Vertebrados exóticos são introduzidos intencionalmente como recurso, como uma alternativa para fins econômicos ou de lazer. Aqueles que se tornam capazes de expandir espontaneamente as novas populações em áreas naturais são conhecidas como invasores e frequentemente estão implicados em efeitos indesejados em populações, comunidades e ecossistemas autóctones. Uma destas espécies é o cervo axis Axis axis, introduzido mundialmente para a caça. Apesar da sua ampla distribuição e utilização, pouco se sabe sobre seus efeitos nas áreas invadidas e em quais regiões esta espécie pode se tornar invasora. Isto dificulta as tomadas de decisão, pois avaliar os efeitos da introdução e prever as áreas em risco de invasão são tarefas fundamentais para estratégias de prevenção, priorização e ações de controle. Assim, esse trabalho teve como objetivos revisar os efeitos do cervo axis em áreas invadidas, utilizando um protocolo de revisão sistemática, e modelar a possível distribuição mundial e regional desta espécie, utilizando variáveis bioclimáticas. Realizamos buscas por estudos sobre efeitos em áreas alóctones em três bancos de dados, utilizando três conjuntos de palavras chaves. Classificamos os estudos que atenderam aos critérios do protocolo segundo o nível de inferência sobre os efeitos em Efeito Demonstrado e Efeito Sugerido. Extraímos os tipos de efeitos relatados e a região de ocorrência. Para a modelagem de distribuição, utilizamos o algoritmo Maxent e variáveis preditoras bioclimáticas. Os pontos de ocorrência utilizados incluem sua distribuição original e três regiões onde a espécie é invasora e das quais foi possível obter ou estimar coordenadas. A revisão sistemática resultou em apenas quatro trabalhos classificados em Efeito Demonstrado, os quais apontam a competição com espécies nativas, alteração da composição florística e faunística e facilitação da entrada de outras espécies invasoras. Os efeitos sugeridos incluem seis trabalhos mostrando a ocorrência de parasitas, um caso de hibridização com outra espécie de cervídeo em cativeiro e um estudo mostrando a degradação das áreas de florestas causada pelo cervo axis em conjunto com outras espécies invasoras. O modelo de distribuição demonstra que amplas extensões da América do Sul, África Central e Sudeste Asiático são suscetíveis à invasão, portanto, nestas áreas deve-se evitar a introdução e controlar a expansão. O sul do Brasil, Uruguai, norte da Argentina e Paraguai são possíveis áreas de ocorrência segundo os modelos bioclimáticos. / Alien vertebrates are intentionally introduced for leisure and economic purposes. Those who become able to expand their populations in the new areas are known as invasive and are often involved in undesirable effects in indigenous populations, communities and ecosystems. The axis deer was introduced worldwide for hunting. Despite its wide distribution and use, little is known about its effects on the invaded areas and regions in which this species can become invasive. This complicates the decision-making because assessing the effects of the introduction and predict areas at risk of invasion are key tasks for prevention strategies, prioritization and control actions. Like this. So, this study aimed to summarize the effects of the axis deer in invaded areas using a systematic review protocol and to model the potential distribution of this species globally and in South America using bioclimatic variables. To summarized the effects we conducted searches for studies on non-native areas in three databases, using three sets of key-words and classified the studies that met the criteria of the protocol according to the level of inference about the effects they investigated. We extracted the types mentioned effects and occurrence region. To model the potential distribution based on bioclimatic variables we used the program Maxent. We used occurrences from the original distribution and three regions where the species is invasive about which geographical coordinates could be obtained or estimated. Four studies demonstrated effects of the axis deer due to competition with native species, changes in the floristic and faunistic composition and facilitation of other invasion processes. Six studies speculated the occurrence of disease transmition, hybridization with other species and difuse degradation of forest areas in combination with other invasive species. The distribution model demonstrated that large extensions of South America, Central Africa and Southeast Asia are susceptible to invasion. In the southern cone of South America Brazil, Uruguay, northern Argentina and Paraguay include extensive areas prone to invasion based on the bioclamatic models.

The Aedes aegypti mosquito is the vector for four infectious diseases of global concern – Yellow Fever, Dengue, Chikungunya, and Zikavirus. Previous attempts to model the expansion of the vector habitat due to global climate change have rarely included characteristics related to the human populations on which this mosquito is dependent. The purpose of this research was to determine whether the inclusion of human population density improves model performance while creating risk maps that can be used to determine where humans are most likely to be exposed to the vector in the future. The resulting model demonstrated that the inclusion of human population density improves the predictive power for A. aegypti and should be considered during model development. Maps produced by the model were also suitable for identifying regions where human populations are most likely to experience increased risk. Finally, two areas at risk of expansion were highlighted as a case study in pairing risk mapping with evidence-based intervention strategies to identify sites that would benefit from mosquito-control efforts. In this case, a low-cost program of insecticide-treated covers for water storage containers would likely work well in both Minas Gerais, Brazil and Northwestern Province, Zambia to mitigate mosquito risk. This research demonstrates that human population characteristic not only improve model fit but also increase the extent to which risk maps are actionable by aiding in targeting interventions.

Vertebrados exóticos são introduzidos intencionalmente como recurso, como uma alternativa para fins econômicos ou de lazer. Aqueles que se tornam capazes de expandir espontaneamente as novas populações em áreas naturais são conhecidas como invasores e frequentemente estão implicados em efeitos indesejados em populações, comunidades e ecossistemas autóctones. Uma destas espécies é o cervo axis Axis axis, introduzido mundialmente para a caça. Apesar da sua ampla distribuição e utilização, pouco se sabe sobre seus efeitos nas áreas invadidas e em quais regiões esta espécie pode se tornar invasora. Isto dificulta as tomadas de decisão, pois avaliar os efeitos da introdução e prever as áreas em risco de invasão são tarefas fundamentais para estratégias de prevenção, priorização e ações de controle. Assim, esse trabalho teve como objetivos revisar os efeitos do cervo axis em áreas invadidas, utilizando um protocolo de revisão sistemática, e modelar a possível distribuição mundial e regional desta espécie, utilizando variáveis bioclimáticas. Realizamos buscas por estudos sobre efeitos em áreas alóctones em três bancos de dados, utilizando três conjuntos de palavras chaves. Classificamos os estudos que atenderam aos critérios do protocolo segundo o nível de inferência sobre os efeitos em Efeito Demonstrado e Efeito Sugerido. Extraímos os tipos de efeitos relatados e a região de ocorrência. Para a modelagem de distribuição, utilizamos o algoritmo Maxent e variáveis preditoras bioclimáticas. Os pontos de ocorrência utilizados incluem sua distribuição original e três regiões onde a espécie é invasora e das quais foi possível obter ou estimar coordenadas. A revisão sistemática resultou em apenas quatro trabalhos classificados em Efeito Demonstrado, os quais apontam a competição com espécies nativas, alteração da composição florística e faunística e facilitação da entrada de outras espécies invasoras. Os efeitos sugeridos incluem seis trabalhos mostrando a ocorrência de parasitas, um caso de hibridização com outra espécie de cervídeo em cativeiro e um estudo mostrando a degradação das áreas de florestas causada pelo cervo axis em conjunto com outras espécies invasoras. O modelo de distribuição demonstra que amplas extensões da América do Sul, África Central e Sudeste Asiático são suscetíveis à invasão, portanto, nestas áreas deve-se evitar a introdução e controlar a expansão. O sul do Brasil, Uruguai, norte da Argentina e Paraguai são possíveis áreas de ocorrência segundo os modelos bioclimáticos. / Alien vertebrates are intentionally introduced for leisure and economic purposes. Those who become able to expand their populations in the new areas are known as invasive and are often involved in undesirable effects in indigenous populations, communities and ecosystems. The axis deer was introduced worldwide for hunting. Despite its wide distribution and use, little is known about its effects on the invaded areas and regions in which this species can become invasive. This complicates the decision-making because assessing the effects of the introduction and predict areas at risk of invasion are key tasks for prevention strategies, prioritization and control actions. Like this. So, this study aimed to summarize the effects of the axis deer in invaded areas using a systematic review protocol and to model the potential distribution of this species globally and in South America using bioclimatic variables. To summarized the effects we conducted searches for studies on non-native areas in three databases, using three sets of key-words and classified the studies that met the criteria of the protocol according to the level of inference about the effects they investigated. We extracted the types mentioned effects and occurrence region. To model the potential distribution based on bioclimatic variables we used the program Maxent. We used occurrences from the original distribution and three regions where the species is invasive about which geographical coordinates could be obtained or estimated. Four studies demonstrated effects of the axis deer due to competition with native species, changes in the floristic and faunistic composition and facilitation of other invasion processes. Six studies speculated the occurrence of disease transmition, hybridization with other species and difuse degradation of forest areas in combination with other invasive species. The distribution model demonstrated that large extensions of South America, Central Africa and Southeast Asia are susceptible to invasion. In the southern cone of South America Brazil, Uruguay, northern Argentina and Paraguay include extensive areas prone to invasion based on the bioclamatic models.

Vertebrados exóticos são introduzidos intencionalmente como recurso, como uma alternativa para fins econômicos ou de lazer. Aqueles que se tornam capazes de expandir espontaneamente as novas populações em áreas naturais são conhecidas como invasores e frequentemente estão implicados em efeitos indesejados em populações, comunidades e ecossistemas autóctones. Uma destas espécies é o cervo axis Axis axis, introduzido mundialmente para a caça. Apesar da sua ampla distribuição e utilização, pouco se sabe sobre seus efeitos nas áreas invadidas e em quais regiões esta espécie pode se tornar invasora. Isto dificulta as tomadas de decisão, pois avaliar os efeitos da introdução e prever as áreas em risco de invasão são tarefas fundamentais para estratégias de prevenção, priorização e ações de controle. Assim, esse trabalho teve como objetivos revisar os efeitos do cervo axis em áreas invadidas, utilizando um protocolo de revisão sistemática, e modelar a possível distribuição mundial e regional desta espécie, utilizando variáveis bioclimáticas. Realizamos buscas por estudos sobre efeitos em áreas alóctones em três bancos de dados, utilizando três conjuntos de palavras chaves. Classificamos os estudos que atenderam aos critérios do protocolo segundo o nível de inferência sobre os efeitos em Efeito Demonstrado e Efeito Sugerido. Extraímos os tipos de efeitos relatados e a região de ocorrência. Para a modelagem de distribuição, utilizamos o algoritmo Maxent e variáveis preditoras bioclimáticas. Os pontos de ocorrência utilizados incluem sua distribuição original e três regiões onde a espécie é invasora e das quais foi possível obter ou estimar coordenadas. A revisão sistemática resultou em apenas quatro trabalhos classificados em Efeito Demonstrado, os quais apontam a competição com espécies nativas, alteração da composição florística e faunística e facilitação da entrada de outras espécies invasoras. Os efeitos sugeridos incluem seis trabalhos mostrando a ocorrência de parasitas, um caso de hibridização com outra espécie de cervídeo em cativeiro e um estudo mostrando a degradação das áreas de florestas causada pelo cervo axis em conjunto com outras espécies invasoras. O modelo de distribuição demonstra que amplas extensões da América do Sul, África Central e Sudeste Asiático são suscetíveis à invasão, portanto, nestas áreas deve-se evitar a introdução e controlar a expansão. O sul do Brasil, Uruguai, norte da Argentina e Paraguai são possíveis áreas de ocorrência segundo os modelos bioclimáticos. / Alien vertebrates are intentionally introduced for leisure and economic purposes. Those who become able to expand their populations in the new areas are known as invasive and are often involved in undesirable effects in indigenous populations, communities and ecosystems. The axis deer was introduced worldwide for hunting. Despite its wide distribution and use, little is known about its effects on the invaded areas and regions in which this species can become invasive. This complicates the decision-making because assessing the effects of the introduction and predict areas at risk of invasion are key tasks for prevention strategies, prioritization and control actions. Like this. So, this study aimed to summarize the effects of the axis deer in invaded areas using a systematic review protocol and to model the potential distribution of this species globally and in South America using bioclimatic variables. To summarized the effects we conducted searches for studies on non-native areas in three databases, using three sets of key-words and classified the studies that met the criteria of the protocol according to the level of inference about the effects they investigated. We extracted the types mentioned effects and occurrence region. To model the potential distribution based on bioclimatic variables we used the program Maxent. We used occurrences from the original distribution and three regions where the species is invasive about which geographical coordinates could be obtained or estimated. Four studies demonstrated effects of the axis deer due to competition with native species, changes in the floristic and faunistic composition and facilitation of other invasion processes. Six studies speculated the occurrence of disease transmition, hybridization with other species and difuse degradation of forest areas in combination with other invasive species. The distribution model demonstrated that large extensions of South America, Central Africa and Southeast Asia are susceptible to invasion. In the southern cone of South America Brazil, Uruguay, northern Argentina and Paraguay include extensive areas prone to invasion based on the bioclamatic models.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-05-11T15:38:12Z No. of bitstreams: 1 Glauco Alves Pereira.pdf: 2610242 bytes, checksum: 9df0e14131c1138d6879358ccb530d2a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-11T15:38:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Glauco Alves Pereira.pdf: 2610242 bytes, checksum: 9df0e14131c1138d6879358ccb530d2a (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Pernambuco Endemism Center is the sector of the Atlantic Forest situated in the states of Alagoas, Pernambuco, Paraíba, and Rio Grande do Norte. This is the most devasted area of whole dominium, with a large number of endemic, and/or threatened birds. In this study, we analyzed the geographic range and performed the modeling of forest, endemic, and/or threatened birds, in addition to check and suggest important areas for bird conservation. We also examined the current and potential range of two birds considered Critically Endangered (Leptodon forbesi and Phaethornis margarettae camargoi) by ecological niche modeling, using the algorithm of maximum entropy (Maxent). To these two taxa we analyzed all records from 1987 to 2015, the vegetation type with highest number of records and we reviewed their conservation status. Both birds of the three target groups as the two birds modeled separately had a higher concentration of records and greater suitability potential in Alagoas and Pernambuco. There was no relationship between vegetation types and distribution of the birds of the three groups, but those were more abundant in moist forests, while the drier parts of the study area showed little representation. The protected areas were well representative at set of endemic and/or endangered birds, but some important areas for bird conservation did not have any protected forest fragment. We suggested update the conservation status of L. forbesi to 'Endangered' and P. margarettae camargoi to 'Vulnerable'. Urgent conservation actions must be taken in the Pernambuco Endemism Center due to the high degree of forest fragmentation, the high number of endemic and threatened taxa and the restricted distribution area of endemics. In future plans for the creation of protected areas, it must prioritize those areas overlapped the IBA's, because of the large number of endemic and/or threatened birds. / O Centro de Endemismo Pernambuco é o setor nordestino da Mata Atlântica situado nos estados de Alagoas, Pernambuco, Paraíba e Rio Grande do Norte. Esta é a área mais degradadada de todo o domínio, possuindo um grande número de táxons de aves florestais, endêmicos e/ou ameaçados de extinção. Nesse estudo, foi analisada a distribuição geográfica e realizada a modelagem de aves florestais, endêmicas e/ou ameaçadas de extinção, além de se verificar e sugerir importantes áreas para a conservação das aves. Também foi analisada a distribuição atual e potencial de duas aves consideradas Criticamente Ameaçadas (Leptodon forbesi e Phaethornis margarettae camargoi) através da modelagem de nicho ecológico, utilizando-se o algorítimo de Máxima Entropia (Maxent). Para esses dois táxons foram analisados os registros de 1987 a 2015, o tipo vegetacional onde há maior número de registros e foram revistos os seus status de conservação. Tanto as aves dos três grupos-alvos como as duas espécies modeladas separadamente tiveram maior concentração de registros e maior adequabilidade potencial em Alagoas e Pernambuco. Não houve relação entre os tipos vegetacionais e a distribuição das aves dos três grupos, porém essas se mostraram mais abundantes nas florestas úmidas, ao passo que as partes mais secas da área de estudo apresentaram pouca representatividade. As Unidades de Conservação foram bem representativas na conservação do conjunto de aves endêmicas e/ou ameaçadas, porém algumas áreas importantes para a conservação das aves não possuem nenhum fragmento florestal protegido. É sugerido que L. forbesi tenha seus status de conservação atualizado para a categoria „Em Perigo‟ e P. margarettae camargoi para „Vulnerável‟. Medidas urgentes de conservação devem ser tomadas no Centro de Endemismo Pernambuco devido ao alto grau de fragmentação florestal, ao elevado número de táxons endêmico e/ou ameaçados e a restrita área de distribuição dos endemismos. Em futuros planos para a criação de Unidades de Conservação, devem-se priorizar aquelas áreas sobrepostas às Important Bird Areas, devido ao elevado número endêmicos e/ou ameaçados.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-10-20T17:21:43Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Túlio Max de Oliveira Guimarães - 2014.pdf: 2190502 bytes, checksum: 95a9c8660ff6a8f4fee3c71a61784e47 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-21T10:06:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Túlio Max de Oliveira Guimarães - 2014.pdf: 2190502 bytes, checksum: 95a9c8660ff6a8f4fee3c71a61784e47 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-21T10:06:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Túlio Max de Oliveira Guimarães - 2014.pdf: 2190502 bytes, checksum: 95a9c8660ff6a8f4fee3c71a61784e47 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-04-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Understand how species are spatially distributed has been exhaustively discussed in ecology over the last decades. Recently, frameworks based on Ecological Niche Models (ENM) have emerged to avoid problems related to the lack of species geographical information, once it identify which environmental suitable conditions of geographic space enable the persistence of species. Recently this approach has become a significant component in Systematic Conservation Planning, helping managers to select better areas to create reserves. Several factors limit the fundamental niche of species and poor geographical information about species distribution may lead to be an underestimation of suitable conditions that one specie occur,, revealing an non-equilibrium with climate. Thus, using good fossil records to construct ecological niche models can be a better way to evaluate and improve ENM predictions and it allows us to estimate other suitable conditions not seen before. Thereby, our aim was to investigate if ENMs built for Mauritia flexuosa, and Tapirus terrestris improve with the addition of fossil information. So, different ENMs were built using, first, current records and, second, using different proportions of fossil data. The results showed that species closer to equilibrium with climate (M. flexuosa) had an improvement in model’s performance with the addition of fossil records, while species with higher non-equilibrium (T. terrestris) decreased the model’s performance. / Entender como as espécies estão espacialmente distribuídas pelo planeta tem sido um assunto exaustivamente discutido em ecologia ao longo das últimas décadas. Recentemente, abordagens baseadas nos Modelos de Nicho Ecológico têm surgido com o intuito de eliminar problemas relacionados à lacuna de informação geográfica sobre as espécies, uma vez que identifica locais no espaço geográfico que apresenta as condições ambientais favoráveis à persistência das mesmas. Vários fatores limitam o nicho fundamental das espécies e informações geográficas enviesadas acerca de sua distribuição podem levar a uma subestimativa das condições adequadas à ocorrência, revelando um desequilíbrio com o clima. Deste modo, a utilização de registros fósseis na construção dos Modelos de Nicho Ecológico pode ser uma maneira de melhorar as predições dos modelos, já que adiciona novas informações ambientais que não haviam sido encontradas atualmente. Deste modo, nosso objetivo foi investigar se os Modelos de Nicho Ecológico construídos para Mauritia flexuosa e Tapirus terrestris apresentaram melhora no poder preditivo pela adição de informação fóssil. Para isso, foram construídos diferentes modelos utilizando dados atuais apenas e modelos utilizando tanto informação atual quanto informação fóssil, em diferentes porcentagens. Através de uma Análise de Variância Fatorial, medimos se a adição de informação fóssil apresentava melhora significativa no poder preditivo dos modelos. Nossos resultados mostram que quando há pouca variação na informação ambiental adicionada (M. flexuosa), os modelos apresentam uma melhora significativa no poder preditivo, ao passo que para aqueles dados com maior variação (T. terrestris) o efeito é inverso. Isso se deve pela variação dos erros de omissão e comissão gerados durante o processo de modelagem.

Background: As the climate warms, many species of reptiles are at risk of habitat loss and ultimately extinction. Locations of suitable habitat in the past, present, and future were modeled for several lizard species using MaxEnt, incorporating climatic variables related to temperature and precipitation. In this study, we predict where there is currently suitable habitat for the genus Pogona and potential shifts in habitat suitability in the past and future. Methods: Georeferenced occurrence records were obtained from the Global Biodiversity Information Facility, climate variables (describing temperature and precipitation) were obtained from WorldClim, and a vegetation index was obtained from AVHRR satellite data. Matching climate variables were downloaded for three different past time periods (mid-Holocene, Last Glacial Maximum, and Last Interglacial) and two different future projections representative concentration pathways (RCPs 2.6 and 8.5). MaxEnt produced accuracy metrics, response curves, and probability surfaces. For each species, parameters were adjusted for the best possible output that was biologically informative. Results: Model results predicted that in the past, there was little suitable habitat for P. henrylawsoni and P. microlepidota within the areas of their current range. Past areas of suitable habitat for P. barbata were predicted to be similar to the current prediction. Pogona minor and P. nullarbor were predicted to have had a more expansive range of suitable habitat in the past, which has reduced over time. P. vitticeps was predicted to have less suitable habitat in the past when examining the region of their known occurrence; however, there was predicted growth in suitable habitat in Western Australia. Both 2070 models predict a similar distribution of habitat; however, the model produced using the 2070 RCP 8.5 climate change projection showed a larger change, both in areas of suitable habitat gain and loss. In the future, P. henrylawsoni and P. microlepidota might gain suitable habitat, while the other four species could possibly suffer habitat loss. Discussion: Based on the model results, P. henrylawsoni and P. microlepidota had minimal areas of suitable habitat during the Last Glacial Maximum, possibly due to changes in tolerance or data/model limitations, especially since genetic analyses for these species suggest a much earlier emergence. The predicted late Quaternary habitat results for all species of Pogona are conservative and should be compared to the fossil record which is not possible at the moment due to the current inability to identify fossil Pogona to the species level. P. nullarbor and P. vitticeps future models predict substantial habitat loss. P. nullarbor could potentially be considered vulnerable in the present since it already has a restricted range, and a conservation plan may need to be considered.

No description available.

The genus Castor is represented in Eurasia by Castor fiber, North America by C. canadensis, and has been in North America since the late Miocene. This study aims to assess whether morphology of Miocene-Pliocene C. californicus and extant C. canadensis are distinctly different. Specimens of Castor were compared using geometric morphometrics on cranial material and linear measurements of postcranial material. Species occurrence data were compared with past and future climate data to assess Castor distribution in North America through time. Results show that C. canadensis is highly variable in both cranial and postcranial morphology and C. californicus falls largely within the range of variation seen within the extant species. Past distributions match fossil occurrences of Castor, suggesting confidence in projected models. Morphological and distribution similarities between the two species suggest that they can be treated as ecological analogs, though evaluation of whether they are conspecific will require more data.

The conservation biology field seeks to preserve biodiversity and the processes shaping that variation. Conservation biology is intimately tied to evolutionary research, in order to identify evolutionary distinct lineages that may be in danger of disappearing. Interestingly, patterns and processes of lineage divergence and persistence change with respect to spatial and temporal scale. I seek to evaluate biodiversity, the factors that have shaped this heterogeneity, and how this variability persists. To accomplish this I used a phylogeographic approach as well as niche and population modeling on the Peromyscus maniculatus species group found widely distributed in North America. My emphasis was on the southeastern U.S. species P. polionotus and its distinct beach forms. At a continental scale, I found that environmental niches are likely involved in generating and/or maintaining genetic lineages within the P. maniculatus species group. These findings add to a growing number of studies that have identified lineages occupying different environmental spaces. At a regional scale, I supported the hypothesis that barrier islands on the Atlantic coast of Florida were colonized by an ancestral form of P. polionotus by a single colonization, from the central Florida area. Subsequently, at least two distinct lineages diverged (P. p. phasma and P. p. niveiventris). I also found evidence that suggests that the extinct form of beach mouse (P. p. decoloratus) is part of the P. p. phasma lineage. At the population level, I evaluated changes in genetic diversity in historical samples compared to those that experienced recent human encroachment on natural habitat I used tissue preserved in natural history collections to compare with live-trapped specimens, and found that P. p. niveiventris has maintained historical genetic diversity levels. I suggest that the continuation of historical levels of genetic diversity is due to the presence of a single large area iv of continuous habitat in the central portion of the species’ current distribution. Finally, I evaluated the importance of scrub and beach habitat to the population dynamics of beach mice. Beach mice have traditionally have been associated with beach dunes rather than with the scrub habitat found more inland on barrier islands. Using almost three years of capture-recapture data from Cape Canaveral Air Force Station (CCAFS), I created a stochastic matrix model to assess the relative contribution of populations from the two different habitats to a variety of demographic measures. Both field data and model results provided evidence that the population dynamics of beach mice may rely much more on scrub habitat than formerly documented. Overall, my research emphasized a hierarchical approach to evaluate biodiversity and the processes shaping differentiation at different spatial and temporal scales. The methods and findings give insight into speciation at different scales, and can be applied to a wide range of taxa for questions related to evolutionary and conservation biology.