Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 IvaldoRT.pdf: 3649445 bytes, checksum: 624c427ba32cfc36890765f50db5140c (MD5) Previous issue date: 2000-05-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Great part of the gold mineralizations are associated with shearing zones through which circulate a great volume of fluids, that interact with the host rocks, originating leaching or precipitation of chemical elements, including gold. The studied mineralizations are inserted in the Serid? Belt. The tungsten mineralization in Breju? Mine is hosted in calcsilicate rocks from Jucurutu Formation. The S?o Francisco auriferous mineralization has as host rocks mica-schists from Serid? Formation, while the Ponta da Serra and Fazenda Simp?tico mineralizations are hosted in orthogneisses of this fold belt basement. The research conducted on these mineralizations had the purpose of integrate the data of chemical elements behavior during the shearing/mineralizing event, and its influence on the isotopic systems Rb-Sr and Sm-Nd. The studies of chemical mobility in the auriferous mineralizations showed that elements that during the shearing displayed in general an immobile behavior were Al, Ti and Zr. Among the elements that were mobilized during the event, K and Rb showed mass gain in ali belts of transformed rocks, while the elements Ca, Na and Sr normally lost mass. Petrographic studies showed that the minerais biotite and plagioclase, in all investigated mineralizations, played an important role in the chemical reactions occurred in the transformed rocks to the generation of muscovite, cordierite and sillimanite, justifying the input of K to the formation of muscovite, and the release of Na and Ca from plagioclase to the fluid phase. In the S?o Francisco auriferous mineralization, the results of the Rb-Sr isotopic analysis yielded ages of 645 ? 19 Ma and 596 ? 17 Ma, with both samples, from original and transformed rocks. Two ages, 569 ? 20 Ma. and 554 ? 19 Ma., were obtained with samples frem the transformed rocks domain. These ages suggest that there were two metamorphic pulses during the emplacement of the mineralized shearing zone. The Sm-Nd data yielded TDM ages of 1,31 Ga and 1,26 Ga with 3Nd (0,6 Ga) of -0,26 e -0,40 for the original and final transformed rocks, respectively. In case of the orthogneisses of Caic? Complex, e.g. the Ponta da Serra and Fazenda Simp?tico mineralizations, the Rb-Sr data did not yield ages with geological significance. In the Ponta da Serra mineralization, the Sm-Nd isotopic data yielded T DM ages of 2,56 Ga and 2,63 Ga to the original rocks and of 2,71 Ga to the mineralized sheared rock, and values of 3Nd (2,0 Ga) between -3,70 e -5,42 to the original and sheared rock, respectively. In the Fazenda Simp?tico, Sm-Nd data yielded TDM between 2,65 and 2,69 Ga with values of 3Nd (2,0 Ga) between -5,25 e -5,52. Considering the Sm-Nd data, the TDM ages may be admitted as the age of the parental magma extraction, producer of the protoliths of the orthogneisses from Ponta da Serra and Fazenda Simp?tico mineralizations. The chemical mobility studies showed that in the basement hosted mineralizations, Rb achieved mass while Sr lost mass, as Sm as well as Nd were strongly mobilized. The Sm/Nd ratio remained constant, however, confirming the isochemical character of those elements. In the basement mineralizations, Rb-Sr ages are destituted of geological significance, because of the partial opening of the isotopic system during the tectono-metamorphic transformations. In the tungsten mineralization, the diagram Sm-Nd constructed with the whole-rock data of calcsilicatic and the high-temperature paragenesis (garnet, diopside and iron-pargasitic hornblende) indicated an 631 ? 24 Ma age, while with the whole-rock data and low-temperature paragenesis (vesuvianite, epidote and calcite), a 537 ? 107 Ma age was obtained. These ages, associated with the petrographic observations, suggest that there was a time gap among the hydrothernal events responsible by the formation of the high and low temperature paragenesis in the calcsilicatic rocks mineralized in scheelite / As mineraliza??es estudadas est?o inseridas na Faixa de dobramento Serid?. A scheelit?fera de Breju? est? hospedada em rochas calciossilic?ticas da Forma??o Jucurutu. A mineraliza??o aur?fera de S?o Francisco tem como hospedeiros micaxistos da Forma??o Serid?, enquanto que as mineraliza??es de Ponta da Serra e da Fazenda Simp?tico est?o hospedadas em ortognaisses do embasamento desta faixa de dobramentos. Grande parte das mineraliza??es de ouro est?o associadas ? zonas de cisalhamento que funcionam como conduto para a circula??o de um grande volume de fluidos, que interagem com as rochas hospedeiras provocando lixivia??o ou precipita??o de elementos qu?micos, incluindo o ouro. Estas foram algumas das principais caracter?sticas observadas nas mineraliza??es aqui estudadas. A pesquisa realizada nas mineraliza??es de ouro teve a finalidade de integrar os dados do comportamento de elementos qu?micos durante o evento cisalhamento/mineralizante, e sua influ?ncia nos sistemas isot?picos Rb-Sr e Sm-Nd. Os estudos de mobilidade qu?mica mostraram que os elementos, que durante o cisalhamento, de uma forma geral apresentaram um coportamento im?vel, foram o AI, Ti e Zr. Dentre os elementos que foram mobilizados durante o evento, o K e o Rb mostraram ganho de massa em todas as faixas de rochas transformadas, enquanto que os elementos Ca, Na e o Sr normalmente perderam massa. Os elementos Sm e Nd na mineraliza??o de S?o Francisco se comportaram como im?veis e em Ponta da Serra e Fazenda Simp?tico perderam massa. Os estudos petrogr?ficos mostraram que os minerais biotita e plagiocl?sio, em todas as mineraliza??es estudadas, tiveram papel importante nas rea??es qu?mica ocorridas nas rochas transformadas para a gera??o de muscovita, cordierita e silimanita, justificando a entrada do K para forma??o da muscovita e da libera??o de Na e Ca do plagiocl?sio para a fase fluida. Na mineraliza??o aur?fera de S?o Francisco, os resultados das an?lises isot?picas de Rb e Sr, forneceram idades de 645 ? 19 Ma e de 596 ? 17 Ma com amostras das rochas originais e transformadas juntas. Duas idades, 569 ? 20 Ma e 554 ? 19 Ma foram obtidas com as amostras do dom?nio das rochas transformadas. Estas idades s?o sugestivas de que houve dois pulsos metam?rficos durante a instala??o da zona de cisalhamento mineralizada. Os dados Sm-Nd forneceram idades TDM de 1,31 Ga e de 1,26 Ga com 3Nd (0,6 Ga) de -0,26 e -0,40 respectivamente para a rocha original e transformada final. Para os ortognaisses do Complexo Caic?, caso da mineraliza??o de Ponta da Serra e da Fazenda Simp?tico, os dados Rb-Sr n?o forneceram idades com significado geol?gico. Na mineraliza??o de Ponta da Serra, os dados isot?picos Sm-Nd forneceram idades T DM de 2,56 Ga e 2,63 Ga para as rochas originais e de 2,71 Ga para a rocha cisalhada, mineral?zada e valores de 3Nd (2,0 Ga) entre -3,70 e -5,42 para rocha original e cisalhada respectivamente. Na Fazenda Simp?tico os dados de Sm-Nd forneceram as idades T DM ficaram entre 2,65 e 2,69 Ga com valores de 3Nd (2,0 Ga) entre -5,25 e -5,52. Quanto aos dados Sm-Nd as idades T DM podem ser admitidas como a idade de extra??o do magma parental formador dos prot?l?tos dos ortognaisses das mineraliza??es Ponta da Serra e da Fazenda Simp?tico. Os valores de 3Nd baixos e negativos sugerem uma fonte crustal, ou a participa??o de duas fontes (mantocrosta) . Os estudos de mobilidade qu?mica mostraram que nas mineraliza??es hospedadas no embasamento, o Rb ganhou massa enquanto o Sr perdeu massa e tanto o Sm quanto o Nd, foram fortemente mobilizados. As raz?es Sm/Nd entretanto se mantiveram constantes, confirmando o car?ter isoqu?mico destes elementos. Nas mineraliza??es do embasamento, idades pelo m?todo Rb-Sr s?o desprovidas de significado geol?gico, em fun??o da abertura parcial do sistema isot?pico durante as transforma??es tectonometam?rficas. Na mineraliza??o scheelit?fera foi realizado um estudo geocronol?gico Sm-Nd com o intuito de se obter as idades das parag?neses formadas durante os eventos hidrotermais sofridos pelas rochas calciossilic?ticas mineralizadas. O diagrama Sm-Nd constru?do com os dados de rocha total e parag?nese de alta temperatura (granada, diops?dio e hornblenda ferropargas?tica) forneceu uma idade de 631 ? 24 Ma, e com os dados de rocha total e parag?nese de baixa temperatura (vesuvianita, epidoto e calcita), foi obtida uma idade de 537 ? 107 Ma. Estas idades associadas com as observa??es petrogr?ficas sugerem que houve um lapso de tempo entre os eventos hidrotermais respons?veis pelas forma??es das parag?neses de alta e de baixa temperatura nas rochas calciossilic?ticas mineralizadas em scheelita

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:56:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 405417.pdf: 1389351 bytes, checksum: 6f00a0ed9add46a5b7f8106681a81fdd (MD5) Previous issue date: 2008-01-31 / Com abertura do mercado de energia el?trica e o aumento da competitividade no setor el?trico brasileiro, as concession?rias de energia buscam ferramentas para minimizar as perdas comerciais e maximizar seus lucros. Visando solucionar este problema foi desenvolvido um m?todo de minera??o de dados para detec??o de desvio de comportamento no uso de energia em concession?ria de energia el?trica. Pois quanto menos perde-se, menos precisa ser gerado, e menos se desperdi?a recursos naturais. Na elabora??o do m?todo compreendeu etapas de an?lise e avalia??o dos dados, assim como constru??o de um Data Warehouse mais adequado para o desenvolvimento deste trabalho. Foram analisadas curvas de cargas dos clientes e atrav?s dessa an?lise observou-se o perfil de consumo dos mesmos, embasados na an?lise foram aplicados os algoritmos de minera??o de dados, como o algoritmo de associa??o Apriori para fornecer padr?es de indicadores de perfil dos consumidores bem como os algoritmos de ?rvore de Decis?o e Classificadores Bayesianos. Os resultados validam o m?todo desenvolvido e implementado permitindo sua utiliza??o em uma concession?ria de energia el?trica sendo utilizado como mais uma ferramenta de GLD para auxiliar e somar-se a a??es j? existentes na concession?ria.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:56:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 388093.pdf: 2571421 bytes, checksum: 24dba4cbf5ab13c6a005e3d642b95d63 (MD5) Previous issue date: 2006-10-30 / O objetivo desta disserta??o ? desenvolver um modelo completo de minera??o de dados no ambiente de uma opera??o de telecomunica??es, com foco na reten??o de clientes usu?rios do STFC ( Servi?o Telef?nico Fixo Comutado). Atualmente, a manuten??o da base de clientes ? ponto crucial para a atua??o das operadoras de telecomunica??es no pa?s. Com o surgimento de novas tecnologias de comunica??o e com a populariza??o de acessos de banda larga e do SMP (Servi?o M?vel Pessoal), as taxas de cancelamentos dos acessos de STFC exigem das operadoras que oferecem o servi?o um processo consistente visando ? reten??o de sua planta f?sica instalada e da receita gerada. Atrav?s da constru??o de um modelo de minera??o de dados, formou-se um sistema visando ? predi??o de eventos e a classifica??o de clientes. O evento a ser previsto ? o churn (cancelamento do servi?o), com base na utiliza??o de algoritmos classificadores aplicados sobre uma base de dados real, contendo informa??es cadastrais, de relacionamento com o fornecedor, de consumo e faturamento. A forma??o do modelo de minera??o de dados envolveu as etapas de an?lise do problema (churn), avalia??o e entendimento dos dados, pr?-processamento e classifica??o. Como algoritmos classificadores (utilizados na predi??o), foram estudados e utilizados tr?s m?todos: redes Neurais RBF ( Radial Basis Function), ?rvores de Decis?o e Classificadores Bayesianos. Os resultados obtidos validam o modelo desenvolvido, permitindo a sua utiliza??o e aperfei?oamento no ambiente de uma operadora de telecomunica??es ou ainda como um modelo gen?rico de minera??o de dados, pass?vel de aplica??o em diferentes segmentos envolvendo o problema da reten??o e fideliza??o de clientes

Submitted by PPG Ci?ncia da Computa??o (ppgcc@pucrs.br) on 2018-02-16T13:18:07Z No. of bitstreams: 1 Ant?nio_do_Nascimento_Le?es_ Neto_Dis.pdf: 1049012 bytes, checksum: 293046d3be865048cd37706b38494e1a (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-02-22T16:34:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Ant?nio_do_Nascimento_Le?es_ Neto_Dis.pdf: 1049012 bytes, checksum: 293046d3be865048cd37706b38494e1a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-22T16:40:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ant?nio_do_Nascimento_Le?es_ Neto_Dis.pdf: 1049012 bytes, checksum: 293046d3be865048cd37706b38494e1a (MD5) Previous issue date: 2017-11-20 / The accelerated growth of data repositories, in the different areas of activity, opens space for research in the area of data mining, in particular, with the methods of classification and combination of classifiers. The Boosting method is one of them, which combines the results of several classifiers in order to obtain better results. The main purpose of this dissertation is the experimentation of alternatives to increase the effectiveness and performance of the algorithm AdaBoost.M1, which is the implementation often employed by the Boosting method. An empirical study was perfered taking into account stochastic aspects trying to shed some light on an obscure internal parameter, in which algorithm creators and other researchers assumed that the training error threshold should be correlated with the number of classes in the target data set and logically, most data sets should use a value of 0.5. In this paper, we present an empirical evidence that this is not a fact, but probably a myth originated by the mistaken application of the theoretical assumption of the joint effect. To achieve this goal, adaptations were proposed for the algorithm, focusing on finding a better suggestion to define this threshold in a general case. / O crescimento acelerado dos reposit?rios de dados, nas diversas ?reas de atua??o, abre espa?o para pesquisas na ?rea da minera??o de dados, em espec?fico, com os m?todos de classifica??o e de combina??o de classificadores. O Boosting ? um desses m?todos, e combina os resultados de diversos classificadores com intuito de obter melhores resultados. O prop?sito central desta disserta??o ? responder a quest?o de pesquisa com a experimenta??o de alternativas para aumentar a efic?cia e o desempenho do algoritmo AdaBoost.M1 que ? a implementa??o frequentemente empregada pelo Boosting. Foi feito um estudo emp?rico levando em considera??o aspectos estoc?sticos tentando lan?ar alguma luz sobre um par?metro interno obscuro em que criadores do algoritmo e outros pesquisadores assumiram que o limiar de erro de treinamento deve ser correlacionado com o n?mero de classes no conjunto de dados de destino e, logicamente, a maioria dos conjuntos de dados deve usar um valor de 0.5. Neste trabalho, apresentamos evid?ncias emp?ricas de que isso n?o ? um fato, mas provavelmente um mito originado pela aplica??o da primeira defini??o do algoritmo. Para alcan?ar esse objetivo, foram propostas adapta??es para o algoritmo, focando em encontrar uma sugest?o melhor para definir esse limiar em um caso geral.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:48:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 399894.pdf: 2578031 bytes, checksum: 13c49dacd5dde6e8b24f2ef51ae6b87a (MD5) Previous issue date: 2007-01-11 / Um processo de neg?cio define um conjunto de atividades junto com os seus poss?veis fluxos de execu??o e recursos necess?rios. Trabalhos da ?rea de Business Intelligence (BI) t?m destacado o papel da minera??o de dados como instrumento facilitador da an?lise, previs?o e otimiza??o de processos de neg?cio. Uma das tarefas mais utilizadas da minera??o de dados ? a classifica??o, cujo objetivo ?, dado um conjunto de dados ou inst?ncias de treino, induzir um modelo preditivo capaz de associar a cada inst?ncia sua classe ou categoria. Espera-se que este modelo seja bem sucedido na classifica??o de novas inst?ncias. No contexto de processos de neg?cio, o uso da classifica??o tem como objetivo entender as causas de determinados comportamentos e gerar modelos de predi??o do comportamento e do desempenho dos processos. Problemas pr?ticos de classifica??o de padr?es e descoberta de conhecimento requerem a sele??o de subconjuntos de atributos preditivos para representar os padr?es a serem classificados, pois a presen?a de atributos preditivos irrelevantes, redundantes ou em grande quantidade pode prejudicar a qualidade do modelo de classifica??o. Em classifica??o de processos de neg?cio, ? bastante interessante a utiliza??o de sele??o de atributos, visto que a quantidade de atributos que caracterizam um processo pode ser enorme. Al?m dos atributos diretamente relacionados a uma inst?ncia de processo, tamb?m devem ser considerados os atributos pertencentes ?s atividades contidas neste processo. Assim, este trabalho prop?e a utiliza??o de algoritmos gen?ticos multiobjetivos para sele??o de atributos em problemas de classifica??o de processos de neg?cio. Os resultados obtidos foram considerados satisfat?rios, visto que os crit?rios utilizados na fun??o de fitness, ou seja, os crit?rios a serem otimizados, foram melhorados. Problemas espec?ficos do dom?nio de processos de neg?cio foram detectados. Esses problemas surgem em virtude da presen?a de caminhos alternativos e ordem de execu??o das atividades nos fluxos de processos. Embora tais problemas n?o sejam tratados no presente trabalho, s?o apresentadas poss?veis solu??es a serem abordadas em trabalhos futuros.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 423037.pdf: 1478944 bytes, checksum: d2974fba2b6145147b3c83b7003075fb (MD5) Previous issue date: 2010-03-16 / Embora o ?ltimo levantamento epidemiol?gico (BRASIL, 2006) revele uma sens?vel melhora na condi??o bucal da popula??o brasileira nas ?ltimas duas d?cadas, patologias bucais ainda demandam grandes investimentos financeiros por parte do governo federal. Este trabalho tem como objetivo desenvolver e documentar uma abordagem computacional (Knowledge Discovery in Database) capaz de gerenciar grandes volumes de dados e produzir modelos mais compreens?veis para o suporte ? tomada de decis?o, formula??o de melhores pol?ticas de sa?de bucal, bem como a viabiliza??o de novas atividades de ensino e pesquisa na ?rea. Para tanto, analisamos uma amostra de dados referente ?s fichas odontol?gicas de 598 pacientes de baixa renda, atendidos junto a uma unidade da PUCRS vinculada ao SUS (Sistema ?nico de Sa?de). Como principal resultado deste trabalho, identificamos oportunidades de data mining pela extra??o de modelos preditivos aplicados ? an?lise de patologias periodontais, m?-oclus?o e indicadores de c?rie dent?ria.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431852.pdf: 1120851 bytes, checksum: 164e0d72a540ab33502e807a748407b1 (MD5) Previous issue date: 2010-03-10 / Este trabalho apresenta uma arquitetura para suporte ? execu??o de tarefas de minera??o de dados em ambientes de computa??o de alto desempenho, tais como: clusters, m?quinas SMP e grades. Esta arquitetura automatiza o processo de dimensionamento da aplica??o paralela, criando ferramentas para a constru??o autom?tica de tarefas, mapeamento, ger?ncia e execu??o dessas aplica??es nos recursos computacionais dispon?veis. Os mecanismos criados para a execu??o de aplica??es de minera??o possibilitam a combina??o do paralelismo do fluxo de dados e de instru??es. Como contribui??o do trabalho, destaca-se a organiza??o da arquitetura proposta e a cria??o de um algoritmo para mapeamento de aplica??es de minera??o paralelas em ambientes computacionais heterog?neos. Enfatiza-se o suporte ao aproveitamento de recursos com m?ltiplos n?cleos de processamento (multi-cores). Al?m disso, apresenta-se a paraleliza??o de um algoritmo de minera??o de dados para regress?o

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 432221.pdf: 7126072 bytes, checksum: 4f9458bc22424532f20fd0c85208b5c7 (MD5) Previous issue date: 2011-03-31 / O desenvolvimento de f?rmacos ? um dos grandes desafios da ci?ncia atual por se tratar de um processo onde os custos e o tempo envolvido s?o elevados. Um dos problemas mais interessantes nessa ?rea ? a predi??o da conforma??o e da energia envolvida na intera??o entre ligantes e suas prote?nas-alvo ou receptores. ? nos experimentos de docagem molecular que essa intera??o ? avaliada. ? muito comum que durante a docagem molecular se fa?am simplifica??es onde o receptor ? tratado como r?gido. Por?m, prote?nas s?o inerentemente sistemas flex?veis e essa flexibilidade ? essencial para a sua fun??o. A inclus?o da flexibilidade do receptor em experimentos de docagem molecular n?o ? uma tarefa trivial, pois, para permitir mobilidade a certos ?tomos do receptor, h? um aumento exponencial do n?mero de graus de liberdade a serem considerados. H? atualmente diversas alternativas para contornar esse problema, entre elas, a que se optou neste trabalho: considerar a flexibilidade expl?cita do receptor por meio da execu??o de uma s?rie de simula??es de docagem molecular, utilizando em cada um deles uma conforma??o diferente da trajet?ria din?mica do receptor, gerada por uma simula??o por din?mica molecular (DM). Um dos maiores problemas desse m?todo ? o tempo necess?rio para execut?-lo. Sendo assim, o objetivo desse trabalho ? contribuir para a sele??o de conforma??es do receptor de forma a acelerar a execu??o de experimentos de docagem molecular com o receptor completamente flex?vel. Al?m do mais, o trabalho apresenta novas metodologias para a an?lise da intera??o receptor-ligante em simula??es de docagem deste tipo. Para alcan?ar esses objetivos, ? aplicado um processo de descoberta de conhecimento. A primeira etapa consistiu no desenvolvimento de um banco de dados para armazenar informa??es detalhadas sobre o receptor e suas conforma??es, ligantes e experimentos de docagem molecular, chamado FReDD. Com os dados organizados no FReDD, foi poss?vel a aplica??o de diferentes t?cnicas de minera??o de dados. O primeiro conjunto de experimentos foi realizado utilizando o algoritmo de classifica??o J48. O segundo conjunto de experimentos foi executado com o algoritmo de regress?o M5P, onde apesar de resultados interessantes, a utiliza??o direta para sele??o de conforma??es em futuros experimentos de docagem molecular n?o se mostrou promissora. Finalmente, foram executados os experimentos de agrupamento com 10 diferentes algoritmos, com entradas variadas. Para os algoritmos de agrupamento foram desenvolvidas diferentes fun??es de similaridade onde os resultados finais utilizados em conjunto com o padr?o de dados P-MIA permitiu a redu??o efetiva da quantidade de experimentos de docagem

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 436381.pdf: 5238803 bytes, checksum: ca22d61f2fb4075e277ed531aee231ce (MD5) Previous issue date: 2012-01-17 / With the growth of biological experiments, solving and analyzing the massive amount of data being generated has been one of the challenges in bioinformatics, where one important research area is the rational drug design (RDD). The interaction between biological macromolecules called receptors, and small molecules called ligands, is the fundamental principle of RDD. In in-silico molecular docking experiments it is investigated the best bind and conformation of a ligand into a receptor. A docking result can be discriminated by a continue value called Free Energy of Binding (FEB). We are attempting on mining data from molecular docking results, aiming at selecting promising receptor conformations to the next docking experiments. In this sense, we have developed a comprehensive repository to store our molecular docking data. Having such repository, we were able to apply preprocessing strategies on the stored data and submit them to different data mining tasks. Among the techniques applied, the most promising results were obtained with regression model trees. Although we have already addressed important issues and achieved significant results, there are some properties in these experiments turning it difficult to properly select conformations. Hence, a strategy was proposed considering the three-dimensional (3D) properties of the receptor conformations, to predict FEB. This thesis presents the 3D-Tri, a novel algorithm able to handle and treat spatial coordinates in a x,y,z format, and induce a tree that predicts FEB value by representing such properties. The algorithm uses such coordinates to split a node in two parts, where the edges evaluate whether the atom being tested by the node is part of a given interval [(xi,xf );(yi,yf );(zi,zf )], where i indicates the initial position of the coordinate, and f its final position. The induced model can help a domain specialist to select promising conformations, based on the region of the atoms in the model, to perform new molecular docking experiments / Com o avan?o nos experimentos biol?gicos, a manipula??o e an?lise do grande volume de dadossendo gerados por esses experimentos t?m sido um dos desafios em bioinform?tica, onde umaimportante ?rea de pesquisa ? o desenho racional de f?rmacos (RDD - Rational Drug Desing). Aintera??o entre macromol?culas biol?gicas, chamadas de receptores, e pequenas mol?culas, chamadasligantes, ? o princ?pio fundamental do RDD. ? em experimentos in silico de docagem molecularque se investiga o melhor encaixe e conforma??o de um ligante em uma cavidade do receptor. Oresultado de um experimento de docagem pode ser avaliado a partir de um valor cont?nuo de energialivre de liga??o (FEB - Free Energy of Binding). Tem-se empregado esfor?os em minerar dados deresultados de docagem molecular, com o objetivo de selecionar conforma??es relevantes para reduziro tempo de futuros experimentos de docagem. Nesse sentido, foi desenvolvido um reposit?rio paraarmazenar todos os dados a respeito desses experimentos, em n?vel de detalhe. Com esse reposit?rio,os dados foram devidamente pr?-processados e submetidos a diferentes tarefas de minera??ode dados. Dentre as t?cnicas aplicadas, a que apresentou-se mais promissora para o tipo de dadossendo utilizado foi ?rvore de decis?o para regress?o. Apesar dos resultados alcan?ados por essesexperimentos serem promissores, existem algumas propriedades nos experimentos que dificultam aefetiva sele??o de conforma??es. Dessa forma, prop?e-se uma estrat?gia que considera as propriedadestridimensionais (3D) do receptor para predizer o valor de FEB. Assim, nesta Tese ? apresentadoo 3D-Tri, um algoritmo de indu??o de ?rvore de regress?o que considera essas propriedades 3D,onde essas propriedades s?o definidas como atributos no formato x,y,z. O algoritmo proposto fazuso dessas coordenadas para dividir um nodo em duas partes, onde o ?tomo sendo testado parao nodo ? avaliado em termos de sua posi??o em um bloco [(xi,xf );(yi,yf );(zi,zf )] que melhorrepresente sua posi??o no espa?o, onde i indica a posi??o inicial de uma coordenada, e f indicaa posi??o final. O modelo induzido pode ser ?til para um especialista de dom?nio para selecionarconforma??es promissoras do receptor, tendo como base as regi?es dos ?tomos que aparecem nomodelo e que indicam melhores valores de FEB

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:58:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006-Joventino Fernandes Moreira.pdf: 938643 bytes, checksum: b9ddd1b30c4ea4ca7ccd346032713eb5 (MD5) Previous issue date: 2006-02-17 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The production of aluminum and alumina generates a great amount of red mud, which is harmful to the environment mainly for its high pH, electric conductivity and concentration of sodium, which restrict plant growth. However, there are some indications that it may be used as a conditioner for acid sandy soils. This work tested a red mud from an alumina production plant by Alumar- S?o Lu?s MA, Brazil as soil conditioner for two acid soil types: sandy and clay soils) and the growth of oil palm hybrids (E. guinensis x E. oleifera) grown in red mud deposition tank vegetated with leguminous trees for 8 years. The red mud was characterized in relation to its physical, chemical and microbial characteristics and tested in two types of soils, a Planossolo and an Argissolo and two bioindicators plants, the grass Brachiaria brizantha and common bean (Phaseolus vulgaris). Bean plants were harvested and brachiaria received a first cut 50 days after planting. A second and third cut were performed in brachiaria 70 and 140 days after the first one. Plant biomass was dried until constant weight and analysed for nutrient content. Number of sprouts of grass was counted at the third harvest. The evaluation of oil palm growth on red mud included eight hybrids between Elaeis oleifera x Elaeis guiinensis from Embrapa Amaz?nia Ocidental. breeding program (C2501, C2301, C2328, C3701, C2801, C7201, RUC13 and RUC 87) 12 months after transplanted to a red mud tank vegetated for 8 years with a mixture of nodulated leguminous trees. Diameter at the base of the plants, top diameter, number of leaves, plant height, diazotrophic bacteria, mycorrhizal fungi and nutrient contents were studied on the oil palm plants. Soil fauna and nutrient availability were evaluated in soils under oil palm and in an area with native species nearby the tanks. The addition of small amounts of red mud to the soils increased soil pH. Addition of red mud decreased plant growth in both soils tested with more deleterious effect on bean than on the grass. However the addition of 5 Mg ha-1 of red mud in the sandy acid soil increased the grass biomass at the last harvest in relation to the control. The evaluation of the oil palm in the tanks indicated that hybrid RUC 87 and C7201 presented larger diameter at soil level, plant height and number of leaves. All cultivars and hybrids showed large population of diazotrophic bacteria in their leaves and mycorhizal infection on roots. Similar richness and density of soil fauna was observed in the red mud below the oil palm to that observed in a soil collect in a secondary forest nearby indicating that the vegetation with leguminous trees is returning the ecological processes toward a sustainable system. / O processo de produ??o de alum?nio e alumina gera grande quantidade de res?duo de bauxita, tamb?m chamado red mud (lama vermelha). Este res?duo ? objeto de preocupa??o para o meio ambiente devido as suas caracter?sticas de alto pH e condutividade el?trica, al?m da elevada concentra??o de s?dio, condi??es estas prejudiciais ao desenvolvimento de plantas, tornando dif?cil o manejo desse material e necessitando de grandes ?reas para seu armazenamento. Por outro lado, alguns estudos t?m sido desenvolvidos com aplica??o desse material na agricultura, visando aumentar o pH e disponibilidade de nutrientes e melhorar a reten??o de ?gua para as plantas em solos arenosos. Esse trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar o potencial de uso do res?duo alcalino do refino de bauxita tratado e n?o tratado com ?gua do mar como condicionador de solos. Para isso os materiais foram caracterizados em aspectos f?sicos, qu?micos e microbiol?gicos e comparados quanto a seus efeitos no solo testando-os sobre dois tipos de solos, um Planossolo e um Argissolo e sobre duas plantas bioindicadoras, a braqui?ria (Brachiaria brizantha) e o feij?o comum (Phaseolus vulgaris). Ap?s 50 dias do experimento, as plantas de feij?o foram colhidas e foi feito o primeiro corte da braqui?ria, as plantas foram secas e pesadas, para a an?lise da massa seca. Contou-se tamb?m o n?mero de perfilhos da braqui?ria e nesta foram feitos mais dois cortes, um aos 120 e o ?ltimo aos 190 dias. Al?m dessa avalia??o foi feito um estudo sobre o desenvolvimento de dend? nos tanques de estocagem do res?duo ap?s 8 anos de implanta??o da revegeta??o com leguminosas arb?reas. Foram utilizadas 8 materiais gen?ticos de Elaeis spp (dend?) recomendados pela Embrapa Amaz?nia Ocidental: C2501, C2301, C2328, C3701, C2801, C7201, RUC13 e RUC87 e avaliados o di?metro do c?lo da planta e da copa, o n?mero de folhas, a altura das plantas, a presen?a de bact?rias diazotr?ficas e fungos micorr?zicos associadas ?s plantas de dend?, a fauna de solo e o estado nutricional das plantas e a fertilidade do solo. Os resultados apresentados indicam que os res?duos foram eficientes na eleva??o do pH do solo, j? com pequenas doses. A leguminosa mostrou-se mais sens?vel que a braqui?ria em rela??o ? salinidade provocada pela adi??o dos res?duos, nos dois tipos de solos, sendo que nessa ?ltima, houve aumento de mat?ria seca de parte a?rea em fun??o das doses dos res?duos n?o tratado e tratado com ?gua do mar at? a dose de 5 Mg ha-1, no Planossolo. Na avalia??o do dend? foi observada uma grande quantidade de bact?rias diazotr?ficas e coloniza??o micorr?zica, independentemente do gen?tipo. Os dados indicam tamb?m um melhor desempenho para os gen?tipos RUC87 e C7201 no que se refere ao di?metro do c?lo e da copa, n?mero de folhas e altura das plantas, apresentando uma maior capacidade de estabelecimento destas cultivares em rela??o ?s demais. No que se refere ? fauna do solo na ?rea de dend?, os seus valores de riqueza de grupos e densidade de indiv?duos foram pr?ximos aos valores encontrados em uma mata secund?ria local o que mostra que a revegeta??o com leguminosa est? sendo eficiente em retomar os processos ecol?gicos e o equil?brio do ecossistema.