Thesis (Ph. D. in Biological Sciences)--Vanderbilt University, May 2009. / Title from title screen. Includes bibliographical references.

Thesis (M.S.)--University of North Carolina Wilmington, 2008. / Vita. Title from PDF title page (viewed May 27, 2009) Includes bibliographical references (p. 52-54)

Thesis (Ph.D. (Biochemistry, Microbiology & Biotechnology)) - Rhodes University, 2008.

Thesis (M.S.)---University of North Carolina Wilmington, 2008. / Title from PDF title page (viewed September 22, 2008) Includes bibliographical references (p. 45-50)

Proefschrift - Utrecht. / Summary in English.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2006. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 102-116).

Orientador: Lígia Souza Lima Silveira da Mota / Resumo: O Brasil é um país megadiverso detentor de grande parte da riqueza ecológica do mundo, porém seus biomas, importantes devido aos serviços ecossistêmicos, sofrem com a pressão antrópica. Assim, os grandes predadores, que possuem efeito regulatório no ecossistema, geram conflitos direto com o homem. O Puma concolor é um predador generalista, atuando no perfil trófico onde reside. Estudos de populações in situ são importantes na elaboração de planos de manejo e a utilização de amostras não invasivas nos permitem ter acesso a informações biológicas a baixo custo. O objetivo deste trabalho foi avaliar o uso de amostras não invasivas para contribuir com informações nos planos conservacionistas da região. Foram percorridas bordas de mata e áreas de transição da APA-Botucatu. As amostras de fezes encontradas foram georreferenciadas, coletadas, selecionadas, fotografadas, classificadas e seu DNA extraído por meio da técnica empregando fenol/clorofórmio. O DNA obtido foi quantificado em espectrofotômetro e sua qualidade avaliada em eletroforese. Trinta e cinco amostras foram classificadas quanto ao seu grau de degradação, submetidas à extração de DNA e seu produto avaliado. A presença de material genético nas fezes frescas ou pouco degradadas apresentaram maiores concentrações de DNA além de melhor qualidade quando comparadas com as mais degradadas. Estes resultados evidenciam que, o DNA obtido empregando metodologia de baixo custo, possui quantidade e qualidade suficientes para seu em... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-20Bitstream added on 2014-06-13T19:23:36Z : No. of bitstreams: 1 miranda_ap_dr_jabo.pdf: 553828 bytes, checksum: d736c8d07571b50750a6e56f01d50fae (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Avaliaram-se dietas formuladas com milho ou sorgo para suínos nas fases inicial, crescimento e terminação sobre o desempenho dos animais, digestibilidade dos nutrientes, produção e características de fezes e urina e biodigestão anaeróbia dos dejetos. No ensaio de desempenho não foram verificadas diferenças quanto ao consumo médio diário de ração, ganho médio diário de peso e conversão alimentar. Foi realizado um ensaio de digestibilidade em cada fase de crescimento dos animais utilizando o método de coleta total de fezes, não se observando diferenças para coeficientes de digestibilidade da matéria seca e da energia bruta, coeficiente de metabolizabilidade, energia digestível e metabolizável. Os maiores coeficientes de digestibilidade da proteína bruta e proteína digestível foram verificados nos animais alimentados com dietas à base de milho na fase terminação. Para animais alimentados com dietas formuladas com sorgo foram verificados maiores valores de matéria seca digestível nas fases crescimento e terminação. Verificou-se maior produção média de fezes para animais alimentados com dietas formuladas com sorgo, gerando maiores coeficientes de resíduo. Os maiores teores de sólidos totais e voláteis foram verificados nas fezes de animais alimentados com dieta à base de milho, em todas as fases de crescimento. As concentrações médias dos nutrientes nas fezes e na urina variaram entre os tratamentos e fases. O abastecimento de 20 biodigestores indicou maiores reduções nos teores de sólidos voláteis e maiores produções de biogás quando se utilizaram fezes de suínos alimentados com dietas formuladas à base de milho. As concentrações médias dos nutrientes no afluente e efluente dos biodigestores variaram entre os tratamentos e fases. / There were evaluated diets formulated with corn or sorghum for pigs in the initial stages, growing and finishing on the growth performance of animals, digestibility of nutrients, production and characteristics of feces and urine and anaerobic digestion of pigs manure. In the test of growth performance were not found differences in the average daily consumption of feed, average daily weight gain and feed conversion. There was performed a test of digestibility at each stage of growth of animals using the total collection of feces, no difference was observed for digestibility coefficients of dry matter and gross energy, coefficient to metabolize, digestible and metabolizable energy. The highest rates of digestibility of crude protein and digestible protein were observed in animals fed with diets based on corn in the finishing stage. For animals fed diets formulated with sorghum there were observed higher values of digestible dry matter in growing and finishing phases. There was a greater average production of feces by animals fed with diets based on sorghum, generating higher coefficient of waste. The highest levels of total and volatile solids were found in the feces of animals fed with diets containing corn, in all the stages of growth. The average concentrations of minerals in feces and urine varied among treatments and stages. The supply of 20 anaerobic digesters indicated greater reductions in the volatile solids levels and greater production of biogas when using waste from pigs fed with diets based with corn. The average concentrations of minerals in the affluent and effluent in the anaerobic digesters varied among treatments and stages.

Made available in DSpace on 2014-10-09T12:23:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:06:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01107.pdf: 2937024 bytes, checksum: 79731d7cd4026a178cbdc41ff721c163 (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IEA/D / Faculdade de Medicina Veterinaria e Zootecnia, Universidade de Sao Paulo - FMVZ/USP

A importância da espécie suína na transmissão de Campylobacter spp. assemelha-se aos demais grupos de animais que se destinam à produção de carne, incluindo aves, bovinos e ovinos. Os objetivos deste estudo foram isolar Campylobacter spp. a partir de fezes e carcaças de suínos abatidos no Estado de São Paulo; identificar as espécies de Campylobacter spp. presentes nos animais abatidos; caracterizar os isolados obtidos através do Polimorfismo do Comprimento de Fragmentos Amplificados (AFLP). Para tal, foram utilizadas 120 amostras de fezes e 120 suabes de carcaças de suínos, colhidas de quatro diferentes abatedouros do Estado de São Paulo. Das 120 amostras de fezes analisadas, 30 foram positivas para o isolamento de Campylobacter coli (25%) e duas foram positivas para isolamento de Campylobacter jejuni (1,6%). Todas as amostras analisadas de suabes de carcaça foram negativas para Campylobacter spp. As estirpes isoladas que apresentaram características bioquímicas sugestivas de Campylobacter spp. foram submetidas ao teste de susceptibilidade ao ácido nalidixico e cefalotina, destas 19,16% (23/120) apresentaram resistência ao ácido nalidixico apesar de todas as características bioquímicas indicarem se tratar de Campylobacter coli. Foram selecionadas para a análise genotípica 38 amostras isoladas, sendo 36 de C. coli e dois de C. jejuni. A análise dos isolados através do AFLP revelou a presença de 28 perfis que foram designados P1 a P28. A técnica discriminou as cepas de acordo com a espécie, porém, uma cepa previamente caracterizada como C. coli foi agrupada com isolados de C. jejuni. Não foi possível estabelecer a correlação entre os isolados e o abatedouro de origem, no entanto observa-se uma forte tendência dos isolados resistentes ao ácido nalidixico em formar grupamentos de maior similaridade. / The importance of swine species in the transmission of Campylobacter spp. resembles to the other groups of animals that are destined to the meat production, including bovine and ovine animals. The objectives of this study were to isolate Campylobacter spp. from swine feces and carcasses slaughtered in São Paulo State; to identify the Campylobacter spp. species presents in the slaughtered animals; to characterize the isolated samples by amplified fragment length polymorphism (AFLP), for this, 120 swine feces samples and the same number of carcasses swabs were collected of four different slaughterhouses in São Paulo State. From 120 feces samples, 30 (25%) were positive for Campylobacter coli isolation and two (1,6%) were positive for Campylobacter jejuni. All the analyzed carcass swabs samples were negatives for Campylobacter spp. The isolated samples that presented suggestive biochemical characteristics of Campylobacter spp. were submitted to the susceptibility test to the nalidixic acid and cefalotine, from that 19.16% (23/120) presented resistance to the nalidixic acid in spite of all the biochemical characteristics indicate that they were Campylobacter coli. They were selected for the genotypic analysis 38 isolated samples, being 36 of C. coli and two of C. jejuni. The analysis of the 38 tested samples by AFLP showed the presence of 28 profiles that had been assigned P1 to P28. The technique discriminated the samples in agreement with the species, however, one sample previously characterized as C. coli was clustered as C. jejuni. It was not possible to establish the correlation between the isolated samples and the origin slaughterhouse, however a strong tendency of the isolated samples acid nalidixic resistant to create clusters with more similarity.