Les G-quadruplexes (G4) sont des structures d'acides nucléiques non-canoniques formées par des séquences riches en Guanines (G) principalement localisées dans les telomères et les régions promotrices des oncogènes. Elles sont constituées de l'empilement de plusieurs tétrades de G en présence de cations. En utilisant la spectroscopie par RMN, nous avons caractérisé l'interaction entre le ligand TAP et le G4 télomérique humain constituée de la séquence d(AG3(T2AG3)3). CD et RMN 1D 1H ont été utilisés pour suivre l'interaction entre les deux partenaires. RMN 2D a été utilisé pour attribuer sans ambiguïté toutes les résonances de 1H dans le complexe et d'explorer le site d'interaction. Un modèle illustrant l'interaction de TAP avec 22AG au niveau des sillons et boucles a été généré. Une autre partie de ce travail consiste en l'étude du G4 tétra-moléculaire formé par TG4T et son interaction avec des ligands G4 par la RMN dans les cellules. Des spectres 1H-15N HMQC ont été effectués à l'intérieur de Xenopus laevis et les lysats des cellules HeLa et comparés avec ceux observés dans les conditions in vitro ce qui a montré une bonne stabilité de G4 à l'intérieur de la cellule. En outre, l'interaction de d [TG4T]4 avec des ligands spécifiques de G4 présentant trois différents modes d'interaction a également été étudiée. Le ligand 360A a montré un comportement prometteur. Enfin, dans la dernière partie, différentes séquences de promoteur Kras ont été criblés par RMN pour sélectionner des candidats pour la détermination de structure haute résolution. Deux séquences différentes ont été sélectionnées et caractérisées par spectroscopie CD. La stabilisation des structures G4 formées par ces séquences en interaction avec différents ligands a également été étudiée. Une titration RMN 1D 1H entre 22RT et le ligand Braco19 a montré un comportement intéressant de k-ras G4 par la formation d'espèces intermédiaires lors de l'addition de Braco19. / G-quadruplexes (G4) are non-canonical nucleic acid structures formed by G-rich sequences mainly localized in telomeres and promoter regions of oncogenes. They are built from the stacking of several G-quartets in the presence of cations. Using NMR spectroscopy, we have characterized the interaction between the TAP ligand and the human telomeric G4 formed by the sequence d(AG3(T2AG3)3). CD and 1D 1H NMR spectroscopy were used to follow the interaction between the two partners. 2D NMR was used to assign unambiguously all 1H resonances in the complex and to explore the binding site. A model depicting the interaction of TAP with 22AG in grooves and loops was generated. Another part of this work consists in the study of tetramolecular G4 formed by TG4T and its interaction with G4 ligands by in-cell NMR. 1H-15N HMQC spectra were performed inside Xenopus laevis and HeLa cell lysates compared to those observed in vitro conditions showing a good stability of G4 inside the cell. Furthermore, the interaction of d[TG4T]4 with three G4 specific ligands presenting different mode of interaction was also investigated. The ligand 360A showed a promising behavior. Finally, in the last part, different sequences of Kras promoter were screened by NMR to select good candidates for high resolution structure determination. Two different sequences were selected and characterized by CD spectroscopy. The stabilization of G4 structures formed by these sequences in interaction with different ligands was also investigated. A 1D 1H NMR titration between Braco19 and 22RT showed an interesting behavior of k-ras G4 by the formation of intermediate species upon the addition of Braco19.

Le Syndrome de l'X Fragile (FXS) est la forme héréditaire majoritaire dedéficience intellectuelle et la cause monogénique de l'autisme. Le FXS est causé par unemutation du gène Fragile X Mental Retardation 1 (Fmr1), qui entraîne son inactivationet l'absence d’expression de la protéine codée: Fragile X Mental Retardation Protein(FMRP). FMRP est une protéine de liaison à l’ARN, impliquée dans la régulation de lasynthèse protéiques à la synapse. Un rôle central est attribué au sous-type 5 desrécepteurs métabotropiques au glutamate du groupe I (mGluR5) dans laphysiopathologie du FXS. En effet, une réponse exagérée suite à l'activation de mGluR5pourrait expliquer le dysfonctionnement synaptique dans ce syndrôme. Bien que denombreux travaux aient mis l'accent sur la dérégulation de la synthèse des protéinessynaptiques comme une conséquence de cette signalisation accrue du mGluR5, il y aaussi un équilibre altéré dans l'association de mGluR5 avec les différentes isoformes desprotéines Homer, partenaires de densité post-synaptique (PSD) du mGluR5. Bien qu'uneabondante littérature décrit l'association mGluR5/Homer, les conséquences de laperturbation de cette interaction dans le contexte du FXS sont peu connues. Parconséquent, l'objectif de ma thèse était d'étudier les conséquences de la perturbation del’interaction mGluR5/Homer au niveau des propriétés et des fonctions de mGluR5, tellesque l'expression durant le développement, l'expression de surface et le ciblageaxonal/dendritique, l’internalisation déclenchée par l'agoniste, les dynamiques desurface, et la modulation des courants NMDAR induite par mGluR5.Dans un premier temps, nous avons étudié l’expression de surface de mGluR5dans des neurones hippocampiques in vitro issus de souris sauvages et Fmr1 KO, par destechniques d’immunofluorescence et de biotinylation. Nous avons constaté que mGluR5est plus exprimé à la surface neuronale et est différemment distribué dans les dendrites etles axones des neurones Fmr1 KO. Puis, nous avons démontré que cette altérationd’expression et de ciblage est une conséquence directe de l’altération de l’interactionmGluR5/Homer. Nous avons aussi observé que mGluR5, indépendamment del’altération de l’interaction mGluR5/Homer, ne subit pas d’internalisation suite sonactivation soutenue par DHPG dans les neurones Fmr1 KO.Dans la seconde partie de mon étude, nous avons étudié les conséquences de laperturbation de l’interaction mGluR5/Homer dans les dynamiques de surface de mGluR5et par conséquent pour la fonction du NMDAR dans les neurones Fmr1 KO. Par destechniques d'imagerie et de pistage moléculaire, nous avons constaté que l’altération ducomplexe mGluR5/Homer augmente spécifiquement la diffusion latérale à la synapsedes neurones hippocampiques Fmr1 KO in vitro.La mobilité élevée du mGluR5 conduit à une probabilité accrue d'une interactionphysique transitoire avec NMDAR dans la PSD du Fmr1 KO.Cette interaction altère la modulation, induite par mGluR5, des courantsNMDAR. En effet, en utilisant des enregistrements en patch-clamp de neuronespyramidaux de CA1 sur tranches couplés à la stimulation des fibres collatérales deSchaffer, nous avons constaté que les courants excitateurs post-synaptiques induits parNMDAR (NMDAR-EPSCs) présentent des amplitudes plus faibles dans les neuronesFmr1 KO. De plus, l'expression post-synaptique de mGluR5, induite par la dépression àlong-terme de NMDAR-EPSCs est réduite dans les neurones Fmr1 KO. Finalement,nous avons démontré que ces défauts des courants NMDAR sont dépendants de laperturbation de l’interaction mGluR5/Homer et altèrent les dynamiques de mGluR5.Cette étude pourrait avoir des conséquences dans le traitement desdysfonctionnements synaptiques du mGluR5 dans le FXS, en ciblant l’interactionmGluR5/Homer, et offre de nouvelles suggestions pour corriger la signalisationdéfectueuse sous-jacente aux troubles du spectre autistique. / Fragile X Syndrome (FXS) is the most common inherited form of intellectualdisability and autism. FXS is caused by a mutation in the fragile X mental retardation 1(Fmr1) gene which leads to the lack of the encoded FMRP protein. FMRP is an RNAbinding protein involved in protein synthesis regulation at synapses. Many evidencessuggest a central role of the Group-I metabotropic glutamate receptor subtype 5(mGluR5) in the FXS pathophysiology. In particular, an exaggerated signaling responsefollowing mGluR5 activation may underlie synaptic dysfunction in this disorder.Although much work has focused on the dysregulation of synaptic protein synthesis as aconsequence of this enhanced mGluR5 signaling, it becomes clear that in FXS there isalso an altered balance of mGluR5 association with Homer scaffolding proteins, whichare postsynaptic density (PSD) partners of mGluR5. Although an extensive literaturedescribes the mGluR5/Homer association, very little is known about the consequences ofthe disruption of this interaction in the FXS context. Therefore, the goal of my thesis wasto study the consequences of mGluR5/Homer crosstalk disruption in the Fmr1 knockout(KO) mouse model of FXS in terms of properties and functions of mGluR5, such asexpression during development, surface expression and axonal/dendritic targeting,agonist-induced internalization, surface dynamics and mGluR5-mediated modulation ofNMDA receptor (NMDAR) currents.In a first set of experiments we investigated the mGluR5 surface expression incultured hippocampal neurons from WT and Fmr1 KO mice by usingimmunofluorescence techniques and biotinylation assay. We found that mGluR5 wasmore expressed on the neuronal surface and was differently distributed in dendrites andaxons of Fmr1 KO cultured neurons. We then hypothesized that these alterations were adirect consequence of the mGluR5/Homer crosstalk disruption. We demonstrated thatthe altered expression and targeting of mGluR5 were critically dependent onmGluR5/Homer crosstalk disruption. We also observed that mGluR5 did not undergointernalization upon sustained mGluR5 activation with DHPG in Fmr1 KO neurons.This latter phenotype, however, was not dependent on the disruption of themGluR5/Homer crosstalk. Altogether, these results demonstrate that mGluR5/Homercrosstalk disruption contributes to the pathophysiology of FXS altering expression andtargeting of mGluR5 on the surface of Fmr1 KO neurons.In the second part of my study we investigated the consequences of the disruptedmGluR5/Homer crosstalk for the mGluR5 surface dynamics, and consequently forNMDAR function in Fmr1 KO neurons. Using a combination of live-cell imaging andsingle-molecule tracking, we found that mGluR5/Homer crosstalk disruption specificallyincreased the mGluR5 lateral diffusion at the synapse of cultured Fmr1 KO hippocampalneurons. The higher mGluR5 mobility resulted in an increased probability of transientphysical interaction with NMDAR in the PSD of Fmr1 KO. This interaction altered themGluR5-mediated modulation of NMDAR currents as evidenced by the two followingchanges. First, using patch-clamp recordings from CA1 pyramidal neurons, we foundthat NMDAR-mediated excitatory postsynaptic currents (NMDAR-EPSCs) evoked bySchaffer collateral stimulation showed lower amplitudes in Fmr1 KO neurons. Second,the postsynaptic expression of mGluR5 mediated long term depression (LTD) ofNMDAR-EPSCs was reduced in Fmr1 KO neurons. Finally, we demonstrated that thesedefects in NMDA currents were strongly dependent on the mGluR5/Homer crosstalkdisruption and altered mGluR5 dynamics.Altogether, our results show that mGluR5/Homer disruption contributes to themGluR5 dysregulation in Fmr1 KO neurons. This study might have implication for thetreatment of mGluR5 synaptic dysfunctions in FXS by targeting mGluR5/Homerinteraction and provide new suggestions to correct the defective signaling underlyingcognitive impairment and autism.

Nous avons étudié les récepteurs GABAA dans un modèle de la maladie de Huntington. En combinant des approches biochimiques, moléculaires, électrophysiologiques et de l’imagerie haute résolution, nous avons montré une modification de la neurotransmission GABAergique chez des animaux à des stades pre- et post-symptomatiques. Nos études montrent une diminution de de la neurotransmission GABAergique dans le globus pallidus des souris Huntington qui pourrait conduire à une modification des noyaux de sortie des ganglions de la base et de l’activité motrice. L’ensemble de nos résultats permet de définir le rôle de différents types de récepteurs GABAA dans le cerveau dans des conditions physiologiques et pathologiques. / We explored GABAergic neurotransmission in a mouse model of Huntington's disease. Combining molecular, imaging and electrophysiologicaltechniques, we showed changes of GABAergic neurotransmission in presymptomatic and symptomatic R6/1 mice. Our data demonstrated a decreased GABAergic inhibition in the globus pallidus of R6/1 mice, which could result in an alteration of basal ganglia output nuclei and motor activity. Taken together, our results will help to define the contribution of receptor subtypes to inhibitory transmission throughout the brain in physiological and pathophysiological states.

Parmi les récepteurs Frizzled, Frizzled 4 est le seul à avoir un phénotype vasculaire fort. Parcriblage, nous avons identifié l’ubiquitine ligase PDZRN3 en tant que nouveau partenaire de la protéineadaptatrice Dvl3 qui agit en aval de Fzd4. En utilisant des modèles murins inductibles, nous montronsque la délétion de PDZRN3 induit une létalité embryonnaire suite à des défauts de vascularisation dusac amniotique ; et que PDZRN3 est requis pour une vascularisation normale de la rétine. De par sonactivité d’ubiquitine ligase, PDZRN3 induit la prise en charge du complexe Fzd4/ Dvl3 par les vésiculesd’endocytose ce qui permet la transduction du signal après fixation du ligand Wnt5a sur le récepteurFzd4. PDZRN3 régule également le maintien des jonctions des cellules endothéliales et l’intégrité de labarrière hémato-encéphalique. La délétion de PDZRN3 stabilise les microvaisseaux après ischémiecérébrale. PDZRN3 induit la disruption des jonctions serrées et la rupture de la barrièrehématoencéphalique en ubiquitinant la protéine d’échafaudage MUPP1. / Fzd4 is the only Frizzled receptor that is essential for angiogenesis. By using a yeast twohybrid screening, we have identified the ubiquitin ligase PDZRN3 as a potential partner of the adaptorprotein Dvl3 that acts downstream of Fzd4. By using inducible mouse models, we have shown that lossof PDZRN3 leads to early embryo lethality due to vascular defects in the yolk sac when deleted inutero, and is then required during post natal retinal vascularization. PDZRN3 would target the Fzd4/Dvl3 complex to endosome, leading to signal transduction upon binding of Wnt5a to Fzd4. PDZRN3also regulates integrity of the blood brain barrier by acting on tight junctions stability. Loss of PDZRN3stabilizes microvessels after cerebral ischemia. PDZRN3 would induce tight junction disruption andblood brain barrier leakage by ubiquitinylating the scaffolding protein MUPP1.

A partir d’un travail qualitatif réalisé au sein de deux groupes d’établissements d’enseignement supérieur : deux grandes écoles et deux universités spécialisées en sciences sociales et sciences et technologie, cette thèse contribue à la compréhension des défis de l’internationalisation auxquels les institutions françaises font face à, à travers des pratiques institutionnelles de recrutement et d’accueil d’étudiants étrangers.L’analyse comparée de deux groupes d’institutions vise à examiner les profils d’étudiants étrangers accueillis dans ces deux groupes et identifier la convergence et la non-convergence des stratégies mises en oeuvre dans les grandes écoles et les universités pour recruter et accueillir des étudiants étrangers.Le travail présent s’appuie sur les entretiens avec trois groupes d’acteurs institutionnels : les personnels administratifs du bureau de relations internationales, les enseignants-chercheurs et les étudiants étrangers au niveau d’études Master ou équivalent; et sur l’analyse des documents officiels institutionnels. / The increasing impact of marketization on higher education and global attention on referencing systems has discretely transformed the academic world. We observed some nations’ overemphasis on economic benefits in international education and some nations’ huge investment in their HEIs building for better ranking positions. We observed the quasi-gratuity of higher education fees in France; and in spite of their unsatisfactory academic performance on international rankings, French HEIs have always been the top favorite hosting destinations. We also observed the lack of knowledge of grandes écoles in the international academic community and a mysterious image created by the complexity of this dual system for French HEIs. To examine the contradictory facts and reveal the complex phenomena, two grandes écoles and two universities specializing in similar study fields were selected to be sites of exploration. The purpose of this local comparative study was mainly to explore how the two groups of institutions have developed their respective strategies in the international student recruitment process in the context of internationalization. This study used a qualitative approach for data collection incorporating interviews and documentation analysis. The analysis revealed both the pain and the gain that the grandes écoles and universities have been experiencing in internationalization and the comparative results related to inbound study mobility in these institutions.

La F1FO-ATP synthase mitochondriale produit la majorité de l’énergie cellulaire chezles eucaryotes aérobes sous forme d’ATP par le processus des oxydations phosphorylantes.Chez la plupart des espèces, cette enzyme possède une origine génétique double, nucléaire etmitochondriale. Dans la première partie de ce travail, je décris la construction de modèles delevure de mutations du gène mitochondrial ATP6 de l’ATP synthase découvertes chez despatients atteints de maladies neurologiques (9185T>C and 9191T>C) ou dans des tumeurs(8716A>G, 8914C>A, 8932C>T, 8953A>G and 9131T>C). Le gène ATP6 code une sousunitéessentielle (a/6) du domaine FO de l’ATP synthase. J’ai trouvé que la mutation 9185T>Cn’affecte pas l’assemblage de l’ATP synthase, mais conduit à une diminution de la vitesse desynthèse d’ATP d’environ 30%. La mutation 9191T>C empêche presque entièrementl’incorporation de la sous-unité a/6 dans l’ATP synthase. Les cinq mutations identifiées dansles tumeurs ont un effet modeste à nul, indiquant que ces mutations ne favorisent pas latumorigenèse en affectant le processus énergétique mitochondrial, comme évoquéprécédemment. J’ai ensuite étudié la régulation de la synthèse des sous-unités a/6 et 9 dans lesmitochondries de levures. La sous-unité 9 est présente sous la forme d’un anneau de 10 copiesqui interagit avec la sous-unité 6. Durant la catalyse, la rotation de cet anneau provoque deschangements conformationnels favorisant la synthèse d’ATP dans le secteur F1 de l’ATPsynthase. Je montre que la synthèse de ces protéines est couplée à leur assemblage, demanière à ce qu’elles soient produites dans une stoechiométrie adéquate et pour éviterl’accumulation d’intermédiaires d’ATP synthase potentiellement délétères / Mitochondrial F1FO-ATP synthase produces most of the cellular energy in aerobiceukaryotes under the form of ATP in the process of oxidative phosphorylation. This enzymehas in most species a double genetic origin, nuclear and mitochondrial. In the first part of thiswork, I describe the construction of yeast models of ATP synthase mutations in themitochondrial ATP6 gene, that have been found in patients presenting with neurologicaldisorders (9185T>C and 9191T>C) and in tumors (8716A>G, 8914C>A, 8932C>T,8953A>G and 9131T>C). The ATP6 gene encodes an essential subunit (called a/6) of theATP synthase proton-translocating domain (FO). The 9185T>C mutation had no effect on theassembly of ATP synthase, but reduces the rate of ATP synthesis by 30%. The 9191T>Cmutation almost completely prevented incorporation of the subunit a/6 into the ATP synthase.The five mutations found in tumors had modest, if at all, effect, indicating that thesemutations probably do not favor tumorigenesis, as was hypothesized. In the second part of mythesis, I studied the regulation of synthesis of subunits a/6 and 9 in yeast mitochondria. Thesubunit 9 is present in 10 copies forming a ring that interacts with subunit 6. Protonmovements through the FO induce the rotation of the subunit 9-ring, which results inconformational changes that promote ATP synthesis in the catalytic sector (F1) of ATPsynthase. I discovered mechanisms that enable the coupling of the synthesis of these proteinsto their assembly, as a means to ensure the production of subunits 6 and 9 in the rightstoichiometry and to avoid accumulation of potentially harmful assembly intermediates of theATP synthase.

Le but de ce travail est l'étude de la connectivité anatomique et fonctionnelle desréseaux neuronaux et le développement des nouveaux outils à cet effet. Car le dernieraspect est une préoccupation majeure de la neuroscience actuelle, nous avonsdeveloppé d'abord un nouveau traceur virale permettant la reconstruction neuronale.Nous avons ensuite appliqué cet et d'autres techniques pour sonder les défauts deconnectivité neuronale dans le syndrome de l'X fragile.Dans la première partie, nous avons discuté les avantages et inconvénients d'unetechnique émergente en utilisant un nouveau type de vecteur viral qui permet uneunique application pour l’étude du cerveau.Dans la deuxième partie, nous avons développé, au départ de ce vecteur viral, unenouvelle variante de faciliter le traçage et reconstruction des caractéristiquesmorphologiques de neurones. Nous avons montré la force de cette varianteantérograde du virus de la rage recombinant glycoprotéine supprimé pour lareconstruction de calcul de toutes les caractéristiques morphologiques clés deneurones: les dendrites, épines, les axones longs envergure dans tous les terminaux ducerveau et les boutons.Dans la troisième partie, nous avons examiné les modifications dans la connectivitédes structures cérébrales dans le syndrome du X fragile (FXS). FXS est le retardmental héréditaire la plus fréquente et la forme génétique la plus fréquente del'autisme, ce qui conduit à l'apprentissage et de la mémoire des déficits, lescomportements répétitifs, des convulsions et une hypersensibilité à des stimulisensoriels (visuels). Une des hypothèses éminents dans le domaine de l'autismesuppose une phénotype de hyper-connectivité locale mais de hypo-connectivité pourles connexions longue portée. Pour tester cette hypothèse dans un modèle de sourisFXS nous avons utilisé l'imagerie par résonance magnétique, pour balayer la totalitédu cerveau et de mesurer la connectivité anatomique et fonctionnel. Cela nous apermis d'identifier des altérations de connectivité dans plusieurs domains. Après nous8avons utilisé des traceurs viraux pour explorer un de ceux domains plus detaillé. Enutilisant le virus de la rage rétrograde à quantifier le nombre de neurones projetantvers ces zones, nous avons confirmé une connectivité d'entrée modifié pour le cortexvisuel primaire, ce qui pourrait contribuer au traitement visuel altéré de l'information.Nous avons découvert une connectivité réduite à longue portée globale anatomique etfonctionnelle entre plusieurs régions du cerveau, l'identification FXS comme unepathologie de la connectivité neuronale, ce qui pourrait expliquer les difficultés deplusieurs stratégies de sauvetage visant des cibles moléculaires sont actuellementconfrontés. / The goal of this work was the investigation of the anatomical and functionalconnectivity of neuronal networks and the development of novel tools for thispurpose. Since the latter aspect is a major focus of current neuroscience, we firstsought a novel viral tracer enabling sparse neuronal reconstruction and neuronclassification. We then applied this and other techniques to probe neuronalconnectivity defects in Fragile X Syndrome.In the first part we discussed the merits and drawbacks of a emergingtechnique using a new type of viral vector that allows in a unique manner mapping ofthe input of a given brain area.In the second part we developed, departing from this viral vector, a newvariant to facilitate the tracing and reconstructing of morphologic features of neurons.We showed the strength of this anterograde variant of the recombinant glycoproteindeletedrabies virus for computational reconstruction of all key morphologicalfeatures of neurons: dendrites, spines, long-ranging axons throughout the brain andbouton terminals.In the third part we examined alterations in the wiring of brain structures inthe Fragile X Syndrome (FXS). FXS is the most common inherited mental retardationand most frequent genetic form of autism, leading to learning and memory deficits,repetitive behavior, seizures and hypersensitivity to sensory (e.g. visual) stimuli. Oneof the eminent hypotheses in the autism field assumes a local hyper- connectivityphenotype but hypo-connectivity for long-ranging connections. To test this hypothesisin a FXS mouse model we used magnetic resonance imaging, to scan the entire brainand measure the anatomical and functional connectivity. This allowed us to identifyconnectivity alterations in several areas that we further explored using viral tracers.Using retrograde rabies virus to count the number of neurons projecting to such areaswe confirmed an altered input connectivity to the primary visual cortex, which couldcontribute to the altered visual information processing. We discovered an overallreduced anatomical and functional long-range connectivity between several brainareas, identifying FXS as pathology of neuronal connectivity, which might explain thedifficulties several rescue strategies aiming at molecular targets are currently facing.

Le traitement de référence de la maladie de Parkinson (MP) reste l’utilisation du précurseurdirect de la dopamine: la L-3,4-dihydroxyphenylalanine (L-Dopa). Le traitement chroniquedes patients parkinsoniens à la L-Dopa induit, en revanche, systématiquement desmouvements involontaires anormaux que l’on qualifie de dyskinésies induites par la L-Dopa(DIL). L’étude de l’expression des dyskinésies s’est essentiellement focalisée sur lesdysfonctions neuronales engendrées dans les régions motrices des ganglions de la base et apermis de révéler une surexpression significative de gènes de réponse précoce (GRP) tels que: ΔFosB, ARC, Zif268 et FRA2 dans le striatum de rats dyskinétiques traités chroniquement à la L–Dopa. En revanche, plusieurs autres régions dopaminoceptives, probablement affectées par la dopamine exogène nouvellement synthétisée, ont été négligées alors qu’elles pourraient jouer un rôle clé dans l’expression des dyskinésies. Par conséquent, nous avons quantifié l’expression de ΔFosB, ARC, FRA2 et Zif268 dans l’ensemble du cerveau de rats dyskinétiques que nous avons comparée à des rats non-dyskinétiques. Cette approche nous a permis d’identifier 9 structures, localisées en dehors des ganglions de la base, présentant une surexpression d’au moins 3 des GRPs cités ci-dessus. Parmi ces structures, le domaine dorsolatéral du « bed nucleus of the stria terminalis » (dlBST) et l’habenula latérale (LHb) montrent une corrélation significative entre l’expression de ΔFosB et la sévérité des dyskinésies. Nous avons donc fait l’hypothèse que ces 2 structures pouvaient être impliquées dans l’expression des dyskinésies. Par conséquent, pour évaluer le rôle potentiel du dlBST et de la LHb dans les dyskinésies, nous avons inhibé l’activité électrique des neurones exprimant FosB/ΔFosB en utilisant la méthode d’inactivation sélective du Daun02/ß-galactosidase que nous avons précédemment validée dans une structure bien connue pour être impliquée dans les dyskinésies: le striatum. Nous avons démontré que l’inhibition de ces neurones, à la fois dans le dlBST et la LHb, diminuait la sévérité des dyskinésies sans affecter l’effet bénéfique de la L-Dopa chez les rats dyskinétiques. Nous avons ensuite pu confirmer l’implication du dlBST grâce au model de référence des dyskinésies: le macaque dyskinétique lésé au MPTP. L’ensemble de ces résultats nous a ainsi permis de montrer, pour la première fois, l’implication fonctionnelle de 2 structures externes aux ganglions de la base dans l’expression des dyskinésies, offrant de nouvelles perspectives thérapeutiques. / The gold standard treatment for Parkinson’s disease (PD) remains the dopamine precursor L- 3,4-dihydroxyphenylalanine (L-Dopa). Long-term L-Dopa treatment systematically leads to abnormal involuntary movements (AIMs) called L-Dopa-induced dyskinesia (LID). These manifestations first led to investigate the neuronal dysfunctions in the motor regions of thebasal ganglia and unravelled an overexpression of ΔFosB, ARC, Zif268 and FRA2 immediate-early genes (IEG) in the dopamine-depleted striatum of dyskinetic rats. However, other several dopaminoceptive structures, likely affected by the exogenously produced dopamine, have been neglected although they might play a key role in mediating LID. Hence, we assessed the expression of ΔFosB, ARC, FRA2 and Zif268 IEGs in the whole brain of dyskinetic rats compared to non-dyskinetic ones. Such approach shed light notably upon 9 structures located outside of the basal ganglia displaying an IEG overexpression. Among them, the dorsolateral bed nucleus of the stria terminalis (dlBST) and the lateralhabenula (LHb) displayed a significant correlation between ΔFosB expression and LID severity. We therefore postulated that these structures might play a role in LID manifestation. Therefore, to assess dlBST and LHb causal roles upon LID severity, we inhibited the electrical activity of FosB/ΔFosB-expressing neurons using the selective Daun02/β- galactosidase inactivation method that we previously validated in a well known structure involve in LID: the striatum. Interestingly, the inactivation of dlBST and LHb ΔfosBexpressing neurons alleviated LID severity and increased the beneficial effect of L-Dopa in dyskinetic rats. Remarkably, BST involvement in LID was confirmed in the gold standard model of LID, the dyskinetic MPTP-lesioned macaque. Altogether, our results highlight for the first time the functional involvement of 2 structures.

La recherche sur le traitement des cancers a évolué durant les dernières années principalement dans une direction: la médecine personnalisée. Idéalement, le choix du traitement doit être basé sur les caractéristiques dupatient et de sa tumeur. Cet objectif nécessite des développements biostatistiques, pour pouvoir évaluer lesmodèles pronostiques, et in fine proposer le meilleur. Dans une première partie, nous considérons le problèmede l’évaluation d’un score pronostique dans le cadre de données multicentriques. Nous étendons deux mesuresde concordance aux données groupées analysées par un modèle à fragilité partagée. Les deux niveaux inter etintra-groupe sont étudiés, et l’impact du nombre et de la taille des groupes sur les performances des mesuresest analysé. Dans une deuxième partie, nous proposons d’améliorer la prédiction du risque de décès en tenantcompte des rechutes précédemment observées. Pour cela nous développons une prédiction issue d’un modèleconjoint pour un événement récurrent et un événement terminal. Les prédictions individuelles proposées sontdynamiques, dans le sens où le temps et la fenêtre de prédiction peuvent varier, afin de pouvoir mettre à jourla prédiction lors de la survenue de nouveaux événements. Les prédictions sont développées sur une série hospitalièrefrançaise, et une validation externe est faite sur des données de population générale issues de registres decancer anglais et néerlandais. Leurs performances sont comparées à celles d’une prédiction issue d’une approchelandmark. Dans une troisième partie, nous explorons l’utilisation de la prédiction proposée pour diminuer ladurée des essais cliniques. Les temps de décès non observés des derniers patients inclus sont imputés en utilisantl’information des patients ayant un suivi plus long. Nous comparons trois méthodes d’imputation : un tempsde survie moyen, un temps échantillonné dans une distribution paramétrique et un temps échantillonné dansune distribution non-paramétrique des temps de survie. Les méthodes sont comparées en termes d’estimationdes paramètres (coefficient et écart-type), de risque de première espèce et de puissance. / Research on cancer treatment has been evolving for last years in one main direction: personalised medicine. Thetreatment choice must be done according to the patients’ and tumours’ characteristics. This goal requires somebiostatistical developments, in order to assess prognostic models and eventually propose the best one. In a firstpart, we consider the problem of assessing a prognostic score when multicentre data are used. We extended twoconcordance measures to clustered data in the context of shared frailty model. Both the between-cluster andthe within-cluster levels are studied, and the impact of the cluster number and size on the performance of themeasures is investigated. In a second part, we propose to improve the prediction of the risk of death accountingfor the previous observed relapses. For that, we develop predictions from a joint model for a recurrent event anda terminal event. The proposed individual prediction is dynamic, both the time and the horizon of predictioncan evolve, so that the prediction can be updated at each new event time. The prediction is developed ona French hospital series, and externally validated on population-based data from English and Dutch cancerregistries. Its performances are compared to those of a landmarking approach. In a third part, we explore theuse of the proposed prediction to reduce the clinical trial duration. The non-observed death times of the lastincluded patients are imputed using the information of the patients with longer follow-up. We compared threemethods to impute the data: a survival mean time, a time sampled from the parametric distribution and atime sampled from a non-parametric distribution of the survival times. The comparison is made in terms ofparameters estimation (coefficient and standard-error), type-I error and power.

En Afrique sub-Saharienne, les femmes et les filles sont particulièrement vulnérables à l’infection parle VIH. L’infection par le VIH est une menace importante pour la santé reproductive de cettepopulation. Les études de recherche présentées dans le cadre de cette thèse ont été conduites enAfrique de l’Ouest et avaient pour objectifs principaux : i) Estimer la prévalence de la violenceperpétrée par le partenaire intime selon le statut sérologique ; ii) Estimer l’incidence de grossesseaprès la mise sous traitement antirétroviral ; iii) Déterminer l’effet de la grossesse après la mise sousARV sur le risque de décès, de progression de la maladie à VIH et d’être perdu de vue. Nos résultatsnous montrent que la prévalence de violence physique et sexuelle perpétrée par le partenaire intimeest plus élevée auprès des femmes VIH-positives qu’auprès de celles non-infectées (63,1 vs. 39,3%,p=0.01 and 69,7 vs. 35,3%, p=0.01, respectivement). De plus, l’incidence brute globale de premièregrossesse après la mise sous ARV en Afrique de l’Ouest est de 2,9 par 100 femmes-années(IC95% :2,7 – 3,0). Auprès des jeunes femmes âgées de 25-29 ans cette incidence peut être de 4,7per 100 femmes-années (IC95% :4,3 – 5,1). Finalement, la grossesse après la mise sous ARV réduitle risque de décès ou de progression de la maladie à VIH (aHR : 0,61, CI95% : 0,40-0,92) ainsi que lerisque de devenir perdue de vu (aHR : 0,74 ; CI95% : 0,60-0,92) des femmes ouest-africaines infectéespar le VIH. La prévalence de violence perpétrée par le partenaire intime est très élevée auprès desfemmes infectées par le VIH et cela pourrait entrainer des conséquences négatives de santé de cesfemmes. La grossesse est un évènement fréquent auprès des femmes VIH positives sous ARV qui ades répercussions importantes sur le statut de santé des femmes séropositives. L’intégration desprogrammes de prise en charge maternelle dans les services de prise en charge du VIH doit êtrepriorisé en Afrique sub-saharienne. / HIV infection in sub-Saharan Africa is a major public health threat particularly for girls and women ofreproductive age. The research presented in this thesis was conducted particularly in West Africa andthe specific objectives are i) to estimate the prevalence of intimate partner violence according to HIVserological status; ii) to estimate the incidence rate of pregnancy following ART initiation; iii) todetermine the effect of pregnancy after ART initiation on the risk of death, HIV-disease progressionand loss to follow-up. Firstly, in Togo, According to our findings, the prevalence rates of lifetimephysical and sexual violence (IPV) among HIV-infected women were significantly higher thanamong uninfected women (63.1 vs. 39.3%, p=0.01 and 69.7 vs. 35.3%, p=0.01, respectively).Secondly, Among HIV-infected West African women, the crude incidence of first pregnancy afterART initiation was 2.9 per 100 women-years [95% confidence interval (CI): 2.7 to 3.0] and it could beas high as 4.7 per 100 women-years (95% CI: 4.3 to 5.1) among women aged 25-29 years old. Finally,pregnancy after ART initiation appeared to reduce the risk of death or HIV-disease progression(Adjusted Hazard Ratio [aHR] =0.61; 95%CI: 0.40-0.92) and the risk of becoming LTFU at M48(aHR=0.74; 95%CI: 0.60-0.92) among West African HIV-infected women. Intimate partner violence ishighly prevalent among HIV-infected women and it may have negative repercussions on their healthstatus. Pregnancy is a common event after ART initiation and it might have repercussions on thehealth status of HIV-infected women. The design of safe motherhood programs addressed to HIVinfectedwomen and its integration within HIV care services must are a public health priority in sub-Saharan Africa.