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Previous issue date: 2013-03-05 / The breeding programs have made significant contributions to obtain more productive genotypes. Studies in Plant biotechnology has been one of the tools to aid plant breeding, as well as the use of molecular markers. Transposons and
Retrotransposons are ubiquitous in plant genomes and are increasingly studied. This study aimed to evaluate the genetic similarity among different rice cultivars using the techniques of IRAP and REMAP using the presence of retrotransposons. To verify this similarity was performed in 20 rice genotypes (Brazilian, Japanese and Filipinos) a DNA extraction for subsequent PCR amplification using the techniques IRAP and
REMAP. Analysis of amplification products was made by classifying the fragments as independently presence and absence of amplification at different heights polyacrylamide gel for data were used to construct a binary matrix. The data
generated were used for the calculation of genetic similarity between all pairs of individuals with the aid of the computer program NTSYS pc 2.1. To describe the patterns of similarity was adopted Dice coefficient and a dendrogram was
constructed by the method of unweighted UPGMA grouping in pairs. Furthermore, was estimated cophenetic correlation coefficient (r), according to the Mantel test and statistical stability of the grouping was estimated by analysis of bootstrapping with 1000 replicates through the computer program WinBoot 1.0. The results of this work show that it is possible to assess the genetic variability in rice genotypes using IRAP and REMAP techniques through the use of retrotransposons as molecular markers. / Os programas de melhoramento genético têm contribuído para a obtenção de genótipos mais produtivos. Estudos em Biotecnologia vegetal tem sido uma das ferramentas de auxílio para o melhoramento genético vegetal, assim como a
utilização dos marcadores moleculares. Transposons e Retrotransposons são onipresentes no genoma das plantas e são cada vez mais estudados. Esse trabalho teve como objetivo avaliar a similaridade genética entre diferentes cultivares de arroz utilizando as técnicas de IRAP e REMAP utilizando a presença de retrotransposons. Para verificar essa similaridade, foi realizada em 20 genótipos de arroz (brasileiros,
japoneses e filipinos) a extração de DNA, para posterior amplificação por PCR utilizando as técnicas IRAP e REMAP. A análise dos produtos da amplificação foi feita classificando os fragmentos independentemente conforme presença e ausência
de cada fragmento amplificado em diferentes alturas do gel de poliacrilamida para que os dados fossem utilizados na construção de uma matriz binária. Os dados gerados foram utilizados para o cálculo de similaridade genética entre todos os
pares de indivíduos, com o auxílio do programa computacional NTSYS pc 2.1. Para descrever os padrões de similaridade foi adotado o coeficiente de Dice e foi construído um dendrograma por meio do método não-ponderado de agrupamento aos pares UPGMA. Além disso, foi estimado o coeficiente de correlação cofenética (r), de acordo com o teste de Mantel e a estabilidade estatística do agrupamento foi estimada por meio da análise de bootstraping com 1000 replicações, através do
programa computacional WINBOOT. Os resultados obtidos neste trabalho mostram que é possível avaliar a variabilidade genética em genótipos de arroz utilizando as técnicas IRAP e REMAP através do uso dos retrotransposons como marcadores
moleculares.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:123456789/1208 |
| Date | 05 March 2013 |
| Creators | Santos, Gabriela Guerra dos |
| Contributors | CPF:43725678049, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780819H4, Oliveira, Antonio Costa de |
| Publisher | Universidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, UFPel, BR, Biotecnologia |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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