This thesis describes searching for high-risk clusters of portals in the Ingress game by using data mining techniques. The work contains background for descibed problematics and methods and experiments used to search for theese information.

The thesis deals with the acceleration of backpropagation neural networks using graphics chips. To solve this problem it was used the OpenCL technology that allows work with graphics chips from different manufacturers. The main goal was to accelerate the time-consuming learning process and classification process. The acceleration was achieved by training a large amount of neural networks simultaneously. The speed gain was used to find the best settings and topology of neural network for a given task using genetic algorithm.

This master's thesis deals with cellular automata and further deals possibility of their global control. It describes the implementation of simulator of globally controlled cellular automata. The goal is, design and test the classification of globally controlled cellular automata. Classification is based on evaluation of influence of each parameter of automata on their dynamics.

This thesis deals with text mining. It focuses on problems of document classification and related techniques, mainly data preprocessing. Project also introduces the SVM method, which has been chosen for classification, design and testing of implemented application.

Tato diplomová práce se zabývá možností využití bezeztrátových kompresních algoritmů ke klasifikaci biologických sekvencí. Nejdříve je představena literární rešerše o bezeztrátových kompresních algoritmech, která byla využita k výběru slovníkového algoritmu vytvořeného A. Lempelem a J. Zivem v roce 1976 (LZ77). Tento algoritmus je běžně používán k datové kompresi a v předkládané práci byl modifikován tak, aby umožnil klasifikaci biologických sekvencí. K algoritmu byly navrženy další modifikace, které rozvíjí jeho klasifikační možnosti. V průběhu práce byla sestavena sada datasetů biologických sekvencí, která umožnila podrobné testování algoritmu. Algoritmus byl porovnán s klasickými zarovnávacími metodami: Jukes-Cantor, Tamura a Kimura. Bylo ukázáno, že algoritmus dosahuje srovnatelných výsledků v oblasti klasifikace biologických sekvencí a dokonce je u 20% datasetů překonává. Lepší výsledky dosahuje zejména u sekvencí, jež jsou si vzájemně vzdálené.

Software projects go through a phase of maintenance and, in case of open source projects, through hard development process. Both of these phases are prone to regressions, meaning previously working parts of system do not work anymore. To avoid this behavior, systems are being tested with long test suites, which can be sometimes time consuming. For this reason, prediction models are developed to predict software regressions using historical testing data and code changes, to detect changes that can most likely cause regression and focus testing on such parts of code. But, these predictors rely on static code analysis without deeper semantic understanding of the code. Purpose of this master thesis is to create predictor, that relies not only on static code analysis, but provides decisions based on code semantics as well.

Tato práce se zabývá klasifikací paketů v počítačových sítích. Klasifikace paketů je klíčovou úlohou mnoha síťových zařízení, především paketových filtrů - firewallů. Práce se tedy týká oblasti počítačové bezpečnosti. Práce je zaměřena na vysokorychlostní sítě s přenosovou rychlostí 100 Gb/s a více. V těchto případech nelze použít pro klasifikaci obecné procesory, které svým výkonem zdaleka nevyhovují požadavkům na rychlost. Proto se využívají specializované technické prostředky, především obvody ASIC a FPGA. Neméně důležitý je také samotný algoritmus klasifikace. Existuje mnoho algoritmů klasifikace paketů předpokládajících hardwarovou implementaci, přesto však tyto přístupy nejsou připraveny pro velmi rychlé sítě. Dizertační práce se proto zabývá návrhem nových algoritmů klasifikace paketů se zaměřením na vysokorychlostní implementaci ve specializovaném hardware. Je navržen algoritmus, který dělí problém klasifikace na jednodušší podproblémy. Prvním krokem je operace vyhledání nejdelšího shodného prefixu, používaná také při směrování paketů v IP sítích. Tato práce předpokládá využití některého existujícího přístupu, neboť již byly prezentovány algoritmy s dostatečnou rychlostí. Následujícím krokem je mapování nalezených prefixů na číslo pravidla. V této části práce přináší vylepšení využitím na míru vytvořené hashovací funkce. Díky použití hashovací funkce lze mapování provést v konstantním čase a využít při tom pouze jednu paměť s úzkým datovým rozhraním. Rychlost tohoto algoritmu lze určit analyticky a nezávisí na počtu pravidel ani na charakteru síťového provozu. S využitím dostupných součástek lze dosáhnout propustnosti 266 milionů paketů za sekundu. Následující tři algoritmy uvedené v této práci snižují paměťové nároky prvního algoritmu, aniž by ovlivňovaly rychlost. Druhý algoritmus snižuje velikost paměti o 11 % až 96 % v závislosti na sadě pravidel. Nevýhodu nízké stability odstraňuje třetí algoritmus, který v porovnání s prvním zmenšuje paměťové nároky o 31 % až 84 %. Čtvrtý algoritmus kombinuje třetí algoritmus se starším přístupem a díky využití několika technik zmenšuje paměťové nároky o 73 % až 99 %.

This diploma thesis deals with the acquisition and classification of movement using accelerometer and gyroscope data. The theoretical part contains biomechanics of movement, sensors used in the motion analysis and customization options and classification of measured data. A description of the components of the acquisition system, its implementation and placement on the body of the measured person are introduced in this work as well. To verify the functionality of the device, measured data was compared with the data measured by mobile application Sense-it. Classification of motion was inplemented by two methods in the Matlab software environment. The first one uses a vector of three parameters, the other classifies the movement by the absolute value of the difference in signal deflections.

The aim of this diploma thesis is to monitor glacier change in the Cordillera Blanca in the period from 1987 to 2014. This diploma thesis focuses on three mountains and eleven glaciers in the northern part of the Cordillera Blanca. The input data consist of 29 Landsat scenes (Landsat 4,5,7 and 8) and the ASTER global digital elevation model version 2. Semi-automatic classification algorithm is created based on threshold values detected by spectral analyses of selected land cover types in the Cordillera Blanca. Additionally, the mean snowline (equilibrium line) altitude change is computed for all of the three mountains and eleven glaciers. Besides, glacier change depending on slope and aspect is evaluated. The results of this diploma thesis are presented in maps, tables and charts. The results of the classification are compared with the GLIMS Glacier Database and the field measurements provided by Adam Emmer, MSc. Finally, the advantages and disadvantages of the new Landsat 8 satellite sensor are discussed. Key words: Remote sensing, Landsat, classification, ice and snow detection, ELA, Cordillera Blanca

The Pilsen region suffers the highest incidence of kidney tumours worldwide. Approximately 240 new cases diagnosed as C64 (malignant renal tumours outside the pelvis) were recorded in this region of about 580,000 inhabitants in 2015. Clear renal cell carcinoma has long held first place as the most common tumour, with papillary renal cell carcinoma (pRCC) being the second most frequently operated kidney tumour at the Urology Department of the University Hospital in Pilsen. The 2016 WHO classification of kidney tumours recognizes officially only the stratification of pRCC to type 1 (pRCC1) and type 2 (pRCC2). Unfortunately, the current division does not correspond with knowledge derived from everyday practice. Most clinical trials involving pRCC do not differentiate between the subtypes, adhering only to the official type 1 and 2 divisions and the atypical papillary forms being excluded from their studies. We therefore have to face the question of whether the histological pRCC subtype affects the risk of recurrence, or death, in surgically treated patients. The aim of this dissertation work is to take into consideration also all other papillary types which differ from characterization of pRCC1 and pRCC2. The analyses of a group of patients with surgically treated and histologically verified pRCC at...