Les objectifs de cette thèse sont (1) de définir les facteurs contrôlant le développement à grande échelle des plateformes carbonatées intracratoniques et (2) de relier la diagenèse précoce des discontinuités avec les paléoenvironnements et les modèles de stratigraphie séquentielle. L’évolution de la plateforme carbonatée de l’ouest de la France a été reconstituée de l’Aalénien à l’Oxfordien (17 millions d’années). La topographie du socle contrôle la répartition latérale des bathymétries jusqu’au Bathonien moyen. La tectonique régionale favorise ou empêche localement la production carbonatée. À l’échelle des bassins ouest-téthysiens, des phases généralisées de disparition et de croissance des plateformes carbonatées sont contrôlées par les variations du climat d’une période de 9 millions d’années. La production carbonatée est faible pendant les périodes humides et importante au cours des périodes sèches perturbées par de courtes moussons. Des analyses isotopiques (δ18O et δ13C) à haute résolution ont été réalisées sur des ciments précoces variés localisés sous des discontinuités, permettant de reconstituer l’histoire paléoenvironnementale aboutissant à leur formation. Les ciments en dents de chien ainsi que les ménisques et enveloppes micritiques analysées ont précipité directement en calcite faiblement magnésienne dans l’eau de mer. Un nouveau modèle reliant architecture, stratigraphie séquentielle, faciès et diagenèse précoce est proposé pour une bordure de plateforme oolithique. Sur la plateforme interne, les discontinuités passent latéralement de surfaces subaériennes à des hardgrounds marins, dont l’érosion aboutit au dépôt de niveaux à intraclastes sur la bordure de plateforme. La cimentation précoce est uniquement localisée sous les discontinuités et est absente dans la bordure de plateforme où la sédimentation est continue. / The objectives of this thesis are (1) to characterize the factors controlling the large-scale development of intracratonic carbonate platforms and (2) to link early diagenesis of discontinuities with palaeoenvironments and sequence stratigraphy models. The evolution of the western France carbonate platform is reconstructed from the Aalenian to the Oxfordian (17 million years). The basement topography controls bathymetries until the mid-Bathonian. Regional tectonics promotes or prevents locally carbonate production. General stages of carbonate platform growth and demise in western Tethyan basins are controlled by 9 million years’ climatic variations. Carbonate production is low during humid intervals and high during dry intervals disturbed by short periods of intensive rainfall. High resolution isotopic analyses(δ18O and δ13C) were performed on various early cements located below discontinuities to reconstruct the palaeoenvironmental conditions leading to their formation. Dogtooth cements, micritic meniscus and envelopes precipitated in low-magnesium calcite directly in seawater. A new model, linking architecture, facies, sequence stratigraphy and early diagenesis is proposed for an oolitic platform wedge. On the inner platform, discontinuities change laterally from subaerial surfaces to marine hardgrounds, whose erosion leads to the deposit of an intraclasts level on the platform wedge. Early cements are only located under discontinuities and are absent in the platform wedge because of a continuous sedimentation rate.

Les infections multiples sont courantes dans la nature et sont considérées comme très importantes dans l'évolution des caractéristiques biologiques des parasites. Théoriquement, les infections multiples devraient entraîner une évolution de la virulence à la fois comme stratégie adaptative et comme stratégie plastique. Dans cette thèse, j'utilise Hyaloperonospora arabidopsidis, un parasite naturel d'Arabidopsis thaliana, qui s'est avéré pratique pour des études en écologie évolutive, pour étudier: i) les infections multiples consécutives à la co-inoculation et à l'inoculation séquentielle; succès de l'infection et succès de transmission d’une souche individuelle (génotypage par PCR) et des phénotypes d'infection, y compris virulence entre inoculation unique et mixte, iii) effet du délai d'inoculation et d'ordre des souches inoculées sur les phénotypes d'infection et le succès de l'infection individuelle. Ici, j'ai trouvé une fréquence plus élevée de co-infection à la suite de l'inoculation séquentielle que à la suite de la co-inoculation des mêmes combinaisons de souches. L'inoculation mixte de certaines combinaisons de souches a entraîné une modification des phénotypes d'infection, souvent avec un succès d'infection plus faible chez certaines souches à la suite des inoculations en mélanges qu’en inoculation simple. Ce résultat implique une interférence entre les souches dans l'inoculum mixte. La virulence globale de l'infection après l'inoculation mixte n'était pas toujours supérieure à celle de l'infection à souche simple. De plus, les souches uniques utilisées dans ces expériences ne différaient pas toujours les unes des autres en termes de virulence. Le seul test d'un mélange de génotypes à trois souches a provoqué une virulence globale plus élevée que les trois infections à souche unique respectives. Une plus grande virulence globale dans ce cas pourrait être due à la plasticité des souches parasitaires inoculées, à la réponse à la présence d'autres souches dans l'inoculum mixte ou à l'effet de multiples souches supprimant le système de défense de l'hôte. Lorsque les souches ont été inoculées de manière séquentielle et non ensemble, le succès de l'infection de souches individuelles différait entre les différents ordres d'inoculation, ce qui pourrait être dû à des effets indirects via le système de défense de l'hôte. En résumé, l'inoculation séquentielle a semblé réduire l'interférence entre les souches parasitaires, avec un effet de décalage temporel et d'ordre de la souche inoculée sur le succès de l'infection de souches individuelles. Une interférence dans un inoculum mixte peut générer différents succès d'infection et phénotypes d'infection à partir des inoculations individuelles respectives. J'ai trouvé un cas évident de virulence globale plus élevée dans les infections causées par des inoculations mixtes. Par conséquent, une virulence globale plus élevée peut se produire malgré le fait que nous ne trouvions pas de meilleures performances de génotypes plus virulents dans des infections à la suite d'inoculations mixtes. Ainsi, ces résultats ne permettent pas de prédire l’évolution de la virulence supérieure parmi ces combinaisons de souches testées. Cependant, la plasticité des phénotypes des souches inoculées dans l'inoculum mixte a généré une virulence globale de l'infection plus élevée. Ces résultats peuvent aider à comprendre comment les génotypes de parasites répondent aux infections mixtes. / Multiple infections are common in nature, and are considered very important in the evolution of parasite life-history traits. Theoretically, multiple infections should lead to evolution of higher levels of virulence both as an adaptive and as a plastic strategy. In this thesis I use Hyaloperonospora arabidopsidis, a natural parasite of Arabidopsis thaliana, which has proven a useful tool for unlocking some evolutionary ecology questions, to investigate: i) multiple infections following co-inoculation and sequential inoculation, ii) number of infected plants, infection success and transmission success of individual strain (genotyping via PCR), and infection phenotypes including virulence between after single- and mixed inoculation, iii) effect of time lag of inoculation and order of inoculated strain on infection phenotypes and individual strain infection success. Here I found that sequential inoculation contributed higher frequency of co-infection than co-inoculation of the same strain combinations. Mixed inoculum of some strain combinations led to modification of overall infection phenotypes, often with poorer infection success of individual strains compared with that of the more infectious strains. This result implies interference between strains in mixed inoculum. Overall virulence of infection after mixed inoculation was not always higher than that of single strain infection. Furthermore the single strains used in these experiments did not always differ from each other in virulence. The one test of a three-strain mixture of genotypes caused higher overall virulence than the three respective single strain infections. Higher overall virulence in this case might be caused by plasticity of inoculated parasite strains reponse to the presence of other strains in mixed inoculum or an effect of multiple strains suppressing the host defence system. When strains were inoculated sequentially instead of together, infection success of individual strains differed between different orders of inoculation, which could be due to indirect effects via the host defence system. In summary, sequential inoculation seemed to reduce interference between parasite strains, with effect of time lag and order of inoculated strain on infection success of individual strains. Interference in mixed inoculum can generate different infection successs and infection phenotypes from the respective single inoculations. I found one clear case of higher overall virulence in infections caused by mixed inoculations. Thus higher overall virulence can occur despite our not finding higher performance of more virulent genotypes from infections following mixed inoculations. Thus these finding do not predict the evolution of higher virulence among these strain combinations tested. However, plasticity of phenotypes of inoculated strains in mixed inoculum did generate higher overall virulence of infection. These findings can help to understand how the parasite genotypes respond to in mixed infections.

L'objectif principal de cette thèse est la mise au point d'une méthodologie de travail pour l'optimisation, hors ligne, des conditions opératoires applicables en conduite des procédés alimentaires. La première partie du travail est consacrée à l'élaboration d'une stratégie d'optimisation en deux étapes : la construction du problème d'optimisation et le choix de la méthode de résolution. Ce dernier point est réalisé à l'aide d'un diagramme décisionnel, qui propose une méthode d'optimisation déterministe (la programmation quadratique séquentielle, SQP), une méthode stochastique (l'algorithme génétique, AG) ou bien, une méthode hybride (AG-SQP). La méthodologie est adaptée aux caractéristiques des procédés alimentaires, c'est-à-dire à des systèmes dynamiques, non linéaires, multivariables et soumis aux contraintes diverses. L'optimisation est réalisée numériquement à l'aide d'un modèle dynamique du système. Dans la deuxième partie du travail, la méthodologie est appliquée à trois procédés alimentaires afin d'obtenir les trajectoires des variables de commande optimisant un critère économique, technologique ou de qualité : un procédé discontinu de séchage du riz, un procédé discontinu de déshydratation, imprégnation d'un produit carné par immersion et un procédé continu de cuisson des biscuits. Ces trois applications mettent en évidence, d'une part, la capacité de la stratégie d'optimisation à gérer différents types de problèmes posés par les procédés alimentaires, et d'autre part, le bénéfice qu'une démarche d'optimisation peut apporter lors de la conduite des procédés. Cette méthodologie peut être appliquée dans un grand nombre des procédés alimentaires. La performance des résultats dépend néanmoins de l'utilisation d'un modèle de système fiable, de la prise en compte des caractéristiques de la matière première lors du calcul de l'optimum et de la poursuite des conditions optimales à l'aide d'un bon système de commande.

Ce travail concerne le Trias alpin de la partie septentrionale de Belledonne : affleurements de la Girotte, de la vallée de l'Arly, Crest Volland et Signal de Bisane. La sédimentation continentale est étudiée dans des zones à la tectonique très active.

L'étude du bassin du Chiapas nous a amené à mettre au point une zonation basée sur les foraminifères planctoniques, zonation qui peut être exactement corrélée avec celle des bassins européens. Cette zonation a conduit à un découpage en 8 zones du Paléocène: 4 au Danien, 2 au Sélandien et 2 au Thanétien. Elle nous a permis de corréler les évènements majeurs enregistrés dans les Chiapas avec ceux des bassins européens. Nous avons ainsi retrouvé deux régressions très importantes à la limite Danien/Sélandien (limite des zones à Acarinina uncinata et à Morozovella angulata) et au sommet du Thanétien (limite des zones à Luterbacheria pseudomenardii et à Morozovella velascoensis) et deux épisodes transgressifs majeurs dans le Sélandien (zone à Igorina albeari) et dans le Thanétien (zone à Luterbacheria pseudomenardii). Le bassin paléocène du Chiapas est pourtant un bassin étroitement contrôlé par la tectonique liée aux grandes failles est-ouest de décrochement senestre qui ont joué un rôle dans la délimitation du rebord de la plate-forme au Danien et dans les périodes d'intenses remaniement gravitaires, tant à la limite Danien/Sélandien que dans le Thanétien au sommet de la zone à Luterbacheria pseudomenardii.

La synthèse des connaissances sur la sédimentation au Berriasien supérieur et au Valanginien inférieur dans les domaines jurassien et nord-vocontien et l'homogénéisation des interprétations séquentielles ont abouti à une reconstruction de l'agencement des corps sédimentaires le long d'un transect plate-forme-bassin. Une interprétation phylogénétique de l'évolution des faunes de calpionelles en domaine de bassin autorise un nouveau découpage zonal à très haute résolution (précision de l'ordre de +/- 250 000 ans) notamment pour l'intervalle Berriasien supérieur-Valanginien inférieur. Dans ce cadre chronostratigraphique, les répartitions de quelques foraminifères benthiques ont également pu être calées et utilisées pour les corrélations à longue distance. Une trentaine de coupes en domaine de bassin, de talus et de plate-forme a fait l'objet d'une étude sédimentologique et biostratigraphique fine qui a permis d'enrichir le découpage séquentiel. La nature et l'importance des transferts de sédiments dans les corps sédimentaires en fonction des variations du niveau marin relatif ont pu être ainsi estimés. Il ressort de cette étude que la plupart des particules sédimentaires dans les dépôts carbonatés peuvent être, contrairement à l'idée classiquement admise, allochtones, comme dans le cas des dépôts silicoclastiques. Depuis la plate-forme jurassienne jusqu'au Bassin Vocontien, les corrélations biochronologiques, séquentielles et géométriques aboutissent à un schéma correspondant à une morphologie de rampe carbonatée complexe pour la période étudiée. Dans cet intervalle, le long du transect, les accumulations sédimentaires sont particulièrement disproportionnées: - Sur la plate-forme, notamment dans les parties les plus internes (Jura neuchâtelois), l'ensemble Berriasien-Valanginien n'excède pas 25 mètres: les séquences Be0, Be1, Be2, Be3, Va0 et Va3 ne sont représentées que très partiellement, les autres séquences Be4, Be5 et Val ont été érodées (karstifiées) ou n'ont pas été déposées (Be6). Certaines séquences (Be5 ou Va3) sont préservés de façon très variable d'une coupe à l'autre en domaine de plate-forme, l'importance des matériaux remaniés et l'irrégularité de la surface qui les caractérise semble liée à des géométries de vallées incisées. - Dans la partie médiane de la rampe (bordure de plate-forme et talus), le même intervalle stratigraphique peut être représenté par plus de 500 mètres de dépôt ; les séquences de dépôt qui constituent la série deviennent de plus en plus complètes et de nouveaux corps sédimentaires apparaissent (cortèges de bas niveau progradant et agradant). - Dans le bassin, la sédimentation est aussi lacunaire (limite de séquence Va0 par exemple) à cause de la présence de surfaces de discontinuité (liées ou non à des remaniements gravitaires). Les séquences de dépôt qui constituent la série deviennent de plus en plus complètes en direction du talus et de nouveaux corps sédimentaires apparaissent (cortèges de bas niveau). La synthèse des coupes de terrain a abouti à un transect à haute résolution chonostratigraphique qui permet par encadrement des corrélations fines à l'échelle de la séquence de dépôt. Ces datations montrent qu'en domaine de plate-forme, les intervalles de temps documentés par des sédiments sont beaucoup plus réduits que les intervalles de temps correspondant aux périodes de non-dépôt ou de non préservation des dépôts.

La ségrégation séquentielle n'a été que très peu étudiée avec des signaux de parole et il est donc difficile d'évaluer l'implication de ce mécanisme dans la séparation de voix concurrentes. Il est aussi difficile d'identifier les indices qui sont pertinents pour la séparation de signaux de parole, ces indices ayant surtout été étudiés isolément à l'aide de signaux très simples. L'objet de cette thèse est d'étudier les indices perceptifs impliqués dans la ségrégation séquentielle de voyelles différant par leur hauteur fondamentale. Les investigations menées montrent que les indices spectraux de hauteur jouent un rôle dans ce phénomène. En revanche, la périodicité de l'enveloppe temporelle ne semble pas constituer un indice de hauteur exploitable dans le cas de la parole. Enfin, il semble que la capacité des sujets à percevoir ces deux types d'indices ne permette pas d'expliquer l'ensemble des variations de performances des sujets dans une tâche de ségrégation séquentielle de voyelles.

Le Quaternaire terminal a été le théâtre de changements importants du climat, à l'échelle de la dizaine ou de la centaine de milliers d'années. Ces fluctuations ont affecté les enregistrements sédimentaires continentaux et marins à travers le monde. Même si la variabilité du climat est maintenant bien reconnue, les changements associés du niveau marin absolu et de l'environnement, ainsi que l'empreinte de ces changements sur l'organisation stratigraphique restent à préciser.<br />Les travaux entrepris depuis une dizaine d'années sur la marge du Golfe du Lion (Méditerranée occidentale) montrent qu'il s'agit d'une zone exceptionnelle pour explorer l'impact de la variabilité climatique et glacio-eustatique sur l'organisation stratigraphique des sédiments. Les séquences sédimentaires liées aux grands cycles tardi-pléistocènes de 100 000 ans, révélées par la sismique, ont été échantillonnées et interprétées grâce aux données multi-proxies des forages du projet européen "Promess-1". La révision du modèle stratigraphique de la marge, propagé sur l'ensemble de la plateforme, a contribué à préciser les modèles conceptuels de la stratigraphie séquentielle. L'analyse sismo- et litho-stratigraphique à plus haute résolution révèle également l'enregistrement de séquences liées à des cycles climatiques beaucoup plus courts durant le dernier cycle glaciaire (~130 000 ans). L'association des événements de Heinrich et de Dansgaard-Oeschger dans les cycles génériques de Bond présente une expression stratigraphique distincte, sous la forme de paraséquences régressives. Enfin, la modélisation de l'agencement des structures sédimentaires associées à la remontée du niveau marin lors de la dernière déglaciation (~20 000 ans) souligne le rôle des événements climatiques extrêmes dans la formation du message sédimentaire. Cette étude présente enfin une confirmation semi-quantitative et bien contrainte dans le temps, du rôle fondamental des variations du niveau marin et des flux sédimentaires dans l'organisation des séquences de dépôt, y compris à l'échelle des événements climatiques rapides.

Cette étude est consacrée à la modélisation spatio-temporelle de la pollution atmosphérique urbaine en utilisant un ensemble de méthodes statistiques exploitant les mesures de concentrations de polluants (NO2, O3) fournies par un réseau de surveillance de la qualité de l'air (AIRPARIF). Le principal objectif visé est l'amélioration de la cartographie des champs de concentration de polluants (le domaine d'intérêt étant la région d'Île-de-France) en utilisant, d'une part, des méthodes d'interpolation basées sur la structure spatiale ou spatio-temporelle des observations (krigeage spatial ou spatio-temporel), et d'autre part, des algorithmes, prenant en compte les mesures, pour corriger les sorties d'un modèle déterministe (Filtre de Kalman d'Ensemble). Les résultats obtenus montrent que dans le cas du dioxyde d'azote la cartographie basée uniquement sur l'interpolation spatiale (le krigeage) conduit à des résultats satisfaisants, car la répartition spatiale des stations est bonne. En revanche, pour l'ozone, c'est l'assimilation séquentielle de données appliquée au modèle (CHIMERE) qui permet une meilleure reconstitution de la forme et de la position du panache pendant les épisodes de forte pollution analysés. En complément de la cartographie, un autre but de ce travail est d'effectuer localement la prévision des niveaux d'ozone sur un horizon de 24 heures. L'approche choisie est celle mettant en œuvre des méthodes de type réseaux neuronaux. Les résultats obtenus en appliquant deux types d'architectures neuronales indiquent une précision correcte surtout pour les 8 premières heures de l'horizon de prédiction

Le vieillissement de la population entraîne une hausse des maladies chroniques telle que la maladie d’Alzheimer dans nos sociétés occidentales. L’enjeu du vieillissement se répercute aussi dans les réformes de nos politiques sociales, et plus généralement dans la gestion des services publics. Dans ce contexte, le régime de santé publique québécois connaît diverses modifications concernant la prestation de soins de première ligne. De nouveaux acteurs acquièrent des rôles et des responsabilités définissant des enjeux particuliers. Nous étudierons l’un de ces enjeux. Ce mémoire vise à spécifier les processus sociaux à la base de l’isolement des aidants familiaux de personnes atteintes par la maladie d’Alzheimer. La stigmatisation des aidants et les microprocessus afférents sont les principaux mécanismes analysés. Les données sont extraites d’entrevues semi-structurées réalisées avec une cohorte d’aidants familiaux (N=60) suivie longitudinalement depuis le début de leur trajectoire de soins. Une démarche qualitative soutient ce projet. Nous avons analysé un échantillon de douze participants au moyen d’une approche séquentielle. Trois processus typiques ont été identifiés : le stigma de forme en ruptures (séparation sociale), le stigma de forme transitoire (stigma transitoire) et le stigma de forme anomique (anomie sociale). Les résultats suggèrent que les réseaux sociaux des aidants sont soumis à un ensemble de conditions favorisant la structuration du stigma social, la principale condition étant un enjeu de pouvoir concernant le contrôle de la personne malade. Les aidants conjoints de personnes atteintes sont plus enclins à la stigmatisation en début de trajectoire. / Aging populations in western societies contribute to the raise of chronic illnesses such as Alzheimer disease. The issue of aging also echoes in recent political reforms and more generally in the way we manage public services. In this context, Quebec’s public health regime has known diverse modifications concerning “first line caregiving” (soins de première ligne). New actors of the public system have acquired roles and responsibilities defining particular issues. We address one of these issues. This research aims at specifying the social processes inherent to the isolation of family caregivers helping a relative suffering from Alzheimer disease. The stigmatization process and related microprocesses are the principal mechanisms analysed. The data derives from in-depth, semi-structured interviews, realised with a cohort of sixty family caregivers followed longitudinally since the beginning of their care trajectories. A qualitative scheme bears out our investigation. We have analysed a sample of twelve participants using a sequential approach. Three typical processes were identified: social separation, transitory stigma and social anomia. Results suggest that the caregivers’ support networks are subjected to a setting of conditions structuring social stigma, the recurrent condition being an issue of power implying the social control of the ill relative. Caregivers who also are the spouses of the ill relative are the most inclined to stigmatization in early trajectory.