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Epizoítos y parásitos de la tortuga boba (Caretta caretta) en el Mediterráneo Occidental.

Badillo Amador, Fco. Javier 12 March 2007 (has links)
En el presente trabajo se ha realizado un estudio de los epizoítos y endoparásitos de la tortuga boba (Caretta caretta) en el Mediterráneo occidental. En el apartado de epizoítos, se ha encontrado 39 taxones pertenecientes a los filos Cnidaria, Annelida, Crustacea, Mollusca y Ectoprocta. El hallazgo de algunas de estas especies suscita cierto interés por ser de nueva aparición en el Mediterráneo o por constituir nuevos registros como epizoítos de tortugas marinas en el Mediterráneo o a nivel mundial. Se halló un copépodo harpacticoide perteneciente a la familia Balaenophilidae que muestra rasgos morfométricas propios de una nueva especie, denominada aquí, por el momento, Balaenophilus sp. Asimismo, se ha redescrito el copépodo especialista de C. caretta Balaenophilus umigamecolus a partir de ejemplares procedentes de Japón, tras hallarse nuevos caracteres y corregirse algunos otros respecto a la descripción original. Además, se ha estudiado el hábitat y la alimentación de los copépodos del género Balaenophilus para averiguar la asociación existente con sus hospedadores: B. unisetus, especialista de cetáceos misticetos, y Balaenophilus sp., la especie encontrada por nosotros en el Mediterráneo occidental. El contenido digestivo y el estudio histopatológico de lesiones asociadas a Balaenophilus sp., sugiere que ambas especies se alimentan de tejido del hospedador, compuesto en su mayor parte por queratina. Su asociación exclusiva con ballenas y tortugas marinas podría deberse a su habilidad para explotar este recurso, escaso en el medio marino. Asimismo, se ha realizado por primera vez un estudio cuantificado de algunos determinantes de la diversidad de epizoítos y se ha intentado cuantificar el efecto de la metodología del muestreo sobre los resultados. El presente estudio muestra que la comunidad potencial de epizoítos de cualquier individuo de C. caretta en el Mediterráneo occidental está compuesta por un grupo de especialistas y un conjunto mas variable de generalistas de sustratos flotantes. A diferencia de otros estudios, el análisis sobre las interacciones bióticas de colonización muestra asociaciones globales positivas en especialistas y neutras en las especies no especialistas. No hemos hallado relaciones de exclusión entre especies. La presencia de algas del género Polysiphonia determina la presencia de un núcleo de 3 especialistas frecuentes, Caprella andreae, Hyale grimaldii y Hexapleomera robusta. También se ha confirmado la relación positiva entre la talla de las tortugas y el número de especies de epizoitos. Se han hallado 10 especies de helmintos, todos en el tracto digestivo: 8 trematodos digeneos (Enodiotrema megachondrus, Calycodes anthos, Hemiuroidea spp., Pachypsolus irroratus, Rhytidodes gelatinosus, Orchidasma amphiorchis, Plesiochorus cymbiformis, Pleurogonius trigonocephalus) y 2 nematodos (Kathlania leptura y Anisakis sp. tipo I). Todos ellos son especialistas de tortugas marinas excepto el digeneo Hemiuroidea spp. y el nematodo Anisakis sp. tipo I, considerados accidentales. El estudio de la diversidad de las comunidades helmínticas gastrointestinales de C. caretta revela que éstas constituyen un sistema aislado para el intercambio de parásitos con otros vertebrados marinos. En el Mediterráneo occidental la tortuga boba debe "sostener" su fauna de parásitos especialistas puesto que tampoco los intercambia con otras especies de tortugas marinas. De hecho, las infracomunidades están compuestas por especialistas con prevalencias muy bajas. Esto podría explicarse por el carácter ectotérmico de las tortugas, su gran vagilidad y su amplia dieta. El análisis comparativo de la composición y estructura de las comunidades helmínticas de dos grupos de tortugas de distinto origen (decomisadas y varadas) no reveló diferencias, a pesar de que su dieta sí mostraba diferencias significativas, al menos en dos grupos de presas de gran importancia numérica, los tunicados pelágicos y los teleósteos. Se sugiere que ello se debe a que los digeneos especialistas de las tortugas bobas utilizan gasterópodos y/o bivalvos como hospedadores intermediarios. / This study focussed on the epibionts and endoparasitic fauna in the Loggerhead turtle (Caretta carretta) in the Western Mediterranean.39 taxons belonging 5 epizoite phyla were found. Some of these findings are of special interest since these species have never recorded in the Mediterranean or as epizoites of marine turtles.A comparative morphometric study between a harpacticoid copepod from our samples and Balaenophilus umigamecolus from Japan revealed differences indicative for a new species. Also, an updated description of B. umigamecolus, first described in Japan, was made.Also, a study was carried out in order to find out the type of association between the species of genus Balaenophilus and their hosts, suggesting that these species feed on host tissue, formed mainly of keratin.At the same time, a quantitative study of some limiting factors of the epizoites diversity in C. caretta was carried out, attempting to quantify the effect of the sampling methodology on the results. Our study shows that the potential community of epizoites of individuals of C. caretta in the Western Mediterranean is composed by a group of specialists and a group of non specific fouling species. In contrast to other studies, positive associations were found between the biotic colonization interactions in specialists and neutral associations in the case of non specialist. We did not find exclusive interactions between species. Positive relation between turtle size and season, with number of species of epizoites, was detected. A total of 10 species of helminths were found, 8 digenean and 2 nematodes, all of them in the digestive tract. Except Hemiuroidea spp. and Anisakis sp., both accidental, all species are marine turtle specialists. The gastrointestinal helminth infracommunities of C. caretta are very depauperate, being formed by species that appear in low prevalence, despite their specialist status. The comparative analysis of composition and structure of helminth communities of turtles from two different origins of the Western Mediterranean did not reveal differences, although their diet did show significant differences. It is suggested that this pattern is possibly explained because sea turtle specialist digeneans use gastropods and/or bivalves as intermediate hosts.
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Control biológico del piojo rojo de California, Aonidiella aurantii (Maskell) (Hemiptera: Diaspididae) y estrategias reproductivas de su principal enemigo natural Aphytis chrysomphali (Mercet) (Hymenoptera: Aphelinidae)

Pina Desfilis, Mª Tatiana 04 April 2007 (has links)
Esta tesis describe la situación del control biológico del piojo rojo de California, Aonidiella aurantii (Maskell) (Hemiptera: Diaspididae), por parasitoides en la Comunidad ValencianaEl piojo rojo de California es una de las plagas más importantes de cítricos en España. Esta plaga, a pesar de todos los tratamientos químicos que se realizan para su control, se encuentra por encima del umbral económico de daños.En este trabajo se constata, tras un muestreo realizado a lo largo de un año, que Aphytis chrysomphali (Mercet) (Hymenoptera; Aphelinidae) es el parasitoide mayoritario de esta cochinilla en la Comunidad Valenciana, a pesar de todas las sueltas realizadas desde los años 70 de la especie Aphytis melinus DeBach, parasitoide más eficaz en otros países. Junto a estas dos especies se ha verificado el establecimiento de Aphytis lingnanensis Compere en Castellón, tras repetidas sueltas, así como se ha descrito la presencia de dos nuevas especies de parasitoides sobre A. aurantii: Aphytis hispanicus (Mercet), parasitoide habitual de Parlatoria pergandii (Comstock) (Hem.; Diaspidadae) pero no de A. aurantii en España; y una especie que podría tratarse de un nuevo taxón para la ciencia y que hasta el momento de su próxima descripción se ha denominado Aphytis sp. grupo lingnanensis. De esta especie destacan como características principales la pigmentación casi absoluta de la pupa (fundamentalmente cabeza y tórax), la exuvia también oscura y la crénula solapada en el adulto. Junto a este grupo de ectoparasitoides, también se ha realizado la introducción de dos nuevos endoparasitoides del piojo rojo de California en la península Ibérica, dentro de un programa de control biológico clásico: Comperiella bifasciata (Howard) (Hym.; Encyrtidae) y Encarsia perniciosi (Tower) (Hym.; Aphelindae). Sólo se ha establecido la segunda especie en Castellón, tras ser transferida su cría al insectario de Sanidad Vegetal de Almazora (Castellón) y en colaboración con la unidad de entomología del Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias. Durante el periodo de estudio también se ha localizado a Comperiella lemniscata Compere y Annecke (Hym.; Encyrtidae), nueva especie de endoparasitoide de Chrysomphalus dictyospermi (Morgan) (Hem.; Diaspididae) en España.Se ha verificado que A. chrysomphali en campo parasita fundamentalmente cochinillas macho, lo cual --y tal y como se demuestra en la tesis-- afecta negativamente al tamaño del parasitoide, a su longevidad y fecundidad. Sin embargo, en condiciones de laboratorio, esta especie prefiere un hospedador de mayor tamaño como la hembra joven, y por tanto la elección en campo de un hospedador de menor calidad obedece a cuestiones de tipo ecológico. Entre estas variables, podrían ser determinantes aspectos como la estructura de la población de la cochinilla en campo donde predominan estados inmaduros, hecho que a su vez podría ser responsable de la baja densidad de la población de A. melinus que requiere estados más avanzados para su correcto funcionamiento.Por otro lado, se ha observado que A. chrysomphali está infectada por la bacteria endosimbionte Wolbachia. En este trabajo se demuestra como esta bacteria en A. chrysomphali induce la partenogénesis telitoca, de tal modo que si se elimina la bacteria mediante tratamientos antibióticos se revierte el porcentaje de sexos hacia la producción de una descendencia formada exclusivamente por machos. Además, a medida que disminuye la densidad de la bacteria en los progenitores, su fecundidad, y la supervivencia de los estados inmaduros, se ve reducida. Por otro lado, los machos obtenidos presentan un comportamiento de cópula normal a diferencia de las hembras, infectadas o curadas, que no se muestran receptivas e impiden la cópula, concluyendo que la reproducción partenogenética telitoca exhibida por la hembra es de tipo irreversible.
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Biodiversity and structure of parasite communities in Boops boops (Teleostei: Sparidae) from the Western Mediterranean and off the North East Atlantic coasts of Spain.

Pérez-del-Olmo, Ana 25 April 2008 (has links)
The present study carried out a detailed assessment of the metazoan parasite fauna in Boops boops (Sparidae) along the Spanish coasts off the Western Mediterranean and North-East Atlantic, which provided taxonomically consistent dataset comprising three levels of parasite community organisation that allowed questions regarding the structure of parasite communities to be addressed.The diversity of the parasite fauna of B. boops appeared to be higher than previously thought, as evidenced by the description of one new species, Wardula bartolii Pérez-del-Olmo et al., 2006 and the recovery of 53 parasite species (25 new host records). The complete checklist of parasites of this host throughout its distributional range comprises 78 species and 365 host-parasite-area records. A group of nine species with a wide geographical distribution was identified as the core of the parasite fauna of B. boops. The regional parasite fauna of B. boops was richest in the North-East Atlantic. There was a clear separation of the North-East Atlantic and Mediterranean local faunas, with a 'transition' location occupying an intermediate position. Local parasite faunas were generally diverse. There was a high representation of parasites with complex life-cycles, transmitted via food ingestion, mostly trematodes. The phylogenetic influence on the parasite communities in B. boops is rather weak, since generalist parasites comprised a considerable part of communities. The species of the core parasite fauna of B. boops were already present in juvenile fish, whereas all species added to communities in larger fish were rare/accidental. The observed sequence of species appearance and persistence supported the hypothesis that species with wide geographical distributions appear in the fish population earlier than rare/stochastic species. Parasite communities were rich and abundant from an early age. Six species of the core parasite fauna of B. boops were identified as key parasites in developing communities since they persisted as common in all size cohorts and represented the majority of the individuals. A nested subset pattern was found which could not be completely attributed to either accumulation over time or segregation of the parasite species among different host cohorts. Nestedness was strongly related to the differential species abundance, suggesting that passive sampling could be the mechanism leading to this non-random structure.The data revealed that the geographical distance and the region affect the species composition and structure of parasite faunas and component communities in B. boops. The distance between localities/regions contributed significantly to the decay of the similarity estimated from parasite abundance at the infracommunity level. The structured spatial patterns were consistent in time but not across seasons. The spatial synchrony observed was solely due to the assemblage of the 'core' species, supporting the hypothesis that widespread species would be strongly associated with patterns of variation in environmental conditions. The interspecific abundance-distribution patterns were recognized as the most important for the distance-decay relationship of similarity in this system due to the strong correlations observed at all scales of analysis.The comparative analyses revealed a notable alteration of parasite abundance patterns and dramatic changes in community richness, abundance and structure of parasite communities in B. boops studied after the Prestige oil-spill. A directional trend in parasite community succession was detected. However, the differences were still large indicating that shifting pollution baselines probably affect community recovery.The elevated levels of monoxenous infections could indicate that changes in immune parameters of fish. The increase of heteroxenous may have reflected an enhancement of the populations of the mollusc and copepod hosts due to organic enrichment following the oil-spill. Focusing on higher taxonomic/functional levels and the use of multivariate statistical approach have proved to be very useful in studying the response of parasite communities to pollution. / En la presente tesis doctoral se realizó un estudio exhaustivo de los metazoos parásitos de la boga, Boops boops (Sparidae) en la costa Mediterránea y Atlántica española. La diversidad parásita fue mucho mayor de lo que previamente se pensaba, como se evidenció en la descripción de una nueva especie y la presencia de 53 especies (incluyendo 25 nuevos registros). Se encontró regularmente un grupo de nueve especies de amplia distribución, que fueron considerados el núcleo de la parasitofauna de B. boops. Las faunas parásitas locales resultaron ser diversas y caracterizadas por una gran representación de parásitos generalistas y con ciclos vitales complejos. La secuencia de aparición y persistencia observada en el desarrollo de las comunidades parásitas apoyó la hipótesis de que las especies con distribución geográfica amplia aparecen en las poblaciones de peces antes que las raras y estocásticas. Las comunidades parásitas de B. boops fueron ricas y abundantes desde una edad temprana. Se detectó una estructura anidada fuertemente relacionada con una abundancia diferencial de las especies, sugiriendo que el muestreo pasivo de parásitos del hospedador podría ser el mecanismo responsable de esta estructura no-aleatoria. Tanto la distancia geográfica como la región de origen afectaron la composición de especies y la estructura de las faunas parásitas y comunidades componentes. El patrón de estructura espacial fue consistente en el tiempo pero no entre estaciones. La relación abundancia-distribución interespecífica fue el aspecto más importante en el declive de la similitud con la distancia.El análisis comparativo de las muestras de localidades afectadas por el vertido del petrolero "Prestige reveló un cambio drástico en la riqueza, abundancia y estructura de las comunidades parásitas, así como una notable alteración de los patrones de abundancia. Se detectó una tendencia direccional en la sucesión de las comunidades parásitas tras el vertido. Sin embargo, las diferencias siguen siendo acusadas, lo que podría indicar un desplazamiento de los niveles base que estaría afectando la recuperación de las comunidades bentónicas y parásitas tras el vertido. Tanto el enfoque basado en niveles taxonómicos y funcionales superiores como la aproximación mediante análisis estadísticos multivariantes, resultaron ser muy efectivos para este tipo de estudios.
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Feeding and breeding ecology of three insectivorous birds in Mediterranean ecosystems

Atiénzar Navarro, Francisco 21 December 2009 (has links)
Tits (Paridae) are one of the most and better passerines known owing to they are broadly distributed, breeding in different habitats from gardens to forests, and they make use of nest boxes for breeding. Hence, such species are ideal for comparative studies on a large geographical scale. Despite the great amount of information concerned to tits, we still do not really understand life-history strategies of birds living under most ecological conditions. The present thesis is focused on achieving a better understanding of how birds are adapted to their environment. In particular, to examine the existence and the consequences of food limitation in Mediterranean evergreen habitats, through an adequate knowledge of the constraints affecting both feeding behaviour and breeding success. To achieve the main objectives proposed, studies were conducted in three Mediterranean ecosystems: pine and Holm Oak Quercux iles forests, and an orange grove. This was carried out mainly over Great Tits Parus major, and in certain cases over Crested Tits Lophophanes cristatus and Coal Tits Periparus ater. The specific aims pursued in this thesis are as follows: / Los Carboneros son aves insectívoras que pertenecen a la Familia Paridae. Las especies que engloba dicha familia están muy estudiadas, conociéndose bastante sobre su biología. Esto se debe a que están ampliamente distribuidas, reproduciéndose en diferentes tipos de hábitat. Por lo tanto, dichas especies son ideales para estudios comparativos a gran escala geográfica. A pesar de la gran cantidad de información existente, todavía se desconoce las estrategias de vida de las aves bajo determinadas condiciones ecológicas. La presente tesis pretende alcanzar un mejor entendimiento de cómo las aves están adaptadas a su ambiente. En concreto, se examinó la existencia y las consecuencias de la limitación de alimento en ambientes Mediterráneos perennifolios, sobre el comportamiento trófico y el éxito reproductor. El estudio se llevó a cabo en tres ecosistemas Mediterráneos: bosque de pino y Carrasca Quercus ilex, y en un naranjal. Se utilizó principalmente como especie modelo, el Carbonero Común Parus major, y en menor medida, el Herrerillo Capuchino Lophophanes cristatus y el Carbonero Garrapinos Periparus ater. En la presente tesis, se ha demostrado que las aves hicieron uso de la temperatura ambiental en tal de ajustarse a las variaciones de la fenología del alimento, haciendo uso de las características de la vegetación para reducir la detección por parte de los depredadores. Las aves también se las arreglaron en relación a factores ambientales e intrínsecos cuando alimentaban a sus pollos, disminuyendo o aumentando su esfuerzo. Han compensado demandas conflictivas, por ejemplo, entre la coloración y la predación del nido. Hembras coloridas evitaron la predación del nido eligiendo lugares camuflados. Además, se ha demostrado cómo se las arreglaron los Herrerillos Capuchinos que se reprodujeron en un ambiente poco usual para la especie (carrascar), mediante la elección de cajas nido rodeadas de pino. Finalmente, las tres especies de aves utilizadas coexisten dentro de un mismo hábitat alimentándose de presas de distinto tamaño, reproduciéndose en lugares con características de la estructura de la vegetación diferente, o a través de distintos tiempos de reproducción. Dado que los datos fueron obtenidos mediante el uso de cajas nido, algunos de los resultados obtenidos podrían no ser relevantes o comparativos en aquellos casos en los que se estudie las aves nidificando en agujeros naturales debido a las diferencias, por ejemplo, en la presión por predación.
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Bioecología, diversidad e interés epidemiológico de los culícidos mediterráneos (Diptera: culicidae)

Bueno Marí, Rubén 12 July 2010 (has links)
Desde la erradicación del paludismo en España, los estudios acerca de los mosquitos culícidos (Diptera: Culicidae) han disminuido drásticamente en nuestro país. Con el objetivo de actualizar los datos faunísticos de la familia en la Comunidad Valenciana, se llevaron a cabo intensivos muestreos larvarios en los años comprendidos entre 2005 y 2008. Durante estos cuatro años se consiguió recolectar 11.279 ejemplares pertenecientes a 29 especies de Culicidae, repartidos en 548 puntos de captura diferentes. El estudio de la salinidad de los biotopos larvarios indica que únicamente Ochlerotatus caspius (Pallas, 1771) y Ochlerotatus detritus (Haliday, 1833) pueden calificarse como especies eurihalinas, tipificándose al resto de especies como estenohalinas del componente dulceacuícola u oligosalobre. Se obtuvieron elevados porcentajes de asociación larvaria entre especies, como Culex territans Walker, 1856 y Culex impudicus Ficalbi, 1890 (61,9%), Oc. caspius y Oc. detritus (57,2%) o Culiseta longiareolata (Macquart, 1838) y Culex laticinctus Edwards, 1913 (48,7%), fruto de la existencia de similares requerimientos acerca de los hábitats donde desarrollar la fase preimaginal. Por el contrario, otras como Culex pipiens Linnaeus, 1758 demuestran ser especies poco restrictivas al cohabitar en porcentajes elevados con especies de requerimientos muy dispares. Las variables cuantitativas y cualitativas recopiladas para cada criadero larvario han permitido la obtención de modelos predictivos acerca de la presencia de especies como Cx. pipiens, Cx. territans, Cs. longiareolata y Oc. caspius, con porcentajes de precisión del 60%, 60%, 67% y 67,2%, respectivamente. Los resultados también evidencian que la biodiversidad de mosquitos sufre importantes variaciones con respecto a la influencia de patrones climáticos y antrópicos diferentes, de modo que la escasez de precipitaciones y la proximidad de asentamientos humanos son dos factores que afectan negativamente a la biodiversidad de mosquitos, deparando un filtro de selección que sólo unas pocas especies pueden superar. Se han detectado especies relacionadas con la transmisión de enfermedades al hombre. La bioecología de los vectores estudiados, coadyuvada por el nivel socioeconómico y sanitario de nuestro país, revela que los episodios de transmisión de paludismo son poco probables. La situación es diferente atendiendo a las arbovirosis, ya que existen vectores con elevados grados de domiciliación. Además, exceptuando a los virus de carácter antroponótico, la participación de animales vertebrados como hospedadores amplificadores suele enmascarar las posibilidades reales de iniciación de brotes epidémicos. En conclusión, los programas de control poblacional de mosquitos deben tener en cuenta los aspectos bioecológicos, biogeográficos y fenológicos de las especies implicadas. Datos éstos que se ven incrementados con la contribución de la presente tesis. / Intensive larval samplings of mosquitoes (Diptera: Culicidae) were carried out between 2005 and 2008 in several biotopes located in a varying climate region in Eastern Spain (Valencian Autonomous Region). The biodiversity was deeply analyzed and divided into alpha, beta and gamma components with the aim of comparing the mosquito biodiversity according to the different structure of the landscape due to the incidence of climatic and anthropic patterns. Likewise the synanthropic index of Nourteva was calculated for each species caught. A total of 11.279 mosquitoes belonging to 29 species were collected and identified. Mosquito biodiversity was higher in the wettest and non-anthropized areas. All this information was also used to group the different regions studied depending on its mosquito faunistic composition through cluster analysis. On the other hand, a classification of Spanish mosquitoes according to different life cycles was also developed. The bio-ecological parameters analyzed were the ovipositional sites, overwintering stages, preferred hosts, and number of generations per year of each species. Results showed the existence of 13 different functional groups. The Jaccard cluster and the principal components analysis (by means of between group analysis method) revealed 3 different mosquito groups: the tree hole species, the aedine species (except dendrolimnic ones) and the rest of the non-dendrolimnic culicid species. The importance of the different overwintering patterns in distinguishing these 3 classes is also discussed. Moreover the quantitative and qualitative variables analyzed for each larval breeding site have allowed the establishment of predictive models about species such as Culex pipiens Linnaeus, 1758, Culex territans Walker, 1856, Culiseta longiareolata (Macquart, 1838) and Ochlerotatus caspius (Pallas, 1771), with accuracy rates of 60%, 60%, 67% and 67.2% respectively. Finnally the re-emergence of antroponosis, like malaria, seems unlikely given the low values of the synanthropic index for the anophelines captured. However the situation is clearly different regarding to several arboviruses due to the presence of different vector species with high degrees of domiciliation.
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Parasitological study of cultured and wild sparids in the Mediterranean

Alama Bermejo, Gema 05 December 2011 (has links)
Aquaculture is a growing agricultural sector that due to the actual market saturation by sea bass and gilthead sea bream, needs for new fish species diversification. Sparid fishes are important candidates for species diversification in the Mediterranean aquaculture. Under culture conditions, parasites may cause serious problems. This thesis aims to improve our knowledge of myxozoan and aporocotylid parasites in sparids which are new candidates or existing Mediterranean aquaculture species. The present study seeks to identify, describe and clarify the taxonomic position of the parasite taxa by morphological and molecular approaches, and by defining their phylogenetical position and relationship with previously described species. Development, habitat selection in the host and pathology are analysed in order to evaluate the pathogenic potential of the parasites described. Also this thesis focuses on the study of parasite life cycles, seasonality, transmission and routes of infection in the fish host, with the final aim to provide information allowing for the development of management strategies for aquaculture systems. The study led to the following findings and conclusions: -A new genus and species of blood fluke, Skoulekia meningialis n. gen., n. sp. was described from the common two-banded seabream Diplodus vulgaris in a non common location, the ectomeningeal veins surrounding the optic lobes of the brain. The adults of S. meningialis were found to cause mild, chronic, localised meningitis. Its special location surrounding a vital organ should be kept in mind when establishing D. vulgaris in aquaculture systems. -Large cysts of myxosporean spores of the species Unicapsula pflugfelderi were detected in the fillets of sand steenbras Lithognathus mormyrus. Myoliquefaction process was not found to occur in U. pflugfelderi. However, the massive presence of macroscopic plasmodia in the fillets of L. mormyrus could produce marketing problems, affecting to the potential of the sand steenbras as an aquaculture candidate. -A new myxozoan parasite Ceratomyxa puntazzi n. sp. was found to cause histopathological changes in the liver and in the gall bladder of the sharpsnout seabream Diplodus puntazzo and has to be considered as an opportunistic parasite in immunocompromised hosts. The genus Ceratomyxa seems to be very host-specific in sparids and high species diversity can be expected in Mediterranean sparids. The phylogenetical analyses revealed that all ceratomyxid species of sparids from the Mediterranean rise from a common ancestor. -This thesis provides unique insights into the development and cellular organisation of the myxozoan C. puntazzi. This study is the first use of confocal laser scanning microscopy with specific stains on developmental stages of a myxozoan. C. puntazzi seems to follow a sequence of development with two pathways in the bile: pre-sporogonic proliferative development where stages show high degree of motility, cellular divisions and budding by plasmotomy, and sporogonic development, characterized by the formation and maturation of spores. For the first time in myxozoans, motility and the distribution of potential effectors of motility were analysed. F-actin rich cytoskeletal elements were found to concentrate at one end of the parasite, which produces localised filopodia, thus facilitating parasite motility. The mechanism of budding was identified, for the first time, as an active F-actin dependent separation process. -Natural exposures of sharpsnout seabream to a C. puntazzi enzootic habitat are the first attempt of conducting a seasonality study in marine myxozoans and provide important insights into the seasonal patterns of myxozoan abundance in a temperate marine environment. C. puntazzi infection in the bile shows a marked temperature-related seasonality, with visual detection of parasites exclusively between April - November. However, PCR detection in the bile is possible all year round. Blood stages were detected all year round by PCR. This indicates that actinospores are present in the sea water and the blood of exposed fish is invaded throughout the whole year. Implications for D. puntazzo culture are discussed. / La acuicultura mediterránea necesita diversificación de especies de peces para el cultivo debido a la saturación del mercado con dorada y lubina. En condiciones de cultivo, los peces pueden verse afectados por diversos patógenos, entre ellos los parásitos. Entre los parásitos mas problemáticos en la acuicultura mediterránea, figuran los mixozoos y los aporocotílidos. En esta tesis doctoral se presentan nuevas y se aportan nuevos datos de especies ya descritas de estos dos grupos parásitos, se estudia la relación parasito-hospedador y se incluyen nuevos datos del desarrollo, rutas de infección, ciclo de vida y estacionalidad en especies de peces candidatas para el cultivo. Un nuevo género y especie de aporocotílido Skoulekia meningialis n. gen. n. sp. se halló en un hábitat poco común, las venas ectomeningeales del cerebro de la mojarra Diplodus vulgaris, donde los adultos provocan una meningitis moderada pero crónica. Plasmodios alargados con esporas del mixozoo Unicapsula pflugfelderi se hallaron en la musculatura de la herrera Lithognathus mormyrus y aunque no se observó mioliquefaccion, la presencia masiva de estas estructuras en los filetes puede afectar al potencial de la herrera como especie para la acuicultura. Ceratomyxa puntazzi n. sp. es una nueva especie de mixozoo descrita de la vesícula biliar del sargo picudo Diplodus puntazzo. C. puntazzi provoca cambios histopatológicos en el hígado y la vesícula biliar del sargo picudo y debe considerarse como un patógeno oportunista. C. puntazzi forma parte del complejo de especies del género Ceratomyxa hallado en espáridos del Mediterráneo los cuales provienen de un ancestro común. Dentro del estudio de C. puntazzi, se describen los componentes celulares, y los mecanismos que intervienen en la motilidad de los mixozoos y como estos elementos están implicados en los procesos de gemación y citocinesis en los mixozoos. Experimentos de transmisión con jaulas en el mar a un medio natural enzoótico para C. puntazzi reveló una estacionalidad marcada, con presencia de esporas en la bilis de Abril a Noviembre, pero con detección por PCR durante todo el año tanto en la bilis como en la sangre. Estos resultados tienen implicaciones para el manejo del cultivo del sargo picudo.
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Contribució a l'estudi de les aranyes de mar (Pycnogonida): biogeografia de les espècies antàrtiques i biologia alimentària de les espècies mediterrànies

Soler Membrives, Anna 09 November 2010 (has links)
Les aranyes de mar o Pycnogonida (Latreille 1810) són un extraordinari grup d’artròpodes marins; són estranys, fascinants i animals força primitius, fet que comporta una alta controvèrsia quant a afinitats amb altres grups. Estan distribuïdes per tot el món, i fins a dia d’avui, s’han descrit més de 1300 espècies i 80 gèneres. El següent resum sintetitza els treballs realitzats per tal de contribuir en l’estudi de la biogeografia i distribució batimètrica de les espècies antàrtiques, així com aportar nous coneixements sobre a la biologia alimentària de les espècies mediterrànies: Les aigües antàrtiques estan caracteritzades pels alts nivells de riquesa específica i d’endemismes, i els picnogònids antàrtics són excel·lents representants d’aquesta alta diversificació. Avui dia s’han descrit 264 espècies en aigües australs, que representen el 19.6% de les espècies mundials; 107 espècies són endèmiques d’aigües antàrtiques, mentre que 63 són comunes a ambdues zones, antàrtica i sub-antàrtica. El gènere amb major riquesa és Nymphon, que compta amb 67 espècies. S’ha proposat la hipòtesi del refugi insular bentònic com a explicació de la distribució actual de les aranyes de mar australs, proposant com a origen l’Arc d’Escòcia. Aquesta hipòtesi, juntament amb la migració des de la zona magallànica, podria explicar la riquesa específica extraordinàriament alta del Mar d’Escòcia. Els resultats conclouen que gairebé el 30% de les espècies presenten una distribució circumpolar; l’augment de les expedicions que impliquen un major nombre de mostrejos ha fet que augmenti la circumpolaritat, i per tant, davalli la endemicitat zonal. La informació bàsica sobre els patrons de distribució batimètrica, la diversitat d’espècies i la composició de la comunitat és escassa per a aquest grup. Les aportacions d’aquest treball quant a la distribució geogràfica contribueixen a comprendre millor les distribucions dels picnogònids antàrtics. Pallenopsis kupei és nou per a aigües antàrtiques, i sis espècies no s’havien trobat mai fins ara en aigües del Mar de Weddell. S’ha analitzat els patrons de distribució batimètrica en el Mar de Weddell, mostrant que la composició específica de la plataforma continental (des dels 100 fins als 900 m de fondària) difereix respecte a la del talús (a partir dels 900 m). Mentre que la majoria d’espècies estan confinades als límits de la plataforma continental, el talús està dominat bàsicament pel gènere Nymphon. Així, la profunditat sembla ser un factor important quant a la distribució de les aranyes de mar. Aquests resultats suporten la hipòtesi que els picnogònids antàrtics han evolucinat i diversificat a la plataforma continental, i posteriorment s’han submergit als fons profunds. La conca central de l’Estret de Bransfield està caracteritzada per una sèrie de volcans isolats. La fauna d’aquestes estructures volcàniques s’ha analitzat per intentar esbrinar si els volcans eren actius durant el període mostrejat. Les famílies més abundants són Nymphonidae i Colossendeidae, tot i que la biomassa és molt major pels colossendeids. Això indica que aquests probablement estan utilitzant l’estratègia de la K, enlloc de l’estratègia de la r que és més típica dels petits nymphonids. La col·lecció és representativa del bentos de la zona oest de l’Antàrtica. Les estructures volcàniques de la zona no estaven actives durant el mostreig. Nymphon australe Hodgson 1902 és l’espècie més abundant d’aranya de mar a l’Oceà Austral. Aquesta espècie està considerada com a circumpolar, euribàtica i morfològicament variable. En aquest estudi, s’investiga l’estructura genètica de les poblacions de N. australe al llarg de l’Antàrtica, utilitzant dades d’ADN mitocondrial. Els resultats suporten la circumpolaritat suposada per aquesta espècie, sense indicació d’especiació críptica. No obstant, les poblacions de la Península Antàrtica, el Mar de Weddell i l’Est Antàrtic estan efectivament aïllades, indicant que el flux genètic és limitat. A més a més, existeix una certa estructura genètica entre poblacions dins d’una mateixa zona. Es conclou que N. australe ha colonitzat amb èxit gran part de l’ecosistema marí antàrtic, tot i la seva limitada capacitat de dispersió. El sistema digestiu de les aranyes de mar no ha estat discutit en el context de la seva ecologia i comportament alimentari. S’ha estudiat el sistema digestiu de dues espècies, Ammothella longipes (Hodgson 1864) i Endeis spinosa (Montagu 1808), així com el procés digestiu que s’hi dóna. Les diferències més importants s’han observat en la probòscide, reflectint adaptacions segons la dieta. L’estructura de la boca i del filtre de la faringe, així com la musculatura de la trompa, són els trets més diferents alhora de comparar les dues espècies. Els productes salivals juguen un paper important en la digestió oral. El seu procés digestiu dels picnogònids difereix del de la majoria de crustacis i xifosurs marins, bàsicament per l’absència de cèl·lules glandulars en el digestiu mig, i la presència d’una cèl·lula digestiva multifuncional. Les cèl·lules epitelials presenten un estat de repòs durant els períodes de dejú. Durant la digestió, els grànuls secretors són alliberats al lumen intestinal, i es formen els lisosomes secundaris, on es dóna la digestió. Finalment, s’alliberen els cossos residuals al lumen per a ser excretats a través de l’anus. L’anàlisi d’àcids grassos ha estat demostrat com una bona eina per a determinar les relacions tròfiques i el comportament alimentari dels organismes, dels quals la seva dieta no pot ser inferida a partir del contingut estomacal. Les variacions estacionals en el contingut d’àcids grassos totals (TFA) i la composició d’àcids grassos ha estat analitzada en Ammothella longipes per tal d’establir les seves relacions tròfiques. Els resultats revelen que A. longipes és capaç modificar la seva dieta depenent de l’època de l’any, i l’aliment disponible. Aquesta espècie sembla ser carnívora durant la primavera i primers d’estiu, però s’alimenta de detritus quan les preses ja no són tan assequibles, durant l’hivern. S’han detectat alts nivells de cadena senar durant l’estiu i tardor, que són indicadors de bacteris adquirits a través de la dieta detritívora, o bé a través de la síntesi de novo a partir de propionat. El contingut TFA en A. longipes es manté durant tot l’any. Aquest fet concorda amb la seva activitat reproductora, que té lloc durant tot l’any excepte de maig a juliol, període durant el qual, adquireix una dieta carnívora. / Pycnogonida (Latreille 1810) or sea spiders are one of the most intriguing groups of marine arthropods; they are bizarre, fascinating and very primitive animals of highly controversial affinities. They are found worldwide, and more than 1300 species and 80 genera are described to date. This report summarizes the studies carried out to provide a better insight of the biogeography, bathymetric distribution and the feeding biology of this group. Antarctic waters are characterized by the high levels of species richness and endemism, and Antarctic sea spiders are excellent representatives of this highly diversification. To date 264 austral species have been recorded, accounting for 19.6% of the species recorded worldwide; 107 of them are endemic to Antarctic waters, while 63 are common in the sub-Antarctic and Antarctic regions. The richest genus is Nymphon, with 67 species. The benthic insular refuge hypothesis is proposed as an explanation for the southern distribution of the present pycnogonid fauna, with an origin in the Scotia Arc. This hypothesis together with the migration from the Magellan zone would explain the extremely high species richness of the Scotia Sea. Results conclude that nearly the 30% of the species present a circumpolar distribution; a tendency toward circumpolarity of species and subsequent decrease of zonal endemicity is noticed, probably due to the increasing expeditions with more sampling. Basic information regarding bathymetric distribution patterns, diversity of species, and community composition is scarce in this group. The geographical distribution remarks on the species in the present study contribute to the better understanding of Antarctic pycnogonid distributions. Pallenopsis kupei is new for Antarctic waters, and six species have not been found previously in the Weddell Sea. Bathymetric patterns of distribution are analyzed in the Weddell Sea showing a difference in the composition between the continental shelf (from 100 to 900 m depth) and the slope (below 900 m). Most of the species are confined to the continental shelf boundaries, whereas the deep sea is dominated by the genus Nymphon. Thus, depth seems to be an influential factor in the structure of pycnogonid assemblages. These findings support the hypothesis that these taxa have evolved and radiated on the shelf and later submerged in the deep sea. The central Bransfield Stratit Basin is dominated by series of isolated volcanoes and associated ridges. Here, the fauna from volcanic structures is analyzed to deduce whether the volcanoes were active or inactive during the sampling period. The most abundant families are Nymphonidae and Colossendeidae, though biomass is much greater for the Colossendeidae. This indicates that colossendeids are probably employing the K-strategy instead of the rstrategy, which is typical for smaller pycnogonids such as nymphonids. The volcanic structures sampled were inactive during 1996, since none of the specimens showed signs of hydrothermal phenomena. This collection is typically representative of the west Antarctic benthic zone. Nymphon australe Hodgson 1902 is the most abundant species of sea spiders in the Southern Ocean. The species is recognized as highly morphologically variable, circumpolar and eurybathic. In this study, we investigate the genetic structure of N. australe populations around Antarctica by using mitochondrial DNA data. Results support the circumpolarity supposed for N. australe, without indication of cryptic speciation. However, the Antarctic Peninsula, the Weddell Sea and the East Antarctica populations of N. australe are effectively isolated, indicating that gene flow is limited. Furthermore, there is some genetic structure among populations within zones. We conclude that N. australe has successfully colonized large parts of the Antarctic marine ecosystem, despite its limited dispersal abilities. The digestive system of sea spiders (Pycnogonida) presents peculiarities that have not been discussed in the context of their ecology or feeding behavior. The digestive system of two Mediterranean species, Ammothella longipes (Hodge 1864) and Endeis spinosa (Montagu 1808), is investigated and the ongoing digestive process observed. Major differences are observed in the proboscis, reflecting adaptation to their diet. The structures of mouth and pharyngeal filter as well as musculature of the proboscis are the main differential elements when comparing A. longipes to E. spinosa. Salivary products play an important role in the oral digestion. The digestive process in sea spiders differs from most marine arthropods mainly because of the absence of midgut gland cells and the presence of a unique multifunctional type of midgut epithelial cell. Epithelial cells are present in a small ‘resting’ form during starvation periods. During digestion, secretory granules are released to the midgut lumen and secondary lysosomes are formed, where digestion occurs. Residual bodies formed within the epithelial cell are released to the midgut lumen to be transported towards the hindgut. Fatty acid analysis has been largely proven to be helpful in determining seasonal trophic links and the feeding behavior in organisms in which diet cannot be inferred from stomach content analyses. Seasonal variations in total fatty acid content (TFA) and fatty acid composition of Ammothella longipes are analyzed to establish its trophic links. The results of this study reveal that A. longipes may change its feeding behavior depending on the season and available food. This pycnogonid species appears as a carnivore during spring and early summer, but it seems to feed on detritus when availability of prey diminishes during winter. Notable high amounts of odd-chain fatty acids are found in summer-autumn for this species, which may come from bacteria acquired from the detritical diet or from de novo biosynthesis from propionate. TFA content of A. longipes did not present seasonal variations. This is in accordance to its reproductive activity, which occurs throughout the year except from May to July, period in which they adopt a carnivory diet.
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Spatial analysis of Aujeszky's disease eradication in Catalonia, Spain

Allepuz Palau, Alberto 28 July 2008 (has links)
El programa d'eradicació de la malaltia d'Aujeszky va començar a Espanya l'any 1995, però no va ser fins el 2003, quan a causa de les garanties suplementàries establertes en els intercanvis intracomunitaris de l'espècie porcina amb relació a la malaltia d'Aujeszky, que aquest programa es va reforçar i es varen establir les bases del programa coordinat de lluita, control i eradicació de la malaltia. L'objectiu d'aquest estudi és realitzar una anàlisi espacial de l'eradicació de la malaltia d'Aujeszky a Catalunya (Espanya) des del 2003 fins el 2007. L'estudi s'ha dividit en quatre períodes, en base a les diferents etapes establertes al programa d'eradicació a Catalunya. A la primera part de l'estudi, varem analitzar si la distribució espacial de la malaltia d'Aujeszky a Catalunya ha estat homogènia o hi han hagut zones d'alt risc (conglomerats) durant les diferents etapes del programa d'eradicació. Per fer-ho, en cada període varem realitzar diferents anàlisis espacials amb el programa SaTScan v6.1 basats en el model de Bernoulli. En els quatre períodes d'estudi, varem identificar conglomerats de granges positives de truges (cicle obert i cicle tancat) i/o de granges positives d'engreixos, tant a l'oest com al centre com a l'est de Catalunya. Com que el risc d'infecció va disminuir més ràpidament fora dels conglomerats que dintre, els valors del ràtio de prevalença d'aquests conglomerats augmenten al llarg del temps. Per analitzar l'evolució de la malaltia, varem estudiar si hi havia àrees en les que la proporció de granges que s'havien reinfectat o que havien eliminat la infecció era més gran. Aquestes anàlisis van demostrar que hi havia zones en les que la proporció de granges que havien eliminat la infecció era més alta, i per tant que l'eradicació de la malaltia té també un component espacial. En els quatre períodes d'estudi, també es van detectar àrees en les que la proporció de granges reinfectades havia estat més alta. El risc relatiu d'aquests conglomerats era més gran que el dels conglomerats descrits abans. D'altra banda, existeix una associació geogràfica entre els conglomerats de granges de mares positives, granges d'engreix positives i granges de mares reinfectades. Aquesta associació podria ser deguda a la transmissió a nivell local del virus d'Aujeszky. Ja que la densitat de granges a una zona podria ser un factor relacionat amb aquesta transmissió local, varem analitzar aquesta variable en conglomerats d'eradicació i de reinfeccions. La densitat mitjana de granges de porc als conglomerats d'eradicació és de 0.4 granges per quilòmetre quadrat (mitjana de 0.28 i desviació estàndard de 0.33) i de 1.51 (mitjana de 0.7 i desviació estàndard de 1.61) als conglomerats on més granges de truges s'han reinfectat (valor de p<0.05). En base a aquests resultats, a la segona part de l'estudi varem analitzar el paper que podien exercir factors geogràfics en la transmissió a nivell local del virus i en la persistència de la malaltia d'Aujeszky a determinades zones. Per fer-ho, varem usar un model jeràrquic bayesià, en el que varem incloure diferents variables geogràfiques que podien estar implicades en la transmissió a nivell local del virus; com són la distància a l'escorxador més proper, distància a la carretera més pròxima, nombre d'animals d'engreix positius pròxims a la granja (radi de 750 metres) i nombre de truges positives pròximes a la granja (radi de 750 metres). Al model també varem incloure una altra variable no geogràfica: tipus de granja (cicle obert o cicle tancat). L'ús d'aquests models jeràrquics bayesians permet d'incorporar un terme que té en compte la dependència espacial (autocorrelació) existent a les dades. La dependència espacial va ser inclosa al model mitjançant una distribució normal condicionalment autoregressiva (CAR) basada en un nombre de veïns. Aquests veïns van ser definits com aquelles granges localitzades en un radi de 500 metres de cada granja de truges. De les quatre variables geogràfiques incloses al model, només la presència d'animals d'engreix positius presents a la proximitat d'una granja de truges incrementava la probabilitat d'infecció pel virus d'Aujeszky. Al primer període, per cada 1000 porcs d'engreix al voltant de cada granja de mares, l'odds (raó de probabilitats) de cada granja d'ésser positiva s'incrementava per un factor entre 1.005 i 1.36. En el període 2.2, tenir porcs d'engreix al voltant augmentava la raó de probabilitats d'infecció per un valor d'entre 1.84 i 3.22. En el període 2.1 i en el període 3, cap de les variables va influir de forma significativa en la probabilitat de ser una granja positiva. El tipus de granja (cicle obert o cicle tancat) tampoc es va relacionar amb la probabilitat de ser una granja positiva en cap dels períodes de l'estudi. El patró geogràfic dels residus (observats versus predits) del model binomial jeràrquic bayesià va ser molt similar al dels observats, en tots els períodes de l'estudi. Aquest resultat evidencia que la transmissió a nivell local del virus d'Aujeszky probablement no hagi estat el principal factor relacionat amb la persistència del virus en granges de truges. Altres factors, específics de cada granja, probablement han tingut una relació més alta en la probabilitat d'infecció que les variables geogràfiques incloses en aquesta anàlisi. / El programa de erradicación de la enfermedad de Aujeszky comenzó en España en 1995, pero no fue hasta el 2003, cuando debido a las garantías suplementarias establecidas en los intercambios intracomunitarios de la especie porcina en relación a la enfermedad de Aujeszky, que dicho programa se reforzó y se establecieron las bases del programa coordinado de lucha, control y erradicación de la enfermedad. El objetivo de este estudio es realizar un análisis espacial de la erradicación de la enfermedad de Aujeszky en Cataluña (España) desde el 2003 hasta el 2007. El estudio se ha dividido en cuatro periodos, en base a las diferentes etapas establecidas en el programa de erradicación en Cataluña. En la primera parte del estudio, analizamos si la distribución espacial de la enfermedad de Aujeszky en Cataluña ha sido homogénea o han existido zonas de alto riesgo (conglomerados) durante las distintas etapas del programa de erradicación. Para ello, en cada periodo realizamos diferentes análisis espaciales con el programa SaTScan® v6.1 basados en el modelo de Bernoulli. En los cuatro periodos de estudio, identificamos conglomerados de granjas positivas de cerdas (ciclo abierto y ciclo cerrado) y/o de granjas positivas de engordes, tanto en la parte oeste como en el centro y este de Cataluña. Debido a que el riesgo de infección disminuyó más rápido fuera de los conglomerados que dentro, los valores del ratio de prevalencia de estos conglomerados aumentaron a lo largo del tiempo. Para analizar la evolución de la enfermedad, estudiamos si había áreas en las que la proporción de granjas que se habían reinfectado o que habían eliminado la infección era mayor. Estos análisis demostraron que había zonas en las que la proporción de granjas que habían eliminado la infección era más alta, y por lo tanto que la erradicación de la enfermedad tiene también un componente espacial. En los cuatro periodos de estudio, también se detectaron áreas en las que la proporción de granjas reinfectadas fue más alta. El riesgo relativo de estos conglomerados era mayor que el de los otros análisis de conglomerados. Por otro lado, existía una asociación geográfica entre los conglomerados de granjas de madres positivas, granjas de engorde positivas y granjas de madres reinfectadas. Esta asociación podría ser debida a la transmisión a nivel local del virus de Aujeszky. Ya que la densidad de granjas en una zona podría ser un factor relacionado con esta transmisión local, analizamos esta variable en conglomerados de erradicación y de reinfecciones. La densidad media de granjas de porcino en los conglomerados de erradicación fue de 0.4 granjas por kilómetro cuadrado (mediana de 0.28 y desviación estándar de 0.33) y de 1.51 (mediana de 0.7 y desviación estándar de 1.61) en los conglomerados donde más granjas de cerdas se habían reinfectado (valor de p<0.05). En base a estos resultados, en la segunda parte del estudio analizamos el papel que podían desempeñar factores geográficos en la transmisión a nivel local del virus y en la persistencia de la enfermedad de Aujeszky en determinadas zonas. Para ello, usamos un modelo jerárquico bayesiano y en él incluimos diferentes variables geográficas que podían estar implicadas en la transmisión a nivel local del virus; como son la distancia al matadero más cercano, distancia a la carretera más próxima, número de animals de engorde positivos próximos a la granja (radio de 750 metros) y número de cerdas positivas próximas a la granja (radio de 750 metros). En el modelo también incluimos otra variable no geográfica: tipo de granja (ciclo abierto o ciclo cerrado). El uso de estos modelos jerárquicos bayesianos permite incorporar un término que tiene en cuenta la dependencia espacial (autocorrelación) existente en los datos. La dependencia espacial fue incluida en el modelo mediante una distribución normal condicionalmente autoregresiva (CAR) basada en un número de vecinos. Dichos vecinos fueron definidos como aquellas granjas localizadas en un radio de 500 metros de cada granja de cerdas. De las cuatro variables geográficas incluidas en el modelo, sólo la presencia de animales de engorde positivos presentes en la proximidad de una granja de cerdas incrementaba la probabilidad de infección por el virus de Aujeszky. En el primer periodo, por cada 1000 cerdos de engorde en la vecindad de cada granja de madres, el odds (razón de probabilidades) de ser positiva de cada granja se incrementaba por un factor entre 1.005 y 1.36. En el periodo 2.2, tener cerdos de engorde en la vecindad aumentaba la razón de probabilidades de infección por un valor entre 1.84 y 3.22. En el periodo 2.1 y en el periodo 3, ninguna de las variables influyó de forma significativa en la probabilidad de ser una granja positiva. El tipo de granja (ciclo abierto o ciclo cerrado) tampoco se relacionó con la probabilidad de ser una granja positiva en ninguno de los periodos del estudio. El patrón geográfico de los residuos (observados versus predichos) del modelo binomial jerárquico bayesiano fue muy similar al de los observados, en todos los periodos del estudio. Este resultado evidencia que la transmisión a nivel local del virus de Aujeszky probablemente no haya sido el principal factor relacionado con la persistencia del virus en granjas de cerdas. Otros factores, específicos de cada granja, probablemente tengan una relación más alta en la probabilidad de infección que las variables geográficas incluidas en este análisis. / Aujeszky's disease (AD) eradication programme started in Spain in 1995, but it was not until 2003, due to the additional guarantees in intra-community trade relating to Aujeszky's, that AD eradication programme was adapted and ensured. The aim of this study is to conduct a spatial analysis of the Aujeszky's disease (AD) eradication programme in Catalonia, Spain, from 2003 to 2007. The study has been divided in four periods, based on the phases designed in the AD eradication programme in Catalonia. In the first part of the study, we explore for high risk areas (clusters) in order to test whether the spatial distribution of AD in the region during the consecutive eradication periods was homogeneously distributed over the territory or clustered in space. Different purely spatial analyses, based on the Bernoulli model, were run with SaTScan® v6.1 in each period. Clusters of positive sow farms (farrow to weaning and farrow to finish) and/or fattening farms were identified in the four study periods in the western, central and north eastern part of the region. The prevalence ratio values of these clusters increased throughout the study period due to the fact that the risk of disease decreased faster outside the clusters than inside the clusters. In order to study the evolution of the disease, we explored for areas where more negative sow farms became infected and areas where more sow farms eliminated the infection. These analyses demonstrated areas with significantly higher proportions of sow farms that became negative, which indicates that the eradication of the disease has a spatial component. Clusters of negative sow farms that were infected again (reinfections) were also detected in the four study periods. The relative risk values of these clusters were much higher compared to the other cluster analyses. There was a geographical association between the clusters of positive sow farms, positive fattening farms and re-infected sow farms. This association could be attributable to the local spread of Aujeszky´s disease virus. Pig farm density could be a factor influencing the local spread of infection and was therefore evaluated for clusters of re-infected sow farms and clusters of sow farms that eliminated the infection. The mean density of pig farms was 0.40 farms per square Km (median of 0.28 and standard deviation of 0.33) in clusters of sow farms that became negative and 1.51 (median of 0.70 and standard deviation of 1.61) in clusters where more sow farms became positive (p-value<0.05). Based on these results, in the second part of the study, we tested the role of geographical factors that could be implicated in local spread and persistence of AD in certain areas. Several geographic variables describing the possible risk factors associated to neighbourhood transmission: Distance to the nearest slaughterhouse, distance to conventional roads, mean number of AD serological positive sows and serological positive fattening pigs in the neighbourhood (750 meters radius) of each sow farm were included in a hierarchical Bayesian binomial model. A non geographic variable; type of farm (farrow to weaning versus farrow to finish) was also included. The use of Bayesian models allowed us to take into account the spatial dependence (autocorrelation) among the data; included in the model as a random effect. Spatial dependence was parameterised with a conditional autoregressive distribution (CAR) based on a set of neighbours. The set of neighbours was defined as those farms located in a 500 meters buffer radius around each sow farm. From the four geographical variables included in the model, only positive fattening animals in the neighbourhood of sow farms increased the probability of being AD positive. In the first period, 1,000 positive fattening pigs in the neighbourhood (750 meters buffer radius) increase the odds of each sow farm being AD positive by a factor between 1.005 and 1.36. In period 2.2, having positive fattening animals in the neighbourhood increased the likelihood of each sow farm to be AD positive between 1.84 and 3.22. In period 2.1 and period 3, none of the variables had a positive relation with the probability of being positive. The type of farm (farrow to weaning or farrow to finish) also did not influence the probability of being AD positive in any period. The geographical pattern of the residuals of the hierarchical bayesian binomial model (observed versus predicted) was very similar to the observed infection in sow farms in all the eradication periods, showing that neighbourhood transmission might not be the main factor related to the eradication of Aujeszky-s disease in sow farms. Other herd¬specific risk factors might be much more related to the probability of AD infection than the geographical variables included in this study.
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Estudio de las relaciones tróficas de algunos peces bentónicos de interés comercial del golfo de Valencia (Mediterraneo Occidental)

Morte Segura, Mª Salome 19 September 2001 (has links)
No description available.
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Molecular characterisation of the underlying mechanisms of pathogen-associated molecular pattern (PAMP) recognition in fish

Boltaña Harms, Sebastian 06 June 2011 (has links)
La respuesta inmune innata es basada en la activación de receptores genotípicamente codificados, llamados receptores de reconocimiento de patógenos (PRR). Los PRR pueden ser proteínas solubles tal como las proteínas plasmáticas PGRPs o pueden estar anclados en las membranas celulares como los TLR. Estos receptores son capaces de reconocer a los patógenos o a sus patrones moleculares (PAMPs). La interacción PAMP-PRR provoca la activación de genes diana y promueve la producción de mediadores pro- e inflamatorios. El principal objetivo de esta tesis doctoral fue la caracterización de las respuestas de macrófagos de la trucha arcoíris Oncorhynchus mykiss, y de la dorada tratados con diferentes PAMPs y la subsecuente exploración de cambios en la expresión de genes relacionados con la respuesta inmune así como cambios globales en la respuesta transcriptómica de los macrófagos. Un objetivo especifico de este estudio fue registrar los cambios en los macrófagos activados hacia un fenotipo inflamatorio después de tratamientos con lipopolisacarido (LPS) crudo de bacterias Gram negativas, enfatizando que el peptidoglicano (PGN) es un contaminante encontrado en las preparaciones crudas de LPS. PGN es capaz de inducir la expresión de mRNA de IL-1β y IL-6 e inducir la liberación de productos inflamatorios como prostaglandinas. Los análisis de microarray fueron hechos para describir la concentración y la dependencia en el tiempo de las modulaciones transcriptómicas en los macrófagos de trucha y dorada tratados con PGN o LPS. En el caso de dorada, se diseño y valido un microarray de oligonucleótidos. Los resultados revelaron la sobre-regulación de transcritos específicos que están cercanamente relacionados con la síntesis de prostaglandinas y las vías de señalización activadas a partir de TLR. Así, el reconocimiento de PGN en peces resulta del reconocimiento de mecanismos específicos que no incluyen TLR pero si otros grupos de receptores como PGRPs o NODs. Estos mecanismos parecen ser conservados en la respuesta de defensa innata a lo largo del grupo de los vertebrados. / The innate immune response is based upon the activation of a restricted number of genotypic encoded receptors, the pathogen recognition receptors (PRRs). PRRs can be soluble proteins such as plasmatic PGRPs or cell membraneanchored TLRs able to recognize pathogens or their pathogen-associated molecular patterns (PAMPs). PAMP-PRR interaction results in the activation of target genes and promotes the production of pro- and inflammatory mediators. The main goal of this dissertation was to characterise the responses of rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, and gilthead seabream, Sparus aurata, macrophages treated with different PAMPs and to explore subsequent changes in the expression of immune related genes or global shifts in the macrophage transcriptome. A specific goal of this study was to register changes in macrophages activated toward an inflammatory phenotype after treatments with crude gram negative bacterial lipopolysaccharide (LPS) preparations, highlighting that peptidoglycan (PGN) is a contaminant within crude LPS. PGN is able to induce the mRNA expression of IL- 1β and IL-6 and release inflammatory products such as prostaglandins. Microarray analyses were made to describe concentration and time-dependent transcriptional modulations both in trout and seabream macrophages treated with PGN or LPS. In the case of sea bream, a specific oligonucleotide microarray was designed and validated for these studies. Results reveal up-regulation of specific mRNA transcripts that are closely related to prostaglandin synthesis and TLR signalling pathways. Thus PGN recognition in fish is a result of recognition mechanisms including non-TLR PRRs such as PGRPs and NODs. These mechanisms appear to be conserved throughout the vertebrate innate immune response.

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