Spelling suggestions: "subject:"luftförsvar"" "subject:"kustförsvar""
1 |
Regulation of Plant Defense Genes Against Bacterial PathogensSjöström, Jenny January 2021 (has links)
Sjukdom på grödor orsakad av bakterier kan bidra till ekonomiska förluster för bönder samt brist på mat, därför är det viktigt att utveckla nya hållbara sätt att motverka och behandla grödor mot bakterier. Idag är det mest vanliga tillvägagångssättet antibiotika men detta är inte hållbart p.g.a uppkomst av antibiotikaresistens. Antibiotika är inte heller tillgängligt för alla bönder och grödor då kostnaden blir för hög. Världsbefolkningen växer och om 80 år beräknas det bo mellan 9.9 och 12.7 biljoner (95% konfidens) människor på jorden. Växande befolkning samt ökande klimatförändringar, som torka och höjda temperaturer kräver nya bekämpningsmetoder mot bakterier för att tillgodose behoven i framtiden. Det saknas information om hur växter hanterar och reglerar bakteriella hot, därför är målet med denna studie att bidra med kunskap kring den transkriptionella regleringen av växters immunsystem mot bakterier. För att göra detta har promotorsekvenser hos gener som är förknippade med immunförsvaret i växter undersökts efter konserverade regulatoriska element. En känd receptor, FLS2 har en stor roll i växters försvar mot bakterier och känner igen en peptid från bakteriers flagell. Denna studie har undersökt FLS2 och den sammankopplade receptorn SERK1. Hos FLS2 kunde ingen konserverad modul hittas i uppströmsekvensen, däremot observerades ett 8 bp långt motiv, CAACTTG, i alla undersökta arter. I SERK1 hittades en lång konserverad modul bestående av flera motiv. Både FLS2-motifet och två motiv i SERK1-modulen binds av transkriptionsfaktorn MYC2. För att testa hypotesen att MYC2 bidrar till den transkriptionella regleringen av FLS2 och SERK1 har en experimentell plan utformats, där Nicotiana benthamiana transfekteras av Agrobacterium tumefaciens innehållandes promotorsekvenserna samt generna till transkriptionsfaktorn MYC2. En ökad förståelse kring de olika delarna och mekanismerna som medverkar inom växters immunförsvar kan bidra till den fortsatta forskningen mot hållbara lösningar till att säkra mat i framtiden. / Several factors contribute to the demand of new, sustainable solutions to bring food security to the world population. The United Nations predicts, with a confidence of 95%, that the world population will be between 9.9 and 12.7 billion by year 2100. At the same time plant agriculture as seen today is threatened by climate changes e.g., rising temperatures and more extreme weather conditions. In addition, plant bacterial pathogens reduce yields, and cause losses of over $1 billion dollars worldwide every year to the food production chain. The currently most used and effective treatment against bacterial infections on crops is antibiotics, but this is not a viable alternative for most growers due to increasing antibiotic resistance and the high development, production, and distribution cost. During the upcoming years development of new approaches against bacterial infections on crops is of high importance but currently there are information gaps in the field of plant defense regulation systems. This study was aimed to provide knowledge about the transcriptional regulation of genes that are included in plant immune system towards bacteria. To investigate this, conserved regulatory elements of the upstream sequences of two defense-related plant receptor kinases, FLS2 and SERK1, was searched for in different species. FLS2 is a surface receptor that recognizes a peptide derived from the bacterial flagellin protein, and is part of the pathogen-triggered immunity response of most of higher plants. In FLS2 no conserved module was found but a single motif, CAACTTG, is conserved in all chosen species. In SERK1 a strikingly long and conserved module was found. Both the FLS2 motif and two motifs in the SERK1 module are recognition motifs with MYC2, a transcription factor involved in different plant mechanisms and the regulation of phytohormones like abscisic acid and auxin. To address whether MYC2 is involved in the transcriptional regulation of FLS2, an experimental approach is described, involving transactivation by MYC2 of FLS2 reporter constructs, studies using agroinfiltration in Nicotiana benthamiana. An increased knowledge about the different components and mechanisms of plant defense regulation will help the research towards new bactericides, transgenic plants, and other ways to secure food for upcoming generations.
|
2 |
Importance of tannins for responses of aspen to anthropogenic nitrogen enrichmentBandau, Franziska January 2016 (has links)
Boreal forests are often strongly nitrogen (N) limited. However, human activities are leading to increased N inputs into these ecosystems, through atmospheric N deposition and forest fertilization. N input into boreal forests can promote net primary productivity, increase herbivore and pathogen damage, and shift plant species composition and community structure. Genetic diversity has been suggested as a key mechanism to promote a plant species’ stability within communities in response to environmental change. Within any plant population, specific traits (e.g. growth and defense traits) can vary substantially among individuals, and a greater variation in traits may increase chances for the persistence of at least some individuals of a population, when environmental conditions change. One aspect of plant chemistry that can greatly vary among different genotypes (GTs) are condensed tannin (CTs). These secondary metabolites have been suggested to affect plant performance in many ways, e.g. through influencing plant growth, the interactions of plants with herbivores and pathogens, and through affecting litter decomposition, and hence the return of nutrients to plants. To investigate how genotypic variation in foliar CT production may mediate the effects that anthropogenic N enrichment can have on plant performance and litter decomposition, I performed a series of experiments. For these experiments, aspen (Populus tremula) GTs with contrasting abilities to produce foliar CTs (i.e. low- vs. high-tannin producers) were grown under 3 N conditions, representing ambient N (+0 kg ha-1), upper level atmospheric N deposition (+15 kg ha-1), and forest fertilization rates (+150 kg ha-1). This general experimental set-up was once established in a field-like environment, from which natural enemies were excluded, and once in a field, in which enemies were present. In my first two studies, I investigated tissue chemistry and plant performance in both environments. I observed that foliar CT levels decreased in response to N in the enemy‑free environment (study I), but increased with added N when enemies were present (study II). These opposing responses to N may be explained by differences in soil N availability in the two environments, or by induction of CTs after enemy attack. Enemy damage generally increased in response to N, and was higher in low-tannin than in high-tannin plants across all N levels. Plant growth of high‑tannin plants was restricted under ambient and low N conditions, probably due to a trade-off between growth and defense. This growth constraint for high‑tannin plants was weakened, when high amounts of N were added (study I and II), and when enemy levels were sufficiently high, so that benefits gained through defense could outweigh the costs of defense production (study II). Despite those general responses of low- and high‑tannin producers to added N, I also observed a number of individual responses of GTs to N addition, which in some case were not connected to the intrinsic ability of the GTs to produce foliar CTs. In study III, gene expression levels in young leaves and phenolic pools of the plants that were grown in the enemy‑free environment were studied. This study revealed that gene control over the regulation of the phenylpropanoid pathway (PPP) was distributed across the entire pathway. Moreover, PPP gene expression was higher in high-tannin GTs than in low‑tannin GTs, particularly under ambient N. At the low N level, gene expressions declined for both low- and high-tannin producers, whereas at the high N level expression at the beginning and the end of the PPP was upregulated and difference between tannin groups disappeared. Furthermore, this study showed that phenolic pools were frequently uncorrelated, and that phenolic pools were only to some extent related to tannin production and gene expression. In study IV, I investigated the decomposability of litter from the field plants. I found that N enrichment generally decreased mass loss, but there was substantial genetic variation in decomposition rates, and GTs were differentially responsive to added N. Study IV further showed that CTs only had a weak effect on decomposition, and other traits, such as specific leaf area and the lignin:N ratio, could better explain genotypic difference in mass loss. Furthermore, N addition caused a shift in which traits most strongly influenced decomposition rates. Collectively, the result of these studies highlight the importance of genetic diversity to promote the stability of species in environments that experience anthropogenic change. / Boreala skogar är ofta mycket kväve (N) begränsade. Men mänskliga aktiviteter leder till ökad N tillförsel i dessa ekosystem, både genom depostition av N från atmosfären och skogsgödsling. N-tillförsel i boreala skogar kan främja netto primärproduktionen men även leda till ökade skador från naturliga fiender (herbivorer och patogener) samt skiftningar i växtartsammansättning. Genetisk mångfald har föreslagits som en viktig mekanism för att främja en växtarts stabilitet inom samhällen som upplever miljöförändringar. Inom varje växtpopulation kan specifika egenskaper (t.ex. tillväxt och försvar) varierar kraftigt mellan individer och en större variation i egenskaper kan öka chanserna för att åtminstone några individer från en population överlever ifall miljöförhållandena förändras. En aspekt av växtkemi som i hög grad kan variera mellan olika genotyper (GT) är bladens kondenserade tanniner (KT). Dessa sekundära metaboliter har föreslagits påverka växtens prestationsförmåga på många sätt, t.ex. genom att påverka tillväxt, interaktioner mellan växter och herbivorer eller patogener och genom att påverka förna nedbrytning, och följaktligen återbördandet av näringsämnen till kretsloppet. För att undersöka hur genotypiska variation i KT produktion kan påverka de effekter som antopogent N kan ha på växtens prestationsförmåga och förna nedbrytning, utförde jag en serie experiment. Jag studerade olika asp (Populus tremula) GT med olika förmåga att producera KT (låg- och hög-tannin producenter). Växterna odlades i tre olika N förhållanden, som representerade ambient N nivå (+0 kg ha-1), atmosfärisk N deposition = låg nivå (+15 kg ha-1), och skogsgödsling = hög nivå (150 kg ha‑1). Dessa GT etablerades i en fält-liknande miljö där naturliga fiender uteslutits och i ett fält där naturliga fiender var närvarande. I mina första två studierna undersökte jag vävnadskemi och växternas prestationsförmåga i de båda miljöerna. Jag observerade att KT nivåerna sjönk till följd av N‑tillsats i den fiende-fria miljön (studie I), men ökade med N-tillsats ifall fiender var närvarande (studie II). Dessa motsatta reaktioner på N-tillsats kan förklaras av skillnader i N-tillgång mellan de två odlingsplatserna eller genom ökad KT produktion som respons på angrepp. Skador orsakade av herbivorer och patogener ökade generellt till följd av N‑tillsats och var högre i låg-tannin än i hög‑tannin producerande GT oavsett N‑förhållande. Tillväxten hos växter från hög‑tannin GT begränsades i ambient- och låg N-tillsats förhållanden, troligen på grund av att avvägning mellan tillväxt och försvar förskjutits emot försvar. Den begränsade tillväxten i hög-tannin växter minskade om stora mängder N tillsattes (studie I och II) och om antalet fiender var tillräckligt högt så att nyttan av försvaret kunde uppväga kostnaderna för försvarsproduktionen (studie II). Trots dessa generella respons hos låg- och hög-tannin GT till följd av N‑tillsats observerade jag även ett antal individuella respons hos GT som i vissa fall var orelaterade till växters förmåga att producera KT. I studie III undersöktes genuttrycksnivåer och fenolinnehåll i blad från växter som odladats i en miljö där naturliga fiender exkluderats. Denna studie visade att fenylpropanoidsyntesvägen (FPV) regleras genom kontroll av många av de undersökta FPV-generna. Dessutom var FPV genuttryck högre i hög-tannin GT än i låg-tannin GT, särskilt vid ambient N. Vid låg N-tillsats minskade genuttrycket av FPV-gener i både låg- och hög-tannin producenter, medan hög N-tillgång ledde till att gener i början och slutet av FPV uppreglerades och till att skillnaderna mellan tannin grupperna försvann. Dessutom visade studien att de separata fenol-poolerna ofta var okorrelerade med varandra och att fenol-poolerna bara till viss del var korrelerade med KT produktion och FPV-genutryck. I studie IV undersökte jag nedbrytningshastigheten för förnan från fältodlade aspar. Jag upptäckte att N-tillsats generellt minskade viktförlusten men att det fanns en betydande genetisk variation mellan GT och att dessa även var olika mottagliga för tillsatt N. Studie IV visade vidare att KT endast hade en svag effekt på nedbrytning och att andra egenskaper såsom specifik bladyta och lignin:N ratio kunde bättre förklara den genotypiska skillnaden i viktförlust. Dessutom orsakade N‑tillsats en förskjutning av vilka egenskaper som mest påverkade förnans nedbrytningshastighet. Sammanfattningsvis visar mina studier på vikten av genetisk mångfald för att främja växtartens stabilitet i miljöer som upplever antropogena förändringar.
|
Page generated in 0.0444 seconds