Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-24T17:27:56Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 464260 bytes, checksum: 1291a21c187b97378d74b519f8510676 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T17:27:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 464260 bytes, checksum: 1291a21c187b97378d74b519f8510676 (MD5) Previous issue date: 2003-05-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Quatro experimentos, em condições de campo, foram conduzidos, com o objetivo de quantificar a eficiência de produtos alternativos no manejo da requeima ou mela do tomateiro, causada por Phytophthora infestans. Em todos os experimentos, quantificaram-se variáveis associadas ao progresso da doença: severidade durante a metade da duração da epidemia (Y 50 ), severidade final (Y máx ), área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) e taxa de progresso da doença (r). Os experimentos e os tratamentos avaliados foram: Ensaio 1 extratos (E) de: pimenta, pimenta do reino, cravo, açafrão-da-índia e alho (E1); pimenta do reino, cravo e alho (E2); cravo, açafrão-da-índia e alho (E3); Ensaios 2 e 3 - óleo de nim (0,5%) e leite (20%), em cultivo aberto (Ensaio 2), e protegido (Ensaio 3); Ensaio 4 - preparado homeopático na dinamização C30 e mistura de água e etanol. Em todos os experimentos, incluíram-se os tratamentos fungicida metalaxyl e testemunha (sem aplicação de quaisquer produtos). Não houve diferença entre os diferentes extratos e a testemunha para as variáveis Y 50 , Y máx , AACPD e r. No ensaio 2, os valores de Y 50 nos tratamentos óleo nim e calda bordalesa foram semelhantes, 3,0% e 1,0%, respectivamente. No entanto, o valor de Y máx foi maior nas parcelas tratadas com óleo de nim (44%) do que naquelas tratadas com calda bordalesa (14%). Não houve redução de Y máx com leite. Os valores de r (0,161) e AACPD (533) foram menores nas parcelas tratadas com o óleo de nim que nas da testemunha (r = 0,211 e AACPD = 1186) e semelhantes aos estimados no tratamento calda bordalesa (r = 0,156 e AACPD = 130). Nas parcelas tratadas com leite, os valores de r e AACPD não diferiram dos da testemunha. Não houve epidemia de requeima em cultivo protegido. Os valores de Y 50 , Y máx , AACPD e r nas parcelas tratadas com mistura água e etanol e preparado homeopático foram similares aos obtidos na testemunha. A calda bordalesa foi o tratamento mais eficiente no controle da requeima. O óleo de nim foi promissor, entretanto, é necessário avaliar outras concentrações. No manejo da requeima do tomateiro em sistemas alternativos de produção, é necessária a integração de práticas a fim de se potencializar os efeitos individualizados. / Four field trials were carried out to quantify the efficacy of alternative products to manage tomato late blight, caused by Phytophthora infestans. Variables related to late blight progress as severity at half of epidemic duration (Y 50 ); final severity (Y max ); area under the disease progress curve (AUDPC); and disease progress rate (r) were quantified. In trial 1, the effects of plant extracts (E) were assessed: chili pepper, black pepper, clove, turmeric, and garlic (E1); black pepper, clove, and garlic (E2); and clove, turmeric, and garlic (E3). The effect of neem oil (0.5%) and crude cow milk (20%) were assessed under field (trial 2) and plastic house conditions (trial 3). Trial 4 was set to evaluate the effect of homeopathic preparation and the mixture of water and ethanol. In all experiments, two controls were included: no sprays and metalaxyl. For Y 50 , Y max , AUDPC, and r, there was no difference between the extracts and the control when.Values of Y 50 on plants treated with neem oil (3%) were similar to those on plants treated with Bordeaux mixture (1%), but Y max on neem treated plants (44%) was higher than on plants treated with Bordeaux mixture (14%). Milk at 20% did not reduce Y max . The r (0.161) and AUDPC (533) values were lower in plots treated with neem oil than in the controls (r = 0.211 and AUDPC = 1186) and similar to the Bordeaux mixture plots (r = 0.156 and AUDPC = 130). Values of r and AUDPC on plots treated with milk were similar to those in the control plots. There was no significant reduction of Y 50 , Y max , AUDPC, and r values when plants were treated with the homeopathic product. Bordeaux mixture was the most efficient treatment for controlling tomato late blight. Neem oil is potentially useful and its efficacy may be improved at higher concentrations. Integrated management must be implemented to keep late blight at acceptable levels on alternative tomato production systems. / Dissertação importada do Alexandria

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-14T15:37:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1034565 bytes, checksum: c504a98dadccf295255bca92bfe49d24 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T15:37:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1034565 bytes, checksum: c504a98dadccf295255bca92bfe49d24 (MD5) Previous issue date: 2005-04-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os genes WRKY codificam proteínas de ligação ao DNA que reconhecem a seqüência conservada de nucleotídeos (T)(T)TGAC(C/T) (W box), presente em promotores de genes de defesa relatados em plantas. As proteínas WRKY podem ser divididas em grupos e subgrupos distintos, com base nas características do domínio WRKY de ligação ao DNA altamente conservado entre os membros dessa família e de pequenos domínios adicionais conservados. Esse trabalho objetivou caracterizar, mediante a obtenção da seqüência completa, dois fatores de transcrição WRKY relacionados aos clones de cDNA MG.LE.EB.A3.0208D3 e MG.LE.EB.A3.0209E3 que foram expressos na linhagem resistente NC-EBR-2 de tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill.) 36 horas após a inoculação com o fungo Alternaria solani. A triagem efetuada por PCR de uma biblioteca de fosmídeos da linhagem NC- EBR-2, utilizando-se oligonucleotídeos derivados das seqüências dos clones MG.LE.EB.A3.0208D3 e MG.LE.EB.A3.0209E3, resultou na identificação de um clone fosmídeo correspondente a cada clone. Por meio do seqüenciamento shotgun desses clones, foram obtidas duas ORFs (open reading frame, sequência aberta de leitura) denominadas de LeWRKY1 (fator de transcrição WRKY 1 de L. esculentum) com 1.165pb e LeWRKY2 (fator de transcrição WRKY 2 de L. esculentum) com 1.570pb, correspondente aos clones MG.LE.EB.A3.0208D3 e MG.LE.EB.A3.0209E3, respectivamente. A proteína codificada por LeWRKY1, que apresenta similaridade de seqüência com a proteína NtWRKY3 de Nicotiana tabacum, possui em sua seqüência de 328 aminoácidos um domínio WRKY de ligação ao DNA, um motivo dedo de zinco do tipo Cys 2 His 2, um motivo conservado denominado domínio 1 que constitui um sinal de localização nuclear e um domínio conservado que inclui a região C de ligação a calmodulina. Essas características permitem classificar LeWRKY1 no grupo II, subgrupo d, dos fatores de transcrição WRKY. Esta proteína apresenta também um domínio N-terminal de 41 aminoácidos com função ainda desconhecida. Na região promotora de LeWRKY1 foi observada a presença do elemento promotor TATA box a –55pb e duas regiões W box a – 89pb (WA) e a –76pb (WB) do sítio de início da transcrição. Análise de Southern blot revelou que esse gene está presente em mais de uma cópia no genoma do tomateiro. A proteína codificada pelo gene LeWRKY2 apresentou similaridade de seqüência com a proteína tWRKY4 de Nicotiana tabacum e possui uma seqüência de 291 aminoácidos constituída de um domínio WRKY de ligação ao DNA e um motivo dedo de zinco Cys 2 HisCys, sendo classificada como membro do grupo III dos fatores de transcrição WRKY. A análise por meio de Southern blot indicou que o gene LeWRKY2 está presente em única cópia no genoma do tomateiro. A comprovação e a quantificação da contribuição desses genes na resistência do tomateiro a Alternaria solani depende, entretanto, de estudos de expressão e análise funcional. / The WRKY genes codify to DNA binding proteins that recognize the conserved nucleotide sequences (T)(T)TGAC(C/T) (W box) present in promoters of plant defense genes. The WRKY proteins can be divided in distinct groups and subgroups, based on characteristics of the DNA binding WRKY domain and on additional conserved small domains. This work aimed to characterize, by means of sequencing, two WRKY transcription factors related to cDNA clones MG.LE.EB.A3.0208D3 and MG.LE.EB.A3.0209E3 expressed in the resistant tomato lineage NC-EBR-2 36 hours post inoculation with the fungus Alternaria solani. Genomic DNA fragments that contained the genes correspondent to each cDNA clones were identified by PCR screening of NC-EBR-2 fosmid genomic library making use of primers derived from MG.LE.EB.A3.0208D3 and MG.LE.EB.A3.0209E3 sequences. Two ORFs (open reading frame) were obtained by sequencing clones from the shotgun library of these fosmids. They were designated as LeWRKY1 (L. esculentum WRKY transcription factor 1, correspondent to MG.LE.EB.A3.0208D3) and LeWRKY2 (L. esculentum WRKY transcription factor 2, correspondent to MG.LE.EB.A3.0209E3), having 1.165bp and 1.570bp, respectively. The protein codified by LeWRKY1 that is similar to the protein NtWRKY3 of Nicotiana tabacum and has 328 amino acids with one WRKY DNA binding domain, one Cys 2 His 2 zinc finger motif, one conserved nuclear localization signal, and one conserved domain that included the calmodulin binding region C. These characteristics classify LeWRKY1 into group II, subgroup d of WRKY transcription factors. This protein also presents an N-terminal domain that comprises 41 amino acids of unknown function. One TATA box element at –55 bp and two W box regions at –89 bp (WA) and –76 bp (WB) at the transcription start position were observed in promoter region of LeWRKY1. Southern blot analysis indicated that more than one copy of this gene is present in the tomato genome. The protein codified by LeWRKY2 presented sequence similarity to tWRKY4 protein of N. tabacum and has 291 amino acids sequence that consists of WRKY DNA binding protein domain and one Cys 2 HisCys zinc finger motif, being classified as group III member of WRKY transcription factors. Southern blot analysis indicated that of LeWRKY2 is a single copy gene. / Dissertação antiga

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-08T15:52:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1783314 bytes, checksum: 388ec983275a357864295d336289ffdb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T15:52:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1783314 bytes, checksum: 388ec983275a357864295d336289ffdb (MD5) Previous issue date: 2002-11-19 / Este trabalho foi desenvolvido na área experimental de irrigação e drenagem, situada no Campus da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, MG, durante o período de março a setembro de 2002. Cultivou-se o tomateiro dentro e fora da casa de vegetação, sendo esta com 384 m 2 de área, estrutura metálica e cobertura na forma circular (altura central de 5 m). Nos dois ambientes foi plantada a mesma área. O objetivo principal foi estudar a necessidade de água do tomateiro e o desempenho do manejo de irrigação pelos métodos: lisímetro de lençol freático constante, balanço hídrico utilizando o programa SISDA 3.5 e estação meteorológica, tensiômetros e tensiômetros com déficit hídrico controlado, para dentro e fora da casa de vegetação. Os objetivos secundários foram comparar o comportamento dos elementos climáticos dentro e fora da casa de vegetação, o desempenho do manejo da irrigação utilizando os coeficientes de localização de Keller e Fereres e a demanda hídrica empregando o cálculo do coeficiente de cultura único (kc único) e o coeficiente de cultura duplo (kc duplo); e definir os kc do tomateiro dentro da casa de vegetação. Os métodos do balanço hídrico utilizando o programa SISDA 3.5 (kl Fereres e Kl Keller) e do lisímetro de lençol freático constante alcançaram produtividades mais elevadas (112,4; 103,1; e 98,4 t/ha), o método do tensiômetro apresentou menor produtividade que os primeiros (93,8 t/ha) e o manejo da irrigação com déficit promoveu a menor produtividade que os demais, evidenciando-se a sensibilidade da cultura quando submetida a déficit hídrico (79,1 t/ha). Os ambientes não influenciaram o êxito do uso de cada um desses métodos. Os manejos não propiciaram diferença nas proporções de tamanho de frutos produzidos nem em altura, número de folhas e número de flores produzidas pelas plantas. Aquelas geradas dentro da casa de vegetação apresentaram maior altura média e maior número de flores. A necessidade de água da cultura determinada pelos referidos métodos dentro da casa de vegetação foi, em média, 19,4% menor que a verificada no ambiente externo (223,9 mm e 267,3 mm). A evapotranspiração de referência dentro do ambiente protegido foi 20,3% menor e a radiação incidente, reduzida em 32% com relação ao ambiente externo. O coeficiente de localização de Fereres promoveu elevações de 1/4 e 1/3 da lâmina aplicada para dentro e fora da casa de vegetação, respectivamente. A ETc determinada com o uso do kl de Fereres foi 10% maior que a medida pelo lisímetro, enquanto a ETc determinada utilizando kl de Keller foi 15% menor. A curva de kc medido dentro da casa de vegetação indica que há necessidade de ajustar a duração e o comportamento dos kc nas várias fases de desenvolvimento da cultura. Os coeficientes de cultura ajustados em função da variação da umidade do solo (ks) e da localização de aplicação de água (kl) aproximaram-se dos kc medidos pelo lisímetro de lençol freático constante, ao passo que os ajustados em função do kl de Fereres foram, em geral, maiores que os kc medidos no lisímetro. Os kc ajustados em função do kl de Keller foram, em geral, menores que os medidos pelo lisímetro. O uso do kc duplo não se mostrou fundamental para tornar mais precisa a condução do manejo da irrigação localizada para a cultura do tomateiro. / This project was carried out in the experimental area of irrigation and draining, located on the Campus of the Federal University of Viçosa, in Viçosa, from March to September 2002. The tomato was planted inside and outside the greenhouse which has an area of 384 m 2 , a metallic structure, and a circular shaped ceiling (central height of 5m). The same area was planted in both environments. The main objective was to study the water need of the tomato and the performance of the irrigation management through the methods: lisimeter of water level constant, daily water balance using the SISDA 3.5 program and weather station, tensiometers and tensiometers with controlled water deficit, inside and outside the greenhouse. The secondary objectives were to compare the climatic elements behavior inside and outside the greenhouse, the performance of the irrigation management using the location coefficients of Keller and Fereres and the water necessity employing the single crop coefficient calculation (kc single), and the dual crop coefficient (kc dual); and to define the kc of the tomato inside the greenhouse. The water balance methods using the SISDA 3.5 program (kl Fereres and Kl Keller) and the lisimeter of water constant level reached higher productivity (112,4; 103,1; and 98,4 t/ha), the tensiometer method presented a smaller productivity than the first ones (93,8 t/ha) and the irrigation management with controlled water deficit promoted the smallest productivity, making evident the sensibility of cultivation when submitted to water deficit (79,1 t/ha). The environment did not influence the success of each method. The managements did not present difference in the proportions of size of the fruit produced nor in height, amount of leaves, or quantity of flowers produced by the plants. Those grown inside the greenhouse showed higher average height and larger amount of flowers. The water necessity of the cultivation determined by the mentioned methods inside the greenhouse was, in average, 19,4% lower than that verified in the external environment (223,9 mm and 267,3 mm). The evapotranspiration of reference inside the protected environment was 20,3% less and the incident radiation, reduced 32% in relation to the external environment. The location coefficient of Fereres presented elevations of 1/4 and 1/3 of the accumulated depth water applied inside and outside the greenhouse, respectively. The ETc determined with the kl of Fereres usage was 10% larger than the one measured by the lisimeter, whereas the ETc determined utilizing the kl of Keller was 15% lower. The kc curve measured inside the greenhouse indicates the need of adjusting the time and behavior of the kc in the several stages of the cultivation development. The coefficients of cultivation adjusted due to the soil moisture variation (ks) and water appliance location (kl) approached to the kc measured by the lisimeter of water level constant, whereas those adjusted due to the kl of Fereres were, in general, larger than those measured by the lisimeter. The kc adjusted due to the kl of keller were lower than the ones measured by the lisimeter. The usage of the kc dual was not essential to make the leading of the irrigation management of the tomato cultivation more precise. / Dissertação importada do Alexandria, sem lattes

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-09-06T12:50:20Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1109140 bytes, checksum: b7a890a4ef77da1ffbd5a5086cb19ba8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-06T12:50:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1109140 bytes, checksum: b7a890a4ef77da1ffbd5a5086cb19ba8 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A requeima, causada por Phytophthora infestans (Mont.) De Bary, é a principal doença foliar do tomateiro. No manejo dessa doença, a estratégia mais promissora é o desenvolvimento de cultivares resistentes, havendo, portanto, a necessidade do entendimento da herança associada à resistência. Em programas de melhoramento os estudos dos parâmetros genéticos auxiliam na escolha do melhor método de melhoramento a ser utilizado. Para estimação desses parâmetros são empregados dados observados em linhagens contrastantes (P 1 e P 2 ) e das gerações F 1 , F 2 , RC 1:1 e RC 1:2 . No entanto, a ocorrência de gene de efeito maior e poligenes dificultam os estudos de herança, uma vez que as metodologias, normalmente, utilizadas não detectam as diferenças entre esses genes. Assim, o objetivo desse trabalho foi estudar a herança da resistência do tomateiro a P. infestans, utilizando a função de verossimilhança para modelar e estimar parâmetros relativos aos efeitos de gene maior e poligenes. Os experimentos foram conduzidos na Horta Experimental do Departamento de Fitotecnia da UFV. Como genitor feminino foi utilizado a cultivar susceptível Santa Clara (Solanum lycopersicum) e como genitor masculino o acesso do Banco de Germoplasma de Hortaliças da UFV BGH 6902 (Solanum habrochaites f. glabratum), resistente a requeima. As plantas F 1 , originadas do cruzamento, foram autofecundas para obtenção da geração F 2 e com posterior retrocruzamento entre os genitores para obtenção das gerações RC 1:1 e RC 1:2 . A inoculação das plantas ocorreu aos 50 dias após o transplantio no campo. A severidade da doença foi avaliada por meio de notas, utilizando escala diagramática. Os testes foram realizados no programa estatístico Monogen v 0.1. Na determinação dos modelos genéticos por meio da função de verossimilhança, a significância dos efeitos que comparam os modelos evidencia que a herança da resistência a requeima em tomateiro é conferida por gene maior, com efeito aditivo e dominante mais poligenes, com efeito aditivo mais os efeitos ambientais. A resistência vertical pode ser explorada com a utilização dos genes de efeito maior. Programas de seleção recorrente e a seleção assistida por marcadores moleculares poderão auxiliar o emprego da resistência conferida pelos poligenes. / Late blight, caused by Phytophthora infestans (Mont.) De Bary is a major foliar disease affecting tomato crops. Among management strategies, the most promising is definitely the development of resistant cultivars. Therefore, it is necessary to understand how resistance to this disease is inherited in tomato plants. In breeding programs, studies of genetic parameters have helped plant breeders to choose the best breeding method to be used. To estimate these parameters, researchers make use of data collected from trials at which contrasting inbred lines (P 1 and P 2 ) and their respective F 1 , F 2 , BC 1:1 e BC 1:2 generations were evaluated. However, occurrence of a major-effect gene and polygenes make it difficult to study inheritance patterns since the methodologies that are commonly used do not detect differences between those genes. Therefore, this work aimed to study inheritance of resistance to P. infestans in tomato plants, by using the function of maximum likelihood estimation to modeling and estimating parameters associated to the effects of major genes and polygenes. Field experiments were conducted at the Horticulture Research Farm, owned by the Federal University of Viçosa’s (UFV) Department of Plant Science. The susceptible cultivar Santa Clara (Solanum lycopersicum) was used as the female genitor and the resistant late-blight S. habrochaites f. glabratum accession (BGH 6902), obtained from the UFV Vegetable Gene Bank, was used as the male genitor. F 1 plants from the crossing were selfed up to produce the F 2 progenies, and also backcrossed with P 1 and P 2 producing BC 1:1 and BC 1:2 generations, respectively. The tomato plants were inoculated 50 days after transplanting. Disease severity was evaluated by notes, using a diagrammatic scale. Statistic tests were performed by the Monogen v 0.1 program. By comparing the genetic models created by using the maximum likelihood function, it was concluded that inheritance of resistance to late blight in tomato is conferred by a major gene, with additive and dominant effects, and polygenes, with additive effects, plus the environmental effect. Vertical resistance can be explored by using genes of major effect. Programs of recurrent and maker-assisted selection are considered more efficient strategies in selecting genotypes that hold resistance to late blight conferred by polygenes.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-09-26T17:01:31Z No. of bitstreams: 1 2016_MarcosAntôniodaSilvaElias.pdf: 1915158 bytes, checksum: fe392a5316d4f8462b451127a6156b87 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-01-09T21:15:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_MarcosAntôniodaSilvaElias.pdf: 1915158 bytes, checksum: fe392a5316d4f8462b451127a6156b87 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-09T21:15:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_MarcosAntôniodaSilvaElias.pdf: 1915158 bytes, checksum: fe392a5316d4f8462b451127a6156b87 (MD5) / Existe atualmente a preocupação de que o desmatamento, o uso de inseticidas e as mudanças climáticas possam estar contribuindo para o declínio da abundância de polinizadores em algumas regiões. O objetivo desta tese foi verificar o impacto desses fatores de risco nas abelhas nativas polinizadoras do tomateiro. No capítulo I foram mensuradas as variáveis da paisagem: proporção de vegetação nativa, tamanho relativo do maior fragmento e a distância entre o cultivo e a vegetação nativa mais próxima e relacionadas com a abundância de visitas de abelhas às flores do tomateiro amostradas em cultivos convencionais. A abundância total de polinizadores, além do grupo Exomalopsis e Centris aumentaram com a cobertura de vegetação nativa. No entanto, a fragmentação da paisagem favoreceu a abundância da maioria dos polinizadores do tomateiro. Não houve relação entre a distância dos fragmentos de vegetação nativa e a abundância para nenhum dos grupos. O capítulo II apresenta a genotoxicidade do inseticida deltametrina em células da hemolinfa, hemócitos, de indivíduos da espécie de abelha nativa Melipona quadrifasciata. As duas concentrações subletais do inseticida deltametrina levaram a um aumento significativo de danos ao DNA em hemócitos da abelha quando comparados ao inseticida imidacloprid e com o controle negativo. No capítulo III as potenciais consequências das mudanças climáticas foram avaliadas para cinco espécies de abelhas nativas. Foram realizadas projeções conjuntas através de cinco algoritmos para o ano de 2100 em dois cenários de emissão de carbono. Haverá redução na área de habitat adequado para as cinco espécies no futuro e essa redução ocorrerá também em áreas de plantio de tomate no Brasil. O presente estudo sugere que o desmatamento, os inseticidas e as mudanças climáticas podem afetar negativamente a abundância, a permanência e a distribuição espacial futura de abelhas nativas polinizadoras associadas aos cultivos de tomate. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Deforestation, use of pesticides and climate change are some of the factors of concern that may be contributing to the decline in abundance of pollinators in some regions. The objective of this thesis was to evaluate the impact of these risk factors in pollinating native tomato bees. In Chapter I, landscape variables: proportion of native vegetation, the largest fragment size and the distance between the crop and the closest native vegetation were measured and related to the abundance of bee visits to tomato flowers sampled in conventional crops. The total abundance of pollinators, in addition to Exomalopsis and Centris group increased with native vegetation cover. However, the landscape fragmentation favored abundance of most tomato pollinators. There was no relation between the distance of fragments of native vegetation and abundance for either group. Chapter II presents the genotoxicity of deltamethrin in hemolymph cells, hemocytes, of individuals of the native bee, Melipona quadrifasciata. The two sublethal concentrations of deltamethrin led to a significant increase in DNA damage in bee hemocytes when compared to imidacloprid insecticide and with the negative control. In Chapter III, the potential consequences of climate change were evaluated for five species of native bees. joint projections were conducted through five algorithms for the year 2100 in two carbon emission scenarios. There will be a reduction in habitat area suitable for five species in the future and this reduction will also occur in areas of tomato planting in Brazil. This study suggests that deforestation, pesticides and climate change can negatively affect the abundance, the permanence and future spatial distribution of pollinating native bees associated with tomato crops.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2016-04-07T12:59:49Z No. of bitstreams: 1 2016_TadeuAraujoSouza.pdf: 1810896 bytes, checksum: 875d57d95829fcdd5ba22d41167265c1 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-04-07T16:48:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_TadeuAraujoSouza.pdf: 1810896 bytes, checksum: 875d57d95829fcdd5ba22d41167265c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-07T16:48:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_TadeuAraujoSouza.pdf: 1810896 bytes, checksum: 875d57d95829fcdd5ba22d41167265c1 (MD5) / O tomateiro (Solanum lycopersicum) é um das hortaliças mais cultivadas em todo o mundo, inclusive no Brasil, principalmente pelas suas características nutricionais e pela sua importância sócio econômica. Essa cultura pode ser alvo de uma grande diversidade de pragas, incluindo alguns grupos de vírus. Entre os principais encontram-se as espécies dos gêneros Begomovirus, Tospovirus e Crinivirus. Os crinivírus são vírus emergentes, com duas espécies conhecidas em tomateiro Tomato chlorosis virus (ToCV) e Tomato infectious chlorosis virus (TICV) e que foram identificadas em meados da década de 90, nos Estados Unidos. No Brasil, até o momento, apenas ToCV foi relatado infectando o tomateiro. Geneticamente, o ToCV é composto por duas moléculas de RNA fita simples, encapsidadas em partículas virais longas e flexuosas. A transmissão é feita por três espécies de moscas-brancas: Bemisia tabaci, Trialeurodes vaporariorum e T. abutiloneus. Em tomateiro, o principal sintoma caracteriza-se por manchas cloróticas que desenvolvem uma clorose internerval intensa, visualizada principalmente nas folhas baixeiras. O primeiro relato de ToCV no Brasil ocorreu em 2008 e, desde então, este vírus tem sido encontrado nas principais regiões produtoras de tomate do país, porém ainda é pouco estudado. Devido a essa demanda de pesquisa, o objetivo desse trabalho foi determinar a gama de hospedeiros do ToCV no Brasil. Foram avaliadas 50 espécies dentre elas, plantas cultivadas e não cultivadas, inoculadas com ToCV pelo inseto vetor (B. tabaci biótipo B). Do total de plantas avaliadas, nove espécies foram suscetíveis ao isolado testado de ToCV, indicando a potencial capacidade dessas plantas de atuarem como hospedeiras alternativas de ToCV em campo. Concluiu-se então que é necessária maior preocupação com as plantas Amaranthus hibridus, Solanum americanum, Nicandra physaloides e Physalis angulata, pois além de suscetíveis a ToCV, são plantas altamente infestantes em lavouras de tomate e potenciais hospedeiras alternativas do vírus na ausência ou na presença da cultura. Na ausência de tomateiro nas áreas de produção, o virus pode permanecer nas hospedeiras alternativas e, na presença de tomateiro, tais hospedeiras são potencias fontes de inóculo de ToCV. O sinergismo entre ToCV e o tospovírus Tomato spotted wilt virus (TSWV) foi recentemente relatado na Espanha. Nessa interação, há aparentemente um favorecimento da infecção de TSWV em plantas resistentes (com gene Sw-5), quando previamente infectadas por ToCV. Por se tratar de um relato preocupante, parte desse trabalho foi então desenvolvido para avaliar esse sinergismo entre ToCV e tospovírus em tomateiro. Foram selecionadas as cultivares resistentes a tospovírus, Predador e Viradoro, e a cultivar suscetível Dominador, utilizada como controle nos ensaios. As cultivares de tomateiro resistentes foram previamente infectadas por ToCV pelo inseto vetor e, posteriormente, inoculadas com os tospovírus Tomato chlorotic spot virus (TCSV) e Groundnut ringspot virus (GRSV). Após a inoculação, as plantas resistentes não foram infectadas pelos tospovírus, avaliadas visualmente e por teste sorológico (Dot-Elisa). Adicionalmente, foi utilizado outro modelo biológico com Nicotiana benthamina não transgênica e transgênica, transformada constitutivamente com o gene Sw-5. As plantas transgênicas resistentes previamente infectadas por ToCV e posteriomente inoculadas com os tospovírus apresentaram sintoma de lesão local, indicando resistência e ausência de infecção sistêmica. A infecção prévia de ToCV não alterou a expressão do gene Sw-5, responsável por conferir resistência a tospovírus em plantas de tomate e N. benthamiana. Estudos para identificar hospedeiras alternativas de ToCV e compreender o comportamento dos vírus em casos de infecção mista constituem ações indispensáveis para o sucesso de qualquer estratégia de controle. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The tomato (Solanum lycopersicum) is one of the most cultivated vegetables around the world, including Brazil, mainly by their nutritional characteristics and socio-economic importance. This crop is affected by a large variety of pests and pathogens, including some viruses. The major species are found within the genus Begomovirus, Tospovirus and Crinivirus. The criniviruses are emerging viruses, with two known species in tomato Tomato chlorosis virus (ToCV) and Tomato infectious chlorosis virus (TICV). They were identified in the mid 90s, in the United States. In Brazil, only ToCV was reported in tomatoes. Genetically, ToCV consists of two single-stranded RNA molecules, encapsidated in long and flexuous viral particles. They are transmitted by three whitefly species: Bemisia tabaci, Trialeurodes vaporariorum and T. abutiloneus. In tomato, the main symptoms are characterized by chlorotic spots, which evolve to strong internerval chlorosis, mainly visualized in the lower leaves. The first report of ToCV in Brazil was made in 2006 and since then the virus has been found in the main producing regions of tomato of the country. However, it has been poorly studied. Due to this demand, the aim of this study was to determine the host range of ToCV in Brazil. A total of 50 species of cultivated and non-cultivated plants was tested in inoculation with ToCV by the insect vector (B. tabaci biotype B). Nine species were shown to be susceptible to ToCV infection, indicating the potential ability of these plants to act as alternative hosts of ToCV in the field. Therefore, it was concluded that the growers are concerned with the following plants: Amaranthus hibridus, Solanum americanum, Nicandra physaloides and Physalis angulata. They were all susceptible to ToCV, and are frequently found in tomato crops. They are potential virus alternative hosts in the absence of tomato plants, and when tomatoes are present, they can act as inoculum source of ToCV to these plants. The possible synergism between ToCV and the tospovirus Tomato spotted wilt virus (TSWV) was recently reported. In this interaction, apparently a ToCV infection foster TSWV infection in TSWV-resistant plants (contatining the Sw-5 gene). The interaction between two or more viruses can result in unexpected pathological consequences and because of this possible impact in the Brazilian tomato production, we evaluated this synergism between ToCV and tospovirus in tomatoes in the Brazilian conditions. The tospovirus-resistant cultivars Predador and Viradoro were selected, and the susceptible cultivar Dominador was used as control in the assays. Resistant tomato cultivars were previously infected with ToCV by the insect-vector and then inoculated with tospoviruses Tomato chlorotic spot virus (TCSV) and Groundnut ringspot virus (GRSV). After inoculation, the resistant plants were not infected, confirmed by visual inspection and a sorologic test (Dot-Elisa). In addition, a similas test was performed using transgenic and non-transgenic Nicotiana benthamiana plants, which are constitutively transformed with the gene Sw-5. The resistant transgenic plants previously infected with ToCV and subsequently inoculated with TCSV and GRSV showed local lesion symptoms, indicating resistance and absence of systemic infection. The prior infection of the resistant plants with ToCV did not alter the expression of the Sw-5 gene. It is believed that this absence of resistance breakdown is possibly associated with the tomato variety and the viral species that were used. The identification of alternative hosts of ToCV and undertanding the interaction of the viruses in cases of mixed infection are essential information to enable the success of any virus control strategy.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-03T10:38:37Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5867083 bytes, checksum: 916fdcf3e282fa36b460ff1928933f7c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-03T10:38:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5867083 bytes, checksum: 916fdcf3e282fa36b460ff1928933f7c (MD5) Previous issue date: 2005-04-15 / O gene Sw-5, membro de uma família multigênica com membros dispersos nos cromossomos 9 e 12 do tomateiro, é o principal gene de resistência a tospovírus utilizado nos programas de melhoramento de tomateiro para a indústria e para mesa. O acesso LA 371 de Lycopersicon peruvianum possui resistência de amplo espectro a tospovírus e estudos de introgressão e análise genética da resistência demonstraram que a resistência desse acesso é determinada por um gene dominante localizado no loco Sw-5 ou em um loco proximamente ligado. Estudos prévios haviam levantado a hipótese de que oligonucleotídeos que anelam nas regiões correspondentes ao início da ORF codificada por Sw-5 e na região 5’ deste gene poderiam amplificar seqüências do loco Sw-5 e de um loco proximamente ligado. Esta hipótese foi confirmada neste trabalho. Utilizando esses oligonucleotídeos foram amplificados e clonados dois genes homólogos ao Sw-5, denominados de homólogo 1 e homólogo 2, a partir de DNA extraído de uma planta resistente a tospovírus denominada EP-1 derivada do acesso LA 371. As proteínas putativas codificadas por esses homólogos apresentam 92,94 % de similaridade diferindo em 82 aminoácidos. A proteína 2 é mais similar à proteína codificada pelo gene Sw-5 (99,28%) sugerindo que o homólogo 2 é responsável pela resistência a tospovírus encontrada em LA 371. Essas seqüências foram transferidas para o vetor binário pBI121 e experimentos de transformação encontram-se em andamento visando à comprovação da função desses homólogos na resistência de LA 371 a tospovírus. / The gene Sw-5, member of a multigenic family with members dispersed in tomato chromosomes 9 and 12, is the most used tospovirus resistance gene in tomato breeding programs. The Lycopersicon peruvianum accession LA 371 has a broad-spectrum toposvirus resistance. Genetic analysis has demonstrated that a dominant gene located in the Sw-5 locus or in a closely linked locus is responsible for tospovirus resistance of this accession. Prior studies suggested that oligonucleotides with complementary sequences corresponding to the terminal regions of the Sw-5 ORF would be able to amplify sequences from the Sw-5 locus and from one closely linked locus. This hypothesis was confirmed in this work. DNA extracted from a tospovirus resistant plant called EP-1, derived from the accession LA 371, was used as template for PCR amplification. The PCR product was cloned and restriction analysis revealed that two Sw-5 homologous sequences, called homologous 1 and homologous 2, had been cloned. The putative protein codified by these homologous display 92.94% of similarity for each other, differing in 82 amino acids. The protein coded by homologous 2 is more similar to Sw-5 protein (99.28%) suggesting that this homologous is responsible for the LA 371 tospovirus resistance. These sequences were transferred to the binary vector pBI121 and transformation experiments are in progress aiming to test this hypothesis. / Dissertação importada do Alexandria

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-07-25T17:48:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 750082 bytes, checksum: 6ebd145cc9b8eaaf79a6ed3959196394 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-25T17:48:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 750082 bytes, checksum: 6ebd145cc9b8eaaf79a6ed3959196394 (MD5) Previous issue date: 2001-05-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Plantas de tomate foram cultivadas em solução nutritiva, em casa-de- vegetação, e depois transferidas para sala-de-crescimento (fotoperíodo de 14 horas (iniciando-se às 8:00 horas), densidade de fluxo fotossintético de 500 μmol m -2 s -1 , temperatura entre 20-23°C e umidade relativa do ar entre 60-63%), com a finalidade de determinar e avaliar a ação de sinalizadores, presentes na seiva do xilema de plantas submetidas a estresse hídrico, sobre a taxa transpiratória. Os estudos foram realizados em plantas inteiras e em folhas destacadas. Em plantas, sem estresse, foram determinadas as alterações diurnas e sazonais de nutrientes e pH da seiva xilemática. Em plantas submetidas a estresse hídrico rápido (horas após adição de PEG) e lento (dias após adição de PEG), induzidos mediante adição de PEG 6000 à solução nutritiva, avaliou-se a relação entre a transpiração, potencial hídrico foliar, concentração de ácido abscísico (ABA), Ca +2 , K + , Mg +2 , NH 4+ , NO 3- , PO 4-3 e SO 4- e pH da seiva xilemática. Foi avaliada também a sensibilidade estomática ao ABA contido na seiva xilemática, em função da variação dos níveis de NO 3- , Ca +2 e PO 4+3 da seiva de plantas submetidas a estresses. Em folhas destacadas de plantas não estressadas avaliou-se o efeito da fusicocina, cloreto de lantânio e vermelho de rutênio, em combinação com ABA exógeno, sobre a taxa transpiratória. Avaliou-se também a sensibilidade estomática ao ABA exógeno, em função dos níveis de NO 3- , Ca +2 e PO 4+3 . Além disso, avaliou-se o efeito de diferentes pHs (5,5, 6,5 e 7,5), de diferentes soluçõesde imersão (seiva natural, seiva artificial e solução nutritiva de Hoagland 1⁄2 força) e aminoácidos concentrações (ácido de aspártico ácidos e orgânicos glutâmico, (málico, asparagina, maleico e cítrico), glutamina e prolina), açúcares-álcoois (manitol e sorbitol) e putrescina, sobre a taxa transpiratória. O pH da seiva xilemática variou de 5,4 a 6,6. Os pHs menos ácidos ocorreram nos meses de temperaturas médias do ar mais elevadas. A variação diurna do pH da seiva dependeu da época do ano. Exceto NO 3- e PO 4+3 , cujas concentrações na seiva do xilema foram maiores nos meses de temperaturas médias mais baixas, as concentrações dos demais nutrientes analisados não apresentaram um padrão relacionado com a época do ano. A concentração de ABA e Ca +2 , K + , Mg +2 , NH 4+ , NO 3- , PO 4-3 e SO 4- na seiva das plantas submetidas aos estresses lento e rápido aumentou com a progressão dos estresses. Nas plantas submetidas a estresses rápido ocorreu um aumento de 0,7 unidade no pH da seiva xilemática. A adição de cloreto de lantânio e vermelho de rutênio à seiva artificial inibiu a redução da taxa transpiratória promovida por ABA. Fusicocina promoveu uma redução de 30% na taxa transpiratória e inibiu os efeitos do ABA sobre a mesma. A redução na taxa transpiratória, promovida por ABA exógeno, variou com o pH e com os níveis de Ca +2 e NO 3- da solução de imersão e foi maior em folhas imersas em solução com pH 7,0, contendo NO 3- e Ca +2 . Os ácidos málico e cítrico, quando adicionados à seiva natural com pH 7,0, retardaram as reduções nas taxas transpiratórias. Dentre os aminoácidos, o ácido glutâmico promoveu reduções na taxa transpiratória. Os resultados mostraram que as interações entre os componentes da seiva xilemática envolvidos na sinalização variaram com a forma do estresse. É possível que, em tomateiro, o cálcio e a H + -ATPase estejam envolvidos na rota de transdução da sinalização do estresse hídrico, uma vez que tanto os inibidores de canais de cálcio quanto o ativador da H + -ATPase inibiram os efeitos do ABA sobre a taxa transpiratória. / To determine the action of xylem sap signaling compounds on the transpiratory rate, tomato plants were subjected to water stress induced by polyethylene glycol 6000 (PEG). Before stress, plants were cultivated in nutritive solution, under glasshouse conditions, and then transferred to a growth room (photoperiod of 14 hours, beginning at the 8:00 hours), photosynthetic photon flux density of 500 μmol m -2 s -1 , 20-23oC temperature and 60-63% relative humidity. The studies were accomplished in whole plants and in detached leaves. Plants were submitted to fast (hours after addition of PEG) and slow (days after addition of PEG) water stress. It was evaluated the relationship between transpiration and leaf water potential, concentration of abscisic acid (ABA), Ca +2 , K + , Mg +2 , NH 4+ , NO 3- , PO 4-3 and SO 4- and pH of the xylem sap. It was also evaluated the stomata sensibility to ABA contained in the xylem sap, in function of the variation of the levels of NO 3- , Ca +2 and PO 4+3 . In detached leaves of non-stressed plants, it was evaluated the effects of the fusicoccina, lanthanum chloride and ruthenium red, in combination with endogenous ABA, on the transpiratory rate. It was also evaluated the effects of different pH (5,5, 6,5 and 7,5), immersion solutions (nutrient solution 1/2 force, natural sap and artificial sap), concentrations of the organic acids malic, maleic and citric, the amino acids proline, asparagine, glutamine, aspartic acid and glutamic acid, the sugar-alcohols mannitol and sorbitol and the polyamine putrescine on transpiration. It was also evaluated the effects of the addition of those products to the natural sap pH 6,0 and 7,0 on the transpiratory rate. In plants, without stress, it was observed diurnal and seasonal alterations in pH and in nutrients of xylem sap. The pHs with values above 6 was observed on January and February, months of larger medium temperature. Starting from April the pH values were inferior to 6,0, reaching the smallest values, among 5,4-5,6, on June to September, months of smaller medium temperature. Except PO4-3, whose concentration in the sap stayed constant in the period, the other ions appeared in larger concentrations in the saps collected in April - June. K+ was the cation found in larger concentration in the sap (8-16 mM), representing 50-75% of the total concentration of all the analyzed cations. Its concentration reduced in 50% from 9:00 to 16:00 hours. NH 4+ NO 3- and PO 4-3 concentrations, increased during the day, while the concentrations of SO 4 - , Ca +2 and Mg +2 didn't vary. Under growth chamber it was observed reduction on stomatal conductance while transpiration remained constant. The transpiratory rate decreased as the pH became more alkaline, independent of the immersion solution or the addition of any composed to the solution. The acids maleic and citric just promoted small reductions in the transpiratory rate when added to the artificial sap. When added to the natural sap pH 6,0, which not corresponds to thepH of the sap of stressed plants, none of the acids promoted any alteration in the transpiratory rate. In pH 7, that it corresponds to the pH of the sap of stressed plants, the addition of the malic and citric acids to the sap delayed the reductions in the transpiratory rate. The results showed that the interactions among the components of the xylem sap involved in the signaling they varied with the form of the stress. It is possible that, in tomato, the calcium and H + -ATPase are involved in the route of transduction of the signaling of the water stress, once so much the inhibitors of channels of calcium as the activator of H + -ATPase inhibited the effects of ABA on the transpiratory rate.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2012. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-04-27T14:32:57Z No. of bitstreams: 1 2012_MariliaCristinaSantos.pdf: 1394849 bytes, checksum: a88cafb07ccc4ca0cb94f66cb1ecded9 (MD5) / Approved for entry into archive by Elzi Bittencourt(elzi@bce.unb.br) on 2012-05-01T12:38:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_MariliaCristinaSantos.pdf: 1394849 bytes, checksum: a88cafb07ccc4ca0cb94f66cb1ecded9 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-01T12:38:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_MariliaCristinaSantos.pdf: 1394849 bytes, checksum: a88cafb07ccc4ca0cb94f66cb1ecded9 (MD5) / O uso do silício na agricultura apresenta potencial para diminuir o uso de agrotóxicos, mantendo a qualidade dos frutos e protegendo o ambiente. Este trabalho teve o objetivo de avaliar as alterações na morfologia do intestino médio, mandíbula, biologia e não- preferência de oviposição de Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) causadas pela alimentação com compostos contendo silício, além de avaliar a melhor fonte e menor dose de silício eficaz no controle desta praga. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com cinco repetições, sendo vinte e um tratamentos, incluindo a testemunha [(Agrosilício® solo (t ha -1 de SiO2) - T1 0,45; T2 0,90; T3 1,35; T4 1,80); (Agrosilício® foliar (t ha -1 de SiO2) - T5 0,5; T6 1,0; T7 1,5; T8 2,0); (Sili-K® (l ha -1 do produto) - T9 0,5; T10 1,0; T11 2,0; T12 3,0); (Ácido silícico foliar (% de SiO2) - T13 0,5; T14 1,0; T15 2,0; T16 3,00); (Ácido silícico solo (% de SiO2) - T17 0,5; T18 1,0; T19 2,0; T20 3,00); controle (T21)]. Lagartas de T. absoluta foram alimentadas com diferentes compostos contendo silício e a histologia do intestino médio de lagartas de quarto ínstar foi analisada. As mandíbulas de todos os estádios larvais foram dissecadas e processadas para análise em microscópio eletrônico de varredura. As características biológicas avaliadas foram: duração das fases larval e pupal, sobrevivência de lagartas e pupas e peso de pupas machos e fêmeas. A não-preferência para oviposição de T. absoluta em plantas de tomateiro tratadas com silício foi avaliada através de testes com e sem chance de escolha. Não foram observadas alterações na morfologia das mandíbulas das lagartas de T. absoluta alimentadas com silício comparadas ao grupo testemunha. Lagartas de T. absoluta provenientes da testemunha e dos tratamentos onde o silicato de cálcio foi aplicado ao solo não mostraram diferenças na morfologia das células do epitélio do intestino médio, que foi formado por uma camada única de células onde quatro tipos celulares puderam ser identificados: células colunares, caliciformes, regenerativas e micetócitos. Em lagartas de T. absoluta obtidas dos tratamentos à base de silício aplicado via foliar, o epitélio digestivo médio apresentou descolamento da membrana basal. Não foram observadas diferenças na duração das fases larval e pupal, peso de pupas machos e fêmeas de T. absoluta e preferência de oviposição, nos indivíduos provenientes dos tratamentos com silício aplicado no solo e testemunha. Entretanto, insetos obtidos dos tratamentos à base de silício aplicado via foliar apresentaram aumento no número de dias das fases larval e pupal, diminuição do peso de pupas machos e fêmeas e diminuição na preferência de oviposição, o que pode caracterizar o possível efeito antialimentar deste elemento para lagartas de T. absoluta. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The use of silicon in agriculture has potential to reduce pesticide use, keeping fruit quality and protecting the environment. This study evaluated changes in the morphology of the midgut, mandibles, biology and non-preference for oviposition of Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) caused by feeding with compounds containing silicon. The experimental design was randomized blocks with five replicates, twenty one treatments, including control [(Agrosilício® soil (t ha -1 of SiO2) - T1 0,45; T2 0,90; T3 1,35; T4 1,80); (Agrosilício® leaves (t ha -1 of SiO2) - T5 0,5; T6 1,0; T7 1,5; T8 2,0); (Sili-K® (l ha -1 of product) - T9 0,5; T10 1,0; T11 2,0; T12 3,0); (Silicic Acid Leaves (% of SiO2) - T13 0,5; T14 1,0; T15 2,0; T16 3,00); (Silicic Acid Leaves (% de SiO2) - T17 0,5; T18 1,0; T19 2,0; T20 3,00); control (T21)]. T. absoluta larvae were fed with different compounds containing silicon and histology of the midgut of fourth instar larvae was analyzed. The mandibles of all larval instars were dissected and processed for scanning in electron microscope. The biological characteristics evaluated were: duration of larval and pupal stages, survival of larvae and pupae and pupal weight of males and females. The non-preference for oviposition of T.absoluta in tomato plants treated with silicon was evaluated using choice and non choice trials. There were no changes in the morphology of mandibles on T.absoluta fed with silicon compared to the control group. T. absoluta larvae from the control group and treatments where the calcium silicate was applied to the soil showed no differences in cell morphology of the epithelium of midgut, which was formed by a single layer of cells where four cell types could be identified: columnar cells, goblet, regenerative, and mycetocyte. However, in T.absoluta larvae obtained from leaf application silicon-based treatments, the medium digestive epithelium showed detachment of the basement membrane. There were no differences in duration of larval and pupal stages, pupal weight of males and females of T.absoluta and oviposition preference from the treatments with silicon applied to the soil and those in the control group. However, individuals obtained from leaf application silicon-based treatments showed an increased in the larval and pupal stages, decreased weight of pupae males and females and decreased oviposition preference, which may characterize the possible deterrent effect of this element for larvae of T. absoluta.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-02-03T14:00:48Z No. of bitstreams: 1 2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-14T19:07:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T19:07:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / O tomateiro é uma solanácea cultivada em várias partes do mundo, com fruto rico em compostos com propriedades antioxidantes e anticancerígenas. A tomaticultura está sujeita a várias doenças que podem limitar sua produção, diversos vírus têm sido descritos e estão amplamente disseminados nos campos de produção. As viroses estão dentre as doenças de maior importância, pois são de difícil controle e não existem produtos anti-virais disponíveis no mercado. A diagnose das espécies virais é realizada comumente por técnicas tradicionais e modernas, testes sorológicos como o ELISA e testes moleculares como a RT-PCR e a PCR são utilizados para detecção de patógenos previamente caracterizados. As limitações dessas técnicas aparecem quando se trata da detecção e identificação de um novo vírus. Identificar o agente causador de uma nova doença, onde não se tem informações sobre a morfologia, composição ou características químicas e físicas do patógeno, utilizando tais técnicas juntamente com microscopia eletrônica constitui uma tarefa difícil que pode demorar meses ou anos. Devido a essas dificuldades, novas abordagens para melhorar a identificação dos agentes causadores de novas doenças foram desenvolvidas. A abordagem metagenômica utilizando o método de Sanger gerou uma série de realizações importantes, porém, ao final do século XX, o sequencimento de alto desempenho (Next generation sequencing – NGS) foi lançado para suprir as limitações desse método. O sequenciamento de alto desempenho sequencia massalmente a população de ácidos nucleícos presentes em uma amostra, gerando sequências curtas de uma ou de ambas as extremidades, conhecidas como reads. O advento dessa forma de sequenciar transformou os estudos metagenômicos de grande escala em procedimentos práticos e de baixo custo. Com o objetivo de conhecer a população viral (viroma) e de obter genomas virais completos ou parciais, o sequenciamento de alto desempenho foi implementado para detectar patógenos virais em tomateiros de Brazlândia (DF), Campinas (SP) e Araguari (MG). Amostras de tomateiros que apresentavam sintomas típicos de infecções virais foram coletadas e agrupadas em cinco amostras compostas: BRAZ, com plantas de Brazlândia e AHOL, TOCA1, TOCA2, com plantas de Campinas e CAM-RNY2, com plantas de Araguari. As amostras compostas foram submetidas ao processo de semi-purificação de partículas virais, à extração de RNA e posteriormente foram enviadas para sequenciamento na plataforma Illumina HiSeq2000, na Macrogen (Coréia do Sul). Diversos vírus de ocorrência habitual nos campos de produção brasileiros foram detectados: os tospovírus Groundnut ringspot virus, o Tomato spotted wilt virus; o tobravírus Pepper ringspot virus; o crinivírus Tomato chlorosis virus; os begomovírus Sida micrantha mosaic virus e o Tomato severe rugose virus; o tymovírus Tomato blistering mosaic virus; e os potyvírus Pepper yellow mosaic virus e Potato virus Y. O Pepper mild mottle virus foi detectado como um resultado inesperado, devido à predominância de tobamoviroses causadas por Tomato mosaic virus em tomateiro. Dois contigs da amostra BRAZ geraram suspeitas de existência de uma nova espécie de ilarvírus, devido a sua baixa identidade com Ageratum latent virus e Parietaria mottle virus. O amalgavírus Southern tomato virus foi detectado em todas as bibliotecas e dois genomas semi-completos foram montados (STV-DF e STV-MG). Esses genomas mostraram alta identidade de nucleotídeos entre si e com os demais isolados de STV depositados no banco de dados. O STV é um vírus de RNA fita-dupla de aproximadamente 3,5 Kbp, pertencente ao gênero Amalgavirus, que foi descrito na América do Norte (Estados Unidos e México). Não há evidências de transmissão mecânica ou por enxertia desse vírus, porém, estudos anteriores confirmaram elevadas taxas de transmissão vertical (70% – 90%). Os relatos desse vírus têm crescido nos últimos anos, foi relatado também na França, na Espanha, na China, na Itália e em Bangladesh. A detecção sempre em co-infecção com outros vírus e a ausência de sintomas em plantas positivas para o vírus gerou dúvidas a respeito de sua patogenicidade, porém sua alta taxa de transmissão vertical e a expansão de sua distribuição gerou preocupações para a indústria do tomate. Maiores estudos são necessários para definir o efeito de sua presença em lotes de sementes comerciais e o seu potencial de patogenicidade. Com o objetivo de caracterizar o isolado de STV encontrado no Brasil, a presença desse vírus foi confirmada e foi realizado um estudo filogenético, além da detecção por RT-PCR em plantas coletadas no campo e em sementes comerciais de tomateiro utilizando dois pares de primers. Todas as amostras compostas originais testadas apresentaram resultados positivos para RT-PCR, com ambos os primers. A clonagem e sequenciamento de fragmento gerado a partir da amostra BRAZ possibilitou a obtenção dos nucleotídeos faltantes na sequência STV-DF. A análise filogenética da RNA polimerase pelo método da máxima verossimilhança, mostrou agrupamento dos isolados de STV-DF e STV-MG com as demais sequências de STV. Os isolados de STV permaneceram próximos a outros vírus pertencentes à família Amalgaviridae, que se mostraram mais próximos dos vírus da família Partitiviridae que do vírus pertencente à família Totiviridae. O vírus foi detectado em amostras coletadas em Brazlândia e Taquara (DF), em São José do Rio Preto (SP), em Corúmba de Goiás, Morrinhos e Goianápolis (GO) e em Reserva (PR) As plântulas testadas das cultivares Predador, Santa Clara, H-9992 e H-9553 também apresentaram resultados positivos para infecção por STV. A alta similaridade entre os isolados de STV encontrados e os existentes e a detecção desse vírus em plântulas de sementes comerciais indicam uma provável introdução do vírus através de materiais vegetais importados. Aproximadamente um sétimo dos vírus de plantas conhecidos são transmitidos por sementes de pelo menos uma espécie vegetal por ele infectada. A detecção desse vírus em plântulas oriundas de sementes comerciais demonstra a fragilidade do controle do material vegetal que entra no país. Quatorze países exportam sementes de tomate para o Brasil sem a análise de risco de pragas por estarem autorizados pelo MAPA. Embora a importação seja importante para a economia do país, a ineficiência das medidas fitossanitárias para autorizar a entrada das sementes pode trazer consequências desastrosas para agricultura brasileira. / The tomato is a solanaceous plant, rich in substances with antioxidant properties, and which is cultivated in several regions of the world. Susceptible to infection by different viruses, the tomato production has serious risks that limit its production. Viruses are among the most important diseases because of the difficulty in their control. The diagnosis of viral species is commonly carried out by traditional and modern techniques, such as serological and molecular tests such as PCR or RT-PCR, which are used to detect previously characterized pathogens. These tools have limitation in cases when there is a need for detection and identification of unknown viruses. The identification of the etiological agent of a new disease, i.e. without information on particle morphology, genome composition and chemical and physical properties, starting from electron microscopy, is a difficult task that can take months or years to accomplish. To circumvent these difficulties, new techniques were developed. The metagenomics approach, using the Sanger method, has generated a number of important achievements, but at the end of the 21st century, high-performance sequence was launched to overcome the limitations of this method. The Next generation sequencing (NGS) strategy enables the determination of sequences of the whole population of nucleic acids present in a sample, by generating sequences of one or both ends (named reads). The advent of this sequencing technique has transformed metagenomic studies of large-scale practical and with a low cost. In order to determine the viral population (virome) and assemble the complete or partial viral genomes present in tomato plants, high-performance sequencing has been implemented in plants collected in the regions Brazlândia (DF), Campinas (SP) and Araguari (MG). Tomato samples with typical symptoms of viral infections were collected and grouped into five composite samples: BRAZ, containing plants collected in Brazlândia; AHOL, TOCA1, TOCA2 from Campinas; and CAM-RNY2 from Araguari. The composite samples were subjected to the process of semi-purification of viral particles, extraction of RNA and sequencing on Illumina platform HiSeq2000 at Macrogen, Inc. (South Korea). Several viruses commonly found in Brazilian production fields were detected, such as tospovírus Groundnut ringspot virus and Tomato spotted wilt virus; the tobravírus Pepper ringspot virus; the crinivírus Tomato chlorosis virus; the begomovírus Sida micrantha mosaic virus and Tomato severe rugose virus; the tymovírus Tomato blistering mosaic virus; and the potyvírus Pepper yellow mosaic virus and Potato virus Y. The tobamovirus Pepper mild mottle virus was also detected, though this result was not expected due to the predominance of Tomato mosaic virus in tomato. Two contigs generated from BRAZ sample showed a proximity to the ilarvirus Ageratum latent virus and Parietaria mottle virus suggesting the presence of a new ilarvirus in the plants. The amalgavirus Southern tomato virus (STV) was detected in all libraries and two semi-complete genomes (STV-DF and STV-MG) were assembled. These genomes showed high nucleotide identity each other and among other STV sequences deposited in nucleotide databases. STV is a double-stranded RNA virus of approximately 3.5 kbp, belonging to the genus Amalgavirus, which was described in North America (United States and Mexico). There is no evidence for mechanical transmission or by grafting of this virus, however, previous studies have confirmed high vertical transmission rates (70% - 90%). The reports of this virus have increased in the last years, being reported in France, Spain, China, Italy and Bangladesh. Questions regarding its pathogenicity properties are unanswered since they are usually detected in co-infection with other viruses and because of the absence of symptoms in positively infected plants. Its high rate of vertical transmission and the expansion of its worldwide spread are of big concerns for the tomato industry. Further studies are needed to define the effect of their presence in batches of commercial seeds and its potential for pathogenicity. In order to characterize the STV isolates found in Brazil, the presence of this virus has been confirmed and we performed a phylogenetic study, in addition to the RT-PCR using two primer sets, detection in plants collected in the field and in commercial tomato seeds. The original composite test samples were all positive for RT-PCR with both primer sets. The gap on the STV NGS-sequence from Brazlândia was filled by cloning and sequencing of an RT-PCR amplified fragment. The phylogenetic analysis of the RNA-dependent RNA polymerase gene by the maximum likelihood method showed grouping of STV-DF and STV-MG sequences with other STV sequences reported throughout the world. The STV sequences were closely related to viruses of other genus within the family Amalgaviridae, and to those of Partitiviridae than to those of Totiviridae. The virus was detected in new samples from Brazlândia and Taquara (DF), in São José do Rio Preto (SP), in Corumba de Goiás, Morrinhos and Goianápolis (GO), and Paraná (PR). Seedlings tested for the detection of STV of the cultivars Predator, Santa Clara, H-9992 and H-9553 were positive. The high identity among the isolates and the high incidence rate of STV in seeds indicate a possible introduction of the virus from the tomato seeds. Approximately one in seven known plant viruses is transmitted by seeds of at least one plant species. The detection of this virus in commercial seed seedling demonstrates the fragility in the control system of importation of plant materials. Fourteen countries export tomato seeds to Brazil without the need of risk analysis of pests because they are authorized by MAPA. Although this importation is important for the tomato production chain, the inefficiency of phytosanitary regulation system by authorizing the entry of contaminated seeds can have disastrous consequences for the Brazilian agriculture.