The first and main part of this thesis is focused on the design and synthesis of photo-activableand metal chelating alkanethiols. Chelate associated photochemistry (CAP) is a novel conceptof combining two well-known protein (ligand) immobilization strategies to obtain a sensorsurface of covalently bound ligand with defined orientation. This includes nitrilotriacetic acid(NTA) which is used to capture and pre-orientate histidine-tagged proteins to the sensorsurface, followed by UV activation of a neighboring photo-crosslinking agent, benzophenone(BP), to covalently bind the ligand in this favorable orientation. Our results (paper 1) indicatethat up to 55% more activity of the ligand is achieved with the CAP concept compared to theactivity of the randomly oriented ligand (immobilized only by BP). This also yields a surfacethat is more robust compared to if only NTA is used. The photo cross-linking withbenzophenone (BP) adduct is limited to a distance range of 3Å, it is therefore favorable tocapture the ligand before reacting with surface bound BP-adduct. The surface consists of anexcess of ethylene glycols (known for its protein-repellent properties) to prevent non-specificprotein binding, thereby increase the specificity of the sensor surface. With this obtainedsurface chemistry we hope to contribute to the development of large-scale screening systemsand microarrays based on His-tagged labeled biomolecules. This will be used in a number ofapplications such as proteomics-related applications, including drug discovery, the discoveryof lead compounds and characterization of protein-protein interactions. The second part of this thesis describes the effect of the synthetic N-(3-oxododecanoyl)-Lhomoserinelactone (30-C12-HSL) on eukaryotic cells. 30-C12-HSL is a natural occurringsignal substance in the bacterium Pseudomonas aeruginosa, and this signal molecule isinvolved in the regulation of bacterial growth. Pseudomonas aeruginosa has been consideredas a common cause of infections in hospitals, especially in patients with compromisedimmune systems. Since the 30-C12-HSL can diffuse freely cross the cell membranes, it isexpected to have influence on the host cell behaviour. Herein, we study how the eukaryoticcells respond to the bacterial signal molecule, 30-C12-HSL. Our results (paper 2) indicatethat 30-C12-HSL disrupt the adherens junctions in human epithelial cells. The disruption iscaused by a hyperphosphorylation of the adherens junction proteins (protein complexbetween epithelial tissues). This suggests the bacterial signals are sensed by that the host cells.

Cathodic arc deposition is a powerful technique for thin film synthesis, associated with explosive phase transformations resulting in an energetic and highly ionized plasma. This Thesis presents film growth through arc deposition from compound cathodes of Ti3SiC2, providing source material for plasma and films rich in Si and C. The interest for the resulting Ti-Si-C-N films is inspired by the two ternaries Ti-Si-N and Ti-C-N, both successfully applied as corrosion  and wear resistant films, with a potential for synergistic effects in the quarternary system. When using a rotating substrate fixture setup, which is common in high capacity commercial deposition systems, the repeated passage though the plasma zone results in growth layers in the films. This effect has been observed in several coating systems, in deposition of various materials, but has not been explained in detail. The here investigated layers are characterized by a compositional modulation in Si and Ti content, which is attributed primarily to preferential resputtering in segments of rotation when the plasma has high incidence angle towards the substrate normal. For depositions in a non-reactive environment, the films consist of primarily understoichiometric TiCx, Ti, and silicide phases, and display a modest hardness (20-30 GPa) slightly improved by a decreasing layer thickness. Hence, the side effects of artificial layering from substrate rotation in deposition systems should be recognized. Adding N2 to the deposition process results in reactive growth of nitride material, formed in a wide range of compositions, and thereby enabling investigation of films in little explored parts of the Ti-Si-C-N system. The structure and properties of such films, comprising up to 12 at% Si and 16 at% C, is highly dependent on the supply of N2 during deposition. Superhard (45-50 GPa) cubic-phase (Ti,Si)(C,N) films with a nanocrystalline feathered structure is formed at N-content of 25-30 at%. At higher N2 deposition pressure, C and Si segregate to column and grain boundaries and the cubic phase assumes a more pronounced nitride character. This transformation is accompanied by substantially reduced film hardness to 20 GPa. Ti-Si-C-N films thus display a rich variety of structures with favorable mechanical properties, but in the regime of high Si and C content, the amount of N must be carefully controlled to avoid undesirable formation of weak grain boundary phases based on Si, C and N.

Syftet med examensarbetet är att synliggöra naturvetenskap och teknik mer på förskolorna. Arbetet har resulterat i ett praktiskt användbart arbetsmaterial för förskolan, Upptäck och Utforska Naturvetenskap och Teknik med Kråkis – ett arbetsmaterial för förskolan. Det är ett årstidsrelaterat arbetsmaterial som innehåller experiment kopplat till fysik, kemi, natur och teknik där olika fenomen behandlas. Arbetsmaterialet är framtaget genom inläst litteratur och har utvärderats med materialtest på flera förskolor, samt genom en enkätundersökning och observationer. Arbetsmaterialet ska hjälpa förskolorna uppfylla strävansmålen i Lpfö98 och bidra till ett lustfullt lärande. Enligt resultatet är pedagogerna nöjda med materialet. Litteraturen berör varför och hur naturvetenskap och teknik i förskolan, användandet av naturvetenskapligt språk och begrepp, varför experimentera och dokumentationens betydelse för pedagoger och barn. Arbetsmaterialet har fått pedagogerna att öppna ögonen och upptäckt att de tillsammans med barnen upplever att det är roligt att experimentera.

As the need for and usage of biomaterials in medicine constantly increase, so do the requirements for increased biocompatibility and hemocompatibility. Initially in blood-biomaterial interactions, the surface of an implanted biomaterial is enclosed with adsorbed host proteins and the composition of the adsorbed protein layer depends mainly on the physical-chemical properties of the biomaterial. It is known that the adsorption of proteins on the biomaterial surface may be followed by conformational changes of the adsorbed proteins and subsequent activation of the complement system. For example, binding of complement component C1q to IgG and IgM associated with biomaterial surfaces mediates complement classical pathway activation. The aim of this degree project work was to prepare and evaluate IgG and IgM free sera with functional complement activity for complement activation studies. Further complement studies necessitated IgG and IgM free sera, since two novel polymers with different compositions needed evaluation regarding their ability to induce antibody-independent complement classical pathway activation. Initially, immunoglobulin deficient fetal bovine serum was evaluated regarding complement activity, but no detectable complement activation was present. Different methods for depleting human serum of IgG and IgM were instead utilized and evaluated. From the results, it can be concluded that a close to complete IgG-depletion of human serum is achievable with serum maintaining low but functional complement activity. None of the applied methods for IgM-depletion were however successful and necessitate further optimization and evaluation.

No description available.

Rikkärr är en naturtyp med hög artrikedom, som återfinns i kalkrika våtmarker. Kända rikkärr upptar idag 2-3 % av myrarealen i Sverige (Sjörs & Gunnarsson 2002). Med snabbare och effektivare inventeringsmetoder skulle med all sannolikhet fler rikkärr återfinnas. Rikkärrens många arter har under lång tid anpassat sig till de speciella förhållandena men är idag starkt hotade då biotopen rikkärr minskar. Tillbakagången är ett resultat av dikning, upphörd hävd, övergödning, försurning och skogsbruk. I de svenska rikkärren finns många rödlistade och utrotningshotade arter inom grupperna snäckor, kärlväxter och mossor. För att bevara den biologiska mångfalden behöver vi ha säkra metoder för att identifiera rikkärr och på så vis ha möjlighet att skydda dem. Naturtypen rikkärr har många fysionomier som gör den svår att urskilja vid flygbildstolkning. Syftet med examensarbetet är att undersöka om det med hjälp av geologiska data hos Sveriges geologiska undersökning (SGU) är möjligt att finna kopplingar till rikkärren som kan användas för att på ett säkert sätt kunna identifiera potentiella rikkärrsområden snabbare i framtiden. Arbetet har genomförts genom att studera samband mellan utvalda element ur ett antal undersökningar utförda av SGU. Resultatet visar tydligt det starka samband rikkärren har till områden med kalkberggrund och på hur tydligt detta syns vid användandet av det geografiska informationsprogrammet ArcGIS. Resultaten i uppsatsen tydliggör även svårigheten med att använda befintliga data, ur SGU:s geodatabas, för att finna kompletterade komponenter med samband till biotopen rikkärr. Resultaten leder till rekommendationer om framtida undersökningar att utföra för att stärka vår kunskap om rikkärren. / Kan SGUs data användas för att förutsäga vegetationens sammansättning?

Celiaki är en kronisk autoimmun överkänslighetssjukdom mot proteinet gluten. Gluten förekommer i vete, korn, råg och havre. Sädesslagen innehåller olika prolaminer, vilka gemensamt benämns för gliadin. Autoantigenet utgörs av enzymet vävnadstransglutaminas (tTG). Genom deamidering medför enzymet att gliadinets immunogenitet ökar. Det är av största vikt att tidigt ställa korrekt diagnos och inleda glutenfri diet, eftersom celiakin i sig inte bara kan orsaka lidande utan även frambringa en rad följdsjukdomar. Symptomen vid celiaki kan vara väldigt varierande. Därför är behovet av säkra analysmetoder mycket stort. Idag sker diagnostiken vanligen med den serologiska markören immunoglobulin A (IgA) tTG. Analysprincipen bygger på en antigen-antikroppsreaktion mellan bundet antigen och eventuella antikroppar hos patienten, riktade mot antigenet. En sekundär antikropp konjugerad med enzym tillsätts och binder in till komplexet. Vid efterföljande enzymreaktion uppstår en mätbar produkt, vilken är direkt proportionell mot halten av de sökta antikropparna. Syftet med denna studie var att undersöka korrelationen mellan analysinstrumenten, Immulite® 2500 och Phadia® 250, med avseende på markören IgA tTG. Dessutom undersöka sambandet mellan markörerna IgA gliadin (Agl) samt deamiderat gliadin IgA (Agp) respektive deamiderat gliadin immunoglobulin G (Ggp). Korrelationen mellan analysinstrumenten beräknades till 0,85. Korrelationen var något lägre än förväntat, men trots det resulterade 80 % av analysresultaten i samma kliniska bedömning. Korrelationen mellan gliadinmarkörerna var följande: 0,79 mellan Agl och Agp, 0,57 mellan Agl och Ggp samt 0,67 mellan Agp och Ggp. Resultaten visade att 64 % av analysresultaten gav samma kliniska bedömning. Fortsatta studier med referensmaterial krävs för att bedöma markörernas sensitivitet och specificitet.

Uppsatsen handlar om attityder till naturvetenskap. Syftet med min undersökning är att ta reda på vilken definition pedagogerna hade av NO, vilka attityder som pedagogerna ansåg fanns hos pedagogerna själva, deras kollegor och deras elever i grundskolans tidiga skolår samt vilket förhållningssätt pedagogerna hade till lärande i NO. Jag intervjuade fem pedagoger i skolår F-6 och analyserade deras svar för att få fram likheter och skillnader genom tillämpning av en fenomenografisk analys. Resultatet visade att definitionen av NO var snarlik hos samtliga respondenter samt att de var intresserade av NO och menade att det var viktigt. På grund av att det är ett svårt ämne och eftersom kärnämnena som mäts genom nationella prov ofta går före NO bedrivs inte så mycket naturvetenskaplig undervisning i grundskolans tidiga skolår. Elever lär sig bäst genom en varierad undervisning med mycket praktiskt arbete, men teori är också viktigt för att undervisningen skall passa alla elever.

The purpose of this essay is to find an answer to whether the methodology used by the Naturskolan conduces to learning and also if the Naturskolan, as a method of its own, leads to an increased interest in natural science for the pupils participating in the classes at the Naturskolan. The method which has been used to reach the results of the study is a quantitative opinion poll. The results reached through the study has been compared to previous research in the subject. Deeper studies were made to examine however the interest of the pupils was influenced by their visit at the Naturskolan. The results of the study show an increase of interest in natural science after visiting the Naturskolan. It also shows that the teachers’ interest in natural science and outdoor pedagogy has increased by the visit at the Naturskolan. Through this study we came to the conclusion that the Naturskolan is a good method to learning.

The main topic of the thesis is characterisation and evaluation of volatile organic compounds emitted by packaging materials based on paperboard products. The properties and concentration of these compounds are critical to how well these materials perform when applied as a main component of food packaging. Specifically there is an interest for finding out whether the materials are neutral enough from a flavour and odour perspective. This means that the odour and flavour of the packed foodstuff must not be influenced in a nonacceptable way by the packaging. The studies may be seen as divided into two main parts complemented with an additional study. In the first part ”Electronic noses”, based on quite a number of gas sensors of different sensitivity profiles, conventional gas chromatography and to some extent also sensory analysis were applied for evaluating the volatile organic compounds emitted from paperboard products. The results obtained from the ”electronic nose” measurements were evaluated in the light of the detailed chemical information provided by the gas chromatography. First a large number of paperboard products were analysed followed by analysis of some thirty sequential jumbo reels of two different board products. The obtained results clarified what could be achieved when applying the gas sensor based analytical system to this type of materials. Furthermore the experiences gained by the experiments pointed out the importance of managing sample handling, headspace generation and gas flow distribution in a good way. These findings were useful for managing a third experimental series in which a commercial gas sensor based system was applied for differentiating aqueous thyme solutions regarding the thyme concentrations. The multivariate data analysis methodology used for evaluating the gas sensor responses was successfully applied also to the obtained gas chromatography data. The chosen approach was to treat the chromatograms as having been generated by a large number of sensors. The sensory analysis was applied for investigating whether the found differences were relevant from a taint perspective which was invaluable since the ”electronic nose” system and our human chemical senses work according to different principles. It was therefore especially interesting to find out that the “electronic nose” and off-flavour differentiation between sequential jumbo reels of one product agreed well. Furthermore it was clearly not just a matter of different humidity of the materials. In the second part the sensory analysis was the mainly applied evaluation technique. Gas chromatography was very valuable for supporting the experimental work and contributing to the understanding of the results whereas no gas sensor related evaluations were performed. In the first part a need for investigating a number of issues more carefully was pointed out. Topics such as sensory sensitivity, perception of mixtures in relation to the mixture components and calibration of sensory analysis were consequently investigated. For managing it was necessary to restrict the studies to simplified model systems that were arranged based on results and experiences obtained from studies of real packaging systems. The results pointed out the complexity of sensory related packaging issues and help in improving these type of sensory analysis e.g. by suggesting calibration procedures. The additional study is related to active packaging which means that the intention with the packaging is to influence the packed foodstuff in a way that is favourable and desired. In this study odorants were added to dispersion coatings that well could be used in the paperboard products. Headspace gas chromatography was successively applied for measuring the amounts and coating retention of the odorants upon drying. Furthermore multivariate data analysis was useful for overviewing the results and finding relations and structures that otherwise were hard to see. / Avhandlingens kärna är karaktärisering och utvärdering av flyktiga ämnen vilka emitteras från kartongmaterial. Sammansättning och halter av dessa ämnen är kritiska för hur väl materialen fungerar som huvudkomponenter i förpackningar vilka används till varor såsom mat, drycker, sötsaker och cigaretter. I synnerhet är man intresserad av sådana ämnen som kan inverka på de förpackade varornas lukt och smak. ”Elektroniska näsor”, uppbyggda av ett antal gassensorer med olika känslighetsprofiler, konventionell gaskromatografi och sensorisk analys användes för att utvärdera de emitterade ämnena från kartongprodukter. Genom att relatera de resultat som genererades av de ”elektoniska näsorna” till den detaljerade kemiska information som gaskromatografin gav fick man klarhet i vad som har varit möjligt att uppnå med den undersökta gassensortekniken för denna typ av tillämpning. Dessutom framgick mycket tydligt att prov- och gasflödeshanteringen är kritiska delar av analyssystemet och mycket avgörande för en god funktion. Den multivariata metodik som användes för att utvärdera sensorernas responser applicerades framgångsrikt även på gaskromatografiska data där kromatografin sågs som en alternativ sensorteknik. Man kunde bland annat visa att gasblandningens sammansättning bestående av de emitterade flyktiga ämnena hade tydliga samband med kartongtillverkningsprocessen och att man därigenom kunde följa processförändringar från produktionen. Den sensoriska utvärderingen gjorde det möjligt att undersöka huruvida de instrumentella mätningarna var relevanta ur lukt- och smaksynvinkel. Detta var helt nödvändigt på grund av de stora skillnader i funktion hos lukt- och smaksinnena å ena sidan och de instrumentella teknikerna å andra sidan. Detta innebar även att en djupare förståelse för den sensoriska analysen blev nödvändig. Frågor såsom hur sensoriska responser genereras, vilken mätnoggrannhet och känslighet som kan uppnås samt hur olika sensoriska responser interagerar undersöktes. Dessa kunskaper och insikter gav infallsvinklar till hur sensorisk analys av dessa typer av material kan förbättras. Exempel på detta är en bättre jämförbarhet mellan sensoriska resultat och större förståelse för hur man genom att välja analysparametrar bättre kan få en känsligare och mer tillförlitlig analys.