Biosensors are nowadays a powerful tool to enable the detection of specific biological interactions and to evaluate the concentration dependence in the response. A biosensor usually consists of three different parts: the sample to be measured, the transducer and the electronic system that amplifies the signal, analyzes the data and brings a result to the final user. The transducer includes the bioreceptor (which specifically interacts with the sample) and the interface that transforms the recognition from the bioreceptor into a measurable signal. When the analyte interacts with the bioreceptor, the transducer sends a signal that is processed by the electronics. All this process occurs in an efficient, quick, cheap, easy, simple and specific way. Regarding the type of the transductor, the biosensors can be electrochemical, optical, acoustic, magnetic or thermometric; but overall the most powerful ones are the optical biosensors, and among them the grating coupler. As a technique for investigating processes at the solid/liquid interface, presents high mechanical stability, immunity to electromagnetic interferences and pushes the sensitivity to levels even higher than other techniques and allows for the direct monitoring of macromolecular adsorption. Taking advantage of the last advances in nanotechnology, the goal of this thesis is to study the versatility of an Optical Grating Coupler Biosensor. The design of new grating sensor chips will be investigated, a new calibration technique for the sensors will be proposed and, taking advantage of the technique, different biomedical scenarios will be tested. / Esta tesis consiste en el diseño, fabricación y test de un Biosensor Óptico basado en redes de difracción y sus aplicaciones en biomedicina. Los biosensores ópticos son dispositivos que detectan interacciones biomoleculares específicas mediante un transductor óptico. Exhiben alta sensibilidad, alta estabilidad mecánica, son inmunes a las interferencias electromagnéticas y permiten medidas no destructivas. En los Biosensores Ópticos por Onda Evanescente un modo guiado se propaga a lo largo de la guía de ondas mientras que la onda evanescente interactúa con la superficie del sensor, reconociendo cualquier interacción biomolecular que provoque una modificación en el índice de refracción efectivo de la guía óptica. En este caso, la inserción de luz láser en la guía óptica se produce con ayuda de una red de difracción grabada en la superficie del sensor. Para un ángulo muy preciso se excita un modo guiado. Como consecuencia de las reacciones en la superficie se produce un cambio en el ángulo de acoplo. La medida en tiempo real del ángulo de acoplo, en función de la actividad bioquímica en la superficie es la base de este tipo de biosensor óptico. El objetivo es fabricar sensores de bajo coste en polímero y también en distintos materiales que permitan calibrar otras técnicas. Otro objetivo de esta tesis es la calibración de los sensores y de las distintas soluciones buffer comúnmente usadas en biosensado. Como aplicación, se ha usado un equipo comercial (Optical Waveguide Lightomode Spectroscopy, OWLS, MicroVacuum) para estudiar, mediante control electroquímico, el crecimiento y la liberación de multicapas de PLL/DNA para aplicaciones en administración de fármacos. También se ha usado el OWLS para optimizar la inmovilización de receptores olfativos en un dispositivo biosensor para el desarrollo de una nariz bioelectrónica.

La senescència floral, procés que condueix a la mort de la flor (i les seves peces florals) durant l’etapa més terminal del seu desenvolupament, té una important repercussió en floricultura. Per tant, el millor coneixement del procés pot permetre’ns adreçar els esforços cap a la millora de la longevitat floral i qualitat de la flor tallada. Generalment, l’etilè juga un paper clau en la regulació de la senescència floral (flors sensibles a l’etilè; clavell, rosa, etc.), tot i que, depenent de l’espècie, el procés també pot no estar controlat per l’efecte de l’etilè (flors insensibles, Lilium, Iris, etc.). Actualment i donat que la majoria de flors pateixen una senescència sensible a l’etilè, la majoria d’estudis han estat clàssicament enfocats a la descripció dels canvis ocasionats pel control de l’etilè sobre el procés, quedant més obscurs els mecanismes seguits per les espècies on l’etilè no és clau. Per tal d’aprofundir en el coneixement de la via insensible a l’etilè, es determinaren les variacions dels principals reguladors endògens de senescència (fitohormones, estrès oxidatiu i sucres) al llarg del desenvolupament dels diversos teixits florals del Lilium L.A. ‘Courier’, revelant comportaments diferencials entre els teixits i al llarg del desenvolupament floral. Amb intenció de millorar la qualitat i la longevitat de la flor tallada de Lilium, es van comparar ambdós desenvolupaments natural (flor no tallada, unida a la planta) i artificial (flor tallada), mostrant que la reducció de la longevitat floral observada com a conseqüència del tall de la vara floral es veia també reflectida per una accentuació de les variacions endògenes. D’altra banda, l’adició de sacarosa exògena al gerro permetia contrarestar aquest escurçament de la longevitat, mantenint la flor oberta per més temps gràcies a ambdós efectes promotor l’obertura i retardant de la senescència floral. Alhora, l’efecte de la sacarosa implicà també variacions significatives en el balanç hormonal dels diversos òrgans florals, demostrant la capacitat de senyalització dels sucres en el desenvolupament floral. També es determinà l’efecte de l’aplicació exògena de diverses fitohormones sobre la senescència floral i també en la foliar (àcid abscísic, ABA, el seu anàleg Pyrabactin®, i una barreja comercial de citocinines i gibberel•lines anomenada Promalin®), doncs l’aspecte del fullatge de la vara floral també influeix en la qualitat de la flor tallada. En aquest sentit, es corroborà l’efecte beneficiós de les citocinines i gibberel•lines en el retard de la senescència d’ambdós òrgans, mentre que l’ABA resultà ser un dels reguladors de la senescència (floral i foliar) en Lilium més importants, actuant com a inductor del procés. A més, l’aplicació de Pyrabactin, utilitzat aquí per primer cop per avaluar els efectes de l’ABA en senescència vegetal, corroboraven la capacitat del Pyrabactin per actuar in vivo com a antagonista de l’ABA en fulles de Lilium (retard de la senescència foliar), mentre que en flors mostrà el comportament contrari (agonista de l’ABA). A més, l’anàlisi de l’estat oxidatiu de les peces florals de Lilium revelà l’acumulació d’alfa i de gamma-tocoferol a totes les peces florals (excepte al gineceu). La forma predominant fou, en tots els casos, l’alfa-tocoferol, nivells del qual incrementaren marcadament en resposta a petits augments de la producció d’espècies reactives de l’oxigen. A més, l’alfa-tocoferol podria tenir un rol específic en la senescència dels tèpals i l’androceu de Lilium. Finalment, pel que fa les fulles, la inducció de la senescència per foscor accelerà el procés i provocà importants variacions hormonals, tot i que ni la biomassa ni la capacitat reproductiva es van veure afectades pel tractament de foscor. / Floral senescence in Lilium: Importance of endogenous regulators and effects of exogenous applications Floral senescence, as the latest developmental stage leading to flower (and its tissues) death, becomes very important in floriculture and research on this should give us new tools to improve both quality and longevity of cut flowers. Ethylene tends to be the main regulator of floral senescence (ethylene-sensitive flowers; carnation, rose...), while in ethylene-insensitive flowers (Lilium, Iris...) it does not control the process. Most studies describe ethylene effects in controlling floral senescence, while the ethylene-insensitive pathway remains more unknown. To better understand the latter, main endogenous regulators (phytohormones, oxidative stress and sugars) were analysed throughout development and in each floral tissues of Lilium L.A. ‘Courier’. Results showed different behaviours among floral tissues and during flower development. Aiming to improve cut flower longevity and quality, both natural (attached flowers) and cut flower developments were compared. Cutting the stem reduced floral longevity, which in turn also caused a greater hormonal imbalance. However, exogenous sucrose counteracted this effect by maintaining the flower open for longer (sucrose induced floral opening and delayed its senescence) while it also caused a hormonal imbalance (regarding controls) in several floral organs, demonstrating its signalling ability in floral development. In addition, effects of exogenous abscisic acid (ABA), Pyrabactin® (ABA analog), and Promalin® (commercial mixture of gibberellins and cytokinins) and its combinations were analyzed in both flowers and leaves, since foliage is also important for cut flower quality. Results corroborated the beneficial effects of cytokinins and gibberellins, whereas ABA acts an inductor of both floral and leaf senescence. Pyrabactin, used here for the first time to evaluate its effects in plant senescence, acted as an agonist in leaves and as an antagonist in flowers. Oxidative state analyses showed accumulations of both alpha and gamma-tocopherol in all floral tissues, except for the gynoecium. The main form was alpha-tocopherol and its levels increased sharply in response to little increases of reactive oxygen species production. In addition, results suggested a specific role for alpha-tocopherol in senescence of both tepals and androecium of Lilium. Finally, dark treatment accelerated leaf senescence and caused a hormonal imbalance, although neither biomass on fitness were affected by darkness.

En aquesta tesi s'ha estudiat el procés d'organogènesi adventícia de brots i rels en el clavell.D'una banda s'ha demostrat l'efecte de genotip en aquest procés, tot sent el cultivar White Sim el més regeneratiu. Prèviament s'havien estudiat les relacions genètiques entre els vuit cultivars de clavell estudiats, mitjançant anàlisis RAPDs. També s'ha trobat un efecte de l'explant en aquest procés morfogènic, tot sent les fulles lleugerament més regeneratives que els pètals. I també un efecte del tipus, balanç i concentració dels reguladors del creixement exògens (l'auxina NAA i les citocinines BA i TDZ). Cal destacar el gran efecte morfogènic del thidiazuron (TDZ), comparat amb la benziladenina (BA), i la sinèrgia trobada entre el TDZ i l'àcid naftalenacètic (NAA) en la regeneració de brots. El TDZ ha tingut un efecte organogènic tant directe, com indirecte a través de promoure un increment en determinades citocinines endògenes. Aquestes s'han trobat localitzades (mitjançant la tècnica de la immunolocalització) en els meristemes apicals dels primordis caulinars adventicis en formació.La concentració d'agar del medi i la humitat relativa del cultiu han influït també en la capacitat organogènica dels explants estudiats i en el grau d'hiperhidricitat dels brots regenerats.La presència del gen rolC d'Agrobacterium rhizogenes en plantes de clavell ha incrementat la capacitat organogènica, tant de brots com de rels, dels explants de clavell, mostrant un efecte similar al de les citocinines i al de les auxines, respectivament. Quantificacions de citocinines endògenes en les diferents línies estudiades han demostrat que les fulles transgèniques presenten nivells més elevats de citocinines tipus zeatina que les fulles control, mentre que els pètals transgènics tenen més concentració de citocinines tipus isopenteniladenina (iP). La concentració d'iP ens els pètals de les diferents línies transgèniques estudiades s'ha correlacionat amb la capacitat de regeneració dels pètals. D'altra banda, donat que els nivells d'auxines de les plantes rolC són similars als de les plantes no transgèniques, l'efecte d'auxina del gen rolC s'explicaria per un increment de la sensibilitat a las auxines.Finalment, l'estudi de la influència dels gens rol d'Agrobacterium rhizogenes en plantes ornamentals amb flor ha mostrat que el fenotip obtingut pot ser de gran interès comercial, donat que promouen hàbits de creixement compactes, una major ramificació lateral, millor arrelament i un increment en la floració, la qual, en alguns casos, pot fins i tot avançar-se. La disminució de la fertilitat masculina, obtinguda en la major part de transformacions, seria pràcticament l'única característica negativa. D'entre els gens rol, el rolC seria el més recomanable, donat que els seus efectes són els més avantatjosos pel que fa a la millora de trets ornamentals i horticulturals. / In this thesis we have studied the adventitious organogenesis of shoots and roots in carnation.On one hand, we have found an effect of the genotype in this process, the White Sim cultivar being the most regenerative among the studied cultivars. Previously, we analyzed the genetic relatedness among the eight carnation cultivars. We have also found an effect of the explant in this morphogenic process: leaves were found to be more regenerative than petals. And finally, we have shown an effect of the type, balance and concentration of exogenous plant growth regulators (auxins and cytokinins). It is worth noting the great morphogenic effect of thidiazuron (TDZ), compared with benzyladenine, and the synergy found with TDZ acting together with naphthaleneacetic acid in the adventitious shoot regeneration. TDZ showed a direct effect on the shoot organogenesis, but also an indirect effect by promoting an increase in specific endogenous cytokinins. The cytokinins have been located in the apical meristems of the adventitious shoot primordia formed on the petal surface. The agar concentration of the media and the relative humidity of the culture atmosphere have also influenced the organogenic capacity of the studied explants and the hyperhydricity of the regenerated shoots. The introduction of the rolC gene of Agrobacterium rhizogenes in carnation plants have improved both shoot and root organogenesis of the explants, thus showing a cytokinin-like but also an auxin-like activity. By quantifying the endogenous cytokinins, rolC-transgenic leaves have been found to have higher levels of zeatin-type cytokinins, whereas rolC-transgenic petals have shown higher levels of isopentenyladenine-type cytokinins. On the other hand, since auxin levels of rolC-transgenic plants have not differed from those of non-transgenic plants, the auxin-like effect of the rolC gene could be explained by an increase in auxin sensitivity in transgenic tissues. Finally, the study of the influence of rol genes in floriculture have shown that the obtained phenotype by transforming ornamental flowering plants with rol genes can be commercially desirable, since these genes promote dwarf and bushy phenotypes, promote better rooting and improve flowering, both by increasing the number of flowers and advancing the flowering time. Among rol genes, the rolC gene is the most recommendable.

Tesi realitzada a la Unitat de Botànica / Dept. Biologia Vegetal / Los hongos calicioides es un grupo artificial de hongos, liquenizados y no-liquenizados, que se incluían dentro del antiguo orden Caliciales, y que ahora se mantienen agrupados debido la similar morfología de sus apotecios . La mayoría viven en zonas de penumbra y elevada humedad, al resguardo de la lluvia directa, ocultándose en oquedades de la corteza vieja de árboles de bosques maduros. Entre ellos son comunes las estrategias parasíticas o parasimbióticas de otros líquenes. Se encuentran presentes en las listas rojas de líquenes de la mayor parte del mundo y se suelen utilizar como bioindicadores del grado de madurez del bosque. Estos organismos presentan una gran complejidad en su estudio, principalmente debido a sus reducidas dimensiones que dificultan la localización y la identificación de los ejemplares. Actualmente, este grupo artificial incluye miembros de tres clases (Coniocybomycetes, Lecanoromycetes y Euriotiomycetes) y cinco órdenes diferentes (Coniocybales, Caliciales, Lecanorales, Agyriales y Mycocaliciales), mientras que una familia (Microcaliciaceae) permanece (a fecha de hoy) en posición incierta. En esta Tesis Doctotal se presentan cuatro publicaciones con el fin de profundizar, aclarar y divulgar el conocimiento y la presencia de estos hongos en la Península Ibérica e Islas Baleares. En la primera publicación: Mycocalicium llimonae, a new species from the Iberian Peninsula. A partir de unos especímenes que recogidos en el oeste de la Península Ibérica sobre piñas de Pinus halepensis, se describe una nueva especie: Mycocalicium llimonae. En este artículo, el nuevo taxon se compara con las otras especies del género Mycocalicium presentes en la península, en especial con Mycocalicium subtile, nombre bajo el cual muchos de estos especímenes habían sido erróneamente identificados. Además, se comparan con otras especies de géneros de la familia Mycocaliciaceae que tienen ecologías que podrían resultar similares, como es el caso de Chaenothecopsis resinicola o algunos Phaeocalicium. En la segunda publicación: Mycocalicium llimonae Hladun & Muñiz (Ascomycota, Eurotiomycetes, Mycocaliciales) un fong mediterrani tan freqüent com difícil de veure. Ecologia i distribució a Catalunya. Se hace hincapié en la abundancia de una especie hasta ahora desconocida y se amplía el conocimiento que se tiene sobre la misma. En la tercera publicación: Sphinctrina paramerae, a new Mediterranean lichenicolous species with non-septate spores. Se describe una nueva especie que abarca toda la región mediterránea, se compara con diferentes especies del mismo género y se presenta una clave de identificación. Para dicha descripción se han tenido en cuenta: características de ascósporas (tamaño, morfología y ornamentación), apotecios (morfología, tamaño y reacciones químicas) y características ecológicas. Sphinctrina paramerae crece sobre Pertusaria paramerae, que a su vez es epífito sobre corteza de Juniperus thurifera. Aparece en áreas altas y expuestas de la meseta ibérica y en otras áreas montanas de la región mediterránea. A los ejemplares ibéricos cabe añadir el material proveniente de Marruecos, Libia, Turquía, Macedonia. En la cuarta publicación: Calicioides. Flora Ibérica. Vol.7. Se presenta un inventario de las especies que aparecen en la Península Ibérica e Islas Baleares, añadiendo descripciones completas que incluyen caracteres anatómicos, macroscópicos y microscópicos, químicos y ecológicos. Además, se presentan claves dicotómicas a nivel de grupo, a nivel de familia y a nivel de género. A todo esto cabe añadir la presencia de una completa relación del material revisado con el fin de facilitar la localización y consulta de otros especialistas. Este anexo hace referencia al material examinado tanto de las especies presentes en la Península Ibérica e incluídas en la tesis como a material adicional referido a especies fuera del ámbito de estudio. / The calicioid fungi represent an artificial group including lichenized and non-lichenized fungi. Historically, those taxa were grouped within Caliciales; currently, molecular studies have proved to belong to different classes. Here, we present four papers with the aim of increasing the knowledge of this group in the Iberian Peninsula and Balearic Islands. Mycocalicium llimonae, a new species from the Iberian Peninsula. The new species, Mycocalicium llimonae, is described based on specimens collected from cones of Pinus halepensis in the west of the Iberian Peninsula. The new taxon is compared with the other species of the genus Mycocalicium in the Iberian Peninsula, particularly Mycocalicium subtile, and also with other genera in the Mycocaliciaceae. Mycocalicium llimonae Hladun & Muñiz (Ascomycota, Eurotiomycetes, Mycocaliciales) un fong mediterrani tan freqüent com difícil de veure. Ecologia i distribució a Catalunya. New data regarding Mycocalicium llimonae Hladun & Muñiz, a calicioid fungus previously mentioned, erroneously, from the Iberian Peninsula under the name M. minutellum (=M. subtile). Besides a brief description, this work includes an identification key, corologic data, a comprehesive map of its distribution in Catalonia, a synthesis of the observed ecology and macrophotographies of the habitus of this tiny, dew-loving lignicolous, thermophilous, ascomycete. Sphinctrina paramerae, a new Mediterranean lichenicolous species with non-septate spores. The new species, Sphinctrina paramerae, is proposed. Characteristics of ascospores (size, morphology and ornamentation), apothecia (morphology, size and chemical reactions) and ecological features revealed significant differences between S. paramerae and the currently known species of Sphinctrina with non-septate ascospores. The new species grows on Pertusaria paramerae, epiphytic on the bark of Juniperus thurifera, which occurs on well-exposed areas of parameras in the Iberian high plateau and other montane Mediterranean areas. Calicioides. Flora Ibérica. Vol.7. An inventory of species from Iberian Peninsula and Balearic Islands is presented. Including descriptions of macroscopic and microscopic characters, chemical features, ecology and distribution. The work includes determination keys for the group, families and genera.

In this thesis we characterize the behavior of molecular motors when the properties of the cytoplasm they displace through are not homogeneous or isotropic. Anisotropies in the cytoplasm can be induced, for example, by net fluxes that can be generated by the displacement of motors themselves as well by other mechanism such as remodeling of the overall cell shape. In the cytoplasm there are many molecules, proteins, vesicles and organelles in suspension. Such a crowded environment develop inhomogeneities in the local properties of the cytoplasm. The different length scales that characterize such inhomogeneities might led to different interplays according to the size of the cargo pulled by motors. For example, suspended particles whose size is much smaller than the cargo size will be experienced by the cargo as an enhancement in the effective viscosity. On the other hand, suspended particles of the same size or bigger than cargoes will develop local structures that affect the space the cargo can explore and will act like a porous medium. In the first chapter we characterize the hydrodynamic coupling generated by an ensemble of molecular motors displacing along a filament. By numerical simulations we show how such a coupling develops. The hydrodynamic coupling between motor relies on the fluid flow generated by motors displacement. We discuss how the hydrodynamic coupling between motors depends upon the boundary conditions provided by different geometries. Motors do not always displace in the same direction, rather cargoes pulled by teams of motors pulling on opposite directions has been observed to undergo a bidirectional motion where the cargo moves back and forth due to the reorganization of the force generated by the motors. In many cases the cargoes motors pull on are vesicles or membrane-embedded organelles. In these cases motors exert force on the cargo by pulling on molecular linkers embedded in the membrane that link the tail of the motors to the membrane. Therefore, the displacement of the linkers in the membrane will lead to a local flow of membrane that can lead to an overall coupling between motors that will sum up to the one generated by the displacement of the motors in the cytoplasm. In the second chapter we develop a coarse grained description of a team of motors pulling on opposite directions that are hydrodynamically coupled. Thanks to our coarse grained model we characterize the overall dynamics of the system and we discuss the peculiar features induced by the hydrodynamic coupling by comparing them against those obtained in the case of rigidly coupled motors. In the third chapter we characterize the dynamics of a single molecular motor displacing in an inhomogeneous environment modeled as a varying section channel. In the limit in which the channel section is smoothly varying it is possible to reduce the overall dynamics to that of a particle moving in a 1D effective potential where the varying confinement enters as an entropic contribution to the overall potential. Using this framework we characterize the dynamics of molecular motors moving according to different schemes. The comparison between the results obtained with the different models allows us to distinguish between general behaviors and model dependent features. / El objetivo de esta tesis es la caracterización de la interacción entre la dinámica interna de los motores y el entorno en que los motores moleculares se mueven. Hemos caracterizado dos escenarios diferentes para los cuales las propiedades locales del fluido afectan significativamente a la dinámica general de los motores. Como primer caso hemos estudiado la dinámica de varios motores moleculares que se desplazan a lo largo de un filamento común. Mientras se desplazan, los motores moleculares generan flujos citoplasmáticos locales que afectan el estado local del fluido. Por lo tanto la dinámica interna de los motores moleculares se ve afectada por el acoplamiento hidrodinámico entre los motores. Hemos caracterizado el acoplamiento hidrodinámico entre motores moleculares en dos escenarios diferentes. Por un lado hemos encontrado que el acoplamiento hidrodinámico entre motores proporcionados por el citoplasma puede afectar fuertemente a su velocidad global. Las variaciones locales en la densidad de motores pueden crecer y llevar a la formación de clusters que aceleran la velocidad de los motores y que conducen a la aparición de estructuras estables. Cuando varios motores están empujando una carga común, la naturaleza fluida de la membrana que envuelve la carga proporciona un acoplamiento hidrodinámico adicional entre los motores. En este escenario, hemos observado que el acoplamiento hidrodinámico entre los motores que tiran en direcciones opuestas, puede conducir a la ruptura de la simetría así como la biestabilidad incluso para tamaños de sistemas comparables con situaciones biológicas relevantes. Por lo tanto, las interacciones hidrodinámicas representan una alternativa para el control de la dinámica de la carga. Como segundo caso hemos estudiado la dinámica de un motor molecular singlo en movimiento en un fluido intrínsecamente inhomogéneo en el cual, la inhomogeneidad del líquido se induce por la presencia de confinamientos geométricos. Si el espacio local disponible varia, surgen fuerzas adicionales de la naturaleza entrópica. La interacción entre el movimiento a saltos del motor y la modulación en el confinamiento puede conducir a nuevos regímenes dinámicos, distintos de los que ocurren en el caso de partículas bajo fuerzas constantes o motores moleculares desplazando en un entorno homogéneo.

Esta tesis se encuentra dentro de un proyecto que pretende construir una planta piloto de almacenamiento geológico de CO2, en Hontomín (Plataforma Burgalesa, norte de España). Los objetivos principales son construir un modelo 3D de la estructura de Hontomín y entender el patrón de fracturas de la Plataforma Burgalesa para aplicarlo a la zona de Hontomín. El modelo tridimensional se interpreta a partir de datos de sísmica 3D y es presentado en esta tesis, definiendo la estructura y las principales unidades reservorio y sello. El patrón de fracturas se ha analizado a través de análogos de campo. Concretamente, se ha estudiado la fracturación en las rocas cretácicas superiores de la Plataforma Burgalesa, en la zona de la falla de Ubierna y en el diapiro de Poza de la Sal (cuyos resultados han sido presentados en los tres artículos compilados en la presente tesis). El resultado de estos estudios ha sido integrado y se ha propuesto un modelo de evolución del patrón de fracturación de la zona. Asimismo, se han extrapolado estos datos de fracturación a la estructura de Hontomín dando las directrices del principal patrón de fracturación que se espera. / This thesis is part of a project funded by the Fundación Ciudad de la Energia (CIUDEN), which decided to build a plant science and technology for CO2 capture and storage development in Spain, in the Hontomín anticline (north of Burgos). Within this project have collaborated many research centers in Spain and specifically the "Institut de Recerca de la UB Geomodels" was given the task of characterizing both the threedimensional structure and the fracture pattern that affects the main reservoir and seal structure Hontomín. The purpose of this thesis is precisely to fill this need to characterize the structure together with the Hontomín fracturing, constraining the latter with the acquisition of regional data to characterize the deformation mechanisms responsible for their formation and evolution. From the interpretation of a 3D seismic cube provided by CIUDEN (integrated with information of wells Hontomín-1,-2,-3 and -4), a 3D model of the Hontomín structure has been generated. This model shows a raised platform limited to the south and to the west by two monocline flexures that plunge Mesozoic materials below Cenozoic sedimentary fill of the Bureba basin. To the south, the ENE-WSW monocline culminated by tight E-W folds, which underlines the Quintanilla anticline, connecting with Ubierna Fault near the town of Montorio. Below Quintanilla anticline seismic lines show a strongly dipping fault (parallel to the anticline) dipping towards north, with mainly clockwise displacement (vertical displacement is almost zero or very low and slightly up the northern block). These structures were generated after the sedimentation of the continental Oligocene deposits. Previously of this sedimentation, the area was already affected by a prior Upper Jurassic to Lower Cretaceous structure. It involves developing a bending of carbonate platforms of the terminal Triassic to Middle Jurassic to the north and to the west associated with forced folds, formed mainly during the early stages of the syn-rift sedimentation of the Upper Jurassic - Lower Cretaceous (specifically contemporary the "Purbeck" facies), which show a growth strata geometry above the oldest bended Jurassic successions. Conversely, strike-slip and reverse faults are younger so they cut lower Cretaceous sequences. The culmination of this dome located in the center of the 3D seismic cube Hontomín shifted to the SE, appears below the angular unconformity that, in this area, separates the sub-horizontal Lower Cretaceous to the tilted succession of the terminal Triassic-Upper Jurassic to the north and to the west. This shift in the position of the dome culmination is innate in the folding of angular unconformities as shows the work of Suppe et al., 1992. Data analyzed in the Burgalesa Platform show that the fracture pattern depends primarily on: 1) The tectonic events that have affected the material; 2) the position of the rocks in relation to major faults affecting the area; and 3) the lithology of the rock where they developed. Jurassic and Lower Cretaceous materials are affected by the Upper Jurassic – Lower Cretaceous extension and by the subsequent Pyrenean compression. Thus, they present a complex pattern that includes NW-SE to E-O extensional faults and NNE-SSW and WNW-ESE joints. These fractures, mostly, were generated during the Upper Jurassic – Lower Cretaceous extension and were partly contractively reactivated during the compression event. The density and degree of deformation generated is fairly constant throughout the study area and increases considerably over Ubierna deformed bands and Oña where compressive Cenozoic deformation was more intense. Also, it appears to be higher around salt diapirs. The upper Cretaceous successions, only affected by compressive Pyrenean deformation are less fractured. In general, these sequences one can distinguish two patterns fracturing; one located along directional deformation bands that bounds the Burgalesa platform, and the other developed at the inside of the raised platform. The deformed Ubierna band is characterized by right strike-slip faults oriented WNW -ESE and by a penetrative network of NNW -SSE joints. In this zone thrust are oriented NE- SW and the left strike-slip faults are oriented NE-SW. Otherwise, in the deformed Oña band, is characterized by NS to NNW-SSE cleavages, WSW-ENE joints and faults WNW –ESE left strike-slip faults and subordinately, NE-SW right strike-slip faults. Out of these deformed bands, the deformation is less intense and is made especially for joints orientated WNW-ESE, WSW-ENE, NNW-SSE and NNE-SSO. Moreover, this area present also other types of fractures (although less abundant than joints) constituted by extensive faults oriented WNW-ESE, NNW-SSE and WSW-ENE, compressive faults (and cleavages) oriented ENE-WSW, WNW-ESE and NE-SW right strike-slip faults and WNW-ESE left strike-slip faults.

The main objective of this thesis is to analyse the variation in non-breeding social systems within the group of parids and to identify the main factors involved. More specifically, I studied the role of food hoarding on the structure of winter social systems at different scales. The study was focused on the social patterns and hoarding of two species of tits inhabiting boreal (the Willow tit, "Parus montanus") and montane subalpine forests (the Coal tit, "Parus ater"). The results included in this thesis are mainly concerned with the Coal tit, because the Willow tit has been studied in some detail by other researchers in the same study area described below. Therefore, most of the points here investigated for the Coal tit were already studied for the Willow tit.

El objetivo del presente trabajo es evaluar la influencia de la contaminación atmosférica de la Zona Metropolitana de la Ciudad de México sobre las poblaciones de Microtus mexicanus, Peromyscus melanosis y P. difficilis en los Parques Nacionales: Desiertode los Leones (Desierto) y el Ajusco (Ajusco) para lo cual se analizó la estructura y ultraestructura del epitelio traqueal; el análisis histopatológico de: pulmón, hígado, bazo y riñón y la acumulación de metales (As, Al, Cd, Cr, Cu, Mn, Mo, Ni, Pb, Rb, Se, Sn, V, Ba, Ca, K, Mg, Na, P, S, Sr, Ti, Zn, Fe) en diversos órganos y tejidos en organismos capturados de mayo de 1996 a abril de 1997, en los dos parques naturales. No se detectaron diferencias significativas en el porcentaje de área ocupada por células ciliadas en el epitelio traqueal observándose hiperplasia de células mucosas, en el análisis ultraestructural no se observo alteración en la orientación ciliar, se detectó la presencia de: dilataciones vesiculares epiteliales y ciliares, cilios duplicados, cilios supernumerarios, dilatación del citoplasma del cilio y desorganización en su ultraestructura, no encontrándose diferencias significativas entre los dos parques nacionales en la presencia de las alteraciones antes mencionadas. La incidencia de estas alteraciones sugiere que el epitelio traqueal de las especies analizadas puede presentar deficiencias en la retención de contaminantes atmosféricos en los dos parques naturales. En el pulmón se observó neumoconiosis, procesos inflamatorios e hiperplasia septal adenomatosa; principalmente en los ejemplares procedentes del Desierto; en el hígado se detectaron diversas patologías entre las que destacan procesos inflamatorios, necrosis celular significativamente en mayor grado y frecuencia de incidencia en los individuos de P. melanosis del Desierto, así como la presencia de Toxoplasma gondii en P. melanosis asociado a los casos más evidentes de necrosis e inflamación en los dos sitios de colecta, el desarrollo de alteraciones renales es notorio en los individuos de P. melanosis del Desierto. El grado y nivel de alteración orgánicas en los tejidos analizados de M. mexicanus, P. melanosis y P. difficilis en apariencia no llegan a comprometer las tasas de supervivencia por enfermedades de estas especies. En M. mexicanus se observaron procesos vinculados con la secreción de glucocorticoides sin que se observara un deterioro orgánico del individuo. Se obtuvieron diferencias significativas en al menos uno de los metales detectado en los órganos, tejidos y la grasa subcutánea analizados, siendo de particular interés los niveles detectados de rubidio en las tres especies y de forma particular las concentraciones significativamente más elevadas en M. mexicanus en el Ajusco, en comparación con P.melanotis y P. difficilis. Las poblaciones presentan patrones de asimilación de Cd renal, cuyos niveles en conjunción con los valores de Pb y Al en hueso pueden estar afectando el estado nutricional y sanitario de las especies estudiadas, en mayor proporción durante la temporada seca que bien pueden haber influido en el desarrollo de un número mayor de patologías inflamatorios en los ejemplares del Desierto.

Las anátidas son aves territoriales que, una vez han acabado la cría, se vuelven altamente gregarias y realizan en general grandes movimientos para invernar en una o varias localidades. Los requerimientos espaciales durante las dos épocas en que a grandesrasgos se divide su ciclo anual (reproducción e invernada) son distintos, así como su comportamiento, y ello conduce a que los métodos de muestreo en una y otra época sean muy diferentes. Por tanto, los márgenes de error al comparar con el mismo método datos obtenidos de fuentes distintas producen desviaciones considerables. Eso implica que, a pesar del gran interés científico que representa el estudio del ciclo anual completo, existan pocas publicaciones que traten de ello en profundidad. En el caso concreto del Delta del Ebro, los trabajos disponibles han sido escasos y en su mayor parte se han referido al periodo primaveral-estival, siendo por lo general meras notas faunísticas de escaso interés científico. En cuanto al período invernal, las referencias son igualmente raras y presentan grandes lagunas de información. De hecho, el Delta del Ebro era un área casi desconocida antes de 1970, aunque se produce un incremento notable en el número de investigadores a partir de 1975. Eso ha dado lugar a un destacable volumen de trabajos publicados, si bien es cierto que en determinados campos como la Hidrología se pueden detectar grandes vacíos documentales. El interés internacional que para las anátidas tiene el Delta del Ebro, la multiplicidad de problemas existentes (desecación, cambio de los cultivos, eutrofización de las aguas, perspectivas de turismo intensivo, etc.), así como un cierto deber moral con respecto a la región que le enseñó a conocer la Naturaleza, llevaron al autor de la presente tesis a concebir un trabajo que fuera una aportación a la Ciencia pero al mismo tiempo tuviera aplicaciones prácticas, sirviendo de base para la gestión territorial del Delta con vista a la conservación de su vida silvestre.En definitiva, la presente memoria tiene como hilos conductores tres aspectos relevantes. En primer lugar, conocer la importancia numérica y las fluctuaciones de la población de anátidas a lo largo del ciclo invernal en el transcurso de los años, así como las principales ubicaciones de sus asentamientos en el Delta. En segundo lugar, describir la estructura y el comportamiento de las comunidades de patos a lo largo de dicho ciclo, para así conocer cuáles son los factores reguladores. Por último, ambos aspectos se encuadran en un marco general más amplio, donde se intenta comprobar si el comportamiento de la comunidad de invernantes y del "cuartel de invierno" del Delta se ajusta al modelo general propuesto por la "escuela francesa" surgida en torno al "Centre d'Ecologie de Camargue", que mediante métodos eco-etológicos ha estudiado la distribución espacial de las anátidas invernantes en relación con su organización social.

Los objetivos abordados en la presente memoria son:- 1. Tipificación del nicho ecológico.- Desde dos perspectivas bien diferenciadas, una trófica y otra espacio-temporal. La dimensión trófica del nicho se ha evaluado través del análisis de la dominancia, diversidad y solapamiento de las dietas, desde una perspectiva específica, sexual y temporal, en tres tratamientos distintos: uno taxonómico numérico, otro taxonómico en biomasa y otro por clases de talla de presas. La dimensión espacio-temporal, analizada mediante métodos de captura-recaptura, pretende discriminar qué factores determinan la presencia o ausencia, y la abundancia de "E. asper" en el torrente, así como las variaciones temporales en su distribución. - 2. Estudio de la biología de la reproducción.- En este apartado se ha pretendido describir el ciclo biológico reproductor de esta especie para la vertiente sur pirenaica.-3. Estudio del crecimiento y demografía.- Se pretende establecer el modelo de crecimiento al que se ajustan los distintos subgrupos poblacionales y específicos considerados. En este análisis también se han estimado las tasas de crecimiento y supervivencia, distribución en clases de talla y longevidad entre otras, para dos poblaciones de tritón pirenaico (torrente de Pi e lngla) de la comarca de la Cerdanya (Lleida y Girona). En la primera de las dos poblaciones "E. asper" convive únicamente con "Salamandra salamandra", mientras en la segunda de ellas el tritón pirenaico se presenta en simpatria con "S. Salamandra" y "Salmo trutta ferio". Los resultados obtenidos indican que en el segmento controlado el número de refugios determina la mayor o menor abundancia de tritones adultos en el torrente. La concentración de oxígeno se muestra como el segundo factor en importancia, aunque sólo para los machos. La evolución de la "sex ratio" a lo largo del año indica que los machos son los últimos en iniciar la hibernación y los primeros en abandonar sus refugios de invernada que se localizan para ambos sexos en los márgenes del torrente. La distribución de "S. Salamandra" en el torrente del Pi es preferente alopátrica con "E. asper". La dieta del tritón pirenaico en el torrente del Pi se basa en la fauna reófila, principalmente larvas de plecópteros, efemerópteos y tricópteros, siendo estas dos últimas las energéticamente más rentables debido a la mayor biomasa individual que poseen los efemerópteros principalmente heptagenidos y los tricópteros mayoritariamente riacofilidos. El análisis de la dinámica trafico-ecológica a nivel poblacional muestra que mientras en los machos se presenta una situación de competencia, en las hembras parece apuntarse una cierta tendencia a la segregación trófica.Los valores de diversidad y amplitud de nicho obtenidos demuestran que en torrente de Ingla los adultos de tritón pirenaico se comportan como estenófagos, mostrándose como un claro especialista que dirige su depredación hacia las larvas de efemerópteros casi de forma selectiva. Esta situación contrasta con la hallada para el torrente de Pi, donde "E. asper" se mostraba tendente a la eurifagia y por tanto mucho más generalista. Los ejemplares larvarios de "E. asper" del torrente de Pi basan la dieta en las larvas de dípteros y efemerópteros, siendo las larvas de plecópteros una presa accesoria, tanto numéricamente como en biomasa.El análisis de la dieta de las larvas de "S. salamandra" en el torrente de Pi muestra que este urodelo se alimenta casi de forma exclusiva de larvas de dípteros, que en biomasa llegan a representar algo más del 95% de la dominancia. La supervivencia de "S. Salamandra" en el torrente es posible gracias a la segregación trófica con "E. asper", por la ocupación de distintos microhábitats, y por su rápido desarrollo larvario.Se distinguen tres fases bien diferenciadas en el ciclo testicular del tritón pirenaico. La primera transcurre desde el final de la hibernación hasta junio y se caracteriza por una primera evacuación de los espermatozoides madurados el año anterior y por una espermatogénesis muy activa en el lóbulo inmaduro. La segunda de junio a septiembre se caracteriza por una evacuación muy reducida en el lóbulo maduro y por una espermatogénesis ralentizada en el lóbulo inmaduro. La tercera, a partir de septiembre, se caracteriza por una segunda evacuación importante de espermatozoides del lóbulo maduro, aunque menor que la primaveral y por la continuación de las últimas fases de la espermatogénesis en el lóbulo inmaduro tras la total desaparición del anterior.El número de ovocitos presentes en el ovario es significativamente mayor para la población de Ingla. Esta diferencia puede atribuirse por una parte a la mayor talla de las hembras de esta población y por otra a una mayor disponibilidad de recursos tróficos. El tamaño medio de la puesta es de 39 y 64 huevos para Pi e lngla respectivamente.El crecimiento de las larvas de "E. asper" para los dos subperiodos considerados se ajusta al modelo de Von Beralanffy, habiéndose estimado un crecimiento medio de 0.127 y 0.095 mm./día para el periodo perinvernante y postinvernante respectivamente. El crecimiento medio obtenido para el periodo larvario de "S. salamandra" es de 0.243 mm./día, valor claramente valor claramente superior-al obtenido para el tritón pirenaico. Las hembras son claramente más longevas que los machos, habiéndose estimado en la muestra analizada una edad máxima de 26 y 20 años para hembras y machos respectivamente. La evolución de la población desde las torrenciales lluvias de 1982 hasta 1987 pone de manifiesto que tras la desaparición de casi el 60% de los adultos del torrente de Pi (phi=415), tan solo en cinco años la población vuelve a recuperar su situación inicial previa a la avenida. / The objectives studied in this work are: Ecological niche typing, reproduction biology and, growth and demography study. The first objective has been tackled in two different dimensions: One trophic and one space-temporal. The trophic niche dimension has been evaluated through of dominance, diversity and diet overlap analysis, from the specific, sexual and temporal perspective. Moreover, each analysis has been executed according to the number of prey or the prey-mass and size. The space-temporal dimension is studied through capture-recapture methods in order to know that abiotic factors determining their presence or abundance, and their temporal distribution in the torrent. The study of the reproduction biology describes the testicular and ovarian cycle in two Pyrenean populations localized in the south slope. Also, the fecundity rate and its age variation have been analyzed.The growth and demographic analysis try to know the growth curve model to which the different demographic and specific groups are close-fitted. The squeletto-chronological methods are used to determine the individual age of postmetamorphic "Euproctus asper". Moreover, the growth and survival rate, size and age class distribution and longevity are estimated. Finally, the different methods to calculate the population size are used and confronted.