Orientador: Mario de Beni Arrigoni / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos do fornecimento de fontes de lipídios a bovinos Nelore confinados. O estudo foi conduzido no confinamento experimental da FMVZ, UNESP – Botucatu. Foram utilizados 96 bovinos machos Nelore, com média de 22 meses e peso vivo médio inicial de 399,90 (±19,32). O delineamento experimental foi em blocos casualizados divididos em quatro tratamentos: Coprodutos, com adição de caroço de algodão e gérmen de milho como fontes de lipídios; Nutrigordura, com inclusão de fonte de lipídios protegidos da degradação ruminal provenientes de óleo de soja; Blend, com inclusão de uma mistura de óleos vegetais protegidos da degradação ruminal, contendo ácidos graxos saturados e insaturados e Mix, com adição de caroço de algodão, gérmen de milho e blend. Cada tratamento consistiu em seis baias (4 animais/baia), sendo estas consideradas as unidades experimentais para o estudo. Os animais foram abatidos após 108 dias de estudo. Os dados obtidos foram analisados com auxílio do programa SAS e as médias comparadas por meio do teste de Tukey (P<0,10). Não foram observadas diferenças quanto aos parâmetros de desempenho, características de carcaça e deposição de tecido muscular e adiposo entre os tratamentos. O tratamento Nutrigordura apresentou menor expressão dos genes SREBP1 e LPL. O gene SCD foi menos expresso no tratamento Nutrigordura em comparação à Coprodutos e Mix. Quanto aos parâmetros de qualidade de carne, observou-se diferença apenas para luminosi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study aimed to evaluate the effects of the supply of lipid sources to Nellore cattle. The study was conducted in experimental feedlot of FMVZ, UNESP - Botucatu. 96 Nellore male bulls were used, with a mean of 22 months and initial body weight of 399.90 (± 19.32). The experimental design was in randomized blocks divided into four treatments: Coproducts, with addition of cottonseed and corn germ as sources of lipids; Nutrigordura, with soybean oil protected from rumen degradation; Blend, with inclusion of a mixture of vegetable oils protected from ruminal degradation, containing saturated and unsaturated fatty acids and Mix, with of cottonseed, corn germ and blend. Each treatment consisted of six pens (4 animals / pen), which were considered the experimental units for the study. The cattle were slaughtered after 108 days of study. The data obtained were analyzed using SAS and the means were compared using the Tukey test (P <0.10). No differences were observed regarding parameters of performance, carcass characteristics and deposition of muscular and adipose tissue between the treatments. Nutrigordura presented lower expression of SREBP1 e LPL genes. SCD gene was less expressed in Nutrigordura treatment, compared to Coproducts and Mix. Regarding meat quality parameters, differences were observed only for luminosity, red color intensity and yellow color intensity. The Nutrigordura treatment provided a lower content of saturated fatty acids and a higher CLA content in meat. S... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-31Bitstream added on 2014-06-13T18:54:04Z : No. of bitstreams: 1 oliveirajunior_bc_me_jabo.pdf: 377876 bytes, checksum: 959f8b30ee240eb826bbd8afca79e17a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / dados de prova de ganho em peso (PGP) em confinamento, visando aumento na resposta à seleção pela inclusão de informações de parentesco nas estimativas dos parâmetros genéticos, assim como na acurácia dos valores genéticos estimados e na classificação final dos animais. As características analisadas foram o peso ao final da PGP (P378), o ganho em peso após o período de adaptação (G112), um índice considerando P378 e G112 (IPGP), além do peso inicial e dois pesos intermediários. Foram utilizadas 18.825 mensurações de pesos de 4.758 animais. Os modelos de dimensão finita considerados incluíram os efeitos fixos de mês e ano de nascimento (1977 a 2006) e classe de idade da mãe ao parto (2 a ≥12 anos), além do efeito linear da idade do animal no início da PGP como covariável. Quanto aos efeitos genéticos, foram considerados dois modelos, um só com o efeito genético direto e outro incluindo o efeito de ambiente permanente materno. Os modelos de regressão aleatória incluíram, como aleatórios, os efeitos genéticos aditivos direto, de ambiente permanente direto e materno e, como fixos, os efeitos de grupo de contemporâneos, a classe de idade da vaca ao parto e o polinômio ortogonal de Legendre da idade do animal (regressão quadrática), como covariáveis. Para comparar os resultados obtidos pelos modelos de regressão aleatória, foram conduzidas análises multicaracterísticas. Um total de 13 modelos de regressão aleatória, aplicando polinômios de segunda a quinta ordem foram considerados para modelar os efeitos genéticos aditivos direto e de ambiente permanente direto e materno. O resíduo foi modelado considerando 1, 3, 4, 6 e 9 classes de variâncias. O modelo contendo 4 classes de variâncias foi o que melhor descreveu o comportamento da trajetória para o efeito... / This work was carried through with the objective of study different analysis forms of datasets regarding weight gain test (PGP) in feedlot, aiming improve in selection response through the inclusion of kinship information on estimates of genetic parameters, as well as in the estimated breeding values accuracy and in the final classification of the animals. We analyzed the characteristics weight at the end of PGP (P378), the weight gain after adaptation period (G112), an index considering P378 and G112 (IPGP), as well as the initial weight and two intermediate weights. 18,825 records of weights from 4.758 animals had been used. The considered models of finite dimension had included the fixed effects of year of birth (1977 to 2006) and cow age at birth class (2 ≥12 years), as well as the linear effect of the age of the animal at the PGP beginning as covariate. In spite the genetic analyses, we considered two models: one only with the direct genetic effect and another one including the maternal permanent environment effect. The random regression models included, as random, the additive direct genetic effect, the permanent direct and maternal environment effect, and, as fixed effects, the contemporary group, age of cow at birth class and the Legendre orthogonal polynomial of the animal age (quadratic regression), as covariates. In order to compare the achieved results for the models of random regression, we precede multicharacteristic analysis. A total of 15 models of random regression, applying polynomials of second to fifth order had been considered to fit the additive direct genetic effect and direct and maternal permanent environment effects. The residual was fitted considering 1, 3, 4, 6 and 9 variance classes. The model containing 4 variance classes was the ones that better described the trajectory... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-28Bitstream added on 2014-06-13T18:29:31Z : No. of bitstreams: 1 araujoneto_fr_me_jabo.pdf: 389310 bytes, checksum: 1c20248bba0e60c4bb9d24bce6f9ca34 (MD5) / Neste trabalho objetivou-se avaliar a aplicação de método bayesiano na análise de dados de crescimento, em um modelo multi-características. Dados de 54.182 animais da raça Nelore foram utilizados na estimação de componentes de variância de: a) pesos padronizados as idades de 120 (P20), 210 (P210), 365 (P365), 450 (P450) e 550 (P550) dias; b) perímetro escrotal as idades-padrão de 365 (PE365), 450 (PE450) e 550 (PE550) dias; c) ganhos de peso entre as idades 120/210 (GP1), 210/365 (GP2), 365/450 (GP3) e 450/550 (GP4) e; d) crescimento escrotal nos intervalos de 365/450 (CP1) e 450/550 (CP2). As análises foram realizadas empregando-se o software GIBBS2F90, assumindo um modelo animal para oito características: P120, PE365 e ganhos de peso e perímetro escrotal. As demais foram obtidas mediante propriedades da soma de variâncias. As herdabilidades diretas estimadas foram 0,17; 0,19; 0,13; 0,15; 0,33; 0,19; 0,23; 0,24; 0,35; 0,37; 0,39; 0,52; 0,56; e;0,48 para GP1, GP2, GP3, GP4, CP1, CP2, P120, P210, P365, P450, P550, PE365, PE450 e PE550, respectivamente. Os valores de correlação genética variaram de -0,025 (GP3/PE550) a 0,97 (PE450/PE550). Verificou-se que as características em idades padrão apresentam maior variabilidade genética que as medidas intervalares, o que as indica como critérios de seleção que possibilitaria uma melhor resposta a seleção. Com relação à implementação do método bayesiano em modelo multi-características, verificou-se eficiente apesar do pequeno número de amostras efetivas geradas em alguns parâmetros, indicando a necessidade de um maior número de interações. / This work, the objective is to evaluate application of Bayesian methods in multiple-trait animal models. Records from 54.182 Nellore males were used for estimation of variance components for: a) weight standardized ages of 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), 450 (W450) and 550 (W550) days; b) scrotal circumference at age-standard from 365 (EC365), 450 (EC450) and 550 (EC550); c) weight gains between the standardized ages of 120/210 (WG1), 210/365 (WG2), 365/450 (WG3) e 450/550 (WG4)e; d) scrotal growth in the intervals 365/450 (EG1) and 450/550 (EG2). Analyses were performed using the GIBBS2F90, assuming a multiple-trait animal model. The direct heritability estimates were 0,17; 0,19; 0,13; 0,15; 0,33; 0,19; 0,23; 0,24; 0,35; 0,37; 0,39; 0,52; 0,56; e;0,48 for WG1, WG2, WG3, WG4, EG1, EG2, W120, W210, W365, W450, W550, EC365, EC450 and EC550, respectively. The correlations values was ranging from -0,025 (between WG3 and EC550) to 0,97 (between EC450 and EC550) to genetics. It was found that the standard features in ages show greater genetic variability that measures interval, which indicates how the criteria of selection that would better meet the selection. Regarding the implementation of the Bayesian method in multi-model features, there was efficient despite the small number of effective samples generated in some parameters, indicating the need for a greater number of interactions.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2863.pdf: 780094 bytes, checksum: c8a008a959e5b4d1e7d94595428c3b47 (MD5) Previous issue date: 2010-02-22 / Universidade Federal de Minas Gerais / To remain competitive in the market of meat production, it is crucial that the Brazilian producer is aware of the criteria used by consumers for local and international markets. One factor that determines the beef quality is genetics, so it is necessary to conduct studies in Brazil to understand the genetic variation of carcass and meat quality traits in order to outline plans to improve such attributes. Backfat thickness (BFT) and ribeye area (RAE) are characteristics of late measurements, so the investigation of molecular markers associated with these characteristics can help in their inclusion in breeding programs. In cattle, some polymorphisms have been related to characteristics of meat production. Thus, this work aimed to assess the presence of polymorphisms in candidate genes PPARGC1A (peroxisome proliferative active recptor gamma coactivator 1A), FABP4 (fatty acid binding protein 4), DDEF1 (development and differentiation enhancing factor 1), Leptin, PSMC1 (proteasome 26S subunit, ATPase, 1) and IGF-1 (insulin-like growth factors) and associate them with production traits in reference families of Nellore breed. We used 280 steers descendants of 20 sires, that were chosen to represent the variability in Nellore. The sires were genotyped for all markers to investigate their allelic distribution within the race. The SNPs of the leptin and PSMC1 genes showed no variability in the bulls, so these were not genotyped in the progeny. The other markers were genotyped for the whole population. The investigation of the effects of markers on the characteristics was performed using a mixed model, including fixed and random effects, using the restricted maximum likelihood method. There was a significant association (P<0,05) between FABP4 and BFT and a suggestive association (P<0,10) between fat gain in the feedlot and these marker. Significant association was found between RAE, weaning weight (WW) and yearling weight (YW) and the DDEF1 gene and a suggestive association between the IGF-1 gene and YW in this sample of Nellore cattle. / Para que a produção de carne se mantenha competitiva no mercado, é fundamental que o produtor brasileiro esteja atento aos critérios requeridos pelos consumidores dos mercados locais e internacionais. Um dos fatores que determina a qualidade da carne bovina é a genética, sendo, portanto necessário conduzir estudos no Brasil relacionados à variação genética de características que influenciam a qualidade da carcaça e da carne bovina para que se possam delinear programas de melhoramento no sentido de aperfeiçoar tais atributos. A espessura de gordura subcutânea (EGS) e a área de olho de lombo (AOL) são características de mensuração tardia, por isso, a investigação de marcadores moleculares associados com essas características pode ajudar na inclusão das mesmas em programas de melhoramento. Em bovinos, alguns polimorfismos já foram relacionados com características de produção de carne. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar a presença de polimorfismos nos genes candidatos PPARGC1A (peroxisome proliferative active recptor gamma coactivator 1A), FABP4 (fatty acid binding protein 4), DDEF1 (development and differentiation enhancing factor 1 ), Leptina, PSMC1 (proteasome 26S subunit, ATPase, 1) e IGF-1 (insulin-like growth factor) e associálos com características de produção de carne em famílias de referência da raça Nelore. Foram utilizados 270 novilhos machos, descendentes de 20 touros, escolhidos para representar a variabilidade dentro da raça Nelore. Os touros foram genotipados para todos marcadores para investigar a distribuição alélica dentro da raça. Os SNPs dos genes Leptina e PSMC1 apresentaram-se fixados na amostra, sendo assim, estes não foram genotipados na progênie, enquanto os demais marcadores foram genotipados para toda população. A investigação dos efeitos dos marcadores sobre as características foi realizada através de um modelo misto, incluindo efeitos fixos e aleatórios, utilizando o método de máxima verossimilhança restrita. Foi encontrada uma associação significativa (P<0,05) entre o marcador FABP4 e EGS e associação sugestiva (P<0,10) entre ganho de gordura no confinamento e este marcador. Foi encontrada associação significativa entre o polimorfismo no gene DDEF1 e AOL, peso à desmama (PD) e peso ao sobreano (PS) e associação sugestiva entre o polimorfismo do gene IGF-1 e PS em bovinos da raça Nelore.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-11Bitstream added on 2014-06-13T19:56:25Z : No. of bitstreams: 1 baldin_sr_me_botfmvz.pdf: 242061 bytes, checksum: 910af57b2752ba72663958dd36daa68a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O experimento foi conduzido no confinamento da Unesp/Botucatu, com o objetivo de avaliar a influência da suplementação das vitaminas D e E sobre o desempenho, características de carcaça e atributos de carne de bovinos jovens confinados. Foram utilizados 36 machos inteiros, 18 Nelore (NE) e 18 Canchim (CC); desmamados aos sete meses de idade, com peso vivo médio de 234,53 ± 22,15 e 248,13 ± 34,67 kg, respectivamente. Os animais foram confinados por 134 dias. Aos quarenta e sete dias pré-abate, nove animais NE e nove animais CC, foram suplementados com 1300 UI/vitamina E/dia e 10 dias antes do abate, os mesmos animais foram suplementados com 7,5 x 106 UI/vitamina D3/dia. No último dia da suplementação, foram colhidas amostras de sangue dos animais, para avaliar o cálcio plasmático. O pH da carcaça foi mensurado à zero e 24hs após o abate. Na desossa, foram colhidas amostras de Longissimus, entre a 12a e 13a costelas, para análise de força de cisalhamento, perdas por cocção, índice de fragmentação miofibrilar, lipídeos totais, concentração de vitamina D e E na carne e exposição sob condições simuladas de varejo. A cor e o pH da carne, foram mensurados diariamente nas amostras expostas. No primeiro e no último dia de exposição foram colhidas amostras da gordura subcutânea, para análise do perfil de ácidos graxos. Não houve efeito da suplementação de vitaminas D e E sobre o desempenho, características de carcaça e atributos da qualidade da carne, porém houve efeito para cálcio plasmático. A suplementação de vitaminas D e E, não foi efetiva para melhorar o desempenho, as características de carcaça e os atributos de qualidade da carne de bovinos jovens confinados. / The experiment was conducted at Unesp/Botucatu feedlot, with the objective to evaluate the supplementation of vitamin D and E on performance, carcass characteristics and meat quality of feedlot bullocks. It was used 36 animals, 18 Nellore (NE) and 18 Canchim (CC), weaned at seven months and average initial body weight of 234.53 ± 22.15 and 248.13 ± 34.67 kg, respectively, fed for134 days. At the forty seventh day prior slaughter, nine NE and nine CC were supplemented with 1300 IU/vitamin E/day and 10 days prior slaughter, the same animals were supplemented with 7.5 x 106 IU/vitamin D3/day. At last day of supplementation, blood samples were taken to evaluate plasmatic calcium. Carcass pH was measured at 0 and 24hrs after slaughter. At boning process, Longissimus samples were collected between 12th and 13th ribs for sear force, cooking loss, miofibrilar fragmentation index, total lipids, vitamin D and E concentrations, and retail conditions storage simulation. Meat color and pH of the samples were daily measured. Fatty acid profile samples were collected at first and last day of retail condition storage simulation. There was no effect of vitamin D and E on feedlot performance, carcass characteristics and meat quality, although plasmatic calcium effect was observed. In conclusion, vitamin D and E were not effective to enhance feedlot performance, carcass characteristics and meat quality of feedlot bullocks.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim of this study was to evaluate the influence of different sources of carbohydrates (corn, soybean hulls and wheat bran) on ingestive behavior of twenty four steers with initial average of age and weight of 20 months and 330 kg and Charolais or Nellore predominance. The time spent in feeding activities (214min./day) and total rumination (458min./day) weren t influenced by diet carbohydrate sources. The animals in the wheat bran treatment spent less time in total idling (678min.) in relation to the corn (768min./day) and soybean hulls treatment (774min./day). The neutral detergent fiber (NDF) intake was higher for the animals fed with soybean hulls and wheat bran (5.18 and 5.42 kg/day respectively) compared with those who received corn as a carbohydrate source (3.35kg/day), however the non-fibrous carbohydrates intake was higher for this source of carbohydrate (4.29kg/day), intermediate for wheat bran (2.53kg/day) and lower for those in soybean hulls treatment. The steers fed with soybean hulls presented less intake of digestible energy (27.62Mcal/day) in relation to the corn (35. 5 Mcal/day) and wheat bran (33. 25 Mcal/day) treatments. Rumination efficiency of NDF was higher for soybean hulls (11.92g/min.) and wheat bran (10.23g/min.) compared to corn (7.68g/min.). The chewing time per ruminal bolus was lower for soybean hulls (0.88min./bolus) compared to the diets containing corn (0.96min./bolus) and wheat bran (0.95min./bolus). The animals with Charolais predominance presented higher feeding periods (29.41min.) in relation to the steers with Nellore predominance (24.95min.). The sources of carbohydrates tested didn t influence the feeding and total rumination time of the animals. The animals with Nellore predominance remain less time in lying idling, present longer periods of feeding and spend more time in chewing per ruminal bolus. / Objetivou-se, com este estudo, avaliar a influência de diferentes fontes de carboidratos (milho, casca de soja ou farelo de trigo) sobre o comportamento ingestivo de 24 novilhos castrados com idade e peso médio inicial de 20 meses e 330 kg das predominâncias Charolês ou Nelore. Os tempos despendidos com alimentação (214min./dia) e ruminação total (458min./dia) não foram influenciados pelas fontes de carboidratos. Os animais do tratamento farelo de trigo permaneceram menos tempo em ócio total (678min.) em relação ao milho (768min./dia) e a casca de soja (774min./dia). O consumo da fibra em detergente neutro (FDN) foi maior para os animais alimentados com casca de soja e farelo de trigo (5,18 e 5,42kg/dia respectivamente) comparado aos que receberam milho como fonte de carboidrato (3,35kg/dia), no entanto o consumo de carboidratos não-fibrosos foi superior para esta fonte de carboidrato (4,29kg/dia), intermediário para o farelo de trigo (2,53kg/dia) e inferior para aqueles do tratamento casca de soja. Os novilhos alimentados com casca de soja apresentaram menor consumo de energia digestível (27,62 Mcal/dia) em relação aos tratamentos milho (35,5 Mcal/dia) e farelo de trigo (33,25 Mcal/dia). A eficiência de ruminação FDN foi superior para a casca de soja (11,92g/min.) e farelo de trigo (10,23g/min.) em comparação ao milho (7,68g/min.). O tempo de mastigações por bolo ruminal foi menor para a casca de soja (0,88min./bolo) em comparação as dietas contendo milho (0,96min./bolo) e farelo de trigo (0,95min./bolo). Os animais de predominância Charolês apresentaram maiores períodos de alimentação (29,41min.) em relação aos novilhos de predominância Nelore (24,95min.). As fontes de carboidrato testadas não influenciam o tempo de alimentação e de ruminação total dos animais. Novilhos de predominância Nelore permanecem menos em ócio deitado, apresentam períodos de alimentação mais demorados e gastam mais tempo de mastigação por bolo ruminal.

Submitted by MARCOS VINICIUS ANTUNES DE LEMOS (marcoslemoszootec@gmail.com) on 2017-06-02T15:32:45Z No. of bitstreams: 1 Tese_Marcos_VA_Lemos1.pdf: 3226396 bytes, checksum: 1f97ad6fd98b95977fbdc4ba573a83bb (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-02T17:51:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lemos_mva_dr_jabo.pdf: 3226396 bytes, checksum: 1f97ad6fd98b95977fbdc4ba573a83bb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T17:51:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lemos_mva_dr_jabo.pdf: 3226396 bytes, checksum: 1f97ad6fd98b95977fbdc4ba573a83bb (MD5) Previous issue date: 2017-05-05 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Objetivou-se identificar regiões no genôma de bovinos da raça Nelore que apresentam variações no número de cópias (CNV) e, associar estes CNV com o perfil de ácidos graxos da carne. Além disso, objetivou-se realizar associação genica ampla utilizando os método de single step (GWASss) a fim de detectar regiões genômicas associadas aos ácidos graxos dos grupos saturados, mono e poliinsaturados, assim como os omegas 3, 6 e sua relação. O estudo de caracterização e distribuição dos CNVs ao longo do genoma de bovinos Nelore, foi realizado através do software PennCNV utizando dados genotípicos de 3.794 aniamais, resultando em 399.361 CNVs identificados. Após controle de qualidade, 2.902 foram mantidos nas analises, resultando em 195.873 CNVs, com tamanho medio de 54,744 pb, maximo de 8.7 Mb e minimo 3 kb. As regiões de CNV foram geradas pela sobreposição dos CNVs através do software CNVRuler. Os cromossomos que mostraram maior incidencia de CNVR foram BTA19 (24,26%), BTA23 (18,68%) e BTA25 (18,05%). Ja os que mostraram menor incidencia foram BTA29 (1,63%), BTA13 (9,72%) and BTA8 (9,72%). As 9.805 regiões da CNV estimadas no presente estudo cobrem aproximadamente 13.05% do genoma bovino e sobrepõem-se a 5.495 genes conhecidos que envolvem processos biológicos que poderiam estar envolvidos na adaptação ambiental da subespécie a áreas tropicais. O estudo de GWASss identificou 115 janelas que explicaram mais de 1% da variação genética aditiva para os 22 ácidos graxos estudados. A identificação destas regiões e seus genes genes, tais qual ELOVL5, ESRRG, PCYT1A e os genes do grupo ABC (ABCA5, ABCA6 e ABCA10) são genes que estão relacionados direto e inderamente ao metabolismo lipídico. O GWAS entres os fenótipos de AG e os CNVs resultaram em um total de 186 CNVR siginificantivos para os grupos dos ácidos graxos saturados (43), monosaturados (42), poliinsaturados (66) e omegas (35), nas quais foram identificados 278 genes com funçao descrita. Estes resultados apontaram genes associados a AG de varias saturações, podendo ser destacados os genes SAMD8 e BSCL2, os quais estão relacionados ao metabolism lipidico; e o gene RAPGEF6, relacionado ao metabolism energetico. Assim os inúmeras regiões genômicas encontradas neste estudo, bem como os genes identificados nas mesmas, devem contribuir para a formação de uma base genética do perfil de ácidos graxos da carne de bovino Nelore (Bos indicus), podendo contribuir para uma melhor seleção das características associadas à melhora da saúde humana. saúde. O conhecimento desses CNVs deverá melhorar a compreensão dos mecanismos genéticos e fisiológicos que contribuem para as características produtivas, bem como na seleção de animais mais produtivos e eficientes, contribuindo para o melhoramento genético das características produtivas. / The objective of this study was to identify genomic regions of Nellore cattle that present variations in the number of copies (CNV) and to associate these CNV with the fatty acid profile of the meat. In addition, the objective of this study was to carry out a genome-wid association using the single step method (GWASss) to detect genomic regions associated with saturated, mono and polyunsaturated fatty acids, as well as omega 3, 6 and their relationship. The study of the characterization and distribution of CNVs along the Nellore genome was performed by PennCNV software using genotypic data of 3,794 animals, resulting in 399,361 CNVs identified. After quality control, 2,902 were maintained in the analyzes, resulting in 195,873 CNVs, with an average size of 54,744 pb, maximum of 8.7 Mb and minimum 3 kb. The CNV regions were generated by the overlap of the CNVs by CNVRuler software. The chromosomes that showed the highest incidence of CNVR were BTA19 (24.26%), BTA23 (18.68%) and BTA25 (18.05%). Those with the lowest incidence were BTA29 (1.63%), BTA13 (9.72%) and BTA8 (9.72%). The 9,805 CNV regions estimated in the present study covered approximately 13.05% of the bovine genome and overlaped 5,495 genes known to envolve in biological processes that could be involved in the environmental adaptation of the subspecies to tropical areas. The GWASss study showed 115 windows that explained more than 1% of the additive genetic variation for the 22 fatty acids studied. The identification of these regions and their genes, such as ELOVL5, ESRRG, PCYT1A and the ABC group genes (ABCA5, ABCA6 and ABCA10) are genes directly and indirectly related to lipid metabolism. The GWAS between AG phenotypes and CNVs resulted in a total of 186 CNVRs that were significant for the saturated (43), monosaturated (42), polyunsaturated (66) and omegas (35) fatty acids groups, in which 278 genes with described function. These results pointed genes associated to AG of various saturations, and the genes SAMD8 and BSCL2, which are related to lipid metabolism; and the RAPGEF6 gene, related to energetic metabolism. Thus, the numerous genomic regions found in this study, as well as the genes identified in them, should contribute to the formation of a genetic basis of the Nellore beef (Bos indicus) fatty acid profile, contributing to a better selection of the traits associated with improvement of human health. The knowledge of these CNVs could improve the understanding of the genetic and physiological mechanisms that contribute to the productive traits, as well as the selection of more productive and efficient animals. / FAPESP: 2013/11853-4

Orientador: Ciro Moraes Barbosa / Banca: Marcelo Marcondes Seneda / Banca: Pietro Sampaio Baruselli / Banca: Roberto Sartori / Banca: Sony Dimas Bicudo / Resumo: Alguns estudos indicam que altos níveis de progesterona (P4) plasmática diminuem a pulsatilidade de LH e, conseqüentemente, o crescimento folicular. Isto pode diminuir a eficiência de protocolos para inseminação artificial em tempo fixo (IATF) que se baseiam na utilização de dispositivos intravaginais contendo P4. Objetiva-se com o presente trabalho avaliar a influência de diferentes concentrações de P4, associadas ou não à aplicação de eCG, nas taxas de ovulação e prenhez de novilhas da raça Nelore submetidas a protocolos para IATF. No experimento (exp.) 1, novilhas Nelore (n=15), cíclicas e pré-sincronizadas com tratamento hormonal, foram distribuídas aleatoriamente em quatro grupos experimentais. No dia da inserção do dispositivo intravaginal (D0) todos os animais receberam 2 mg de benzoato de estradiol (BE) e um dispositivo intravaginal contendo 0,558g de P4 (Triu B®, grupo 0,5G, n = 4) ou 1g de P4 (Cronipress®, grupo 1G, n = 4), ou 0,558g de P4 e PGF2α (150 μg d-cloprostenol, grupo 0,5G/PGF , n = 4) ou 1 g de P4 e PGF2α (grupo 1G/PGF, n = 3). Oito dias mais tarde (D8) administrou-se PGF2α em todos os animais e o dispositivo foi removido. Vinte e quatro horas após a remoção do dispositivo intravaginal, as novilhas foram tratadas com BE (1 mg, IM). Entre os dias D0 e D12 foram realizados, diariamente, exames ultrassonográficos dos ovários e mensurado o diâmetro folicular. Foram colhidas amostras de sangue para dosagem da P4 nos dias 0,1,2,4,8 e 10. No exp. 2, novilhas cíclicas da raça Nelore (n=292) foram tratadas com os mesmos protocolos do primeiro experimento. Entretanto, 30 a 36h após a aplicação do BE todos animais foram submetidos a IATF (D10). Em uma amostragem de novilhas de cada grupo os ovários foram examinados, por meio de ultrassonografia, nos dias 9 e 12, para determinar a taxa de ovulação após cada tratamento. No exp. 3, novilhas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Previous reports indicate that high concentration of plasmatic progesterone (P4) decreases LH pulse frequency, and consequently follicular growth. This may reduce the efficiency of fixed-time artificial insemination (FTAI) protocols that utilize P4 in Bos indicus heifers. The objective of the present work was to evaluate the influence of different P4 concentrations associated or not with eCG in the ovulation and pregnancy rates of Nellore heifers submitted to hormonal protocols for FTAI. In experiment (exp.) 1, heifers (n=15) pre-synchronized with a hormonal treatment were randomly allocated in four experimental groups. At the time of intravaginal device insertion (D0) all animals received 2 mg of estradiol benzoate (EB) and an intravaginal progesterone-releasing device containing 0.558g of P4 (TRIU®, group 0.5G, n=4) or 1g of P4 (Cronipress®, group 1G, n = 4), or 0.558g of P4 and PGF2α (150 μg d-cloprostenol, group TRIU/PGF, n = 4), or 1g of P4 and PGF2α (group 1G/PGF, n = 3). Eight days later (D8), PGF2α (150 μg d-cloprostenol) was administered to all heifers, the P4 source was removed. Twenty four hours after removing the intravaginal device, the heifers were treated with EB (1 mg, i.m.). Ovarian ultrasonographic examinations were performed daily, from the day D0 to D12 to measure follicles diameter. Blood samples were collected during the days 0, 1, 2, 4, 8 and 10 to evaluate plasma P4 concentration. In exp. 2, cyclic Nellore heifers (n=292) were treated with the same protocols as in the exp. 1. However, 30 to 36 h later all animals were fixed-time inseminated on D10. In exp. 3, heifers (n=459) received the treatments described to groups 0.5G/PGF and 1G/PGF associated with 300 IU of eCG (i.m., groups 0.5G/PGF/eCG and 1G/PGF/eCG) at the time of intravaginal device removal (D8). In a subset of heifers from each group blood samples were collected on D8 and ovarian ultrasonography... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Jane Maria Bertocco Ezequiel / Banca: Luiz Carlos Roma Junior / Banca: Lúcia Maria Zeola / Banca: Mário De Beni Arrigoni / Banca: Mauro Dal Secco de Oliveira / Resumo: Objetivou-se neste estudo avaliar a inclusão de glicerina bruta em dietas para bovinos da raça Nelore e seu efeito sobre o comportamento ingestivo, consumo, desempenho, parâmetros sanguíneos, características de carcaça e carne, digestibilidade, degradabilidade, parâmetros ruminais, produção de CH4 e CO2 e da massa microbiana. Cinco dietas experimentais foram testadas: G0 - controle sem adição de glicerina, G7,5 - 7,5% de glicerina na matéria seca da dieta, G15 - 15% de glicerina na matéria seca da dieta, G22,5 - 22,5% de glicerina na matéria seca da dieta e G30 - 30% de glicerina na matéria seca da dieta. No primeiro experimento foram utilizados bovinos (n=30, machos, não castrados, raça Nelore, 277,7kg PC, 18 meses de idade) distribuídos em delineamento em blocos ao acaso. Foram avaliados, durante 103 dias de confinamento, o consumo de MS e de nutrientes, GMD, CA, EA, além do comportamento ingestivo. No segundo experimento foram avaliados os parâmetros sanguíneos dos animais do confinamento e pesos de carcaça quente e fria, rendimento de carcaça, AOL, GSUB, além da composição centesimal, perfil de AG, colesterol e análise sensorial da carne. No terceiro experimento foram avaliadas as digestibilidades da MS e de nutrientes e a degradabilidade ruminal dos ingredientes utilizados. Para as incubações ruminais foram utilzados bovinos (n=5, machos castrados, raça Nelore, 400kg PC, 24 meses de idade) dotados de cânulas ruminais permanentes e distribuídos em delineamento em quadrado latino (5 × 5). No quarto experimento foram avaliados pH, N-NH3, AGCC, produção de CH4 e CO2, além das bactérias sólido-aderidas e bactérias e protozoários líquido associados. A inclusão de até 30% de glicerina deprimi a digestibilidade e degradabilidade da fibra, diminui a produção de CH4 e CO2 e interfere negativamente na produção... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study was to evaluate the inclusion of crude glycerin in diets for Nellore cattle and its effect on ingestive behavior, intake, performance, blood parameters, characteristics of carcass and meat, digestibility, degradability, ruminal parameters, production of CH4 and CO2 and microbial mass. Five experimental diets were tested: G0 - control without addition of glycerin, G7, 5 - 7.5% glycerin in the diet dry matter, G15 - 15% glycerin in the diet dry matter, G22, 5 - 22.5% glycerin in the diet dry matter and G30 - 30% glycerin in the diet dry matter. In the first experiment bovine (n=30, steers, Nellore, BW 277.7 kg, 18 months old) distributed in a randomized block design were used. It was evaluated during 103 days of feedlot, DM and nutrient intake, ADG, G:F, F:G, and ingestive behavior. The second experiment evaluated the blood parameters of animals in the feedlot, hot and cold carcass weights, LM, SF, and the proximate composition, fatty acid profile, cholesterol and sensory analysis of meat. In the third experiment it was evaluated the dry matter and nutrient digestibility and ingredients degradability. For rumen incubations, cattle (n=5 steers, Nellore, BW 400kg, 24 months old) fitted with permanent ruminal cannulas and distributed in Latin square design (5 × 5) were used. In the fourth experiment it was evaluated pH, N-NH3, SCFA, production of CH4 and CO2, in addition to the particle-associated bacteria and liquid-associated protozoa and bacteria. The inclusion of up to 30% glycerin depresses fiber digestibility and degradability, decreases production of CH4 and CO2 and has negative impact on the production of particle-associated bacteria, and it does not promote changes in performance variables... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Foi avaliado o efeito do processamento do milho (PRC) e de diferentes teores de fibra insolúvel em detergente neutro proveniente de forragem (FDNf) no desempenho de bovinos. Posteriormente, foi estudado o efeito do PRC e da inclusão de polpa cítrica (PCtr) em substituição ao milho. Foram utilizados em cada experimento 112 bovinos machos não castrados da raça Nelore, com peso inicial de 384,1 ± 29,5 kg e 378,3 ± 21,3 kg respectivamente. O delineamento foi o de blocos completos casualizados em esquema fatorial 2x4. No primeiro experimento os dois PRC foram grão úmido ensilado (GU) e grão seco moído fino (MM) e os teores de FDNf foram 3, 8, 13 e 18% na MS. No segundo experimento foram utilizados os mesmo PRC (GU ou MM) e quatro teores de PCtr (0, 7, 14 e 21% na MS). No primeiro experimento, verificou-se efeito quadrático de FDNf para ganho de peso (P=0,01), sendo o ganho ótimo com inclusão de 13,0% de FDNf. Houve interação de PRC e FDNf (P=0,05) para consumo de matéria seca (CMS) sendo que os maiores CMS foram obtidos com inclusões de 11,3 e 13,7% de FDNf para animais alimentados com MM e GU respectivamente. Em ambos os experimentos a eficiência alimentar (EA) foi melhor (P<0,01) para animais alimentados com GU em relação ao MM. Houve efeito quadrático de FDNf para peso de carcaça quente e fria (P=0,04), sendo as carcaças mais pesadas obtidas com 12,8% de FDNf na dieta. Foi observado efeito quadrático de FDNf para peso de gordura renal, pélvica e inguinal (P=0,04), sendo que a maior deposição ocorreu com inclusões de 12,5% de FDNf. Houve interação de PRC e FDNf para teor de amido fecal (AF; P<0,001). Animais alimentados com GU apresentaram teores médios de AF mais baixos (3% na MS) e independentes do teor de FDNf da dieta. Entretanto, animais recebendo dietas com MM apresentaram teores mais elevados de AF (13% na MS), que foi reduzido com o aumento do teor de FDNf. No segundo experimento, observou-se efeito de PRC (P<0,001) para CMS, que foi menor em animais alimentados com GU em relação aos MM. Houve efeito linear de PCtr no CMS (P<0,001), ocorrendo aumento no CMS com o aumento da inclusão de PCtr. Não houve efeito (P>0,05) de PRC e nem de PCtr para características de carcaça. O AF foi menor em animais alimentados com GU em relação ao MM (3,16 vs. 8,63% na MS, P<0,001). A exigência de FDNf para maior CMS foi dependente do método de PRC, sendo menor para o MM em relação ao GU (11,3 vs. 13,7% FDNf). A inclusão de aproximadamente 13% de FDNf parece ser adequada para maximizar o desempenho de bovinos Nelore em dietas contendo caroço de algodão. O GU melhora a EA e reduz as perdas fecais de amido. / The effect of corn processing (PRC) and different levels of neutral detergente fiber from forage (NDFf) on performance were evaluated in one experiment and the effects of PRC and different citrus pulp levels (PCtr) were evaluated in a second experiment. In each study 112 Nellore bulls were used with 384.1 ± 29.5 kg inicial body weight (iBW) for the first experiment and 378.3 ± 21.3 kg iBW for the second experiment. The animals were used in a randomized complete block design in a 2x4 factorial arrangement. The PRC methods evaluated were high moisture corn (HM) and finely ground corn (GC). The levels of NDFf evaluated were 3, 8, 13 e 18% in the DM. In the second trial the same two PRC (HM and GC) and four levels of PCtr were evaluated (0, 7, 14 and 21% in the DM). In the first experiment a quadratic effect of NDFf was observed (P=0.01) with peak gain at 13.0% of NDFf. There was an interaction between PRC and NDFf (P=0.05) for dry matter intake (DMI); peak DMI occurred with 11.3 and 13.7% NDFf for GC and HM respectively. In both experiments gain efficiency (GE) was better (P<0.01) for animals fed HM than GC. There was a quadratical effect of NDFf for hot and cold carcass weight (P=0.04), with maximum weights at 12.8% NDFf. A quadratical effect of NDFf for renal, pelvic and inguinal fat weight (P=0.04) was observed with the highest weights at 12.5% NDFf. There was an interaction between PRC and NDFf for fecal starch (FS; P<0.001). Animals fed HM diets presented no change in FS with different NDFf levels (3% in the DM). However, animals fed GC had higher average FS (13% in the DM), and there was a decrease in FS content with increasing NDFf percentage. In the second experiment, there was an effect of PRC (P<0.001) on DMI, with lower intakes for animals fed HM diets. There was a linear effect of PCtr (P<0.001) on DMI with increased intakes as a result of increasing PCtr in the diet. No effects were observed for PRC and PCtr for carcass traits. FS was lower in animals fed HM compared to GC (3.16 vs. 8.63% in the DM; P<0.001). The NDFf required to optimize DMI was dependent on method of PRC (maximum intake required 11.3 and 13.7% NDFf for GC and HM, respectively). The performance of Nellore bulls could be optimized with around 13% NDFf in diets with cottonseed. The high moisture corn improves gain efficiency and decreases starch fecal losses.