Submitted by ARLINDO LEAL BOIÇA NETO null (arlindoboica@gmail.com) on 2016-11-10T18:24:40Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_final (CORRIGIDA) com certificado de aprovação.pdf: 2125977 bytes, checksum: 3df4ff312236d23618c3631b2161a7d3 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO null (luizaromanetto@hotmail.com) on 2016-11-16T15:54:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 boica neto_al_dr_jabo.pdf: 2125977 bytes, checksum: 3df4ff312236d23618c3631b2161a7d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-16T15:54:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 boica neto_al_dr_jabo.pdf: 2125977 bytes, checksum: 3df4ff312236d23618c3631b2161a7d3 (MD5) Previous issue date: 2016-10-21 / O amendoim é cultivado em vários estados no Brasil sendo São Paulo o maior produtor, seguido da Bahia e Mato Grosso. Semeadas em épocas diferentes conforme a região do cultivo, a área cultivada do amendoim na safra de 2014/15 no Brasil abrangeu uma área de 107,4 mil hectares, com uma produção média de 3140 kg ha⁻¹. Duas pragas destacam-se pela importância nessa cultura, sendo a lagarta-do-pescoço-vermelho, Stegasta bosquella (Chambers, 1875) (Lepidoptera: Gelechiidae) e o tripes-do-prateamento, Enneothrips flavens Moulton, 1941 (Thysanoptera: Thripidae) por causarem elevados prejuízos econômicos ao agricultor. Na literatura, poucas informações são relatadas de amostragens de pragas no amendoinzeiro. Assim, associando-se esse fato a importância das duas pragas na cultura do amendoim, se fez necessário um estudo por meio de modelos probabilísticos para avaliar as suas distribuições espaciais e amostragens sequenciais, gerando assim futuras informações aos agricultores para o manejo integrado de pragas nessa cultura. Os experimentos foram conduzidos nos anos de 2013/2014 e 2014/2015, em Jaboticabal – SP, utilizando uma área de 1,08 ha, subdividida em 100 parcelas iguais de 108 m² (10,0 x 10,8 m). Em cada parcela foram avaliadas cinco plantas ao acaso, considerando a presença ou não de insetos de S. bosquella e E. flavens. Pelos dados, observaram-se uma distribuição agregada ou moderadamente agregada de E. flavens e uma distribuição aleatória de S. bosquella; o modelo de distribuição que melhor se ajustou para E. flavens foi a binomial negativa e para lagartas de S. bosquella o modelo de distribuição de Poisson. Estes resultados permitiram a elaboração de planos de amostragem sequencial, na qual, tripes e lagartas apresentam duas retas: uma superior (S1 = 6,3072 + 1,0680 N), (S1 = 3,2134 + 0,3274 N), a partir da qual recomenda-se o controle; e outra inferior (S0 = -6,3072 + 1,0680 N), (S0 = -3,2134 + 0,3274 N), na qual, controle não é recomendado, respectivamente. Pelos resultados analisados, é possível verificar que a amostragem sequencial é eficiente na indicação ou não do controle de E. flavens e S. bosquella na cultura do amendoim. / The Peanuts are grown in several states in Brazil and São Paulo is the largest producer, followed by Bahia and Mato Grosso. Sown at different times as the growing region, the cultivated peanut area in 2014/15 crop in Brazil covered an area of 107,400 hectares, with an average production of 3140 kg ha⁻¹. Two pests stand out the importance that culture, and the red-necked peanut worm, Stegasta bosquella (Chambers, 1875) (Lepidoptera: Gelechiidae) and silvering thrips, Enneothrips flavens Moulton, 1941 (Thysanoptera: Thripidae) to cause high economic losses to the farmer. In the literature, little information is reported samplings pest in groundnut. Thus, associating this fact the importance of the two pests in peanut crop, a study using probabilistic models to assess their spatial and sequential sampling distributions made necessary, thus generating further information to farmers for the integrated pest management that culture. The experiments were conducted in the years 2013/2014 and 2014/2015, in Jaboticabal - SP, using an area of 1,08 ha, divided into 100 equal installments of 108 m² (10,0 x 10,8 m). In each plot were evaluated 5 randomly plants considering the presence or absence of E. flavens insects and S. bosquella. From the data, they observed an aggregate or aggregate distribution moderately E. flavens and a random distribution S. bosquella; the distribution model best fit for E. flavens was the negative binomial and larvae of S. bosquella the Poisson distribution model. These results allowed the development of sequential sampling plans in which, thrips and caterpillars have two lines: an upper (S1 = 6.3072 + 1.0680 N), (S1 = 3.2134 + 0.3274 N), the from which it is recommended to control; and bottom (S0 = -6.3072 + 1.0680 N) (S0 = -3.2134 + 0.3274 N), in which control is not recommended, respectively. The results analyzed, you can see that the sequential sampling is efficient in indicating whether or not the control E. flavens and S. bosquella the peanut crop.

Resumo: distribuição espacial do parasitismo, número de machos, fêmeas e total de adultos emergidos da geração F2 do parasitóide larval de Diatraea saccharalis (Fabricius), Cotesia flavipes (Cameron), foi estudada em um talhão comercial de 100x105 m de cana-de-açúcar da variedade CTC 3, com 7 meses, dividido em 100 parcelas de 105 m2, usando a metodologia de liberação de 4 pontos por hectare, com 1500 parasitóides espaçados 50 m entre eles. Em cada parcela foram colocados 10 colmos de cana com uma larva de D. saccharalis em seu interior fixados no solo para avaliação do parasitismo e número de insetos emergidos. Os índices de dispersão utilizados foram: razão variância/média (I), índice de Morisita (Iδ), coeficiente de Green (Cx) e expoente k da distribuição binomial negativa. A distribuição binomial negativa foi o modelo mais adequado para representar a distribuição de freqüência do parasitóide, já que a variância foi superior à média para todas as variáveis avaliadas. A análise dos índices de agregação mostrou que esse inseto se distribui de maneira agregada no campo. O uso da Geoestatística permitiu quantificar e mapear a distribuição de C. flavipes, mostrando ser uma ferramenta útil para teste de metodologias de liberação desse parasitóide. / Abstract: The spatial distribution of the parasitism, number of males, females and total of adults emerged of the F2 generation of the Diatraea saccharalis (Fabricius), larval parasitoid of Cotesia flavipes (Cameron), was studied in a commercial stand of extension of 100x105 m of sugarcane variety CTC 3, with 7 months old, divided into 100 plots with 105 square meters using the liberation methodology of 4 points per hectare, with 1,500 parasitoids spaced 50 m between them. The plot contained 10 stems with one D. saccharalis larvae inside fixed in the soil were used to evaluate the parasitism and the number of insects emerged. The dispersion indexes used were: variance/mean ratio (I), Morisita's index (Iδ), Green's coefficient (Cx) and k exponent of negative binomial distribution. The negative binomial distribution was more representative to the frequency distribution data of the parasitoid, since the variance was superior to the average. The analysis by the aggregation index showed that the most of the samplings presented aggregate distribution in the crop. The geoestatistics could be an useful tool to be applied to tests of different inundative liberations to this parasitoid. / Orientador: José Carlos Barbosa / Coorientador: Sergio Antonio de Bortoli / Banca: Nelson Wanderley Perioto / Banca: Wilson Itamar Maruyama / Mestre

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-05-25T16:16:39Z No. of bitstreams: 1 Cicero Carlos Felix de Oliveira.pdf: 934310 bytes, checksum: 4f4332b0b319f6bf33cdc1d615c36324 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-25T16:16:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cicero Carlos Felix de Oliveira.pdf: 934310 bytes, checksum: 4f4332b0b319f6bf33cdc1d615c36324 (MD5) Previous issue date: 2011-07-08 / This dissertation is being dealt with a discrete distribution based on Bernoulli trials, which is the Negative Binomial distribution. The main objective is to propose a new non-informative prior distribution for the Negative Binomial model, which is being termed as a possible prior distribution Beta(0; 0), which is an improper distribution. This distribution is also known for the Binomial model as Haldane prior, but for the Negative Binomial model there are no studies to date. The study of the behavior of this prior was based on Bayesian and classical contexts. The idea of using a non-informative prior is the desire to make statistical inference based on the minimum of information prior subjective as possible. Well, makes it possible to compare the results of classical inference that uses only sample information, for example, the maximum likelihood estimator. When is compared the Beta(0; 0) distribution with the Bayes-Laplace prior and Jeffreys prior, based on the Bayesian estimators (posterior mean and posterior mode) and the maximum likelihood estimator, note that the possible Beta(0; 0) prior is less informative than the others prior. It is also verified that is prior possible is a limited distribution in parameter space, thus, an important feature for non-informative prior. The main argument shows that the possible Beta(0; 0) prior is adequate, when it is applied in a predictive posterior distribution for Negative Binomial model, leading the a Beta-Negative Binomial distribution (which corresponds the a hypergeometric multiplied by a probability). All observations citas are strengthened by several studies, such as: basic concepts related to Bayesian Inference and concepts of the negative binomial distribution and Beta-Negative Binomial (a mixture of Beta with the negative binomial) distribution. / Nesta dissertação está sendo abordado uma distribuição discreta baseada em ensaios de Bernoulli, que é a distribuição Binomial Negativa. O objetivo principal é prôpor uma nova distribuição a priori não informativa para o modelo Binomial Negativa, que está sendo denominado como uma possível distribuição a priori Beta(0; 0), que é uma distribuição imprópria. Essa distribuição também é conhecida para o modelo Binomial como a priori de Haldane, mas para o modelo Binomial Negativa não há nenhum estudo até o momento. O estudo do comportamento desta a priori foi baseada nos contextos bayesiano e clássico. A ideia da utilização de uma a priori não informativa é o desejo de fazer inferência estatística baseada no mínimo de informação subjetiva a priori quanto seja possível. Assim, torna possível a comparação com os resultados da inferência clássica que só usa informação amostral, como por exemplo, o estimador de máxima verossimilhança. Quando é comparado a distribuição Beta(0; 0) com a priori de Bayes - Laplace e a priori de Jeffreys, baseado-se nos estimadores bayesiano (média a posteriori e moda a posteriori) e no estimador de máxima verossimilhança, nota-se que a possível a priori Beta(0; 0) é menos informativa do que as outras a priori. É verificado também, que esta possível a priori é uma distribuição limitada no espaço paramétrico, sendo assim, uma característica importante para a priori não informativa. O principal argumento mostra que a possível a priori Beta(0; 0) é adequada, quando ela é aplicada numa distribuição a posteriori preditiva para modelo Binomial Negativa, levando a uma distribuição Beta Binomial Negativa (que corresponde a uma hipergeométrica multiplicada por uma probabilidade). Todas as observações citadas são fortalecidas por alguns estudos feitos, tais como: conceitos básicos associados à Inferência Bayesiana e conceitos das distribuições Binomial Negativa e Beta Binomial Negativa (que uma mistura da Beta com a Binomial Negativa).

A água de lastro de navios é um dos principais agentes dispersivos de organismos nocivos à saúde humana e ao meio ambiente e normas internacionais exigem que a concentração desses organismos no tanque seja menor que um valor previamente especificado. Por limitações de tempo e custo, esse controle requer o uso de amostragem. Sob a hipótese de que a concentração desses organismos no tanque é homogênea, vários autores têm utilizado a distribuição Poisson para a tomada de decisão com base num teste de hipóteses. Como essa proposta é pouco realista, estendemos os resultados para casos em que a concentração de organismos no tanque é heterogênea utilizando estratificação, processos de Poisson não-homogêneos ou assumindo que ela obedece a uma distribuição Gama, que induz uma distribuição Binomial Negativa para o número de organismos amostrados. Além disso, propomos uma nova abordagem para o problema por meio de técnicas de estimação baseadas na distribuição Binomial Negativa. Para fins de aplicação, implementamos rotinas computacionais no software R / Ballast water is a leading dispersing agent of harmful organisms to human health and to the environment and international standards require that the concentration of these organisms in the tank must be less than a prespecified value. Because of time and cost limitations, this inspection requires the use of sampling. Under the assumption of an homogeneous organism concentration in the tank, several authors have used the Poisson distribution for decision making based on hypothesis testing. Since this proposal is unrealistic, we extend the results for cases in which the organism concentration in the tank is heterogeneous, using stratification, nonhomogeneous Poisson processes or assuming that it follows a Gamma distribution, which induces a Negative Binomial distribution for the number of sampled organisms. Furthermore, we propose a novel approach to the problem through estimation techniques based on the Negative Binomial distribution. For practical applications, we implemented computational routines using the R software

Nesta dissertação estudou-se o modelo GARMA para modelar séries temporais de dados de contagem com as distribuições condicionais de Poisson, binomial e binomial negativa. A principal finalidade foi analisar no contexto clássico e bayesiano, o desempenho e a qualidade do ajuste dos modelos de interesse, bem como o desempenho dos percentis de cobertura dos intervalos de confiança dos parâmetros para os modelos adotados. Para atingir tal finalidade considerou-se a análise dos estimadores pontuais bayesianos e foram analisados intervalos de credibilidade. Neste estudo é proposta uma distribuição a priori conjugada para os parâmetros dos modelos e busca-se a distribuição a posteriori, a qual associada a certas funções de perda permite encontrar estimativas bayesianas para os parâmetros. Na abordagem clássica foram calculados estimadores de máxima verossimilhança, usandose o método de score de Fisher e verificou-se por meio de simulação a consistência dos mesmos. Com os estudos desenvolvidos pode-se observar que, tanto a inferência clássica quanto a inferência bayesiana para os parâmetros dos modelos em questão, apresentou boas propriedades analisadas por meio das propriedades dos estimadores pontuais. A última etapa do trabalho consiste na análise de um conjunto de dados reais, sendo uma série real correspondente ao número de internações por causa da dengue em Campina Grande. Estes resultados mostram que tanto o estudo clássico, quanto o bayesiano, são capazes de descrever bem o comportamento da série / In this work, it was studied the GARMA model to model time series count data with Poisson, binomial and negative binomial discrete conditional distributions. The main goal is to analyze, in the bayesian and classic context, the performance and the quality of fit of the corresponding models, as well as the coverage percentages performance to these models. To achieve this purpose we considered the analysis of Bayesian estimators and credible intervals were analyzed. To the Bayesian study it was proposed a priori distribution joined to the models parameters and sought a posteriori distribution, which one associate with to certain loss functions allows finding out Bayesian estimates to the parameters. In the classical approach, it was calculated the maximum likelihood estimators using the method of Fisher scoring, whose interest was to verify, by simulation, the consistence. With the studies developed we can notice that, both classical and inference Bayesian inference for the parameters of those models, presented good properties analysed through the properties of the punctual estimators. The last stage of the work consisted of the analysis of one real data set, being a real serie corresponding to the admission number because of dengue in the city of Campina Grande. These results show that both the classic and the Bayesian studies are able to describe well the behavior of the serie

Neste trabalho propomos a distribuição Weibull-Binomial-Negativa (WBN) considerando uma estrutura de ativação latente para explicar a ocorrência do evento de interesse, em que o número de causas competitivas é modelado pela distribuição Binomial Negativa, e os tempos não observados devido às causas seguem a distribuição Weibull. Em geral, as causas competitivas podem ter diferentes mecanismos de ativação, sendo assim os casos de primeira ativação, última ativação e ativação aleatória foram considerados no estudo. Desse modo o modelo proposto inclui uma ampla distribuição, tais como Weibull-Geométrico (WG) e Exponencial-Poisson Complementar (EPC), introduzidas por Barreto-Souza et al. (2011) e G. et al. (2011), respectivamente. Baseando-nos na mesma estrutura, consideramos o modelo de regressão locação-escala baseado na distribuição proposta (WBN) e o modelo para dados de sobrevivência com fração de cura. Os principais objetivos deste trabalho é estudar as propriedades matemáticas dos modelos propostos e desenvolver procedimentos de inferências desde uma perspectiva clássica e Bayesiana. Além disso, as medidas de diagnóstico Bayesiana baseadas na \'psi\'-divergência (Peng & Dey, 1995; Weiss, 1996), que inclui como caso particular a medida de divergência Kullback-Leibler (K-L), foram consideradas para detectar observações influentes / In this work we propose the Weibull-Negative-Binomial (WNB) considering a latent activation structure to explain the occurrence of an event of interest, where the number of competing causes are modeled by the Negative Binomial distribution and the no observed time due to the causes following the Weibull distribution. In general, the competitive causes may have different activation mechanisms, cases of first, last and random activation were considered in the study. Thus, the proposed model includes a wide distribution such as Weibull-Geometric distribution (WG) and Exponential-Poisson complementary (EPC) introduced by (Barreto-Souza et al., 2011) and (G. et al., 2011) respectively. Based on the same structure, we propose a location-scale regression model based on the proposed distribution (WNB) and the model for survival data with cure fraction. The main objectives of this work is to study the mathematical properties of the proposed models and develop procedures inferences from a classical and Bayesian perspective. Moreover, the Bayesian diagnostic measures based on the \'psi\'-divergence (Peng & Dey, 1995; Weiss, 1996), which includes Kullback-Leibler (K-L) divergence measure as a particular case, were considered to detect influential observations

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The term aggregation refers to overdispersion and both are used interchangeably in this thesis. In addressing the problem of prevalence of infectious parasite species faced by most rural livestock farmers, we model the distribution of faecal egg counts of 15 parasite species (13 internal parasites and 2 ticks) common in sheep and goats. Aggregation and excess zeroes is addressed through the use of generalised linear models. The abundance of each species was modelled using six different distributions: the Poisson, negative binomial (NB), zero-inflated Poisson (ZIP), zero-inflated negative binomial (ZINB), zero-altered Poisson (ZAP) and zero-altered negative binomial (ZANB) and their fit was later compared. Excess zero models (ZIP, ZINB, ZAP and ZANB) were found to be a better fit compared to standard count models (Poisson and negative binomial) in all 15 cases. We further investigated how distributional assumption a↵ects aggregation and zero inflation. Aggregation and zero inflation (measured by the dispersion parameter k and the zero inflation probability) were found to vary greatly with distributional assumption; this in turn changed the fixed-effects structure. Serial autocorrelation between adjacent observations was later taken into account by fitting observation driven time series models to the data. Simultaneously taking into account autocorrelation, overdispersion and zero inflation proved to be successful as zero inflated autoregressive models performed better than zero inflated models in most cases. Apart from contribution to the knowledge of science, predictability of parasite burden will help farmers with effective disease management interventions. Researchers confronted with the task of analysing count data with excess zeroes can use the findings of this illustrative study as a guideline irrespective of their research discipline. Statistical methods from model selection, quantifying of zero inflation through to accounting for serial autocorrelation are described and illustrated. / Statistics / M.Sc. (Statistics)

Metodologias para obtenção do tamanho amostral para estimar a concentração de organismos em água de lastro e verificar normas internacionais são desenvolvidas sob uma abordagem bayesiana. Consideramos os critérios da cobertura média, do tamanho médio e da minimização do custo total sob os modelos Poisson com distribuição a priori gama e binomial negativo com distribuição a priori Pearson Tipo VI. Além disso, consideramos um processo Dirichlet como distribuição a priori no modelo Poisson com o propósito de obter maior flexibilidade e robustez. Para fins de aplicação, implementamos rotinas computacionais usando a linguagem R. / Sample size methodologies for estimating the organism concentration in ballast water and for verifying international standards are developed under a Bayesian approach. We consider the criteria of average coverage, of average length and of total cost minimization under the Poisson model with a gamma prior distribution and the negative binomial model with a Pearson type VI prior distribution. Furthermore, we consider a Dirichlet process as a prior distribution in the Poisson model with the purpose to gain more flexibility and robustness. For practical applications, we implemented computational routines using the R language.

Recruitment of pelagic fish populations is believed to be regulated during the planktonic larval stage due to high rates of mortality during the early life stages. Starvation is thought to be one of the main sources of mortality, despite the fact that there is rarely a strong correlation between the feeding success of larval fish and food availability as measured in the field. This lack of relationship may be caused in part by (i) inadequate sampling of larval fish prey and (ii) the use of total zooplankton abundance or biomass as proxies for larval food availability. Many feeding studies rely on measures of average prey abundance which do not adequately capture the variability, or patchiness, of the prey field as experienced by larval fish. Previous studies have shown that larvae may rely on these patches to increase their feeding success. I assess the variability in the availability of larval fish prey over a range of scales and model the small-scale distribution of prey in Conception Bay, Newfoundland. I show that the greatest variability in zooplankton abundance existed at the meter scale, and that larval fish prey were not randomly distributed within the upper mixed layer. This will impact both how well we can model the stochastic nature of larval fish cohorts, as well as how well we can study larval fish feeding from gut content analyses. Expanding on six years of previous lab and field studies on larval Radiated Shanny (Ulvaria subbifurcata) from Conception Bay, Newfoundland, I assess the feeding success, niche breadth (S) and weight-specific feeding rates (SPC, d-1) of the larvae to determine whether there are size-based patterns evident across the years. I found that both the amount of food in the guts and the niche breadth of larvae increased with larval size. There was a shift from low to high SPC with increasing larval size, suggesting that foraging success increases as the larvae grow. My results suggest that efforts should be made to estimate the variability of prey abundance at scales relevant to larval fish foraging rather than using large-scale average abundance estimates, since small-scale prey patchiness likely plays a role in larval fish feeding dynamics. In addition, the characteristics of zooplankton (density, size and behaviour) should be assessed as not all zooplankton are preyed upon equally by all sizes of larval fish. Overall, this thesis demonstrates that indices based on averages fail to account for the variability in the environment and in individual larval fish, which may be confounding the relationship between food availability and larval growth.