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Variação genética e filogenia de Pseudoplusia includens single nucleopolyhedrovirusCraveiro, Saluana Rocha 17 February 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2012. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-05-16T16:54:09Z
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2012_SaluanaRochaCraveiro_Parcial.pdf: 10672925 bytes, checksum: 0939eba1de8766746468f493f67e2742 (MD5) / A lagarta falsa-medideira (Pseudoplusia includens; Walker, 1857) tornou-se
uma praga de grande importância nas lavouras de soja no Brasil. Sete isolados virais,
caracterizados como variantes genotípicos do baculovirus Pseudoplusia includens
single nucleopolyhedrovirus(PsinSNPV), foram obtidos de larvas P. includens coletadas em plantações de soja e algodão no Brasil e Guatemala. Visando determinar a diversidade genética e filogenia de sete isolados de PsinSNPV (IA a IG), sequências parciais dos genes lef-8 e
lef-9(late expression factor), pif-2 (per os infectivity factor 2),phr (DNA photolyase)
e polh/gran (polyhedrin/granulin)foram obtidas e árvores filogenéticas foram construídas usando análises da máxima parcimônia (MP) e Bayesiana (IB).DNA de sete isolados foi amplificado por PCR utilizando
oligonucleotideos degenerados específicos aos genes lef-8, lef-9, pif-2, phr e polh/gran e as sequências obtidas foram de 513, 260, 357, 780 e 510 pb de tamanho,
respectivamente. Para cada gene, as sequências alinhadas mostraram pouco
polimorfismo nucleotídico entre os isolados de PsinSNPV. A relação filogenética de
PsinSNPV com outros 57 baculovirus sequenciados foi também determinada a partir de sequências nucleotídica e peptídica, individual e concatenada, dos genes lef-8, lef-9, pif-2 e polh/gran.
As árvores filogenéticas demostraram que PsinSNPV agrupou-se com os baculovirus do gênero Alphabaculovirus Grupo II, onde PsinSNPV é mais proximamente relacionado ao
Chrysodeixis chalcites NPV (ChchNPV) e
Trichoplusia ni SNPV (TnSNPV). Árvores filogenéticas por máxima parcimônia e Bayesiana foram obtidas da concatenação das sequências nucleotídicas dos cinco genes
lef-8, lef-9, phr, pif-2 epolh, onde pif
-2 foi o mais variável. As árvores exibiram dois grupos monofiléticos estreitamente relacionados, um contendo os isolados IB, IC e ID e o outro contendo os isolados IA, IE, IF e IG. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The soybean looper (Pseudoplusia includens
; Walker, 1857) has become a
major pest in soybean crops in Brazil. Seven isolates, characterized as genotypic
variants of the Pseudoplusia includens single nucleopolyhedrovirus(PsinSNPV)
baculovirus were obtained from
P. includenslarvae collected in soybean and cotton crops in Brazil and Guatemala. In order to determine the genetic diversity and
phylogeny of the seven isolates PsinSNPV (IA - IG), partial sequences of the genes lef-8and lef-9(late expression factor), pif-2
(per osinfectivity factor 2), phr
(DNA photolyase) and polh/gran
(polyhedrin/granulin) were obtained and phylogenetic trees constructed using maximum-parsimony (MP) and Bayesian analyses (IB). DNA from seven isolates was amplified by PCR using lef-8, lef-9, pif-2, phrand polh/gran
specific degenerate primers and the sequences obtained were 513, 260, 357, 780 and 510 bp long, respectively. For each gene, the aligned sequences showed little nucleotide polymorphism between PsinSNPV isolates. The phylogenetic relationship of PsinSNPV with 57 other baculoviruses was also determined from the individual and concatenated nucleotide and amino acid sequences of the genes lef-8,
lef-9, pif-2and polh. The phylogenetic trees clearly place PsinSNPV with the group II
Alphabaculovirus, where PsinSNPV is most closely related to ChchNPV and TnSNPV. Maximum parsimony and Bayesian phylogenetic trees were obtained from the concatenation of the nucleotide sequence of the five genes, lef-8, lef-9, phr, pif-2 andpolh, where pif-2 was by far the most variable.
The trees exhibited two closely related monophyletic groups, one containing the isolates IB, IC and ID and another containing the isolates IA, IE, IF and
IG.
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Epidemiologia e controle da antracnose em Capsicum spp. e identificação de Colletotrichum spp. associados às solanáceas cultivadasAzevedo, Caroline Pedroso de January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2006. / Submitted by Érika Rayanne Carvalho (carvalho.erika@ymail.com) on 2009-10-03T22:44:16Z
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Previous issue date: 2006 / A importância econômica de pimentões e pimentas do gênero Capsicum (Solanaceae), vem crescendo no Brasil e em diversos países, com aumento do consumo in natura ou pelo processamento de molhos, temperos e conservas de pimentas. Apesar dos avanços tecnológicos no sistema de produção, as doenças, como a antracnose, causada por Colletotrichum spp ainda representam um sério entrave à produtividade do pimentão, tanto em campo quanto em casa-de-vegetação. Dado ao crescimento da importância da antracnose em solanáceas e aos poucos relatos sobre medidas alternativas de controle voltadas para esse patossistema, este trabalho objetivou identificar isolados de Colletotrichum de Solanaceae cultivadas (no capítulo 1), avaliar o efeito do estádio fisiológico na resistência genética de frutos de diferentes espécies de Capsicum à doença (capítulo 2) e, por fim, avaliar medidas alternativas de controle através de testes da interação de controle químico e coberturas, além de manejo da adubação nitrogenada (capítulo 3). A antracnose em Capsicum pode ser causada por várias espécies de fungos do gênero Colletotrichum mas, no Brasil, a maioria dos relatos identificam Colletotrichum gloeosporioides como o principal agente causal da doença, com raros registros das demais espécies. No capítulo 1, vinte e dois isolados de Colletotrichum sp. foram estudados quanto ao crescimento micelial, coloração de colônias e morfometria e morfologia de conídios, e agressividade a frutos e plântula de Capsicum e outras solanáceas. Todos os cinco isolados de pimenta foram classificados como C. gloeosporioides, assim como a maioria dos de pimentão e um isolado de jiló. Os demais isolados foram identificados como C. acutatum. C. acutatum foi a espécie predominante entre os isolados de jiló. Os isolados mais agressivos em frutos de jiló foram aqueles originalmente isolados de frutos desta mesma espécie. Em geral, estes isolados foram também patogênicos ao pimentão. Os isolados que causaram maiores lesões em pimentão foram os isolados de pimenta e pimentão, e estes geralmente não foram capazes de causar lesões em fruto s de jiló.Os isolados mais agressivos aos frutos de jiló são da espécie C. acutatum, enquanto que os isolados mais agressivos ao pimentão são da espécie de C. gloeosporioides. A grande maioria dos isolados não foi capaz de causar sintomas em plântulas. Os resultados dos testes em plântulas foram insuficientes para diferenciar a agressividade ou a especificidade dos isolados. No capítulo 2, avaliou-se a reação de frutos verdes e maduros à inoculação com diferentes espécies de Colletotrichum em 11 genótipos de Capsicum (frutos pertencentes às espécies Capsicum annuum, C. baccatum e C. chinense). Frutos verdes de C.annuum se mostraram consistentemente mais suscetíveis que frutos maduros contra todos os isolados testados. A mesma resposta foi observada em C. baccatum e C. chinense quando inoculados com isolados de C. gloeosporioides. Entretanto, para inoculações com C. acutatum, as maiores lesões ocorreram em frutos maduros. Todas as três espécies de Capsicum testadas apresentaram diversidade quanto a suscetibilidade à Colletotrichum spp., variando de materiais extremamente suscetíveis até com bom nível de resistência, mostrando que o germoplasma desse gênero tem fontes de resistência promissoras para o melhoramento para resistência à antracnose. Os efeitos do controle químico, coberturas e adubação nitrogenada no progresso de antracnose do pimentão foram estudados no capítulo 3, em duas séries de experimentos instalados em condições de campo. Os experimentos foram realizados com o híbrido “Maximos F1” no inverno (março a julho)e no verão (setembro a dezembro). Os tratamentos de controle químico foram Fosfato bipotássico (K2HPO4) e Clorotalonil e os tratamentos de cobertura do solo foram cobertura plástica e orgânica (palhada de Andropogon sp.), totalizando quatro tratamentos, em blocos ao acaso com quatro repetições. Foram testados os níveis 0 Kg/ha, 50 Kg/ha , 150 Kg/ha e 450 Kg/ha de N, aplicados na forma de uréia (45-46 % N), em blocos ao acaso com quatro repetições. O trabalho demonstrou que a severidade de antracnose de pimentão é influenciada pela época de plantio, cobertura do solo e pelos químicos adotados. A severidade da antracnose foi muito maior no plantio de verão que no de inverno, nas parcelas pulverizadas com K2HPO4 do que nas com Clorotalonil e com cobertura plástica do que com cobertura orgânica. No plantio de inverno, o efeito da cobertura orgânica foi melhor evidenciado sob K2HPO4, com menores taxas de progresso da doença em comparação com a cobertura plástica, enquanto as taxas de progresso foram uniformemente baixas com uso de Clorotalonil, independentemente do tipo de cobertura. Já no plantio de verão, o efeito da cobertura orgânica foi melhor evidenciado sob Clorotalonil, com menores taxas de progresso com cobertura orgânica, enquanto nas parcelas pulverizadas com K2HPO4 as taxas de progresso foram uniformemente altas, independentemente da cobertura usada. No plantio de verão, nenhum tratamento resultou em controle satisfatório da doença. A maior dosagem de nitrogênio (450 Kg/ha), resultou em maiores severidades de antracnose, tanto no inverno quanto no verão. As demais dosagens(0 a 150 Kg/ha) mostraram valores muito próximos de severidade. _____________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Although pepper and sweet-pepper anthracnose may be caused by several Colletotrichum species, most domestic (Brazilian) reports identify Colletotrichum gloeosporioide the main causal agent, with rare records of other species. Twenty-two
Colletotrichum isolates were studied as to their mycelial growth, colony coloration and conidial morphology and morphometrics, as well as to their aggressiveness to Capsicum fruits and plantlets. All five pepper isolates belonged to the C. gloeosporioides taxon, as well as the majority of sweet-pepper isolates and one S. gilo isolate. Most of the remaining isolates were identified as C. acutatum. C. acutatum was the predominant species among S.
gilo isolates. The most aggressive isolates on S. gilo fruits were the ones that were originally isolated from this same species, and they were generally pathogenic to sweetpepper as well. In agreement, most aggressive isolates to sweet-pepper were obtained from pepper and sweet-pepper, but these were not capable of inducing symptoms on S. gilo fruits. The most aggressive isolates to S. gilo fruits belong to C. acutatum, while most aggressive isolates to sweet-pepper belong to C. gloeosporioides. Almost none of the
isolates was able to induce symptoms on plantlets. The results from plantlet inoculation were insufficient to differentiate among isolates according to their host specificity or aggressiveness. This work studied the reaction of green and mature fruits to inoculation with different Colletotrichum spp. isolates onto 11 Capsicum genotypes (fruits of the species Capsicum annuum, C. baccatum e C. chinense). Green fruits of C. annuum were consistently more susceptible than mature fruit, irrespective of the isolate tested. When inoculated with the C. gloeosporioides isolates, C. baccatum and C. chinense fruits responded the same way. However, when these Capsicum species were inoculated with the C. acutatum isolate, larger lesions were verified in mature fruit. All three Capsicum species presented genetic variability as to susceptibility to Colletotrichum spp., from extremely susceptible to resistant, demo nstrating that the genus includes promising sources for breeding for anthracnose resistance. The effects of chemical control, soil mulch and nitrogen fertilization on the progress of sweet-pepper anthracnose were studied in two series of field experiments. Experiments were conducted in the winter (March to July) and summer (September to December) seasons, with sweet-pepper hibrid “Maximos F1”. Chemical treatments were Potassium phosphate dibasic (K2HPO4) and Chlorotalonil, and soil mulch treatments were plastic mulch and organic (Andropogon sp.) mulch, in a total of four treatment-combinations, in a randomized complete block design (RCBD), replicated four times. In separate experiments, the effect of four levels of nitrogen fertilization (0 Kg/ha, 50 Kg/ha , 150 Kg/ha and 450 Kg/ha de N) were tested in the winter and summer seasons. Nitrogen was applied in the
form of urea (45-46 % N) and the experiments followed a RCBD, with four replicates. Results showed that severity of sweet-pepper anthracnose is affected by planting season, soil mulch and chemical control. Disease severity was much larger in the summer than in the winter season, larger with K2HPO4 than Chlorotalonil, and also larger with plastic mulch than organic mulch. In the winter season, the effect of the organic mulch was better noted under K2HPO4, while disease progress rates were uniformly low with Chlorotalonil,
irrespective of mulch type. On the other hand, on the summer season, the effect of organic mulch was better noted under Chlorotalonil, while disease progress rates were uniformly high with K2HPO4, irrespective of soil cover type. In the summer, however, no treatmentcombination gave sufficient disease control. The highest nitrogen dose (450 Kg/ha) resulted in significantly larger disease severities in both seasons, while a differ among the remaining doses from 0 to 150 Kg/ha.
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Consorciação de hortaliças e sua influência na produtividade, ocorrência de plantas espontâneas e artrópodes associadosSugasti, Juan Benjamin 28 February 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-05-30T13:08:34Z
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2012_JuanBenjaminSugasticompleto.pdf: 3717867 bytes, checksum: 50800cad0db0a894d05b442292d9d7f8 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-09-21T11:54:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2012_JuanBenjaminSugasticompleto.pdf: 3717867 bytes, checksum: 50800cad0db0a894d05b442292d9d7f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-21T11:54:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2012_JuanBenjaminSugasticompleto.pdf: 3717867 bytes, checksum: 50800cad0db0a894d05b442292d9d7f8 (MD5) / O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito do consórcio das culturas de alface, quiabo e rabanete na produção. índices econômicos, infestação de plantas espontâneas e artrópodes de parte aérea e solo. O experimento foi realizado na Fazenda Água Limpa - UnB. de setembro de 2010 a Janeiro de 2011. O delineamento foi de blocos ao acaso, em três repetições, com os seguintes tratamentos: monoculturas: alface (Al), rabanete (Rb). quiabo aberto (Ql) e quiabo tradicional (Q2). consórcios duplos: alface e rabanete (Al/Rb). alface e quiabo aberto (Al/Ql). alface e quiabo tradicional (A1/Q2), rabanete e quiabo aberto (Rb/Ql). rabanete a quiabo tradicional (Rb/Q2). e os consórcios triplos: alface, rabanete e quiabo aberto (AL/Ql/Rb) e alface, rabanete e quiabo tradicional (Al/Q2/Rb). A cultura de rabanete em monocultura apresentou maior número de maços (7.8 maços m-2) e maior perda de raiz (21.1%), enquanto em consórcio triplo foram observadas as menores perdas. A maior produtividade da alface foi alcançada em monocultura, seguida dos consórcios triplos. No entanto, a monocultura apresentou plantas com menor massa fresca (0.33 kg), comparada aos consórcios triplos (0.43kg em A1/Q2/RB e 0.45kg Al/Ql/Rb). A maior produtividade de quiabo foi observada em Q2 (1,3 kg.m-2) e o tratamento que proporcionou maior produção por planta foi o consórcio triplo Al/Ql/Rb (0.51 kg.m" ). Os tratamentos que apresentaram maior índice de equivalência de área foram Al/Rb/Q2 (2,71), seguido de Al/Ql/Rb (2.61). Os consórcios triplos apresentaram os maiores custos operacionais totais e as maiores receitas líquidas. Os melhores índices de lucratividade também foram observados nos consórcios triplos (57.%). As menores densidades e massa fresca de plantas espontâneas foram observadas nos consórcios triplos. Alface em consórcio com quiabo reduziu a necessidade de capina comparada às monoculturas de quiabo, nos consórcios duplos e triplos. Houve efeito dos tratamentos na comunidade de artrópodes de solo. A menor incidência de pulgões em plantas de quiabo foi observada no consórcio triplo e também foi observada maior incidência de predadores e menor incidência de sugadores nos consórcios triplos e duplos. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This research aimed to evaluate intercropping of lettuce, radish and okra and its effect on yield, economical index, weeds infestation, soil and plants arthropods' incidence. The experiment was carried out at Fazenda Água Limpa - UnB. from September 2010 to January 2011. The experimental design was randomized blocks, in three replicates, with the following treatments: single crops: lettuce (Al). radish (Rb). open space okra (Ql) and traditional space okra (Q2): double intercropping: lettuce and radish (Al/Rb). lettuce and open okra (Al/Ql). lettuce and traditional space okra (A1/Q2). radish and open space okra (Ql/Rb). radish and traditional space okra (Rb/Q2). and triple intercropping: lettuce. radish and open space okra (Al/Ql/Rb) and lettuce, radish, and traditional space okra (Al/Q2/Rb). Single radish yielded the highest number of packets per square meter (7.8) and showed the highest root loss (21.1%) when compared to triple intercropping radish- The highest lettuce yield was observed in single cropping followed by that observed in triple intercropping. However, plants of lettuce from single cropping system presented a lower fresh matter (0.33 kg) than those from triple intercropping (0.43kg in A1/Q2/RB and 0,45kg in Al/Ql/Rb). Okra highest yield was observed in Q2 (1.3 kg.m-2), but the treatment that showed the highest production per plant was the triple intercropping Al/Ql/Rb (0.51 kg.m-2 ). The treatments that showed the highest equivalent area index were Al/Rb/Q2 (2.71), followed by Al/Ql/Rb (2.61). Triple intercropping showed the highest total operational costs and the highest net revenues. The highest economic index was observed in both triple intercropping treatments (57%). The lowest weeds' density and fresh matter were observed on triple intercropping treatments. Triple and double intercropping of lettuce and okra reduced the need of cleaning weeds compared to single okra. There was effect of treatments on soil arthropods' community. The lowest aphids' incidence was observed on okra plants of the triple intercropping. More predators and less sucking insects were observed in the triple and double intercropping treatments.
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Impacto da consorciação de culturas e aplicação de silício na produção de hortaliças, manejo de artrópodes e plantas espontâneasReis Filha, Rogerlâni dos 26 March 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2013. / Submitted by Luiza Silva Almeida (luizaalmeida@bce.unb.br) on 2013-07-24T18:03:11Z
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2013_RogerlânidosReisFilha.pdf: 2342802 bytes, checksum: c91109b0b470b2ce3c8367b201988adf (MD5) / Approved for entry into archive by Leandro Silva Borges(leandroborges@bce.unb.br) on 2013-07-25T18:29:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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2013_RogerlânidosReisFilha.pdf: 2342802 bytes, checksum: c91109b0b470b2ce3c8367b201988adf (MD5) / O presente trabalho teve como objetivo avaliar o impacto da consorciação e aplicação de silício em repolho, milho-doce e feijão-vagem nos seguintes parâmetros: produção, índice de equivalência de área, manejo de artrópodes-praga e plantas espontâneas. O experimento foi realizado na Fazenda Água Limpa – FAL, da Universidade de Brasília – UnB, no período de junho a novembro de 2011. O delineamento foi de blocos ao acaso com 14 tratamentos e 04 repetições, sendo os tratamentos: monoculturas - repolho (RE), repolho/silício (RE/Si), milho-doce (MD), milho-doce/silício (MD/Si), feijão- vagem (FV), feijão-vagem/silício (FV/Si); consórcio duplo: repolho e milho-doce (RE/MD), repolho e milho-doce/silício (RE/MD/Si), repolho e feijão-vagem (RE/FV), repolho e feijão-vagem/silício (RE/FV/Si) e milho-doce e feijão-vagem (MD/FV), milho-doce e feijão-vagem/silício (MD/FV/Si); consórcios triplos: repolho, milho-doce e feijão-vagem (RE/MD/FV) e repolho, milho-doce e feijão-vagem/silício (RE/MD/FV/Si). Na produção do repolho, foram avaliadas a massa fresca da cabeça e circunferência. No milho-doce, foram avaliados a altura da planta, diâmetro do colmo, massa fresca, altura e circunferência das espigas. No feijão-vagem, foram avaliados a massa fresca, comprimento e número de vagens. Os artrópodes-pragas foram avaliados desde o início do ciclo até o momento da colheita. Placas amarelas adesivas foram instaladas a cada quinze dias até o momento da colheita para quantificação e identificação dos insetos. A avaliação das plantas espontâneas foi realizada em duas ocasiões com o quadro de madeira de 25x25 cm em cada parcela. Não foi observado efeito significativo da interação silício e consórcio nos parâmetros avaliados, com exceção do número de vagens no feijão-vagem. A maior massa fresca do repolho foi observada nas parcelas de consórcio RE/FV e RE/FV/MD, enquanto a menor circunferência foi observada na monocultura, diferindo estatisticamente dos demais arranjos de consórcio. Para altura e diâmetro de colmo de milho-doce, os valores mais altos foram observados nas parcelas consorciadas. Não foi observada diferença significativa para massa fresca da espiga entre os sistemas de consórcio. A maior massa fresca de vagens do feijão-vagem foi observada na monocultura, diferindo significativamente dos demais tratamentos. Não houve efeito significativo dos arranjos de consórcio no comprimento de vagens. Houve interação significativa entre silício e consórcio para o número de vagens por planta, apresentando valores superiores na monocultura de feijão-vagem com silício. O índice de equivalência de área indicou vantagem do consórcio, com os maiores valores no consórcio triplo RE/MD/FV. Na avaliação visual da Plutella xylostella foi observado na monocultura do repolho maior número de lagartas nos tratamentos de consórcios duplos e triplos. No milho-doce, as maiores médias de lagartas de Spodoptera frugiperda foram encontradas no consórcio duplo de MD/RE com e sem silício. As maiores médias de adultos de Bemisia tabaci em feijão-vagem foram observadas no consórcio duplo de FV/RE. Quanto à infestação de adultos de Diabrotica speciosa, não foi observada diferença significativa entre os consórcios. Na avaliação das placas amarelas, foi verificado menor número de mastigadores na monocultura do repolho. Quanto aos sugadores, o maior número foi encontrado na monocultura do feijão-vagem. Para parasitóides e predadores, na monocultura do repolho com silício e no consórcio duplo de FV/MD houve maior número de espécimes desses insetos. Para plantas espontâneas, a monocultura de repolho e os consórcios duplo de RE/FV e triplo RE/MD/FV apresentaram as menores médias de massa fresca. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This study aimed to evaluate the impact of vegetables intercropping and application of silicon in cabbage, sweet corn and snap bean production, area equivalency index management of arthropod pests and weeds. The experiment was carried out Fazenda Água Limpa, University of Brasilia, from June to November 2011. The experiment was a randomized block design with 14 treatments and 04 replicates, with monocultures: cabbage (RE), cabbage and silicon (RE/Si), sweet corn (MD), sweet corn and silicon (MD/Si), snap beans (FV), snap beans and silicon (FV/Si) double: intercropping cabbage and sweet corn (RE/MD), cabbage and sweet corn and silicon (RE/MD/Si), cabbage and snap beans (RE/FV), cabbage and snap beans and silicon (RE/ FV/Si) and sweet corn and snap beans (MD/FV), sweet corn and snap beans and silicon (MD/FV/Si), triple intercropping: cabbage, sweet corn and snap beans (RE/MD/FV) and cabbage, sweet corn and snap beans and silicon (RE/MD/FV/Si). The variables recorded were cabbage fresh weight and circumference, sweet corn plant height and stem diameter, ear fresh weight, circumference and length; snap beans fresh weight, length and number of pods. For arthropod pests, evaluations were performed weekly on each parcel. Yellow sticky cards were placed in the parcels every fifteen days, until the final harvest when the number of arthropod were counted and identified. Weeds were recorded twice using a wooden frame of 25x25 cm in each parcel. There was no interaction of silicon and intercropping for variables, except for snap beans number. The highest cabbage fresh weights were observed at RE/FV and RE/FV/MD, while the lowest plant diameter were recorded at the single crop treatment, statistically different from all intercropping treatments. For sweet corn height and plant diameter, the highest values were observed at the intercropping parcels. There was no difference among intercropping treatments for ear fresh weight. The highest fresh weight for snap beans was observed at single crop cultivation, differing statistically from all treatments. No effect of intercropping was observed for snap beans length. A significant interaction between silicon and intercropping was observed for snap bean number, with the highest values in the single crop cultivation with silicon. The equivalency area index showed an advantage of the intercropping treatments with highest values observed at the triple intercropping RE/MD/FV. The highest number of individuals of Plutella xylostella was observed at the single crop cultivation compared to double and triple intercropping. For sweet corn, the highest number of Spodoptera frugiperda was observed at MD/RE with and without silicon. The highest number of Bemisia tabaci in snap beans was recorded at FV/RE. Concerning Diabrotica speciosa, no effect of intercropping was observed. Through yellow sticky cards, a smaller number of chewers arthropods were observed at cabbage single crop compared to other treatments. Snap beans single crop showed the highest number of suckers arthropods. For parasitoids and predators, the highest numbers of individuals were observed at cabbage single crop with silicon and at double intercropping of FV/MD. For weeds, cabbage single crop, double intercropping of RE/FV and triple intercropping of RE/MD/FV showed the smallest values for fresh weight.
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Baculovírus recombinantes contendo genes de proteases são mais virulentos contra Spodoptera frugiperdaWelzel, Aline 23 March 2006 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, 2006. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-10-27T18:10:25Z
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Previous issue date: 2006-03-23 / Os baculovírus são vírus de DNA, específicos de artrópodes, possuindo uma ampla utilização, principalmente, como bioinseticida em lepidópteros e como vetores de expressão de genes heterólogos. A habilidade do vírus Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) de infectar um grande número de hospedeiros tem facilitado estudos moleculares desse vírus com o objetivo de melhorar sua propriedade bioinseticida. Este trabalho teve por objetivo a construção de AcMNPV recombinantes com a introdução de um gene de uma protease (catepsina-L) e de uma quitinase no genoma viral, para a observação dos efeitos da infecção viral em larvas de Spodoptera frugiperda, comparativamente aos vírus AcMNPV selvagem e outro AcMNPV recombinante, contendo o gene de uma serino-protease (queratinase) de Aspergillus fumigatus. Outro objetivo do trabalho foi a construção de Anticarsia gemmatalis multiple nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) recombinantes com a introdução dos genes das proteases catepsina-L e queratinase no genoma viral. Foram utilizados os vetores de transferência pSynXIVVI+X3 e p2100, respectivamente, para cada vírus. O DNA plasmidial dos vetores de transferência recombinantes foi co-transfectado com o DNA do vírus vSyngalVI- e do vAgGalA2, em células de Trichoplusia ni (BTI-Tn5B1-4) e Anticarsia gemmatalis (UFL-AG-286), respectivamente. Os isolamentos dos vírus recombinantes foram feitos com a técnica de diluição seriada em placa de 96 poços e a detecção dos vírus recombinantes se deu pela observação de poliedros nas células infectadas por meio da microscopia de luz. O vírus AcMNPV recombinante contendo o gene da catepsina-L (vSynCAT) assim como o AcMNPV recombinante contendo o gene da queratinase (vSynQUERAT) foram mais virulentos contra larvas de 3° e 4° instar de S. frugiperda quando comparados aos vírus selvagem e o vírus AcMNPV xx recombinante contendo o gene da quitinase (vSynQUIT). Além disso, os vírus vSynCAT e vSynQUERAT induziram a melanização da cutícula dos insetos nos estágios mais tardios da infecção. Os AgMNPV recombinantes ainda não foram isolados e, desta forma, não foi possível analisar o efeito desses genes no genoma do baculovírus mais utilizado como bioinseticida no mundo. __________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Baculoviruses are DNA viruses specific to artropods. They have been widely used as bioinseticides against lepidopterous insect pests and as heterologous gene expression vectors. The ability of the Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) to infect a great variety of hosts, have facilitated molecular biology studies aiming the improvement of this virus as a biopesticide. The aim of this work is the construction of recombinant AcMNPV viruses with the introduction of a protease gene (cathepsin-L) from Sarcophaga peregrina and a chitinase gene from Metarhizium anisopliae, into the viral genome and observation of the effects of these recombinant viruses during the infection of Spodoptera frugiperda larvae, comparatively with the wild-type AcMNPV and another AcMNPV recombinant, containing a serino-protease (keratinase) gene from Aspergillus fumigatus . Another aim of this work was the construction of Anticarsia gemmatalis multiple nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) recombinant viruses containing the cathepsin-L and keratinase genes into the viral genome. The pSynXIVVI+X3 e p2100 transfer vectors were used, respectively for each virus. Recombinant transfer vectors DNAs were co- transfected with DNA from polyhedrin minus vSyngalVI- and vAgGalA2 viruses, in Trichoplusia ni (BTI-Tn5B1-4) and Anticarsia gemmatalis (UFL-AG-286) cells, respectively. Isolation of the recombinant viruses was carried out using the serial dilution method in 96 well-plates and was achieved by the observation of polyhedra inside infected cells under a light microscope. The AcMNPV recombinant containing the cathepsin-L gene (vSynCAT), as well as the AcMNPV recombinant containing the keratinase gene (vSynQUERAT), were more virulent towards 3° and 4° instar S. frugiperda larvae, when compared to the wild-type AcMNPV and a AcMNPV xxii recombinant containing the kitinase gene (vSynQUIT). Furthermore, the vSynCAT and vSynQUERAT viruses induced melanization of insect cuticule late in infection. The AgMNPV recombinants have not been isolated yet, and therefore, it was not possible to analyse the effect of the introduction of these genes on the virulence of the world most used baculovirus biopesticide.
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Estudo da atividade de proteínas cry, derivadas de Bacilos thuringiensis ativas para insetos-praga do algodoeiroMartins, Érica Soares 16 July 2009 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-22T16:35:44Z
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Previous issue date: 2009-07-16 / Toxinas Cry de Bacillus thuringiensis (Bt) são proteínas inseticidas utilizadas para controle de insetos. Elas agem por ingestão e são ativadas por proteases e interagem com receptores específicos localizados na superfície da célula hospedeira, resultando na lise de células do intestino médio. Este trabalho está dividido em quatro capítulos. No primeiro, foi feita uma revisão sobre Bacillus, ecologia e modo de ação, e insetos-praga do algodão. O segundo capítulo descreve a seleção e o estudo do conteúdo de genes cry de estirpes de B. thuringiensis com atividade para Anthonomus grandis. O terceiro capítulo descreve a clonagem, sequenciamento e expressão da toxina Cry1Ba da estirpe S601 de B thuringiensis, que é tóxica para A. grandis. A ligação da toxina Cry1Ba6 a proteínas localizadas na borda escovada de células do intestino médio de A. grandis foi analisada e descobriu-se que a proteína Cry1Ba6 se liga a duas proteínas (62 e 65 kDa) com atividade de fosfatase alcalina (ALP). Este trabalho é o primeiro relato da localização de receptores de toxina Cry em células do intestino médio de A. grandis. Finalmente, o capítulo quatro mostra como outras toxinas (Cry1Ia e Cry10A) expressas em Bt, com atividade já descrita para A. grandis interagem com BBMVs de A. grandis e S. frugiperda. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Cry toxins from Bacillus thuringiensis (Bt) are isecticidal proteins used for insect control. They actin by ingetion and are activated by host proteases and interact with specific receptors located on the host cell surface, resulting in midgut epithelial cells lysis. This work is divided in four chapters. In the first, a review was done o Bacillus, ecology and action mode, and cotton insect-pests. The second chapter describes the selection and study of the content of cry genes of B. thuringiensis strains with activity against nthonomus. grandis. The third chapter describes cloning, sequencing and expression of a cry1Ba toxin gene from the B. thuringiensis S601 strain which is toxic to A. grandis. The binding of Cry1Ba6 toxin to proteins located on the midgut brush border membrane of A. grandis was analyzed and it was found that Cry1Ba6 binds to two proteins (62 and 65 kDa) that showed alkaline phosphatase (ALP) activity. This work is the first report that shows the localization of Cry toxin receptors on the midgut cells of A. grandis. Finally, the chapter four shows how other toxins (Cry1Ia and Cry10A) expressed in Bt, which previously had activity described to A. grandis, interact with A. grandis and S. frugiperda BBMVs.
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Caracterização molecular e desenvolvimento de marcadores específicos para a detecção de biótipos de mosca branca Bemisia tabaciSilva, Paulo Roberto Queiroz da 04 1900 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2006. / Submitted by Mariana Fonseca Xavier Nunes (nanarteira@hotmail.com) on 2010-09-26T00:28:32Z
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Previous issue date: 2006-04 / A mosca-branca (Bemisia tabaci) tem assumido um papel de destaque na agricultura mundial por ser uma praga de importância econômica em função das infestações causadas pelo biótipo B de B. tabaci e que já se encontra distribuído em todos os continentes. O conhecimento da diferenciação genética de B. tabaci permitirá o desenvolvimento de estratégias para o controle da mosca-branca no Brasil. O presente estudo teve como objetivo caracterizar e analisar a variabilidade genética da mosca-branca B. tabaci, por meio de marcadores moleculares baseados em DNA. Os dados de caracterização molecular por RAPD, revelaram a extrema complexidade da espécie sugerindo uma possível separação das populações em função da planta hospedeira. Posteriormente, os dados de variância molecular revelaram que, a maior fonte de variabilidade era originária de diferenças entre as populações, do que em relação a variações dentro das populações do biótipo B desse inseto. Observou-se, ainda, que o biótipo BR, nativo do Brasil, apresentou baixa similaridade genética em relação ao biótipo B, que foi introduzido no país. Sendo assim, fragmentos de RAPD de ocorrência persistente nas populações estudadas dos biótipos B e BR, foram clonados e seqüenciados, seguindo-se o desenvolvimento de dois conjuntos de primers, para a detecção do biótipo B e um para a detecção do biótipo BR. Esses marcadores denominados SCAR (Seqüências Caracterizadas de Regiões Amplificadas) mostraram-se sensíveis para a detecção dos biótipos em questão, sendo capazes de discriminá-los em testes utilizando amostras de DNA provenientes de diferentes insetos. Os resultados obtidos permitem propor um modelo para a dispersão do biótipo B em campo. Possivelmente, as fêmeas de B. tabaci biótipo B adotam um sistema multifatorial (detecção de predadores, interferência por machos de outros biótipos, disponibilidade de recursos e competição entre populações de um mesmo biótipo) para a seleção das culturas hospedeiras. Independente do fenômeno ocorrido em relação à cultura hospedeira selecionada pelo biótipo B de B. tabaci, os marcadores SCAR foram capazes de detectar os dois biótipos de ocorrência no Brasil. O desenvolvimento de marcadores específicos para cada biótipo de B. tabaci é uma etapa decisiva para o estabelecimento de estratégias baseadas em DNA para a detecção e a prevenção da entrada de novos biótipos no Brasil, minimizando os riscos provocados pela entrada de insetos exóticos no agro-ecossistema brasileiro. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The whitefly Bemisia tabaci has assumed an increasing importance because it is one of the most harmful pests of plant production. An increasing number of plant diseases were related to the B biotype of B. tabaci. This biotype is the most widespread pest of economically important plant crops. The understanding of the genetic differentiation of B. tabaci allows the development of methods to control this pest in many countries, including Brazil. The objective of this study was the characterization and analysis of the genetic variability of the B. tabaci using DNA based molecular markers. The molecular characterization by RAPD revealed the extreme complexity of this species suggesting possible population segregation by host culture. The molecular variance analysis (AMOVA) revealed that the highest genetic variability were more due to variations among the populations analyzed than genetic variation in the populations of the B biotype of B. tabaci. The native B. tabaci biotype (called BR) showed low genetic similarity to the introduced B. tabaci B biotype. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) fragments occurring persistently in all B and BR populations studied were cloned, sequenced, and used to design two sets of SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) primers to detect the B biotype and one to detect the BR biotype. These SCAR markers were very sensitive to discriminate the two biotypes analyzed in this study. The specific biotype detection occurred in several conditions, including tests using DNA extracted from different insect sources. These molecular results could be used in a proposition of a model trying to explain the dispersion of B. tabaci in the field. Possibly, the B. tabaci B biotype females could adopt a multifactorial system to select its host crops. This system could be formed by factors like detection of predators of its offspring, interference by males from different biotypes, availability of plant resources, and competition among populations of the same biotype. Independently of which factors were interfering or influencing on B. tabaci to take a decision about host plant, the SCAR markers developed in this study were able to detect the most common B. tabaci biotypes occurring in Brazil. The development of specific molecular markers to each B. tabaci biotypes is a very important step to the establishment of DNA based strategies to detect and prevent the incoming of new biotypes of whiteflies in Brazil, reducing the risks produced by the introduction of exotic insects in the Brazilian agricultural.
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Composição de gafanhotos (Orthoptera, acrioidea) em áreas de cerrados e lavouras na Chapada dos Parecis, Estado de Mato Grosso, BrasilGuerra, Wanderlei Dias 11 November 2011 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2011. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-03-30T11:51:48Z
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2011_WanderleiDiasGuerra.pdf: 3420305 bytes, checksum: 6adf8a84777a31a412a0c0d09fa7e1b4 (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2012-04-02T11:37:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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2011_WanderleiDiasGuerra.pdf: 3420305 bytes, checksum: 6adf8a84777a31a412a0c0d09fa7e1b4 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi contribuir com o conhecimento da composição de Orthoptera, Acridoidea, na Chapada dos Parecis, estado de Mato Grosso. Esta região foi uma das que mais sofreram nas décadas de 1980 e 1990 com uma importante praga de gafanhotos, a espécie Rhammatocerus schistocercoides (Rehn, 1906), o que levou o Ministério da Agricultura a gastar mais de US$5 milhões para seu controle. Hoje, apesar de esta espécie estar controlada, outras espécies tem despontado como pragas potenciais na região e no estado, possivelmente em função da expansão dos cultivos agrícolas. Este estudo foi conduzido em áreas nativas de cerrado e também nas áreas antropizadas pelas lavouras, de 2008 a 2010. Foram coletados 3.031 gafanhotos de 64 espécies distribuídas entre as seguintes famílias e subfamílias: Acrididae (49): Gomphocerinae (21), Ommatolampinae (10), Melanoplinae (6), Acridinae (4), Leptysminae (3), Copiocerinae (3), Proctolabinae (1) e Cyrtacanthacridinae (1); Romaleidae (13): Romaleinae (13) e Ommexechidae (2): Ommexechinae (2). Para auxiliar na identificação, além da consulta a especialistas foi feita a tradução e adaptação da chave de Famílias e Subfamílias de Acridoidea Neotropicais. As diferenças foram significativas entre o número de espécies encontradas nos cerrados (61) e nas lavouras (16). No entanto a maior abundância foi registrada nas lavouras, com 60, 3% dos indivíduos coletados, contra 39,7% nos cerrados. A espécie mais abundante, Baeacris punctulatus (Thunberg, 1824), encontra-se amplamente na Chapada dos Parecis e está intimamente relacionada aos cultivos agrícolas. O conhecimento da composição de Acridoidea da Chapada dos Parecis, com predomínio de vegetação de cerrado, revelou uma grande semelhança com a composição de espécies coletadas em outras regiões do estado, sobretudo na Chapada dos Guimarães, também com predomínio de cerrados. Isto permite inferir que esta deve ser a realidade no restante do estado onde esta fitofisionomia seja predominante. É possível que estes sejam os primeiros registro de ocorrência em Mato Grosso para Rhammatocerus pseudocyanipes, Sinipta sp., Eutryxalis filata minor, Parorphula gramínea, Cylindrotettix dorsalis, Zygoclistron trachystictu, Chromacris nuptialis, Staleochlora viridicata viridicata, Xyleus gracilis e que entre outros cinco espécimes (Hyalopterygini sp., Scyllinini sp., Abracrini sp., Dichroplini sp. e Gomphocerinae sp.) pode estar alguma espécie ainda sem registro na literatura. Em função da predominância da espécie B. punctulatus, sobre a qual há registros na literatura como praga, foi feito um estudo mais detalhado contemplando a história de vida e a dinâmica populacional da mesma ao longo do ano. Os resultados sugerem que no estado de Mato Grosso há entre 3,9 a 5,1 gerações por ano. Foram também obtidas informações sobre as características morfológicas dos diferentes ínstares, fornecendo um método rápido e fácil de identificar cada estágio em condições de campo. Os diferentes ínstares podem ser separados pelo número de segmentos da antena, tamanho do corpo e forma e tamanho das tecas alares. Variações anuais e regionais de temperatura e umidade podem influenciar a história de vida e a dinâmica populacional de B. punctulatus. O conhecimento da dinâmica populacional e dos fatores ecológicos que regulam os efetivos populacionais, pode ser importante ferramenta para a tomada de decisão, caso ações de controle fitossanitário sejam requeridas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this study was to contribute to the knowledge of the Orthoptera’s diversity (Acridoidea) in the Parecis Plateau region, Mato Grosso state. In the 1980’s and 1990’s this region was affected with a locust outbreak, the species Rhammatocerus schistocercoides (Rehn, 1906), which led Brazilian Agriculture Department to consume more than US$5 million for its control. Even though this specie is currently under control, other species have emerged as potential pests in the region and in the Mato Grosso state in general, possibly due to the expansion of crop cultivated areas. This study was conducted by survey of native areas (savanna) and also in the disturbed areas by cultivation, from 2008 to 2010. Were collected 3031 grasshoppers of 64 different species distributed among the following families and subfamilies: Acrididae (49): Gomphocerinae (21), Ommatolampinae (10), Melanoplinae (6), Acridinae (4), Leptysminae (3), Copiocerinae (3), Proctolabinae (1) and Cyrtacanthacridinae (1); Romaleidae (13): Romaleinae (13) and Ommexechidae (2): Ommexechinae (2). The differences were significant between the number of species found in the savannas (61) and in the crop areas (16). However the highest abundance was found in the crops with 60.7% of the total sample and 39.7% in the native areas. The most abundant specie, Baeacris punctulatus (Thunberg, 1824), is widely distributed throughout the Parecis Plateau and is closely related to agricultural crops. Knowledge of the Acridoidea diversity in the Parecis Plateau region, under savanna vegetation predominance, showed a strong resemblance to the composition of species collected in other regions, especially in the Guimarães Plateau, also under savanna vegetation. This allows to infer that it might be also happening in the rest of the state where this vegetation type is predominant. It’s possible that these are the first record of occurrence in Mato Grosso to Rhammatocerus pseudocyanipes, Sinipta sp., Eutryxalis filata minor, Parorphula gramínea, Cylindrotettix dorsalis, Zygoclistron trachystictu, Chromacris nuptialis, Staleochlora viridicata viridicata, Xyleus gracilis and from five other species (Hyalopterygini sp. Scyllinini sp. Abracrini sp. Dichroplini sp. and Gomphocerinae sp.) may be some species not yet recorded in the literature. Due the predominance of B. punctulatus, which there are records as a pest, including in Mato Grosso, was make a detailed study covering the life history and population dynamics of this specie throughout the year. Overall, this study suggests that in the State of Mato Grosso there are 3.9 to 5.1 generations per year. Were obtained information on the morphological characteristics of different instars, providing a quick and easy method to identify each stage in the field conditions. The various instars could be differentiated by the number of antennal segments, body size, and shape and size of wing pads. Annual and regional variation in temperature and moisture may influence the life history and population dynamics of B. punctulatus. This identification, coupled with the knowledge of population dynamics and ecological factors that define the effective population, may be an important tool for decision making if the phytosanitary actions are required.
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Indução abiótica de genes de resistência em cana-de-açúcar relacionadas à defesa contra Sporisorium scitameneumOLIVEIRA, Louise Melo de Souza 24 October 2012 (has links)
Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-27T22:14:16Z
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Previous issue date: 2012-10-24 / CNPq / Nos diferentes ambientes onde é cultivada a cana-de-açúcar, a cultura é submetida às mais diversas condições e exposta a uma ampla variedade de fatores, capazes de reduzir sua produtividade, sendo as doenças um deles. O carvão é uma das principais doenças da cana-de-açúcar que provoca a restrição do uso de variedades suscetíveis altamente produtivas. A indução de resistência consiste na ativação de mecanismos naturais de defesa das plantas contra patógenos por meio de indutores bióticos e abióticos. Este método alternativo de controle é uma proposta promissora para o controle de doenças, reduzindo a dependência aos produtos químicos e possibilitando, em algumas culturas, a utilização de cultivares com alto potencial agrícola e reduzida resistência a determinadas doenças. A expressão de genes e proteínas de resistência tem sido usada como uma importante abordagem experimental para conhecer função gênica e compreender os mecanismos moleculares que estão relacionados com processos de tolerância. A técnica de Reverse Transcription Poylemrase Chain Reaction (RT-PCR) é uma ferramenta útil na identificação de genes de defesa em plantas a estresse biótico. Este trabalho teve como objetivo analisar a diferença de expressão de genes e proteínas em cana-de-açúcar induzidas com elicitores abióticos para controle do carvão utilizando a técnica RT-PCR. Plantas da variedade SP 791011 (suscetível) com três meses de idade foram tratadas com: ASM (10 g do p.c./ 100 litros de água); Silicato de potássio (24g/l), Extrato alcoólico de Allamanda blanchetti (1000ppm) e plantas controle, não tratadas tiveram seus tecidos coletados com 0, 24, 48 e 72 horas após a indução de resistência e imediatamente acondicionado em nitrogênio líquido para a extração de RNA e proteínas totais, os quais foram extraídos da folha utilizando o reagente Trizol e o cDNA obtido utilizando o Kit SuperScriptII. Foram desenhados primers de genes de resistência da cana-de-açúcar ao carvão, e realizada a análise de expressão. As proteínas totais foram extraídas, solubilizadas e separadas por eletroforese bidimensional (2-DE) para posterior identificação via espectrometria de massas. Foram observadas mudança de expressão gênica e protéica nos diferentes tratamentos, principalmente na expressão dos genes de quitinase, glucanase e peroxidase. Foi possível verificar a eficiência dos diferentes indutores de resistência e estes resultados são muito úteis para ajudar a elucidar a base molecular dos mecanismos que as plantas utilizam para tolerar a presença de fungos fitopatogênicos. / In different environments where it is grown in sugar cane, the culture is subjected to various conditions and is exposed to a wide variety of factors that can reduce productivity, illness being one of them. Coal is a major disease of cane sugar that causes the restriction of the use of susceptible varieties highly productive. The induction of resistance is the activation of natural defense mechanisms of plants against pathogens through biotic and abiotic inducers. This alternative method of control is a promising proposal for the control of diseases, reducing dependence on chemicals and allowing, in some cultures, the use of cultivars with high agricultural potential and reduced resistance to certain pathogens. The expression of resistance genes and proteins has been used as an important experimental approach to gene function knows and understand the molecular mechanisms that are related to processes tolerance. The Reverse Transcription Poylemrase Chain Reaction (RT-PCR) technique has been effective in the idetification of defense genes in plants to biotic stress. This study aimed to analyze the difference in expression of genes and proteins in sugarcane induced with abiotic elicitors to control coal using RT-PCR technique. Plants of the variety SP 791011 (susceptible) with three months of age were treated with: ASM (10 g pc / 100 liters of water); Potassium silicate (24g / l), alcoholic extract of Allamanda blanchetti (1000ppm) and control plants Untreated their tissues were collected with 0, 24, 48 and 72 hours after induction of resistance and immediately stored in liquid nitrogen for RNA extraction and total proteins, which were extracted from the leaf using the Trizol reagent and the cDNA Kit obtained using SuperScriptII. Primers were designed for resistance genes from sugar cane to coal, and performed expression analysis. The total protein were extracted, solubilized and separated by two-dimensional electrophoresis (2-DE) for identification via mass spectrometry. We observed a change in gene and protein expression in the different treatments, especially in the expression of genes for chitinase, glucanase and peroxidase. It was possible to verify the effectiveness of different inducers of resistance and these results are very useful to help elucidate the molecular basis of the mechanisms that plants use to tolerate the presence of pathogenic fungi.
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Caracterização molecular e biológica de um isolado de Tomato yellow vein streak virusAlbuquerque, Leonardo Cunha de January 2008 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2008. / Submitted by Jaqueline Oliveira (jaqueoliveiram@gmail.com) on 2008-12-16T17:50:35Z
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DISSERTACAO_2008_LeonardoCDeAlbuquerque.pdf: 1785694 bytes, checksum: 7ec9388303ad69ff93f3b26d72ff1861 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-02-20T15:11:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1
DISSERTACAO_2008_LeonardoCDeAlbuquerque.pdf: 1785694 bytes, checksum: 7ec9388303ad69ff93f3b26d72ff1861 (MD5) / A família Geminiviridae é caracterizada pela morfologia geminada das partículas e genoma composto por DNA circular de fita simples. Esta família é dividida em quatro gêneros, Mastrevirus, Begomovirus, Curtovirus e Topocuvirus, de acordo com a espécie de
inseto vetor, círculo de hospedeiros e organização genômica. Os begomovírus, em sua maioria, possuem dois componentes genômicos (DNA-A e DNA-B), são transmitidos por Bemisia tabaci (mosca-branca) e infectam plantas dicotiledôneas. A disseminação de begomovírus em diversas partes do Brasil está associada à introdução e dispersão do biótipo B de B. tabaci, que atualmente tem destacada importância como vetor dos begomovírus, não apenas para o tomateiro, mas também para outras hortaliças e mais recentemente, a batata (primeiro relato feito há mais de 20 anos). Atualmente, esse grupo de vírus parece ser o mais importante afetando tomate (e batata, em surtos eventuais) no estado de São Paulo. O objetivo deste trabalho foi caracterizar molecular e biologicamente um begomovírus isolado de batata, denominado Ba-3, provavelmente pertencente à espécie
Tomato yellow vein streak virus. Inicialmente, um novo método de clonagem foi desenvolvido utilizando a DNA polimerase do bacteriófago 29 via amplificação isotérmica em círculo rolante (RCA). Esta técnica se mostrou eficiente e simples para a realização de clonagens dos begomovírus. Para caracterização molecular, o genoma completo do Ba3 foi amplificado por RCA, clonado e a sequência genômica determinada.
Para o seqüenciamento completo do DNA-A e DNA-B foram utilizados primers do vetor e
primers internos em ambas as orientações. Análises comparativas indicaram que a
identidade de seqüências do DNA-A do isolado Ba3 foi menor que 88% quando comparado com qualquer outro begomovírus com seqüência registrada até o momento, sugerindo que este isolado representa, provavelmente, uma nova espécie do gênero, nomeado como Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). Para o círculo de hospedeiros, clones contendo 1,5 cópias dos componentes virais foram produzidos e inoculados através de bombardeamento de partículas em plantas cultivadas e daninhas e a detecção realizada por PCR. A infecção foi comprovada em plantas de batata, tomate, Nicotiana benthamiana e Nicandra physaloides. Para o estudo preliminar de pseudo-recombinação, clones infecciosos dos vírus Tomato severe rugose virus (ToSRV), Sida micrantha mosaic virus (SimMV) e Tomato rugose mosaic virus (ToRMV) foram utilizados. Foram observados
sintomas em plantas de tomate inoculadas com DNA-A de ToYVSV-[Ba3] + DNA-B de
ToSRV, DNA-A de ToSRV + DNA-B de ToYVSV-[Ba3] e DNA-A de ToRMV + DNA-B
de ToYVSV-[Ba3] indicando que este isolado pode pseudo-recombinar com outros
begomovírus. Estes resultados, juntamente com os estudos mais detalhados que
permanecem em andamento, contribuirão para a validação do Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) como uma espécie definitiva no gênero Begomovirus.
_______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Geminiviridae family is characterized by a geminated particle morphology and circular single-stranded DNA genome. This family is divided in four genera, Mastrevirus, Begomovirus, Curtovirus and Topocuvirus, based on insect vector species, host range and genome organization. The majority of begomoviruses has two genomic components (DNAA and DNA-B), and they are transmitted by Bemisia tabaci (whitefly) for dicotyledonous plants. In most regions of Brazil, the begomovirus dissemination has been associated to the introduction and spread of the B biotype of B. tabaci. They occur not only on tomatoes, but also on other vegetables and more recently, on potatoes (the first report was done more than
20 years ago). Currently, this virus seems to be the most important one infecting tomato
(and potato in occasional epidemics) in the state of São Paulo. The objective of the present work was to characterize on its biological and molecular aspects the begomovirus isolated from potato, named Ba3, probably belonging to Tomato yellow vein streak virus species. Initially, a new cloning method was developed using the bacteriophage 29 DNA polymerase through rolling circle isothermal amplification (RCA). This technique was demonstrated to be efficient and simple for begomovirus genome cloning. For the molecular characterization, the complete genome of Ba3 was amplified, cloned and the genome sequence determined. The complete sequencing of DNA-A and DNA-B was done using vector and internal primers in both orientations. Analysis indicated that the Ba3 DNA-A sequence shared less than 88% nucleotide identity with any other begomovirus sequence avaliable, suggesting that this isolate most likely represents a new species of Begomovirus genus, named Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). For host range
studies, clones containing 1.5 copies of each genome segment were inoculated via particle
bombardment in cultivated and weed plants, and detection done by PCR. Infection was
confirmed in potato, tomato, Nicotiana benthamiana and Nicandra physaloides plants. For a preliminary study of the ability to form pseudo-recombinants, infectious clones of the viruses Tomato severe rugose virus (ToSRV), Sida micrantha mosaic virus (SimMV) and Tomato rugose mosaic virus (ToRMV) were used. Symptoms were observed in tomato plants inoculated with DNA-A of ToYVSV-[Ba3] + DNA-B of ToSRV, DNA-A of ToSRV + DNA-B of ToYVSV-[Ba3] and DNA-A of ToRMV + DNA-B of ToYVSV [Ba3] indicating that this isolate can form viable pseudo-recombinants with other
begomoviruses. These results, together with more detailed studies which remain in course,
will contribute to validate Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) as a definite species.
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