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Population genetics and natural history of Triatoma sanguisuga in southeastern Louisiana

January 2017 (has links)
acase@tulane.edu / The United States is home to eleven species of triatomine insects that can carry and transmit the parasite that causes Chagas disease, Trypanosoma cruzi. Much of the natural history of these vectors remains unknown. This is especially true of the species native to southeastern Louisiana, Triatoma sanguisuga. To this end experiments were undertaken to understand the movements, blood meal sources, and associated vertebrates of T. sanguisuga. Sites of genetic variability were sequenced and compared to determine how related T. sanguisuga spatially aggregate. It is demonstrated that the cytochrome b gene can be used to identify sub-populations of these insects and monitor their spatial aggregation over a multi-year period. Genetic analysis suggests the presence of wide-spread sub-populations. The sources of vertebrate blood meals were determined from collected specimens to determine the most frequent bloodmeal sources. The most frequent bloodmeal sources were found to be from humans, cows, pigs, dogs, and raccoons - though some of these sequences are likely the result of laboratory contamination. Finally, habitat modeling of T. sanguisuga provides a framework for assessing the shared habitats of T. sanguisuga and its vertebrate food sources. By using publicly available reports of T. sanguisuga, a model representing suitable habitat for the vector was created. By comparing this distribution to similar distribution models of associated animals, it was determined that the most statistically significant overlap of suitable habitats occurs between T. sanguisuga and two small rodent species, Oryzomys palustris and Neotoma floridana. The present research adds significantly to the limited knowledge of the natural history of this vector species. The work provides a foundation on which to build evidence-based risk assessments of autochthonous human Chagas disease in southeastern Louisiana and beyond. / 1 / Samuel B Jameson
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Identifying Spatial Data Needs for Chagas Disease Mitigation

Morris, Emily 18 August 2015 (has links)
The objective of this thesis is to analyze how existing data can address Chagas disease transmission risk in South America given data availability. A literature review was conducted to determine prominent variables that models use to assist with Chagas disease mitigation efforts, followed by a Web search to collect publicly available spatial data pertaining to these variables. The data were then used to create maps of data availability and in an agent-based model to identify which variables are most associated with disease transmission risk. Data availability varied widely across South America, and model results indicate that datasets related to household size and spatial housing arrangement are most important to Chagas disease infection in urban areas. Governments can use this information to better direct their resources to collect data and control the spread of triatomine vectors and Chagas disease more effectively, and potentially identify more cost-effective strategies for vector elimination.
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DetecÃÃo do DNA de Trypanosoma cruzi por PCR em sangue de pacientes com doenÃa de Chagas crÃnica e em dejetos de triatomÃneos utilizados para o xenodiagnÃstico / THE DETECTION OF TRYPANOSOMA CRUZI BY PCR-MULTIPLEX IN BLOOD OF PATIENTS WITH SUSPECTED DISEASE CHRONIC WOUNDS AND WASTE OF USED FOR XENODIAGNOSIS TRIATOMINES.

Allan Rodrigo Soares Maia 23 January 2012 (has links)
FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / A doenÃa de Chagas à causada pelo parasito intracelular Trypanosoma cruzi e afeta em torno de 17 milhÃes de pessoas na AmÃrica Latina. A fase crÃnica da doenÃa caracteriza-se por baixo nÃvel de parasitemia e alto nÃvel de anticorpos Anti-T.cruzi e o diagnÃstico à feito preferencialmente utilizando-se mÃtodos sorolÃgicos, incluindo imunofluorescÃncia indireta (IFI), hemaglutinaÃÃo indireta (HAI) e imunoensaio enzimÃtico (ELISA). SÃo testes que apresentam alta sensibilidade, mas sofrem de baixa especificidade, e um variÃvel nÃmero de indivÃduos apresenta testes sorolÃgicos inconclusivos. Nos Ãltimos anos, muitos estudos tÃm usado a tecnologia da ReaÃÃo em Cadeia da Polimerase (PCR) para detectar sequÃncias de DNA de T. cruzi em sangue de pacientes chagÃsicos crÃnicos. A alta especificidade da PCR tem apontado para sua aplicaÃÃo como mÃtodo confirmatÃrio no diagnÃstico de pacientes com provas sorolÃgicas inconclusivas. O objetivo desse trabalho foi realizar uma anÃlise comparativa entre a PCR e os mÃtodos convencionais mais utilizados para o diagnÃstico - sorologia e xenodiagnÃstico, na detecÃÃo da infecÃÃo por T. cruzi, em indivÃduos com doenÃa de Chagas crÃnica. Sangue de 67 pacientes chagÃsicos crÃnicos, ambos os sexos, provenientes do ambulatÃrio de doenÃa de Chagas do Hospital UniversitÃrio Walter CantÃdio, da Universidade Federal do CearÃ, foram avaliados para T. cruzi, utilizando testes sorolÃgicos (IFI, HAI e ELISA), PCR-Multiplex e xenodiagnÃstico. AlÃm disso, foi avaliado tambÃm a PCR-Multiplex em dejetos de triatomÃneos provenientes do xenodiagnÃstico destes pacientes. De acordo com o resultado dos testes sorolÃgicos, os pacientes foram classificados em 3 grupos: 1Â. Sorologia positiva (quando 2 ou 3 resultados dentre os 3 testes sorolÃgicos foram positivos), 2Â. Sorologia inconclusiva ou indeterminado (apenas 2 resultados foram negativos) e 3Â. Sorologia negativa (quando os 3 resultados foram negativos). Dentre as 59 amostras com sorologia positiva foram obtidos 18 (30,5%) resultados positivos de PCR-Multiplex em sangue perifÃrico e 41 (69,5%) resultados negativos. Nos PCR-Multiplex em dejetos de triatomÃneos foram obtidos 20 (33,9%) resultados positivos e 39 (66,1%) resultados negativos. As 2 amostras com sorologia inconclusiva foram negativas na PCR-Multiplex, tanto em sangue perifÃrico como em dejetos de triatomÃneos. As amostras com sorologia negativa (n=6) apresentaram 2 resultados positivos (33,3%) na PCR-Multiplex em sangue e 4 resultados negativos (66,7%). Nos dejetos de triatomÃneos, as 6 amostras com sorologia negativa foram negativas na PCR-Multiplex. Estes resultados mostraram que o ensaio da PCR-Multiplex em amostras de sangue perifÃrico e em dejetos de triatomÃneos, empregando iniciadores para regiÃes diferentes, no caso, DNA nuclear e DNA do cinetoplasto, podem ser aplicados para o diagnÃstico da doenÃa de Chagas crÃnica (mesmo com diferentes metodologias de extraÃÃo de DNA total). Os dados mostraram tambÃm que a PCR-Multiplex em dejetos de triatomÃneos à mais sensÃvel que o ensaio do xenodiagnÃstico.
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Estudo de transcriptomas por RNAseq em tecidos de cabeça e glândula salivar de Rhodnius montenegrensis e Rhodnius robustus (Hemiptera, Reduviidade, Triatominae) / Transcriptome analysis supports Rhodnius montenegrensis and Rhodnius robustus (Hemiptera, Reduviidae, Triatominae) as distinct species

Carvalho, Danila Blanco de [UNESP] 14 March 2016 (has links)
Submitted by DANILA BLANCO DE CARVALHO null (28472552810) on 2016-04-12T17:41:32Z No. of bitstreams: 1 Tese - Dr. Danila Blanco de Carvalho.pdf: 6148040 bytes, checksum: 510e83862caa6edf09797bb1e816f80b (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-04-13T16:58:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_db_dr_arafcf.pdf: 6148040 bytes, checksum: 510e83862caa6edf09797bb1e816f80b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T16:58:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_db_dr_arafcf.pdf: 6148040 bytes, checksum: 510e83862caa6edf09797bb1e816f80b (MD5) Previous issue date: 2016-03-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A doença de Chagas é uma das principais parasitoses que ocorrem na América Latina, cujo agente etiológico é o protozoário Trypanosoma cruzi, que é veiculado por triatomíneos. Estima-se que entre oito milhões de pessoas estejam infectadas. Rhodnius é um dos gêneros que pode veicular T. cruzi e inclui espécies estreitamente relacionadas com baixos níveis de diferenciação morfológica. Atualmente, existem 19 espécies conhecidas, entre elas, Rhodnius montenegrensis que é considerada a fim de Rhodnius robustus. Para investigar as diferenças genéticas interespecíficas dessas duas espécies utilizou-se a metodologia de larga escala RNA-seq. Por essa técnica foram geradas quatro bibliotecas de RNA total de cabeças e glândulas salivares de machos de R. montenegrensis e R. robustus. Após filtrar pela qualidade, foram realizadas montagens de novo de cada uma das espécies. Esse processo resultou em 64952 contigs para R. montenegrensis e 70894 para R. robustus com N50 de 2100 para as duas espécies aproximadamente. Com base na montagem de R. robustus, foi feita uma procura por SNPs e foram encontrados 3055 polimorfismos interespecíficos fixados. Foram selecionados 216 transcritos com alta divergência contendo apenas polimorfismos fixados entre as duas espécies. O teste de enriquecimento nesses transcritos revelou uma sobrerepresentação de oito termos relacionados ao complexo da proteína clatrina. Os resultados obtidos mostram que R. montenegrensis e R. robustus apresentam uma quantidade substancial de polimorfismos interespecíficos fixados o que sugere um alto grau de divergência genética entre as duas espécies. / Chagas disease is one of the main parasitic diseases found in Latin America infecting an estimated eight million people worldwide. The protozoan Trypanosoma cruzi, its etiological agent, uses triatomines as a disease vector, among them the genus Rhodnius. This genus includes species that have been difficult to differentiate because they show low amounts of morphological differentiation. Despite that, there are currently 19 known species described, one of them Rhodnius montenegrensis, which has been confounded with Rhodnius robustus. Here we generated Large-scale RNA-sequencing data from heads and salivary glands to investigate genetic differences between these two species. We produced a total of four RNAseq libraries from heads and salivary glands of males of R. montenegrensis and R. robustus. de novo transcriptome assemblies produced for each species resulted in 64,952 contigs for R. montenegrensis and 70,894 contigs for R. robustus, with N50 of approximately 2100 for both species. We performed a search for SNPs based on the more complete R. robustus assembly and found 3,055 fixed interspecific differences. We identified two hundred and sixteen transcripts with high levels of divergence which contained fixed polymorphisms found between the two species. A Gene Ontology enrichment analysis revealed that these highly differentiated transcripts were enriched for the following terms: clathrin coat of endocytic vesicle, AP-2 adaptor complex, clathrin-coated endocytic vesicle, clathrincoated endocytic vesicle membrane, clathrin coat of coated pit, endocytic vesicle membrane, clathrin vesicle coat, and coated pit. The results reveal that R. montenegrensis and R. robustus show a substantial quantity of fixed interspecific polymorphisms, a finding which suggests a high degree of genetic divergence between the two species, which likely corroborates their species status. / CAPES: 23038.005285/2011-12
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Mathematical Models of Triatomine (Re)infestation

Oduro, Bismark 19 July 2016 (has links)
No description available.
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Indicadores ambientais para doença de Chagas no meio rural do município de Mossoró, Rio Grande do Norte / Environmental indicators for chagas disease in rural areas of Mossoró County, North Rio Grande

Sousa, Maressa Laíse Reginaldo de 23 February 2015 (has links)
Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-01-31T13:25:05Z No. of bitstreams: 1 MaressaLRS_DISSERT.pdf: 3021577 bytes, checksum: 40cf7f2dc4b6c4875e71426f5e937747 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-31T13:25:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MaressaLRS_DISSERT.pdf: 3021577 bytes, checksum: 40cf7f2dc4b6c4875e71426f5e937747 (MD5) Previous issue date: 2015-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Due to its prevalence and the severity of its manifestations Chagas disease is still today a major public health problem in affected countries. Knowing the importance of an active, participatory and permanent surveillance involving community participation for the success of prevention and harm reduction the present study aimed to evaluate the knowledge of the vector of Chagas disease living in rural communities with a history of triatomine capture the city of Natal, Rio Grande do Norte - Brazil, and to verify the presence and association of environmental indicators of risk for infestation of insects in these communities. For this, we used a semi-structured questionnaire administered to the resident responsible for the residence containing questions about their socioeconomic profile and also issues related to the vector of Chagas disease. For assessment of environmental risk indicators, we used a structured interview. It was observed lack of knowledge of the residents on issues related to the life cycle of the insects and on the time of day and the time of year when more appear and how are born. In addition, lack of guidance was detected in the population as to what action to take when a vector is found at his residence. It was an observed association between socioeconomic profile and knowledge of residents about the triatomine. In 10.75% of the homes visited were captured triatomine and association was observed between the catch and the presence of risk factors for the presence of these insects. Among the indicators are present the structure of households, peridomicile characteristics and the presence of wild animals (p<0.05). In this study, it is evident the need for greater disclosure of information related to the vector of the disease, in order to prevent its spread in the studied areas. The observed association between the capture of insects and the presence of environmental risk indicators in the communities emphasize the importance of early identification of these factors in order to improve prevention and control / Devido a sua prevalência e a gravidade de suas manifestações a doença de Chagas consiste, ainda hoje, um grave problema de saúde pública nos países afetados. Sabendo-se da importância de uma vigilância epidemiológica atuante, participativa e permanente envolvendo a participação da comunidade para o sucesso da prevenção e redução do agravo a presente pesquisa objetivou avaliar o conhecimento sobre o vetor da doença de Chagas de moradores de comunidades rurais com histórico de captura de triatomíneos no município de Mossoró, Rio Grande do Norte, além de verificar a presença e associação de indicadores ambientais de risco para infestação de triatomíneos, nessas comunidades. Para isso utilizou-se um questionário semiestruturado aplicado ao morador responsável pela residência contendo perguntas sobre seu perfil socioeconômico e também questões relacionadas ao vetor da doença de Chagas. Para avaliação dos indicadores ambientais de risco foi utilizado um roteiro estruturado.. Foi observada falta de conhecimento dos moradores sobre questões relacionadas ao ciclo biológico dos triatomíneos, assim como sobre o horário do dia e o período do ano em que mais aparecem e como nascem. Além disso, foi detectada falta de orientação para a população a respeito de que atitude tomar quando um vetor é encontrado em sua residência. Foi observada associação entre o perfil socioeconômico e os conhecimentos dos moradores sobre os triatomíneos. Em 10,75 % das casas visitadas foram capturados triatomíneos e foi observada associação entre a captura e a presença de indicadores de risco para a presença desses insetos. Dentre os indicadores presentes estão à estrutura das residências, características do peridomicílio e presença de animais silvestres (p < 0,05). Com esse estudo, torna-se evidente a necessidade de maior divulgação sobre informações relacionadas ao vetor da doença, a fim de se evitar a sua disseminação nas áreas estudadas. A associação observada entre a captura de triatomíneos e a presença de indicadores ambientais de risco nas comunidades ressalta-se a importância da identificação prévia desses fatores com o objetivo de melhorar as ações de prevenção e controle / 2017-01-30
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Taxa de infecção triatomínica e pesquisa de infecção humana por trypanosoma cruzi em uma área rural de Sergipe / Infection rate of triatomines and research of human infection with Trypanosoma cruzi in a rural area of Sergipe

Lins, Janicelma Santos 22 March 2013 (has links)
The Human Chagas disease still affects a great number of people around the world, and the Northeast of Brazil has attracted the attention of public health authorities, due to the presence of native insects and dwellings of poor quality, prone to colonization of triatomines responsible for transmission of this disease. Aiming to check the infection rate of triatomines and research the human infection with Trypanosoma cruzi in a rural area of Tobias Barreto in the southern state of Sergipe, was developed a study with two model approaches. Initially retrospective data were collected at the Laboratório Central de Sergipe to identify the species and the infection rate of triatomines with Trypanosoma cruzi in this municipality. The species found were: Triatoma pseudomaculata, Triatoma tibiamaculata, Triatoma melanocephala, Panstrongylus megistus, Panstrongylus lutzi and Panstrongylus geniculates. It was observed a wide variation in the rate of infection in different species - 31.2 to 100.0% (from 2006 to 2011). Proceeded with a cross-sectional study involving 235 individuals, aged 1-30 years old, in the villages of Alagoinhas and Poço da Clara. We collected blood samples from 235 individuals of this population. These samples were submitted to serological tests for Chagas Disease (ELISA and indirect immunofluorescence), but did not identify the disease in the population studied. It is possible that this seronegativity is result of factors such as young age (under 30 years), vector-parasite interaction (with lower rates of metacyclogenesis) or the influence of host genetics in susceptibility to infection. It wasn´t detected human infection in the population aged 1-30 years old, despite high infection rate of triatomines with Trypanosoma cruzi in the region, suggesting no recent transmission of the Chagas Disease. / A Doença de Chagas Humana ainda atinge um grande número de pessoas em todo o mundo, sendo que a região Nordeste do Brasil tem despertado atenção das autoridades em saúde pública, devido à presença de triatomíneos autóctones e moradias de baixa qualidade, propícias à colonização de triatomíneos transmissores desta doença. Com o objetivo de verificar a taxa de infecção triatomínica e a pesquisa de infecção humana por Trypanosoma cruzi em uma área rural de Tobias Barreto, sul do Estado de Sergipe, foi realizado um estudo com dois modelos de abordagem. Inicialmente foram coletados dados retrospectivos no Laboratório Central de Sergipe para identificar as espécies e a taxa de infecção dos triatomíneos por Trypanosoma cruzi neste município. As espécies encontradas foram: Triatoma pseudomaculata, Triatoma tibiamaculata, Triatoma melanocephala, Panstrongylus megistus, Panstrongylus lutzi e Panstrongylus geniculates. Foi encontrada grande variação na taxa de infecção nas diferentes espécies - 31,2 a 100,0% (no período de 2006 a 2011). Prosseguiu-se com a realização de estudo transversal, envolvendo 235 indivíduos, com idades entre 1 a 30 anos, nos povoados Alagoinhas e Poço da Clara. Foram coletadas amostras de sangue dos 235 indivíduos desta população. Estas amostras foram submetidas aos testes sorológicos para Doença de Chagas (ELISA e Imunofluorescência Indireta), contudo, não se identificou a infecção na população estudada. É possível que essa soronegatividade seja resultado de fatores como: faixa etária jovem (menor de 30 anos), interação parasito-vetor (menores taxas de metaciclogênese) ou a influência das características genéticas do hospedeiro na susceptibilidade à infecção. Não foi detectada a infecção humana na população entre 1 a 30 anos de idade, apesar da elevada taxa de infecção dos triatomíneos pelo Trypanosoma cruzi na região, sugerindo não haver transmissão recente da doença.
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AVALIAÇÃO DA PREVALÊNCIA DE TRIATOMÍNEOS EM ÁREAS DE IMPLANTAÇÃO DE USINAS SUCROALCOOLEIRAS NO MUNICÍPIO DE QUIRINÓPOLIS - GO (2005-2010)

Pasquali, Regina Maria 16 December 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:56:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 REGINA MARIA PASQUALI.pdf: 5096069 bytes, checksum: 7b17ccd6bce42fbded25f3c6b24256e7 (MD5) Previous issue date: 2011-12-16 / This research aimed to make a survey of triatomines in Quirinópolis - GO city (2005-2010) to identify the species and evaluate the urbanization of these vectors resulting from environmental changes that occurred after the installation of sugarcane power plants (São Francisco and Boa Vista) that replaced the traditional farming of grain, chiefly corn and soybeans, with sugarcane monoculture. The study are a had four rural regions (Bruacas, Pedra Lisa, Salgado e Sete Lagoas) and 31 districts in urban area. The qualitative / quantitative method was used and the research methodology comprised field work and analysis of the forms of the Program for the Control of Human Chagas Disease (PCHCD), exclusive of FUNASA. The data relating to agriculture and demographic density was obtained from the Company of Technical Assistance and Rural Extension (EMATER) and the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE), respectively, since the epidemiological studies on Chagas Disease (CD) were obtained from the Information System of Diseases and Notification (SINAN), the Municipal Health secretary and local medical laboratories. The analysis of the results were through descriptive statistics. Through the entomological survey 2.925 triatomines were identified and divided into seven species, from whict, two are endemic of Cerrado: Triatoma sordida and Rhodnius neglectus and five non endemic species: Panstrongylus diasi, Triatoma brasiliensis, Panstrongylus megistus, Panstrongylus geniculatus and Triatoma williami. The specimens were captured into and peridomestic environment of rural and urban areas. From these 15 specimens of T. sordida and two specimens of R. neglectus were positive to T. cruzi. It was also possible to identify 381 cases of CD and one case of Acute Chagas Desease (ACD) reported by SINAN in the period (2005-2010). / Esta pesquisa teve como objetivo fazer um levantamento de triatomíneos no município de Quirinópolis - GO (2005-2010) para identificar as espécies e avaliar a urbanização desses vetores decorrente das transformações ambientais ocorridas após a implantação das usinas sucroalcooleiras (São Francisco e Boa Vista) que substituíram a agricultura tradicional de grãos, principalmente o milho e a soja, pela monocultura canavieira. A área de estudo compreendeu quatro regiões rurais (Bruacas, Pedra Lisa, Salgado e Sete Lagoas) e 31 bairros na zona urbana. O método utilizado foi quali/quantitativo e a metodologia da pesquisa foi trabalho de campo e análise de formulários do Programa de Controle da Doença de Chagas Humana (PCDCH), de uso exclusivo da FUNASA. Os dados referentes à agricultura e densidade demográfica foram obtidos na Empresa de Assistência Técnica e Extensão Rural (EMATER) e Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), respectivamente, enquanto os epidemiológicos sobre a Doença de Chagas (DC) foram obtidos pelo Sistema de Informação de Agravos e Notificação (SINAN), Secretaria Municipal de Saúde e laboratórios de análises clínicas. As análises dos resultados foram feitas por meio de estatística descritiva. Mediante o levantamento entomológico foram identificados 2.925 triatomíneos distribuídos em sete espécies, dentre essas duas são endêmicas do Cerrado: o Triatoma sordida e Rhodnius neglectus e cinco espécies não endêmicas: Panstrongylus diasi, Triatoma brasiliensis, Panstrongylus megistus, Panstrongylus geniculatus e Triatoma williami. Os espécimes foram capturados nos ambientes intra e peridomiciliares da zona rural e urbana. Destes,15 espécimes de T. sordida e 2 exemplares R. neglectus apresentaram positivos ao T. cruzi. Foi também possível identificar 381 casos da DC e um caso da Doença de Chagas Aguda (DCA) notificado pelo SINAN no período (2005-2010).

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