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Bactérias associadas a variedades de cana-de-açúcar cultivadas em Pernambuco: diversidade genética e produção de ácido indol acético / Bacteria associated of varieties of sugar cane cultivated in Pernambuco: genetic diversity and indole acetic acid productionRAMOS, Andresa Priscila de Souza 26 August 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-08-26 / The association between bacteria and plants is considered extremely important because it may promote the plant development by providing nutrients, protection, and production of plant growth promoting substances like indole acetic acid (IAA). The sugarcane production is under a great economic and agricultural importance, and increasing its production still depending on several chemical inputs that are expensive and environmentally damaging. A sustainable alternative is the use of beneficial bacteria that may diminish or abolish the use of these inputs and increase agricultural production. Therefore, the objectives of this study were: i) selecting and evaluating IAA producing bacteria, dependent and independent pathway of tryptophan, sugarcane roots plant association in crop fields in Pernambuco, ii) evaluate the influence of niche isolation, the place of cultivation, the cultivation time and host plant genotype on frequency and IAA-producing bacteria; iii) Analyze the genetic variability of IAA-producing bacteria by BOX-PCR, and iv) assess the noncultivable bacterial community sugarcane ratoon-associated v) Evaluate the production of IAA, two endophytic bacteria according to the time. Isolates were studied at four and ten months sugarcane plant cultivation, collected in EECAC Carpina-PE and Petribú factory,Lagoa de Itaenga-PE and isolates from three months on sugarcane plant-ratoon regrowth, collected in EECAC. The results showed that plants from sugarcane crop fields in Pernambuco have a high frequency of bacteria producing IAA in vitro by a tryptophan-dependent and independent pathways, the crop place, cultivation time of the host plant and niche colonization. Bacterial influence on the distribution of IAA-producing bacteria. In addition, the location, time of cultivation of the host plant genotype and bacterial niche colonization influenced the production levels. The strains showed high genetic variability. In sugarcane plant-ratoon, the bacterial population density was higher than in the rizhosphericsoil and root-endophytic bacteria also showed a high frequency capacity to produce IAA in vitro. Analysis of variability and genetic diversity revealed high genetic variability among bacteria producing IAA and the predominance of dominant bacterial groups not grown in soil and inside the roots of sugarcane plant-ratoon grown in Pernambuco. Some strains of root endophytic sugarcane plant, with capacity to produce IAA, were identified as belonging to the genus Enterobacter and Burkholderia / A associação entre bactérias benéficas e plantas é considerada extremamente importante, pois pode promover o desenvolvimento do vegetal através da disponibilização de nutrientes, proteção e produção de substâncias promotoras de crescimento vegetal, como o ácido indol acético (AIA). A canade- açúcar é uma cultura de grande importância agrícola e econômica, e sua produção crescente ainda depende de diversos insumos químicos que são onerosos e prejudicam o ambiente. Uma alternativa sustentável seria a utilização de bactérias benéficas que possam diminuir ou anular o uso desses insumos e incrementar a produção agrícola. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram: i) selecionar e avaliar bactérias produtoras de AIA, via dependente e independente de triptofano, associadas a raízes de plantas de cana-de-açúcar cultivadas em Pernambuco; ii) avaliar a influência dos nichos de colonização, do local e tempo de cultivo e do genótipo da planta hospedeira sobre a frequência e produção de bactérias produtoras de AIA; iii) analisar a variabilidade genética de bactérias produtoras de AIA por BOX-PCR; iv) avaliar a comunidade bacteriana não cultivável associada a cana soca; v) e avaliar a produção de AIA, de duas bactérias endofíticas, em função do tempo. Foram estudadas bactérias isoladas aos quatro e dez meses de cultivo de cana planta, coletadas na EECAC- Carpina-PE e na Usina Petribú- Lagoa de Itaenga-PE e linhagens isoladas aos três meses de rebrota na cana soca, coletadas na EECAC. Os resultados demonstraram que as plantas de cana-deaçúcar cultivadas em Pernambuco apresentam alta frequência de bactérias com capacidade de produzir AIA in vitro, via dependente e independente de triptofano, e que o local, tempo de cultivo da planta hospedeira e o nicho de colonização bacteriana influenciaram na distribuição das bactérias produtoras de AIA. Além disso, o local, tempo de cultivo, genótipo da planta hospedeira e o nicho de colonização bacteriana influenciaram nos níveis de produção e as linhagens apresentaram alta variabilidade genética. Na cana soca, a densidade populacional bacteriana foi maior no solo rizosférico do que endofítica de raiz e também apresentaram alta frequência de bactérias com capacidade de produzir AIA in vitro. A análise da variabilidade e diversidade genética revelaram alta variabilidade genética entre as bactérias produtoras de AIA e a predominância de grupos bacterianos dominantes, não cultivados, no solo e no interior das raízes de cana soca, cultivadas em Pernambuco. Algumas linhagens endofíticas de raiz de cana planta, com capacidade de produzir AIA, foram identificadas como pertencentes aos gêneros Burkholderia e Enterobacter
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Efeitos de estresses bióticos sobre os parâmetros ecofisiológicos e componentes de produção de quatro variedades de cana-de-açúcar / Biotic stresses effects on the ecophysiological parameters and yield components of four sugarcane varietiesSilva, Fábio Leal Santos da 31 July 2015 (has links)
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Brazil is the main world producer of sugarcane (Saccharum ssp.), being the activity of the
Brazilian sugarcane industry in continuous expansion, which can be seen due to increasing
both the production capacity as agricultural areas intended for the cultivation. However, the
increase of the production costs and the expansion of cultivation to less productive areas have
increasingly demanded strategies to safeguard the sector's profitability. In this sense, studies
of environmental factors that limit the yield of sugarcane crops are fundamental and can cite
the biotic stresses caused by pathogenic microorganisms and the weeds. Plants respond
differently to various types of stress, and, in general, are firstly affected in their physiological
and photosynthetic properties. Therefore, the analysis of ecophysiological parameters - being
this a tool to detect small deviations from normality of the photosynthetic performance - can
provide useful information about the behavior of plants under stressful conditions caused by
the disease and weed competition. Thus, this study aimed to evaluate the behavior of four
different sugarcane varieties submitted to the stresses caused by the bacterium Leifsonia xyli
subsp. xyli (Lxx) - causal agent of Ratoon stunting disease (RSD) - and competition with the
weed plant Brachiaria decumbens Stapf., correlating the production data with the
ecophysiological responses resulting from the stress condition. To this finality, stem segments
with just one bud were planted in plastic trays and kept in a greenhouse, being the seedlings
subsequently transplanted to the field, where were measured both yield parameters (biometric
and technological), the fluorescence of chlorophyll a and the gas exchange of plants subject,
or not, to mentioned stressors. The experimental design used was the randomized block
design with four replications, in a split-plot scheme, being the plots composed by varieties Co
997, RB867515, RB92579 and RB951541; and the subplots by the induction or not of stress
factor. Regarding Lxx inoculation, RB92579 and RB951541 varieties were less sensitive to
the RSD effects, since both ecophysiological and yield parameters were just a little bit
affected by disease, while RB867515 and Co 997 varieties underwent changes in many
parameters, highlighting the decline of photosynthetic rate and the reduction of height and
diameter of the stalks. Regarding weed competition with B. decumbens, the four varieties
tested were affected in all parameters, resulting in significant losses of yield, being that the
RB92579 variety showed higher competitive ability than the others. Thus, the use of
ecophysiological analysis tool is feasible to aid the work of selection of tolerant sugarcane
genotypes to typical adverse situations of his cultivation. / O Brasil é o principal produtor mundial de cana-de-açúcar (Saccharum ssp.), entando a
atividade do setor sucroenergético brasileiro em contínua expansão, o que pode ser constatado
devido ao aumento crescente tanto da capacidade produtiva como das áreas agrícolas
destinadas à cultura. No entanto, o aumento dos custos de produção e a expansão do cultivo
para áreas menos produtivas têm exigido cada vez mais estratégias capazes de salvaguardar a
rentabilidade do setor. Nesse sentido, os estudos dos fatores ambientais que limitam o
rendimento dos canavias são fundamentais, podendo-se citar os estresses bióticos causados
pelos microrganismos fitopatogênicos e pelas plantas infestantes. As plantas respondem de
formas diferentes aos diversos tipos de estresse, sendo que, em geral, são primeiramente
afetadas em suas propriedades fisiológicas e fotossintéticas. Isto posto, a análise dos
parâmetros ecofisiológicos – sendo uma ferramenta capaz de detectar pequenos desvios da
normalidade do desempenho fotossintético – pode fornecer informações úteis acerca do
comportamento das plantas sob as condições estressantes causadas por doenças e pela
matocompetição. Assim, o presente estudo teve por objetivo avaliar o comportamento de
quatro diferentes variedades de cana-de-açúcar submetidas aos estresses causados pela
bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) – agente causal da doença Raquitismo da soqueira
(RSD) – e pela competição com a planta infestante Brachiaria decumbens Stapf.,
correlacionando os dados de produção com as respostas ecofisiológicas decorrentes da
condição de estresse. Para tal, segmentos de colmo com apenas uma gema foram plantados
em bandejas plásticas e mantidos em casa de vegetação, sendo as mudas posteriormente
transplantadas para o campo, onde foram mensurados os parâmetros de produção (biométricos
e tecnológicos), a fluorescência da clorofila a e as trocas gasosas de plantas sujeitas ou não
aos fatores de estresse mencionados. Foi utilizado o delineamento experimental em blocos
casualizados, com quatro repetições, em esquema de parcelas subdivididas, sendo as parcelas
compostas pelas variedades Co 997, RB867515, RB92579 e RB951541; e as subparcelas pela
imposição ou não do fator de estresse. Em relação à inoculação de Lxx, as variedades
RB92579 e RB951541 foram menos sensíveis aos efeitos do RSD, uma vez que, tanto
parâmetros ecofisiológicos como de produção foram pouco influenciados pela doença, ao
passo que as variedades RB867515 e Co 997 sofreram alterações em diversos parâmetros,
com destaque para o declínio da taxa fotossintética e redução da estatura e diâmetro dos
colmos. Em relação à matocompetição com B. decumbens, as quatro variedades testadas
foram afetadas em todos os parâmetros, acarretando em perdas expressivas de produtividade,
sendo a variedade RB92579 a que demonstrou maior habilidade competitiva. Assim, uso da
ferramenta de análise ecofisiológica é viável no auxílio aos trabalhos de seleção de genótipos
de cana-de-açúcar tolerantes às situações adversas própria do seu cultivo.
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