Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Química. / Made available in DSpace on 2012-10-20T19:07:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O desenvolvimento de reagentes que promovem eficiente clivagem no DNA constitui um desafio na atualidade devido à sua aplicação potencial para o desenvolvimento de novas nucleases, para a utilização como agentes terapêuticos e ferramentas úteis em toda a biologia molecular. Este trabalho inclui o estudo de nove compostos que foram capazes de clivar o DNA através de um possível mecanismo hidrolítico. Os compostos [Fe2III(BPClNOL)2(H2O)2](ClO4)2 (1), [Fe2III(BPClNOL)2(SO4)]×H2O (2), [Cu2(H2bbppnol)OAc(H2O)2]Cl2×2H2O (3), [Cu2(Hbtppnol)(OAc)](ClO4)2 (4), [Cu(HISMIMI)Cl2] (5), [Cu(HISMIMA)Cl2] (6), 1,3-bis(p-carboxifenil)triazeno (7), 1-(p-carboxifenil)-3-(p-amidofenil)triazeno (8) e 3-(p-carboxifenil)-1-feniltriazeno 1-óxido (9), foram capazes de clivar o DNA plasmidial ou genômico de mexilhão (gDNA). O trabalho faz uso de várias técnicas experimentais como a eletroforese em gel de agarose, espectroscopia eletrônica, voltametria cíclica, etc, utilizando-se condições definidas de pH, temperatura, concentração do composto e tipos de DNA e tampões.

Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Curso de Pós-Graduação em Química / Made available in DSpace on 2012-10-20T04:36:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-26T02:19:42Z : No. of bitstreams: 1 182719.pdf: 15388804 bytes, checksum: 53f1af18379a28dfe939b59efb2f56c7 (MD5) / Neste trabalho analisou-se a atividade de clivagem do complexo metálico [Cu (C21H21N3O2)(OH2)2] ( CuMFF ) sobre o B-DNA dupla fita e circular. A clivagem do DNA mostrou-se ser dependente da temperatura, pH, força iônica e concentração deste complexo. A adição de captadores de radicais livres não alterou a fração de clivagem sobre o DNA exercida por CuMFF o que indica que possivelmente radicais livres difusos não estão envolvidos no processo de clivagem. Não houve alteração da banda a 408 nm exibida por CuMFF com a adição de DNA plasmidial o que nos leva a supor que CuMFF não é um complexo metálico que intercala na dupla hélice de DNA. Estudou-se a reação de clivagem usando-se excesso de CuMFF e então parâmetros cinéticos para a degradação do DNA foram estabelecidos. Nos experimentos de sequênciamento utilizando-se uma modificação do método de Sanger os resultados nos levam a concluir que CuMFF não exibe um padrão de clivagem específico e que portanto este reage de forma aparentemente randômica sobre a dupla hélice de DNA.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-20T17:57:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 191341.pdf: 1032344 bytes, checksum: 181147078a68df06b4226956b74fa506 (MD5) / O presente trabalho apresenta os resultados referentes à otimização de um protocolo para a extração de DNA a partir de acículas de plantas adultas de Araucaria angustifolia e critérios para o armazenamento e conservação do material vegetal, além da otimização e adaptação de protocolos para as técnicas RAPD e AFLP, bem como o teste de transferibilidade de iniciadores para marcadores microssatélites de Pinus sp para A. angustifolia. A capacidade informativa destes marcadores para análise da diversidade genética de A. angustifolia foi testada em uma população natural do Parque Ecológico Municipal de Lages/SC, a qual já havia sido estudada com marcadores isoenzimáticos e RFLP-PCR. Observou-se que o acondicionamento e armazenamento das acículas é um fator crucial para a qualidade do DNA extraído. A quantidade de DNA obtido nas extrações variou entre 66 a 400 mg por grama de tecido, com um valor médio de 147,3 mg para os materiais acondicionados em sílica gel. Materiais acondicionados em caixas térmicas com gelo resultaram em DNA com qualidade inferior, com uma média de 137,3 mg. Materiais armazenados por até três meses a -20°C resultaram em menor quantidade de DNA, com qualidade inferior. O protocolo otimizado resultou em DNA com baixa contaminação por proteínas, com razão OD260/OD280 entre 1,7 e 2,0 em 80% das amostras analisadas. Com o protocolo otimizado para a técnica RAPD, 10% dos iniciadores utilizados revelaram polimorfismo quando testados em indivíduos de duas populações, todavia, apenas 7,5% revelaram polimorfismo quando somente a população de Lages foi analisada. Os seis iniciadores utilizados revelaram 18 bandas polimórficas. O protocolo adaptado para a técnica AFLP possibilitou um número variável de bandas polimórficas, entre nenhuma e 29 bandas, dependendo da combinação de iniciadores utilizada. Dentre 29 iniciadores para marcadores microssatélites testados, somente dois geraram produtos amplificados em A. angustifolia, sem, no entanto serem utilizados para a análise da diversidade genética da população, devido à característica das bandas. A análise da diversidade genética da população foi realizada a partir de 18 marcadores RAPD, 62 marcadores AFLP e com os 80 marcadores agrupados. A diversidade genética estimada pelo índice de Shannon foi de 0,53, 0,54 e 0,54, respectivamente. Os dendogramas de similaridade genética gerados também apresentaram grande coerência entre as três situações testadas. O nível de diversidade genética estimado com esses marcadores foi superior àquele obtido com marcadores isoenzimáticos e RFLP-PCR utilizados anteriormente por outros pesquisadores. Os resultados obtidos neste trabalho levam à conclusão que o armazenamento das folhas e o processo de extração do DNA são cruciais para o sucesso de estudos utilizando marcadores baseados na análise direta do DNA e confirmam a hipótese de que marcadores RAPD e AFLP são poderosas ferramentas para estudos genéticos em A. angustifolia, devido à sua capacidade de acessar aleatoriamente, amplas regiões genômicas. Já o baixo nível de transferibilidade de iniciadores microssatélites deve-se, provavelmente, à grande distância taxonômica entre as espécies utilizadas no estudo, caracterizando a necessidade do desenvolvimento de iniciadores para regiões microssatélites específicos para A. angustifolia.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-25T22:54:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 289615.pdf: 1626236 bytes, checksum: eb5909cc2286b014f8dbbb39bc279d05 (MD5) / Neste trabalho de dissertação foram sintetizados e caracterizados quatro complexos mononucleares de cobre (II), [Cu(bpma)dppz](ClO4)2.0,67H2O (1), [Cu(acac)dppz](ClO4) (2), [Cu(AAZ)dpq](ClO4)2.H2O (3), [Cu(dppz)tenoilCF3(CH3CN)].ClO4 (4). Os ligantes utilizados foram o acetilacetonato (acac), N-bis-(2- piridilmetil) amina (bpma), dipirido[3,2-f:2',3'-h]quinoxalina (dpq), dipirido[3,2-a:2',3'-c]fenazina monohidratado (dppz) e o tenoiltrifluoroacetonato (tenoilcf3). Os quatro complexos foram caracterizados através de medidas espectroscópicas (IV e UV-Vis), de condutividade e eletroquímicas (voltametria cíclica). As estruturas cristalinas inéditas foram resolvidas por difratometria de raios X. A avaliação da interação entre os quatro complexos e o CT-DNA foi realizada através de experimentos distintos. A titulação espectrofotométrica UV-Vis resultou em valores de Kb que demonstram a #boa# interação com o sulco maior do DNA. A titulação por fluorescência resultou em valores de Kapp na ordem de 106, que demonstram a interação dos compostos com DNA. A interação medida por voltametria de onda quadrada converge com os dados demonstrados pelos outros experimentos. A geometria planar dos ligantes dpq e dppz servem de âncora para a interação dos complexos entre os pares de bases do DNA. A atividade de nuclease e fotonuclease dos complexos 1, 2 e 3 foi determinada por experimentos de eletroforese em gel de agarose, para clivagem de DNA plasmidial. Os complexos apresentam bons resultados de clivagem no UV e sob luz visível (vermelha). A clivagem de DNA, com ativação na faixa do UV-A (365 nm) por 5 minutos mostra-se a mais eficaz. A citotoxicidade dos complexos 1, 2 e 3 foi determinada frente a células leucêmicas K562, com a determinação do IC50 de 1,75; 2,3 e 3,2 µmol.L-1 para os compostos, respectivamente. A concentração de cobre intracelular para os complexos 1, 2 e 3 ficou em 45x10-16, 45x10-16 e 153x10-16 mol.cél.-1, respectivamente. / In this study were synthesized and characterized four new mononuclear copper (II) complexes, [Cu(bpma)dppz](ClO4)2.0,67H2O (1), [Cu(acac)dppz](ClO4) (2), [Cu(AAZ)dpq](ClO4)2.H2O (3), [Cu(dppz)thenoylCF3(CH3CN)].ClO4 (4). The ligands used were acetylacetonate (acac), N-bis-(2-pyridilmethyl) amine (bpma), dipyrido[3,2-f:2',3'-h]quinoxaline (dpq), dipyrido[3,2-a:2',3'- c]phenazine monohydrated (dppz) and the thenoyltrifluoroacetonate (thenoylcf3). The four complexes were characterized using spectroscopic measurements (IR and UV-Vis), conductivity and eletrochemical analysis (cyclic voltammetry). The new structures were resolved by X-ray diffraction. Interaction study between the complexes and CT-DNA was made by distinct experiments. The evaluation of interaction among the four complexes and CT-DNA was carried out by different experiments. The spectrophotometric titration in UV-Vis results in values of Kb which shows the good interaction with the major groove of DNA. The fluorescence titration resulted in values of Kapp in order of 106, demonstrating the interaction of compounds with DNA. The interaction measured by square wave voltammetry converges with the presented data by other experiments. The planar geometry of the ligands dpq and dppz act like an anchor for the interaction of complexes between the base pairs of DNA. The nuclease and photonuclease activity of complexes 1, 2 and 3 was determined by agarose gel electrophoresis, for plasmidial DNA cleavage. The complexes show good cleavage results under UV and visible light (red light). The DNA cleavage, with activation in UV-A range (365 nm) by 5 minutes was the more effective. The cytotoxicity of complexes 1, 2 and 3 were determined front leukemic cells K562, with determination of IC50 of 1,75; 2,3 e 3,2 ìmol.L-1 for the compounds, respectively. The intracellular copper concentration for the complexes 1, 2 e 3 was 45x10- 16, 45x10-16 and 153x10-16 mol.cell.-1, respectively.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T02:43:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 293002.pdf: 1217384 bytes, checksum: 6d8835077b7f274cd999a49d15cb016b (MD5) / As algas calcárias do Filo Rhodophyta, apresentam como principal característica a impregnação de carbonato nas paredes celulares, e por este motivo são necessárias técnicas diferenciadas para estudos anatômicos destas algas. Apesar do aprimoramento recente na caracterização do referido grupo, a ausência de um padrão metodológico que se observa nos estudos realizados para este grupo, demonstra que ainda existe demanda por metodologias alternativas que subsidiem a taxonomia do grupo. O uso de ferramentas moleculares é uma alternativa informativa dentro deste contexto, e vem sendo cada vez mais utilizada, aliada a características morfoanatômicas, para determinar a posição sistemática de gêneros, espécies e subespécies. Este trabalho teve por objetivo principal descrever os representantes do gênero Lithophyllum no meso e infralitoral do Sul do Brasil, com base em dados morfoanatômicos aliados a dados moleculares. As análises foram realizadas a partir de espécimes coletados em 5 pontos do litoral do Sul do Brasil. O estudo morfoanatômico foi realizado em microscópio óptico e microscópio eletrônico de varredura. Os estudos moleculares se basearam em sequências de DNA dos marcadores UPA, cox1 e SSU rDNA, sendo que para cada marcador foram geradas análises de Distância e Máxima Parcimônia, e para o último foram realizadas além destas, a análise bayesiana. Através de estudo morfoanatômico comparativo, foram identificadas duas entidades taxonômicas, Lithophyllum margaritae (Hariot) Heydrich, e Lithophyllum sp.1, e os dados moleculares corroboraram com a identificação dos referidos táxons. Os marcadores moleculares UPA e cox1 se mostraram eficientes na separação de entidades taxonômicas de um mesmo gênero, demonstrando serem estes marcadores adequados para utilização como "DNA barcoding". Os dados obtidos neste estudo representam um avanço na taxonomia das algas calcárias não articuladas no Brasil, que pela primeira vez baseou-se em características moleculares aliadas a características morfoanatômicas.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-graduação em Química / Made available in DSpace on 2012-10-23T01:40:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 246307.pdf: 1522841 bytes, checksum: e270e85d281daf546c1840335752a9f5 (MD5) / Complexos biomiméticos do sítio ativo das PAPs foram sintetizados com o objetivo de elucidar o papel das PAPs nos sistemas vivos e simultaneamente encontrar novas aplicações para estes complexos como nucleases sintéticas. Com este intuito, foi testada a atividade de uma série de complexos heterodinucleares Fe3+M2+, usando o ligante assimétrico H2BPBPMP. Os complexos são: FeCuOAc, FeCuOH, FeZnOAc, FeZnOH, FeMnOH e FeNiOAc. O DNA plasmidial foi utilizado como modelo para testar a clivagem da ligação fosfato pelos complexos. Foram testadas diferentes condições de pH e concentração dos complexos. As reações também foram realizadas na presença de captadores de radicais livres e na ausência de oxigênio. Para verificar a interação complexo/DNA foram realizados experimentos com Distamicina e titulação espectrofotométrica UV-Vis. Todos os complexos, exceto FeNiOAc, foram capazes de clivar DNA por um mecanismo hidrolítico em baixas concentrações do complexo (2,5 µM) a 37 oC em pH próximo ao fisiológico (faixa de 6,0 a 7,0). O complexo FeNiOAc não cliva o DNA, mas pode se ligar ao DNA e alterar significativamente sua mobilidade. O complexo FeCuOAc é o mais ativo da série apresentando uma aceleração de 2,71 x 107 vezes quando comparado com o valor do DNA não catalisado, seguido por, FeMnOH, FeZnOAc, FeCuOH e FeZnOH.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Odontologia, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 322030.pdf: 2692251 bytes, checksum: 678de34d08ca2657f572f4b0901b35f8 (MD5) Previous issue date: 2013 / O objetivo desta pesquisa foi avaliar a estrutura da comunidade bacteriana do biofilme de dentes decíduos em pacientes com cárie severa na infância através da análise de PCR-DGGE e verificar a ação de agentes antimicrobianos sobre bactérias prevalentes nesse tipo de lesão. Foram coletadas amostras de biofilme bacteriano provenientes de dentes hígidos (G1), com lesão de cárie de esmalte (G2) e dentina (G3) de 23 crianças entre 1 ? 5 anos de idade. O DNA metagenômico foi extraído pelo o método de CTAB, a qualidade do DNA foi verificada em gel de agarose seguida de eletroforese, e a quantificação e pureza foi determinado espectrofotometricamente. Em seguida, a região V3 do gene rDNA 16S foi amplificada utilizando-se o DNA extraído e os iniciadores universais BA 338fGC e UN518r. A quantidade de amplicons foi analisada por PCR-DGGE utilizando gel de acrilamida:bisacrilamida seguida de eletroforese. A aquisição das imagens foi realizada com fotodocumentador. Foram obtidos 45 amplicons, nos quais foi observado que as estruturas de comunidades bacterianas dos grupos estudados apresentaram diferenças entre os pacientes e entre os grupos de dentes, onde houve um maior numero de amplicons nosdentes do G2 e G3 quando comparados ao G1 (p < 0,05). Para a verificação da ação do gás ozônio e da associação de fluoreto de sódio (NaF) com clorexidina (CHX) contra S.mutans, L. acidophilus e E. faecalis foi utilizado a análise de recuperação de unidades formadoras de colônia (UFC/mL) em placas com ágar (TSA/SB) após o tratamento, e para os testes da associação do NaF e CHX foram verificadas por meio de análise da densidade ótica em placas de microtitulação de 96 poços. Os dados obtidos do tratamento com ozônio foram submetidos aos testes de Wilcoxon (p<0,05), ANOVA e Tukey (p<0,05). Para os dados de NaF-CHX foram aplicados os testes de ANOVA 2-way e Bonferroni (p<0,05). A contagem de UFC/mL demonstrou morte > 3log10 (99,9%) para todas as bactérias em uma aplicação de ozônio = 20ppm para S. mutans e = 200ppm para L. acidophilus e E. faecalis, enquanto que a associação de NaF-CHX foi mais eficaz (p<0,001) em todos as bactérias testadas quando comparado com as análises das substância isoladamente e ao grupo controle. Para este estudo in vitro pode-se concluir que a estrutura da comunidade bacteriana é mais complexa em dentes cariados, e o métodos de PCR-DGGE do gene rDNA 16S foi comprovado por ser uma ferramenta bastante valiosa para diferenciar a composição microbiana do biofilme dental. Todos os agentes antimicrobianos testados foram eficazes no controle do crescimento bacteriano de S. mutans, L. acidophilus e E. faecalis. <br> / Abstract : The objective of this research was to evaluate the structure of bacterial community from biofilms of deciduous teeth in patients with early childhood caries through the analysis of PCR ? DGGE; verify the action of antimicrobial agents on bacteria related. Biofilm samples were collected from intact teeth (G1) , with enamel caries (G2) and dentin caries (G3) of 23 children aged 1-5 years. The metagenomic DNA was extracted by the CTAB method, the quality of the DNA was checked by electrophoresis, while quantification and purity were determined spectrophotometrically. Then, the DNA extracted associated to universal primers (BA 338fGC UN518r) were used to amplify the V3 region of the gene 16S rDNA. The amount of fragments was analyzed by PCR- DGGE using gel Acrylamide : bisacrylamide followed by electrophoresis. A total of forty-five amplicons were obtained, it was observed that the structures of bacterial communities of both groups showed differences between patients and between groups of teeth , where there was a higher number of amplicons in the biofilm of G2 and G3 compared to G1 ( p < 0.05). The method of analyzing recovery colony forming units (CFU / mL ) on agar plates (TSA/SB) was used to test the action ofozone gas and the association of sodium fluoride (NaF) with chlorhexidine (CHX) against S. mutans , L. acidophilus and E. faecalis. The data obtained from the ozone treatment were subjected to Wilcoxon (p< 0.05 ) , ANOVA and Tukey test (p< 0.05 ). For data CHX - NaF -tests were applied to 2 -way ANOVA and Bonferroni (p<0.05). The number of CFU/mL showed death > 3log10 ( 99.9 % ) for all bacteria on an application of ozone = 20ppm for S. mutans and = 200 ppm for L. acidophilus and E. faecalis , while the combination of CHX - NaF was effective (p<0.001) in all the bacteria tested when compared to analysis of substance alone and the control group. For this in vitro study it can be concluded that the bacterial community structure is more complex in decayed teeth, and methods of PCR - DGGE of 16S rDNA gene was proven to be a very valuable tool for differentiating the microbial composition of the biofilm. All antimicrobial agents tested were effective in controlling bacterial growth of S. mutans, L. acidophilus and E. faecalis.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:56:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326598.pdf: 2853679 bytes, checksum: baef196ef4de6a3980796e04b08cac81 (MD5) Previous issue date: 2014 / A influência da segunda esfera de coordenação principalmente na eficiência catalítica de sistemas biológicos, tem sido um importante tema de estudos no contexto da química bioinorgânica. Através de novas estratégias sintéticas, a inserção de agentes intercalantes em ligantes pode ser uma alternativa para potencializar a eficiência de catálise de um complexo. Este trabalho aborda a síntese de dois novos complexos de Cu(II) com ligantes polidentados derivados do núcleo triazínico, utilizando 1,4-diaminobutano como unidade espaçadora e um destes com a unidade pireno como possível agente intercalante do DNA. Ambos foram devidamente caracterizados por técnicas espectroscópicas e eletroquímicas, e estudos cinéticos envolvendo atividade de catecolase dos dois complexos também foram realizados. Os parâmetros cinéticos dos compostos frente a oxidação do substrato modelo 3,5-DTBC mostraram que a inserção do espaçador 1,4-diaminobutano e do grupo pireno contribuiu de forma significativa para o aumento da eficiência catalítica desses sistemas. Na verdade, esses grupos influenciam no aumento de Kass, fazendo com que as interações entre o catalisador e o substrato sejam mais efetivas quando comparadas com o sistema no qual esses grupos estão ausentes. Testes preliminares em DNA plasmidial revelaram que ambos complexos, em baixas concentrações, são capazes de clivar a dupla fita até sua forma III, ou seja, sua forma totalmente linear. Sendo assim, estes complexos podem ser considerados não só como bons modelos miméticos para a enzima catecol oxidase, mas também como agentes de clivagem do DNA plasmidial.<br> / Abstract : The influence of the second coordination sphere on the catalytic efficiency of biological systems has been an important subject of studies in bioinorganic chemistry. By means of new synthetic strategies, the insertion of intercalating agents linked to polydentate ligands represents an interesting alternative to enhance the catalytic efficiency of a biomimetic complex. The work presented here focuses on the synthesis of two new Cu(II) complexes with polydentate ligands derived from a triazine core containing 1,4-diaminobutane as a spacer and a pyrene group as a possible DNA intercalating agent. The complexes were characterized by spectroscopic and electrochemical techniques, and catecholase-like activity of both were also carried out. The kinetic parameters of the complexes in the oxidation of the model substrate 3,5-DTBC revealed that insertion of the spacer 1,4-diaminobutane and the pyrene group, strongly contributed to increase the catalytic efficiency of these systems. In fact Kass becomes significantly increased, indicating that these groups influence the interactions between the complex and the substrate, which are much more effective when compared do the catalyst without such groups. Preliminary studies showed that both complexes, at very low concentrations, are capable of cleaving double-stranded plasmid DNA into its form II (circular) and form III (linear). Thus, these complexes can be considered good biomimetic models for catechol oxidase, and also as plasmid DNA cleavage agents.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:15:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 324079.pdf: 3716544 bytes, checksum: c964ef763956b148f2f6d8aef7544c11 (MD5) Previous issue date: 2013 / Agentes que possam interagir e/ou clivar a molécula de DNA possuem uma grande importância devido a sua potencial aplicação antitumoral ou ainda como antibióticos. Vários compostos de coordenação clivam o DNA de forma oxidativa. Porém este mecanismo de clivagem possui uma grande desvantagem por afetar as biomoléculas de forma indiscriminada e aleatória, o que é indesejável em aplicações bioquímicas ou mesmo em estudos de interação com DNA.Desta forma é absolutamente necessário nestes estudos o desenvolvimento de compostos que possam clivar o DNA através de um mecanismo hidrolítico. Algumas metalonucleases naturais fazem uso de íons metálicos em seus sítios ativos de modo a se beneficiar das características desses metais. Dentre elas podem-se destacar a acidez de Lewis que pode ser usada na ativação do átomo de fósforo bem como na formação de um nucleófilo em condições de pH fisiológico. No caso de nucleases binucleares os centros metálicos podem atuar na orientação do nucleófillo em relação ao substrato de modo a facilitar a hidrólise da ligação fósforo-diester.Inspirados nestas metalonucleases vários complexos modelo foram desenvolvidos visando a clivagem hidrolítica do DNA, porém em sua maioria não possuem seletividade quanto ao sítio de clivagem, sendo o grande desafio atual o aumento da seletividade de interação compexo-DNA. Uma estratégia que vem sendo utilizada é a inserção de grupos intercalantes, que interagem com o sulco maior ou menor do DNA. Estes grupos serviriam então como direcionadores, o que pode gerar um grande aumento da atividade de clivagem, bem como na seletividade.Considerando o exposto, o objetivo principal deste trabalho é sintetizar e caracterizar novos ligantes contendo grupos intercalantes e seus complexos metálicos (sistemas conjugados) que apresentem as características requeridas para o estudo de interação e clivagem eficiente de ácidos nucléicos.<br> / Abstract : Agents that can interact and / or cleave the DNA molecule have a great importance due to their potential application as antibiotics or antitumor drugs. Several coordination compounds cleave DNA oxidatively. However, this cleaving mechanism has a great disadvantage because it affects the biomolecules indiscriminately and random, which is undesirable in applications or even biochemical studies of interaction with DNA.Thus, it is necessary in these studies to develop compounds that can cleave DNA by a hydrolytic mechanism. Some natural metallonucleases make use of metal ions in their active sites in order to benefit from the characteristics of these metals. Among them we can emphasize the Lewis acidity which can be used in activating the phosphorus atom as well as the formation of a nucleophile under conditions of physiological pH. In the case of the binuclear metal centers nucleases can act in nuclephile orientation relative to the substrate in order to facilitate hydrolysis of the phosphorus-diester.Inspired in these metallonucleases, various biommimetic models were developed to hydrolytic cleavage of DNA, but mostly lack selectivity regarding cleavage site, and the current challenge increased selectivity complex-DNA interaction. One strategy that has been used is the insertion of intercalating groups that interact with the major or minor groove of DNA. These groups then serve as drivers, which can generate a large increase in cleavage activity and selectivity.Considering the above, the main objective of this work is to synthesize and characterize new ligands containing intercalating groups and their metal complexes (conjugated systems) having the characteristics required for the study of interaction and efficient cleavage of nucleic acids.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa catarina, Centro de Ciências Biológiocas. Programa de Pós-graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-21T14:39:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Drogas ou moléculas que interagem com DNA e RNA, especialmente aquelas capazes de clivar ácidos nucléicos, têm sido alvo de grande interesse por servir como ferramentas em biologia molecular, bioquímica e terapêutica. Nucleases químicas são compostos sintéticos que mimetizam a ação de nucleases enzimáticas naturais e podem ser utilizadas como uma alternativa em processos bioquímicos e biotecnológicos com algumas vantagens, tais como menor tamanho, o que lhes permite ação em regiões de macromoléculas inacessíveis a enzimas, e pelo fato de que sua especificidade e eficiência podem ser moduladas. O ligante macrocíclico poliaza 3,6,9,17,10,23-hexaazatriciclo[23.3.1.111,15]triaconta-1(29),11-(30),12.14,2S(26),27-hexaeno (BMXD) foi produzido pela primeira vez em 1990. Consiste de um macrociclo formado por duas porções dietilenotriamina separadas por duas pontes fenol, capaz de coordenar um ou dois centros Cu(II) pelas porções dietilenotriamina. Foi demonstrado previamente que o ligante BMXD apresenta afinidade por ATP e é capaz de promover sua conversão em ADP e ortofosfato através de uma reação oxidativa. Coordenando um ou dois centros de zinco, o ligante BMXD é capaz de se ligar a maleato, pirofosfato e melanina e é capaz de promover a clivagem hidrolítica de BNP. É demonstrado, no presente trabalho, que o complexo Cu2BMXD é capaz de promover a clivagem oxidativa de DNA, convertendo DNA plasmidial superenovelado em DNA plasmidial circular aberto com uma velocidade de 4,67 x 10-2h-1 a 50°C em pH 7,0.