Fruit ripening is a highly coordinated process involving numerous structural, biochemical and physiological changes, many of which are influenced by both endogenous and environmental stimuli. Light signaling and plant hormones such as ethylene and auxins have been identified as important regulators of tomato fruit ripening. However, it is still not fully understood how light and hormonal signaling cascades interact to control the development and physiology of fleshy fruits. By applying a mutant-based approach, this study investigated the potential interconnection among light, auxin and ethylene signaling cascades during tomato fruit ripening and carotenogenesis. Analysis of ethylene and auxin metabolism and signaling in ripening fruits of the light-hyperresponsive high-pigment 2 (hp2) mutant revealed that the loss of HP2 function promotes the transcription of genes encoding key regulators of fruit ripening and increases ethylene signaling along with the increments in carotenoid synthesis and accumulation typically found in this mutant. Compared to the wild type (WT), significant changes in fruit auxin signaling were also observed in the hp2 mutant, including significantly higher activation of the auxin-responsive promoter DR5, severe down-regulation of all AUXIN/INDOLE-3-ACETIC ACID (Aux/IAA) genes more closely associated with fruit ripening as well as disturbed transcript abundance of genes encoding AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF) transcription factors. Evidence of increased tissue responsivity to ethylene and auxins in hp2 ripening fruits is also provided. Moreover, comparing the auxin and ethylene metabolism and signaling in fruits of the phytochrome chromophore-deficient mutant aurea (au) in relation to the WT genotype provided new insights into the phytochrome-hormonal signaling crosstalk regulating the timing of fruit ripening. Compared to the WT, fruits of the au mutant exhibited a delayed-ripening phenotype, which was associated with the late induction of genes encoding master controllers of ripening, delayed ethylene climacteric production as well as coordinated changes in the expression of auxin signaling-related genes. Besides the temporal changes in hormonal signaling associated with ripening, the deficiency in functional phytochromes also seems to repress the cyclization of lycopene, leading to reduced levels of ?-carotene and lutein in the fruit tissues. Although the exact molecular mechanisms behind the altered hormonal responses in tomato fruits triggered by changes in light signaling remain to be further elucidated, the data obtained in this study provide clear evidence that an intricate crosstalk among light, ethylene and auxin signaling may be involved in controlling tomato fruit ripening and carotenogenesis. Therefore, these findings open up a window of opportunity for further improvement in the regulation of ripening-associated processes through the combined manipulation of hormonal and light signaling-related genes / O amadurecimento de frutos é um processo altamente regulado que envolve várias mudanças estruturais, bioquímicas e fisiológicas, muitas das quais são influenciadas tanto por fatores endógenos quanto ambientais. O sinal luminoso, bem como os hormônios vegetais etileno e auxina têm se revelado importantes reguladores do amadurecimento de frutos. Porém, ainda não está totalmente esclarecido como as cascatas de sinalização luminosa e hormonal interagem a fim de controlar o desenvolvimento e a fisiologia dos frutos carnosos. O presente estudo teve como objetivo analisar as interações entre as cascatas de sinalização da luz, do etileno e das auxinas durante o amadurecimento e carotenogênese em frutos de tomateiro por meio do uso de mutantes fotomorfogênicos dessa espécie. As análises do metabolismo e sinalização do etileno e das auxinas em frutos do mutante high-pigment 2 (hp2), o qual apresenta respostas exageradas à luz, revelaram que a perda da função do gene HP2 resultou no aumento dos níveis de transcritos de genes que codificam os reguladores-chaves do processo de amadurecimento bem como um incremento na sinalização do etileno, sendo que essas mudanças estiveram atreladas ao maior acúmulo de carotenoides tipicamente encontrados neste mutante. Comparado ao genótipo selvagem, frutos do mutante hp2 também apresentaram uma elevação considerável na sinalização das auxinas, incluindo incrementos na ativação do promotor DR5, regulação negativa da maioria dos genes AUXIN/INDOLE-3-ACETIC ACID (Aux/IAA) envolvidos no amadurecimento do tomate, bem como alterações na abundância de transcritos dos genes que codificam os fatores de transcrição AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF). Indícios obtidos também sugerem uma maior responsividade dos frutos de hp2 aos hormônios etileno e auxinas. Além disso, as análises do metabolismo e a sinalização das auxinas e do etileno realizadas em frutos do mutante aurea (au), deficiente na síntese do cromóforo dos fitocromos, indicaram que a interação entre esses fotorreceptores e fitormônios influencia o início do amadurecimento dos frutos de tomateiro. Os frutos deste mutante, quando comparados ao selvagem, exibiram um atraso no amadurecimento, o qual se mostrou temporalmente relacionado à indução tardia dos genes que controlam esse processo, ao atraso na produção climatérica do etileno, bem como associado a alterações nos níveis de transcritos de genes-chaves relacionados com a sinalização das auxinas. Além das mudanças temporais na sinalização hormonal associadas ao amadurecimento, os dados obtidos também sugerem que a deficiência em fitocromos funcionais reprime a ciclização do licopeno, levando a níveis reduzidos de ?-caroteno e luteína nos tecidos dos frutos. Embora os mecanismos moleculares responsáveis pelas alterações nas respostas hormonais desencadeadas pela luz ainda precisem ser melhor elucidados em frutos de tomateiro, os dados obtidos neste estudo forneceram evidências de que uma complexa interação entre a sinalização luminosa, do etileno e das auxinas estaria envolvida no controle do amadurecimento e carotenogênese nessa espécie. Portanto, estas descobertas trazem consigo oportunidades de melhoria na regulação de eventos relacionados ao processo de amadurecimento por meio da manipulação combinada de genes relacionados à sinalização luminosa e hormonal

Our knowledge of the factors mediating ethylene-dependent and -independent ripening of climacteric fruit remains limited. Besides the known importance of ethylene roles, auxin has also been emerged as crucial to regulating ripening. Furthermore, the crosstalk between ethylene and auxin in tomato fruit ripening still awaits clarification. ERFs (Ethylene Responsive Factors) are transcription factors belonging to a large family acting downstream on ethylene signaling that direclty regulate ripening-related metabolisms, but their specific roles are still lacking. We present here a comprehensive expression profiling of tomato ERFs in wild-type and tomato ripening-impaired tomato mutants (Nr, rin and nor) indicating that out of the 77 ERFs present in the tomato genome, 27 show enhanced expression at the onset of ripening, while 28 display a ripening-associated decrease in expression, suggesting that different ERFs may have contrasting roles in fruit ripening. Members of subclass E, ERF.E1, ERF.E2 and ERF.E4, show dramatic down-regulation in the ripening mutants suggesting their expression might be instrumental to fruit ripening. The study illustrates the high complexity of the regulatory network interconnecting RIN and ERFs and identifies subclass E members as the most active ERFs in ethylene- and RIN/NOR-dependent ripening. Additionally, with the aim to shed more light into ethylene and auxin interplay, hormonal treatments were applied to tomato fruits and several ripening aspects were then evaluated such as the volatile profile. Overall, results elicited that auxin delay the onset of ripening further showing epistatic effects over the influence of ethylene. Several ripening-related genes, including components of the ethylene signaling, were affected by auxin suggesting potential crosstalk points between the two hormones. Moreover, ethylene appears as potentially part of the auxin regulation through inducing its conjugation. The modulation of hormone levels in tomato fruit throughout ripening can be useful to help designing approaches that both improve fruit quality and extend shelf life. / O conhecimento acerca dos fatores dependentes e independentes de etileno que regulam o amadurecimento de frutos climatéricos é ainda limitado. Além da importância conhecida do etileno, a auxina também tem sido apontada como crucial para o controle do amadurecimento. Mais ainda, há poucos estudos envolvendo o crosstalk entre etileno e auxina em frutos de tomateiro. ERFs (Ethylene Responsive Factors) são fatores de transcrição que atuam nos últimos níveis da via de sinalização de etileno, regulando diretamente metabolismos associados ao amadurecimento. Contudo, seus papéis específicos ainda são desconhecidos. O presente estudo revela o perfil detalhado de expressão de ERFs em tomate selvagem e nos mutantes cujo amadurecimento é comprometido (Nr, rin e nor) indicando que dos 77 ERFs presentes no genoma, 27 apresentam aumento de expressão no início do amadurecimento, enquanto 28 apresentam redução, sugerindo que diferentes ERFs possivelmente têm papéis distintos na regulação do amadurecimento. Membros da subclasse E, ERF.E1, ERF.E2 e ERF.E4, apresentam drástica redução de expressão nos mutantes Nr, rin e nor apontando que tais fatores devem atuar fortemente no amadurecimento. O estudo ilustra também a complexidade das vias de regulação envolvendo RIN e ERFs e ainda aponta os membros da subslasse E como os mais ativos ERFs atuando nas vias etileno-dependentes e RIN/NOR-dependentes. Indo além, com o objetivo de se aprofundar no crosstalk entre etileno e auxina, tratamentos hormonais foram aplicados em frutos de tomateiro e diversos parâmetros do amadurecimento foram avaliados. De uma maneira geral, a auxina retarda o amadurecimento e ainda parece sobrepor os efeitos indutórios do etileno. Genes relacionados ao amadurecimento, incluindo genes relacionados à via de sinalização de etileno, foram afetados pela auxina sugerindo potenciais pontos de crosstalk entre os dois hormônios. O etileno ainda parece regular o metabolismo de auxina no fruto via indução de conjugação pela ativação de GH3s. Compreender o papel dos hormônios no controle da maturação é essencial para o desenvolvimento de tecnologias que visam melhorar a qualidade pós-colheita de frutos.

Our knowledge of the factors mediating ethylene-dependent and -independent ripening of climacteric fruit remains limited. Besides the known importance of ethylene roles, auxin has also been emerged as crucial to regulating ripening. Furthermore, the crosstalk between ethylene and auxin in tomato fruit ripening still awaits clarification. ERFs (Ethylene Responsive Factors) are transcription factors belonging to a large family acting downstream on ethylene signaling that direclty regulate ripening-related metabolisms, but their specific roles are still lacking. We present here a comprehensive expression profiling of tomato ERFs in wild-type and tomato ripening-impaired tomato mutants (Nr, rin and nor) indicating that out of the 77 ERFs present in the tomato genome, 27 show enhanced expression at the onset of ripening, while 28 display a ripening-associated decrease in expression, suggesting that different ERFs may have contrasting roles in fruit ripening. Members of subclass E, ERF.E1, ERF.E2 and ERF.E4, show dramatic down-regulation in the ripening mutants suggesting their expression might be instrumental to fruit ripening. The study illustrates the high complexity of the regulatory network interconnecting RIN and ERFs and identifies subclass E members as the most active ERFs in ethylene- and RIN/NOR-dependent ripening. Additionally, with the aim to shed more light into ethylene and auxin interplay, hormonal treatments were applied to tomato fruits and several ripening aspects were then evaluated such as the volatile profile. Overall, results elicited that auxin delay the onset of ripening further showing epistatic effects over the influence of ethylene. Several ripening-related genes, including components of the ethylene signaling, were affected by auxin suggesting potential crosstalk points between the two hormones. Moreover, ethylene appears as potentially part of the auxin regulation through inducing its conjugation. The modulation of hormone levels in tomato fruit throughout ripening can be useful to help designing approaches that both improve fruit quality and extend shelf life. / O conhecimento acerca dos fatores dependentes e independentes de etileno que regulam o amadurecimento de frutos climatéricos é ainda limitado. Além da importância conhecida do etileno, a auxina também tem sido apontada como crucial para o controle do amadurecimento. Mais ainda, há poucos estudos envolvendo o crosstalk entre etileno e auxina em frutos de tomateiro. ERFs (Ethylene Responsive Factors) são fatores de transcrição que atuam nos últimos níveis da via de sinalização de etileno, regulando diretamente metabolismos associados ao amadurecimento. Contudo, seus papéis específicos ainda são desconhecidos. O presente estudo revela o perfil detalhado de expressão de ERFs em tomate selvagem e nos mutantes cujo amadurecimento é comprometido (Nr, rin e nor) indicando que dos 77 ERFs presentes no genoma, 27 apresentam aumento de expressão no início do amadurecimento, enquanto 28 apresentam redução, sugerindo que diferentes ERFs possivelmente têm papéis distintos na regulação do amadurecimento. Membros da subclasse E, ERF.E1, ERF.E2 e ERF.E4, apresentam drástica redução de expressão nos mutantes Nr, rin e nor apontando que tais fatores devem atuar fortemente no amadurecimento. O estudo ilustra também a complexidade das vias de regulação envolvendo RIN e ERFs e ainda aponta os membros da subslasse E como os mais ativos ERFs atuando nas vias etileno-dependentes e RIN/NOR-dependentes. Indo além, com o objetivo de se aprofundar no crosstalk entre etileno e auxina, tratamentos hormonais foram aplicados em frutos de tomateiro e diversos parâmetros do amadurecimento foram avaliados. De uma maneira geral, a auxina retarda o amadurecimento e ainda parece sobrepor os efeitos indutórios do etileno. Genes relacionados ao amadurecimento, incluindo genes relacionados à via de sinalização de etileno, foram afetados pela auxina sugerindo potenciais pontos de crosstalk entre os dois hormônios. O etileno ainda parece regular o metabolismo de auxina no fruto via indução de conjugação pela ativação de GH3s. Compreender o papel dos hormônios no controle da maturação é essencial para o desenvolvimento de tecnologias que visam melhorar a qualidade pós-colheita de frutos.

O mamão papaia (Carica papaya L.) é uma fruta tropical de grande relevância comercial uma vez que o Brasil é o maior produtor mundial e terceiro maior exportador da fruta. Contudo, por ser uma fruta climatérica, tem uma vida pós-colheita limitada, devido ao rápido Amaciamento da polpa. Neste trabalho foi realizada uma investigação proteômica comparativa de polpa do mamão verde e maduro. Várias centenas de componentes protéicos (spots) foram resolvidos em géis 2-DE (faixa de pH 4-7) utilizando a eletroforese diferencial em gel (DIGE) e posteriormente as imagens geradas foram analisadas pelo programa PDQuest. Os spots diferencialmente expressos foram retirados do gel, digeridos e sequenciados (ESI-Q-TOF-MS/MS). Em geral, as proteínas diferencialmente expressas foram associadas ao metabolismo do etileno, resposta ao estresse, metabolismo de carbono e outros importantes processos fisiológicos. Os papéis de algumas das proteínas identificadas foram discutidos em relação à qualidade dos frutos do mamão. Este estudo fornece a primeira caracterização das mudanças no proteoma da polpa do mamão durante o amadurecimento. Deste modo a identificação de proteínas envolvidas na instalação ou desenvolvimento do amadurecimento pode contribuir para o entendimento deste processo e, também, gerar subsídios para avanços tecnológicos visando à qualidade e diminuição das perdas pós-colheita. / Papaya (Carica papaya L.) fruit is a relevant tropical crop since Brazil is the world\'s largest producer and third largest exporter of fruit. However being a climacteric fruit, has a limited green life due to the rapid pulp softening. We report here a comparative proteomic investigation of fruit pulp from unripe and ripe papayas. Several hundreds of protein components were resolved on 2-DE gels (pH range 4-7) using the differential gel electrophoresis (DIGE) approach, and images were analyzed by PDQuest. The variable components were excised, in-gel digested and were analyzed by ESI-Q-TOF-MS/MS. In general, the differentially expressed proteins were associated to ethylene metabolism, stress response, carbon metabolism and other important physiological processes. The roles of some of the identified proteins were discussed in relation to papaya fruit quality. To the best of our knowledge, this investigation provides the first characterization of the changes in papaya fruit pulp proteome during ripening. Thus the identification of proteins involved in the installation or development of the ripening may contribute to the understanding of this process and also provide subsidies for technological advances aimed at quality and reduction of post harvest losses.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T12:44:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ruver Rodriques Feitosa Ramalho - 2015.pdf: 3672502 bytes, checksum: 9452919a961824a1718a9111d9ee60ad (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T12:46:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ruver Rodriques Feitosa Ramalho - 2015.pdf: 3672502 bytes, checksum: 9452919a961824a1718a9111d9ee60ad (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-19T12:46:53Z (GMT). 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Through analysis by GC/MS was possible to identify a total of 28 substances in essential oils of pitanga fruit. The red variety was characterized by the presence of germacrone (39.67-46.54%) curzerene (14.36- 15.75%) and atractylone (6.90-10.10%), while the red-orange presents as major compounds: selina-1,3,7(11)-trien-8-one (36.06-41.22%) and selina-1,3,7(11)-trien-8- one epoxide (19.36-34.28%). The purple variety contains germacrone (51.56-56.80%), curzerene (4.10-5.11%), atractylone (0.72-1.50%), selina-1,3,7(11)-trien-8-one (11.04- 14.31%) and selina-1,3,7(11)-trien-8-one epoxide (3.70-5.86%). Total sesquiterpenes are the major constituents of the fruits of the three varieties at all stages of maturation, and the oxygenated sesquiterpenes were more abundant in red and purple varieties, while hydrocarbons sesquiterpenes were dominant in the red-orange variety. Generally no significant differences were observed in the concentrations of the major volatile compounds of the three varieties during the period of maturation, only the orange-red variety showed variations in the total levels of sesquiterpenes and monoterpenes. It was concluded that the composition of essential oils and anthocyanin levels are the factors that distinguish the three varieties, while in relation to the ripening process the anthocyanins, flavonoids, phenolic compounds and some minor constituents of the oils have varied significantly. / A composição de óleos essenciais e os teores de compostos fenólicos em frutos de três variedades de pitanga (frutos vermelho, vermelho-laranja e roxo) foram analisados durante quatro estádios de maturação. A análise de variância (ANOVA two-way) mostrou que os teores de antocianinas diferem significativamente entre as três variedades de pitanga, principalmente no último estádio. Teores de flavonóides variaram durante a maturação de forma diferente para cada variedade e somente no terceiro estádio os níveis destes metabólitos foram iguais para as três variedades. Não foram observadas diferenças nas concentrações de taninos durante o amadurecimento dos frutos e de fenóis totais entre as três variedades. Através de análise por CG/EM foi possível identificar no total 28 substâncias nos óleos essenciais dos frutos de pitanga. A variedade vermelha foi caracterizada pela presença de germacrona (39,67-46,54%), curzereno (14,36-15,75%) e atractilona (6,90-10,10%), enquanto a variedade vermelhaalaranjada possui como compostos majoritários: selina-1,3,7(11)-trien-8-one (36,06- 41,22%) e epóxido de selina-1,3,7(11)-trien-8-one (19,36-34,28%). A variedade roxa contém tanto germacrona (51,56-56,80%), curzereno (4,10-5,11%) e atractilona (0,72- 1,50%) quanto selina-1,3,7(11)-trien-8-one (11,04-14,31%) e epóxido de selina- 1,3,7(11)-trien-8-one (3,70-5,86%). Os sesquiterpenos totais são os constituintes majoritários dos frutos das três variedades em todos os estádios de maturação, sendo que os sesquiterpenos oxigenados foram mais abundantes nas variedades vermelha e roxa, enquanto os hidrocarboneto sesquiterpênicos foram dominantes na variedade vermelha-alaranjada. Em geral não foram observadas diferenças significativas nas concentrações dos compostos voláteis majoritários das três variedades durante o período de maturação, somente a variedade vermelho-alaranjada apresentou variações nos teores totais de sesquiterpenos e monoterpenos. Concluiu-se que a composição dos óleos essenciais e os níveis de antocianinas são os fatores que mais distinguem as três variedades, em relação ao processo de amadurecimento dos frutos temos que antocianinas, flavonóides, fenóis totais e alguns constituintes minoritários dos óleos variaram de forma significativa.

O mamão papaia (Carica papaya L.) é uma fruta tropical de grande relevância comercial uma vez que o Brasil é o maior produtor mundial e terceiro maior exportador da fruta. Contudo, por ser uma fruta climatérica, tem uma vida pós-colheita limitada, devido ao rápido Amaciamento da polpa. Neste trabalho foi realizada uma investigação proteômica comparativa de polpa do mamão verde e maduro. Várias centenas de componentes protéicos (spots) foram resolvidos em géis 2-DE (faixa de pH 4-7) utilizando a eletroforese diferencial em gel (DIGE) e posteriormente as imagens geradas foram analisadas pelo programa PDQuest. Os spots diferencialmente expressos foram retirados do gel, digeridos e sequenciados (ESI-Q-TOF-MS/MS). Em geral, as proteínas diferencialmente expressas foram associadas ao metabolismo do etileno, resposta ao estresse, metabolismo de carbono e outros importantes processos fisiológicos. Os papéis de algumas das proteínas identificadas foram discutidos em relação à qualidade dos frutos do mamão. Este estudo fornece a primeira caracterização das mudanças no proteoma da polpa do mamão durante o amadurecimento. Deste modo a identificação de proteínas envolvidas na instalação ou desenvolvimento do amadurecimento pode contribuir para o entendimento deste processo e, também, gerar subsídios para avanços tecnológicos visando à qualidade e diminuição das perdas pós-colheita. / Papaya (Carica papaya L.) fruit is a relevant tropical crop since Brazil is the world\'s largest producer and third largest exporter of fruit. However being a climacteric fruit, has a limited green life due to the rapid pulp softening. We report here a comparative proteomic investigation of fruit pulp from unripe and ripe papayas. Several hundreds of protein components were resolved on 2-DE gels (pH range 4-7) using the differential gel electrophoresis (DIGE) approach, and images were analyzed by PDQuest. The variable components were excised, in-gel digested and were analyzed by ESI-Q-TOF-MS/MS. In general, the differentially expressed proteins were associated to ethylene metabolism, stress response, carbon metabolism and other important physiological processes. The roles of some of the identified proteins were discussed in relation to papaya fruit quality. To the best of our knowledge, this investigation provides the first characterization of the changes in papaya fruit pulp proteome during ripening. Thus the identification of proteins involved in the installation or development of the ripening may contribute to the understanding of this process and also provide subsidies for technological advances aimed at quality and reduction of post harvest losses.

Durante o amadurecimento ocorrem profundas alterações na composição química dos frutos e a expressão gênica desempenha papel fundamental no controle desse processo. Apesar da importância comercial do mamão, as informações a respeito da expressão gênica durante o amadurecimento são limitadas. Assim, nessa tese, técnicas de estabelecimento de perfis de RNA mensageiro, como Differential Display-PCR, cDNA-AFLP e Cross-Species Microarray, foram aplicadas para a identificação de genes com expressão alterada. Alguns genes ligados ao metabolismo e transporte de açúcares, de lipídeos e carotenóides, à degradação de parede celular e stress, e fatores de transcrição dependentes e independentes de hormônios vegetais pareceram apresentar diferenças de expressão durante o amadurecimento do mamão papaia. O isolamento dos genes diferencialmente expressos permitiu traçar um panorama da expressão gênica do fruto e, dessa maneira, a relação das funções dos genes com o amadurecimento do mamão contribuiu para o aumento do entendimento acerca da qualidade pós-colheita do fruto. / Ripening affects the quality of fleshy fruits by changing the chemical composition, and gene expression regulates most part of these transformations. Although papaya fruit is an important Brazilian crop, there are restricted studies concerning its ripening and gene expression. In this work, it is described the use of some RNA profiling techniques, such as Differential Display-PCR, cDNA-AFLP and Cross-Species Microarray, to identify ripening-related genes in papaya fruit. Using these techniques, some differentially expressed genes during papaya fruit ripening were isolated. Their functions were associated with metabolism and transport of sugars, lipids and carotenoids, cell wall disassembly, stress and transcription factors dependent and independent of plant hormones. In this way, it was proposed a pattern of gene expression during papaya fruit ripening, at least for those isolated genes, and the assemblage of these data with other authors data can locate fruit handling to a better level, minimizing postharvest losses and increasing papaya fruit shelf-life.

Durante o amadurecimento ocorrem profundas alterações na composição química dos frutos e a expressão gênica desempenha papel fundamental no controle desse processo. Apesar da importância comercial do mamão, as informações a respeito da expressão gênica durante o amadurecimento são limitadas. Assim, nessa tese, técnicas de estabelecimento de perfis de RNA mensageiro, como Differential Display-PCR, cDNA-AFLP e Cross-Species Microarray, foram aplicadas para a identificação de genes com expressão alterada. Alguns genes ligados ao metabolismo e transporte de açúcares, de lipídeos e carotenóides, à degradação de parede celular e stress, e fatores de transcrição dependentes e independentes de hormônios vegetais pareceram apresentar diferenças de expressão durante o amadurecimento do mamão papaia. O isolamento dos genes diferencialmente expressos permitiu traçar um panorama da expressão gênica do fruto e, dessa maneira, a relação das funções dos genes com o amadurecimento do mamão contribuiu para o aumento do entendimento acerca da qualidade pós-colheita do fruto. / Ripening affects the quality of fleshy fruits by changing the chemical composition, and gene expression regulates most part of these transformations. Although papaya fruit is an important Brazilian crop, there are restricted studies concerning its ripening and gene expression. In this work, it is described the use of some RNA profiling techniques, such as Differential Display-PCR, cDNA-AFLP and Cross-Species Microarray, to identify ripening-related genes in papaya fruit. Using these techniques, some differentially expressed genes during papaya fruit ripening were isolated. Their functions were associated with metabolism and transport of sugars, lipids and carotenoids, cell wall disassembly, stress and transcription factors dependent and independent of plant hormones. In this way, it was proposed a pattern of gene expression during papaya fruit ripening, at least for those isolated genes, and the assemblage of these data with other authors data can locate fruit handling to a better level, minimizing postharvest losses and increasing papaya fruit shelf-life.