Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-05-30Bitstream added on 2014-06-13T20:33:50Z : No. of bitstreams: 1 pereira_vmc_me_jabo.pdf: 170146 bytes, checksum: a632189e1f4550de16cb0049845075b8 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Estimaram-se, pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas, parâmetros genéticos dos pesos ao nascimento (PN), à desmama (P240), ao ano (P365) e ao sobreano (P550), dos ganhos em peso do nascimento à desmama (GND) e do nascimento ao sobreano (GN18), do número de dias para ganhar 175 kg do nascimento à desmama (D175) e 450 kg do nascimento ao abate (D450) de machos e fêmeas, do perímetro escrotal (PE12) de machos aos 12 meses de idade e da idade (IPP) e peso (PPP) ao primeiro parto e peso adulto (PAD) de fêmeas, em um rebanho Canchim. As herdabilidades foram: 0,41 (PN e PE12); 0,28 (P240 e P550); 0,38 (P365); 0,26 (GND); 0,30 (GN18); 0,23 (D175 e D450); 0,09 (IPP); 0,42 (PPP) e 0,48 (PAD). As correlações genéticas entre as características de crescimento (-0,98 a 0,97) e das características de crescimento com PE12 (-0,39 a 0,46) e com IPP (-0,38 a 0,44) foram favoráveis, com exceção de PN com IPP (0,49). Com PPP (-0,47 a 0,88) e PAD (-0,42 a 0,78), as correlações genéticas das características de crescimento foram desfavoráveis e as de PE12 com IPP, PPP e PAD foram -0,37; 0,04 e -0,09, respectivamente. Os resultados sugerem que a seleção para melhorar as características de crescimento após o nascimento deve reduzir IPP, mas resultar em fêmeas com maior PAD, enquanto que a seleção para maior PE12 deve reduzir IPP sem modificar PAD. / Genetic parameters for body weights at birth (PN), weaning (P240), twelve (P365) and eighteen (P550) months of age, body weight gains from birth to weaning (GND) and from birth to eighteen (GN18) months of age, and days to gain 175 kg from birth to weaning (D175 = 175/GND) and 450 kg (D450 = 450/GN18) from birth to slaughter of males and females, male scrotal circumference at 12 months of age (PE12), and female age (IPP) and weight (PPP) at first calving, and adult body weight (PAD), were obtained by the derivative free restricted maximum likelihood method, in a Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) beef cattle herd. The heritabilities were: 0.41 (PN and PE12), 0.28 (P240 and P550), 0.38 (P365), 0.26 (GND), 0.30 (GN18), 0.23 (D175 and D450), 0.09 (IPP), 0.42 (PPP) and 0.48 (PAD). The genetic correlations among the growth traits (-0.98 to 0.97), and between the growth traits and PE12 (-0.39 to 0.46) and IPP (-0.38 to 0.44) were favorable, with the exception of that for PN and IPP (0.49). For PPP (-0.47 to 0.88) and PAD (-0.42 to 0.78) with the growth traits, the correlations were unfavorable, while for PE12 with IPP, PPP and PAD they were -0.37, 0.04 and -0.09, respectively. The results suggest that selection to enhance growth traits after birth should reduce IPP, but increase PAD, while selection to increase PE12 should reduce IPP without changes in PAD.

Orientador: Maurício Mello de Alencar / Banca: Alexander George Razook / Banca: Pedro Franklin Barbosa / Resumo: Estimaram-se, pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas, parâmetros genéticos dos pesos ao nascimento (PN), à desmama (P240), ao ano (P365) e ao sobreano (P550), dos ganhos em peso do nascimento à desmama (GND) e do nascimento ao sobreano (GN18), do número de dias para ganhar 175 kg do nascimento à desmama (D175) e 450 kg do nascimento ao abate (D450) de machos e fêmeas, do perímetro escrotal (PE12) de machos aos 12 meses de idade e da idade (IPP) e peso (PPP) ao primeiro parto e peso adulto (PAD) de fêmeas, em um rebanho Canchim. As herdabilidades foram: 0,41 (PN e PE12); 0,28 (P240 e P550); 0,38 (P365); 0,26 (GND); 0,30 (GN18); 0,23 (D175 e D450); 0,09 (IPP); 0,42 (PPP) e 0,48 (PAD). As correlações genéticas entre as características de crescimento (-0,98 a 0,97) e das características de crescimento com PE12 (-0,39 a 0,46) e com IPP (-0,38 a 0,44) foram favoráveis, com exceção de PN com IPP (0,49). Com PPP (-0,47 a 0,88) e PAD (-0,42 a 0,78), as correlações genéticas das características de crescimento foram desfavoráveis e as de PE12 com IPP, PPP e PAD foram -0,37; 0,04 e -0,09, respectivamente. Os resultados sugerem que a seleção para melhorar as características de crescimento após o nascimento deve reduzir IPP, mas resultar em fêmeas com maior PAD, enquanto que a seleção para maior PE12 deve reduzir IPP sem modificar PAD. / Abstract: Genetic parameters for body weights at birth (PN), weaning (P240), twelve (P365) and eighteen (P550) months of age, body weight gains from birth to weaning (GND) and from birth to eighteen (GN18) months of age, and days to gain 175 kg from birth to weaning (D175 = 175/GND) and 450 kg (D450 = 450/GN18) from birth to slaughter of males and females, male scrotal circumference at 12 months of age (PE12), and female age (IPP) and weight (PPP) at first calving, and adult body weight (PAD), were obtained by the derivative free restricted maximum likelihood method, in a Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) beef cattle herd. The heritabilities were: 0.41 (PN and PE12), 0.28 (P240 and P550), 0.38 (P365), 0.26 (GND), 0.30 (GN18), 0.23 (D175 and D450), 0.09 (IPP), 0.42 (PPP) and 0.48 (PAD). The genetic correlations among the growth traits (-0.98 to 0.97), and between the growth traits and PE12 (-0.39 to 0.46) and IPP (-0.38 to 0.44) were favorable, with the exception of that for PN and IPP (0.49). For PPP (-0.47 to 0.88) and PAD (-0.42 to 0.78) with the growth traits, the correlations were unfavorable, while for PE12 with IPP, PPP and PAD they were -0.37, 0.04 and -0.09, respectively. The results suggest that selection to enhance growth traits after birth should reduce IPP, but increase PAD, while selection to increase PE12 should reduce IPP without changes in PAD. / Mestre

Resumo: Os objetivos deste trabalho foram identificar as funções matemáticas que melhor se ajustam para descrever o crescimento de fêmeas da raça Canchim e do grupo genético MA (filhos de touros da raça Charolesa e vacas ½ Canchim + ½ Nelore), e estimar a herdabilidade dos parâmetros A e k da curva que melhor se ajustou aos dados e a correlação genética desses com a idade (IPP) e o peso (PPP) ao primeiro parto e idade (ISP) e peso (PSP) ao segundo parto. As funções não lineares Brody, Richards, Von Bertalanffy e duas alternativas de Gompertz e de Logístico foram ajustadas pelo método de Gauss Newton e procedimento NLIN do SAS, a dados peso-idade de 1.923 bovinos da raça Canchim e MA, nascidos de 1972 a 2006, com pesagens no mínimo até os 37 meses de idade e no máximo até os 100 meses de idade e com pelo menos sete pesagens. A comparação entre os modelos foi realizada com base na interpretação biológica dos parâmetros e nos avaliadores de qualidade de ajuste. A estimação dos parâmetros genéticos foi feita pelo método da máxima verossimilhança restrita, utilizando análises uni e bicaracterísticas com modelos que incluíram o efeito fixo de grupo de contemporâneos e o efeito aleatório aditivo direto. Os modelos Brody e Von Bertalanffy ajustaram aos dados peso-idade, enquanto que os demais não convergiram, sendo que o modelo Brody foi escolhido para a obtenção dos parâmetros A e k de cada animal. As estimativas de herdabilidade obtidas foram 0,32 ± 0,05; 0,12 ± 0,04; 0,12 ± 0,04; 0,43 ± 0,06; 0,19 ± 0,06 e 0,44 ± 0,06, para A, k, IPP, PPP, ISP e PSP, respectivamente. Estes resultados sugerem que é possível, mas difícil obter mudanças na curva de crescimento dos animais pela seleção. As estimativas de correlação genética dos parâmetros A e k com as idades e os pesos aos partos sugerem que a seleção para modificar A deve provocar mudanças no ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objectives in this study were to identify the mathematical function that best fits the growth of Canchim and MA (offspring of Charolais bulls and ½ Canchim + ½ Nelore cows) females, and to estimate the heritability of parameters A and k of the function that best fitted the data and the genetic correlations of these parameters with age (IPP) and weight (PPP) at first calving and age (ISP) and weight (PSP) at second calving. Brody, Richards, Von Bertalanffy and two alternatives of Gompertz and of Logistic non-linear models were fitted by Gauss Newton method and NLIN procedure of SAS. Weight-age data of 1,923 females born from 1972 to 2006, with weighing at least at 37 months of age and at most at 100 months of age, and with at least seven weighing were used. The comparison between the models was based on the biological interpretation of parameters and measures of quality of adjustment. The genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method using one and two-trait analyses with animal models that included the fixed effect of contemporary group and the random additive direct effect. The Brody and the Von Bertalanffy models adjusted the weight-age data well, while the others did not converge, and the Brody function was chosen to obtain the parameters A and k of each animal. The heritability estimates were 0.32 ± 0.05, 0.12 ± 0.04, 0.12 ± 0.04, 0.43 ± 0.06, 0.19 ± 0.06 and 0.44 ± 0.06 for A, k, IPP, PPP, ISP and PSP were, respectively. These values suggest that it is possible, but difficult to obtain changes in the pattern of the growth curve of the animals by selection. Estimates of genetic correlation of parameters A and k with the other traits suggest that selection to change A should cause changes in the same direction in PPI, PPP, ISP and PSP, and that changes in k, if they occur, should also be followed by changes in the other traits, but in the opposite direction / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Alfredo Ribeiro de Freitas / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Lenira El Faro Zadra / Mestre

Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Danísio Prado Munari / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Nedenia Bonvino Stafuzza / Resumo: Recentes avanços tecnológicos possibilitaram a utilização de dados genômicos na avaliação de animais de produção. Os marcadores do tipo SNP ("Single Nucleotide Polymorphism") estão entre os mais utilizados para estudos do genoma bovino, pois estão presentes em grande quantidade e podem estar associados a regiões do genoma que atuam em características de interesse econômico. Fatores como a redução dos custos de genotipagem e a alta densidade dos painéis de marcadores possibilitaram que esta tecnologia seja utilizada em larga escala. Os objetivos deste trabalho foram avaliar o desequilíbrio de ligação (DL) e a conservação da fase do desequilíbrio de ligação (FDL) entre animais da raça Canchim e do grupo genético MA; e aplicar a metodologia "Generalized Quase- Likelihood Score" para estudo de associações genômica entre SNPs e características de peso corporal ao nascimento (PN), ao desmame (PD) e ao sobreano (PS); perímetro escrotal ao desmame (PED) e ao sobreano (PES); e idade ao primeiro (IPP) e segundo (ISP) parto nestes mesmos animais. Foram utilizados 285 animais da raça Canchim (proporção Charolês-Zebu igual a 62,5 % e 37,5%) e 114 animais do grupo genético MA (proporção aproximada Charolês-Zebu igual a 65,6% e 34,4%) genotipados para o painel de alta densidade BovineHD - Illumina® bead chip (777k). Para o estudo de DL e FDL as informações dos genótipos de alta densidade foram concatenadas com o mapa de genótipos de menor densidade (BovineSNP50 v2 bead chip) que possui aproximadamente 50 mil SNPs (50k), realizando assim a redução da densidade dos marcadores. Foram realizadas análises para animais Canchim, MA e Canchim + MA. O painel de 777k mostrou-se mais eficiente para estudo do DL e FDL quando comparado ao painel de 50k, pois apresentou elevada conservação de FDL (acima de 0,80)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Recent technological advances have enabled to use genomic data in livestock evaluation. Single nucleotide polymorphism (SNP) are one of the most widely used genetic markers because they are widely spread along the genome and also could be associated with traits of economic interest. High-throughput panels are becoming interesting for the producers as the cost of genotyping reduces. The objectives of this study were to evaluate the extent of linkage disequilibrium (LD) and the phase of linkage disequilibrium (PLD) between Canchim animals and MA genetic group; and to apply the "Generalized Quasi-Likelihood Score" method to perform a genome wide association study with birth weight (BW), weaning weight (WW), yearling weight (YW), scrotal circumference at weaning (SCW), scrotal circumference at yearling (SCY), age at first calving (AFC), and age at second calving (ASC). Analyses considered 285 Canchim animals (Charolais-Zebu proportion of 62.5% - 37.5%) and 114 animals of the MA genetic group (Charolais-Zebu proportion of 65.6% - 34.4%) genotyped with the BovineHD - Illumina Bead® chip (777k). Two marker densities were used for the LD and PLD analyses; one considered the 777k panel while the other considered a reduced panel which was resulted from a combined information of the high-throughput panel and the BovineSNP50 chip bead v2 map from Illumina®. These analyses were carried out for Canchim, MA, and Canchim + MA animals. PLD conservation was high in both panels, but only the 777k panel had higher mean r2 (LD measure) equal to 0.38, 0.34, and 0.31 at distances from 0.00 to 0.0025 Mb, 0.0025 to 0.0050 Mb, and 0.0050 to 0.0075 Mb in the Canchim + MA analysis. After this step, genome wide associations were carried out using the Generalized Quasi-Likelihood Score method (GQLS), which considers the logistic regression to associate phenotypic information... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Roberto Hiroshi Higa / Coorientador: Marcos Eli Buzanskas / Banca: Marcos Túlio de Oliveira / Banca: Fabiana Barichello Mokry / Resumo: Recentes avanços tecnológicos em genética permitiram a genotipagem de espécies de interesse zootécnico, como os bovinos. Foram desenvolvidos painéis de genotipagem com diferentes densidades de marcadores do tipo polimorfismos de nucleotídeo único ("single nucleotide polymorphism" - SNP). Painéis de alta densidade permitiram maior cobertura do genoma e possibilitaram sua aplicação em diferentes tipos de estudos, como a identificação de regiões do genoma conservadas devido à seleção. Tais regiões são denominadas assinaturas de seleção (AS). As AS são detectáveis por diferentes metodologias, como a Homozigose do Haplótipo Estendido ("extended haplotype homozygosity" - EHH) e o Escore de Integração dos Haplótipos ("integrated haplotype score" - iHS), sendo esta última derivada da EHH. O objetivo desse trabalho foi identificar regiões de AS em bovinos de corte da raça Canchim, genotipados com painel de alta densidade, visando futuras aplicações no melhoramento genético animal. O pacote rehh do programa R foi utilizado para identificação de AS por meio da metodologia iHS. Foram utilizados registros de 285 animais da raça Canchim, 114 do grupo genético MA e um da raça Charolês. Todos os animais (amostras) foram genotipados com o painel Illumina BovineHD BeadChip (786.799 SNPs) e provenientes da base de dados da Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP. O controle de qualidade de genótipos (CQ) foi realizado por meio do pacote snpStats, do R. Após o CQ, restaram 687.655 marcadores SNP e 396 amostras. Foi utilizado o programa BEAGLE para a inferência das fases de ligação e construção dos haplótipos, etapa necessária para utilização da iHS. A estatística iHS para cada um dos marcadores foi transformada em para conveniência da análise dos resultados. Valores de foram observados nos cromossomos BTA (Bos taurus) 5 e 14, com 39 e nove SNPs estatisticamente significativos ... / Abstract: Genomic selection has been considered as a technique that will allow significant increase in the genetic progress of animal breeding programs. Recent technological advances in genetics have allowed the genotyping of livestock species such as cattle, by means of single nucleotide polymorphism (SNP) chip panels. High-density SNP panels have allowed greater coverage of the genome and its application in different studies, such as the identification of conserved regions of the genome due to selection. Such regions are known as selection signatures (SS). The SS are detectable by various methods, such as the extended haplotype homozygosity (EHH); and the integrated haplotype score (iHS), which is derived from the HHE. The aim of this study was to identify regions of SS in Canchim beef cattle, genotyped with high-density SNP panel, and evaluate its future application in animal breeding. The rehh package of the R software was used for identification of SS through the iHS methodology. Data on 285 Canchim animals, 114 "MA" genetic group (cross between Charolais sires and Canchim-zebu dams), and one Charolais breed individual were used. The database used in this study was provided by Embrapa Cattle Southeast (São Carlos, SP, Brazil), which contains animals (samples) genotyped with the Illumina BovineHD BeadChip panel (786,799 SNPs). The quality control of genotypes (QC) was performed through snpStats package present in R. After the QC, a total of 687,655 SNP markers and 396 samples remained for SS analysis. The BEAGLE software was used to infer the linkage phase and to construct the haplotypes. The iHS statistic for each marker was transformed into piHS for better understanding of the results. On the Bos taurus (BTA) chromosomes 5 and 14 were observed piHS ≥ 5 (P <0.00001), with 39 and nine statistically significant SNPs, respectively. Windows of one million base pairs each were built to assist in the delimitation of SS regions. Within ... / Mestre

Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Patrícia Tholon / Banca: Claudia Cristina Paro de Paz / Banca: Danísio Prado Munari / Abstract: Temperament is a trait of notable economic relevance, due to its association with management and productive trait, and can be used as a selection criterion of cattle, requiring identification of environmental factors that influence, as well as the verification of genetic variability and the interrelationship with the other characteristics of interest to the production system. The objective of this study was to estimate genetic, phenotypic and environmental parameters using four measures of temperament evaluated on Canchim cattle. The temperament measures used were: flight speed (TS), composite score of temperament (ECT), total score of temperament (ET) and reactivity (REAT). This study analyzed 2090 information of Canchim cattle from the Canchim farm belonging to Embrapa Pecuária Sudeste, located at São Carlos, SP. The temperament traits were analyzed using an animal model, through bi-trait analyzes. For all traits, the contemporaries group (CG) was formed by animals born in the same year and belonging to the same sex. The evaluations were carried out during the weaning, yearling and long yearling phases. The temperament measures showed heritability estimates ranging from 0,07 (0,142) (TS at weaning) to 0,36 (0,240) (TS at yearling) values of moderate to low magnitude that were influenced by management practices and environmental conditions, being important knowledge such factors for selection actions. The genetic correlation estimates were higher for ETxREAT (1.00 at long ye... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: As medidas de temperamento possuem notória relevância econômica devido a sua associação com características de interesse produtivo. Essas medidas podem ser utilizadas como critérios de seleção de bovinos, requerendo identificação de fatores ambientais que as influenciem, assim como a verificação de variabilidade genética e a inter-relação destas com as demais características de interesse ao sistema de produção. O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais de quatro medidas de avaliação do temperamento de bovinos da raça Canchim. As medidas de temperamento utilizadas foram: tempo de saída (TS), escore composto de temperamento (ECT), escore total (ET) e reatividade (REAT). Neste trabalho foram analisadas 2090 informações de bovinos da raça Canchim provenientes da fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste, situada na cidade de São Carlos, SP. As características foram analisadas utilizando-se um modelo animal, por meio de análises bi-característica. Para todas as características, o grupo de contemporâneos (GC) foi formado por animais nascidos no mesmo ano e pertencentes ao mesmo sexo. As avaliações foram realizadas durante as fases de desmama, ano e sobreano. As medidas de temperamento apresentaram estimativas de herdabilidade que variaram de 0,07 (0,142) (TS na desmama) a 0,36 (0,240) (TS, ao sobreano). As baixas magnitudes das estimativas indicam que as características são influenciadas principalmente por práticas de manejo e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Roberto Augusto de Almeida Torres Júnior / Banca: Cintia Righetti Marcondes / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Fernando Sebastian Baldi Rey / Resumo: A utilização de animais como reprodutores em programas de melhoramento genético de bovinos está associada ao registro genealógico pela Associação de Criadores. O objetivo neste trabalho foi avaliar e relacionar a aprovação dos animais ao registro genealógico definitivo com as características avaliadas no programa de avaliação genética da raça Canchim. Foram estimados parâmetros genéticos, por meio de modelo multicaracterística, para os pesos ao nascimento, ao desmame e ao sobreano, escores para conformação frigorífica ao desmame e ao sobreano, classificação final no registro ao desmame (CLD) e ao sobreano (CLS), escores para comprimento de umbigo e qualidade do pelo (PEL) avaliados ao desmame, e perímetro escrotal ao sobreano (PE), e por modelos bicaracterística para aprovação ao registro genealógico (AP) com cada uma das demais variáveis. A relação entre classificação final e as outras características avaliadas foi desdobrada pela análise de trilha para estimar efeitos diretos e indiretos. A probabilidade de aprovação ao registro genealógico foi estudada, as diferenças esperadas na progênie (DEP) para todas as características foram estimadas e foi elaborado o índice de qualificação genética (IQG) utilizado pelo Programa de Avaliação Genética do Canchim. Foi estimada a herdabilidade do escore de coloração da mucosa dos animais e foram obtidas as probabilidades de ocorrência de cada um dos escores de acordo com a coloração da mucosa dos pais. A probabilidade de um animal ser a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The use of animals in beef cattle breeding programs is dependent on their approval to genealogical registry by the breeders association. The aim of this work was to evaluate and to relate the approval of the animals to the definitive genealogical record with the traits evaluated in the genetic evaluation program of the Canchim breed. Genetic parameters were estimated by means of a multi-trait model for birth, weaning and yearling (18 months of age) weights, slaughter conformation scores at weaning (CSW) and yearling (CSY), final registry classification scores at weaning (CLW) and yearling (CLY), navel and hair coat (HC) scores at weaning, and scrotal circumference at yearling (SCY), and using two-trait models for approval to registry (AR) with each of the above traits. The relationship of CLW and CLY with the other traits was studied by path analysis to estimate direct and indirect effects. Probabilities of approval to registry were studied, expected progeny differences (EPD) for all traits were estimated and a genetic qualification index (GQI) used by the Canchim Genetic Evaluation Program was obtained for each animal. Heritability was also estimated for color of the mucosa, and the probability of occurring the various color of mucosa in the offspring according to the mucosa of the parents were obtained. The probability of an animal being approved for registration by the Brazilian Canchim Breeders Association at weaning was 77.48%, 75.15% for males and 79.43% for females, while at yearling, given the approval at weaning, the probability was 87.36%, 86.43% for males and 87.83% for females. The total probability of an animal being approved for registration at yearling was 69.63%, 72.26% for females and 67.71% for males. The genetic correlations among the traits varied from low negative (-0.07) to high po... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Foram realizados 2 experimentos no Departamento de Zootecnia da ESALQ/USP com o objetivo de avaliar o desempenho de tourinhos terminados em confinamento. No experimento 1 foram comparados três métodos de processamento de milho, laminado (L), floculado (F) e moído fino (M), combinados com 3 níveis crescentes de uréia (0,5; 1,0 e 1,5% na MS da dieta). As dietas continham 8,5, 9,9 e 11,3% de PB respectivamente. Foram utilizados 180 tourinhos da raça Nelore com peso inicial de 343 kg, distribuídos em 36 baias, confinados por 101 dias. As dietas continham 12% de feno picado e 88% de concentrado (milho, melaço, uréia e núcleo mineral com ionóforo). A floculação do milho flint aumentou o GPD, resultando em 20,5% maior eficiência alimentar em comparação com o milho laminado. Comparada com a moagem fina, a floculação aumentou em 11,6% a eficiência alimentar dos animais. A moagem fina melhorou a eficiência alimentar dos animais em 7,9% em comparação com a laminação. Independente do método de processamento do milho a eficiência alimentar dos animais aumentou de forma linear com o aumento dos níveis de uréia na ração. Os parâmetros de carcaça avaliados não foram afetados pelos tratamentos. No experimento 2 foram comparadas a digestibilidade do amido em dietas com três processamentos de milho (laminado, floculado e moído fino) em dois grupos genéticos de animais: predominantemente Bos taurus (Canchim) e Bos indicus (Nelore). Foram utilizados 15 tourinhos da raça Nelore, com peso vivo inicial de 325 kg e 15 tourinhos da raça Canchim, com peso vivo inicial de 361 kg. Os animais foram alojados em baias individuais, por 27 dias. As dietas continham 20% de feno de tifton e 80% de concentrado constituído de milho, farelo de soja, melaço, uréia, calcário calcítico e núcleo mineral. A concentração de amido fecal para os animais que receberam rações com milho moído fino e milho floculado foram menores (12,8 e 29,6%, respectivamente) quando comparadas ao milho laminado. A digestibilidade do amido no trato total foi maior para animais Canchim que para Nelore. Esses resultados permitem concluir que nos dois experimentos conduzidos, a moagem fina e a floculação, em comparação com a laminação, resultaram em aumento na digestibilidade do amido e na eficiência alimentar dos animais maior do que o relatado na literatura americana, provavelmente em virtude da diferença no tipo de milho utilizado nos dois países. / Two experiments were conducted at the Department of Animal Science, ESALQ / USP in order to evaluate the performance of feedlot finished young Nellore bulls. In Experiment 1 three corn processing methods were compared, dry rolling (L), steam flaking (F) and fine grinding (M) combined with three increasing crude protein levels (8.5, 9.9 and 11.3%) via addition of urea (0.5, 1.0 and 1.5% in diet DM) in diets rich in concentrate. 180 young Nellore bulls with initial weight of 343 kg were allotted to 36 feedlot pens for 101 days. Experimental diets consisted of 12% chopped hay and 88% concentrate (corn, molasses, urea and mineral supplement with ionophore). Steam flaking of flint corn reduced DMI and increased ADG, resulting in a 20.5% higher feed efficiency compared with dry rolled corn. Compared to grinding, steam flaking increased feed efficiency by 11.6%. Fine grinding improved feed efficiency by 7.9% compared to dry rolling. Regardless of corn processing method feed efficiency increased linearly with increasing levels of dietary urea. Carcass parameters were not affected by treatments. In experiment 2 starch digestibility was evaluated among diets containing three corn processing methods (dry rolling, steam flaking and fine grinding) among animals of two different genetic groups: predominantly Bos taurus (Canchim) and Bos indicus (Nellore). A total of 15 young Nellore bulls, with initial weight of 325 kg and 15 young Canchim bulls, with initial weight of 361 kg were housed in individual pens. Experimental diets contained 20% Tifton hay and 80% concentrate consisting of corn, soybean meal, molasses, urea, limestone and mineral core. Fecal starch concentration for animals receiving diets with finely ground and flaked corn were lower (12.8 and 29.6%, respectively) compared with to dry rolled corn. There was no difference in the total starch digestibility (DTA) among the genetic groups. These results suggest that on both experiments the fine grinding and steam flaking, compared with dry rolling, resulted in increased starch digestibility and feed efficiency, higher than usually reported in American literature, probably due to the difference among maize varieties used in the two countries.

Foram realizados 2 experimentos no Departamento de Zootecnia da ESALQ/USP com o objetivo de avaliar o desempenho de tourinhos terminados em confinamento. No experimento 1 foram comparados três métodos de processamento de milho, laminado (L), floculado (F) e moído fino (M), combinados com 3 níveis crescentes de uréia (0,5; 1,0 e 1,5% na MS da dieta). As dietas continham 8,5, 9,9 e 11,3% de PB respectivamente. Foram utilizados 180 tourinhos da raça Nelore com peso inicial de 343 kg, distribuídos em 36 baias, confinados por 101 dias. As dietas continham 12% de feno picado e 88% de concentrado (milho, melaço, uréia e núcleo mineral com ionóforo). A floculação do milho flint aumentou o GPD, resultando em 20,5% maior eficiência alimentar em comparação com o milho laminado. Comparada com a moagem fina, a floculação aumentou em 11,6% a eficiência alimentar dos animais. A moagem fina melhorou a eficiência alimentar dos animais em 7,9% em comparação com a laminação. Independente do método de processamento do milho a eficiência alimentar dos animais aumentou de forma linear com o aumento dos níveis de uréia na ração. Os parâmetros de carcaça avaliados não foram afetados pelos tratamentos. No experimento 2 foram comparadas a digestibilidade do amido em dietas com três processamentos de milho (laminado, floculado e moído fino) em dois grupos genéticos de animais: predominantemente Bos taurus (Canchim) e Bos indicus (Nelore). Foram utilizados 15 tourinhos da raça Nelore, com peso vivo inicial de 325 kg e 15 tourinhos da raça Canchim, com peso vivo inicial de 361 kg. Os animais foram alojados em baias individuais, por 27 dias. As dietas continham 20% de feno de tifton e 80% de concentrado constituído de milho, farelo de soja, melaço, uréia, calcário calcítico e núcleo mineral. A concentração de amido fecal para os animais que receberam rações com milho moído fino e milho floculado foram menores (12,8 e 29,6%, respectivamente) quando comparadas ao milho laminado. A digestibilidade do amido no trato total foi maior para animais Canchim que para Nelore. Esses resultados permitem concluir que nos dois experimentos conduzidos, a moagem fina e a floculação, em comparação com a laminação, resultaram em aumento na digestibilidade do amido e na eficiência alimentar dos animais maior do que o relatado na literatura americana, provavelmente em virtude da diferença no tipo de milho utilizado nos dois países. / Two experiments were conducted at the Department of Animal Science, ESALQ / USP in order to evaluate the performance of feedlot finished young Nellore bulls. In Experiment 1 three corn processing methods were compared, dry rolling (L), steam flaking (F) and fine grinding (M) combined with three increasing crude protein levels (8.5, 9.9 and 11.3%) via addition of urea (0.5, 1.0 and 1.5% in diet DM) in diets rich in concentrate. 180 young Nellore bulls with initial weight of 343 kg were allotted to 36 feedlot pens for 101 days. Experimental diets consisted of 12% chopped hay and 88% concentrate (corn, molasses, urea and mineral supplement with ionophore). Steam flaking of flint corn reduced DMI and increased ADG, resulting in a 20.5% higher feed efficiency compared with dry rolled corn. Compared to grinding, steam flaking increased feed efficiency by 11.6%. Fine grinding improved feed efficiency by 7.9% compared to dry rolling. Regardless of corn processing method feed efficiency increased linearly with increasing levels of dietary urea. Carcass parameters were not affected by treatments. In experiment 2 starch digestibility was evaluated among diets containing three corn processing methods (dry rolling, steam flaking and fine grinding) among animals of two different genetic groups: predominantly Bos taurus (Canchim) and Bos indicus (Nellore). A total of 15 young Nellore bulls, with initial weight of 325 kg and 15 young Canchim bulls, with initial weight of 361 kg were housed in individual pens. Experimental diets contained 20% Tifton hay and 80% concentrate consisting of corn, soybean meal, molasses, urea, limestone and mineral core. Fecal starch concentration for animals receiving diets with finely ground and flaked corn were lower (12.8 and 29.6%, respectively) compared with to dry rolled corn. There was no difference in the total starch digestibility (DTA) among the genetic groups. These results suggest that on both experiments the fine grinding and steam flaking, compared with dry rolling, resulted in increased starch digestibility and feed efficiency, higher than usually reported in American literature, probably due to the difference among maize varieties used in the two countries.

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-18Bitstream added on 2015-03-03T12:06:20Z : No. of bitstreams: 1 000810894.pdf: 860867 bytes, checksum: 36e288609bb5e15f82609175b82fe944 (MD5) / Recentes avanços tecnológicos em genética permitiram a genotipagem de espécies de interesse zootécnico, como os bovinos. Foram desenvolvidos painéis de genotipagem com diferentes densidades de marcadores do tipo polimorfismos de nucleotídeo único (“single nucleotide polymorphism” - SNP). Painéis de alta densidade permitiram maior cobertura do genoma e possibilitaram sua aplicação em diferentes tipos de estudos, como a identificação de regiões do genoma conservadas devido à seleção. Tais regiões são denominadas assinaturas de seleção (AS). As AS são detectáveis por diferentes metodologias, como a Homozigose do Haplótipo Estendido (“extended haplotype homozygosity” – EHH) e o Escore de Integração dos Haplótipos (“integrated haplotype score” - iHS), sendo esta última derivada da EHH. O objetivo desse trabalho foi identificar regiões de AS em bovinos de corte da raça Canchim, genotipados com painel de alta densidade, visando futuras aplicações no melhoramento genético animal. O pacote rehh do programa R foi utilizado para identificação de AS por meio da metodologia iHS. Foram utilizados registros de 285 animais da raça Canchim, 114 do grupo genético MA e um da raça Charolês. Todos os animais (amostras) foram genotipados com o painel Illumina BovineHD BeadChip (786.799 SNPs) e provenientes da base de dados da Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP. O controle de qualidade de genótipos (CQ) foi realizado por meio do pacote snpStats, do R. Após o CQ, restaram 687.655 marcadores SNP e 396 amostras. Foi utilizado o programa BEAGLE para a inferência das fases de ligação e construção dos haplótipos, etapa necessária para utilização da iHS. A estatística iHS para cada um dos marcadores foi transformada em para conveniência da análise dos resultados. Valores de foram observados nos cromossomos BTA (Bos taurus) 5 e 14, com 39 e nove SNPs estatisticamente significativos ... / Genomic selection has been considered as a technique that will allow significant increase in the genetic progress of animal breeding programs. Recent technological advances in genetics have allowed the genotyping of livestock species such as cattle, by means of single nucleotide polymorphism (SNP) chip panels. High-density SNP panels have allowed greater coverage of the genome and its application in different studies, such as the identification of conserved regions of the genome due to selection. Such regions are known as selection signatures (SS). The SS are detectable by various methods, such as the extended haplotype homozygosity (EHH); and the integrated haplotype score (iHS), which is derived from the HHE. The aim of this study was to identify regions of SS in Canchim beef cattle, genotyped with high-density SNP panel, and evaluate its future application in animal breeding. The rehh package of the R software was used for identification of SS through the iHS methodology. Data on 285 Canchim animals, 114 “MA” genetic group (cross between Charolais sires and Canchim-zebu dams), and one Charolais breed individual were used. The database used in this study was provided by Embrapa Cattle Southeast (São Carlos, SP, Brazil), which contains animals (samples) genotyped with the Illumina BovineHD BeadChip panel (786,799 SNPs). The quality control of genotypes (QC) was performed through snpStats package present in R. After the QC, a total of 687,655 SNP markers and 396 samples remained for SS analysis. The BEAGLE software was used to infer the linkage phase and to construct the haplotypes. The iHS statistic for each marker was transformed into piHS for better understanding of the results. On the Bos taurus (BTA) chromosomes 5 and 14 were observed piHS ? 5 (P <0.00001), with 39 and nine statistically significant SNPs, respectively. Windows of one million base pairs each were built to assist in the delimitation of SS regions. Within ...