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Caracterização estrutural e bioquímica das arabinanases de Bacillus licheniformis / Structural and biochemical characterization of arabinanases from Bacillus licheniformisErick Giancarlo Suclupe Farro 28 April 2016 (has links)
As mudanças climáticas estão causando prejuízos em vários setores da economia mundial. Na reunião da COP21, que teve como foco estas mudanças climáticas, participantes do mundo todo decidiram tomar atitudes urgentes para tentar conter aumento da temperatura média global. Dentro deste cenário, a produção e o consumo de energia têm uma importância central, onde fontes de energia renováveis vêm sendo preferidas às fontes de energias fósseis. O Brasil tem uma participação importante na geração de energia renovável mundial aportando um 40% do total de sua matriz energética. A degradação dos componentes da parede celular vegetal tem um vasto potencial na geração de biocombustíveis e outros compostos verdes a partir da celulose, hemicelulose e lignina. Para isto estudos das enzimas capazes de degradas estes componentes vem sendo realizados, com ênfase nas enzimas hidrolases de glicosídeos. Dentre as hidrolases, encontram-se as arabinanases, enzimas capazes de hidrolisar o arabinano, componente polissacídeo da hemicelulose, em L-arabinose. Neste trabalho, estudos envolvendo duas arabinanases de Bacillus licheniformis foram realizados, iniciando na etapa de clonagem dos genes. Os produtos foram transformados em Escherichia coli e expressos e purificados. A avaliação da estabilidade térmica indicou uma afinidade das enzimas por metais divalentes. Tentativas de cristalização resultaram na formação de um cristal, que possibilitou a determinação da estrutura uma das arabinanases. Através de ensaios bioquímicos, foi determinada a especificidade por substrato, temperatura e pH ótimos e a atividade frente a metais. Foi observado que as enzimas são seletivas para arabinano não ramificado, tem temperatura ótima em 45 e 40 graus, para BlAbn-1 e BlAbn-2, respectivamente, e pH ótimo em 8 e 7. Por último, foram realizados ensaios complementares de sinergismo e atividade oxidativa. Embora os ensaios de atividade oxidativa tenham sido inconclusivos, os ensaios de sinergismo mostraram que a enzima BlAbn-1 é capaz de aumentar em 30% a atividade do coquetel enzimático Accellerase 1500 sobre biomassa pré-tratada e sobre celulose pura. Este efeito é ainda maior na presença de sulfato de níquel. / Climate change is causing losses in different sectors of the world economy. At the meeting of COP21, focused on climate changes, participants from around the world decided to take urgent actions to try to halt the increase in global average temperature. Within this scenario, the production and consumption of energy are of central importance, where renewable energy sources have been preferred to fossil fuels. Brazil has an important role in the global renewable energy generation by contributing 40% of its total energy mix. The degradation of the components of plant cell wall has a vast potential in the generation of biofuels and other green chemical from cellulose, hemicellulose and lignin. Thus, studies of enzymes that degrade these components have been carried out, with emphasis on glycoside hydrolases. Among the hydrolases are the arabinanases, enzymes capable of hydrolyzing arabinan, a polysaccharide component of hemicellulose, in L-arabinose. In this work, studies involving two arabinanases from Bacillus licheniformis were carried out, starting in gene cloning step. The products were transformed into Escherichia coli, expressed and purified. The evaluation of the thermal stability of the enzymes showed an affinity for divalent metals. Crystallization attempts resulted in the formation of a single crystal, which made it possible to determine the crystal structure of one arabinanase. Through biochemical assays, it was determined the substrate specificity, optimum temperature and pH and activity against metals. It was observed that the enzymes are selective for non-branched arabinan, have optimum temperature at 45 and 40 degrees, to BlAbn-1 and BlAbn-2, respectively, and optimum pH of 8 and 7. Finally, additional tests were performed to evaluate the possible synergism and oxidative activity. Although the oxidative activity assays were inconclusive, the synergism tests showed that BlAbn-1 is able to increase by 30% the activity of the enzymatic cocktail Accellerase 1500 on pre-treated biomass and on pure cellulose. This effect is even greater in the presence of nickel sulfate.
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Isolamento e caracterização de α-fucosidases digestivas em Arachnida. / Isolation and characterization of digestive α-fucosidases in Arachnida.Rodrigo Moreti da Silva 16 November 2010 (has links)
Os artrópodes constituem as formas mais abundantes de vida animal no planeta. O sistema digestivo dos Arthropoda é uma das mais importantes superfícies de contato com o ambiente. Pouco se conhece a respeito do sistema digestivo dos aracnídeos. Identificamos as principais carboidrases digestivas em três Arachnida modelo: Tityus serrulatus, Amblyomma cajennense e Nephilengys cruentata. As α-fucosidases são glicosídeo hidrolases que catalisam a hidrólise de ligações glicosídicas entre uma fucose ligada a outro carboidrato ou outro tipo de molécula. Estas enzimas são fundamentais no processamento de glicoproteínas e glicolipídeos. Observamos altas atividades de α-fucosidases em todas as espécies estudadas e estas enzimas foram isoladas e caracterizadas. / Arthropods are the most abundant animal life form on the planet. The digestive system of Arthropoda is one of the most important areas of contact with the environment. The study of Arachnida digestive enzymes has been sporadic and remains a largely unexplored area. We identified the most important digestive carbohydrases in three Arachnida models: Tityus serrulatus, Amblyomma cajennense and Nephilengys cruentata. The α-fucosidases are glycoside hydrolases that catalyze the hydrolysis of glycosidic links between a fucose linked to other carbohydrate or another type of molecule. These enzymes are essential in the processing of glycoprotein and glycolipids. We showed that all models tested presented high activities of digestive α-fucosidases and these enzymes were isolated and characterized.
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Intoxicação espontânea e experimental por tifton 68 (Cynodon nlemfuensis vanderyst) em bovino / Spontaneous and experimental poisoning by Tifton 68 (Cynodon Nlemfuensis Vanderyst) in cattleGalindo, Claudia Martins 20 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Tifton 68 (Cynodon nlemfuensis Vanderyst) is a grass cultivated in southern Brazil and it causes peracute clinical manifestations of dyspnea, swallowing difficulty, muscle tremors, bloat and recumbency in cattle. After starting the first clinical signs, death occurs quickly. Gross and microscopic lesions were not observed. The present study describes the epidemiological, clinical and lesional spontaneous tifton 68 poisoning that occurred in Rio do Sul, Pouso Redondo, Taió and Rio do Campo, in Santa Catarina State. Data were obtained through information from Animal Pathology Laboratory, Centro de Ciências Agroveterinárias (LAPA / CAV) archives. Experimentally was performed the hydrocyanic acid concentration in fresh and dry leaves and treatment with specific antidote solution. The disease was experimentally reproduced with the administration of tifton 68 green leaves for two cattle in doses starting of 10.3 g/kg. The cyanogenic poisoning was confirmed by the immediate response to sodium thiosulfate and sodium nitrite intravenous treatment. Tifton 68 green leaves samples had positive response to picric acid paper test, with mild reaction, turning orange in color. Dried tifton 68 leaves showed no toxicity even at high doses (18 and 27 g/kg) being safe for cattle consumption / Tifton 68 (Cynodon nlemfuensis Vanderyst) é uma gramínea cultivada na região sul do Brasil e é responsável por manifestações clínicas superagudas de dispneia, dificuldade de deglutição, tremores musculares, timpanismo e decúbito em bovinos. A morte ocorre rapidamente após o inicio dos primeiros sinais e não são encontradas alterações macro e microscópicas significativas. O presente estudo descreve os aspectos epidemiológicos, clínicos e lesionais da intoxicação espontânea por tifton 68 que ocorreu nos municípios de Rio do Sul, Pouso Redondo, Taió e Rio do Campo, estado de Santa Catarina, registrados no Laboratório de Patologia Animal do Centro de Ciências Agroveterinárias (LAPA/CAV). Experimentalmente foram avaliados a concentração de ácido cianídrico nas folhas verdes e secas dessa planta e o uso de solução antídoto específica. A reprodução experimental consistiu na administração de folhas verdes de tifton 68 para dois bovinos com doses a partir de 10,3 g/kg. O quadro de intoxicação cianogênica foi confirmado pela imediata resposta ao tratamento endovenoso com tiossulfato de sódio e nitrito de sódio. As amostras da planta verde forneceram resposta positiva ao teste do papel picro-sódico. O feno de tifton 68 não demonstrou qualquer toxicidade, mesmo em doses maiores (18 e 27 g/kg), sendo seguro para a alimentação de bovinos
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