Orientador: Fernando Sebastian Baldi Rey / Coorientador: William Koury Filha / Coorientador: Claudio de Ulhoa Magnabosco / Coorientador: Rafael Lara Tonussi / Banca: Danísio Prado Munari / banca: Carina Ubirajara Faria / Resumo: O objetivo do presente estudo foi reunir as características morfológicas de estrutura (ES), precocidade (PS) e musculosidade (MS) ao sobreano em características únicas indicadoras de biotipo animal, estimar seus parâmetros genéticos e para características de importância econômica como peso ajustado aos 450 dias de idade (P450), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea na costela (EG), espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8), ES, PS, MS, perímetro escrotal ajustado aos 365 (PE365) e 450 (PE450) dias de idade, idade ao primeiro parto (IPP), probabilidade de parto precoce (PPP) e stayability(STAY), a fim de verificar a possibilidade da utilização das características indicadoras biotipo em programas de melhoramento genético de bovinos de corte da raça Nelore. Os dados analisados foram fornecidos pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). O modelo utilizado para a estimativa de parâmetros genéticos incluiu o efeito aleatório genético aditivo direto e o efeito fixo de grupo de contemporâneos. Para as análises foi utilizada a metodologia ssGBLUP. Métodos multivariados foram empregados para análises de componentes principais pelo procedimento PROC PRINCOMP do software SAS. Foram utilizados dados de ES, PS, MS e P450. O primeiro e o segundo componentes da análise explicaram 82,08% da variabilidade dos dados de e foram utilizados como autovalores para obtenção dos índices de biotipo animal PCA1 e PCA2. A característica SAM foi formada pel... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this study was to gather the morphological characteristics after yearling of body structure (BS), finishing precocity (FP) and muscling (MS) in unique traits indicative of animal biotype and estimate its genetic parameters and for the characteristics of economic importance of body weight at 450 days of age (W450), ribeye area (REA), backfat thickness (BF), rump fat thickness (RF), BS, FP, MS, scrotal circumference at 365 (SC365) and 450 (SC450) days of age, age at first calving (AFC), heifer pregnancy (HP) and stayability (STAY) in order to verify the possibility of using the animal biotype indicator characteristics in breeding programs for Nelore beef cattle. The data analyzed were provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). The model used for the estimation of genetic parameters included the additive genetic direct random effect and the fixed group effect of contemporaries. For the analyzes, the ssGBLUP methodology was used. Multivariate methods were used for principal component analyzes by the PROC PROCOMP procedure of the SAS software. Data from BS, FP, MS and W450 were used. The first and second components of the analysis explained 82.08% of the variability of the data and were used as eigenvalues to obtain the indices of animal biotype PCA1 and PCA2. The SAM characteristic was formed by the combination of BS, FP and MS scores, penalizing or subsidizing late or early animals, respectively. The animal biotype indexes presented high ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Mônica Correa Ledur / Coorientador: Jane de Oliveira Peixoto / Banca: Nedenia Bonvino Stafuzza / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Adriana Mercia Guaratini Ibelli / Banca: Claudia Cristina Paro de Paz / Resumo: Em programas de melhoramento de frangos de corte, as aves são selecionadas principalmente para características de desempenho e carcaça, acarretando em mudanças no tamanho, forma e função dos órgãos, o que implica em alterações fisiológicas importantes durante o desenvolvimento das aves. A seleção intensa dos frangos de corte resultou em problemas locomotores, diminuição da resistência óssea dos animais e aumento da mortalidade. Com isso, técnicas de biologia molecular podem ser utilizadas na seleção assistida por marcadores com o intuito de identificar genes candidatos para auxiliar no processo de seleção de características relacionadas às desordens ósseas. Os objetivos do presente trabalho foram estimar os parâmetros genéticos para características relacionadas à integridade óssea do fêmur e peso aos 42 dias de idade e estudar as associações dos genes RUNX2 ("Runt-related transcription factor 2") e TNFSF11 ("Tumor necrosis fator (ligand) superfamily, member 11") com características de importância econômica em frangos de corte no intuito de fornecer suporte para o programa de melhoramento genético de aves e direcionar o processo de seleção visando a redução dos problemas relacionadas às desordens ósseas. Estimativas de parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais foram obtidas para características associadas à integridade óssea do fêmur e peso aos 42 dias de idade (P42) pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando modelo animal multicaracterística, com efeito fixo de grupo (sexo e incubação) e os efeitos aleatórios genéticos aditivos e residuais. Análises de associações genéticas entre o SNP g.57.397A>G (RUNX2) e SNP g.14.614A>G (TNFSF11) com características de desempenho, composição de carcaça, órgãos e integridade óssea do fêmur foram realizadas com o propósito de avaliar os efeitos desses polimorfismos sobre esse grupo de características, por... / Abstract: In the broiler breeding programs, the broilers are selected primarily for performance and carcass traits, resulting in changes in the size, shape and function of organs which implies important physiological changes during the development of the broilers. Intense selection of broilers resulted in locomotors problems, decreased bone strength of animals and increased mortality. Thus, molecular screening techniques began to be used in order to identify candidate genes to assist in the selection of related traits to bone disorders. The objective of this study was estimate genetic parameters for traits related to femoral integrity bone and weight at 42 days and association study of RUNX2 ("Runt-related transcription factor 2") and TNFSF11 ("Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 11") genes with economical traits in broilers in order to provide support for the broiler breeding program and direct the selection process to reduce problems related to bone disorders. Estimates of genetic parameters were obtained for traits associated with the femur bone integrity and weight at 42 days of age by the restricted maximum likelihood method using multi-trait animal model with the fixed group effect (sex and incubation), and the random effects and additives residuals. The investigation of polymorphisms in association RUNX2 genes and TNFSF11 and the association study of polymorphisms found and their respective SNPs (Nucleotide single polymorphism) of RUNX2 genes (SNP g.57.397A>G) and TNFSF11 (SNP g.14.614A> g) with the performance, carcass composition, parts and femoral bone integrity in order to evaluate the effects of these polymorphisms about this group of traits to maximum likelihood method. We used the TT reference population database with about 1,500 broilers belonging to Embrapa Swine and Poultry Breeding Program in Concordia/SC, Brazil. Heritability coefficients estimated for weight at 42 days of age (W42) and the related traits to ... / Doutor

Orientador: Ricardo da Fonseca / Banca: Leonardo de Oliveira Seno / Banca: Francisco Ribeiro de Araújo Neto / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: As características ligadas à eficiência reprodutiva são as que apresentam maior valor econômico na maioria dos sistemas de criação de carne ovina, pois estão intimamente ligadas à disponibilidade do produto final. Estimativas confiáveis de parâmetros genéticos são essenciais para a definição de índices de seleção e para determinar a resposta correlacionada sobre as demais características presentes no índice de seleção. Assim, esse trabalho teve por objetivo estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características reprodutivas em ovinos da raça Santa Inês. Foram utilizados dados de 4.742 ovelhas pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da raça Santa Inês da Associação Sergipana de Criadores de Caprinos e Ovinos em parceria com a Universidade de São Paulo. Para o estudo foram consideradas as características: Idade ao primeiro parto (IPP), Intervalo de partos (IDP), Número de cordeiros nascidos por ovelha parida (NCN), Número de cordeiros desmamados por ovelha parida (NCD) e Habilidade de criação por ovelha parida (HC) definido como a razão entre NCN e NCD. Os componentes de (co)variância foram estimados por meio de análises bivariadas, sob modelo animal linear para IPP e IDP e limiar (threshold) para as demais características, utilizando o método da amostragem de Gibbs do programa THRGIBBS1F90. O número de iterações, tamanho do descarte e intervalo de descarte considerados foram 1.500.000, 500.000 e 250, respectivamente. As herdabilidades estimadas à posteriori foram de 0,239 ± 0,053 para IPP, 0,056 ± 0,022 para IDP, 0,098 ± 0,047 para NCN, 0,016 ± 0,01 para NCD e 0,019 ± 0,011 para HC. As correlações genéticas estimadas à posteriori entre as características variaram -0,62 entre NCN e HC a 0,82 entre NCD e HC. As correlações fenotípicas à posteriori entre IPP e IDP e cada uma com as demais características foram de baixa magnitude, próximas a... / Abstract: Reproductive efficiency traits are of significant economic importance as they relate to the source income of sheep meat enterprise. Reliable genetic parameters are essential for selection index design and to determine the correlated response to selection that will occur in other traits in a selection index. Thus, the aim of this study was to estimate (co)variance components and parameter genetics for reproductive traits in Santa Inês sheep. Data included records of 4,742 Santa Inês sheep from Santa Inês Breeding Program of Sergipe State Sheep and Goats Breeders Association and University of São Paulo. In the first part, studied traits were age at first lambing (AFL), Lambing Interval (LI), Litter size at birth per ewe lambing(LSB), Litter size at weaning per ewe lambing and Ewe rearing ability per ewe lambing (RA) defined as lambs weaned per lamb born. The (co)variance components were estimated by bivariate analysis using Gibbs sampling methodology with THRGIBBS1F90 software and number of iterations, length of burn-in and sampling interval were 1,500,000, 500,000 and 250, respectively. For AFL and LI, a linear model was applied and for LSB, LSW and RA, a threshold model. Posterior means of heritability were 0.239 ± 0.053 for AFL, 0.056 ± 0.022 for LI, 0.098 ± 0.047 for LSB, 0.016 ± 0.01 for LSW and 0.019 ± 0.011 for RA. Posterior means of genetic correlation among reproductive traits ranged from -0.62 between LSB and RA to 0,82 between LSW and RA. Posterior means of phenotypic correlation between AFL and LI and each one among the others were low, close to zero. The phenotypic correlation were positive and medium between LSB and LSW (0.44 ± 0.02), medium and negative between LSB and RA (0.37 ± 0.02) and were high and positive between LSW and RA (0.98 ± 0.00). Reasonable genetic progress can be obtained in sexual precocity using age at first lambing as selection criteria. Large influences of environmental effects on LI, LSB ... / Doutor

Orientador: Henrique Nunes de [UNESP] Oliveira / Coorientador: Rodrigo Giglioti / Coorientador: Fernando Flores Cardoso / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Ricardo da Fonseca / Banca: Guilherme Jordão de Magalhães Rosa / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Resumo: Babesiose bovina é uma doença transmitida pelo carrapato, sendo que a Babesia bovis é considerada a espécie mais patogênica. Ambos são considerados como um entrave na melhoria da produtividade da bovinocultura de corte nos trópicos, especialmente para animais de raças taurinas e suas cruzas. Esse estudo analisou uma população de bovinos Hereford e Braford e foi composto por quatro capítulos com os seguintes objetivos: Capítulo 1) Revisão de literatura; Capítulo 2) Estimação de parâmetros genéticos para contagem de carrapatos (TC) e B. bovis usando modelos lineares e modelos lineares generalizados; Capítulo 3) Avaliar a habilidade de predição e a possibilidade de aplicação da seleção genômica e conduzir estudos de associação genômica ampla (GWAS) para nível de infecção de B. bovis (IB); Capítulo 4) Procurar por estruturas causais entre TC, IB, ganho de peso do nascimento a desmama (WG) e ganho de peso da desmama ao sobreano (YG) usando a abordagem do modelo de equação estrutural (SEM). Os carrapatos foram contados manualmente em um lado do animal. A quantificação de B. bovis foi feita por meio de ensaios de qPCR. No Capítulo 2, os dados de contagem de carrapato e B. bovis estavam em escala logaritímica para as análises usando modelos lineares. O modelo de Poisson foi aplicado para contagem de carrapato sem tranformação logarítimica e para os modelos probit o fenótipo foi considerado como ausência (0) ou presença (1) de B. bovis baseado em três diferentes limiares (BBt1: IB usa... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bovine babesiosis is a tick-borne disease, and the Babesia bovis is considered the most pathogenic species. Both parasites constitute major drawbacks for improvement of beef cattle productivity in the tropics, especially when purebred and crossbred taurine animals are used. This study analyzed a population of Hereford and Braford cattle and it was composed of four chapters with the following objectives: Chapter 1) Literature review; Chapter 2) Estimate genetic parameters for tick count (TC) and B. bovis using linear and generalized linear models; Chapter 3) Evaluate predictive ability and application of genomic selection and performed genome wide association studies (GWAS) for B. bovis infection level (IB) using single step GBLUP model; Chapter 4) Search for causal structures to investigate potential functional relationships among TC, IB, weight gain from birth to weaning (WG), and weight gain from weaning to yearling (YG) using structural equation modeling (SEM). Tick counts were performed by manually counting adult female ticks on one side of each animal. The B. bovis quantification was performed using a qPCR assay. In the Chapter 2, the tick count and B. bovis records were in log scale for analysis using linear model. A Poisson model was applied for tick count without log transformation and for probit model the phenotype was assessed by absence or presence of B. bovis based on three different thresholds (BBt1: IB using the threshold observed; BBt2: BB using threshold as a ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:22Z : No. of bitstreams: 1 000858101.pdf: 926291 bytes, checksum: 660d4582b79e99e824b748dfc9ba03c3 (MD5) / As características ligadas à eficiência reprodutiva são as que apresentam maior valor econômico na maioria dos sistemas de criação de carne ovina, pois estão intimamente ligadas à disponibilidade do produto final. Estimativas confiáveis de parâmetros genéticos são essenciais para a definição de índices de seleção e para determinar a resposta correlacionada sobre as demais características presentes no índice de seleção. Assim, esse trabalho teve por objetivo estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características reprodutivas em ovinos da raça Santa Inês. Foram utilizados dados de 4.742 ovelhas pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da raça Santa Inês da Associação Sergipana de Criadores de Caprinos e Ovinos em parceria com a Universidade de São Paulo. Para o estudo foram consideradas as características: Idade ao primeiro parto (IPP), Intervalo de partos (IDP), Número de cordeiros nascidos por ovelha parida (NCN), Número de cordeiros desmamados por ovelha parida (NCD) e Habilidade de criação por ovelha parida (HC) definido como a razão entre NCN e NCD. Os componentes de (co)variância foram estimados por meio de análises bivariadas, sob modelo animal linear para IPP e IDP e limiar (threshold) para as demais características, utilizando o método da amostragem de Gibbs do programa THRGIBBS1F90. O número de iterações, tamanho do descarte e intervalo de descarte considerados foram 1.500.000, 500.000 e 250, respectivamente. As herdabilidades estimadas à posteriori foram de 0,239 ± 0,053 para IPP, 0,056 ± 0,022 para IDP, 0,098 ± 0,047 para NCN, 0,016 ± 0,01 para NCD e 0,019 ± 0,011 para HC. As correlações genéticas estimadas à posteriori entre as características variaram -0,62 entre NCN e HC a 0,82 entre NCD e HC. As correlações fenotípicas à posteriori entre IPP e IDP e cada uma com as demais características foram de baixa magnitude, próximas a... / Reproductive efficiency traits are of significant economic importance as they relate to the source income of sheep meat enterprise. Reliable genetic parameters are essential for selection index design and to determine the correlated response to selection that will occur in other traits in a selection index. Thus, the aim of this study was to estimate (co)variance components and parameter genetics for reproductive traits in Santa Inês sheep. Data included records of 4,742 Santa Inês sheep from Santa Inês Breeding Program of Sergipe State Sheep and Goats Breeders Association and University of São Paulo. In the first part, studied traits were age at first lambing (AFL), Lambing Interval (LI), Litter size at birth per ewe lambing(LSB), Litter size at weaning per ewe lambing and Ewe rearing ability per ewe lambing (RA) defined as lambs weaned per lamb born. The (co)variance components were estimated by bivariate analysis using Gibbs sampling methodology with THRGIBBS1F90 software and number of iterations, length of burn-in and sampling interval were 1,500,000, 500,000 and 250, respectively. For AFL and LI, a linear model was applied and for LSB, LSW and RA, a threshold model. Posterior means of heritability were 0.239 ± 0.053 for AFL, 0.056 ± 0.022 for LI, 0.098 ± 0.047 for LSB, 0.016 ± 0.01 for LSW and 0.019 ± 0.011 for RA. Posterior means of genetic correlation among reproductive traits ranged from -0.62 between LSB and RA to 0,82 between LSW and RA. Posterior means of phenotypic correlation between AFL and LI and each one among the others were low, close to zero. The phenotypic correlation were positive and medium between LSB and LSW (0.44 ± 0.02), medium and negative between LSB and RA (0.37 ± 0.02) and were high and positive between LSW and RA (0.98 ± 0.00). Reasonable genetic progress can be obtained in sexual precocity using age at first lambing as selection criteria. Large influences of environmental effects on LI, LSB ...

Made available in DSpace on 2016-04-01T17:54:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:40Z : No. of bitstreams: 1 000859648.pdf: 1295303 bytes, checksum: 59b3dfa419ed51a31897edb8da93dbc3 (MD5) / A estimativa da evapotranspiração de referência é de suma importância para o manejo da irrigação. A FAO (Food and Agriculture Organization of the United Nations) recomenda a utilização do método de Penman-Monteith, para estimar a evapotranspiração de referência (ETo). Esse método apresenta um nível de exigência de dados de entrada que dificulta sua aplicação, uma vez que tais elementos meteorológicos nem sempre encontram-se disponíveis em algumas regiões. Com este trabalho o objetivo foi verificar a eficiência de métodos que utilizam apenas a medição da temperatura do ar para a estimativa da evapotranspiração de referência comparando com o método de Penman-Monteith, nas condições climáticas do município de Jaboticabal - SP. Foram utilizados dados médios diários dos anos de 2009 a 2014 de radiação solar global, velocidade do vento, temperatura do ar e umidade relativa do ar obtido em uma estação meteorológica automática. Os métodos avaliados para estimativa da ETo foram Hargreaves, Hargreaves-Samani, Jensen-Haise, Makkink, Camargo e Penman-Monteith. A análise dos resultados foi realizada aplicando técnicas que verificam a integridade dos dados meteorológicos para estimativa da ETo e utilizando metodologias de análise dos dados médios e desvios padrões da ETo. A integridade dos dados meteorológicos foi aceitável conforme os critérios adotados. O resultado de avaliação dos métodos, utilizando a metodologia de análise de desvios padrões diários da ETo, indica que uma relação linear foi determinada, portanto, podem ser comparados. A conclusão de avaliação dos métodos, utilizando a metodologia de análise dos dados médios da ETo, mostra que o método Hargreaves-Samani apresentou o melhor ajuste para a estimativa da ETo / The estimation of reference evapotranspiration is extremely important for the irrigation management. The FAO (Food and Agriculture Organization of the United Nations) recommends using the Penman-Monteith method to estimate the reference evapotranspiration (ETo). This method presents an input data demand level that hinders its application, since these meteorological variables are not always available in some regions. With this work, the objective was to verify the efficiency of methods using only the air temperature measurement to estimate the reference evapotranspiration compared with the Penman-Monteith method, in the climatic conditions of Jaboticabal - SP. Average daily data were used between the years 2009 and 2014 of the global solar radiation, wind speed, air temperature and relative humidity obtained in an automatic weather station. The methods evaluated to estimate ETo were Hargreaves, Hargreaves-Samani, Jensen-Haise, Makkink, Camargo and Penman-Monteith. The results analysis was performed by applying techniques that verify the integrity of meteorological data to estimate ETo and using analysis methodologies of average data and standard deviations of ETo. The integrity of the meteorological data was acceptable according to the adopted criteria. The result of the evaluation methods, using the analysis methodology of daily standard deviations ETo indicates that a linear relationship was established, therefore they can be compared. The conclusion of assessment methods, using the analysis methodology of average data of ETo, demonstrates that the Hargreaves-Samani method showed the best fit to estimate ETo

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-12-05Bitstream added on 2014-06-13T19:02:04Z : No. of bitstreams: 1 assuncao_hf_dr_botfca.pdf: 2405298 bytes, checksum: 8e84fd2e177909f6f5d16a6bb2bacec6 (MD5) / Neste trabalho é proposto um modelo paramétrico para calcular a irradiância solar ultravioleta global e suas componentes. As transmitâncias referentes à absorção do ozônio, aos espalhamentos de Rayleigh e das nuvens e, à extinção dos aerossóis foram parametrizadas após a integração numérica das fórmulas espectrais, entre 290 a 400 nm. As componentes difusas foram desenvolvidas com base nos trabalhos de Brine e Iqbal (1983), Justus e Paris (1985), Bird e Riordan (1986) e Gueymard (1995). A equação de Van Heuklon (1979) foi incorporada ao modelo, como parâmetro de entrada, para calcular o conteúdo de ozônio e conseqüentemente a transmitância do ozônio à radiação solar direta. Também, foram incorporadas ao sistema a técnica de Pinazo et al. (1995) que permite o cálculo aproximado do índice de turbidez de Ångström, e a técnica de Assunção e Escobedo (2003) que calcula a transmitância média das nuvens, a partir das irradiância global e difusa. O modelo foi estruturado em VBA (Visual Basic for Application) e executado na planilha eletrônica Microsoft® Excel, requerendo, para isso, as variáveis de espaço (latitude, longitude e altitude), as variáveis de tempo (data e hora), e as variáveis meteorológicas (índice de claridade, fração direta, conteúdo de ozônio, umidade relativa e albedo da superfície) adquiridas no local em estudo. As irradiâncias ultravioletas previstas pelo modelo, após a calibração, foram comparadas com os correspondentes valores médios registrados, a cada 5 minutos, na Estação Radiométrica de Botucatu, SP (22° 51' S; 48° 26' W; 876 m), durante o período de janeiro de 2000 a julho de 2003. Os indicadores estatísticos de performance apontaram o modelo paramétrico como uma ferramenta adequada para calcular a irradiância solar ultravioleta. Foram feitas simulações com o modelo paramétrico, levando-se em... . / A parametric model is proposed to calculate ultraviolet solar irradiance components. The transmittances corresponding to ozone absorption, Rayleigh scattering, clouds diffusion and, aerosol extinction have been parameterized after the numeric integration of spectral formulae, from 290 to 400 nm. The diffuse components were developed with base in the works of Brine and Iqbal (1983), Justus and Paris (1985), Bird and Riordan (1986) and Gueymard (1995). Van Heuklon's equation has been joined to the model, as entrance parameter, to calculate ozone content and consequently its transmittance to the direct solar radiation. Also, Pinazo's technique that calculates Ångström's turbidity, and the algorithm of Assunção and Escobedo (2003) that calculates clouds transmittance, based on global and diffuse irradiances, were incorporated to the system. The parametric model was structured in VBA (Visual Basic for Application) to be run on Microsoft® Excel. This model requires as entrance parameters, the space (latitude, longitude and altitude), time (date and hour) and meteorological variables (clearness index, direct fraction, ozone content, relative air humidity and surface albedo) obtained on study place. The calibrated ultraviolet irradiances were compared with mean data of five minutes carried out on the Radiometric Station of Botucatu, SP (22° 51' S; 48° 26' W; 876 m), from January of 2000 to July of 2003. The statistical performance indicators pointed parametric model as tool appropriate to calculate the ultraviolet solar irradiance. Simulations were made with parametric model, taking into account the atmospheric conditions more frequent in Botucatu. Simulation results allowed to explain the effects produced on diffuse, direct and global ultraviolet irradiances by changes on the zenithal angle, on the ozone content, on the Ångström's turbidity and on the cloud optical thickness... (Complete abstract, click electronic address below).

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-26. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:59Z : No. of bitstreams: 1 000834610.pdf: 293273 bytes, checksum: f51e9e2ae4c1980ea4f071c64c0122ff (MD5) / Em programas de melhoramento de frangos de corte, as aves são selecionadas principalmente para características de desempenho e carcaça, acarretando em mudanças no tamanho, forma e função dos órgãos, o que implica em alterações fisiológicas importantes durante o desenvolvimento das aves. A seleção intensa dos frangos de corte resultou em problemas locomotores, diminuição da resistência óssea dos animais e aumento da mortalidade. Com isso, técnicas de biologia molecular podem ser utilizadas na seleção assistida por marcadores com o intuito de identificar genes candidatos para auxiliar no processo de seleção de características relacionadas às desordens ósseas. Os objetivos do presente trabalho foram estimar os parâmetros genéticos para características relacionadas à integridade óssea do fêmur e peso aos 42 dias de idade e estudar as associações dos genes RUNX2 (Runt-related transcription factor 2) e TNFSF11 (Tumor necrosis fator (ligand) superfamily, member 11) com características de importância econômica em frangos de corte no intuito de fornecer suporte para o programa de melhoramento genético de aves e direcionar o processo de seleção visando a redução dos problemas relacionadas às desordens ósseas. Estimativas de parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais foram obtidas para características associadas à integridade óssea do fêmur e peso aos 42 dias de idade (P42) pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando modelo animal multicaracterística, com efeito fixo de grupo (sexo e incubação) e os efeitos aleatórios genéticos aditivos e residuais. Análises de associações genéticas entre o SNP g.57.397A>G (RUNX2) e SNP g.14.614A>G (TNFSF11) com características de desempenho, composição de carcaça, órgãos e integridade óssea do fêmur foram realizadas com o propósito de avaliar os efeitos desses polimorfismos sobre esse grupo de características, por ... / In the broiler breeding programs, the broilers are selected primarily for performance and carcass traits, resulting in changes in the size, shape and function of organs which implies important physiological changes during the development of the broilers. Intense selection of broilers resulted in locomotors problems, decreased bone strength of animals and increased mortality. Thus, molecular screening techniques began to be used in order to identify candidate genes to assist in the selection of related traits to bone disorders. The objective of this study was estimate genetic parameters for traits related to femoral integrity bone and weight at 42 days and association study of RUNX2 (Runt-related transcription factor 2) and TNFSF11 (Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 11) genes with economical traits in broilers in order to provide support for the broiler breeding program and direct the selection process to reduce problems related to bone disorders. Estimates of genetic parameters were obtained for traits associated with the femur bone integrity and weight at 42 days of age by the restricted maximum likelihood method using multi-trait animal model with the fixed group effect (sex and incubation), and the random effects and additives residuals. The investigation of polymorphisms in association RUNX2 genes and TNFSF11 and the association study of polymorphisms found and their respective SNPs (Nucleotide single polymorphism) of RUNX2 genes (SNP g.57.397A>G) and TNFSF11 (SNP g.14.614A> g) with the performance, carcass composition, parts and femoral bone integrity in order to evaluate the effects of these polymorphisms about this group of traits to maximum likelihood method. We used the TT reference population database with about 1,500 broilers belonging to Embrapa Swine and Poultry Breeding Program in Concordia/SC, Brazil. Heritability coefficients estimated for weight at 42 days of age (W42) and the related traits to ...

Orientador: Fernando Luiz Pio dos Santos / Resumo: Neste trabalho, apresentamos uma estratégia para estimação de parâmetros de um modelo matemático não-linear de equações diferenciais ordinárias, que descreve a dinâmica populacional de mosquitos da Dengue, para o qual há dados disponíveis para as fases aquática e alada. Para estimar um conjunto de parâmetros biológicos desconhecidos, uma função custo envolvendo tais parâmetros é minimizada por meio do método Levenberg −Marquardt (LM). O principal interesse foi ajustar o modelo aos dados levando em conta os parâmetros estimados. Os resultados das simulações numéricas mostram a eficácia da técnica de estimação de parâmetros acoplada ao LM. A comparação entre a solução numérica e os dados comprova a eficiência do código no ajuste dos dados, consonante com estimativas apresentadas na literatura. / Mestre

Orientador: João Francisco Escobedo / Resumo: Neste trabalho é proposto um modelo paramétrico para calcular a irradiância solar ultravioleta global e suas componentes. As transmitâncias referentes à absorção do ozônio, aos espalhamentos de Rayleigh e das nuvens e, à extinção dos aerossóis foram parametrizadas após a integração numérica das fórmulas espectrais, entre 290 a 400 nm. As componentes difusas foram desenvolvidas com base nos trabalhos de Brine e Iqbal (1983), Justus e Paris (1985), Bird e Riordan (1986) e Gueymard (1995). A equação de Van Heuklon (1979) foi incorporada ao modelo, como parâmetro de entrada, para calcular o conteúdo de ozônio e conseqüentemente a transmitância do ozônio à radiação solar direta. Também, foram incorporadas ao sistema a técnica de Pinazo et al. (1995) que permite o cálculo aproximado do índice de turbidez de Ångström, e a técnica de Assunção e Escobedo (2003) que calcula a transmitância média das nuvens, a partir das irradiância global e difusa. O modelo foi estruturado em VBA (Visual Basic for Application) e executado na planilha eletrônica Microsoft® Excel, requerendo, para isso, as variáveis de espaço (latitude, longitude e altitude), as variáveis de tempo (data e hora), e as variáveis meteorológicas (índice de claridade, fração direta, conteúdo de ozônio, umidade relativa e albedo da superfície) adquiridas no local em estudo. As irradiâncias ultravioletas previstas pelo modelo, após a calibração, foram comparadas com os correspondentes valores médios registrados, a cada 5 minutos, na Estação Radiométrica de Botucatu, SP (22° 51' S; 48° 26' W; 876 m), durante o período de janeiro de 2000 a julho de 2003. Os indicadores estatísticos de performance apontaram o modelo paramétrico como uma ferramenta adequada para calcular a irradiância solar ultravioleta. Foram feitas simulações com o modelo paramétrico, levando-se em... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: A parametric model is proposed to calculate ultraviolet solar irradiance components. The transmittances corresponding to ozone absorption, Rayleigh scattering, clouds diffusion and, aerosol extinction have been parameterized after the numeric integration of spectral formulae, from 290 to 400 nm. The diffuse components were developed with base in the works of Brine and Iqbal (1983), Justus and Paris (1985), Bird and Riordan (1986) and Gueymard (1995). Van Heuklon's equation has been joined to the model, as entrance parameter, to calculate ozone content and consequently its transmittance to the direct solar radiation. Also, Pinazo's technique that calculates Ångström's turbidity, and the algorithm of Assunção and Escobedo (2003) that calculates clouds transmittance, based on global and diffuse irradiances, were incorporated to the system. The parametric model was structured in VBA (Visual Basic for Application) to be run on Microsoft® Excel. This model requires as entrance parameters, the space (latitude, longitude and altitude), time (date and hour) and meteorological variables (clearness index, direct fraction, ozone content, relative air humidity and surface albedo) obtained on study place. The calibrated ultraviolet irradiances were compared with mean data of five minutes carried out on the Radiometric Station of Botucatu, SP (22° 51' S; 48° 26' W; 876 m), from January of 2000 to July of 2003. The statistical performance indicators pointed parametric model as tool appropriate to calculate the ultraviolet solar irradiance. Simulations were made with parametric model, taking into account the atmospheric conditions more frequent in Botucatu. Simulation results allowed to explain the effects produced on diffuse, direct and global ultraviolet irradiances by changes on the zenithal angle, on the ozone content, on the Ångström's turbidity and on the cloud optical thickness... (Complete abstract, click electronic address below). / Doutor