Tabebuia roseo-alba (Ridl.) Sand. (ipê branco) é uma árvore semidecídua que floresce abundantemente entre os meses de Agosto e Setembro. Valiosa pela qualidade de sua madeira, bem como por sua capacidade de ornamentação, esta espécie tem sido largamente utilizada em reflorestamentos e arborização urbana. A fragmentação florestal reduz o tamanho da população reprodutiva, a densidade populacional e pode isolar populações e indivíduos em campos e pastagens. Dessa forma, entender seus efeitos é fundamental para providenciar recomendações para conservação in situ e ex situ de espécies florestais. Assim, os objetivos desse trabalho foram: transferir, padronizar e caracterizar marcadores moleculares microssatélites previamente desenvolvidos em Tabebuia aurea para Tabebuia roseo-alba; avaliar a diversidade e divergência genética, o sistema reprodutivo e o fluxo de pólen em duas populações de T. roseo-alba submetidas a diferentes condições de preservação localizadas em área urbana no município de Ribeirão Preto- SP e ambiente natural em Selvíria-MS. Para isso, sementes de polinização aberta derivadas de árvores matrizes procedentes das duas populações em estudo foram coletadas. Todas as amostras tiveram seu DNA extraído e amplificado com oito pares de microssatélites heterólogos. As análises mostraram que todos os locos avaliados apresentaram herança mendeliana simples e segregam independentes, sendo, portanto, adequados para estudos de sistema de cruzamento, estrutura genética de populações e análise de paternidade. Também foi constatado que as duas populações têm elevada diversidade genética (He variando de 0,743 a 0,835) sendo as amostras de Selvíria mais diversas. Os níveis de divergência genética entre as populações foram altos e com tendência a aumentar quando comparadas as gerações de progênies. A análise do sistema de cruzamento, permitiu afirmar que as populações estudadas são mistas ( m t Ribeirão Preto = 0,840 e m t Selvíria = 0,963) com maior probabilidade de aumento na autofecundação nas árvores isoladas da população urbana. Significantes desvios do cruzamento aleatório foram observados através do cruzamento entre parentes e cruzamentos correlacionados entre e dentro de frutos, indicando endogamia nas populações. O número efetivo de doadores de pólen foi muito baixo para um mesmo fruto (1,21 em Ribeirão Preto e 1,50 em Selvíria) e mais alto entre frutos de uma mesma árvore (8,20 em Ribeirão Preto e 9,8 em Selvíria). A distância média do fluxo de pólen acessada pela análise TWOGENER foi baixa nas duas populações tanto para o modelo normal (35,4m em Ribeirão Preto e 57,3m em Selvíria) quanto para o exponencial (39,9m em Ribeirão Preto e 64,6m em Selvíria). Como o conhecimento da endogamia, cruzamentos correlacionados, autofecundação e estrutura genética espacial são fatores chave na tomada de decisões para a coleta de sementes e o plantio das mudas, estes resultados podem auxiliar programas de restauração florestal e conservação da espécie. / Tabebuia roseo-alba (Ridl.) Sand (Guayacan blanco) is one semideciduous tree that blossoms massively between August and September. Valuable for the quality of its wood, as well as its ability to ornamentation, this species has been used in urban afforestation and reforestation. The forest fragmentation reduces the size of the reproductive population, population density and can isolate populations and individuals in fields and pastures. Thus, the knowledge of the fragmentation effects may be indispensable for successful tree species conservation, breeding and regeneration. So, the aims of this study were: transfer, standardize and characterize molecular markers microsatellites developed for Tabebuia aurea; assess the diversity and genetic divergence, the mating system and the flow of pollen in two populations of T. roseoalba in different preservation conditions in an urban area located in Ribeirao Preto- SP and in a natural environment from Selvíria-MS. Therefore, open-pollinated seeds derived from seed-trees coming from the two populations above were collected. All samples had their DNA extracted and amplified with eight pairs of heterologous microsatellites. The analysis showed that all assessed loci have simple Mendelian inheritance and independent segregation, and are, therefore, suitable for studies of mating system, genetic structure of populations and paternity analysis. It was also noted that the two populations have high genetic diversity (He ranging from 0.743 to 0.835) being Selvíria samples more diversified. The levels of genetic divergence among populations were high and with a tendency to increase when the generations of offspring were compared. The analysis of the mating system showed that the populations have a mixed-mating system ( m t Ribeirão Preto = 0.840 e m t Selvíria = 0.963) with an increasing of self-fertilization in isolated trees from the urban population. Significant deviations from random mating were observed through of mating among relatives and correlated matings among and within fruits, indicating inbreeding in the populations. The effective number of pollen donors was very low for the same fruit (1.21 in Ribeirão Preto and 1.50 in Selvíria) and higher among fruits of the same tree (8.20 in Ribeirão Preto and 9.8 in Selvíria ). The average distance of the pollen flow accessed by TWOGENER analysis was low in the two populations in both normal (35.4 m in Ribeirão Preto and 57.3 m in Selvíria) and exponential models (39.9 m in Ribeirão Preto and 64.6 m in Selvíria). As the knowledge of inbreeding, correlated matings, self-fertilization and spatial genetic structure are key factors to making decisions for the collection of seeds and planting seedlings, these results may help forest restoration programs and conservation of this species.

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T12:04:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Macrini_CamilaMenezesTrindade_D.pdf: 8857853 bytes, checksum: 881e366a70a23fe7a69154f9b30021f3 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Mestra em Genética e Biologia Molecular

Orientador:: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T17:59:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bartoleti_LuizFilipedeMacedo_M.pdf: 981663 bytes, checksum: 9efdfd02f5146e866175388d02da7638 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Processos históricos e contemporâneos moldaram os padrões de variabilidade genética das espécies da Mata Atlântica, um dos biomas mais diversos do mundo. Além disso, a fragmentação recente das florestas brasileiras pode causar sérios efeitos na estruturação genética das populações naturais, intensificando processos como deriva genética e endogamia. Os efeitos da fragmentação dependem principalmente da matriz entre os fragmentos e das características de dispersão da espécie. As aranhas são organismos que possuem modos de vida bastante diversos e as características de dispersão podem também variar bastante. Nephila clavipes é uma aranha que possui ampla distribuição na Mata Atlântica e considera-se que a espécie é capaz de dispersão por balonismo (dispersão aérea). Os objetivos desse trabalho foram estudar os padrões de variabilidade e estruturação genética em populações de fragmentos de Mata Atlântica, usando N. clavipes. Os estudos foram realizados em micro e macro escala, para inferir padrões de fluxo gênico e relacionar os resultados a aspectos ecológicos e comportamentais da espécie. Além disso, buscou-se explorar aspectos da história evolutiva da espécie e sua corrente distribuição em populações. Para isso, foi sequenciado o gene mitocondrial Citocromo Oxidase I de 323 indivíduos coletados em 15 populações de cinco Estados. Foram calculados índices de diversidade genética, além de parâmetros filogeográficos, por meio de análises bayesianas e de máxima verossimilhança. Todas as populações apresentaram polimorfismo sendo que, em geral, as populações de Minas Gerais apresentaram índices de diversidade mais altos. Os valores médios de diversidade ficaram próximos aos encontrados para outras espécies do gênero. Foi encontrada grande estruturação genética, principalmente em distâncias médias e grandes, com FST geral de 0,30178. O FST no Estado de São Paulo (a microescala geográfica) foi de apenas 0,02996, indicando baixa estruturação em baixas distâncias. A distância genética não apresentou claras relações com a distância geográfica (Teste de Mantel, p > 0,05), o que pode ser devido à dispersão por agentes, inclusive antrópicos. A análise dos valores de FST obtidos apenas com as fêmeas indica que os machos podem ter efeito de manutenção do fluxo gênico em baixas distâncias. A rede de haplótipos e as árvores de máxima verossimilhança e bayesiana indicaram a presença de três clados genéticos, não inteiramente concordantes com a distribuição dos grupos geográficos. As estimativas apontam para divergências entre esses clados genéticos datadas do Pleistoceno, assim como reportado em vários outros organismos que habitam a Mata Atlântica. Nossos resultados mostram uma espécie de invertebrado apresentando padrões filogeográficos semelhantes aos encontrados para organismos de outros grupos, o que pode indicar processos em comum na diversificação das espécies da Mata Atlântica / Abstract: Historic and contemporary processes have shaped the patterns of genetic variability of the species from Brazilian Atlantic Rainforest, one of the world's most diverse biomes. Furthermore, the recent fragmentation of Brazilian Rainforests may cause serious effects in genetic structure of natural populations, intensifying processes like genetic drift and endogamy. Fragmentation effects depend mainly on the matrix between the fragments and the species' dispersion characteristics. Spiders are organisms that show different lifestyles, and dispersion characteristics may also vary within the group. Nephila clavipes is a spider that is widely distributed in the Atlantic Rainforest and it is widely accepted that it is capable of ballooning (aerial dispersal). In the present work, we sought to study the patterns of genetic variability and structure in populations from fragments of Atlantic Rainforest, using N. clavipes. The studies have been made in micro and macro scale, looking forward to infer gene flow patterns and relate the results to ecologic and behavioral aspects of the species. Furthermore, we sought to explore aspects of the species' evolutionary history and its current distribution in populations. With those objectives in mind, we sequenced the mitochondrial gene Cytochrome Oxidase I from 323 individuals sampled in 15 populations from five States. We calculated genetic diversity indexes, phylogeographic parameters, and performed bayesian and maximum likelihood analysis. All populations presented polymorphism and, in general, Minas Gerais populations showed higher diversity indexes. Diversity mean values were close to that found in others species from the genera. We found high genetic structure, mainly at medium and great distances, with a FST value of 0,30178. The FST in São Paulo State (the geographic micro scale) was as low as 0,02996, showing low genetic structure at short distances. The genetic distance didn't show clear relationships with the geographic distance (Mantel test, p > 0,05), which may be due to the agent-guide dispersal, including anthropic agents. The analysis of the FST values obtained exclusively from the females indicates that the males may have a gene flow maintenance effect at short distances. The haplotype network and the bayesian and maximum likelihood phylogenetic trees reported the presence of three genetic clades, not entirely in agreement with the geographic groups' distribution. The estimates point to divergences between the genetic clades dated from the Pleistocene, like reported for various other organisms that live in the Atlantic Rainforest. Our results present an invertebrate species showing phylogeographic patterns similar to that found to other groups, which may indicate common processes in the diversification of Atlantic Rainforest species / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientadora: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T18:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nagy-Reis_MarianaBaldy_M.pdf: 70885205 bytes, checksum: c47da08b5a6303f670a2ad95f9faf467 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O gênero Callicebus é o segundo maior dentre os primatas neotropicais e possui ampla distribuição geográfica. No entanto, também e um dos gêneros menos estudados e pouco se sabe sobre sua ecologia e comportamento. Dessa forma, estudamos a ecologia alimentar e o comportamento de C. nigrifrons, com ênfase na dieta, padrão de atividade, uso de espaço e estratégias adotadas em resposta a abundancia de recursos no ambiente. Observações sistemáticas de um grupo de sauás foram conduzidas ao Iongo de um ano (547hs) em um fragmento de Mata Atlântica em Campinas, SP...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Callicebus is the second largest genus among neotropical primates and is widely distributed. However, it is also one of the less-studied genera and there is little information on its ecology and behavior. Therefore, we studied the feeding ecology and behavior of C. nigrifrons, focusing on its diet, activity pattern, use of space, and strategies in response to food abundance. Information was collected during systematic observations on a titi monkey group during a one-year period (547hs) in an Atlantic Forest fragment in Carnpinas, SP...Note: The complete abstract is available with the full electronic document / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientadores: Eleonore Zulnara Freire Setz, Fernando Gertum Becker / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:26:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lokschin_LuisaXavier_M.pdf: 10314057 bytes, checksum: 6d5803664758c20fc4e44437cfeccda5 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: As características de fragmentos florestais e seu contexto podem contribuir para a manutenção de populações de primatas, assim como mudanças na paisagem ao longo do tempo podem alterar sua distribuição. O objetivo deste trabalho é identificar se características de fragmentos florestais e seu contexto na paisagem são determinantes na distribuição de Alouatta clamitans bem como relacionar padrões de mudanças na paisagem ao longo do tempo com a distribuição da espécie, em uma grande cidade no sul do Brasil (Porto Alegre, RS). Dados de presença e ausência da espécie foram obtidos na região de estudo em quadrículas de 25 ha. Os dados de quadrículas foram convertidos para presença/ausência de bugios nos fragmentos florestais. As variáveis (área, forma, isolamento, antropização, distância de via e de urbanização) foram obtidas por ferramentas de geoprocessamento para os 214 fragmentos. Para a análise da distribuição temporal da espécie, a presença/ausência de bugios em 65 quadrículas foi comparada em dois momentos no tempo (1995 e 2010). Obtivemos variáveis de mudança na paisagem através de ferramentas de geoprocessamento, com base em fotografias aéreas e imagens de satélite. Os fragmentos de mata com bugios são em menor número, mais conectados e estão em contexto menos antropizado. Em 63% das quadrículas houve persistência de bugios, em 3% desaparecimento, em 26% colonização e em 8% manutenção de ausência. As mudanças ocorridas na paisagem não estão diretamente relacionadas com a variação na distribuição da espécie. Os bugios estão distribuídos em boa parte dos remanescentes florestais do município, em fragmentos grandes, conectados e em contexto menos antropizado e se mantém, pelo período de 15 anos, num mosaico de paisagem com fragmentos florestais em contexto predominantemente rural / Abstract: Forest fragment characteristics and context may contribute to the persistence of primate population, as well as landscape alteration in time can change their distribution. Our objective is to identify which are those forest fragments and context characteristics that determine the distribution of Alouatta clamitans and also relate landscapes changes in 15 years time with changes in the species distribution in Porto Alegre, RS. The species has been recorded in the municipality in 25 ha squares. Howler monkey presence or absence data in squares were transposed to forest fragments. Areas, shape, isolation, anthopization and distances from roads and urban areas were obtained by geoprocessing tools. Sixty five squares were visited twice, in 1995 and in 2010 to verify changes in howler monkey distribution. Landscape change analysis was made by geoprocessing tools based on aerial photos and satellite images. There are more fragments with howlers' presence than without, and they are also larger, less isolated and in context less anthropized than those where howlers were absent. In 63% of the squares howlers persisted, in 3% they disappeared, 26% were colonized and kept absent in 8%. There were little changes in the landscape, and they're not related to changes in howlers' distribution. Landscape mosaics, with natural and rural areas seem to contribute to the occurrence, and persistence, of the species. Conservation strategies should keep large and connected areas in predominant rural landscapes / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Flavio Antonio Maes dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T02:00:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cavalcanti_AirtondeDeusCysneiros_D.pdf: 6557195 bytes, checksum: beab670108442a3cbaed85443f577345 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador: João Vasconcellos Neto / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-18T12:02:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cortinoz_JanainaRosa_M.pdf: 4578182 bytes, checksum: 437846becfcb9944124c33d6a5acf722 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Plantas com sementes grandes, como palmeiras, são mais afetadas em áreas defaunadas. A redução de dispersores de sementes resulta em maior acumulo de sementes sob a planta-mãe, onde a predação e mais intensa. Roedores e besouros são os principais predadores de sementes de palmeiras e podem interagir entre si, competindo por sementes, ou com roedores predando larvas de besouros ao consumirem sementes previamente infestadas. Ainda, besouros podem ter suas larvas atacadas por vespas parasitóides. Assim, o objetivo deste trabalho foi investigar os efeitos da dispersão e predação de sementes da palmeira Syagrus romanzoffiana por vertebrados sobre a predação de sementes por besouros e o ataque de parasitóides em locais que diferem entre si quanto a presença de vertebrados dispersores e/ou predadores de sementes. As coletas foram realizadas na Serra do Japi em Jundiaí, Reserva Municipal Mata de Santa Genebra, Bosque dos Jequitibás e no campus da Universidade Estadual de Campinas, em Campinas. A predação de sementes por vertebrados e besouros foi comparada entre as áreas. Dados a respeito da fenologia reprodutiva da palmeira e taxas mensais de remoção de frutos por vertebrados e predação de sementes pré e pós-dispersão por besouros foram coletados para avaliar como as interações ocorrem ao longo do período de frutificação da planta. A predação de sementes por besouros foi negativamente relacionada a predação por vertebrados, sendo maior em áreas onde vertebrados predadores de sementes estão ausentes ou em baixas densidades, como Unicamp e Mata de Santa Genebra. A predação por bruquídeos foi menor na presença de esquilos na Serra do Japi e cutias no Bosque dos Jequitibás, mas a predação por curculionídeos foi menor apenas na Serra do Japi. O que pode indicar que o consumo de sementes por vertebrados deve reduzir a quantidade de sementes disponíveis para besouros bruquídeos, e/ou que ha predação intraguilda de larvas de bruquídeos por esquilos e cutias, mas que cutias, provavelmente rejeitam sementes atacadas por curculionídeos. A produção de flores e frutos imaturos foi semelhante entre as áreas, mas o encontro de frutos maduros foi menor na Serra do Japi e com o pico de produção deslocado em relação as outras áreas, possivelmente devido a alta predação de sementes por esquilos nesse local. A predação de sementes pré-dispersão pelo besouro Revena rubiginosa (Curculionidae) ocorreu em todos os meses e o período de oviposição dos besouros não apresentou relação com a disponibilidade de frutos imaturos. Besouros das famílias Bruchidae e Scolytidae predaram as sementes pós-dispersão, que foi maior onde a remoção de sementes por vertebrados foi menor e não esteve relacionada a disponibilidade de frutos maduros e a predação pré-dispersão. Larvas de R. rubiginosa e de bruquideos foram atacadas por vespas parasitoides da família Braconidae na Unicamp e Mata de Santa Genebra. O período de oviposição das vespas não apresentou relação com as taxas de predação dos besouros, e sim com o clima. Dessa forma, como não foram encontrados indícios que sementes sejam recursos limitantes para besouros, a predação de sementes por esses insetos parece ser limitada pela remoção e predação de sementes por vertebrados. Na ausência de vertebrados dispersores e/ou predadores de sementes que controlem a predação por besouros o ataque de parasitóides as larvas e maior / Abstract: Plants with large seeds such as palm trees are more affected in defaunated areas. The absence of seed dispersers results in a higher accumulation of seeds beneath the parent plant, where seed predation is more intense. Rodents and beetles are major predators of palm seed and can interact with each other, competing for seeds. Rodents can also prey on beetles' larvae when consume seed previously infested, and beetles may have their larvae attacked by parasitoid wasps. Thus, the aim of this work was investigate the effects of seed dispersal and predation of the palm Syagrus romanzoffiana by vertebrates on seed predation by beetles and the parasitoid attack in areas that differ with regard to the presence of vertebrate seed dispersers and/or predators. Data was collected at four sites. One of them at Jundiai, at Serra do Japi, and other three at Campinas, SP: Mata de Santa Genebra Municipal Reserve, Bosque dos Jequitibas and Campinas State University's Campus. Seed predation by vertebrates and beetles was compared between areas. Data regarding to the reproductive phenology and monthly rates of pre- and post-dispersal seed predation by beetles were also collected to assess how the interaction occurs throughout of the fruiting season of the plant. Seed predation by beetles was negatively related to seed predation by vertebrates, being higher in areas where vertebrate seed predators are absent or present in low densities, as at Unicamp and Mata de Santa Genebra. Seed predation by bruchids beetles was lower in the presence of the squirrels at Serra do Japi and agoutis at Bosque dos Jequitibas, but seed predation by weevils was lower only at Serra do Japi. These findings may indicate that the consumption of S. romanzoffiana seeds by vertebrates should reduce the amount of seeds available for bruchids beetles, and/or there are intraguild predation on larvae of bruchids by squirrels and agoutis, but agoutis probably reject seeds infested by weevils larvae. The flower and unripe fruit production was similar in all areas, but ripe fruit production was smaller at Serra do Japi, with a displaced peak when compared to the other sites, probably due to the high seed predation by squirrel in this area. Pre-dispersal seed predation by the beetle Revena rubiginosa (Curculionidae) occurred in all months and the period of beetles' oviposition was not related to the unripe fruits availability. Bruchids and scolytids beetles prey on post dispersed seeds, which was greater where the seed removal by vertebrate was lower. Also the post dispersal seed predation was not related to the ripe fruits availability neither to the pre dispersal seed predation. Larvae of R. rubiginosa and bruchids were attacked by braconids wasps at Unicamp and Mata de Santa Genebra. The oviposition by parasitoids was not related to the rates of seed predation by beetles, but was related to the climate. Thus, in the lack of evidence that seeds are a restrict resource, the seed predation by these insects seems to be limited by seed removal and predation by vertebrates. In the absence of vertebrate seed dispersers and/or predators, which control the seed predation by beetles, the attack by parasitoids wasps is higher / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

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Mozambique is to fifty percent covered by forest, most of which belongs to the biodiverse miombo woodlands. The last decades, Mozambique has been suffering from rapid deforestation. The once continuous forest cover has turned into a mosaic of forest patches, farmland, settlements etc. The remaining forest patches are in many cases very isolated. These forests have distinct edges towards the neighbouring land, which means that the edge zones have different environmental conditions (more light, higher temperatures etc.) and tree species composition than the interior. In order to examine how the forests of Mozambique are affected by edge effects, the highly isolated Nhamacoa forest was studied. An additional aim of the project was to make a floristic inventory of the forest in order to further assess its conservation status. Specimens were collected, pressed and photographed for identification. Edge effects were studied in plots at the edge and in the interior of the forest in a paired design. Trees inside the plots were identified, counted and measured (dbh (diameter at breast height) and height) to search for differences in species richness, diversity, biomass and height-to-dbh ratios. Environmental parameters (air temp., soil temp., light and slope) were also measured. In total, 76 species of trees were sampled and 44 (35 in the interior and 32 at the edge) of these were found inside the plots. The interior plots harboured significantly more individuals and species of trees than their paired edge plots. Additionally, biomass and height-to-dbh ratios were higher in the interior plots than in the edge plots. These differences strongly suggest that the Nhamacoa forest is affected by edge effects, although none of the measured environmental parameters could explain why. That the Nhamacoa forest is affected by edge effects goes in line with the research hypothesis and shows that it is important to maintain large and intact pieces of forest in order to preserve the Mozambican miombo forests. For future studies, additional environmental parameters (wind speed, humidity etc.) could be examined in order to better explain the presence of edge effects in the Nhamacoa forest.

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