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Estudo genotípico de Trypanosoma cruzi: epidemiologia e caracterização molecular de isolados do homem, triatomíneos e mamíferos silvestres do Pará, Amapá e Maranhão

VALENTE, Vera da Costa January 2011 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-07T12:57:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoGenotipicoTrypanosoma.pdf: 3239637 bytes, checksum: 1bcb0506e1758886b51d1bcdc717d0da (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-12T12:18:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoGenotipicoTrypanosoma.pdf: 3239637 bytes, checksum: 1bcb0506e1758886b51d1bcdc717d0da (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-12T12:18:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoGenotipicoTrypanosoma.pdf: 3239637 bytes, checksum: 1bcb0506e1758886b51d1bcdc717d0da (MD5) Previous issue date: 2011 / A doença de Chagas aguda (DCA) é endêmica na Amazônia Brasileira sendo a via oral a principal forma de transmissão com surtos familiares ou multifamiliares. Esta via independe da colonização de triatomíneos no domicílio e a ocorrência é regular com média de 100 casos/ano e 5% de óbitos. Apresenta distribuição espaço-temporal bem definida, colocando a enfermidade como emergência de importância em saúde pública nos estados do Pará, Amapá e Amazonas. A presença de mamíferos e triatomíneos silvestres, infectados naturalmente com o c e habitando distintos ecótopos terrestres e arbóreos, mantém um intenso ciclo enzoótico em toda a Amazônia. Perfis moleculares de linhagens de T. cruzi na região estão associados a hospedeiros mamíferos (incluindo o homem), triatomíneos, ecótopos e manifestações clínicas. Foram estudados quatro surtos de DCA ocorridos nos Municípios de Barcarena, Belém e Cachoeira do Arari no Estado do Pará e em Santana, no Estado do Amapá e abordados os aspectos epidemiológicos (parasitológico e sorológico manifestações clínicas, reservatórios e triatomíneos silvestres associados aos surtos). Foi investigado também em São Luís, Estado do Maranhão, o ciclo domiciliar e silvestre do T. cruzi, porém sem a ocorrência de casos de DCA. O estudo incluiu também a genotipagem molecular de T. cruzi pelo gene de mini-exon dos isolados (homem, mamíferos e triatomíneos silvestres) associados aos diferentes ciclos de transmissão. O diagnóstico parasitológico foi confirmado em 63 pacientes com a seguinte sensibilidade nos testes aplicados: 41,3% (26/63) pela gota espessa; 58,7% (37/63) no QBC; 79,4% (50/63) no xenodiagnóstico e 61,9% (39/63) na hemocultura. A sorologia de 2648 pessoas por hemaglutinação indireta (HAI) foi de 3,05% (81/2648) e imunofluorescência indireta IFI apresentaram respectivamente resultados de e 2,49% (66/2648) para IgG e 2,37 (63/2648) para IgM. Os resultados em São Luís foram todos negativos. Foram capturados 24 mamíferos, 13 Didelphis marsupialis, 1 Marmosa cinerea, 5 Philander opossum, 3 Metachirus nudicaudatus, 1 Oryzomys macconnelli, 1 Oecomys bicolor e 433 R. rattus. A taxa de infecção para T. cruzi foi de 7,14% (29/404). Um total de 3279 triatomíneos foi capturado sendo: Triatoma rubrofasciata (n=3008), com taxa de infecção (TI) de 30.46%, (39/128), Rhodnius robustus (n=137), com TI de 76% (79/104), R. pictipes (n=94), TI de 56,9% (49/86%), E. mucronatus (n=6) e P. geniculatus (n=12) com TI de 50% e as demais espécies sem infecção R. neglectus (n=5) e P. lignarius (n=6). As palmeiras foram os principais ecótopos dos triatomíneos silvestres. O urucurizeiro (S. martiana) apresentava infestação de 47,41% (101/213) dos triatomíneos; o “inajazeiro” (Maximiliana regia) 35,21% (75/213); o “babaçueiro” (Orbgnya. speciosa) 5,16% (11/213); o “dendezeiro” (Eleas melanoccoca) 1,87% (4/213) e a “bacabeira” (Oenocarpus bacaba) 10,32% (22/213). Para a genotipagem foram obtidos 46 isolados de tripanossomas de origem humana, 31 isolamentos de mamíferos silvestres e 74 amostras de triatomíneos. Todos os isolados foram caracterizados como da linhagem TcI de T. cruzi. Todos os casos humanos no Pará foram caracterizados como positivos por exame parasitológico. Nem todos os casos de Santana, Amapá, apresentaram casos parasitológicos positivos, pela demora do diagnóstico, mesmo assim estes foram definidos como DCA. Exames como xenodiagnóstico, hemocultura e o QBC® foram mais sensíveis do que a gota espessa. A sorologia por HAI e IFI (IgG e IgM) tiveram excelente sensibilidade para detectar os casos agudos em tempos distintos de infecção. O achado de mamíferos (D. marsupilais) e triatomíneos silvestres (R. pictipes e P. geniculatus) infectados com consideráveis taxas de infecção para T. cruzi no entorno das residências dos pacientes sustentam a importância destes hospedeiros associados à transmissão da DCA. Apesar de na Amazônia circularem vários genótipos de T. cruzi nos diferentes hospedeiros, neste trabalho foi identificada somente a linhagem TCI de T. cruzi, a mais predominante na Região. Em São Luís, Maranhão, embora sem registro de casos de DCA apresenta um ciclo domiciliar associados ao rato doméstico e o triatomíneo da espécie T. rubrofasciata, e um ciclo silvestre mantido por didelfídeos. Nos dois ciclos circulam a linhagem TCI de T. cruzi. Estudos com marcadores de maior resolução com isolados de T. cruzi regionais podem ajudar a esclarecer os ciclos de transmissão, as rotas de contaminação e os hospedeiros envolvidos em casos de DCA na Amazônia. / The acute Chagas disease (ACD) is endemic in the Brazilian Amazon, and its main transmission route is oral, throughout family and multi-family outbreaks. This route is independent from the colonization of triatomine bugs in dwellings and its occurrence is regular, with mean rates of 100 cases per year and a lethality rate of 5%. The disease has a well-defined spatio-temporal distribution, which makes it a relevant public health concern in the states of Pará, Amapá and Amazonas. The existence of wild mammals and triatomine bugs naturally infected with Trypanosoma cruzi inhabiting different terrestrial and arboreal ecotopes maintains an intense enzootic cycle all over the Amazon region. Molecular profiles of T. Cruzi lineages in the region are associated with mammal reservoirs (including humans), triatomine bugs, ecotopes and clinical manifestations. We analyzed four ACD outbreaks in the municipalities of Barcarena, Belém and Cachoeira do Arari on Pará State, and Santana on Amapá State, based on epidemiologic features (laboratory, parasitological and serological diagnoses, clinical manifestations and the reservoirs and wild triatomines related to the outbreaks). We also investigated the domestic and wild transmission cycles of T. cruzi in São Luis on Maranhão State, without the occurrence of ACD cases. This study comprised molecular genotyping of T. cruzi on the mini-exon gene of the isolates associated with both transmission cycles (humans, mammals and wild triatomine vectors). Parasitological diagnosis was confirmed in 63 patients with the following sensitivity rates: 41.3% (26/63) for the thick blood film method; 58.7% (37/63) for QBC; 79.4% (50/63) for xenodiagnosis; and 61.9% (39/63) for blood culture. The serological diagnosis of 2648 individuals by indirect hemagglutination assay (IHA) was of 3.05% (81/2648), whereas the results of the indirect immunofluorescence test (IIF) were 2.49% (66/2648) for IgG and 2.37% (63/2648) for IgM. All tests carried out in São Luís were negative. A total of 24 mammals, 13 Didelphis marsupialis, 1 Marmosa cinerea, 5 Philander opossum, 3 Metachirus nudicaudatus, 1 Oryzomys macconnelli, 1 Oecomys bicolor and 433 R. rattus were captured. The infection rate for T. cruzi was of 7.14% (29/404). A total of 3279 triatomine bugs were captured: T. rubrofasciata (n=3008) and infection rate (IR) of 30.46%, (39/128) and R. robustus (n=137) IR of 76% (79/104), R. pictipes (n=94), IR of 56.9% (49/86%) E. mucronatus (n=6) and P. geniculatus (n=12) IR of 50% and the other non-infected species R. neglectus (n=5) and P. lignarius (n=6). Palm trees were the main ecotopes for the wild triatomine bugs. S. martiana was infested with 47.41% (101/213) of the triatomines; Maximiliana regia, 35,21% (75/213); Orbgnya speciosa, 5.16% (11/213); Eleas melanoccoca), 1.87% (4/213); and Oenocarpus bacaba, 10.32% (22/213). Genotyping was carried out using 46 isolates of trypanosomes obtained from humans, 31 from wild mammals and 74 from samples of triatomine bugs. All isolates were characterized as belonging to the Tcl lineage. All human cases in Pará were characterized as positive by parasitological testing. Not all the cases in Santana were tested positive because of the delay on diagnosis, but they were defined as positive. Xenodiagnosis, blood culture and QBC® were more sensitive than the thick blood film. Serological examinations by IHA and IIF (IgG and IgM) presented an optimal sensitivity to detect acute cases in different moments of infection. Mammals (D. marsupialis) and wild triatomine bugs (R. pictipes and P. geniculatus) infected with high infection rates of T. cruzi in the patients’ peridomicile area account for the importance of these reservoirs in the transmission cycle of the ACD, and are associated with its transmission. Even though several genotypes of T. cruzi circulate in the Amazon Region, only the Tcl lineage was identified in the patients, mammals and triatomines investigated in this study. In São Luís, in spite of these having no record of human cases of ACD, it has a domestic cycle associated with the black rat and the triatomine bugs of the species T. rubrofasciata, as well as a sylvatic cycle associated with didelphids. The Tcl cycles circulate in both cycles. Studies with isolates of local T. cruzi using markers with a higher definition might help clarify the transmission cycles, transmission routes and the reservoirs involved in cases of ACD in the Amazon Region.
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Prevalência da Rinotraqueíte Bovina (IBR) em touros bubalinos em propriedades localizadas no Amapá e Ilha de Marajó (PA), Brasil

FERREIRA, Rafaela Nunes 28 November 2009 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-06-09T18:27:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaRinotraqueiteInfecciosa.pdf: 560365 bytes, checksum: 05557c17526acef9535989407adf8d91 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-07-02T12:58:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaRinotraqueiteInfecciosa.pdf: 560365 bytes, checksum: 05557c17526acef9535989407adf8d91 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-02T12:58:26Z (GMT). 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O estudo foi realizado em animais de oito propriedades, localizadas nos estados do Para e Amapa, regiao Norte do Brasil, encontrando-se distribuidos da seguinte forma: nos municipios de Itaubal do Piriri (N=59), Cutias do Araguari (N=33), Tartarugalzinho (N=14) e Bailique, distrito de Macapa (N=21), totalizando 127 animais no Amapa. Os 73 restantes localizavam-se no estado do Para nos municipios de Soure (N=38) e Muana (N=23), Ilha do Marajo. A analise estatistica constou da aplicacao do teste Binomial para comparar a prevalencia do HBV-1 nas propriedades examinadas nos municipios, e comparar a prevalencia entre as classes de raca, escore corporal e idade. Para avaliar a distribuicao da titulacao de anticorpos para HBV-1, entre Amapa e Marajo, foi utilizado o teste estatistico de Mann- Whitney. Todos os procedimentos foram executados pelo programa BioEstat 5, com nivel de significancia α=0.05. Em todas as propriedades estudadas havia animais positivos, e 82,4% das 188 amostras foram sorologicamente positivas. Entre as racas mediterraneo e Murrah e seus mesticos, houve diferenca real de prevalencia somente entre as racas Mediterraneo e Murrah (p=0,0004). Houve influencia do ECC na prevalencia de touros sorologicamente positivos, sendo que os de ECC=3 apresentaram maior prevalencia que os de ECC < 3 (p=0.009). A prevalencia conforme a idade mostrou que existe uma diferenca significativa (p<0.0001) entre os animais com dois anos e os touros com mais de dois anos de idade, havendo um incremento gradativo das taxas de infeccao com o avancar da idade. A prevalencia no estado do Amapa foi significativamente maior que no Para. As propriedades localizadas nos municipios de Cutias do Araguari, Tartarugalzinho e Bailique (Macapa), apresentram 100% de prevalencia. Foi observado que a titulacao minima ocorreu na maioria dos animais no Marajo, entretanto em somente em 4.8% do rebanho procedente do Amapa teve baixas titulacoes. Todas as 51 amostras de semen apresentaram-se negativas no teste da RTPCR. Concluimos assim que a prevalencia da IBR e altissima em touros bubalinos criados extensivamente no estado do Amapa e Para, Brasil. / Blood samples of 188 buffalo bulls, reared in extensive systems in pasture of lowland, without effective control and reproductive and health, with two to 15 years old, Murrah, Mediterranean breeds and crossbreeds, were collected in sterile Vacutainer tubes, 5 mL and analyzed for the presence of antibodies to HBV-1, through the test virus neutralization. Of the 188 bulls examined, only 51 were obtained from semen of samples, which were submitted to analysis RT-PCR. Information about age, race and body condition score (BCS) of the animals were observed. The descriptive statistics was applied through the proportional distribution and determination of the hips and medians for categorical variables. The study was conducted on eight properties, located in the states of Para and Amapa, northern Brazil, were distributed as follows: 127 animals in the municipalities Itaubal of Piriri (N = 59), Agouti Araguari (N = 33), Tartarugalzinho (N = 14) and Bailique, district of Macapa (N = 21) located in the state of Amapa. The remaining 73 located in the state of Para in the municipalities of Soure (N = 38) and Muana (N = 23), Marajo of Island. Statistical analysis consisted of applying the Binomial test to compare the prevalence of HBV-1 in the properties examined in the cities, and compare the prevalence between the classes of race, age and body score. To assess the distribution of titers of antibodies to HBV-1, between Amapa and Marajo, we used the statistical test of Mann-Whitney. All procedures were performed by the program BioEstat 5, with significance level α= 0.05. All studied properties had seropositive animals, and 82.4% of 188 samples were serologically positive. Between the Mediterranean and Murrah breeds and crossbreeds, there was only real difference in prevalence between the Mediterranean and Murrah breeds (p = 0.0004). There was influence of BCS in the serologically positive bulls prevalence. The BCS = 3 had the highest prevalence of ECC <3 (p = 0.009). The prevalence according to age showed a significant difference (p <0.0001) between animals with two years and the bulls with more than two years of age, with a gradual increase in rates of infection with age. The prevalence in the state of Amapa was significantly higher than in Para. The properties located in the municipalities of the Cutias do Araguari, Tartarugalzinho and Bailique (Macapa), had a 100% prevalence. It was observed that the titration was minimal in most animals in Marajo, but only 4.8% of the Amapa’s herds was founded low titers. All 51 samples of semen, were negative in the RT-PCR test. We conclude that the prevalence of IBR is high in buffalo bulls bred extensively in the state of Para and Amapa, Brazil.
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Diagnóstico da pesca no litoral do Parque Nacional do Cabo Orange e sua área circundante, município de Oiapoque estado do Amapá

SILVA, Sirley Luzia de Figueiredo 19 March 2010 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-07-02T19:08:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoPescaLitoral.pdf: 1486727 bytes, checksum: 49a20c034297b1ad1a24ba56e48fe023 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-07-16T16:26:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoPescaLitoral.pdf: 1486727 bytes, checksum: 49a20c034297b1ad1a24ba56e48fe023 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-16T16:26:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoPescaLitoral.pdf: 1486727 bytes, checksum: 49a20c034297b1ad1a24ba56e48fe023 (MD5) Previous issue date: 2010 / O estado do Amapá apresenta-se com 70 % dos seus 14.281.458,5 ha de extensão transformados em áreas protegidas, entres as várias categorias de Unidades de Conservação e terras indígenas, por sua vez, muitas dessas áreas adentras as águas litorâneas do atlântico, ora pelos seus limites, ora pelos seus entornos (área circundante), tornando conflitante a atividade pesqueira na linha da costa amapaense. O Acordo de Pesca assinado em 2007 entre pescadores do município do Oiapoque e gerencia do Parque Nacional do Cabo Orange (ICMBIO) busca o controle das pescarias pela frota do Oiapoque e diminuir conflito na faixa de 20 km em águas marinhas, que pertencem ao seu limite e área circundante. Este estudo investigou as características da pesca na região do estuário do rio Oiapoque, faixa marinha do Parque e sua área circundante. A metodologia contemplou entrevistas formais e informais de vários atores do setor pesqueiro no Oiapoque, monitoramento de 488 desembarques e viagens aos locais de pescarias. Foram obtidas as CPUE’s em função do rendimento por dia de pesca por pescador (Kg/dia/pesca para cada tipo de embarcação). Foram mapeados os pesqueiros considerados importantes e tradicionalmente explorados pela frota do Oiapoque, dentro dos limites do Parque Nacional do Cabo Orange e em sua área circundante. Os pescadores do município realizam pescarias de subsistência, artesanal de menor e maior escala. Por sua vez, são as pescarias artesanais de menor escala que predominam na área do parque particularmente as embarcações do tipo “barco de pequeno porte” (BPP), que se destacaram em número, cerca de 60 % das cadastradas na colônia. O volume de pescado desembarcado no município do Oiapoque foi 766 toneladas no ano de 2008. São principalmente alvo das pescarias a corvina (Cynoscion virescens) e a pescada branca (Plagioscion spp), desta capturada de pescarias de menor escala, principalmente em embarcações de capacidade até 1 tonelada do tipo barco motorizado (BOM). A produção é comercializada diretamente dos pescadores para intermediários (balanceiros) que por sua vez, vendem para o mercado local, os dois grandes centros consumidores do Amapá (Macapá e Santana) e para outros estados (Pará, São Paulo etc). / The state of Amapá comes with 70% of their 14.281.458,5 there is of extension transformed in protected areas, enter the several categories of Units of Conservation and indigenous lands, for his/her time, many of those areas penetrate the coastal waters of the Atlantic, some times for their limits, other times for their surrounding area, turning conflicting the fishing activity in the line of the coast of Amapá. The Agreement of Fishing signed in 2007 among fishermen of the municipal district of Oiapoque and it manages of Cabo Orange National Park (ICMBIO) it looks for the control of the fisheries for the fleet of Oiapoque and to reduce conflict in the strip of 20 km in sea waters, that you/they belong to his/her limit and surrounding area. This study investigated the characteristics of the fishing in the area of the estuary of the river Oiapoque, sea strip of the Park and his/her surrounding area. The methodology contemplated several actors' of the fishing section formal and informal interviews in Oiapoque, 488 disembarkation attendance and trips to the places of fisheries. They were obtained CPUE's in function of the income a day of fishing for fisherman (Kg/day/fishing for each boat type). The fishing ones were mapped considered important and traditionally explored by the fleet of Oiapoque, inside of the limits of Cabo Orange National Park and in his/her surrounding area. The fishermen of the municipal district accomplish subsistence fisheries, craft of minor and larger scale. For his/her time, they are the craft fisheries of smaller scale than they prevail in the area of the park particularly the embarkations of the type "boat of small load" (BPP), that you/they stood out in number, about 60% of the registered in the colony. The fish volume disembarked in the municipal district of Oiapoque was 766 tons in the year of 2008. They are mainly objective of the fisheries the corvina (Cynoscion virescens) and fished her white (Plagioscion spp), of this captured of fisheries of smaller scale, mainly in capacity embarkations to 1 ton of the type motorized boat (BOM). The production is marketed directly of the fishermen for middlemen (balanceiros) that for his/her time, they sell to the local market, the two great consuming centers of Amapá (Macapá and Santana) and for other states (Pará, São Paulo etc).
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Epidemiologia molecular do Vírus linfotrópico de células T humanas - HTLV 1/2 no Estado do Amapá-Brasil

SILVA, Ivanete do Socorro Pinheiro da January 2006 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T16:44:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirus.pdf: 1170321 bytes, checksum: da4e03bfc36fd6fcd133e64edcce5f7d (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-13T17:24:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirus.pdf: 1170321 bytes, checksum: da4e03bfc36fd6fcd133e64edcce5f7d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-13T17:24:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirus.pdf: 1170321 bytes, checksum: da4e03bfc36fd6fcd133e64edcce5f7d (MD5) Previous issue date: 2006 / A distribuição geográfica da infecção pelo Vírus Linfotrópico de Células T HTLV 1/2 humanas 1 e 2 é ampla, porém existem áreas de maior endemicidade e também particularidades de acordo com o tipo de HTLV. O HTLV-1 apresenta maior soroprevalência no sudoeste do Japão, no Caribe, na América Central, nas diferentes regiões da América do Sul e nas porções centrais e ocidentais da África e Melanésia. Enquanto o HTLV-2 parece acometer grupos populacionais distintos, como as populações nativas de indígenas das Américas do Norte, Central e Sul, pigmeus da África Central, mongóis na Ásia e também usuários de drogas injetáveis. O trabalho realizado teve como objetivo descrever a epidemiologia molecular do HTLV em três populações distintas do estado do Amapá, que foram: pacientes HIV/AIDS infectado, população afro-descendente e finalmente indivíduos atendidos no Laboratório Central de Saúde Pública do Amapá (LACEN-AP), encaminhados para diagnóstico de HTLV. As amostras foram avaliadas para a presença do vírus por métodos sorológicos (ELISA e Western blot) e moleculares (amplificação gênica e caracterização de segmentos das regiões pX e env pela análise de polimorfismo de fragmentos de restrição por ação de endonuclease. Os resultados obtidos nas diferentes populações foram na população de indivíduos infectados pelo HIV/AIDS, todas as amostras foram negativas, na população afro-descendente, apenas uma amostra apresentou positividade na sorologia pelo método de ELISA, porém foi negativa no Western blot e quando submetida ao método molecular, não houve amplificação. No entanto, entre os indivíduos encaminhados para diagnóstico de HTLV, 06 (seis) amostras foram positivas, e dessas, 05 (cinco) foram confirmadas por Western blot e pelo método molecular. O resultado molecular demonstrou a presença de HTLV-1. / The geographical distribution of the infection by human T-cell lymphotropic virus 1/2 – HTLV 1 / 2 is extensive, nevertheless, there are areas that are more endemic and have more particularities depending on the HTLV type. The HTLV 1 shows a bigger occurrence in south west of Japan, Caribbean, Central America, in different regions of South America and in parts of Central, as well as in western Africa, while HTLV-2, seems to assault distinct groups of people, such as Indians native people from North, Central and South America, Pigmies from Central Africa, Mongols in Asia as well as in infecting drug users. The present work had as objective describing HTLV molecular epidemiology, in three different populations the State of Amapá, they are: HIV/IDS positive patients, Afro-descenig population and individuals assisted of Public Health Center Laboratory of Amapá – LACEN-AP, directed for diagnosis of HTLV. The samples were tested for the presence of virus using serological (ELISA and Western blot) and molecular assays (gene amplification and restriction fragment length polymorphism from pX and env for the analysis of polimorfismo o restriction fragments for endonuclease action. The obtained results in different populations are In the population of HIV infected people, all the samples were negative; in the Afro-desceding population, only one sample was positive confirmed by serological test (ELISA), but negative according to western blot test and submitted to the molecular analysis, there wast not amplification. However, among samples of individuals directed for diagnosis of HTLV, 06 (six) were positive, 5(five) out of 6/them were confirmed by western blot test. The molecular result demonstrated the presence of HTLV-1.
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Epidemiologia molecular do Vírus da imunodeficiência humana 1 (HIV-1) no município de Macapá (Amapá), Brasil

MOREIRA, Márcio Ronaldo Chagas 18 January 2007 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T16:52:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusImunodeficiencia.pdf: 630679 bytes, checksum: 39ccd5ebcb2c01cce8610d34e719a8d8 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-03T16:57:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusImunodeficiencia.pdf: 630679 bytes, checksum: 39ccd5ebcb2c01cce8610d34e719a8d8 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-03T16:57:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusImunodeficiencia.pdf: 630679 bytes, checksum: 39ccd5ebcb2c01cce8610d34e719a8d8 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / Uma das principais características do Vírus da imunodeficiência humana (HIV) é sua grande diversidade genética. O presente trabalho tem como objetivo descrever a epidemiologia molecular do HIV-1 circulante na cidade Macapá, Amapá, assim como os fatores associados à aquisição da infecção e correlacionar estes com os subtipos virais encontrados e as informações epidemiológicas da população examinada. Amostras de sangue de 48 indivíduos portadores do HIV foram colhidas no Serviço de Assistência Especializada (SAE) da cidade de Macapá, no período de junho de 2003 a junho de 2004. Após a extração do DNA, foi realizada a amplificação de 297 pb da protease (gene pro) por meio da técnica de Nested PCR, sendo seqüenciadas, posteriormente, para a determinação dos subtipos virais. Foram identificados os subtipos B (93,7%) e F (6,3%) na cidade de Macapá, que são os mais prevalentes no Brasil, não tendo sido observada associação entre os subtipos do HV-1 circulantes nesta cidade e a preferência sexual. No entanto, uma parcela significativa da população examinada possui um baixo grau de escolaridade, característica esta que reflete a maior parcela população infectada pelo HIV no Brasil. / One of the main characteristics of Human immunodeficiency virus (HIV) is its great genetic diversity. The present work has as main objective the description of the molecular epidemiology of HIV-1 circulating in the city of Macapa, Amapa, as well as the factors associated with the infection and to correlate these with the viral subtypes found and the epidemiological data of the investigated population. Blood samples from 48 subjects bearers of the HIV were collected in the Service of Specialized Assistance (SSA) in the city of Macapa, in the mean time of June 2003 to June 2004. After the DNA extraction, was performed an amplification of 297 bp from the protease (gene pro) y means of the Nested PCR assay, being sequenced, afterwards, for the determination of the viral subtypes. Were identified the subtypes B (93.7%) and F (6.3%) in the city of Macapa which are the most prevalent in Brazil, and was not observed an association between the subtypes of HIV-1 circulating in this city with sexual preferences. Although, a significant part of the population examined has a low degree of scholarity, characteristic which reflects the majority of the population infected with HIV in Brazil.
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Caracterização molecular de Vibrio cholerae O1 sacarose negativa de isolados clínicos e ambiente na Amazônia brasileira

BAHIA, Márcia de Nazaré Miranda 11 May 2011 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-10T14:29:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoMolecularVibrio.pdf: 3174345 bytes, checksum: 206791fda17f07e3185ab94a45a6791f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-16T15:10:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoMolecularVibrio.pdf: 3174345 bytes, checksum: 206791fda17f07e3185ab94a45a6791f (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-16T15:10:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CaracterizacaoMolecularVibrio.pdf: 3174345 bytes, checksum: 206791fda17f07e3185ab94a45a6791f (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2011 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O V.cholerae é um microorganismo autóctone do ambiente aquático e os sorogrupos O1 e O 139 estão ligados a pandemia e epidemia de cólera. Os V.cholerae não O1 e não O139 ou vibrios não aglutinantes (NAGs) estão envolvidos em casos isolados e surtos de diarréia semelhantes à cólera. No decorrer da sétima pandemia houve o surgimento de diversos isolados “El Tor atípicos”. Entre estes se encontra a variante bioquímica do V.cholerae O1 que não fermenta a sacarose no TCBS em 18 a 24 horas que é o tempo de incubação convencional. Neste trabalho foram estudados 138 isolados de V.cholerae O1 e não O1 não fermentador da sacarose no TCBS de procedência clínica e ambiental, obtidos entre 1994 e 1995 na Amazônia Brasileira (Estados do Pará, Amapá e Amazonas). Avaliou-se a fermentação da sacarose no TCBS e em caldo; o perfil de suscetibilidade a oito diferentes antimicrobianos em ágar difusão; a relação clonal entre os V.cholerae O1 e NAG clínicos e ambientais pelo PFGE e a presença de genes de virulência ctxAB e tcpA pela reação em cadeia da polimerase. Observou-se que as amostras de V.cholerae não fermentaram a sacarose em 24 de incubação no ágar TCBS e em caldo, 43% utilizaram a sacarose em 24 horas e 57% a fermentavam tardiamente (tempo superior a 24 horas). Os isolados apresentaram baixo percentual de resistência a antimicrobianos (8,7%) e nenhum caso de multiresistência. Em relação aos genes de virulência, de um modo geral, os isolados de V.cholerae O1 apresentavam o tcpA e o ctxAB. Nos não O1 estes estavam ausentes, com exceção de um isolado clínico não O1 (gene tcpA+). A análise do PFGE revelou pulsotipos distintos entre os O1 e NAGs, embora dois destes últimos tenham apresentado relação clonal com os O1 clínicos. Todos os O1 clínicos apresentaram relação clonal com isolados de referência da sétima pandemia. / The V. cholerae is an autochthonous organism of the aquatic environment and serogroups O1 and 139 are associated to the pandemic and epidemic cholera. The V. cholerae non-O1 and non O139 or non-binders vibrios (NAGS) are involved in isolated cases and outbreaks of cholera-like diarrhea. During the seventh pandemic there was the emergence of several isolated “El Tor atypical”. Among these there is a biochemical variant of V. cholerae O1 that does not ferment sucrose in TCBS in 18 to 24 hours which is the conventional incubation time. In this work, we studied 138 isolates of V. cholerae O1 and non O1 non-fermenter of sucrose on TCBS from clinical and environmental origin, obtained between 1994 and 1995 in the Brazilian Amazon (states of Pará, Amapá and Amazonas). We evaluated the fermentation of sucrose in TCBS and broth; the susceptibility to eight different antimicrobials in agar diffusion, the clonal relationship between V. cholerae O1 and NAG from clinical and environmental origin by PFGE and the presence of virulence genes tcpA and ctxAB by the polymerase chain reaction. It was observed that the samples of V. cholerae did not ferment sucrose in 24 hours of incubation in TCBS agar and broth, 43% used sucrose in 24 hours and 57% fermented it lately (more than 24 hours). The isolates had a low percentage of antimicrobial resistance (8.7%) and no cases of multidrug resistance. Regarding the virulence genes, in general, the isolates of V. cholerae O1 showed the ctxAB and tcpA. In the non-O1, these were absent, except for one clinical isolate non-O1 (gene tcpA +). The PFGE analysis revealed pulsotypes distinguished between O1 and nags, although two of the latter had presented the clonal relationship to clinical O1. All O1 clinical isolates were clonally related to the reference isolates from the seventh pandemic.
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Epidemiologia e perfil de sensibilidade de Staphylococcus aureus procedentes de hospitais públicos de Macapá-Amapá

SOUZA, Margarida Maria Machado de 13 December 2007 (has links)
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Estudo da soroprevalência da co-infecção pelo Vírus da hepatite C (VHC) em pacientes portadores do Vírus da imunodeficiência humana 1 (HIV-1) e/ou com SIDA/AIDS no Estado do Amapá

PEREIRA, Francis Christian da Silva January 2005 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T15:41:23Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EstudoSoroprevalenciaCoinfeccao.pdf: 595939 bytes, checksum: 1920cc4fbd58bd47cf18fecda772aca3 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-28T14:00:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EstudoSoroprevalenciaCoinfeccao.pdf: 595939 bytes, checksum: 1920cc4fbd58bd47cf18fecda772aca3 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-28T14:00:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EstudoSoroprevalenciaCoinfeccao.pdf: 595939 bytes, checksum: 1920cc4fbd58bd47cf18fecda772aca3 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2005 / No presente estudo a soroprevalência da infecção pelo Vírus da hepatite C (VHC) foi investigada em indivíduos portadores da infecção pelo Vírus da imunodeficiência humana 1 (HIV-1) da cidade de Macapá, Estado do Amapá, Brasil. Um total de 120 indivíduos infectados pelo HIV-1 foi testado para a presença de anti-VHC usando um ensaio imunoabsorvente ligado a enzima. Todos os pacientes envolvidos no presente estudo foram testados para a carga viral plasmática do HIV-1 e para os níveis de células T CD4+ no momento do consentimento em fazer parte do estudo. Os pacientes responderam a um questionário epidemiológico no momento da coleta de sangue. Do total de 120 amostras testadas apenas sete (5,83%) foram soropositivas para anti-VHC. Quanto ao gênero, quatro (57,2%) e três (42,8%) eram homens e mulheres, respectivamente. A idade dos indivíduos soropositivos para anti-VHC variou de 21 a 40 anos entre os homens e de 21 a 60 entre as mulheres. Considerando o impacto da coinfecção nos valores de carga viral plasmática do HIV-1 e na contágem de células T CD4+ não foram observadas diferenças significativas (Odds Ratio=2,7368, p=0,3624; Odds Ratio=1,7803, p=0,7764). O uso de drogas injetáveis e de piercing mostrou ser um importante fator de risco para a co-infecção (p<0,05). Os resultados do presente estudo representam os primeiros achados acerca da co-infecção HIV-1/VHC no Estado do Amapá e demonstra a necessidade de um estudo continuado objetivando avaliar a soroprevalência da infecção pelo VHC no Amapá e detectar o real impacto clinico da co-infecção HIV-1/VHC no paciente. / In the present study, the seroprevalence of Hepatitis C virus (HCV) infection was investigated among Human immunodeficiency virus-infected subjects from the city of Macapá, state of Amapá, Brazil. A total of 120 HIV-1-infected subjects were tested for the presence of anti-HCV using an enzyme-linked immunosorbent assay. All the patients enrolled in the present study were tested for plasma HIV-1 viral load and CD4+ T-cells at the time of acceptance to join the study. The patients responded to an epidemiological questionnaire at the moment of blood collection. Seven out of 120 tested samples (5,83%) were seropositive for anti-VHC. Concerning gender, four(57,2%) and three(42,8%) were male and female, respectively. The ages of HCV seropositive subjects ranged from 21 to 40 years for males and from 21 to 60 for females. Take into account the impact of co-infection on plasma HIV-1 viral load and CD4+ T-cells quantification it was not observed significant differences (Odds Ratio=2.7368, p=0.3624; Odds Ratio=1.7803, p=0.7764). The intravenous drug use and piercing showed to be important risk factors to co-infection (p<0.05). The results of the current study represent the first report about HIV-1/HCV co-infection in the state of Amapá, and highlight the need for continuous study aiming to evaluate the seroprevalence of HCV infection in Amapá and to detect the real clinical impact of HIV-1/HCV co-infection on the patient.
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Soroprevalência do VHC e avaliação de fatores de risco entre usuários de serviço de hemodiálise no Estado do Amapá

MELO, Ronaldo Dantas de 12 1900 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T12:45:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-01T14:44:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-01T14:44:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / A hepatite C é um dos principais problemas de saúde pública no Brasil e no mundo, tendo alta prevalência em algumas populações específicas, inclusive em pacientes com insuficiência renal crônica, submetidos à hemodiálise. A disseminação do Vírus da Hepatite C (VHC) neste ambiente pode estar relacionada a diversos fatores, como transfusões sanguíneas freqüentes, tempo de duração do tratamento, compartilhamento de máquinas, cateteres e linhas de diálise, e à dificuldade do diagnóstico da infecção, sobretudo nas fases iniciais, quando ainda não ocorreu a soroconversão de anticorpos (anti-VHC). O objetivo deste trabalho foi descrever a soroprevalência de anti-VHC em pacientes renais crônicos submetidos à hemodiálise no Estado do Amapá, e correlacioná-los com os fatores de risco. Para este fim, foram avaliados 103 prontuários de pacientes do serviço de hemodiálise da unidade de nefrologia do Hospital de Clínicas Dr. Alberto Lima, em Macapá, Amapá, em dezembro de 2007. Os resultados das sorologias para o anti-HCV foram relacionados com os fatores de risco. Os resultados mostraram baixa prevalência de anti-VHC (4,8%), concluindo-se, estarem relacionados à baixa freqüência de transfusões sanguíneas, ao diagnóstico precoce da soroconversão, à não reutilização de máquinas e insumos, à adoção de “boas práticas” nos procedimentos e ao não compartilhamento de frações de injetáveis. / Hepatitis C is one of the most serious public health problems in Brazil and the world, and there is high prevalence in some specific populations, including in patients with chronic renal failure, in hemodialysis. The spread of hepatitis C virus (HCV) in this environment may be related to several factors, such as frequent blood transfusions, the duration of the treatment, sharing machines, catheters and lines of dialysis, and to difficulty of diagnosis of the infection, especially in early stages, when there was not yet a seroconversion of antibodies (anti-HCV). The objective of this study was to describe the seroprevalence of anti-HCV in chronic renal patients submitted to hemodialysis in the state of Amapá, and correlate them with the risk factors. For that, 103 charts were evaluated of patients of the service of hemodialysis, nephrology unit of the Hospital de Clínicas Dr. Alberto Lima in Macapá, Amapá, in December 2007. The results of serology for anti-HCV were related to the risk factors. The results showed low prevalence of anti-HCV (4,8%), related to the low frequency of blood transfusion, to the early diagnosis of seroconversion, not reuse of machinery and inputs, to the adoption of “good practices” in procedures and not sharing of injecting fractions.
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A dinâmica dos sistemas de produção praticados em uma unidade de conservação de uso direto na Amazônia - a Reserva Extrativista do Rio Cajari no estado do Amapá. / The dynamics of the production systems practiced in an unit of conservation of direct use in the Amazonian - Cajari River Extractivist

SOUSA, Walter Paixão de 07 August 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2011-03-23T21:19:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Item created via OAI harvest from source: http://www.bdtd.ufpa.br/tde_oai/oai2.php on 2011-03-23T21:19:15Z (GMT). Item's OAI Record identifier: oai:bdtd.ufpa.br:77 / ADA - Agência de Desenvolvimento da Amazônia / This project approaches an specific type of extractivism: the extractivism of Brazil Nut made in the Extractive Reserve of Cajari river in the Amapá State (RESEX/CA). This project is a continuation of researches made in 2000, having as a main focus the understanding of the dynamic production systems used in RESEX/CA. In This project can be noticed that the changes occurred in the systems in a period from 2000 to 2005,more than economic, the remain of agricultural practicing related to the Brazil Nut extraction are ruled for other / different factors. The historical relation between the forest use with the extractivism and agricultural is very complex, thats the reason it can not be valued only by an economical prism. The information demonstrates that the extraction production units are those which have the smaller economical performance, although, there is not a movement of the families in erase this system. In the opposite/ In despite of, the extraction type had not just being keeper, but had improved/razed representatively from 2000 to 2005, showing attraction of this type to the families in RESEX/CA. However, the agro extractive systems had grown also, showing that some families want to achieve a higher quality level of life trough agriculture. About a direct use of conservation unit, to this extractive reserve must be directed support action for small farmers nut to the RESEX/CA, with the purpose that them may have a decent life, without expending in different activitys but extraction. / Este trabalho aborda um tipo específico de extrativismo: o extrativismo da castanha-do-brasil realizado na Reserva Extrativista do rio Cajari no Estado do Amapá (RESEX/CA). O trabalho é uma continuidade de pesquisas realizadas no ano de 2000, e tem como foco principal compreender a dinâmica dos sistemas de produção praticados na RESEX/CA. Neste trabalho percebemos que as mudanças ocorridas nos sistemas de produção praticados na RESEX/CA de 2000 para 2005, evidenciam que além de fatores de ordem econômica, a permanência das práticas agrícolas com o extrativismo da castanha se rege por outros fatores. A relação histórica de uso da floresta com o extrativismo e as agriculturas é bem mais complexa, não podendo ser avaliada apenas do prisma econômico. Os dados demonstram que as unidades de produção extrativistas são aquelas de menor desempenho econômico, e, apesar disso, não há um movimento das famílias em acabar com esse sistema. Ao contrário, o tipo extrativista não apenas se manteve, mas aumentou de representatividade de 2000 para 2005, indicando atratividade deste tipo para as famílias da RESEX/CA. Entretanto, os sistemas agroextrativistas também cresceram, indicando que algumas famílias procuram alcançar melhores níveis de qualidade de vida, através da agricultura. Em se tratando de uma unidade de conservação de uso direto, para esta reserva extrativista deveria ser direcionada ações de apoio aos castanheiros da RESEX/CA, para que eles pudessem ter melhores condições de vida, sem ter que investir em outras atividades, que não o extrativismo.

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