The human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) can be phylogentically classified into multiple groups, subtypes, sub-subtypes and recombinant forms. Subtype B HIV-1 is responsible for approximately 10% of the pandemic and is primarily located in the developed regions of the world, whereas subtype C HIV-1 is responsible for over 50% of the pandemic and is primarily located in the sub-Saharan African countries. The majority of HIV-1 research to date has focused on subtype B HIV-1 and, as a result, little is known about subtype differences or about drug resistance development between the subtypes. Numerous studies have suggested that the K65R reverse transcriptase (RT) mutation develops more readily in subtype C as opposed to subtype B HIV-1. We described that this discrepancy partly lies in the subtype C template coding sequence that predisposes RT to pause strongly at the site of K65R development. This pausing reaction was shown to be specific to the subtype C HIV-1 coding sequence in addition to being difficult to alleviate. We also showed that DNA synthesis assays performed with subtype C templates consistently produced more K65R-containing transcripts than with subtype B templates, regardless of the subtype-origin of the RT enzymes employed. These findings confirm that the mechanism is template-specific and RT-independent. In addition, a pattern of DNA synthesis characteristic of site-specific primer/template slippage and dislocation was only observed on the subtype C sequence. Thus, the data show that during DNA synthesis at the homopolymeric nucleotide stretch of the subtype C K65 region, strand slippage can occur resulting in the misalignment of the primer and template. Consequently, slippage would lead to a deletion of the middle adenine of codon K65 and the production of a -1 frameshift mutation or, upon dislocation and realignment of the primer and template, the development of the K65R mutation. These findings provide specific mechanistic evidence for the facilitated development of the K65R mutation in subtype C HIV-1 and demonstrate the drug resistance mutations can develop differently between HIV-1 subtypes. A more complete understanding of the clinical implications of these findings requires the long-term follow up of patients on antiretroviral therapy in subtype C endemic regions of the world. / Les virus de l'immunodéficience humain de type-1 (VIH-1) peuvent être classifiés en plusieurs groupes, sous-types, sous sous-types et formes recombinantes. Le VIH-1 de sous-type B est responsable d'environ 10% de la pandémie globale qui sévit principalement dans les pays développés du monde. Cependant, le VIH-1 de sous-type C est responsable pour plus de 50% de la pandémie qui se situe principalement dans les pays en voie de développement du monde y compris les pays dans le sud de l'Afrique. La majorité de la recherche sur le VIH-1 se fait sur des virus de sous-type B et, par conséquence, on en connait peu sur les différences entre les sous-types et sur le développement de résistance aux antirétroviraux entre ces derniers. Plusieurs études suggérèrent que la mutation K65R dans la transcriptase inverse (TI) apparait plus rapidement chez les virus de sous-type C que chez ceux de sous-type B. Nous avons établit que la matrice génétique dérivé des virus de sous-type C est, en partie, responsable pour ces observations puisqu'elle entraine un arrêt de la synthèse d'ADN par la polymérase au nucléotide spécifique responsable pour l'apparition de la mutation K65R. Cet arrêt semble spécifique à la matrice génétique des virus de sous-type C et peut être difficilement empêché. Nous avons également montré que des matrices de sous-type C produisent de façon constante des produits ayant la mutation K65R, et ce avec une plus grande fréquence que pour les matrices de sous-type B. Peu importe le sous-type des TI utilisées lors des expériences, les résultats demeurent les mêmes. Ces donnés suggèrent que le mécanisme responsable est spécifique de l'origine de la matrice mais indépendant de l'origine de la TI. De plus, la synthèse d'ADN se déroule d'une façon particulière qui suggère un glissement entre la matrice et l'amorce ce qui entraine une dislocation sur la matrice génétique de sous-type C. Nos résultats montrent que lors de la synthèse d'ADN à partir de séquences nucléotidiques homopolymériques se situant autour de la région K65 de sous-type C, un glissement entre les brins d'ADN peut entrainer un désalignement entre la matrice et l'amorce. Par la suite, ce glissement peut supprimer l'adénine au milieu du codon K65 et produire une mutation de changement de phase ou, suivant une dislocation avec réalignement de la matrice et de l'amorce, produire la mutation K65R. Ces résultats suggèrent que l'apparition de la mutation K65R chez le virus de sous-type C est facilitée et que l'émergence de mutations de résistance peut se produire de façon divergente entre les différents sous-types de VIH-1. Pour mieux comprendre les implications cliniques de ces observations, il faudrait un suivi à long terme des patients traités avec des antirétroviraux dans des régions du monde endémiques par le VIH-1 de sous-type C.

Background The ability to accurately determine extubation readiness in extreme preterm infants is important but difficult. Clinical decision making results in a 20-40% rate of extubation failure and strategies developed to predict successful extubation have shown limited success. Heart rate variability (HRV) and respiratory variability (RV) can distinguish weaning outcome in ventilated adults but have never been assessed in preterm infants undergoing disconnection from MV. Objectives Studies performed in extreme preterm neonates evaluated differences in HRV and RV prior to extubation between infants that would fail or succeed extubation. An additional study evaluated HRV and RV in healthy full-term newborns and determined the effect of position and feeding. Methods Mechanically ventilated infants with a birth weight ≤ 1250g were included in studies evaluating preterm infants. HRV data was collected for 60 min prior to extubation during assist control or synchronized intermittent mandatory ventilation. RV data was collected for 3 min prior to extubation during endotracheal tube continuous positive airway pressure. Extubation failure was defined as the need for re-intubation within 72h of initial disconnection from MV. HRV data was collected using electrocardiography and quantified using frequency analysis. RV data was collected using respiratory inductive plethysmography and quantified using time-domain analysis. Similar methods of data collection and analysis were applied in healthy, full-term infants. Results A significant decrease in HRV prior to extubation was demonstrated in infants that failed extubation. An initial retrospective analysis revealed a significant decrease in mean inspiratory flow variability in infants that required re-intubation. However, a subsequent prospective evaluation showed no differences in RV prior to extubation between success and failure groups. In healthy full-term newborns, reduced HRV and RV were observed in the prone position. No feeding effect was described. ConclusionsThese studies provide a first assessment of HRV and RV in extreme preterm infants being extubated, with additional evaluation in a normative population using similar methodology. HRV and RV can function as biomarkers of extubation outcome and improve clinical decision making. The results described provide a solid basis for improved and refined investigations of both measurements as predictors of successful extubation in future. / Contexte La capacité de déterminer avec précision la facilité d'extubation parmi les nouveau-nés extrêmement prématurés, est importante mais difficile. La prise de décision clinique confère un taux d'échec d'extubation de 20 à 40% et les stratégies développées pour prédire une réussite à l'extubation ont démontré un succès limité. La variabilité du rythme cardiaque (VRC) et la variabilité respiratoire (VR) permettent de distinguer le sevrage de la ventilation mécanique (VM) chez les adultes, mais n'ont jamais été évalués chez les nouveau-nés extrêmement prématurés qui subissent une déconnexion de la VM. Objectif Les études réalisées chez les nouveau-nés extrêmement prématurés ont évalué les différences dans la VRC et RV avant l'extubation, entre les bébés qui seront extubé avec succès et les bébés qui échoueront l'extubation. Une étude additionnelle a évaluée la VRC et VR chez les nouveau-nés à terme et de bonne santé ainsi que l'effet de la position et de l'alimentation ces mesures susmentionnées. Méthodes Les bébés ventilés mécaniquement avec un poids de naissance ≤ 1250 g ont été inclus dans les études évaluant les nouveau-nés extrêmement prématurés. Les données de VRC ont été enregistrées pendant 60 min avant l'extubation lors d'un mode ventilatoire assisté contrôlé intermittent. Les données de VR ont été enregistrées pendant 3 min de pression expiratoire positive à travers le tube endotrachéale. Un échec d'extubation était défini par le besoin de réintubation avant 72h de la déconnexion initiale de VM. Les données de VRC ont été recueillies en utilisant l'électrocardiographie et quantifiés dans le domaine fréquentiel. Les données de VR ont été recueillies par pléthysmographie et quantifiés dans le domaine temporel.Des méthodes de collection de données et d'analyse similaires ont été appliquées pour les nouveau-nés à terme de bonne santé. RésultatsUne diminution significative de VRC avant extubation a été démontrée chez les nouveau-nés qui ont échoué l'extubation. Une analyse rétrospective initiale a révélé une diminution significative de la variabilité du volume courant par durée du temps inspiratoire chez les nouveau-nés ré-intuber. Cependant, une évaluation prospective ultérieure, n'a démontré aucune différence de VR avant extubation entre les bébés qui ont été extubé avec succès et les bébés qui ont échoué l'extubation. Parmi les nouveau-nés à terme de bonne santé, une réduction de VRC et VR a été observée dans la position décubitus ventrale. Aucun effet d'alimentation n'a été décrit. Conclusions Ces études sont les premiers à évaluer les mesures de VRC et VR parmi les nouveau-nés extrêmement prématurés extubés, avec une évaluation supplémentaire dans une population normative utilisant une méthodologie similaire. La VRC et VR peuvent fonctionner comme des « biomarkeurs » du résultat d'extubation et par suite, améliorer la prise de décision clinique. Les résultats décrits dans cette étude fournis une base solide démontrant le rôle de ces deux mesures dans la prédiction d'extubation réussie et donc, des investigations complémentaires seraient d'un intérêt pour évaluer d'avantage l'utilisation de ces mesures dans le milieu clinique.

Introduction: Cisplatin, as one of the most efficient chemotherapeutic agents, is limited in its use by the serious side effect of ototoxicity. In spite of advances in modern preventive treatment, ototoxicity remains an important dose-limiting side effect of cisplatin-based chemotherapy. The purpose of the present project was to improve a chinchilla animal model of systemic cisplatin administration, and to design an instrument for transtympanic drug delivery to the round window membrane of the same animal model. Material and Methods: For the first part of the project, a total number of 18 female chinchillas were divided into three groups. The animals were injected with 10 mg/kg (n=6), 10.5 mg/kg (n=6), and 11 mg/kg (n=6) of intraperitoneal cisplatin, via a programmable syringe pump. The Auditory Brainstem Responses (ABR) before and 24 and 48 hours after cisplatin injection were recorded and compared for hearing threshold shifts for different frequencies. The scanning electron microscopy (SEM) was used for the study of the morphological changes at the end of the experiment. For the second part of the project, a total number of 12 female chinchillas were divided into two groups. The chinchillas' bullae (n=8) were dissected for anatomical orientation. Following the purchase of the instrument, the feasibility of its use was evaluated in the second group (n=4). Results: An intraperitoneal cisplatin administration of 10 mg/kg, through a slow injection by a programmable syringe pump, induces a significant hearing loss, with minimum mortality rate in the chinchilla animal model. A precise transtympanic drug application on the round window membrane of the chinchilla animal model is feasible with the use of a special micro-otoscope. Conclusion: In the chinchilla animal model, a minimum dose of 10 mg/kg of intraperitoneal cisplatin is necessary for the development of ototoxicity. The survival of the animal is still a challenge in the chronic setup of related studies. A study, with a close collaboration between nephrologists and otolaryngologists, on the possible cause of chinchilla's death is necessary. / Introduction: L'usage du cisplatine, connu comme l'un des agents chimiothérapeutiques les plus efficaces, est limité en raison de ses graves effets secondaires, notamment l'ototoxicité. En dépit du progrès dans son traitement préventif, l'ototoxicité reste un effet secondaire important limitant le dosage du cisplatine dans les protocoles chimiothérapeutiques. Le but du présent projet est d'améliorer un modèle animal de chinchilla pour l'administration systémique de cisplatine, et de concevoir un instrument pour l'administration transtympanique de médication/substance au niveau de la membrane de la fenêtre ronde, et ce dans le même modèle animal. Matériel et méthodes: Pour la première partie du projet, un nombre total de 18 chinchillas femelles a été divisé en trois groupes. Les animaux ont été injectés avec 10 mg/kg (n = 6), 10.5 mg/kg (n = 6), et 11 mg/kg (n = 6) de cisplatine par voie intrapéritonéale, par l'intermédiaire d'une seringue électrique programmable. Les réponses du tronc cérébral auditif, avant, 24 et 48 heures après l'injection de cisplatine ont été enregistrées et comparées au niveau des changements de seuil d'audition pour différentes fréquences. La microscopie électronique à balayage a été utilisée pour l'étude des changements morphologiques à la fin de l'expérience. Pour la deuxième partie du projet, un nombre total de 12 chinchillas femelles a été divisé en deux groupes. Les vésicules des chinchillas (n = 8) ont été disséquées pour obtenir une orientation anatomique. Suite à l'achat de l'instrument, l'appareil a été utilisé dans le second groupe (n = 4) afin d'expérimenter son efficacité. Résultats: Une administration intrapéritonéale de 10 mg/kg de cisplatine par injection lente via une seringue électrique programmable induit une perte auditive significative, avec un taux de mortalité minimum dans un modèle animal de chinchilla. Une précise application transtympanique de médication/substance sur la membrane de la fenêtre ronde du modèle animal de chinchilla est possible avec l'utilisation d'un otoscope micro-spécial. Conclusion: Dans le modèle animal de chinchilla, une dose minimale de 10 mg/kg de cisplatine intrapéritonéal est nécessaire pour le développement d'ototoxicité. La survie de l'animal est toujours un défi dans la configuration d'études connexes. Une étude sur la cause possible de la mort du chinchilla s'avère nécessaire et requiert une étroite collaboration entre nephrologues et otolaryngologistes.

Background: Childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a complex disease whose etiology remains largely unknown. Both genetic and environmental factors are believed to be involved in leukemogenesis. It has long been suspected that organic solvents are carcinogens. They are common in the workplace and are potentially important sources of exposure in mothers during various time periods: preconception, pregnancy and postnatal. These time windows are vital for the developing fetus and exposures to carcinogens through the placenta or breast milk could lead to DNA damage. In addition, variants in xenobiotic metabolizing genes that biotransform various chemicals entering the body, in particular CYP (cytochrome P450) and GST (glutathione S-transferase) genes, have equally been linked to the development of ALL. As such, it is quite possible that variants in CYP and GST genes affect the biotransformation of chemicals such as organic solvents in the fetus or infant, leading to increased DNA damage and potentially cancer. Methods: I analyzed the effects of maternal occupational exposure to organic solvents during pregnancy and breastfeeding on the risk of developing ALL in the offspring. The effects of organic solvents from household activities were also investigated in breastfeeding mothers during the postnatal period. In addition, I analyzed the joint effects of case genetic variants in certain likely functional xenobiotic metabolizing genes (CYP1A1, CYP2E1 and GSTM1) with organic solvent exposures. The data was taken from a large population based case-control with 790 cases and 790 controls recruited from Quebec, Canada. The data included state-of-art determination of occupational exposures, household exposures to various environmental exposures, and genotyped DNA samples from the study participants and their parents. The data was analyzed using logistic regression and Poisson log-linear models based on case-control, case-only and case parent-trio designs. Results: Significant main effects were found between case GSTM1 null and CYP1A1 *4 variants and ALL. Additionally, individuals with one copy of the CYP1A1 *2A variant and GSTM1 null had a significant odds ratio of developing ALL at 1.68 (95% CI: 1.03-2.75) as compared to an individual with neither. Offspring with the GSTM1 null variant whose mothers were occupationally exposed to aliphatic alcohols and aliphatic ketones, specific chemical families of organic solvents, during pregnancy had a lower risk of developing ALL than carriers of the wild type carriers. The case-parent trio analysis did detect a harmful interaction effect between offspring with the CYP1A1 *2B variant and maternal occupational exposure to any type of organic solvent during pregnancy. Similarly, the case-only analysis found important harmful interaction effects between the CYP1A1 *2A and *4 variants and maternal occupational exposures to any type of organic solvent during pregnancy and protective interaction effects between GSTM1 null variants and this same exposure. Among mothers who breastfed, exposure to organic solvents from household activities from one year before pregnancy to date of diagnosis did not generally increase the risk of ALL; however, there was evidence to suggest that the GSTM1 null and CYP1A1 *2A variants modified the effect of solvent exposure from furniture stripping, and likewise for the CYP2E1 *5 variant with certain activities involving exposure to electronics. The CYP1A1 *2A variant also appeared to significantly modify the effect of latex and/or acrylic paint exposures in a breastfeeding mother on the risk of ALL. Discussion: Although the study had limited power to uncover statistically significant interactions, the results suggest a role on the incidence of childhood ALL for gene variants involved in the metabolism of carcinogens in the presence of environmental prenatal or breastfeeding exposure to organic solvents. / Introduction: La leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) chez l'enfant est une maladie complexe dont l'étiologie reste peu connue. Des chercheurs soupçonnent que les solvants organiques sont des carcinogènes importants et qu'ils sont présents dans plusieurs lieux de travail. Ces produits chimiques ont le potentiel d'être une source d'exposition chez la mère durant les différentes périodes du développement du foetus, notamment, la préconception, la gestation et le postnatal. De plus, quelques variantes dans les gènes xénobiotiques du métabolisme, qui transforment une multitude de produits chimiques absorbés par le corps, en particularité des variantes dans les gènes CYP (cytochrome P450) et GST (glutathion S-transférase), ont été associées avec la LLA chez l'enfant. Tout cela suggère que les variantes dans les gènes CYP et GST perturbent la biotransformation des produits chimiques, tel que les solvants organiques, chez le fœtus et le nouveau-né, menant à des dommages à l'ADN et possiblement des néoplasies. Méthodes : J'ai analysé les effets de l'exposition maternelle aux solvants organiques pendant la gestation et l'allaitement sur le risque de développer la LLA. Les effets de l'exposition aux solvants organiques retrouvés au domicile ont aussi été investigués chez les mères qui allaitent. De plus, j'ai analysé l'effet cumulatif des variantes dans les gènes CYP et GST et les expositions aux solvants organiques au travail de la mère pendant la gestion et celles au domicile pour les mères qui ont allaité. Les données ont été sélectionnées d'une étude cas-témoin réalisée au Québec, recrutant 790 cas et 790 témoins. Des échantillons d'ADN ont été recueillis des participants et de leurs parents. Les données ont été analysées avec des modèles de régression logistiques et log-linéaire (régression de Poisson) basés sur les concepts de cas-témoins, cas-seul et trio cas-parent. Résultats : Des effets statistiquement significatifs ont été trouvés entre les variantes GSTM1 nulle et CYP1A1 *4 chez l'enfant et la LLA. Les individus qui possèdent une copie de la variante CYP1A1 *2A et de la variante GSTM1 nulle, ont un risque significatif de développer la LLA comparé à des individus avec aucune de ces variantes. Les progénitures d'une mère qui a été exposée à des solvants organiques au travail, particulièrement les alcools aliphatiques et les cétones aliphatiques, qui possèdent la variante GSTM1 nulle, ont un risque inférieur de développer la LLA comparées aux progénitures qui ont le gène de type sauvage. Le trio cas-parent suggérait un effet d'interaction nocive entre la variante CYP1A1 *2B chez la progéniture et l'exposition de la mère à n'importe quel solvant organique au travail pendant la gestation. De même, le type d'étude cas-seul a détecté un effet d'interaction nocive entre les variantes CYP1A1 *2A et *4 et l'exposition de la mère à n'importe quel solvant organique au travail et une interaction protectrice entre la variante GSMT1 nulle et cette même exposition. Le risque de développer la LLA pour les progénitures des mères qui ont allaité et qui ont été exposées à des solvants organiques lors d'activités au domicile pendant une année avant la gestation jusqu'à la date de diagnostic n'était pas élevé. Par contre, les variantes GSMT1 nulle et CYP1A1 *2A ont modifié l'effet des solvants relié à des activités de décapage de meubles et d'électroniques. La variante CYP1A1 *2A a aussi modifié l'effet de l'exposition chez la mère qui allaite aux peintures de type latex et/ou acrylique sur le risque de développer la LLA chez l'enfant. Discussion: Ces résultats suggèrent la possibilité que les variantes des gènes étudiés interagissent avec l'exposition aux solvants organiques pendant la gestation ou l'allaitement chez la mère, pour influencer le risque de développer la LLA chez l'enfant, malgré le pouvoir limité de l'étude pour détecter des interactions statistiquement significatives.

Abstract (English)Introduction: Barrett's esophagus (BE) is a premalignant condition that may progress through a stepwise process to esophageal adenocarcinoma (EAC). It is unknown why some BE patients progress to EAC rapidly while others do so more slowly, or not at all. The aim of this study is to identify the demographic and endoscopic factors that can be used as predictors of dysplastic and neoplastic progression in BE patients, and thereby be used to stratify BE patients into different surveillance protocols according to the risk of neoplastic progression. Method: All BE patients at McGill University Health Center between January 2000 and December 2010 were identified from a pathology database. 1054 patients with intestinal metaplasia on esophageal biopsies were identified. Only those with endoscopic findings of columnar lined mucosa were included in this study, (N=518). Data for demographic variables (e.g., age and gender) and endoscopic variables (presence of hiatus hernia, esophagitis, ulcers, mucosal irregularities and strictures) were collected. Neoplastic and dysplastic progression was examined by time to event analysis. Cox proportional hazard regression modeling and Generalized Estimating Equations (GEE) methods were used to identify the variables that are most predictive of neoplastic progression. Result: From a non-dysplastic BE (NDB) at baseline state, 35(6.7%) patients progressed to dysplastic or neoplastic grades and 10(1.9%) patients progressed to high-grade dysplasia (HGD) or EAC. BE length (HR=1.2, 95%CI=1.1-1.3) and advanced age (HR=3.5, 95%CI=1.7-7.4) were independent predictors of progression from NDB to dysplastic or neoplastic grades. However, mucosal irregularities (HR=8.6, 95%CI=2.4-30.4) and advanced age (HR=5.1, 95%CI=1.7-16.6) were the independent predictors of progression from NDB to HGD/EAC. Conclusion: Advanced age, a long BE segment and presence of mucosal irregularities are associated with increased risk of dysplastic and neoplastic progression in BE patients. In addition to the presence of dysplasia, these factors may help to stratify BE patients according to their risk of neoplastic progression and therefore can be used to individualize BE surveillance. / Abstract (French)Introduction: L'oesophage de Barrett (OB) est un état pré-cancéreux qui peut mener à l'adénocarcinome invasif (ACI) de l'oesophage. Les causes de la progression chez certains patients ayant un OB à l'ACI demeurent inconnues. Le but de cette étude est d'identifier les facteurs démographiques et endoscopiques comme prédicteurs de la progression dysplasique et néoplasique chez le patient atteint de l'OB et ainsi permettre la stratification de ceux-ci dans différents protocoles de surveillance selon le risque de la progression néoplasique.MéthodesTous les patients atteints de l'OB au centre hospitalier du centre universitaire de santé McGill entre janvier 2000 et décembre 2010 ont été revus à partir d'une base de données en pathologie. Les patients présentant une métaplasie intestinale dans les biopsies oesophagiennes ont été identifiés. Seuls ceux ayant un épithélium métaplasique cynlindrique confirmé à la pathologie ont été inclus. Les données suivantes ont été enregistrées : les variables démographiques (l'âge et le sexe) ainsi que les variables endoscopiques (présence de hernie hiatus, esophagites, ulcères, irrégularités au niveau de l'épithélium et sténoses). La progression dysplasique et néoplasique a été examinée par une analyse au temps de l'inclusion à l'évènement. La régression de Cox et la méthode GEE (Generalized Estimating Equations) ont été utilisées pour identifier les variables prédisant la progression néoplasique.Résultats: À partir de 1054 patients atteints de l'OB dont 518 présentant une métaplasie intestinale à la biopsie et ne présentant aucune dysplasie (OBND) à l'entrée de l'étude, 35 (6.7%) d'entre eux ont progressé à un grade de dysplasie ou de néoplasie et 10 (1.9%) d'entre eux ont progressé à une dysplasie de haut grade (DHG) ou à un ACI. Un OB long (HR=1.2, 95%IC=1.1-1.3) et l'âge (HR=3.5, 95%IC=1.7-7.4) sont des prédicteurs de la progression d'un OBND à un grade de dysplasie. Cependant, une irrégularité de l'épithélium (HR=8.6, 95%CI=2.4-30.4) ainsi que l'âge (HR=5.1, 95%CI=1.7-16.6) sont des prédicteurs de la progression d'un état OBND à une DHG ou à l'ACI.Conclusion L'âge, un long segment de OB et la présence d'irrégularités au niveau de l'épithélium ont démontré un risque accru de dysplasie et de progression néoplasique chez les patients atteints de l'OB. En plus de la présence de dysplasies, ces facteurs peuvent aider à stratifier les patients selon leur risque de progression néoplasique et peuvent donc être utilisés pour individualiser la surveillance de l'OB.

The use of the biguanide metformin for the management of type 2 diabetes has been associated with reduced cancer burden and mortality by several population studies. Our previous work has demonstrated that metformin has growth inhibitory effects in vitro that are related to AMPK phosphorylation, leading to mTOR inhibition. Prior evidence linked the activation of AMPK to a decline in ATP as a result of the inhibitory effects of metformin on complex 1 of the mitochondria. In view of this finding, we studied the inhibitory effects of metformin on proliferation as a function of carbon source in several transformed cell lines. Our results demonstrated that the consequences of exposure to metformin vary as a function of carbon source. The greatest inhibition by metformin resulted in the presence of glutamine and absence of glucose. This finding together with prior evidence linking myc expression to "glutamine addiction", led us to examine the effects of varying myc level on metformin sensitivity. Our results revealed the overexpression of this oncogene to be associated with sensitization to the antiproliferative effects of metformin. This suggests that for a subset of neoplasms in which myc is overexpressed, biguanides may provide significant antiproliferative activity.In view of preliminary evidence suggesting defective mitochondrial function in patients with Ataxia-Telangiectasia, we examined whether the ATM inhibitor KU55933 resulted in similar antiproliferative effects to those of metformin. Our results indicated that similar to metformin, KU-55933 exposure resulted in inhibition of proliferation. Furthermore, analogous to the effects of metformin on metabolism, the compound also increased AMPK activation, glucose uptake, and lactate production, while reducing mitochondrial membrane potential and coupled respiration. Our observations suggest a role for ATM in mitochondrial function, and reveal that both KU-55933 and metformin perturb the TCA cycle and oxidative phosphoryaltion. / L'utilisation de la metformine, un biguanide, pour la gestion de diabète de type 2, a été associée à une réduction du risque de cancer et de mortalité due au cancer par plusieurs études de population. Nos travaux antérieurs ont démontré que la metformine a des effets inhibiteurs de la croissance cellulaire in vitro qui sont liés à la phosphorylation d'AMPK, conduisant à une inhibition de mTOR. De plus, des études précédentes ont montré que l'activation de l'AMPK est liée à une baisse de l'ATP suite aux effets inhibiteurs de la metformine sur le complexe 1 de la mitochondrie. Compte tenu de ces résultats, nous avons étudié les effets inhibiteurs de la metformine sur la prolifération en fonction de la source de carbone dans plusieurs lignées cellulaires transformées. Nos résultats ont démontré que les conséquences de l'exposition à la metformine varient en fonction de la source de carbone. La plus grande inhibition par la metformine se produit en présence de glutamine et en l'absence de glucose. Ces résultats, conjointement avec des observations antérieures liant l'expression de myc à la «dépendance à la glutamine», nous a conduits à examiner les effets de la variation des niveaux de myc sur la sensibilité à la metformine. Nos résultats ont révélé que la surexpression de cet oncogène est associée à une sensibilisation aux effets anti-prolifératifs de la metformine. Cela suggère que pour un sous-ensemble des néoplasmes dans lequel myc est surexprimé, les biguanides peuvent apporter une importante activité anti-proliférative. Compte tenu des preuves préliminaires suggérant une fonction mitochondriale défectueuse chez les patients atteints d'ataxie télangiectasie, nous avons examiné si l'inhibiteur de l'ATM KU55933 produit des effets antiprolifératifs similaires à ceux de la metformine. Nos résultats indiquent que comme la metformine, l'exposition à KU-55933 a entraîné une inhibition de la prolifération cellulaire. En outre, KU-55933 provoque des effets analogues à ceux de la metformine sur le métabolisme : soit une augmentation de l'activation de l'AMPK, de l'absorption du glucose et de la production de lactate, tout en réduisant le potentiel de membrane mitochondriale et la respiration couplée. Nos observations suggèrent un rôle pour l'ATM dans la fonction mitochondriale et révèle que KU-55933 et la metformine peuvent perturber le cycle de Krebs et la phosphorylation oxydative.

Introduction: There is increasing evidence to suggest that functional capacity assessment can identify patients at high risk for major surgery, however previous studies have used heterogeneous patient populations. We sought to investigate the effect of poor functional capacity on the incidence of postoperative complications in a population of subjects undergoing elective colorectal surgery. Methods: A retrospective cohort study of adult subjects undergoing elective colorectal resection at a single university-affiliated institution from 2005 to 2011 who were participants in three clinical trials was performed. The main exposure variable was poor functional capacity as measured by cardiopulmonary exercise testing (CPET) or by the distance walked in six-minutes (6MWT). The main outcome variable was complications that occurred within 30 days of the index operation and length of stay. Receiver-operating characteristics curves identified threshold for increased perioperative risk. Multiple regression models estimated the effect of exposure on the outcome by adjusting for confounders. Results: A total of 296 were included in the overall subject cohort. The 6MWT was available in all subjects, and CPET was available in 114 subjects. The overall incidence of postoperative complications was 42% (126/296). The threshold for increased perioperative risk was found to be a peak oxygen consumption (VO2) < 72% of predicted,and a 6MWT < 392 meters. After adjusting for confounders, the odds of suffering a major complication was 7.66 times (95% confidence interval 1.57–37.44) higher in subjects with peak VO2 < 72% of predicted compared to those with peak VO2 ≥ 72% of predicted. The odds of suffering a cardiopulmonary complication (OR 4.75, 95% CI1.46–15.44) or minor complications (OR 1.87, 95% CI 1.02 – 3.46) was significantly higher in subjects with 6MWT < 392 meters. However, major complications were not associated with 6MWT < 392 meters (OR 1.10, 95% CI 0.42–2.99), after adjusting for confounders. Conclusions: Poor functional capacity is associated with increased perioperative risk in subjects undergoing elective colorectal surgery. Functional capacity assessment can be performed using CPET or the 6MWT. / Introduction: Il existe un nombre croissant de preuves qui suggèrent que l'évaluation de la capacité fonctionnelle permet d'identifier les patients à hauts risques pour une chirurgie majeure. Toutefois, les études antérieures ont été basées sur des populations de patients hétérogènes. Nous avons cherché à étudier l'impact d'une faible capacité fonctionnelle sur l'incidence de complications postopératoires au sein d'une population de patients devant subir une chirurgie colorectale. Méthodes: Nous avons réalisé une étude de cohorte de patients adultes, ayant subi une résection colorectale entre 2005 et 2011 dans une même institution affiliée à une université, qui avaient participé à trois essais cliniques. La variable d'exposition principale était une faible capacité fonctionnelle telle que mesurée par l'épreuve fonctionnelle d'exercice (EFX) ou par le test de marche de six minutes (TDM6). Les objectifs principaux étaient les complications développées durant les 30 jours suivant l'opération indexée ainsi que la durée du séjour hospitalier. Les valeurs seuils corrélées avec les complications ont été identifiées à l'aide de courbes ROC. Les modèles de régression multiples ont permis d'estimer l'effet de l'exposition sur les objectifs principaux en ajustant pour les facteurs confondants Résultats: Un total de 296 patients ont été inclus dans la cohorte. Les résultats du TDM6 étaient disponibles pour tous les patients et ceux de l'EFX l'étaient pour 114 patients. L'incidence globale des complications postopératoires était de 42% (126/296). La valeur seuil corrélée avec les complications était un pic de consommation d'oxygène (VO2pic)inférieur au 72% de prédiction et un TDM6 inférieur à 392 mètres. Après l'ajustementpour les facteurs confondants, les chances de développer une complication majeure étaient 7.66 fois (intervalle de confiance à 95%: 1.57-37.44) plus élevées chez les patientsavec un VO2pic < 72% de prédiction. Un TDM6 < 392 mètres était indépendamment associé à une chance plus importante de développer une complication cardio-pulmonaire(OR ajusté 4.75, IC à 95% 1.46-15.44) ou une morbidité mineure (ORa 1.87, IC à 95%1.02-3.46), mais pas une complication majeure (ORa 1.10, IC à 95% 0.42-2.99). Conclusion: Une faible capacité fonctionnelle est associée à des risques péri-opératoires plus élevés chez les patients subissant une chirurgie colorectale. Une évaluation de la capacité fonctionnelle peut être réalisée à l'aide de l'EFX ou du TDM6.

Objective: To prospectively evaluate the role of sentinel lymph node (SLN) biopsy in the management of well differentiated thyroid carcinoma (WDTC)Methods: I designed and implemented a SLN biopsy protocol and subsequently performed it on consecutive patients undergoing thyroid surgery. Thyroid nodules were injected with methylene blue dye. A central compartment neck dissection (CCND) was performed. Frozen section analysis of the SLNs was performed.Results: 157 patients are included in this study. 94 patients had WDTC. Sevently three percent (69/94) of WDTC patients were found to have detectable SLNs. Twenty percent (14/69) of patients with SLNs were found to have central compartment metastases. The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of our SLN biopsy technique to remove all disease from the central compartment was 92.9%, 100%, 100% and 98.8% respectively (p < 0.0001). Conclusion: This data series suggests that if a patient has SLNs deemed as negative for malignancy on frozen section, the rest of the central compartment is unlikely to have lymph node metastasis. / Contexte: Notre objectif est d'évaluer prospectivement le rôle du biopsy ganglion sentinelle dans la gestion du cancer de la thyroïde bien différencié Méthodes: Nous avons conçu et mis en place un protocole de biopsie du ganglion sentinelle et par la suite effectuées notre protocol sur des patients consécutifs subissant une thyroïdectomie. Les nodules ont été injectés avec du bleu de méthylène. Un dissection du cou central a été effectuée. Examen intra-operatoire des ganglion a été réalisée.Résultats: 157 patients sont inclus dans cette étude. 94 patients avaient un dissection central du cou. 73% (69/94) des patients ont été trouvés à avoir ganglion détectable. 20% (14/69) des patients atteints de ganglion ont été trouvés à avoir des métastases compartiment central. La sensibilité, spécificité, valeur prédictive positive et valeur prédictive négative de notre technique de biopsie du ganglion sentinelle pour enlever toutes les maladies à partir du compartiment central était de 92,9%, 100%, 100% et 98,8% respectivement (p <0,0001).Conclusion: Cette série de données volumineux suggère que si un patient a jugé comme négatif intra-operatoire de malignité sur la section gelée, un dissection central peut être preventire.

In the last decade, dance has been used as an innovative form of rehabilitation for different medical conditions. However, there is not much documented research on rehabilitation programs based on partnered dancing. Studies on the use of Argentine tango have proved its feasibility as a form of rehabilitation for Parkinson's disease. The fact that dance is a pleasurable activity for participants enhances program adherence. The aim of this work is to understand the benefits and meanings that tango, a form of partnered dancing, has for people with Parkinson's disease in their healing processes. The thesis first reviews several theoretical frameworks helpful for understanding the benefits of using dance as a form of rehabilitation. I review the theoretical foundations of Dance Movement Therapy and Medical Dance Movement Therapy, philosophical perspectives on the body, and the motivational theory of flow. I also present research that has explored how dance can be used as an innovative tool in rehabilitation. Secondly, I present the results of fieldwork consisting of six in-depth interviews with Parkinson disease patients enrolled in an Argentine tango program offered by a public hospital Neurological Department in Buenos Aires, Argentina. Five themes illustrating the positive perceptions participants had of the program emerged: 1) the role of "others" in a process of curing and healing; particularly the group and the instructors; 2) the use of tango as a strategy to apply in daily life; 3) the sense of liberation, connected with embodied feelings of freedom and security; 4) the importance of recuperating something from the past and its impact on sense of self and; 5) the impact of offering an art-based intervention regarding perception as patients, the medical institution and the physical environment of care. The results of this study show that Argentine tango should be considered a feasible rehabilitation tool for Parkinson's disease, since as an art form and a non-medical activity it provides positive physical, emotional and spiritual outcomes to participants. / Dans la dernière décennie, la danse a été utilisée comme une forme de réhabilitation innovatrice pour différentes conditions médicales. Toutefois, il n'y a pas beaucoup de recherches documentées sur ces programmes de réhabilitation ayant comme objet la danse avec un partenaire. Les études portant sur l'utilisation du tango argentin prouvent cette faisabilité en tant que moyen de réhabilitation pour la maladie de Parkinson (MP). Le fait que la danse est une activité qui procure du plaisir aux participants renforce l'adhésion au programme. Le but de ce travail est de comprendre les avantages et la compréhension du tango argentin, une forme de danse avec un partenaire, qu'a sur les gens atteints de la MP dans leur processus de guérison. Premièrement, cette thèse revoie plusieurs travaux portant sur la théorie de l'aide de la danse. Ayant comme théorie, les avantages d'utiliser la danse comme forme de réhabilitation. Je révise les fondements de la théorie de la thérapie de la danse en mouvement, les perspectives philosophiques sur le corps et les flux de motivation de la théorie. Je présente également de la recherche ayant explorée comment la danse peut être utilisée comme un outil innovateur de réhabilitation. Je présente des résultats obtenus en ayant interrogés six patients atteints de la MP qui participent au programme de tango argentin offert par le département de neurologie d'un hôpital public de Buenos Aires, Argentine. Cinq thèmes illustrant la perception positive des participants ont émergés: 1) le rôle des « autres » dans le processus de cure et de recouvrement, particulièrement le groupe et les instructeurs; 2) l'utilisation du tango comme stratégie à appliquer dans la vie de tous les jours; 3) le sens de libération allié aux sentiments internes de liberté et de sécurité; 4) l'importance de la récupération de quelque chose du passé et son impact sur l'écoute de soi; 5) l'impact d'offrir une intervention artistique basé sur le tango argentin est probable pour la réhabilitation de la MP étant donné que c'est une forme d'art et non une activité médicale, elle procure une réaction physique, émotionnelle, et spirituelle positive chez les participants.

Cell polarity and lumenogenesis within epithelial cells are complex processes regulating normal tissue development and architecture. Deregulation in these processes lead to developmental defects and cancer. During pregnancy and lactation epithelial cells of the mammary gland undergo dramatic growth and morphogenesis, creating a fully differentiated lobuloalveolar network. These structures are characterized by polarized epithelial cells with tight junctions surrounding a central lumen crucial for the proper synthesis and directional secretion of milk proteins needed for breastfeeding. Extensive research has demonstrated that a major contributor of change seen during late pregnancy and lactation is the hormone prolactin (PRL). To investigate the role of PRL in this process, we have established a 3D culture assay using the mammary epithelial cell line HC11. For the first time, our lab reports PRL as a major contributor of epithelial polarity and lumen formation in mammary cells. HC11 cells cultured in the presence of PRL formed mammary acini with a single central lumen accompanied by the correct localization of the apical marker ZO-1 and the lateral/basal marker E-Cadherin. Treatment of HC11 cells with PRL also resulted in a small, yet reproducible inhibitory effect on cellular migration, but not proliferation. Using genetic manipulation, we found that the PRL-induced epithelial polarity was JAK2-dependent. Furthermore, we report that JAK2 is essential for proper PRLR localization, along with membrane localization of polarity proteins E-cadherin and ZO-1. Together, we report here that PRL is an important polarity signal in mammary epithelial cells, which gives new insight into the mechanisms governing its role in mammary gland development and tumour suppression. / La polarité cellulaire, ainsi que la formation du lumen des cellules épithéliales, sont des procédés complexes qui régulent le développement et l'architecture des tissus normaux. La dérégulation de ces procédés mène à des défectuosités du développement et au cancer. Durant la grossesse et l'allaitement, les cellules épithéliales de la glande mammaire subissent une croissance et un changement de morphologie dramatiques, créant ainsi un réseau lobulo-alvéolaire complètement différencié. Ces structures sont caractérisées par des cellules épithéliales polarisées, avec des jonctions serrées entourant un lumen central qui est crucial pour la synthèse et la sécrétion des protéines du lait nécessaires à l'allaitement. Des recherches approfondies ont démontré que l'hormone prolactine (PRL) est une contributrice majeure aux changements observés durant les derniers stages de la grossesse et l'allaitement. Pour déterminer le rôle de la PRL dans ce procédé, nous avons établi un test de culture 3-D en utilisant la lignée de cellules mammaires épithéliales HC11. Pour la première fois, notre laboratoire rapporte la prolactine comme étant une contributrice majeure à la polarité épithéliale et à la formation du lumen des cellules mammaires. Les HC11 cultivées en présence de la PRL forment des acini mammaires avec un seul lumen central accompagné d'une localisation appropriée du marqueur apical ZO-1 et du marqueur latéral/basal E-cadherin. Le traitement des HC11 avec la PRL résulte aussi à une faible mais consistante inhibition de la migration cellulaire, mais pas de la prolifération. En utilisant des manipulations génétiques, nous avons trouvé que la polarité épithéliale induite par la PRL était dépendante de JAK2. De plus, nous rapportons que JAK2 est essentielle à la localisation appropriée du PRLR, ainsi qu'à la localisation des protéines de polarité E-cadherin et ZO-1. Nous rapportons ici que la PRL est un important signal de polarité dans les cellules épithéliales mammaires, ce qui nous donne une meilleure compréhension du mécanisme gouvernant son rôle dans le développement de la glande mammaire et la suppression de tumeur.