Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

L’insuffisance rénale chronique (IRC) cause des anomalies biochimiques, osseuses et vasculaires. L’association entre IRC et fractures reste controversée, alors que les travaux antérieurs ont été restreints à l’étude de certains sites fracturaires et aux patients âgés. En outre, la performance de modalités d’imagerie ou scores de prédiction pour prédire les fractures en IRC fut peu étudiée. Les objectifs de ce mémoire sont donc d’évaluer l’impact de l’IRC légère à modérée sur : 1) la prévalence du statut fracturaire ; 2) l’incidence des fractures selon l’âge et le sexe; 3) la prédiction des fractures par l’échographie calcanéale (QUS); et 4) la performance de scores de prédiction clinique (FRAX, Garvan, QFracture). Nous avons analysé la cohorte CARTaGENE, incluant 19 990 Québécois âgés entre 40 et 69 ans. La fonction rénale fut estimée au recrutement. Les fractures furent identifiées de façon prévalente (autorapportées par questionnaire) et incidente (données médico-administratives). Nous n’avons pas observé d’association entre l’IRC et la prévalence du statut fracturaire après ajustement. Nous avons toutefois observé que l’IRC légère à modérée est associée à une augmentation de l’incidence des fractures à tous sites durant un suivi médian de 70 mois, particulièrement chez les jeunes et les hommes. Nous avons constaté que le QUS discrimine les fractures similairement en IRC et non-IRC, mais les sous-estime en IRC stade 3. Enfin, nous avons observé que la discrimination et la calibration des fractures par FRAX et QFracture étaient similaires en non-IRC et IRC, mais que le score Garvan menait à une discrimination plus faible et une sous-estimation en IRC stade 3. Ces travaux suggèrent un impact de l’IRC sur l’incidence fracturaire et la performance des outils prédictifs. Ils sensibilisent donc les cliniciens à l’impact fracturaire précoce de l’IRC et aux limites de certains outils prédictifs dans cette population. / Chronic Kidney Disease (CKD) causes biochemical, bone and vascular abnormalities. The association of nonterminal CKD with fracture remains controversial as previous studies focused on select fracture sites and were restricted to older patients. Furthermore, the fracture predictive performance of imaging methods and prediction tools has not been thoroughly studied. Thus, our objectives were to assess the impact of non-terminal CKD on : 1) fracture status prevalence; 2) fracture incidence by age and sex; 3) the performance of calcaneal quantitative ultrasonography (QUS) to predict fracture risk and; 4) the performance of three fracture prediction tools (FRAX, Garvan, QFracture). We analyzed the CARTaGENE cohort, which includes 19,990 participants aged 40 to 69 years from the province of Quebec, Canada. Renal function was estimated at baseline. Fractures were assessed at baseline (selfreported by health questionnaire) and during a follow-up of 70 months (medico-administrative data). We did not observe an association between non-terminal CKD and prevalent fracture status after adjustment for potential confounders. In contrast, we found that non-terminal CKD was associated with increased fracture incidence at any site, especially in younger patients and in men. Additionally, we observed that non-terminal CKD did not modify significantly the discriminative ability of QUS for fracture incidence but did lead to an underestimation of fracture incidence in patients with CKD stage 3. Finally, we found that FRAX and QFracture had similar discrimination and calibration for fractures in patients with and without non-terminal CKD while Garvan had lower discrimination and led to fracture underestimation in CKD stage 3. These findings suggest that non-terminal CKD is associated with increased fracture incidence and decreased performance of some fracture prediction tools. They therefore highlight the early effect of CKD on fracture risk and the limitations of some fracture prediction tools in this population.

Objectifs. La vaccination des nouveau-nés contre le rotavirus est recommandée par l'OMS dans les pays où un impact significatif de santé publique est à prévoir, chaque pays doit établir le fardeau des maladies liées au rotavirus et établir le coût-bénéfice potentiel de l'implantation de la vaccination. Le fardeau du rotavirus n'est pas encore bien déterminé au Canada et au Québec, les données épidémiologiques disponibles incluent rarement l'impact sur les unités d'observation pédiatrique de courte durée, les urgences et les visites externes de façon simultanée. L'objectif principal de cette étude est de déterminer le fardeau de la gastro-entérite aiguë liée au rotavirus (GEAR) sur l'ensemble du système de santé de la région de l'Estrie. Méthode. Il s'agit d'une étude de cohorte rétrospective qui incluait les enfants < 5 ans consultant en Estrie pour gastro-entérite aiguë (GEA) selon les codes CIM-9/10 correspondants de novembre 2002 à octobre 2008. Les données d'hospitalisations et de l'urgence provenaient de l'entrepôt de données cliniques CIRESSS du CHUS, celles des consultations externes de la RAMQ. La recherche de rotavirus n'étant pas systématique, nous avons utilisé deux méthodes d'estimation indirecte reconnues (Winter Residual Estimation et méthodes des coefficients de Brandt) pour extrapoler les taux de GEAR. Résultats. Sur les 6 années d'étude, ont été recensées 1435 hospitalisations (hospitalisations standard : 598, hospitalisations de moins de 24h : 837), 3631 consultations à l'urgence et 6220 consultations externes pour GEA. La part liée au rotavirus selon les méthodes de Brandt et WRE était respectivement de 404 à 666 hospitalisations, 1009 à 1361 consultations à l'urgence et 1613 à 1687 consultations ambulatoires. Pour la population des enfants de moins de 5 ans en Estrie les taux d'incidence annuels d'hospitalisations pour GEAR étaient estimés entre 45 et 74/10000, pour les passages à l'urgence entre 113 à 152/10000 et pour les consultations externes entre 180 à 188/10000. La courbe épidémique objectivait un pic annuel survenant durant les mois de mars et d'avril. La majorité d'enfants hospitalisés pour GEAR avaient moins de 2 ans (65%). La durée médiane d'hospitalisation en unité standard était de 53 heures et plus de 90% des enfants hospitalisés ont bénéficié d'une réhydratation par voie intraveineuse. Nous avons identifié 83 GEA nosocomiales. Il n'y a eu aucun décès lié à la GEA pendant l'étude. Conclusion. La plupart des études rétrospectives disponibles sous-estiment le poids de la maladie en omettant les hospitalisations de courte durée. De plus, il s'agit de la première étude au Canada évaluant de façon globale le fardeau de la maladie liée au rotavirus sur l'ensemble du système de santé. Les résultats de cette étude pourront servir à l'évaluation de l'intégration du vaccin anti rotavirus au programme d'immunisation du Québec.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

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Les méthodes et modèles statistiques destinés aux données de survie furent, dans leur grande majorité, développés sous l'hypothèse implicite d'indépendance statistique des observations individuelles. Bien que l'imposition d'une telle hypothèse soit raisonnable pour un grand nombre d'applications, il s'avère évident que dans bon nombre d'autres -- et non des moins courantes --, cette hypothèse est violée. Par exemple, en science vétérinaire, de telles données corrélées apparaissent lorsque les observations individuelles sont regroupées au sein d'élevages.<br />Nous étudions les deux principales classes de modèles pour données de survie corrélées : les modèles de fragilité (ou conditionnels) et les modèles marginaux. Nous nous proposons une large comparaison de ces deux approches, d'une part au travers d'une étude de données vétérinaires, d'autre part au moyen de simulations.<br />Notre objectif est d'évaluer la sensibilité de tels modèles vis-à-vis de la structure des jeux de données qu'ils sont appelés à traiter -- et plus particulièrement vis-à-vis de la taille des groupes.

La fièvre Q est une zoonose mondialement répandue due à Coxiella burnetii. Elle peut engendrer des troubles de la reproduction chez les ruminants. De plus, ces derniers constituent la principale source d'infection pour l'Homme. Il est donc nécessaire de lutter contre la propagation de C. burnetii en troupeaux bovins pour améliorer les performances de ces élevages et limiter le risque zoonotique. L'objectif de cette thèse a été de mieux comprendre la propagation de l'infection au sein d'un troupeau bovin laitier, afin de mieux la contrôler. Un modèle épidémiologique stochastique, individu-centré et en temps discret représentant la propagation intra-troupeau de C. burnetii a été développé. Ses paramètres ont été estimés à partir de données de terrain en utilisant une approche Bayésienne. Une forte hétérogénéité entre vaches excrétrices ayant été rapportée, les voies et niveaux d'excrétion ont été explicitement représentés dans une variante du premier modèle. Les paramètres influençant le plus la dynamique d'infection, identifiés par une analyse de sensibilité, étaient les niveaux d'excrétion, les caractéristiques de la bactérie dans l'environnement et certains traits physiologiques des animaux. Enfin, trois stratégies de vaccination ont été représentées dans le modèle et leurs efficacités à long terme ont été comparées par simulation. La vaccination des vaches et génisses pendant 10 ans s'est avérée la stratégie la plus efficace. En conclusion, outre une meilleure compréhension de la dynamique d'infection, ce travail fournit une aide à la priorisation des besoins de recherche et à la définition des mesures efficaces pour contrôler la fièvre Q en troupeaux bovins laitiers.

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