With current scientific technologies, a significant amount of genetic information can be obtained from biological evidence found at a crime scene. Not only is it possible to identify the donor of the evidence through routine DNA profiling techniques, but new RNA based methods are being developed to determine the tissue type as well as the physical characteristics of the donor. Despite the information that can be obtained, the ability to determine the age or time the biological material was deposited at the crime scene has eluded the forensic community thus far. Timing is critically important as it could help police determine when the crime was committed. In this body of work an investigation was conducted into whether the degradation rates of nucleic acid macromolecules could serve as molecular clocks for age estimations. An attempt was made to gain a better understanding of the degradation products produced from an internal urban environment and to develop an optimal assay accordingly. A number of different RNA based techniques for ageing both hair and blood samples were also examined. Degradation assays have been traditionally designed around amplicon size however, it was established that testing loci stability is an essential requirement in the optimisation process. The results presented in this thesis suggest the reliability of the data can be increased when the two competing target species are selected from the same loci, which minimised the effect of loci susceptibility to degradation. It was determined that blood stains aged up to 60 days in an internal urban environment were best distinguished (in terms of age estimations) by using targets that differed in size by 170 to 240 base pairs, with one of the targets being between 200 and 300 base pairs in length. Despite using a robust TH01 qPCR assay it was established that an internal “urban” environment was not as stable as predicted and that seasonal temperature variation had a large effect on degradation rates. Interpretation of the results was therefore limited suggesting these optimised target sizes may only be relevant to the winter months. Using a carefully designed hermetically sealed dry swab we were able to remove moisture and inhibit the growth of DNA consuming micro-organisms. It was determined that bacteria alone can cause a 2-fold increase in the degradation rate of a sample aged at room temperature. In terms of integrity, storing samples at room temperature in a moisture free environment was equivalent to storing standard samples (exposed to normal humidity levels) in refrigerated conditions. It was also determined that the effect of bacterial degradation can be halved by lowering the storage temperature from room temperature to 4°C. RNA was examined in an attempt to reduce the large variations that had inhibited previous DNA methodologies. IL-6 and TNF-α were initially selected due to their rapid post-extraction change in expression levels. However, their levels were highly variable, unpredictable and therefore not suitable for this type of analysis even on samples that had been aged for only ten days. It is thought that their dynamic roles in a number of haemopoietic processes could be responsible for the poor results. A new RNA methodology, as described by Nolan et al (2008) was used to analyse samples that had been aged over 80 days. Four targets, AMICA1, MNDA, CASP1 and GAPDH were chosen based on their cell lineage as it was hypothesised that inter-donor variation could be reduced by using targets confined to the granulocytic cell lineage. Using the novel 3’/5’ assay, AMICA1, MNDA and CASP1 all performed poorly and no correlation could be determined between the 3’/5’ ratio and sample age. GAPDH showed some encouraging results with a correlation of 0.912 (age to 3’/5’ ratio) although initial stability over the first 20 days and the inter-donor variation were still limiting factors. It was also thought that the various mRNA degradation processes, in particular the 5’/3’ exonuclease activity, contributed to the poor results generally. A large inter-donor variation was a common aspect to all the blood based methodologies trialled. This meant that none of the methods had any practical value. As a result, an alternative RNA method was used to determine if it was possible to age another forensically important type of biological evidence; hair. Using a Reverse Transcription Quantitative PCR (RT-qPCR) assay, we monitored the Relative Expression Ratio (RER) of two different RNA species (18S rRNA and B-actin mRNA) in hair samples that were aged naturally over a period of three months. Overall the results presented here suggest that the age of hair samples containing follicular tags can be approximated using a second order polynomial (Age = 3.31RER2 - 2.85RER – 0.54), although with limitations.

Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos das características do pelame e da taxa de sudação (TS) sobre o desempenho reprodutivo de vacas da raça Braford e estimar as herdabilidades e correlações genéticas destas características. Dados da TS, espessura da capa (E), refletância da superfície da capa (R), comprimento dos pêlos (C), diâmetro dos pêlos (D) e número de pêlos por unidade de área (N) foram observados. Ainda, foram avaliadas as seguintes variáveis da reprodução: intervalo de partos (IEP); dias para o parto (DPP); idade ao primeiro parto (IPP); taxa de detecção de cio (Dcio); taxa de gestação para a primeira inseminação (G1IA) e taxa de gestação para a estação de monta (GEM). Os dados de desempenho reprodutivo referem-se aos partos dos anos de 2003 e 2004. Foram avaliadas as inseminações referentes às gestações da estação de monta do período de outubro de 2003 a janeiro de 2004. Durante este período, foram observadas temperatura máxima do ar (Ta), pressão parcial de vapor (Pv) e carga térmica radiante (CTR). As variáveis contínuas (todas as características do pelame, TS, IEP, DPP e IPP) foram analisadas pelo método dos quadrados mínimos. Os seguintes efeitos fixos foram considerados no modelo de todas as características do pelame: pais; grupos de contemporâneos; mês da observação; genótipo e idade. O pai da vaca foi importante para todas as características do pelame, exceto para N. Grupos de contemporâneos afetou todas as variáveis, o mês afetou a variação do C e da R. O genótipo foi importante para C, D e R e a idade afetou R. Na análise da TS foram considerados: grupos de contemporâneos; pais; genótipo; E; C; D; N; R; hora da observação; idade; Ta; Pv e CTR. Todos os fatores meteorológicos e grupos de contemporâneos foram significativos...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study deals with the effects of hair coat characteristics and sweating rate on reproduction of Braford cows and estimation of heritabilities and genetic correlations of these traits. Data on hair length (L), coat thickness (T), hair diameter (D), number of hairs per unit area (N), coat reflectance (R) and sweating rate (SR) were recorded. In addition, calving interval (CI); days to calving (DC); age at first calving (AFC); Estrous detection rate (EDR); conception rate at first insemination (CR1AI) and conception rate at breeding season (CBS) were evaluated. The continuous data were analyzed by least squares methods; considering the following fixed effects on the model for hair coat traits: sires and contemporary groups; month; genotype and age. The effect of sire was important for all hair coat traits, except for N; contemporary groups affected all hair coat traits; the effect of sampling month was important for L and R; genotype affected L, D and R; age was important only for R. The model of SR considered the following fixed effects: contemporary groups; sires; genotype; T, L, D, N, R; time of day, age, air temperature (Ta), partial vapour pressure (Pv) and radiant heat load (RHL). All the meteorological factors and contemporary groups were significant on SR. Age at calving, genotype, sire, R, T, L, N, D and SR were considered as fixed effects on analyses of CI. For the analyses of DC were considered: R, T, L, N, D, SR, genotype, age and sire. Age, genotype and SR were significant on CI and DC. Age at first calving of heifers born from January to March (AFC1) and from July to October (AFC2) were analyzed. Only sire was significant on AFC1; sire, E and D affected the variation of AFC2. The binary traits EDR; CR1AI and CBS were analyzed by logistic regression models...(Complete abstract, acess undermentioned eletronic address) / Orientador: Roberto Gomes da Silva / Coorientador: César Roberto Esper / Banca: Vera Fernanda Martins H. de Lima / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Banca: Evaldo Antonio Lencioni Titto / Doutor

Introdução: O zumbido pode ser definido como a percepção consciente de um som, sem a participação de uma fonte sonora externa. A presença isolada do zumbido, sem a perda auditiva associada sugere que o mesmo pode ser o primeiro sintoma de alterações cocleares que somente serão percebidas depois do aparecimento da perda. Considerando que o zumbido está frequentemente relacionado a disfunções cocleares e mais especificamente a alterações nas células ciliadas, e que nesse caso as funções desempenhadas por elas podem estar comprometidas em algum grau, é possível que alterações nos mecanismos cocleares em pacientes com limiares auditivos ditos normais e queixa de zumbido sejam encontradas. Objetivo: O objetivo do presente estudo foi verificar as diferenças entre as respostas cocleares em mensurações eletroacústicas e psicoacústicas em indivíduos sem perda auditiva, com e sem queixa de zumbido. Método: Participaram do estudo 57 indivíduos com limiares audiométricos dentro dos padrões de normalidade, divididos em dois grupos: grupo-controle composto por 41 sujeitos (81 orelhas) sem queixa de zumbido, e grupo-zumbido composto por 16 sujeitos (31 orelhas) com queixa de zumbido. Os sujeitos foram submetidos à pesquisa das Curvas de Crescimento das Emissões Otoacústicas Produto de Distorção, pesquisa das Curvas Psicofísicas de Sintonia e aplicação do teste TEN. Resultados: Para as CC-EOAPD somente foi observada diferença estatística nas curvas de 3000 e 6000 Hz, para L2=45 dBNPS e L2=55 dBNPS, respectivamente. Para as curvas psicofísicas de sintonia, foram observadas diferenças estatísticas localizadas nas extremidades das curvas, isto é, para a CPS de 2000 Hz com ruído de 6000 e 8000, para a CPS de 3000 Hz, para 8000 Hz, para a CPS de 4000 Hz para o ruído de 2000 e 8000 Hz e para as CPS de 6000 e 8000 Hz para os ruídos de 3000 e 2000 Hz. Para o teste TEN, não foi encontrada presença de zonas mortas da cóclea, entretanto foi observado padrão diferente entre os grupos, caracterizado pelo limiar na presença de ruído ipsilateral estatisticamente mais elevado no grupo-zumbido do que no grupo-controle. Conclusão: Foi observado que apesar de audiologicamente normais, os grupos apresentam desempenhos estatisticamente distintos nos testes aplicados, principalmente nas Curvas Psicofísicas de Sintonia e no teste TEN, evidenciando funcionamentos cocleares diferentes que, possivelmente, comprometem em algum grau os mecanismos cocleares, principalmente a seletividade de frequência / Introduction: Tinnitus can be defined as the conscious perception of a sound without the participation of an external sound source. The association between tinnitus and hearing loss has been well described. The isolated presence of tinnitus, without hearing loss, suggests that it may be the first symptom of cochlear dysfunctions that will be noticed only after the emergence of the hearing loss. Whereas tinnitus is often related to cochlear dysfunction, specifically in hair cells, their mechanisms could be impaired to some degree. Thus, patients with normal hearing and tinnitus, could show some dysfunctions in cochlear mechanisms. Objective: The aim of this study was to investigate the differences between the cochlear responses in electroacoustic and psychoacoustic measurements in subjects with normal hearing, with and without tinnitus. Method: The study included 57 subjects with audiometric thresholds within normal limits, divided into two groups: control group consisted of 41 subjects (81 ears) without tinnitus and tinnitus group consisted of 16 subjects (31 ears) with tinnitus. The subjects were tested for DPOAE-I/O functions, Psychophysical Tuning Curves (PTC) and TEN test. Results: For DPOAE-I/O only statistical difference was observed in the curves of 3000 and 6000 Hz, for L2 = 45 dBSPL and L2 = 55 dBSPL respectively. For the psychophysical tuning curves, statistical differences were observed at the ends of the curves, i.e. for the PTC 2000 Hz with noise 6000 and 8000 to 3000 PTC Hz to 8000 Hz to 4000 Hz PTC for noise 2000 and 8000 Hz and the PTC 6000 and 8000 Hz for the noise of 3000 Hz and 2000 TEN For the TEN test, there were no presence of \"dead regions in the cochlea,\" however different pattern was observed among groups, characterized by the presence of noise threshold ipsilateral statistically higher in the tinnitus group than the control group. Conclusion: We found that despite normal hearing, the groups have statistically different performances in the test applied, especially in psychophysical tuning curves and the TEN test, showing that different runs cochlear possibly commit to some degree the cochlear mechanisms, mainly the frequency selectivity

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study covers the hair of black women in the city of Santa Maria / RS as a diacritical mark of blackness. It is an ethnographic study in two environments: the Angelita‟s beauty saloon and the Treze de Maio Museum, the first prevail straightened hair and the second the curly hair. The work is mainly aimed to analyze the different meanings the different ways of african hair manipulation: smoothing, relaxing, African permanent hair extensions, Nago braids and natural curly. Through this research it is clear that such a choice is linked to the multiple identities and social environments experienced by these women: The Treze de Maio museum, the Carnival, the "ballads", and feasts. In the first case it was found that women undergo a "ritual of afrianization and especially in the latter case, largely, there is a lessening of blackness. Are also taken representations associated with that choice such as good looks for work and loving relationships. It was also found that the generation is an important variable to understand the choice determined by capillary handling, for older women undergo a major face to use your natural hair and, on the other hand, for younger, makes it easier for assumed it. The fact that younger women are more open to take its natural curly is because of experiencing a moment of appreciation of blackness. This process can be understood by the performance of black activist movements, re-africanization process and exaltation of the African "roots", by affirmative action policies, among other elements. / O presente estudo aborda o cabelo da mulher negra na cidade de Santa Maria/RS como um sinal diacrítico de negritude. Trata-se de um estudo etnográfico realizado em dois ambientes: o salão da Angelita e o Museu Treze de Maio. No primeiro prevalecem os cabelos alisados e nosegundo os crespos. O trabalho tem como objetivo central analisar os diferentes significados atribuídos às distintas maneiras de manipulação do cabelo afro: alisamento, relaxamento, permanente afro, mega hair, tranças nagô e os crespos naturais. Por meio desta pesquisa percebeu-se que tal escolha está ligada às múltiplas identidades e ambientes de sociabilidade vivenciados por essas mulheres: o Museu Treze de Maio, o Carnaval, as baladas , e as festas solenes. No primeiro caso foi verificado que as mulheres passam por um ritual de africanização e, sobretudo, no último caso em grande parte há uma atenuação da negritude. São também levadas representações associadas a essa escolha, como por exemplo, a boa aparência para o trabalho e os relacionamentos amorosos. Também se verificou que a geração é uma variável importante para entender a escolha por determinada manipulação capilar, pois as mulheres mais velhas passam por um enfrentamento maior para utilizar o seu cabelo natural e, em contrapartida, para as mais novas há uma maior facilidade em assumi-lo. O fato das mulheres mais novas estarem mais abertas a assumirem seus crespos naturais deve-se ao fato de vivenciarem um momento de valorização da negritude. Tal processo pode ser entendido pela atuação dos movimentos ativistas negros, pelo processo de reafricanização e exaltação das raízes africanas, pelas políticas de ações afirmativas, dentre outros elementos.

Submitted by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-02-24T18:40:16Z No. of bitstreams: 1 OLIVEIRA_Elisangela_2015.pdf: 17350237 bytes, checksum: a1efb77501c4df3e09734ffce33e70c1 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-02-24T18:40:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 OLIVEIRA_Elisangela_2015.pdf: 17350237 bytes, checksum: a1efb77501c4df3e09734ffce33e70c1 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-02-24T18:40:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 OLIVEIRA_Elisangela_2015.pdf: 17350237 bytes, checksum: a1efb77501c4df3e09734ffce33e70c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-24T18:40:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 OLIVEIRA_Elisangela_2015.pdf: 17350237 bytes, checksum: a1efb77501c4df3e09734ffce33e70c1 (MD5) Previous issue date: 2015-03-19 / Não recebi financiamento / One of the most remarkable and diverse physical characteristics among human beings - and, thus, fundamental for personal identity - is hair. The search for personal hair care products has been increasing in the last years and Brazil is the third largest consumer market for these products. There is a constant quest for cosmetic products able to align, relax and treat hair fibers. There are some products for this purpose, such as smart brushes, Japanese brushes and definitive brushes, among others. In this context, the aim of this project was to synthesize and characterize polyurethane obtained from a renewable source as well as evaluate its effectiveness as a hair treatment agent. Therefore, scanning electron microscopy (SEM), atomic force microscopy (AFM), Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR), nearinfrared reflectance spectroscopy (NIRS) and mechanical tests for tensile properties were used. The FTIR results confirmed the synthesis of the polyurethane. The polymer was associated with citric acid, glycolic acid, lactic acid, and sodium hydroxide with glycose, in order to increase adhesion of the polymer onto the hair fiber. After application, better hair fiber alignment and increased hair roughness were noticed. Through the spectroscopic analysis it was established that a chemical interaction between the polymer, its associations and hair was present. The micrographs also suggested that there was a deposition of the polymer on the hair fibers. The results indicated that the polyurethane and their associations with citric acid and sodium hydroxide with glycose, are promising for applications in hair care products. / Os cabelos constituem uma das características físicas mais marcante e variável dos seres humanos, tornando-se fundamental para a identidade pessoal. Assim, é cada vez maior a busca por produtos para os cuidados dos mesmos. O Brasil é o terceiro maior mercado consumidor de produtos para os cabelos, e existe uma busca constante pelas empresas do setor de cosméticos por produtos capazes de alinhar, relaxar e tratar os fios. Neste sentido podemos encontrar produtos para essa finalidade, com as mais variadas denominações, como as escovas: inteligente, japonesa, definitiva entre outras. Dentro desse contexto, o objetivo do presente projeto foi sintetizar e caracterizar um poliuretano a partir de um poliol obtido de fonte renovável, e avaliar sua eficácia após aplicação do mesmo visando tratamento capilar. Para tanto, foram utilizadas técnicas de microscopia eletrônica de varredura (MEV), microscopia de força atômica (AFM), espectroscopias de infravermelho por transformada de Fourier (FTIR) e espetroscopia de refletância no infravermelho próximo (NIRS) e ensaios mecânicos pelo módulo de tração. Os resultados de FTIR confirmaram a síntese do poliuretano, o qual foi associado aos Ácidos Cítrico, Glicólico, Lático e Hidróxido de Sódio com Glicose com o intuito de aumentar a aderência do polímero na fibra capilar. Após a aplicação verificou-se um melhor alinhamento dos fios e aumento na rugosidade. Através das análises de espectroscopia foi possível constatar que houve uma interação química entre o polímero, suas associações e os cabelos. As eletromicrografias também sugerem que houve uma deposição do polímero sobre as fibras do cabelo. Os resultados obtidos indicaram que o poliuretano e suas associações com ácido cítrico e hidróxido de sódio e com glicose, são promissores para aplicações em produtos capilares.

Made available in DSpace on 2014-10-09T12:50:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:58:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 00041.pdf: 937519 bytes, checksum: 0151bbc43f38095f9eb0ca2ae90edfda (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IEA/D / Escola Politecnica, Universidade de Sao Paulo - POLI/USP

Made available in DSpace on 2014-10-09T12:45:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 07539.pdf: 5143917 bytes, checksum: 6a88cd56ee216361faf630a8563ee875 (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP

Submitted by Luara Afonso de Freitas null (luaraa.freitas@gmail.com) on 2018-02-28T12:52:28Z No. of bitstreams: 1 FREITAS_2018.pdf: 2467849 bytes, checksum: d131127bf0cf93ad3b5bfccd0626241b (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2018-02-28T13:18:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 freitas_la_me_jabo.pdf: 2467849 bytes, checksum: d131127bf0cf93ad3b5bfccd0626241b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-28T13:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 freitas_la_me_jabo.pdf: 2467849 bytes, checksum: d131127bf0cf93ad3b5bfccd0626241b (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O uso de raças ou animais resistentes aos endoparasitas dentro do sistema de produção de ovinos de carne é uma das alternativas mais eficientes para se obter maior produção. O controle dos acasalamentos entre animais aparentados é de grande importância para reduzir perdas na produção pelo aumento da homozigose de alelos deletérios. O peso corporal é uma das características de maior importância econômica em ovinos e pode ser registrado ao longo da vida de um mesmo animal. Os modelos de regressão aleatória na avaliação genética de medidas longitudinais são geralmente recomendados para estimar parâmetros genéticos de dados longitudinais. As análises multivariadas são um conjunto de métodos estatísticos que torna possível a análise simultânea de medidas múltiplas para cada indivíduo ou fenômeno observado. Este trabalho teve como objetivos: (1) analisar a estrutura populacional e verificar o efeito da endogamia sobre características fenotípicas de crescimento e resistência a verminose, (2) comparar estruturas (homogeneidade e heterogeneidade de variâncias) para modelar a variância residual em modelos de regressão aleatória, (3) avaliar a influência desta modelagem na estimação de parâmetros genéticos a fim de determinar o modelo mais apropriado para estudar o crescimento e a resistência à verminose e (4) avaliar a associação genética e explorar o perfil genético da produção de carne e resistência à verminose em ovinos da raça Santa Inês. O banco de dados fenotípico conteve 2.159 registros de peso corporal oriundos de 753 animais, 1.468 registros de volume globular provenientes de 476 animais e 981 registros de contagem de ovos por grama de fezes oriundos de 375 animais entre 30 a 900 dias de idade medidos mensalmente e registros de pedigree de 2.410 animais da raça Santa Inês. Os animais foram divididos em 10 classes de idade (CI90 = 30 a 90 dias de idade CI180= 91 a 180 dias de idade, CI270= 181 a 270 dias de idade, CI360= 271 a 360 dias de idade, CI450= 361 a 450 dias de idade, CI540= 451 a 540 dias de idade, CI630= 541 a 630 dias de idade, CI720= 631 a 720 dias de idade, CI810= 721 a 810 dias de idade, CI900= 811 a 900 dias de idade). A estrutura do pedigree foi analisada utilizando o programa Endog 4.8. As análises de estimação dos componentes de variância foram realizadas por meio de modelo animal unicaracterística de regressão aleatória pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando polinômios de Legendre. O critério da informação bayesiana foi utilizado para selecionar o melhor modelo. A análise de componentes principais foi realizado no software STATISTIC e a analise de agrupamento hierárquico e não hierárquico no software R. Foi observado aumento no coeficiente de endogamia até a 6ª geração máxima, aumento do parentesco médio e da porcentagem de animais endogâmicos até a 7ª geração máxima. O polinômio de Legendre de ordem 3 (intercepto, linear e quadrático) proporcionou o melhor ajuste dos dados para peso corporal, volume globular e contagem de ovos por grama de fezes. A seleção dos animais poderia ser feita com base no peso corporal a partir de 271 dias de idade, pois a estimativa de herdabilidade foi de 0,23 (0,03) e foram altas as correlações genéticas do peso corporal nesta idade com a maioria dos pesos corporais nas demais idades, exceto com peso corporal medida entre 30 a 90 dias de idade. A seleção destes animais para resistência a verminose se realizada poderá ser pouco eficiente devido às baixas estimativas de herdabilidade para volume globular (0,09±0,01 a 0,18±0,02) e contagem de ovos por grama de fezes (0,01±0,02 a 0,17±0,03), portanto, o ganho genético será a longo prazo. A seleção para peso corporal poderia trazer ganhos genético favoráveis para a característica volume globular devido à proximidade das características no eixo do componente principal um. Nas análises de agrupamento apenas um dos três grupos genéticos identificados apresentou perfil genético indicado para a seleção para peso corporal e volume globular. / The use of resistant animals to gastrointestinal nematode parasites within the meat production system is one of the most efficient alternatives to increase meat yield in sheep. The control of mating between related animals is of great importance to reduce losses in meat production by increasing the homozygosity of deleterious alleles. Application of Random regression models in the genetic evaluation of longitudinal measurements is generally recommended to adjust growth curves and to estimate genetic parameters of longitudinal data. The multivariate analyzes are a set of statistical methods that make possible the simultaneous analysis of multiple measures for each individual or observed phenomena. The aims of this study were: (1) to analyze the population structure and verify the effect of inbreeding on phenotypic traits of growth and resistance to gastrointestinal nematode parasites, (2) to compare structures (homogeneity and heterogeneity of variances) to model residual variance in random regression models, (3) to study the influence of this modeling in the estimation of genetic parameters in order to determine the most appropriate model to study the growth and resistance to gastrointestinal nematode parasites curves, and (4) evaluate the genetic association and explore the genetic profile of meat production and resistance to gastrointestinal nematode parasites in Santa Inês sheep. The data contained 2,159 body weight records from 753 animals, 1,468 mean corpuscular volume records from 476 animals and 981 records of fecal egg counts from 375 animals and pedigree information from 2,410 in Santa Ines sheep. The animals were divided into 10 age classes (CI90 = 30 to 90 days of age CI180 = 91 to 180 days of age, CI270 = 181 to 270 days of age, CI360 = 271 to 360 days of age, CI450 = 361 to 450, CI540 = 451 to 540 days of age, CI630 = 541 to 630 days of age, CI720 = 631 to 720 days of age, CI810 = 721 to 810 days of age, CI900 = 811 to 900 days of age). The structure of the pedigree was analyzed using the program Endog 4.8. Analyzes of the variance component estimates were performed using a one-trait model of random regression using the restricted maximum likelihood method. The Bayesian information criterion was used to select the best model. The principal component analysis was performed in STATISTIC software and hierarchical and non-hierarchical analysis grouping was performed in the software R. There was an increase in the inbreeding coefficient up to the 6th maximum generation and also an increase in the average relatedness and in the percentage of inbred animals up to the 7th maximum generation. Genetic correlation estimates for all traits in the age classes presented values close to the unit at close weighings, with a reduction in the magnitude of the correlations as the time interval between weighings increased. The Legendre polynomial of order 3 (intercept, linear and quadratic) provided the best fit of the data for body weight, mean corpuscular volume, and fecal egg counts. The selection of the animals could be made based on body weight from 271 days of age, as the heritability estimate was moderate, 0.23 (0.03), and showed high genetic correlations with most body weights, except with body weight from 30 to 90 days of age. Selection of these animals for resistance to gastrointestinal nematode parasites if carried out may result in low efficiency due to the low estimates of heritability for the mean corpuscular volume (0.09 ± 0.01 to 0.18 ± 0.02) and fecal egg counts (0.01 ± 0.02 to 0.17 ± 0.03), therefore, the genetic gain will be low and in the long term. The selection of body weight could bring favorable genetic gains to the mean corpuscular volume due to the proximity of the traits in the axis of the main component one. In cluster analysis, only one of the three genetic groups identified has a genetic profile indicated for selection for the studied traits. / 2016/10583-1

Submitted by Raquel Vasconcelos Guimarães de Castro null (rvgcastro@hotmail.com) on 2016-06-10T17:22:52Z No. of bitstreams: 1 Definitivo v11 VERSÃO IMPRESSA.pdf: 3954271 bytes, checksum: fbf5e7559a791827787906302174080b (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-06-15T17:22:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 castro_rvg_me_jabo.pdf: 3954271 bytes, checksum: fbf5e7559a791827787906302174080b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-15T17:22:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 castro_rvg_me_jabo.pdf: 3954271 bytes, checksum: fbf5e7559a791827787906302174080b (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A pele é um órgão extenso e de fácil acesso, e possui vários tipos celulares diferentes que estão em constante renovação. Dentre estas células, alguns tipos de células-tronco com potencial proliferativo, de autorrenovação e de diferenciação, são responsáveis pela manutenção da homeostase deste órgão e pela cura de feridas. Estudos anteriores sugerem a existência de um nicho de células-tronco presente no “bulge” dos folículos pilosos, que contém populações positivas para CD200 e CD34. Este trabalho foi realizado com o intuito de: 1- Obter tecidos derivados da pele de cães adultos e fetos, isolar e cultivar as células in vitro derivadas destes, empregando um método de isolamento celular através de digestão enzimática simples 2- Comprovar a presença de células do “bulge”, positivas para CD200 e CD34 após cultivo celular in vitro, comparando com a análise do tecido; Uma coloração por hematoxilina e eosina foi realizada da pele de cães adultos e fetos, e biopsias e células cultivadas in vitro foram caracterizadas pela presença das proteínas CD200 e CD34 através de imunofluorescência, imunocitoquímica e citometria de fluxo. Os resultados da imunofluorescência foram negativos para ambos CD200 e CD34 nas peles de feto e adulto. Na imunocitoquímica, as células foram positivas para CD34 e CD200, tanto em fetos quanto adultos. Adicionalmente, o marcador de pluripotência OCT4 foi testado, sendo expresso em células de feto. Por citometria de fluxo, a porcentagem média de células marcadas duplamente por CD200 e CD34 nos adultos foi de 3,1% e nos fetos de 0,33% (n=3). A marcação somente por CD200 foi encontrada somente nos adultos, sendo de 2,8% (n=3). Os resultados sugerem ser possível a obtenção de células-tronco do “bulge” do folículo piloso através do método de digestão enzimática simples, utilizado neste trabalho. Este estudo é o primeiro passo para novas pesquisas que envolvam esse nicho, na pele de cães. / Skin is an extensive and easily accessible organ, possessing various cell types which are in constant renovation. Some stem cell types found in the skin have the potential of self-renewal, proliferation and differentiation, processes which are responsible for the organ’s maintenance of homeostasis and the healing of wounds. Previous studies suggested the presence of a stem cell niche at the bulge region of the hair follicle, which contains cell populations positive for CD200 and CD34. Thus, this work sought to identify these cell populations in canine cultures using the following methods: 1. 1- Collecting samples of adult and fetus canine skin, isolating and culturing these cells in vitro using a method of simple enzymatic digestion; 2- Testing the cell cultures for CD200 and CD34 in vitro, comparing them with analyzed tissue material. Hematoxylin and eosin staining were conducted for the biopsies and analysis of fetal and adult canine skin, with the extracted cell cultures being characterized for the presence of the proteins CD200 and CD34 through immunofluorescence, immunocytochemistry and flow cytometry. In both adult and fetal tissue samples, CD200 and CD34 immunofluorescence results were negative. In immunocytochemistry, both fetal and adult cultures cells tested positive for CD34 and CD200. The pluripotency marker OCT4 was also tested, and was positive for fetal culture cells. Flow cytometer results showed that, for samples with a double staining of CD200 and CD34 the average percentage of marked cells was 3.1% in adults and 0.33% in fetal cells (n=3). For the CD200 marker alone, positive cells were found only in adult cultures, representing 2.8% of the total population (n=3). In conclusion, the results suggest that obtaining bulge stem cells from both fetuses and adults, with use of CD200 and CD34 markers, is validated through the simple enzymatic digestion and cell culture methods utilized in this study. The present work is the first step towards developing new research involving this niche in dogs.

Submitted by Rodolfo Lizcano Toledo (rodolfolizcano@gmail.com) on 2017-04-11T19:04:14Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Rodolfo_Lizcano_Toledo.pdf: 3969406 bytes, checksum: 2ef5dd577215fbca06ae57d5b3bd9983 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-11T19:16:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lizcanotoledo_r_me_jabo.pdf: 3969406 bytes, checksum: 2ef5dd577215fbca06ae57d5b3bd9983 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-11T19:16:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lizcanotoledo_r_me_jabo.pdf: 3969406 bytes, checksum: 2ef5dd577215fbca06ae57d5b3bd9983 (MD5) Previous issue date: 2017-03-08 / O experimento foi conduzido em casa de vegetação na FCAV/UNESP. Objetivou-se avaliar a caracterização os sintomas visuais de deficiência de micronutrientes em folhas; e avaliar os efeitos desses micronutrientes no estado nutricional do maracujazeiro amarelo. No experimento foi utilizado solução nutritiva, como substrato vermiculita em extrato úmido. Foram utilizadas mudas de maracujá (Passiflora edulis Sims.) do híbrido comercial BRS Gigante Amarelo do Cerrado. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado; com oito tratamentos (solução completa (Controle), omissão de B, omissão de Cu, omissão de Fe, omissão de Mn, omissão de Mo, omissão de Zn, solução completa + Ni); e 5 repetições. Utilizou-se como unidade experimental; vasos com 8 dm-3 de substrato com 1 planta/vaso e 2 vasos por unidade experimental. Após 60 dias do plantio, foi avaliada a matéria seca de cada tratamento, foi feito diagnóstico visual das deficiências nutricionais em folhas. Semanalmente foi avaliado o teor de clorofila para estabelecer regressão linear ou quadrática, entre os teores de clorofila e as deficiências nutricionais de cada tratamento; uma avaliação de variáveis fisiológicas como a transpiração, fotossíntese, condutância estomática e concentração interna e externa de CO2. Avaliaram-se características morfológicas como desenvolvimentos de pêlos radiculares e alterações no mesofilo foliar. A ordem de manifestação das deficiências no experimento foram as seguintes: Fe>Mn>Zn>Cu>Mo>B; a toxicidade de Níquel apareceu aos 40 dias após ao transplante, com sintomas de clorose nas folhas novas, logo um amarelecimento geral e algumas partes brancas. A omissão de B resultou em deformações no limbo foliar e perda da dominância apical, mostrando deformação dos pontos de crescimento; a omissão de Mn ocasionou redução do crescimento e clorose generalizada das folhas jovens com reticulo grosso, a omissão de Fe resultou em uma clorose internerval, com aparência de reticulado fino, sendo Fe e Mn os primeiros nutrientes cuja omissão resulta em sintomas de deficiência nas plantas de maracujá, seguidos pelo zinco e cobre, e por último o boro. O zinco e cobre apresentaram deformação e alongamento das folhas reduzindo consideradamente a altura e desenvolvimento radicular, o molibdênio apresentou uma clorose nas folhas velhas que posteriormente se espalho de forma geral. Os teores dos micros na parte aérea e raiz variaram de acordo ao tratamento, refletindo em problemas morfológicos e a nível ultra-estrutural na célula e fisiológicos, alterando variáveis como a transpiração, fotossíntese, condutância estomática e a relação entre a concentração de CO2 nos espaços intercelulares e a concentração de CO2 no ambiente. A omissão de ferro foi o elemento que mais refletiu problemas pela formação de pêlos radicais, observando-se maior formação destes em condições de deficiência do elemento possivelmente por sua relação com os hormônios etileno e auxinas. Todos os tratamentos apresentaram um desarranjo e desorganização a nível ultra-estrutural, nas organelas como os cloroplastos, parede celular, grânulos de amidos, grânulos de lipídeos, núcleo, afetando o funcionamento da célula e causando problemas fisiológicos que refletem em sintomas visuais e no desenvolvimento do maracujazeiro. / The experiment was conducted in a greenhouse at FCAV / UNESP. The objective was to evaluate the characterization of the visual symptoms of micronutrient deficiency in leaves; And to evaluate the effects of these micronutrients on the nutritional status of yellow passion fruit. In the experiment, a nutrient solution was used, with vermiculite as a substrate in a humid extract. Passion fruit (Passiflora edulis Sims.) Seedlings of commercial hybrid BRS Gigante Amarelo do Cerrado were used. The experimental design was completely randomized; With eight treatments (complete solution (Witness), omission of B, omission of Cu, omission of Fe, omission of Mn, omission of Mo, omission of Zn, complete solution + Ni); And 5 replicates. It was used as experimental unit; Vessels with 8 dm-3 of substrate with 1 plant / pot and 2 pots per experimental unit. After 60 days of planting, the dry matter of each treatment was evaluated, and the nutritional deficiencies were evaluated in leaves. The chlorophyll content was evaluated weekly to establish linear or quadratic regression between chlorophyll levels and nutritional deficiencies of each treatment; besides an evaluation of physiological variables such as transpiration, photosynthesis, stomatal conductance and internal and external CO2 concentration. Morphological characteristics were evaluated by means of optical microscope as were the development of root hair and by means of transmission electron microscopy, changes in leaf mesophyll. The order of manifestation of the deficiencies in the experiment were as follows: Fe> Mn> Zn> Cu> Mo> B; The toxicity of Nickel appeared at 40 days after the experiment was carried out in the vessels with symptoms of chlorosis in the new leaves, thus a general yellowing and some white parts. The omission of B resulted in deformations in the leaf limb and loss of apical dominance, showing deformation of the growth points; The omission of Mn caused reduction of growth and generalized chlorosis of the young leaves with thick reticulum, the omission of Fe resulted in an internerval chlorosis, with the appearance of fine crosslinking, with Fe and Mn being the first nutrients whose omission results in symptoms of plant deficiency Of passion fruit, followed by zinc and copper, and finally boron. The zinc and copper presented deformation and elongation of the leaves, reducing considerably the height and root development, the molybdenum presented a chlorosis in the old leaves that later spread in general form. The contents of the microspheres in the shoot and root varied according to the treatment, reflecting in morphological and ultrastructural problems in the cell and physiological, changing variables such as transpiration, photosynthesis, stomatal conductance and the relation between the concentration of CO2 in the spaces And the concentration of CO2 in the environment. The iron omission was the element that most reflected problems due to the formation of radical hair, being observed a greater formation of iron under conditions of deficiency of the element possibly due to its relation with the hormones ethylene and auxins. The observations in the transmission electron microscope showed in all the treatments a derangement and disorganization at the ultrastructural level, in the organelles as the chloroplasts, cell wall, starch granules, lipid granules, nucleus, affecting the functioning of the cell and causing physiological problems Which reflect on visual symptoms and the development of passion fruit.