Infectious diseases are increasingly being recognised as significant threatening processes in conservation biology. Developing strategies to effectively manage infectious diseases in wildlife is, therefore, of the utmost importance to the maintenance of global biodiversity. The effective management of infectious diseases relies on understanding the ecology of the host, the epidemiological characteristics of the pathogen and the impacts of the pathogen on the host population. However, for most wildlife-disease systems this information remains poorly understood. This is particularly true for endangered species threatened by novel infectious agents as opportunities to observe and assess disease impacts and host-pathogen dynamics in the wild are limited. The Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii), the world’s largest carnivorous marsupial, is threatened with extinction as a result of an epidemic of an emerging disease, a fatal infectious cancer known as Devil Facial Tumour Disease (DFTD). In this thesis I capitalised on a unique dataset from a population of Tasmanian devils where disease arrived part-way through an intensive longitudinal study, and utilised existing genetic samples collected prior to DFTD outbreak, to determine the impact of DFTD on the demography, population dynamics, genetic diversity and population genetic structure of wild Tasmanian devils. I then used this knowledge of the impacts of DFTD impacts in an unmanaged population to evaluate the effectiveness of a disease management trial involving the selective culling of infected individuals. I employed mark-recapture models to investigate the impact of DFTD on age-specific and sex-specific apparent survival rates, to examine the pattern of variation in infection rates (force of infection), and to investigate the impact of DFTD on population growth rate. I investigated demography, life-history traits and morphometric parameters of infected and uninfected individuals to determine the impacts of DFTD on age-structure and sex-structure, female fecundity and individual growth rates. I used this information to assess the population’s ability to respond to low population densities and to compensate for the detrimental impacts of DFTD. To determine the genetic consequences of disease-induced population decline I used microsatellite DNA to compare genetic diversity, population genetic structure and dispersal patterns in three Tasmanian devil populations prior to and following DFTD outbreaks. Capture-mark-recapture analyses revealed that the arrival of DFTD triggered an immediate decline in apparent survival rates of devils, the rate of which was predicted well by the increase in disease prevalence in the population over time. Transition rates of healthy individuals to the diseased class (the force of infection) increased in relation to disease prevalence, while the arrival of DFTD coincided with a marked and ongoing decline in the population growth rate. There was a significant change to the age structure following the arrival of DFTD. This shift to a younger population was caused by the loss of older individuals as a direct consequence of DFTD-driven declines in adult survival rates. Evidence of reproductive compensation in response to these disease impacts was observed via a reduction in the age of sexual maturity of females over time. However, widespread precocial breeding in devils was precluded by physiological and ecological constraints that limited the ability of one year olds to breed. Using temporally-replicated spatial genetic data, I found evidence of increased inbreeding following DFTD arrival and greater population genetic differentiation in post-disease populations. These changes appeared to be driven by a combination of selection and altered dispersal patterns of females in DFTD-affected populations. Comparison of demographic and epidemiological parameters indicative of disease progression and impact between the managed and unmanaged populations revealed that selective culling of infected individuals neither slowed the rate of disease progression nor reduced the population level impacts of this debilitating disease; with culling mortality simply compensating for disease mortality. This thesis provides one of the few direct empirical evaluations of the impact of an emerging wildlife disease epidemic on a wild population. This thesis revealed that infectious diseases can result in major demographic and genetic changes in host populations over relatively few generations and short time-scales. Results showing dramatic and ongoing population declines and very limited population compensation in DFTD-affected populations indicate that DFTD poses a significant extinction risk for wild devil populations. Hence, this study confirms that host-specific pathogens can pose a significant extinction risk for wild species, even in the absence of alternate reservoir hosts, a finding critical to our understanding of host-pathogen dynamics. My thesis also highlights the potential negative interplay between disease susceptibility and host genetic variability, which is of utmost importance to the management of novel wildlife epizootics and the conservation of threatened wildlife in general. The thorough understanding of the ecology and impacts of DFTD in the wild obtained in this study has provided a solid base from which to both rigorously assess the outcome of management strategies and also formulate recommendations for the management of this disease in the wild. The lack of evidence for successful control of the DFTD epidemic in a wild population during the first phase of a selective culling experimental adaptive management approach, points to the need to implement a multi-faceted disease management program when attempting to control a novel infectious disease in the wild. By drawing on the lessons learnt in this case study I show that it is possible to establish a set of general guidelines for the future management of infectious diseases in threatened wildlife.

The main object of this study was to investigate the effects of predation by starlings (Sturnus vulgaris) on populations of the grass grub (Costelytra zealandica) in Canterbury, with the secondary objective of investigating the feasibility of life table studies of grass grub populations under Canterbury conditions. Study plots were established in four areas, two on non-irrigated pastureland at Lincoln and Weka Pass and two on irrigated pastureland at Winchmore. A third study plot was established at Winchmore in the second year of field work.

Thesis (Ph. D.)--Miami University, Dept. of Botany, 2006. / Title from second page of PDF document. Includes bibliographical references.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:30:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 306198 bytes, checksum: 8f1faae152b473ab728693d836276bd4 (MD5) Previous issue date: 2008-02-26 / Faculdade Univértix / Triozoida limbata is one of the most important pests of guava plants. Their nymphs attack young leaves and buds, causing serious damages. Basic studies of population dynamics and determination of factors that regulate the population growth are necessary for the development of integrated programs management of this pest. Agents of natural biological control and the climatic elements are among the factors that more affected the attack intensity of insects-pest. Objective this work was assessed T. limbata population fluctuation and determines the relationship among its occurrence with natural enemies and climatic elements. This research was carried out in a commercial orchard of guava, located in Paula Cândido, Minas Gerais state, from julho/2005 to agosto/2007. Population densities of T. limbata, predators, parasitoids and parasitism rates of nymphs were assessed weekly. Climatic data were also collected daily. Correlations were accomplished among T. limbata densities with the natural enemies population densities and with data climatic elements for determine the relationship among these factors. T. limbata was verified guava plants groves to year, and in most of the time this insect reached the pest status. Seasonality of T. limbata attack to guava plants was associated to variations of climatic elements and predators and parasitoids densities. Populational peaks of eggs, nymphs and adults occurred from August to December, from July to November and from August to November, respectively. The largest intensity of T. limbata attack to guava plants occurred in periods of cool temperatures (18 to 20 ºC) and shorter photoperiod (10 at 11 hours of light). Natural enemies that controlled T. limbata were the predators Chrysoperla sp. (Neuroptera: Chrysopidae), Harmonia axyridis (Coleoptera: Coccinellidae), Acanthinus sp. (Coleoptera: Anthicidae), Discodon sp. (Coleoptera: Cantaridae), Hymenoptera: Vespidae and the parasitoid of nymphs Psyllaephagus sp. (Hymenoptera: Encyrtidae). Results found in this work, the future studies aiming the determination of strategies and tactics management of T. limbata should consider its occurrence time and factors related with the seasonal variations of their populations, like the climatic elements and the natural enemies. / Triozoida limbata é considerada uma das mais importantes pragas da goiabeira. Suas ninfas atacam as folhas de brotações novas, causando sérios danos. Para desenvolvimento de programas de manejo integrado dessa praga são necessários estudos básicos de dinâmica populacional e determinação de fatores que regulam o seu crescimento populacional. Entre os fatores mais importantes que afetam a intensidade de ataque dos insetos-praga estão os agentes de controle biológico natural e os elementos climáticos. Assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a flutuação populacional de T. limbata e determinar a relação entre a ocorrência de T. limbata com os inimigos naturais e os elementos climáticos. O trabalho foi realizado em pomar comercial de goiabeira, localizado em Paula Cândido, MG de julho de 2005 a agosto de 2007. Foram avaliadas, semanalmente, as densidades populacionais de T. limbata, de predadores, parasitóides e a taxa de parasitismo de ninfas. Dados climáticos também foram coletados diariamente. Correlações entre as densidades de T. limbata com as densidades populacionais dos inimigos naturais e os dados dos elementos climáticos foram realizadas para determinação da relação entre estes fatores. T. limbata atacou a cultura da goiabeira durante o ano inteiro, sendo que na maior parte do tempo este inseto atingiu o status de praga. A sazonalidade do ataque de T. limbata à goiabeira esteve associada a variações nos elementos climáticos e nas densidades de predadores e de parasitóide. Os picos populacionais de ovos, ninfas e adultos ocorreram nos meses de agosto a dezembro, julho a novembro e agosto a novembro, respectivamente. A maior intensidade de ataque de T. limbata à goiabeira ocorreu em períodos de temperaturas amenas (18 a 20 ºC) e menor fotoperíodo (10 a 11 horas de luz). Os inimigos naturais que exerceram controle sobre T. limbata foram os predadores Chrysoperla sp. (Neuroptera: Chrysopidae), Harmonia axyridis (Coleoptera: Coccinellidae) Acanthinus sp. (Coleoptera: Anthicidae), Discodon sp. (Coleoptera: Cantaridae), Hymenoptera: Vespidae e o parasitóide de ninfas Psyllaephagus sp. (Hymenoptera: Encyrtidae). Mediante aos resultados encontrados neste trabalho, os estudos futuros visando a determinação de estratégias e táticas de manejo de T. limbata devem levar em consideração a sua época de ocorrência e os fatores relacionados com as variações sazonais de suas populações, como os elementos climáticos e os inimigos naturais.

O presente trabalho tem como objetivo avaliar traços de história de vida de peixes de pequeno porte sob o efeito de diferentes regimes de inundação no Pantanal. As amostragens foram realizadas nas regiões Norte (Rio Cuiabá) e Sul do Pantanal (Rio Paraguai), que apresentam regimes hidrológicos diferenciados. Inicialmente, foram obtidos dados de 623 indivíduos da espécie Odontostilbe pequira no Pantanal Sul, para análise de estrutura populacional e traços reprodutivos. Não foi observada variação significativa na distribuição de comprimento entre os sexos. O período reprodutivo foi longo para ambos os sexos (10 meses), com maior intensidade entre os meses de Junho e Julho. Não ocorreu correlação entre o índice gonadossomático (IGS) de ambos os sexos com a temperatura da água e pluviosidade temporalmente. Os machos não apresentaram associação entre o IGS e o nível do rio, mas uma correlação marginalmente significativa foi observada nas fêmeas. Contudo, foi observado o efeito do nível histórico do rio sobre o IGS para ambos os sexos, indicando que o regime de inundação tem influência decisiva na atividade reprodutiva de O. pequira, proporcionando a ocorrência de desovas mesmo que a pluviosidade e temperatura apresentem baixos valores. O. pequira, pode ser caracterizada como uma espécie de “estratégia oportunista”, apresentando longo período reprodutivo, desova parcelada e elevada fecundidade, com atividade reprodutiva fortemente associada com o regime de inundação. Posteriormente, foram utilizados dados de comprimento de 977 indivíduos de O. pequira no Pantanal Sul, para análises adicionais de traços de história de vida entre os sexos. O comprimento assintótico (L∞) estimado para fêmeas foi maior (39,59mm) que para os machos (37,57mm). As fêmeas também apresentaram maior taxa de crescimento (k=0,93 ano-1) e mortalidade natural (Z=1,56 ano-1) em relação aos machos (k=0,82 ano-1; Z= 1,45 ano-1). Através das curvas de crescimento foram registrados 3 coortes completas para as fêmeas, com longevidade estimada em 3,22 anos, e, 4 coortes para os machos, com longevidade de 3,65 anos. O padrão de recrutamento foi longo para ambos os sexos, não sendo observada variação significativa na forma da distribuição do recrutamento entre os sexos. Constatamos correlação entre o recrutamento e o nível do rio para ambos os sexos, com pico de recrutamento em Julho e Junho para fêmeas e machos, respectivamente, corroborando com o período reprodutivo da espécie e com a associação com o regime de inundação no Pantanal Sul. Finalmente, foram obtidos dados de comprimento das espécies Bryconamericus exodon, Hyphessobrycon eques, O. pequira, Moenkhausia dichroura, Hypoptopoma inexpectatum e Eigemnannia trilineata, nas regiões norte e sul do Pantanal, para realizar as comparações intra e interespecífica. As espécies não apresentaram diferença significativa na forma de distribuição de comprimento entre as regiões. O L∞ das espécies apresentou variação intraespecífica entre as regiões, com os maiores valores para as populações da região norte (exceção, E. trilineata). A taxa de crescimento (k) e mortalidade (Z) apresentou variação intraespecífica entre as regiões, com quatro espécies (B. exodon, H. eques, O. pequira e M. dichroura) demonstrando menores k e Z, e maiores L∞ na região Norte, sugerindo que a região norte oferece condições mais favoráveis em relação à região Sul. Não ocorreu variação intraespecífica entre as regiões para o número de coortes e longevidade. O padrão de recrutamento não apresentou variação intraespecífica entre as regiões, apresentando longo período de recrutamento e picos para todas as espécies entre Junho e Agosto. Na região Norte, o padrão de recrutamento de quatro espécies (B. exodon, H. eques, M. dichroura e H. inexpectatum) não apresentou correlação significativa com o nível histórico do rio Cuiabá, entretanto, essas espécies apresentaram covariação negativa, além de duas espécies (O. pequira e E. trilineata) apresentarem correlação negativa significativa, apresentando picos de recrutamento com a diminuição do nível da água. Na região Sul, cinco espécies (B. exodon, H. eques, M. dichroura, H. inexpectatum e O. pequira) estiveram associadas significativamente com o nível histórico do rio Paraguai, com picos de recrutamento em níveis mais elevados de água, indicando que o regime de inundação tem influência decisiva no padrão de recrutamento (exceção, E. trilineata). Enfim, as espécies apresentaram variação intraespecífica na maioria dos traços de história de vida, mas não há ampla variação, inclusive no padrão de recrutamento que não se altera intra e interespecificamente, evidenciando tanto a força da ancestralidade de táxon (filogenia), como das condições ambientais locais regidas pelo regime de inundação, respectivamente. / The present study aimed to evaluate life history traits of small sized fish according to different flooding regimes in the Pantanal. Samplings were performed in Northern (Cuiabá River) and Southern Pantanal (Paraguai River), which present distinct hydrological regimes. First, data of 623 individuals of Odontostilbe pequira in Southern Pantanal were analyzed as for population structure and reproductive traits. No significant variation was found in length distribution between sexes. The reproductive period was long for both sexes (10 months), with higher intensity between June and July. No correlation was detected between the gonadosomatic index (GSI) of both sexes with water temperature and rainfall over time. Males presented no association between GSI and river water level, but a marginally significant correlation was observed for females. However, it was verified the effect of the historical river level on the GSI for both sexes, indicating that the flooding regime has a decisive influence on the reproductive activity of O. pequira, by promoting spawning even if rainfall and temperature present low values. O. pequira can be characterized as an opportunistic species, presenting a long reproductive period, multiple spawning and high fecundity with reproductive activity strongly associated with the flooding regime. Afterwards, length data from 977 individuals of O. pequira in Southern Pantanal were used for additional analysis on life history traits between the sexes. The asymptotic length (L∞) estimated for females was higher (39.59mm) than for males (37.57mm). Females also presented higher growth rate (k=0.93 year-1) and natural mortality (Z=1.56 year-1) than males (k=0.82 year-1; Z= 1.45 year-1). By means of growth curves, 3 cohorts were recorded for females, with longevity estimated at 3.22 years, and 4 cohorts for males, with longevity of 3.65 years. The recruitment pattern was long for both sexes, without significant variation in recruitment distribution between the sexes. There was a correlation between recruitment and river water level for both sexes, with a recruitment peak in July and June for females and males, respectively, corroborating with the reproductive period of the species and with the association with the flooding regime in Southern Pantanal. At last, length data of Bryconamericus exodon, Hyphessobrycon eques, O. pequira, Moenkhausia dichroura, Hypoptopoma inexpectatum and Eigemnannia trilineata, in Northern and Southern Pantanal, were used for intra- and interspecific comparisons. Species have not presented significant difference in length distribution between regions. The L∞ of species exhibited an intraspecific variation between the regions, with higher values of the populations from the Northern Pantanal (except for E. trilineata). The growth (k) and mortality (Z) rates presented intraspecific variation between the regions, with four species (B. exodon, H. eques, O. pequira and M. dichroura) revealing lower values of k and Z, and higher L∞ values in Northern Pantanal, suggesting that this region provides more favorable conditions than the Southern region. There were no intraspecific variations between the regions for the number of cohorts and longevity. The recruitment pattern also had no intraspecific variation between the regions, presenting a long recruitment period and greater peak for all species between June and August. On the Northern region, the recruitment pattern of four species (B. exodon, H. eques, M. dichroura and H. inexpectatum) showed no significant correlation with historical level of the Cuiabá River, but these species presented a negative covariation; besides that, two species (O. pequira and E. trilineata) presented a significant negative correlation, with recruitment peaks with decreasing water level. In the Southern Pantanal, five species (B. exodon, H. eques, M. dichroura, H. inexpectatum and O. pequira) have been significantly associated with the historical level of the Cuiabá River, with recruitment peaks at higher water levels, pointing out that the flooding regime has a key influence on the recruitment pattern (except for E. trilineata). Finally, species presented intraspecific variations in most of life history traits, but there is no wide variation, including in the recruitment pattern that does not change intra- and interspecies, evidencing both the control of the taxa ancestry (phylogeny) and of local environmental conditions ruled by the flooding regime, respectively.

Dans un objectif de réduction de l'utilisation des pesticides, des méthodes alternatives doivent assurer la protection des cultures. Les dégâts causés par les insectes ravageurs sont les manifestations de dynamiques de population dont certains déterminants paysagers sont des éléments structuraux potentiellement relocalisables. Nous explorons ici, par la simulation numérique, la modification du paysage comme stratégie de protection des cultures.Les éléments paysagers peuvent impacter les populations d'insectes par leur influence sur les comportements individuels. Nous avons développé un modèle de population tenant compte de l'approvisionnement individuel. Ce processus résulte (1) de la perception des ressources distantes par l'individu, (2) de la localisation de la population sur une dimension additionnelle quantifiant les réserves énergétiques, et (3) d'une procédure d'optimisation qui définit des mouvements dirigés adaptés.Une heuristique évolutionnaire de modification de paysages a été développée. Elle produit des réarrangements sous contraintes de composition et de structure. Les modèles de paysages et de dynamique de population ont été appliqués à un problème théorique d'aménagement du paysage. La description mécaniste de l'approvisionnement optimal offre des leviers d'action efficaces, basés sur la perturbation des comportements d'approvisionnement. Nos travaux montrent la réactivité de la population aux modifications du paysage, ainsi que la capacité des algorithmes évolutionnaires à proposer des paysages résistants, sous contraintes agronomiques. / Environmental and health issues call for a switch in crop protection towards less chemically driven strategies. Pest damages on crops result of population dynamics that are influenced by landscape features. Those features may be relocated or dismissed to improve landscapes resistance to pest damages. Here we explore numerically the landscape modification as a crop protection strategy.Landscape features can influence population dynamics through their impact on individuals. Therefore, we developed a multiscale population dynamics model accounting for individual foraging. The foraging process results of (1) the perception of distant features used as resources by the individuals, (2) the localisation of the population along an additional dimension quantifying individual energy supply, (3) an optimisation procedure defining adapted directed motionsWe developed an evolutionary heuristic for landscape modification. It is able to rearrange landscapes with respect to compositional and structural constraints. Population and landscape models were applied to a theoretical landscape planning problem. The mechanistic description of the optimal foraging process enables new and efficient levers for crop protection, building on the disruption of the foraging behaviours. This application enlightens the responsiveness of the simulated population to landscape modifications, as well as the ability of evolutionary algorithms to produce resilient landscapes under agronomic productive constraints.

O presente trabalho tem como objetivo avaliar traços de história de vida de peixes de pequeno porte sob o efeito de diferentes regimes de inundação no Pantanal. As amostragens foram realizadas nas regiões Norte (Rio Cuiabá) e Sul do Pantanal (Rio Paraguai), que apresentam regimes hidrológicos diferenciados. Inicialmente, foram obtidos dados de 623 indivíduos da espécie Odontostilbe pequira no Pantanal Sul, para análise de estrutura populacional e traços reprodutivos. Não foi observada variação significativa na distribuição de comprimento entre os sexos. O período reprodutivo foi longo para ambos os sexos (10 meses), com maior intensidade entre os meses de Junho e Julho. Não ocorreu correlação entre o índice gonadossomático (IGS) de ambos os sexos com a temperatura da água e pluviosidade temporalmente. Os machos não apresentaram associação entre o IGS e o nível do rio, mas uma correlação marginalmente significativa foi observada nas fêmeas. Contudo, foi observado o efeito do nível histórico do rio sobre o IGS para ambos os sexos, indicando que o regime de inundação tem influência decisiva na atividade reprodutiva de O. pequira, proporcionando a ocorrência de desovas mesmo que a pluviosidade e temperatura apresentem baixos valores. O. pequira, pode ser caracterizada como uma espécie de “estratégia oportunista”, apresentando longo período reprodutivo, desova parcelada e elevada fecundidade, com atividade reprodutiva fortemente associada com o regime de inundação. Posteriormente, foram utilizados dados de comprimento de 977 indivíduos de O. pequira no Pantanal Sul, para análises adicionais de traços de história de vida entre os sexos. O comprimento assintótico (L∞) estimado para fêmeas foi maior (39,59mm) que para os machos (37,57mm). As fêmeas também apresentaram maior taxa de crescimento (k=0,93 ano-1) e mortalidade natural (Z=1,56 ano-1) em relação aos machos (k=0,82 ano-1; Z= 1,45 ano-1). Através das curvas de crescimento foram registrados 3 coortes completas para as fêmeas, com longevidade estimada em 3,22 anos, e, 4 coortes para os machos, com longevidade de 3,65 anos. O padrão de recrutamento foi longo para ambos os sexos, não sendo observada variação significativa na forma da distribuição do recrutamento entre os sexos. Constatamos correlação entre o recrutamento e o nível do rio para ambos os sexos, com pico de recrutamento em Julho e Junho para fêmeas e machos, respectivamente, corroborando com o período reprodutivo da espécie e com a associação com o regime de inundação no Pantanal Sul. Finalmente, foram obtidos dados de comprimento das espécies Bryconamericus exodon, Hyphessobrycon eques, O. pequira, Moenkhausia dichroura, Hypoptopoma inexpectatum e Eigemnannia trilineata, nas regiões norte e sul do Pantanal, para realizar as comparações intra e interespecífica. As espécies não apresentaram diferença significativa na forma de distribuição de comprimento entre as regiões. O L∞ das espécies apresentou variação intraespecífica entre as regiões, com os maiores valores para as populações da região norte (exceção, E. trilineata). A taxa de crescimento (k) e mortalidade (Z) apresentou variação intraespecífica entre as regiões, com quatro espécies (B. exodon, H. eques, O. pequira e M. dichroura) demonstrando menores k e Z, e maiores L∞ na região Norte, sugerindo que a região norte oferece condições mais favoráveis em relação à região Sul. Não ocorreu variação intraespecífica entre as regiões para o número de coortes e longevidade. O padrão de recrutamento não apresentou variação intraespecífica entre as regiões, apresentando longo período de recrutamento e picos para todas as espécies entre Junho e Agosto. Na região Norte, o padrão de recrutamento de quatro espécies (B. exodon, H. eques, M. dichroura e H. inexpectatum) não apresentou correlação significativa com o nível histórico do rio Cuiabá, entretanto, essas espécies apresentaram covariação negativa, além de duas espécies (O. pequira e E. trilineata) apresentarem correlação negativa significativa, apresentando picos de recrutamento com a diminuição do nível da água. Na região Sul, cinco espécies (B. exodon, H. eques, M. dichroura, H. inexpectatum e O. pequira) estiveram associadas significativamente com o nível histórico do rio Paraguai, com picos de recrutamento em níveis mais elevados de água, indicando que o regime de inundação tem influência decisiva no padrão de recrutamento (exceção, E. trilineata). Enfim, as espécies apresentaram variação intraespecífica na maioria dos traços de história de vida, mas não há ampla variação, inclusive no padrão de recrutamento que não se altera intra e interespecificamente, evidenciando tanto a força da ancestralidade de táxon (filogenia), como das condições ambientais locais regidas pelo regime de inundação, respectivamente. / The present study aimed to evaluate life history traits of small sized fish according to different flooding regimes in the Pantanal. Samplings were performed in Northern (Cuiabá River) and Southern Pantanal (Paraguai River), which present distinct hydrological regimes. First, data of 623 individuals of Odontostilbe pequira in Southern Pantanal were analyzed as for population structure and reproductive traits. No significant variation was found in length distribution between sexes. The reproductive period was long for both sexes (10 months), with higher intensity between June and July. No correlation was detected between the gonadosomatic index (GSI) of both sexes with water temperature and rainfall over time. Males presented no association between GSI and river water level, but a marginally significant correlation was observed for females. However, it was verified the effect of the historical river level on the GSI for both sexes, indicating that the flooding regime has a decisive influence on the reproductive activity of O. pequira, by promoting spawning even if rainfall and temperature present low values. O. pequira can be characterized as an opportunistic species, presenting a long reproductive period, multiple spawning and high fecundity with reproductive activity strongly associated with the flooding regime. Afterwards, length data from 977 individuals of O. pequira in Southern Pantanal were used for additional analysis on life history traits between the sexes. The asymptotic length (L∞) estimated for females was higher (39.59mm) than for males (37.57mm). Females also presented higher growth rate (k=0.93 year-1) and natural mortality (Z=1.56 year-1) than males (k=0.82 year-1; Z= 1.45 year-1). By means of growth curves, 3 cohorts were recorded for females, with longevity estimated at 3.22 years, and 4 cohorts for males, with longevity of 3.65 years. The recruitment pattern was long for both sexes, without significant variation in recruitment distribution between the sexes. There was a correlation between recruitment and river water level for both sexes, with a recruitment peak in July and June for females and males, respectively, corroborating with the reproductive period of the species and with the association with the flooding regime in Southern Pantanal. At last, length data of Bryconamericus exodon, Hyphessobrycon eques, O. pequira, Moenkhausia dichroura, Hypoptopoma inexpectatum and Eigemnannia trilineata, in Northern and Southern Pantanal, were used for intra- and interspecific comparisons. Species have not presented significant difference in length distribution between regions. The L∞ of species exhibited an intraspecific variation between the regions, with higher values of the populations from the Northern Pantanal (except for E. trilineata). The growth (k) and mortality (Z) rates presented intraspecific variation between the regions, with four species (B. exodon, H. eques, O. pequira and M. dichroura) revealing lower values of k and Z, and higher L∞ values in Northern Pantanal, suggesting that this region provides more favorable conditions than the Southern region. There were no intraspecific variations between the regions for the number of cohorts and longevity. The recruitment pattern also had no intraspecific variation between the regions, presenting a long recruitment period and greater peak for all species between June and August. On the Northern region, the recruitment pattern of four species (B. exodon, H. eques, M. dichroura and H. inexpectatum) showed no significant correlation with historical level of the Cuiabá River, but these species presented a negative covariation; besides that, two species (O. pequira and E. trilineata) presented a significant negative correlation, with recruitment peaks with decreasing water level. In the Southern Pantanal, five species (B. exodon, H. eques, M. dichroura, H. inexpectatum and O. pequira) have been significantly associated with the historical level of the Cuiabá River, with recruitment peaks at higher water levels, pointing out that the flooding regime has a key influence on the recruitment pattern (except for E. trilineata). Finally, species presented intraspecific variations in most of life history traits, but there is no wide variation, including in the recruitment pattern that does not change intra- and interspecies, evidencing both the control of the taxa ancestry (phylogeny) and of local environmental conditions ruled by the flooding regime, respectively.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Melanoides tuberculatus (Müller, 1774) é um gastrópode dulceaquícola de origem afroasiática, atualmente com uma distribuição cosmopolita, devido a seu comportamento invasivo. Utilizamos em nosso trabalho o nome Melanoides tuberculatus por acreditar ser o mais correto para a espécie, pois também é encontrado na literatura o nome Melanoides tuberculata (Müller, 1774), combinação que não atende os preceitos do ICZN. Recuperamos registros em 52 países, sendo 25 na área nativa e 27 na área exótica de distribuição da espécie. Esta espécie foi recentemente introduzida em um riacho na Vila do Abraão (Ilha Grande), possivelmente através do despejo de água de aquário. O objetivo do trabalho foi avaliar a dinâmica populacional deste caramujo neste novo ambiente, assim como seus efeitos sobre a fauna acompanhante, durante dois anos, de julho/2006 até maio/2008, com coletas bimensais. O riacho foi dividido em oito pontos de coleta (P1, o mais a montante até P8, mais a jusante). As coletas foram realizadas através de duas metodologias, coleta direta e Surber. Os animais coletados foram triados, contados e identificados na menor categoria taxonômica possível.Fatores ambientais foram mensurados em cada ponto de coleta. Os testes parasitológicos e identificação do sexo foram realizados com os animais provenientes da coleta direta. Os exemplares de M. tuberculatus foram divididos em quatro classes de tamanho (CL) de acordo com a largura do animal (CL1 0,01 até 2,99 mm; CL2 3,00 até 5,99 mm; CL3 6,00 até 8,99 mm e CL4 >9,00 mm). Os dados foram analisados usando planilha Excel e o pacote estatístico SYSTAT 12. A população de M. tuberculatus apresentou um crescimento em quatro fases: lag, crescimento exponencial, queda e estabilização, diferindo do encontrado nos demais moluscos deste riacho, que apresentaram flutuações populacionais irregulares. O pico populacional foi em novembro/2007 com 3156 exemplares. A espécie se reproduz o ano todo, porém com um pico entre maio/2007 e novembro/2007, quando os indivíduos da CL1 representaram mais de 50% do total. A mortalidade se concentra nos indivíduos maiores (CL3 e CL4), a CL4 sempre representando menos de 5% dos animais coletados. Os testes parasitológicos foram todos negativos, não sendo encontradas interações com a helmintofauna. Observamos apenas fêmeas na população, tratando-se possivelmente de uma população inteiramente partenogenética. A espécie formou grandes agregados populacionais, com uma densidade máxima estimada de 47555 ind./m2, sendo o trecho onde a espécie foi primariamente detectada (P6-P8) o que apresentou as maiores densidades. A biomassa retirada foi de 4,578 kg e foram observados dois picos de biomassa, em março/2007 e novembro/2007. A dispersão de M. tuberculatus neste riacho foi predominantemente ativa, em um processo contra a corrente: em julho/2006 a espécie só ocorria entre o P6 e o P8, em setembro/2006 a identificamos no P5 e em maio/2007 no P4. As médias de tamanho nos pontos de coleta recém colonizados eram sempre maiores que nos pontos colonizados há mais tempo. O agrupamento obtido na Análise Discriminante com os dados da comunidade de macroinvertebrados reflete a alteração da comunidade provocada por M. tuberculatus, juntando os pontos de coleta onde não há a presença da espécie exótica e em outro grupo os pontos onde a espécie já ocorre, entre estes dois extremos ficaram os pontos colonizados durante o estudo. Foi observado o efeito negativo de M. tuberculatus sobre Chironomidae, Odonata e Pisidium punctiferum (Guppy, 1867) (regressões com tendência negativa e p<0,05). Estas espécies também foram menos abundantes nos pontos de coleta nos quais a espécie exótica ocorria. Efeitos não conclusivos foram observados sobre outros grupos. Concluímos que M. tuberculatus apresentou um crescimento populacional em quatro fases, como o demonstrado para outras espécies exóticas invasoras; sua dispersão ao longo do riacho ocorre de forma ativa e, alterou a estrutura da comunidade afetando negativamente outras espécies. / Melanoides tuberculatus (Müller, 1774) is an afro-asiatic freshwater gastropod but nowadays with a cosmopolitan distribution, due his invasive behavior. In this study are used the name Melanoides tuberculatus, it is also found in literature the name Melanoides tuberculata (Müller, 1774), this last name is not in accordance with ICZN rules. We found reports of this species in 52 countries, 25 in native area of distribution and 27 in exotic area. This species was recently introduced in a stream in Vila do Abraão (Ilha Grande), possibly by an aquarist. The aim of this work was to evaluate M. tuberculatus population dynamics in the new habitat, as also the effects of this snail over the fauna. The study was conducted between July/2006 and May/2008 with collections every two months. The stream was divided in eight collecting stations, being P1 the most upstream and P8 the most upstream. In each collecting station were performed two collecting methodologies, timed search and Surber. Collected animals were screened, counted, measured and identified to the lowest possible taxonomic level. Environmental factors were measured in each collection station. Melanoides tuberculatus specimens were divided in four size classes (CL) according to the animal width(CL1 0.01 to 2,99 mm; CL2 3.00 to 5.99 mm; CL3 6.00 to 8.99 mm e CL4 >9.00 mm). Data analysis was done in Excel and SYSTAT 12. The M. tuberculatus population showed a four stages growth: lag, exponential growth, falling and stabilization, a pattern different from others freshwater snails in this stream. Population maximum size was reached in November/2007, when was collected 3156 snails. This species reproduced along the year but with a reproduction peak from May/2007 to September/2007, when CL1 represented more than 50% of collected snails. Mortality was concentrated in biggest specimens (CL3 e CL4), CL4 represented less than 5% of collected snails. All parasitological tests were negative, so interactions with helminthes in the study period are nonexistent. Males are not observed in this population, being a entire partenogenetic population. Melanoides tuberculatus reached a dense population in this stream; maximum estimated density was 47555 snails/m2 on the place that this snail was first observed (P6-P8). Estimated removed biomass was 4,578 kg and was observed two biomass peaks in March/2007 and November/2007. Melanoides tuberculatus dispersal in this stream was active going upstream, reaching P5 in September/2006 and P4 in May/2007. The average size in recently colonized collection stations was bigger than in the other collection stations at the same time. Community composition groups obtained in Discriminant Analysis was influenced by distribution of M. tuberculatus in the stream, in one group was joined the collection stations without M. tuberculatus, in other group the stations with M. tuberculatus. The negative effect of this species was observed over Chironomidae, Odonata and Pisidium punctiferum (Guppy, 1867) (regression with negative tendencies and p<0,05). This species were less abundant in collect stations where M. tubercuatus occurs. Finally, we conclude that M. tuberculatus had a population growth in four stages, as described for other exotic invasive species; dispersion in this stream was active and changed community structure with negative effects over other species.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Fanerógamas marinhas (gramas marinhas) são plantas com flores adaptadas ao ambiente marinho costeiro da maioria dos continentes do mundo. As gramas marinhas formam extensos bancos e proveem valiosos recursos em águas costeiras rasas em todo o mundo, servindo de alimento e berçário para espécies importantes de pescados comerciais e recreacionais. Nesse estudo foi realizada uma revisão sobre o estado de conhecimento das fanerógamas marinhas no Brasil até o presente momento; avaliou-se a importância do monitoramento em longo prazo e a influência de fatores ambientais, como o número de manchas solares; pesquisou-se também a distribuição espacial da grama marinha, bem como a fauna e flora associada; e o crescimento de Halodule wrightii em duas condições ambientais extremas (exposta no ciclo de maré baixa e permanentemente submersa). A revisão bibliográfica sobre as gramas marinhas foi abrangente e verificou a existência de algumas lacunas no conhecimento. Através do monitoramento a longo prazo pôde ser observado que o número de manchas solares tem forte relação negativa sobre a altura do dossel das gramas marinhas de região entre marés. A variação de marés na região de mediolitoral está relacionada diretamente com a distribuição espacial de Halodule wrightii e, consequentemente na distribuição da fauna e flora associada. A diferença de crescimento nos eixos de Halodule wrightii em condições ambientais diferentes é compensada pelas variações nas características de distribuição da planta no ambiente, tais como a altura do dossel, a densidade e biomassa de eixos. O monitoramento a longo prazo pode permitir a tomada de ações que auxiliem no manejo e na recuperação desses importantes habitats costeiros. / Seagrass are flowering plants adapted to coastal marine environments of most continents of the world. Seagrasses form extensive meadows and provide valuable resources in shallow coastal waters worldwide, serving as food and nursery areas for important species of commercial and recreational fish. This study is: a review of the state of knowledge up to now of seagrass in Brazil; an assessment of the importance of long-term monitoring and the influence of long-term environmental factors, such as sunspot number; an analysis of the spacial distribution of seagrass and its associated flora and fauna; an investigation of the growth of Halodule wrightii in two spatially discrete extreme environmental conditions (exposed at low tide cycle and permanently submerged). The literature review on the seagrass was comprehensive and verified the existence of some gaps in knowledge. By monitoring over the long term it could be observed that the number of sunspots has a strong negative relationship with the canopy height of seagrass in the intertidal region. The variation of tides in the intertidal region is directly related to the spatial distribution of Halodule wrightii, and consequently the distribution of fauna and flora associated. Under different environmental conditions the variation in shoot growth of Halodule wrightii is compensated for by variations in the distribution of biomass in the plants, such as canopy height, density and biomass of shoots. The long-term monitoring may allow action to be the taken in order to assist in the management and recovery of these important coastal habitats.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-12-12Bitstream added on 2014-06-13T19:04:54Z : No. of bitstreams: 1 almeida_ej_dr_jabo.pdf: 2925633 bytes, checksum: 1794e969fffc6c2ce4cdd74354b559fc (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho teve os objetivos de estudar comparativamente os caracteres morfológicos e morfométricos úteis para distinção entre Meloidogyne mayaguensis e M. incognita; quantificar os danos causados à goiabeira ‘Paluma’, em formação, por M. mayaguensis em níveis crescentes de inóculo; caracterizar o desbalanço nutricional e a fenologia da goiabeira ‘Paluma’ face à infecção pelo nematóide; avaliar a hospedabilidade de outras frutíferas e plantas invasoras a esse patógeno; estudar a flutuação populacional do nematóide em pomar de goiabeira ‘Paluma’; prospectar materiais resistentes a M. mayaguensis dentre diversos acessos de Psidium guajava e Psidium spp. e avaliar a compatibilidade desses materiais como porta-enxerto para goiabeira ‘Paluma’. Os dados indicam que a morfologia do padrão perineal e da região labial dos machos são suficientes para a distinção segura entre M. mayaguensis e M. incognita. As medidas do diâmetro do tronco, comprimento das três pernadas, massa fresca e seca da parte aérea, retirada nas podas, área de folhas individuais, comprimento, largura, número por planta e massa dos frutos foram inversamente proporcionais aos níveis de inóculo de 0, 10, 100, 1.000 e 10.000 ovos e juvenis/planta. Os teores de N, P e K decresceram de folhas sem sintomas para folhas com o sintoma leve e severo, nas análises realizadas em fevereiro e agosto. / This work had the objectives of to study the morphologic characters and useful morfometric comparatively for distinction between Meloidogyne mayaguensis and M. incognita; to quantify the damages caused to the guava 'Paluma', in growing, for M. mayaguensis in growing levels of inocula; to characterize the nutritional imbalance and the fenology of the guava 'Paluma' face to the infection for the nematode; to evaluate the host suitability of other fruitful ones and its weeds to that pathogen; to study the population fluctuation of the plant parasitic nematode in guava orchard 'Pedro Sato'; resistant material prospect to M. mayaguensis between several accesses of Psidium guajava and Psidium spp. and to evaluate the compatibility of those materials as rootstock for guava 'Paluma'. The data indicate that the morphology of the perineal pattern and of the labial area of the males they are enough for the distinction it holds between M. mayaguensis and M. incognita. The measures of the diameter of the log, length of the three blanches, fresh and dry mass of the blanches, retreat in the pruning, area of individual leaves, length, width, number for plant and mass of the fruits was inversely proportional at the levels of inocula of 0; 10; 100; 1,000 and 10,000 eggs and juveniles/plant. The tenors of N, P and K decreased of leaves without symptoms for leaves with the light and severe symptom, in the analyses accomplished in February and August. The Ca had your concentration increased with the worsening of the symptoms, in February and August and Mg only in August. Sulfur had a larger concentration in leaves without symptoms, in February. In August, the leaves with severe symptoms presented larger concentrations of S.