the night. The PCA, trimmed by statistical test indicated that there were significantly more metabolites that contribute to the distinction between the ages of leaf tissue, and the more reducing sugars are important in young tissue and non-reducing sugars, such as sucrose, are relevant in adult tissue. The presence of unique compounds in tissue E. benthamii such as phenylalanine, can justify the fact that this species is nominated to be used in energy, since this amino acid is directly related to lignin synthesis. Besides E. benthamii has greater abundance sucrose and sugar alcohols compounds than E. grandis, which is related to a better resistance to cold. No statistical differences were found between the concentrations of glucose and galactose which supports the non-use of E. benthamii for pulping.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-04Bitstream added on 2014-06-13T19:18:58Z : No. of bitstreams: 1 brizolla_tf_me_botfca.pdf: 254524 bytes, checksum: 7729f6929f3138aa2ec6cbf4147cd6b8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie Eucalyptus grandis Hill ex Maiden é a mais cultivada em estandes comerciais no Brasil e no mundo. A espécie é plantada como cultivar e também na forma de plantios clonais de seus híbridos interespecíficos. O trabalho é um estudo da variabilidade genética em progênies de polinização livre de Eucalyptus grandis de árvores selecionadas fenotipicamente em pomar de sementes por muda, cuja procedência é originária de Coff’s Harbour – Austrália. Este pomar, de propriedade da empresa Duratex S.A. encontra-se na Fazenda Morro D’Ouro, no Município de Botucatu. Tem também como objetivo analisar as correlações entre os diferentes caracteres nas diferentes idades e estudar as correlações entre as idades juvenis e de final de rotação da cultura, visando subsidiar a seleção precoce em programas de melhoramento com espécie. Os ensaios foram instalados em três experimentos em cada um dos dois locais, Angatuba-SP e Lençóis Paulista-SP, em fevereiro de 1988. O delineamento experimental utilizado foi o blocos casualizados, com 10 repetições, 6 plantas por parcela, ao espaçamento de 3 x 2 metros e totalizando 75 progênies. Os caracteres avaliados foram o diâmetro a altura do peito (DAP); altura de planta e volume de madeira. As avaliações foram feitas em quatro anos consecutivos (02, 03, 04 e 05 anos) em Lençóis Paulista (local 2), sendo que em Angatuba (local 1) foram realizadas avaliações anuais do segundo ao sexto ano. Os resultados mostraram haver variabilidade genética suficiente para avançar as gerações de melhoramento com a espécie... / The species Eucalyptus grandis Hill ex Maiden is the most commonly cultivated in commercial stands in Brazil and throughout the world. The species is planted as a cultivar, by seed, e also by clonal plantings of its interspecific hybrids. The research is a study of genetic variability in open pollinated progenies of Eucalyptus grandis of phenotipically selected trees in Seedling Seed Orchard of Coff’s Harbour – Australia provenance. The orchard is of Duratex S.A. company located in Morro D’Ouro Experimental Station, in Botucatu city, S.P., Brazil. The study also have as objective to analyze the correlations between different traits in different ages and to study the correlations between juvenile and final of culture rotation, aiming to get support for procedures of early selection in forest tree breeding programs of Eucalyptus grandis. The experiments were set up by three trails in each one of two localities, Angatuba and Lençois Paulista, both in São Paulo State, Brazil, in February of 1988. The experimental design was the randomized blocks, with 10 replications, 06 plants per plot, 3 x 2 spacing, and totalizing 75 progenies. The diameter of breast height (dbh), plant height, and wood volume were the studied traits. The evaluations were made through the consecutive years (02, 03, 04, and 05 years old) in Lençois Paulista (Locality 2), and in Angatuba (Locality 1) were made annual evaluations from de second to the sixth years old. The results have shown sufficient genetic variability to advance breeding generations of species... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-29Bitstream added on 2014-06-13T18:40:22Z : No. of bitstreams: 1 menegazzo_m_me_botfca.pdf: 1489242 bytes, checksum: 2ff854fb07d1b64faeeed3a76dbbc27c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Buscando alternativas para o aperfeiçoamento dos recursos florestais nas indústrias de celulose e papel, o presente trabalho teve como objetivo analisar as características morfológicas de celuloses branqueadas de Pinus e Eucalyptus em analisador óptico automático de fibras devido a grande importância nas características e propriedades do papel. Foram comparadas a morfologia de três amostras de celulose fofa (“fluff pulp”) Kraft branqueada de fibra longa de mercado procedente dos Estados Unidos e duas amostras de celulose branqueadas do híbrido de E urophylla x E. grandis, sendo uma amostra obtida de clone de menor densidade básica da madeira, e a outra amostra de clone de maior densidade básica da madeira, utilizando o analisador óptico de fibras Kajaani FS-200. Em seguida foram comparadas as diferenças de morfologia de fibras entre celuloses branqueadas de fibra longa (Pinus) e fibra curta (E. urophylla x E. grandis). Utilizando equipamento Kajaani FS-300, foi analisada a influência do refino (0, 15 e 30 minutos) em amostras de celulose branqueadas integral e classificada em equipamento Bauer McNett de E. globulus em relação à morfologia de fibras e propriedades de resistências físico-mecânicas da celulose. Nas amostras de celulose branqueada de Pinus, houve uma variação nos valores das dimensões em relação comprimento, espessura da parede e diâmetro do lume; a largura foi à dimensão mais estável. Obteve-se relação positiva entre espessura da parede, fração parede e “coarseness”, e relação negativa destes parâmetros com o índice de curvatura da fibra. O comprimento da fibra relacionou positivamente com a espessura da parede, índice de enfeltramento e “coarseness”, e negativamente com o... / Seeking alternatives for the improvement of forest resources in the industries of pulp and paper, this study aimed to analyze the morphological characteristics of bleached pulps from Pinus and Eucalyptus in analyzer automatic optical fiber due to the great importance of the characteristics and properties of paper. Compared the morphology of three samples of pulp fluff bleached softwood kraft market from the United States and two samples of bleached pulp and the hybrid E. urophylla x grandis, and a sample obtained from clone lower basic density, and another sample of clone high basic density of wood, using the analyzer optical fiber Kajaani FS-200. Following the differences were compared in morphology of pulp fibers from bleached softwood (pine) and hardwood (E. urophylla x E. grandis). Using equipment Kajaani FS-300, we analyzed the effect of beating (0, 15 and 30 minutes) in full samples of bleached pulp and classified pulp in equipment Bauer McNett of the E. globulus in relation to morphology and properties of pulp physical and mechanical resistance. Samples of pine pulp bleached, there was a variation in the values of the dimensions in relation length, wall thickness and lumen diameter, the width of the scale was more stable. Positive relation was obtained between wall thickness, wall fraction and coarseness, and negative relationship of these parameters with the index of curvature of the fiber. The fiber length correlated positively with the thickness of the wall, felting index and coarseness, and negatively associated with lumen diameter and fiber population. The dimensions of fibers varied in two samples of Eucalyptus pulp from wood of different densities basic. The pulp fibers in wood from the lower basic density showed... (Complete abstract click electronic access below)

Uma cuidadosa revisão bibliográfica, seguida por uma pesquisa in silico no banco de dados de expressed sequence tags (ESTs) do projeto GENOLYPTUS – Rede Brasileira de Pesquisa do Genoma de Eucalyptus, foram realizadas visando identificar classes de genes potencialmente relacionadas com a resposta vegetal à deficiência hídrica em Eucalyptus grandis. Os principais clones de cDNA selecionados potencialmente codificam proteínas relacionadas com a síntese de osmólitos como prolina, sacarose, osmotina, poliaminas, desidrinas, fatores de transcrição, e genes de uma importante cascata de sinalização vegetal à deficiência hídrica. Duas classes de seqüências foram estudadas mais detalhadamente. A Sadenosil- metionina-descarboxilase (SAMDC) é uma enzima-chave na rota de síntese das poliaminas, aminas catiônicas envolvidas em vários processos celulares, inclusive na proteção das estruturas da célula em respostas a diferentes tipos de estresses. Dois grupos de ESTs foram inicialmente identificados por homologia a seqüências conhecidas de SAMDC e duas seqüências potencialmente completas de cada grupo foram selecionadas e denominadas EgrSAMDC1 e EgrSAMDC2. As seqüências deduzidas de aminoácidos de ambos os cDNAs apresentaram os dois principais domínios da enzima e uma estrutura conservada em relação a outras SAMDCs de plantas. Além da região de leitura aberta (ORF, do inglês, open reading frame) principal, os cDNAs apresentaram duas pequenas regiões codificadoras conservadas, denominadas tiny e small upstream ORFs na longa região 5’ não traduzida, relacionadas à regulação pós-transcricional dos genes. Em análises de Southern blot, foram detectados pelo menos dois fortes sinais de hibridização para cada amostra de DNA genômico de E. grandis digerido por endonucleases distintas, sugerindo a existência de (pelo menos) duas cópias genômicas de SAMDC. Por Northern blots, a presença de mRNAs para SAMDC foi detectada em folhas e caules jovens e, em menor quantidade, em tecidos vasculares de árvores adultas. Entretanto e nitidamente, a maior expressão de SAMDC em E. grandis ocorre em flores abertas. Análises quantitativas por transcrição reversa seguida de reação em cadeia da DNApolimerase (qRT-PCR) com plântulas cultivadas in vitro por 4 meses, submetidas a diferentes tratamentos como ácido abscísico (ABA), ácido naftalenoacético (ANA), quinetina (KIN), cloreto de sódio (NaCl), seca, frio, luz ultravioleta (UV), ferimentos e extrato de leveduras, 9 demonstraram maior indução da expressão de EgrSAMDC2 na presença de ABA e NaCl. Também foi observada uma drástica redução na expressão deste gene, baseado nos níveis de mRNA-molde para as RT-PCRs, quando as plântulas foram expostas a UV e seca. Estes resultados indicaram que o gene EgrSAMDC2 pode estar mais relacionado à resposta vegetal à elevada salinidade, por intermédio da sinalização por ABA, do que à resposta a outros estresses ambientais ou bióticos. A segunda classe de genes identificados e analisados junto ao GENOLYPTUS como potencialmente relacionados à deficiência hídrica potencialmente codificam proteína-cinases ativadas por mitógenos (MAPKs, do inglês, mitogen-activated protein kinases). MAPKs são proteínas de uma importante cascata sinalizadora, constituída por três componentes denominados MAPKKK, MAPKK e MAPK. Elas estão envolvidas na sinalização do desenvolvimento, estímulos hormonais e de estresses bióticos e abióticos. O cDNA selecionado, de aproximadamente 5 kb, representa uma seqüência imatura de mRNA (transcrito primário), no qual estão presentes dois íntrons. Nas extremidades 5’ e 3’ dos íntrons existem sítios canônicos de processamento (splicing) que indicam que o transcrito deve ser corretamente processado em um mRNA maduro. A proteína deduzida a partir da união dos éxons indica que o cDNA isolado de E. grandis potencialmente codifica uma MAPK2, com alta homologia a outras MAPKs vegetais. Além disto, a seqüência de aminoácidos representa uma proteína completa, na qual os 11 domínios conservados em MAPKs, fundamentais para o correto funcionamento da enzima, estão presentes. Análise de Southern blot indicaram que este gene está presente em cópia única no genoma de E. grandis. Em análises da expressão por qRT-PCR em plântulas submetidas aos diferentes tratamentos descritos acima, foi observado uma significativa indução da transcrição com KIN e NaCl, e uma leve indução por ABA. O tratamento com UV provocou uma drástica redução na expressão de EgrMAPK2. Este resultado fornece indícios de que este gene possivelmente esteja em envolvido em repostas a estresses abióticos. / A careful bibliographical review, followed by an in silico screening of the expressed sequence tag (EST) databank of the GENOLYPTUS Project – The Brazilian Research Network on the Eucalyptus Genome, were conducted to identify genes potentially related to drought responses in Eucalyptus grandis. The main selected clones potentially encode proteins related to the biosynthesis of different osmolites such as proline, sucrose, osmotin and polyamines, dehydrines, transcription factors and genes from an important plant signaling cascade. Two gene classes were studied in more detail. S-adenosylmethionine decarboxylase (SAMDC) is one of the key regulatory enzymes in the biosynthesis of polyamines, cationic amines involved in various processes of the cell, including the protection of cellular structures in response to different stresses. Two clusters of ESTs were initially identified by homology to known SAMDC sequences and, from each of them, two full-length cDNAs were identified and named EgrSAMDC1 and EgrSAMDC2. The deduced amino acid sequences from both cDNAs showed the two main enzyme domains and a conserved protein structure in comparison to other plant SAMDCs. Besides the main open reading frame (ORF), two other tiny and small upstream ORFs were found in the long 5’ non-translated region of the cDNAs. These sequences are known to be associated with post-transcriptional regulation. Southern blot analysis resulted in two strong hybridization signals for each genomic DNA digested with different restriction enzymes, indicating (at least) two SAMDC genomic copies. Northern blots detected SAMDC mRNAs in young leaves and stems and a lower transcript level in vascular tissues from mature trees. Nevertheless, the highest levels of E. grandis SAMDC steady-state mRNA was clearly detected in opened flowers. Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) with total RNA from 4-months old in vitro seedlings subjected to different treatments, such as abscisic acid (ABA), naphthaleneacetic acid (NAA), kinetin (KIN), sodium chloride (NaCl), drought, cold, ultraviolet light (UV), wounding and yeast extract, demonstrated higher expression induction of EgrSAMDC2 gene with ABA and NaCl. A drastic reduction in gene expression was observed after UV and drought treatments of the seedlings, based on RNA-template levels for RT-PCRs. These results suggested that 11 EgrSAMDC2 gene might be more related to plant response against high salinity, possibly via ABA signaling, than to other environmental or biotic-like stress responses. The second gene class identified and analyzed in the GENOLYPTUS, as potentially involved in drought responses, encodes a mitogen-activated protein kinase (MAPK). MAPKs proteins are part of an important signaling casacade, which consists of three components, MAPKKK, MAPKK and MAPK. They are associated to developmental signaling, hormonal and biotic and abiotic stimuli. The selected cDNA, of about 5 kb in length, represented an immature mRNA (primary transcript) with two non-spliced introns. The canonical 5’ and 3’ splicing sites suggested that the transcript might probably be correctly translated to a mature mRNA. The deduced protein from the union of all three exons indicated that the isolated E. grandis cDNA potentially encodes a MAPK2, with high homology to other plant MAPKs. Moreover, the amino acid sequence represented a complete protein, with all 11 domains conserved in MAPKs and known to be fundamental for the enzyme functionality. Southern blot analysis indicated that EgrMAPK2 is encoded by a single genomic copy in E. grandis. From qRT-PCR expression analysis, conducted with the same plant material described above, we observed a significant transcription induction with KIN and NaCl, and a weaker induction by ABA. The UV treatment resulted in a drastic reduction of EgrMAPK2 expression. This result strongly indicated that this gene is most probably involved in abiotic stress responses.

Made available in DSpace on 2018-08-01T22:56:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11770_Dissertação IZABELLA 2018-Final.pdf: 1212538 bytes, checksum: fd29ee0b41327808c04cf6686ec7e759 (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Em função da demanda de madeira, o Brasil possui uma grande produção de eucalipto para utilização nas indústrias e isto gera quantidades de cascas que normalmente não são aproveitadas, independentemente do local de cultivo. Assim, este trabalho objetivou identificar a influência do ambiente na composição química da casca de clones de eucalipto, quanto à produção de compostos fenólicos, e avaliar a potencialidade de utilização destes compostos na fabricação de adesivos à base de taninos. Para isso, determinaram-se o pH, o teor de extrativos totais, de lignina e de cinzas das cascas de árvores provenientes de dois ambientes com precipitação média diferentes (A - Nova Almeida ES; e B - Montezuma MG). Os taninos (extraídos em água sob refluxo e adição de 5% de sulfito de sódio) foram avaliados quanto ao teor de extrativos totais, o número de Stiasny, a reatividade ultravioleta, o teor de taninos e não taninos. Após a produção do adesivo em composição de 1:1 (extrato tânico:água destilada) avaliaram-se as propriedades tecnológicas do mesmo (viscosidade, teor de sólidos, pH, tempo de gel, densidade e solubilidade). Na caracterização química das cascas, o ambiente A apresentou as maiores médias para as propriedades avaliadas. De modo geral, o clone 5 se destacou em todas as propriedades e seguiu para extração em autoclave, com uma relação licor:casca de 15:1 e adição de 5% de sulfito de sódio. Para o adesivo obtido, o ambiente B apresentou os melhores resultados para viscosidade, densidade e pH e o A para o tempo de formação de gel. O ambiente de crescimento das árvores influenciou o rendimento de taninos, e o de maior precipitação apresentou os melhores resultados. O adesivo produzido a partir das cascas provenientes do ambiente B apresentou características desejáveis, quanto à qualidade dos adesivos apesar de não ser o ambiente com o maior rendimento em taninos.

Eucalyptus species form an integral part of the South African forestry industry and their uses extend from paper and pulp production to the synthesis of essential oils which are used in various cosmetic products. Throughout their lifetime these hosts are naturally challenged with various pests and pathogens, most of which cause devastating diseases. An approach to curb the spread of pathogens is to enhance the defence response of the host. Most of the information pertaining to defence against pathogens stems from studies conducted in model organisms such as Arabidopsis, however such information is scarce in woody species such as Eucalyptus. It is understood, from model systems, that once the pathogen is perceived by the host, a cascade of defences are initiated such as the activation of salicylic acid (SA), jasmonic acid (JA) and ethylene (ET) signalling pathways. These pathways in turn activate the expression of genes involved in limiting the spread of the pathogen such as pathogenesis-related (PR) proteins. Certain PR genes have also been shown to be markers of the induction of a specific pathway e.g. PR2 is a marker for the SA pathway. This study aimed to elucidate marker genes specific to the SA (PR1, PR2 and PR5) and JA (PR3, PR4 and LOX) signalling pathways in Eucalyptus grandis using the genome sequence, bioinformatics tools and sequence information from other plant species. A co-phylogenetic approach using neighbour joining analysis and maximum likelihood was used to identify and add confidence in the selection of putative orthologs. Following the selection of orthologous markers, the expression profile of these candidate genes was assessed using Reverse transcriptase quantitative PCR (RT-qPCR). Transcript profiling was conducted under mock induction of the signalling pathways as well as under pathogen stress. For the mock induction of the pathways, the expression profiles of the putative marker genes were investigated under various concentrations of the inducer and at various time points. In the interaction with Chrysoporthe austroafricana it was observed that the SA signalling pathway could have a role in facilitating resistance due to the expression profile observed for EgrPR2. In the tolerant genotype (TAG5) this gene was induced at an earlier time point as opposed to the susceptible genotype (ZG14). These putative markers could provide a diagnostic tool for the screening of pathogen challenged eucalypts to determine which signalling pathway(s) are activated against various pathogens. In addition, this research adds to our knowledge of defence responses in E. grandis by elucidating genes that can be used as targets for improving resistance. Additionally this study provides a stepping stone for understanding mechanisms to curb future tree diseases. / Dissertation (MSc)--University of Pretoria, 2014. / Genetics / Unrestricted

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-12-21T15:42:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2730160 bytes, checksum: dc4a39fded036f7ec40656940abca859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-21T15:42:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2730160 bytes, checksum: dc4a39fded036f7ec40656940abca859 (MD5) Previous issue date: 2003-06-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente estudo avaliou a intervenção de desrama artificial em povoa- mentos de três clones de Eucalyptus grandis x E. urophylla, com diferentes arquiteturas de copa, denominados como 1265, 1288 e 1270, na área da CAF/Santa Bárbara Ltda., em Alcobaça, Bahia. Foram estabelecidos três experimentos, seguindo o delineamento inteiramente casualizado, com três repetições. Os tratamentos de desrama aplicados às plantas variaram em intensidade (altura de desrama), freqüência (número de intervenções) e idades (época de realização da primeira intervenção de desrama). Foram avaliados os seguintes parâmetros por ocasião de cada intervenção de desrama e seis meses após a última intervenção: diâmetro a 1,30 m de altura (DAP), altura total, volume das árvores, radiação fotossiteticamente ativa (RFA) e índice de área foliar (IAF) medidos à 0,5 m de altura do solo, arquitetura de copa, acúmulo de matéria orgânica e coeficiente de extinção. Os resultados da arqui- tetura de copa evidenciaram a variação entre os clones na distribuição de biomassa de galhos e folhas ao longo do fuste. Por exemplo, até 3 m de altura das plantas, aos 16 (clone 1265) e 14 (clones 1288 e 1270) meses de idade, estes clones apresentaram, 17,4; 48,3 e 32,7% de área foliar total, respecti- vamente. Até 6 m de altura das plantas, aos 22 (clone 1265) e 20 (clones 1288 e 1270) meses de idade essa proporção foi de 13,4; 20,9 e 29,3%, respec- tivamente. A projeção de copa das plantas indicou fechamento de dossel nos povoamentos estudados antes de 22 meses de idade, indicando que a primeira intervenção de desrama artificial deva ser realizada antes desta idade para estes clones, evitando-se formação de grande quantidade de galhos mortos. A aplicação de desrama em idades mais jovens promoveu redução do IAF e aumento da transmissividade da RFA, enquanto em idades mais avançadas mantiveram-se inalterados. Não foram verificadas diferenças estatísticas signifi- cativas entre tratamentos de desrama para altura, DAP e volume das plantas, para os clones 1265 e 1288, enquanto para o clone 1270, houve diferença estatística significativa apenas para a altura, 19 meses após a primeira inter- venção de desrama. O reduzido efeito da desrama sobre o crescimento destes clones pode estar associado a remoção relativamente baixa de área foliar bem como da capacidade de recuperação de sua copa. A remoção máxima (48,3%) de área foliar foi para o clone 1288, aos 14 meses de idade. Há, porém, neces- sidade de se avaliar o crescimento das plantas, em idades mais avançadas, uma vez que os efeitos da desrama podem surgir até dois anos após a última intervenção. Foi observado, aos 19 meses após a primeira intervenção de desrama, efeito benéfico sobre a produção de madeira limpa, isenta de nós, que constitui-se num parâmetro de qualidade da madeira para uso em serraria. Os resultados desse trabalho indicam a necessidade de definir a intesidade de desrama artificial, em povoamentos de Eucalyptus, com base no percentual de área foliar a ser removido, devendo este ser inferior a 40%. / Artificial pruning was evaluated in three Eucalyptus grandis x E. urophylla clones (1265, 1288, and 1270) with different crown architecture, established in southeastern Bahia, Brazil. Three experiments were established in a completely randomized design with three replications. The pruning treatments varied in intensity (height of pruning), frequency (number of interventions), and ages of the first pruning intervention. The following parameters were evaluated at the time of every pruning intervention and six months after the last intervention: diameter at 1.30 m (DBH), total height, tree volume, photosynthetically active radiation (PAR) and leaf area index (LAI) measured at 0.5 m above the soil, crown architecture, total organic matter and extinction coefficient. It was observed that the clones varied significantly in crown architecture based on biomass distribution of branches and leaves along the trunk. For example, the clone 1265 at the age of 16 months and the clones 1288 and 1270 at the age of 14 months, presented 17.4, 48.3, and 32.7% of the total leaf area, up to a plant height of 3 m and, up to the height of 6 m, at the age of 22 (clone 1265) and 20 months (clones 1288 and 1270), they presented 13.4, 20.9, and 29.3%, respectively. Based on crown projection, the dossel could be considered closed before the plants reached the age of 22 months, indicating that the first artificial pruning intervention should be realized before this age, to avoid the formation of a great quantity of dead branches. Pruning treatments applied at young ages led to a substantial reduction in LAI and increase in PAR transmissivity, whereas these values were not altered at more advanced ages. No statistically significant differences were found among the pruning treatments for height, DBH and plant volume for the clones 1265 and 1288, while significant statistical differences were found for clone 1270 (height only), 19 months after the first pruning intervention. The reduced effect of pruning on growth might be due to the relative small amount of removed leaf area as well as the recovery capacity of the crown. The greatest percentage of leaf area (48,3%) was removed from clone 1288, at the age of 14 months. A beneficial effect of pruning on the production of clean wood (without knots) was observed 19 months after the first pruning intervention. Results of this study point out the need of defining the appropriate intensity of artificial pruning in Eucalyptus stands, based on the percentage of the leaf area to be removed, which must lie below 40%.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-12T12:04:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1183163 bytes, checksum: 0b6d8fdf81146ee021d2a73b3c9b3898 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-12T12:04:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1183163 bytes, checksum: 0b6d8fdf81146ee021d2a73b3c9b3898 (MD5) Previous issue date: 2004-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Ensino Superior / Avaliou-se cinco testes de Progênies de Eucalyptus urophylla com 363 progênies, com uso do procedimento REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viesada) e um teste de Eucalyptus grandis com 265 progênies de treze procedências, visando a seleção com base no DAP (diâmetro à altura do peito), dos indivíduos portadores dos maiores valores genéticos preditos. Os testes de Eucalyptus urophylla foram instalados separados por procedência, em blocos ao acaso com cinco repetições e parcelas lineares de oito plantas, no espaçamento 3 x 2 metros e avaliados aos 48 meses de idade. Nas populações de melhoramento, Pomar de Sementes por Mudas (PSM), de Eucalyptus urophylla o ganho genético variou de 9,5 a 25,3 % e tamanho efetivo populacional de 58 a 224. Para a população de produção, Pomar de Sementes Clonal, o ganho genético estimado variou de 15,2 a 26,8 % com a seleção de 21 indivíduos para a recombinação. O teste de progênies Eucalyptus grandis foi instalado em delineamento de blocos ao acaso com cinco repetições e parcelas lineares de seis plantas, no espaçamento 3 x 2 metros, com as progênies aleatorizadas dentro de cada bloco independentemente das procedências. A seleção com base no DAP (diâmetro à altura do peito) propiciou um ganho genético de 16,1 % e tamanho efetivo populacional de 897 no estabelecimento do Pomar de Sementes por Mudas (PSM) e variou de 12,7 a 22,3 % para o Pomar de Sementes Clonal estabelecido com 29 indivíduos na recombinação. Visando a produção de híbridos interespecíficos foram selecionados 100 genitores de Eucalyptus urophylla e 100 de Eucalyptus grandis para cruzamentos em dialelos circulantes. Os cruzamentos entre os pares de indivíduos portadores das maiores distâncias genéticas conduzirão a um ganho genético estimado variando entre 35,7 a 38,5 %. / Five tests were carried out with 363 Eucalyptus urophylla progenies from Indonesia, and one a test with 265 Eucalyptus grandis progenies from thirteen provenances in Guanhães- MG, in order to estimate the genetic values and parent selection for the production of interspecific hybrids in controlled crosses. A complete randomized block design was used, with five replications and row plots of six Eucalyptus urophylla and eight Eucalyptus grandis plants, in a spacing of 3.0 x 2.0 m. The genetic parameters were estimated with mixed models, using the REML/BLUP procedure (restricted maximum likelihood / best linear unbiased prediction) and minimum squares, for the diameter at breast height (DAP), total height (ALT) and individual volume (VOL) characteristics. The genetic values were predicted only for the iameter at breast height (DAP) characteristics, which was aim of the selection. Heritability estimates in the restricted sense of 0.28 and accuracy in a range of 61% in Eucalyptus urophylla and of 0.23 and accuracy of 53% in Eucalyptus grandis. Were obtained the election of the 100 parents of each species individually indicates genetic gains of 20.6 % in Eucalyptus urophylla and 16.4 % in Eucalyptus grandis. The genetic gain for the diameter at breast height characteristics around 35.0% can be obtained after crosses among the first 10 plants selected from each species that are carriers of the greatest genetic divergences. / Não foi localizado o currículo lattes do autor.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T13:35:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 512543 bytes, checksum: bd3a89a27c9299a9713aef6b4a12a1c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T13:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 512543 bytes, checksum: bd3a89a27c9299a9713aef6b4a12a1c1 (MD5) Previous issue date: 2000-09-11 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Foram avaliados o crescimento, as relações hídricas e a qualidade da madeira de plantas de Eucalyptus grandis submetidas a diferentes intensidades de desrama da copa viva (0%, 12,5%, 25%, 50% e 75%) aos 11 meses de idade, na região de Dionísio, MG. A altura total e o diâmetro a 1,30 m de altura (DAP) foram determinados aos 11, 20, 33, 55, 81 e 92 meses de idade. Foram ajustadas equações de regressão em função da idade para o crescimento em diâmetro, altura e incremento volumétrico. O potencial hídrico, condutância estomática, transpiração, área foliar, temperatura da folha e radiação fotossinteticamente ativa foram avaliados em quatro estratos da copa, por ocasião da aplicação da desrama. A qualidade da madeira foi avaliada aos 92 meses, sendo que, para as toras, foram estudados os defeitos de crescimento (conicidade, encurvamento e achatamento) e fendas e, na madeira serrada (tábuas), os defeitos de crescimento, nodosidades, corte limpo, fendas e bolsas de resina. O crescimento em diâmetro, altura e volume foram maiores para o controle, associando-se inversamente com a intensidade de desrama, tendo sido observada redução de 26,76% para diâmetro, 28,09% para altura e 45,16% para volume, aos 92 meses, quando se comparou o controle com a desrama de 75% da copa viva da planta. A área foliar e a perda de água por transpiração na metade da copa viva para baixo correspondeu a aproximadamente 80% do total, indicando que a maior perda de água ocorre na base da copa da árvore. Desta forma, a eliminação parcial de galhos da base da copa das árvores pode favorecer a sobrevivência das plantas em regiões de défice hídrico. A qualidade da madeira foi avaliada antes (toras) e após o desdobro (tábuas). Não houve defeitos significativos de crescimento nas toras e tábuas, de acordo com a norma brasileira de classificação de madeira serrada, porém, houve tendência de redução da conicidade das toras com o aumento da intensidade de desrama. O número de fendas nas toras decresceu com o aumento da intensidade de desrama da copa (3,67 fendas no controle e 2,13 fendas nas toras com desrama de 75%) enquanto não foi observada diferença significativa entre o número de fendas na base e topo da tora. A desrama foi eficiente para a redução de nós vivos e mortos nas tábuas; o corte limpo também aumentou substancialmente com a intensidade da desrama (65,14 cm para o controle e 165,50 cm para a desrama de 75%). As fendas, as bolsas de resina e o encurvamento das tábuas reduziram com a intensidade da desrama, ao passo que o arqueamento não foi afetado. / The growth, water relations and wood quality of Eucalyptus grandis were studied in plants submitted to different intensities of live crown pruning (0%, 12.5%, 25%, 50% and 75%) at the age of eleven months, in southeastern Brazil. Total height and diameter at breast height (DBH) were measured at the age of 11, 20, 33, 55, 81 and 92 months. Water potential, stomatal conductance, transpiration, leaf temperature, active photosynthetic radiation and leaf area were measured in four crown strata at the time of pruning. Wood quality evaluation was undertaken from logs of 3.60 or 4.00 m lenght and for sawnboards. The following characteristics were analysed: growth defects (taper, bow and flatness) and rifts in sawlogs and growth defects, cracks, clear cut, live and dead knots, number and size of the knots and pitch pockets in boards. The growth in diameter at breast (DBH), height and volume were larger for the control, being inversely associated with tree pruning intensity. It was observed reduction of 26.76% for DBH, 28.09% for height and 45.16% for volume, at the age of 92 months, when plants which had 75% of the live crown pruned were compared to control. Leaf area and transpiration of leaves on the base of the live crown (50% of total live crown height) corresponded, approximately, to 80% of the total, indicating that the greatest loss of water happens at the base of the live crown of the tree. Wood quality was evaluated before (logs) and after sawning (boards). Significant growth defects were not observed in logs and boards, however, there was a tendency of reduction of the taper in logs with increasing pruning intensity. The number of cracks in logs decreased with the intensity of the tree crown live pruning (3.67 cracks in the control and 2.13 cracks in the logs from trees with 75% crown live pruning). There was no significant difference for number of cracks at the base and top of the log. Pruning was efficient to reduce live and dead knots in boards; the clear cut also increased substantially with pruning intensity (65 cm for the control and 165 cm in trees wich had 75% of live crown pruning). The cracks, pitch pockets and board flatness reduced with the intensity of pruning, while the bow was not affected.