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MÉTODOS MOLECULARES E CARACTERÍSTICAS BIOLÓGICAS DE Trichospilus diatraeae E Palmistichus elaeisis (HYMENOPTERA: EULOPHIDAE) / MOLECULAR METHODS AND BIOLOGICAL CHARACTERISTICS Trichospilus - diatraeae AND elaeisis Palmistichus (HYMENOPTERA: EULOPHIDAE)Calado, Vanessa Rodrigues Ferreira 27 February 2015 (has links)
Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-04-11T18:17:18Z
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Previous issue date: 2015-02-27 / Trichospilus diatraeae Cherian & Margabandhu e Palmistichus elaeisis Delvare &LaSalle (Hymenoptera: Eulophidae) are endoparasitoids pupal, preferably lepidopteran and has the potential to be used exclusively or associated with other parasitoids, for the control of insect pests in different agricultural and forest crops. The mass rearing of these parasitoids is known, but nothing is known about the quality of the insects produced after several generations in the laboratory. The objective of this study is to compare biological characteristics of three populations of Trichospilus diatraeae and Palmistichus elaeisis created in pupae of D. saccharalis for twenty generations and to evaluate possible changes in the genetic variability of these parasitoids using molecular markers. In F1, F5, F10, F15 and F20, each parasitoid, the duration of the life cycle, the parasitism, emergence percentage, the number of parasitoids emerged per pupa, longevity of the children, the sex ratio were evaluated, was also evaluated test of two DNA extraction protocols and the transferability of molecular markers for optimization of genetic testing. The creation of T. diatraeae and P. elaeisis in pupae of D. saccharalis for 20 successive generations did not affect parasitism and the sex ratio of their offspring. There were variations in the progeny, but the life cycle, longevity and the size of the head capsule of parasitoids remained at good levels, ie absence of drastic reductions in biological variables. The protocol A (Chelex®) is possible and feasible to be used, the optimization of this technique allowed the use of DNA samples T. diatraeae and P. elaeisis in the PCR reaction with satisfactory results. In T. diatraeae and P. elaeisi reared in the laboratory on two polymorphisms were found microsatellite markers, this indicates that may be considered to be implemented as markers for identifying individuals belonging tothe same family. / Trichospilus diatraeae Cherian & Margabandhu e Palmistichus elaeisis Delvare & LaSalle (Hymenoptera: Eulophidae) são endoparasitoides pupais, preferencialmente de lepidópteros e, tem potencial para serem utilizados exclusivamente ou associados à outros parasitoides, visando o controle de insetos-praga em diferentes culturas agrícolas e florestais. A técnica de produção desses parasitoides é conhecida, porém nada se sabe sobre a qualidade dos insetos produzidos após várias gerações em laboratório. O objetivo foi comparar características biológicas de três populações de T. diatraeae e de P. elaeisis criados em pupas de Diatraea saccharalis (Fabricius) (Lepidoptera: Crambidae) por vinte gerações. Nas gerações F1, F5, F10, F15 e F20, de cada parasitoide, a duração do ciclo de vida (ovo-adulto), as porcentagens de parasitismo e de emergência, o número de parasitoides emergidos por pupa, a longevidade dos descendentes, a razão sexual foram avaliados. Além disso, foi avaliado dois protocolos de extração de DNA e a transferibilidade de marcadores moleculares para otimização das análises genéticas. A criação de T. diatraeae e P. elaeisis em pupas de D. saccharalis por 20 gerações sucessivas não afetou o parasitismo e a razão sexual de seus descendentes. Houve variações na progênie, porém o ciclo de vida, a longevidade e o tamanho da cápsula cefálica dos parasitoides se mantiveram em níveis bons, ou seja, ausência de reduções drásticas das variáveis biológicas. O protocolo A (Chelex®) é possível e viável de ser utilizada, a otimização desta técnica permitiu utilizar as amostras de DNA de T. diatraeae e P. elaeisis na reação de PCR com resultados satisfatórios. Em T. diatraeae e P. elaeisi criados em laboratório foram encontrados polimorfismo em dois marcadores microssatélites, o que indica que podem ser consideradas como marcadores para ser aplicados na identificação de indivíduos pertecentes a mesma família.
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Validação de marcadores microssatélites derivados de regiões funcionais do genoma de aveia / Validation of microsatellite markers derived from functional regions of the oat genomeSantos, Fabiana Fonseca dos 17 August 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-08-17 / The understanding of the genetic structure of the oat species can be obtained with the use of microsatellite molecular markers which represent powerful tools in the investigation of genetic parameters. This study aimed to search the identification and characterization of microsatellite markers occurrence in oat through bioinformatics, describing the possible role of individual genes based on the genome of rice and Arabidopsis thaliana. For the development and validation of EST (Expressed Sequence Tags) primers, sequences were obtained from a public database. A total of 7632 oat contigs were obtained after eliminating the redundancy. To characterize SSR (simple sequence repeats) loci, the SSRLocator program was used. For the design of primers, the module containing the program Primer3 was used. A total of 58 primers were found, from which ten were selected for validation by polymerase chain reaction. Ten genotypes were used to assess polymorphism detection ability of primers. Polymorphism was observed in 80% of primers, whereas the rest showed monomorphic bands. The high genetic diversity revealed by microsatellite markers in this study may reflect a high genetic diversity within the germplasm of Avena sativa. / O conhecimento da estrutura genética de diversas espécies de aveia pode ser obtido com o uso de marcadores moleculares microssatélites, os quais representam poderosa ferramenta na averiguação de parâmetros genéticos. Este trabalho teve como objetivo buscar a identificação e a caracterização da ocorrência de marcadores microssatélites em aveia através da bioinformática, descrevendo a possível função de cada um dos genes, com base no genoma do arroz e da Arabidopsis thaliana. Visando o desenvolvimento e a validação de primers, foram obtidos a partir de um banco de dados público de EST (Expressed Sequence Tag) de aveia um total de 7.632 contigs que tiveram eliminada sua redundância, e para caracterização de locos SSR (Simple Sequence Repeat) foi utilizado o programa SSRLocator. Para o desenho de iniciadores foi utilizado no SSRLocator o módulo contendo o programa Primer3 sendo encontrados 58 primers, dos quais dez foram selecionados para a validação através da reação
em cadeia da polimerase. Dez genótipos de aveia foram avaliados quanto ao nível de polimorfismo. Foi verificado polimorfismo em 80% dos primers, sendo que, o restante apresentou bandas monomórficas. A alta diversidade gênica revelada pelos marcadores microssatélites neste estudo possivelmente reflete uma alta diversidade genética dentro do germoplasma de Avena sativa.
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Assessing the transferability of crash prediction models for two lane highways in Brazil / Avaliação da transferabilidade de modelos de previsão de acidentes em rodovias de pista simples do BrasilSilva, Karla Cristina Rodrigues 04 September 2017 (has links)
The present study focused on evaluating some crash prediction models for two lane highways on Brazilian conditions. Also, the transferability of models was considered, specifically by means of a comparison between Brazil, HSM and Florida. The analysis of two lane highways crash prediction models was promising when the road characteristics were well known and there was not much difference from base conditions. This conclusion was attained regarding the comparison of results for all segments, non-curved segments and curved segments, confirming that a transferred model can be used with caution. In addition, two novel models for Brazilian two-lane highways segments were estimated. The model developed showed better results for non-curved segments in the calibration/validation sample. Thus, for a general analysis purpose of non-curved segments this model is recommended. Finally, there are many factors that could not be measured by these models and reflects road safety various condition. Even so, the study of crash predict models in Brazilian context could provide a better start point in safety road analysis. / O foco desta pesquisa foi avaliar a aplicação de alguns modelos de previsão de acidentes em rodovias de pista simples de três estados brasileiros. Ainda, a transferabilidade destes modelos foi abordada, especificamente por meio de uma comparação entre características do Brasil, Florida e aquelas recomendadas pelo Highway Safety Manual. O uso dos distintos modelos se mostrou promissor para situações nas quais as características da via se mantiveram semelhantes às condições para as quais os modelos foram desenvolvidos. A avaliação foi empreendida para todos os segmentos homogêneos, separados posteriormente segundo a existência de curvas horizontais. Adicionalmente, dois novos modelos foram equacionados para a amostra brasileira. O modelo de previsão de acidentes desenvolvido apresentou melhores medidas de desempenho para segmentos sem curvas horizontais, sendo recomendável para previsão de acidentes em análises preliminares. Por fim, foi constatado que outros fatores não contemplados pelos modelos podem ter impactado as condições de segurança dos locais estudados. Ainda assim, essa pesquisa representa no contexto do Brasil um ponto de partida em análises relacionadas à segurança de rodovias de pista simples.
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Assessing the transferability of crash prediction models for two lane highways in Brazil / Avaliação da transferabilidade de modelos de previsão de acidentes em rodovias de pista simples do BrasilKarla Cristina Rodrigues Silva 04 September 2017 (has links)
The present study focused on evaluating some crash prediction models for two lane highways on Brazilian conditions. Also, the transferability of models was considered, specifically by means of a comparison between Brazil, HSM and Florida. The analysis of two lane highways crash prediction models was promising when the road characteristics were well known and there was not much difference from base conditions. This conclusion was attained regarding the comparison of results for all segments, non-curved segments and curved segments, confirming that a transferred model can be used with caution. In addition, two novel models for Brazilian two-lane highways segments were estimated. The model developed showed better results for non-curved segments in the calibration/validation sample. Thus, for a general analysis purpose of non-curved segments this model is recommended. Finally, there are many factors that could not be measured by these models and reflects road safety various condition. Even so, the study of crash predict models in Brazilian context could provide a better start point in safety road analysis. / O foco desta pesquisa foi avaliar a aplicação de alguns modelos de previsão de acidentes em rodovias de pista simples de três estados brasileiros. Ainda, a transferabilidade destes modelos foi abordada, especificamente por meio de uma comparação entre características do Brasil, Florida e aquelas recomendadas pelo Highway Safety Manual. O uso dos distintos modelos se mostrou promissor para situações nas quais as características da via se mantiveram semelhantes às condições para as quais os modelos foram desenvolvidos. A avaliação foi empreendida para todos os segmentos homogêneos, separados posteriormente segundo a existência de curvas horizontais. Adicionalmente, dois novos modelos foram equacionados para a amostra brasileira. O modelo de previsão de acidentes desenvolvido apresentou melhores medidas de desempenho para segmentos sem curvas horizontais, sendo recomendável para previsão de acidentes em análises preliminares. Por fim, foi constatado que outros fatores não contemplados pelos modelos podem ter impactado as condições de segurança dos locais estudados. Ainda assim, essa pesquisa representa no contexto do Brasil um ponto de partida em análises relacionadas à segurança de rodovias de pista simples.
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Gen?tica e biologia reprodutiva de vriesea minarum (Bromeliaceae): em busca de estrat?gias de conserva??o no quadril?tero ferr?fero, minas geraisRolim, P?mela Lavor 11 March 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-03-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Vriesea minarum is a rupiculous bromeliad species, with naturally fragmented populations, restricted to the Iron Quadrangle, Minas Gerais, Brazil. It is a threatened species, which is suffering from habitat loss due to the growth of cities and mining activities. The knowledge of genetic variability in plant populations is one of the main branches of conservation genetics, linking genetic data to conservation strategies while the knowledge about plant reproductive biology can aid in understanding key aspects of their life story, as well as in the comprehension of their distribution and survival strategies. Thus, the study of diversity, richness, and genetic structure, as well as the reproductive biology of populations of V. minarum can contribute to the development of conservation actions. Chapter 1 presents the transferability of 14 microsatellite loci for V. minarum. Among the results of this chapter, we highlight the successful transferability of 10 microsatellite loci described for other species of Bromeliaceae, all of which are polymorphic. In Chapter 2, we present the genetic analyses of 12 populations of V. minarum that are distributed throughout the Iron Quadrangle. We used the 10 microsatellite loci tested in Chapter 1. The results show a low population structuring (Fst = 0.088), but with different values of genetic richness (mean = 2.566) and gene diversity (mean = 0.635) for all populations; and a high inbreeding coefficient (Gis = 0.376). These may be the result of pollinators action and/or efficient seed dispersal, thus allowing a high connectivity among populations of naturally fragmented outcrops. The reproductive biology and floral morphology of a population of V. minarum, located in the Parque Estadual da Serra do Rola-Mo?a, are studied in Chapter 3. This reserve is the only public environmental protection area where the species occurs. As a result of field experiments and observations, we found that the species has its flowering period from January to March, with flowers that last for two days and that it has a mixed pollination syndrome. It is primarily alogamous, but also has the capacity to be self-ferilized. It is expected that data obtained in chapters 1, 2 and 3 serve as basis for other studies with species from the ferruginous rocky fields, since until now, to our knowledge, there are no other survey of endemic species from the Iron Quadrangle, seeking to merge the genetic knowledge, with the data of the reproductive biology, with the ultimate aim of biodiversity conservation. Considering the great habitat loss for the species by mining, it becomes crucial to analyze the creation of new protected areas for its conservation / Vriesea minarum ? uma esp?cie de brom?lias rup?cola, com popula??es naturalmente fragmentadas, restrita a regi?o do Quadril?tero Ferr?fero, em Minas Gerais, Brasil. ? uma esp?cie amea?ada, que est? sofrendo com a perda de habitat devido ao crescimento das cidades e ?s atividades de minera??o. O conhecimento da variabilidade gen?tica em popula??es de plantas ? um dos principais ramos de gen?tica da conserva??o, associando dados gen?ticos para as estrat?gias de conserva??o, enquanto que o conhecimento sobre a biologia reprodutiva pode ajudar na compreens?o de aspectos fundamentais da hist?ria de vida, distribui??o e estrat?gias de sobreviv?ncia das plantas. Assim, o estudo da diversidade, riqueza, estrutura gen?tica e biologia reprodutiva das popula??es de V. minarum podem contribuir para o desenvolvimento de a??es de conserva??o. O cap?tulo 1 apresenta a transferabilidade de 14 loci de microssat?lites para V. minarum. Entre os resultados desse cap?tulo, destaca-se o sucesso da transferabilidade de 10 loci de microssat?lites descritos para outras esp?cies de Bromeliaceae, sendo todos eles polim?rficos. No cap?tulo 2, ? apresentada a gen?tica de 12 popula??es de V. minarum que se distribuem por todo o Quadril?tero Ferr?fero. Os resultados obtidos mostram pouca estrutura??o entre as popula??es (Fst = 0,088), mas com diferentes valores de riqueza (m?dia = 2.566) e diversidade gen?tica (m?dia = 0.635) para todas as popula??es; o coeficiente de endogamia foi alto (Gis = 0.376). Estes dados podem ser resultado da a??o de polinizadores e/ou dispers?o de sementes eficientes, j? que as popula??es s?o naturalmente fragmentadas. No cap?tulo 3, ? estudada a biologia reprodutiva e morfologia floral de uma popula??o de V. minarum, situada no Parque Estadual da Serra do Rola-Mo?a, Minas Gerais. Como resultado, foi poss?vel identificar que a esp?cie possui flora??o de janeiro a mar?o; com flores que duram dois dias; s?ndrome mista de poliniza??o; sendo primariamente al?gama, mas tamb?m tem capacidade para ser auto fecundada. Espera-se que dados obtidos nos cap?tulos 1, 2 e 3 sirvam como base para outros estudos com esp?cies de campos rupestres ferruginosos, j? que at? o presente momento, n?o ? de nosso conhecimento a exist?ncia de registros de outras pesquisas feitas com esp?cies end?micas do Quadril?tero Ferr?fero, que busquem conciliar o entendimento da gen?tica, com os dados da biologia reprodutiva, tendo como alvo a conserva??o da biodiversidade neste h?bitat altamente amea?ado pela minera??o. Torna-se crucial uma an?lise cuidadosa para a cria??o de novas ?reas de prote??o, para conserva??o das popula??es da esp?cie
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