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An?lise do transcriptoma das gl?ndulas venenosas do escorpi?o Tityus stigmurus

Almeida, Diego Dantas 08 November 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:03:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DiegoDA_DISSERT.pdf: 2395435 bytes, checksum: d36171b7c7d9b30608e690a447e57864 (MD5) Previous issue date: 2011-11-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / In Brazil, accidents with scorpions are considered of medical importance, not only by the high incidence, but also for the potentiality of the venom from some species in determining severe clinical conditions. Tityus stigmurus is a widely distributed scorpion species in Northeastern Brazil and known to cause severe human envenomations, inducing pain, hyposthesia, edema, erythema, paresthesia, headaches and vomiting. The present study uses a transcriptomic approach to characterize the molecular repertoire from the non-stimulated venom gland of Tityus stigmurus scorpion. A cDNA library was constructed and 540 clones were sequenced and grouped into 37 clusters, with more than one EST (expressed sequence tag) and 116 singlets. Forty-one percent of ESTs belong to recognized toxin-coding sequences, with antimicrobial toxins (AMP-like) the most abundant transcripts, followed by alfa KTx- like, beta KTx-like, beta NaTx-like and alfa NaTx-like. Our analysis indicated that 34% include other possible venom molecules , whose transcripts correspond to anionic peptides, hypothetical secreted peptides, metalloproteinases, cystein-rich peptides and lectins. Fifteen percent of ESTs are similar to cellular transcripts. Sequences without good matches corresponded to 11%. This investigation provides the first global view of cDNAs from Tityus stigmurus. This approach enables characterization of a large number of venom gland component molecules, which belong either to known or atypical types of venom peptides and proteins from the Buthidae family / No Brasil, acidentes com escorpi?es s?o considerados de import?ncia m?dicosanit?ria, n?o somente por sua incid?ncia, mas tamb?m pela potencialidade do veneno de algumas esp?cies em determinar quadros cl?nicos graves. Tityus stigmurus ? uma esp?cie de escorpi?o amplamente distribu?da na regi?o Nordeste do Brasil sendo conhecida por causar graves envenenamentos humanos, cujos sintomas incluem: dor, hipoestesia, edema, eritema, parestesia, cefal?ia e v?mitos. A composi??o qu?mica do veneno do escorpi?o T. stigmurus ainda n?o foi bem avaliada, havendo uma car?ncia na literatura de estudos com enfoque na elucida??o do repert?rio molecular dos componentes deste veneno. Neste trabalho, realizamos uma abordagem transcript?mica para caracterizar o repert?rio molecular da gl?ndula de veneno n?o-estimulada do escorpi?o Tityus stigmurus. Para tanto, uma biblioteca de cDNA foi constru?da e, ? partir dela, 540 genes foram clonados e agrupados em 37 clusters com mais de um EST (expressed sequence tag) e 116 singlets (somente um EST). Do total de transcritos, 41% pertencem a sequ?ncias de toxinas conhecidas, sendo os pept?deos antimicrobianos (AMPs) os transcritos mais abundantes, seguido por α-KTX, β- KTX, β-NaTx e α-NaTx, respectivamente. Nossa an?lise revelou ainda que 34% s?o "poss?veis toxinas", cujos transcritos correspondem a pept?deos ani?nicos, pept?deos hipot?ticos secretados, metaloproteases, pept?deos ricos em ciste?na e lectinas. Quinze por cento dos ESTs s?o semelhantes a transcritos celulares. Transcritos sem similaridade com outras sequ?ncias do GenBank, foram chamadas de no hit e correspondem a 11% do total. Este trabalho apresenta a primeira vis?o global de cDNAs das gl?ndulas venenosas do escorpi?o Tityus stigmurus. Esta abordagem permite a caracteriza??o de um grande n?mero de mol?culas componentes da gl?ndula de veneno, que pertencem a tipos conhecidos ou at?picos de pept?deos e prote?nas do veneno da fam?lia Buthidae
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Modelagem de Nicho Ecológico de Tityus serrulatus LUTZ & MELLO, 1922 e Tityus stigmurus (THORELL, 1876) (Arachnida: Scorpiones)

Aranha, Caroline de Oliveira 19 October 2015 (has links)
Submitted by CAROLINE ARANHA (carolinearanha1@gmail.com) on 2015-11-19T13:49:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Caroline Aranha.pdf: 1748172 bytes, checksum: a34ddb6f7a781071afc48ece1b6891b1 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva (sivalda@ufba.br) on 2015-11-30T18:05:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Caroline Aranha.pdf: 1748172 bytes, checksum: a34ddb6f7a781071afc48ece1b6891b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-30T18:05:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Caroline Aranha.pdf: 1748172 bytes, checksum: a34ddb6f7a781071afc48ece1b6891b1 (MD5) / CAPES, FAPESB / Os escorpiões são animais peçonhentos, com alta plasticidade e algumas espécies sinantrópicas consideradas pragas urbanas, e que podem ser excelentes modelos para estudos de Biogeografia, História Natural e Ecologia Evolutiva. Nesse contexto, a ferramenta de modelagem de nicho ecológico pode contribuir para a compreensão de características essenciais para a ocorrência das espécies e para fechar lacunas sobre áreas de ocorrência, além de permitir prever padrões de distribuição futura. Os objetivos do trabalho foram modelar a distribuição de Tityus serrulatus e Tityus stigmurus e identificar as variáveis que influenciam esta distribuição, além da possível ocorrência de exclusão competitiva destas espécies em diferentes biomas. Os dados de ocorrência das espécies foram obtidos de 12 coleções aracnológicas no Brasil, as variáveis bioclimáticas foram oriundas do Worldclim e a modelagem de nicho ecológico feita no MAXENT. Os resultados indicaram que o bioma que influencia a ocorrência das duas espécies é a Mata Atlântica, com registros de sobreposição para este bioma, enquanto para Amazônia, Caatinga e Cerrado há indícios de que haja competição e exclusão competitiva das espécies modelo pelas espécies típicas de cada bioma (Tityus obscurus, Rhopalurus rochae e Rhopalurus agamemnom e Tityus trivittatus, respectivamente). Para Tityus serrulatus, a variável climática mais importante é a temperatura média anual, que em geral é elevada, enquanto que para Tityus stigmurus, a variação anual de temperatura é o fator que mais influencia sua distribuição. Concluiu-se que a temperatura limita ambas as espécies do estudo, pois enquanto T. serrulatus parece não suportar temperaturas muito elevadas, T. stigmurus sofre com variações constantes da temperatura. Apesar disso, T. serrulatus tem ampliado a sua distribuição nas últimas décadas assim como T. stigmurus, e ambas têm se proliferado, principalmente nos bolsões de pobreza de cidades brasileiras com crescimento desordenado, constituindo-se em um problema de saúde pública. / Scorpions are venomous animals with high plasticity and some synanthropic species refered as and urban pests, these animals could serve as an excellent model to Biogeography, Natural History and Evolutionary ecology studies. In this sense, the ecological niche-modelling tool may contribute to the comprehension of essential characteristic from species geographic distribution and fill the blanks about occurrence area, also allowing predicting future distribution patterns. The objective of this work was to model the ecological niche from the scorpions species Tityus serrulatus and Tityus stigmurus and to identify the variables that influence the distribution, beside the possible occurrence of competitive exclusion of these species in different biomes. The species occurrence data were obtained from 12 brazilian aracnological collections. The bioclimatic variables were get from the Worldclim databank and the niche modelling study was done with the MAXENT software. The results showed that the Atlantic Rain Forest biome is influencing both species distribution and is the unique biome with distributional overlap of T. serrulatus and T. stigmurus.There are also evidences of competition and competitive exclusion between both species in the biomes Tropical Rain Forest, Caatinga and Savannah (Tityus obscurus, Rhopalurus rochae and Rhopalurus agamemnom, and Tityus trivitattus, respectively). For T. serrulatus the most important variable is the average annual temperature, which is high in general. However to T. stigmurus the temperature variation influences the most its distribution. In conclusion, temperature limits both species of this study, T. serrulatus doesn’t seem to support very elevated temperatures, while T. stigmurus suffers with constant temperature variations. Despite this, T. serrulatus have expanded its distribution in the last decades, as both have proliferated, mainly in Brazilian urban “pockets of poverty”, which grow disorderly, making it a public health issue.
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Avalia??o funcional e estrutural de um novo pept?deo antimicrobiano do escorpi?o Tityus stigmurus

Melo, Edinara Targino de 31 March 2014 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-03-02T23:14:28Z No. of bitstreams: 1 EdinaraTarginoDeMelo_DISSERT.pdf: 2062041 bytes, checksum: b2de2a9d0f47d751e6c33c3d69b984a7 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-03-04T23:26:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EdinaraTarginoDeMelo_DISSERT.pdf: 2062041 bytes, checksum: b2de2a9d0f47d751e6c33c3d69b984a7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-04T23:26:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EdinaraTarginoDeMelo_DISSERT.pdf: 2062041 bytes, checksum: b2de2a9d0f47d751e6c33c3d69b984a7 (MD5) Previous issue date: 2014-03-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / No Brasil, ? grande a incid?ncia de animais pe?onhentos, dentre os quais se destacam os escorpi?es por sua import?ncia m?dica, sendo sua pe?onha fonte de diversas subst?ncias qu?micas com atividades biol?gicas e farmacol?gicas ainda n?o compreendidas, incluindo diversos pept?deos bioativos. Pept?deos antimicrobianos (PAMs) s?o componentes do sistema imune de procariotos e eucariotos utilizados como primeira linha de defesa contra micro-organismos. No presente trabalho, foi caracterizado o primeiro PAM do escorpi?o Tityus stigmurus, nomeado Stigmurina, previamente identificado por meio do transcriptoma da gl?ndula de veneno desta esp?cie. As caracter?sticas da Stigmurina foram investigadas por modelagem computacional e constru??o de dendrograma. Al?m disso, as caracter?sticas estruturais da Stigmurina foram investigadas por dicro?smo circular em ?gua, em 2, 2, 2- trifluoethanol (TFE) e em dodecil sulfato de s?dio (SDS) e os modelos refinados por simula??es de din?mica molecular. Testes in vitro foram empregados para investigar a atividade antibacteriana, antif?ngica, hemol?tica e citot?xica do veneno bruto e da Stigmurina. Os resultados mostraram que a sequ?ncia selecionada codifica uma prote?na madura com 17 res?duos de amino?cidos e o dendrograma revela um caso de converg?ncia evolutiva. Os espectros de dicro?smo demonstraram flexibilidade conformacional, predominando estrutura estendida e ??folha, al?m de not?vel capacidade de renatura??o. A pe?onha bruta n?o apresentou atividade relevante nos testes antimicrobianos para as concentra??es testadas. No entanto, a Stigmurina mostrou um amplo espectro de atividade antibacteriana, com concentra??es inibit?rias m?nimas (CIMs) entre 31,25?g/mL a 250 ?g/mL para diferentes micro-organismos, enquanto que os resultados para a avalia??o da atividade hemol?tica nestas concentra??es foram baixas. Nos estudos de citotoxicidade, a pe?onha bruta foi incapaz de reduzir a viabilidade celular em c?lulas VERO E6, por?m sua toxicidade em c?lulas SiHa foi significativamente superior, correspondendo a uma IC50 de 3,6 ?g/mL. J? nos testes com a Stigmurina, as concentra??es capazes de reduzir a viabilidade celular das c?lulas VERO E6 e SiHa em 50% foram de 275,67 ?g/mL e 212,54 ?g/mL, respectivamente.Os resultados sugerem que a Stigmurina poder ser considerada como um potencial medicamento anti-infeccioso. / In Brazil, there is a high incidence of venomous animals. Among them, scorpions are highlighted by their medical importance, and for being their venom a source of several molecules with biological and pharmacological activity not yet fully understood, including several bioactive peptides. Antimicrobial peptides (AMPs) are components of the immune system in prokaryotes and eukaryotes, used in the first line of defense against microorganisms. In the present study, we characterized the first PAM previously identified through transcriptome of the venom gland of the scorpion Tityus stigmurus, named Stigmurin. The characteristics of Stigmurin were investigated by computational modeling and construction of dendrogram. In vitro tests investigated the antibacterial, antifungal, haemolytic and cytotoxic effects of crude venom and Stigmurin. In addition, the structural characteristics of Stigmurin were investigated by circular dochroism in water, 2, 2 , 2- trifluoethanol (TFE) and sodium dodecyl sulfate (SDS) and the models were refined by molecular dynamics simulations. The results showed that the selected sequence encodes a mature protein of 17 amino acid residues and the dendrogram reveals a case of convergent evolution. The crude venom showed no antimicrobial activity, however, Stigmurin exhibited a broad spectrum of antibacterial activity, with minimal inhibitory concentrations (MIC) ranging from 31.25 and 250 ?g/mL for different strains, while the hemolytic activity at these concentrations was low. In cytotoxicity studies, the crude venom was unable to reduce cell viability in VERO E6 cells; in contrast, its activity in SiHa cells was significantly higher, corresponding to IC50 of 3.6 ?g/mL. For Stigmurin the concentration sable to decrease cell viability of Vero E6 and SiHa cells in 50% were 275.67 ?g/mL and 212.54 ?g/mL, respectively. The dichroism spectra revealed the conformational flexibility, with predominating extended and ??sheet structures, as well as a remark able renaturation ability. The results suggest that Stigmurin could be considered as a potential antiinfective drug

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