Québec Université Laval, Bibliothèque 2014

Dans son programme Qmentum, Agrément Canada utilise la méthodologie des traceurs pour procéder à l’évaluation des établissements de santé au Canada. Adaptée à partir du modèle du Joint Commission aux États-Unis, cette méthode est utilisée depuis 2008. En se basant sur le Modèle synergique des qualités évolutives de Plante et Bouchard (2002), cette enquête a permis d’interroger les visiteurs d’Agrément Canada afin de déterminer quelle est, selon leur perception, la qualité de la méthodologie des traceurs sous l’angle de cinq qualités transversales et de déterminer quelles sont ses forces et ses faiblesses. La cohérence ainsi que la synergie s’avèrent être les deux qualités transversales dont les indicateurs ont un effet significatif sur la qualité de l’information obtenue. La contrainte du temps quant à elle est la plus grande faiblesse dans l’application de la méthodologie des traceurs et ce, à plusieurs niveaux. / As part of the Qmentum program, Accreditation Canada uses the tracer methodology to evaluate the quality of services in Canada’s health care institutions. Based on the model used by the Joint Commission in the United States of America, the tracer methodology is in place since 2008. Based on the MSQE from Plante et Bouchard (2002), this study allowed to question Accreditation Canada’s surveyors to determine, according to their perception, the tracer methodology’s quality in terms of five transversal qualities and to determine what are its strengths and weaknesses. Consistency and synergy are the two transversal qualities that significantly affect the tracer methodology’s effectiveness. Meanwhile, the time constraint is its biggest weakness, affecting various aspects of it.

Le paradigme multi-agents est largement utilisé pour concevoir des outils de simulation dédiés à la chaîne de création de valeur. En dépit de son attrait et de son ample utilisation dans la recherche, la technologie agent et son intégration avec des outils de planification de la chaîne de création de valeur distribuée représente encore un champ à explorer. En particulier, il existe une lacune de recherche dans la phase d'analyse des cadres méthodologiques basés sur le concept des multi-agents. Cette phase représente le premier effort de modélisation et influence considérablement le processus de création entier, ainsi que les simulations résultantes. Afin de contribuer à combler cette lacune, cette thèse présente un cadre méthodologique appelé FAMASS -Architecture FORAC pour modéliser des simulations multi-agents pour la planification des chaînes de création de valeur. L'approche FAMASS a l'intention de fournir une représentation uniforme d'un système distribué de planification avancée (d-APS) qui utilise la technologie multi-agents, un support à des analystes de simulation pour définir clairement les besoin fonctionnels des utilisateurs de scénarios de simulation, ainsi que leurs définitions expérimentales, et un guide aux analystes pour déployer les modèles d'analyse en modèles de spécification et de design. Par conséquent, la capitalisation de la connaissance et du savoir-faire des acteurs de la simulation est améliorée. Les scénarios de simulation sont donc modélisés plus vite, de façon plus précise, et ils sont éventuellement développés et utilisés. Le cadre méthodologique proposé est validé à travers une méthode de preuve-de-concept fondée sur un cas industriel solide et réaliste.

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2014-2015 / Ce projet vise à développer un outil de prédiction précoce du risque de diabète gestationnel (DG). Il est basé sur une étude de cohorte prospective chez 7929 femmes enceintes recrutées entre 2005 et 2010 dans la ville de Québec. La validation externe de quatre modèles prédictifs a permis d’identifier des variables cliniques (ex. : antécédent de DG, indice de masse corporelle, histoire familiale de diabète) particulièrement performantes pour prédire le développement d’un DG nécessitant une insulinothérapie. Un modèle original combinant ces variables cliniques avec trois marqueurs biochimiques (HbA1c, SHBG et hsCRP entre 14 et 17 semaines de grossesse) a permis d’obtenir une aire sous la courbe ROC de 0,90 et une sensibilité de 72% à un taux de faux positifs de 10%. Ce projet a permis d’identifier des facteurs prédictifs du DG identifiables tôt en grossesse afin de permettre une meilleure prise en charge des femmes à haut risque. / This project aims to develop an early risk-prediction tool for gestational diabetes (GDM). This is a case-control study from a prospective cohort including 7929 pregnant women recruited between 2005 and 2010 in the Quebec City metropolitan area. External validation of four predictive models proposed in the literature allowed the identification of clinical variables (including past history of GDM, body mass index and family history of diabetes) performing particularly well for the prediction of GDM requiring insulin therapy. An original model combining some of these clinical variables with three readily available biochemical markers (HbA1c, SHBG and hsCRP measured between 14 and 17 weeks of gestation) yielded area under the ROC curve of 0.90 and sensitivity of 72% at a false-positive rate of 10%. This project allowed the identification of predictive factors for GDM available early in pregnancy, which could improve the management of high risk women.

La recoverine et la GCAP-1 sont des protéines de la famille des neuroprotéines sensibles au calcium (NCS). Ces protéines sont N-myristoylées et possèdent des motifs EF-hand permettant la liaison du calcium. Elles participent à la phase de recouvrement de la phototransduction visuelle qui a lieu dans les segments externes des photorécepteurs. La liaison membranaire de la recoverine et de la GCAP-1 a été principalement étudiée à l'aide de films monomoléculaires de phospholipides. Nous proposons une méthode d'analyse qui permet d'identifier l'affinité des protéines aux monocouches de phospholipides. Cette méthode pourrait permettre d'identifier rapidement la liaison périphérique des protéines aux monocouches lipidiques. Nous encourageons son utilisation afin de déterminer si elle peut constituer les bases d'un modèle d'analyse plus général. La recoverine est une protéine extrinsèque amphitropique. En absence de calcium, le groupement acyle de la recoverine est enfoui dans une poche hydrophobe. Par contre, en présence de calcium, des réarrangements structuraux permettent l'extrusion de ce groupement myristoyle et induisent la liaison membranaire de la recoverine. Nous avons déterminé que la recoverine possède une forte affinité pour les monocouches de phospholipides anioniques. Cette affinité semble induite par la présence d'un cluster de charges positives situé à proximité du groupement myristoyle. De plus, la N-myristoylation semble être responsable d'une augmentation de la distribution latérale de la liaison membranaire de cette protéine. Ces travaux amènent maintenant à s'intéresser à l'influence de la teneur des membranes discales des photorécepteurs en phospholipides polyinsaturés sur la liaison membranaire de la recoverine. Sur la base d'une structure à haute résolution, il a été déterminé que la GCAP-1 ne possède pas un mécanisme de calcium-myristoyl switch fonctionnel. Toutefois, nous présentons une analyse des structures des protéines de la famille des NCS qui suggère que l'extrusion du groupement myristoyle de la GCAP-1 serait possible en présence de membranes. Nous avons montré qu'une fraction de ces groupements acyles s'insère dans les membranes. La GCAP-1 possède par ailleurs une forte affinité pour les phospholipides anioniques. Nous proposons un mécanisme d'activité pour cette protéine. Des études structurales seront nécessaires afin d'infirmer ou de confirmer ce mécanisme.

Le présent mémoire se divise en deux parties. La première décrit le développement d’une nouvelle méthodologie de synthèse de peptides analogues contraints par une sulfahydantoïne. La deuxième partie décrit la synthèse de nouveaux composés dérivés du motif sulfahydantoïne au potentiel antibactérien. Le premier chapitre est consacré à la description des agents thérapeutiques peptidiques et de leurs applications. Il est sujet également de l’intérêt de développer de nouveaux peptides contraints. Le deuxième chapitre décrit la synthèse du motif sulfahydantoïne ainsi que la synthèse de peptides analogues contraints sur support solide et en solution. Le troisième chapitre traite des résultats conformationnelles des peptides contraints obtenus à l’aide de la spectropolarimétrie de dichroïsme circulaire et par la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire. Le quatrième et dernier chapitre porte sur la synthèse de nouveaux composés dérivés de la sulfahydantoïne et leur caractérisation. Finalement, les résultats des tests biologiques réalisés avec les composés sont présentés.

L'apprentissage automatique (AA) a permis des progrès inégalés en nutrition, notamment dans les domaines de l'évaluation alimentaire, du traitement de données massives associées aux sciences « omiques », de l'analyse des médias sociaux et de la prédiction du risque de maladie. Toutefois, l'AA n'est pas encore exploité dans le domaine de la prédiction de comportements associés à la saine alimentation. Les interventions et politiques de santé publique en nutrition mises sur pied jusqu'à ce jour ne semblent pas porter fruit puisque les choix et comportements alimentaires au niveau populationnel restent sous-optimaux. Afin de contrer l'épidémie de maladies chroniques qui découle d'une alimentation sous-optimale au Québec, il est essentiel d'identifier les facteurs individuels, sociaux et environnementaux qui déterminent les choix alimentaires de la population. Plusieurs études soutiennent l'idée que les algorithmes d'AA ont une meilleure capacité de prédiction que des modèles statistiques traditionnels, et pourraient donc permettre de mieux documenter les facteurs qui influencent les choix alimentaires de la population. Cependant, d'autres études n'ont rapporté aucune valeur ajoutée de l'utilisation d'algorithmes d'AA pour la prédiction du risque de maladies par rapport à des approches prédictives plus traditionnelles. L'objectif de ce projet de maîtrise était donc de comparer la performance de neuf algorithmes d'AA à celle de deux modèles statistiques traditionnels pour prédire un comportement en nutrition, soit une consommation adéquate de légumes et fruits, à partir de 525 variables individuelles, sociales et environnementales reliées aux habitudes alimentaires. Les résultats de ce mémoire démontrent que les algorithmes d'AA ne prédisent pas mieux la consommation adéquate de légumes et fruits que les modèles statistiques traditionnels. Cependant, étant une des premières études à comparer les algorithmes d'AA à des modèles statistiques traditionnels pour prédire un comportement en nutrition, davantage d'études comparant les deux approches doivent être menées afin d'identifier celles qui nous permettront de mieux documenter les déterminants de la saine alimentation. / Machine learning (ML) has offered unparalleled opportunities of progress in nutrition, including in the fields of dietary assessment, omics data analysis, social media data analysis and diet-related health outcome prediction. However, ML has not yet been explored for the prediction of dietary behaviours. Despite several public health interventions and policies in nutrition, adhering to heathy eating remains a challenge. In order to address the epidemic of chronic disease caused by unhealthy eating habits, it is necessary to better identify the individual, social and environmental determinants of healthy eating in the Quebec population. Many studies demonstrate that ML algorithms predict health outcomes with higher accuracy than traditional statistical models, and thus, could allow better identifying the factors that influence food choices in the Quebec population. However, other studies have reported no added value of using ML algorithms for disease risk prediction compared to traditional approaches. The aim of this master's project was to compare the accuracy of nine ML algorithms and two traditional statistical models to predict adequate vegetable and fruit consumption using a large array of individual, social and environmental variables. The results of this study demonstrate that ML algorithms do not predict adequate vegetable and fruit consumption with higher accuracy than traditional statistical models. However, being one of the first studies to compare ML algorithms and traditional statistical models to predict dietary behaviours, more studies comparing both approaches are needed to determine which models will allow better identifying the determinants of healthy eating.

Cette étude de devis méthodologique, avait comme objectifs : 1. d'effectuer l'adaptation culturelle de l'outil Nursing Activities Score (NAS) pour le contexte canadien-français et 2. d'examiner la performance psychométrique de la version adaptée selon : la fidélité, en utilisant le critère d'équivalence entre juges et la validité, à partir des critères de validité de groupes connus et convergente. L'adaptation culturelle du NAS et de son tutoriel a été faite selon les étapes : traduction, synthèse, retraduction, évaluation par un comité d'experts et prétest. Pour évaluer l'équivalence entre juges, l'évaluation de l'accord entre trois évaluateurs (deux paires d'infirmières distinctes et un expert) a été faite par les coefficient intra-classe et Kappa-Fleiss Le test du Khi-carré et le test t de Student ont été utilisés pour tester la validité des groupes connus, et le coefficient de Pearson, la validité convergente. En ce qui a trait à la fidélité, il a été observé un coefficient intra-classe d'environ 0,90, indiquant un bon accord global entre les trois juges. En examinant les items séparément, 15/23 items ont présenté de coefficients Kappa-Fleiss d'environ 65 %, indiquant évidence d'accord. Les items avec coefficients plus bas étaient plutôt ceux des réponses à choix multiples. La validité des groupes connus a été confirmée pour la différence entre les items dans les deux unités de soins intensifs de l'étude. La validité convergente a été démontrée par la corrélation entre le score NAS à l'admission et la durée de séjour ainsi que le nombre de complications et la sévérité clinique. Les résultats de cette étude permettent de conclure que la version canadienne-française du NAS a démontré évidences satisfaisantes de fidélité ainsi que certaines preuves de sa validation. La formation des infirmières pour l'application judicieuse du NAS est impérative. Des études futures doivent continuer à tester d'autres propriétés de validation de l'outil. / This methodological study was aimed at 1. carrying out the cultural adaptation of the tool Nursing Activities Score (NAS) for the French-Canadian context and 2. examining the psychometric properties of the adapted version according to: reliability, using the criterion of interrater realibility, and validity, using the criteria of known groups and convergent validity. The cultural adaptation of NAS and its tutorial was performed in the following stages: translation, synthesis, back-translation, evaluation by an expert panel, and pretesting. To assess inter-judge equivalence, agreement between three raters (two distinct pairs of nurses and one expert) was assessed by the intra-class and Kappa-Fleiss coefficients. The Chi-square test and Student's T-test were used to test the validity of the known groups, and the Pearson's coefficient was used to test convergent validity. With respect to reliability, an intra-class coefficient of about 0.90 was observed, indicating good overall agreement among the three judges. Examining the items separately, 15/23 items presented Kappa-Fleiss coefficients of about 65%, indicating evidence of agreement. The items with lower coefficients were more likely those with multiple choice responses. The validity of the known groups was confirmed by the difference between the items in the two intensive care units of the study. Convergent validity was at least partially confirmed by the correlation between the NAS score at admission and length of stay, as well as the number of complications and clinical severity. The results of this study conclude that the NAS - French-Canadian version demonstrated satisfactory evidence of reliability, as well as some evidence of its validation. Training of nurses in the judicious application of NAS is imperative. Future studies should continue to test other validation properties of the tool.

Ce mémoire propose une étude de la méthode cartésienne selon une perspective géométrique. Selon le philosophe français, l'illustration la plus parfaite de la méthode devrait se réaliser dans la géométrie. Est-ce que Descartes suit bien ses règles méthodologiques dans sa propre pratique de la géométrie? S'il n'est pas à même de respecter et de suivre ses principes, là où la méthode devrait s'appliquer le plus facilement, le plus adéquatement à la pratique, eh bien a fortiori, nous pourrons douter, dans une certaine mesure, de son application dans les autres champs du savoir, notamment en science physique et en morale.

Les norovirus sont les principaux agents responsables des gastroentérites aiguës d'origine virale à travers le monde, pouvant être transmis par des aliments contaminées. La quantité de particules virales retrouvée dans les aliments dépasse rarement la dose minimale infectieuse. Une étape de concentration s'avère nécessaire pour la détection de ces virus dans les aliments. L'objectif de ce projet était de développer et de valider une méthode de concentration immuno-magnétique combinée à l'amplification en temps réel pour une détection spécifique et sensible des norovirus. Une séquence peptidique caractéristique de la capside virale a été sélectionnée pour la production d'anti-norovirus spécifiques du génogroupe II. Les anticorps couplés à des billes magnétiques ont été utilisés pour concentrer les norovirus à partir d'aliments artificiellement contaminés. Les norovirus capturés ont été lysés et l'ARN viral libéré a été détecté par RT-PCR en temps réel. Les norovirus ont été détectés à une concentration de 20 unités RT-PCR.