Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas,Departamento de Biologia Celular, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-10-20T17:59:49Z No. of bitstreams: 1 2014_BrunaVidigaldosSantos.pdf: 21406285 bytes, checksum: ed3bc2e1ee793721bbd92e0962dcb8fc (MD5) / Approved for entry into archive by Tania Milca Carvalho Malheiros(tania@bce.unb.br) on 2014-10-20T18:13:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_BrunaVidigaldosSantos.pdf: 21406285 bytes, checksum: ed3bc2e1ee793721bbd92e0962dcb8fc (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-20T18:13:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_BrunaVidigaldosSantos.pdf: 21406285 bytes, checksum: ed3bc2e1ee793721bbd92e0962dcb8fc (MD5) / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é um alotetraploide com origem recente e cujogenoma tem aproximadamente 2,8 Gb, composto majoritariamente por sequências repetitivas.Este estudo relata uma investigação do componente repetitivo presente nas espécies parentaisdo amendoim, A. duranensis, provável doador do genoma A e A. ipaënsis, provável doador dogenoma B, por meio de análises das suas sequências genômicas completas, bem como declones selecionados da biblioteca BAC de A. duranensis. Nos clones, foram identificados dezretrotransposons LTR distintos, enquanto que nas sequências genômicas completas, 81famílias de retrotransposons LTR foram identificadas em A. duranensis e 89 em A. ipaënsis,ocupando aproximadamente 28,5% e 27,6% do genoma A e B, respectivamente. Dessasfamílias, 37 representam a maior parte do conteúdo repetitivo nos dois genomas, sendo que oselementos FIDEL e Feral são os mais frequentes. Esses resultados mostram que uma partesubstancial do componente altamente repetitivo desses genomas é explicada por um númerorelativamente pequeno de retrotransposons LTR, seus fragmentos e LTRs-solo. A maioria dasdatas de transposição estimadas para esses retrotransposons foi posterior a 3,5 milhões deanos atrás, data estimada da divergência dos genomas A e B, indicando que essesretrotransposons LTR tiveram um papel notável na organização desses genomas. Análises dehibridização in situ por fluorescência (FISH), utilizando sondas obtidas a partir dassequências dos genes que codificam a transcriptase reversa de cada família de retrotransposonLTR, mostraram sinais de hibridização detectáveis múltiplos e dispersos em vários, mas nãoem todos os cromossomos dos subgenomas A e B de amendoim, com marcaçãopredominantemente ao longo dos braços dos cromossomos. Comparações entre sequênciashomeólogas dos genomas A e B indicaram alta semelhança no conteúdo gênico, porémgrandes diferenças no conteúdo repetitivo, mostrando que os retrotransposons identificadosneste estudo, juntamente com outros elementos repetitivos têm desempenhado um papelimportante na remodelação do genoma ao longo da evolução, especialmente em regiõesintergênicas. A construção e validação de pools 3-D construídos para os clones das bibliotecasBAC representativas dos genomas A (A. duranensis) e B (A. ipaënsis) foram realizadas. Essaferramenta possibilitou a identificação e isolamento de genes de interesse em Arachis, tais como, expansina e dessaturase de ácidos graxos. __________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Peanut (Arachis hypogaea L.) is an allotetraploid of recent origin with a genome of about 2.8 Gb and high repetitive content. This study reports an analysis of the repetitive component present of the progenitor species from peanut, A. duranensis, likely donor of A genome and A. ipaënsis of B genome, using their whole genome sequences and selected clones from the BAC library of A. duranensis. Ten LTR retrotransposons were identified in these clones whilst 81 families in A. duranensis and 89 in A. ipaënsis complete genomes, representing about 28.5% of the A genome and 27.6% of B genome, respectively. Only 37 families represent most of the repetitive content of the two genomes, and the most abundant retrotransposon are FIDEL and Feral. It is here shown that a substantial proportion of the highly repetitive component of these genomes is accounted for by relatively few LTR retrotransposons, their fragments and solo-LTR. These retroelements are predominantly of recent evolutionary origin, most apparently post-dating the evolutionary estimated date of the A and B genomes divergence of the cultivated peanut, about 3.5 million years ago. This indicates that these LTR retrotransposons contributed to the divergence of these genomes. Analysis by fluorescence in situ hybridization using probes obtained from the genes sequencing codifying for the reverse transcriptase of each family of LTR retrotransposons of A and B genomes produced multiple and dispersed hybridization signals on several, but not all chromosomes of A-B peanut subgenomes, mainly along the chromosomes arms. Comparisons between homeologues sequences of A and B genomes showed high similarity in gene content, but differences in the repetitive content showing that the retrotransposons identified in this study, and another repetitive elements have played an important role in these genomes remodeling, especially in intergenic regions, over evolutionary time. The construction and validation of 3-D pools for clones of the A-B genomes BAC libraries were made. This tool allowed the identification and isolation of genes of interest in Arachis such as expansins and fatty acid desaturase.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-16T15:27:47Z No. of bitstreams: 1 2014_DanieleCristinaWondracekLudke.pdf: 81245787 bytes, checksum: 7db97591c73e9c039c598d308967b4e1 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-02-03T18:16:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_DanieleCristinaWondracekLudke.pdf: 81245787 bytes, checksum: 7db97591c73e9c039c598d308967b4e1 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-03T18:16:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_DanieleCristinaWondracekLudke.pdf: 81245787 bytes, checksum: 7db97591c73e9c039c598d308967b4e1 (MD5) / Neste estudo foram investigadas as relações de cruzabilidade de Arachis valida com as espécies que representam os genomas A, AB, B, D, F, G, K e com as espécies A. aff. hoehnei e A. vallsii da secção Arachis. Foram feitas 44 combinações de cruzamento entre os acessos K 30147 e V 13514 de A. valida e 28 espécies da secção Arachis. Foram feitas 1283 polinizações e obtidas 179 plantas híbridas em 37 combinações de cruzamento. Arachis valida formou híbridos com todos os genomas encontrados na secção Arachis, com exceção de A. glandulifera, que possui genoma D, sendo obtidos segmentos de frutos com embriões abortados. Arachis valida faz parte do grupo de espécies caracterizadas como possuidoras do genoma B, pois foram obtidos híbridos entre A. valida e todas as espécies possuidoras desse genoma: A. gregoryi, A. ipaënsis, A. magna e A. williamsii que pertencem ao mesmo pool gênico. A obtenção de híbridos entre A. valida (2n=2x=20) e A. hypogaea (2n=4x=40), confirma a premissa que para pertencer à secção Arachis a espécie deve cruzar com A. hypogaea. Foram obtidos híbridos com 2n=2x=19, a partir da combinação de cruzamento A. valida V 13514 (2n=2x=20) x A. praecox (2n=2x=18). Arachis valida formou híbridos com espécies possuidoras do genoma A e abre-se a possibilidade da criação de novos anfidiplóides sintéticos AABB. A menor viabilidade de pólen foi do híbrido de A. valida V 13514 x A. cardenasii G 10017 (genoma B x genoma A chiquitano) com 0,2% de viabilidade de pólen. A maior viabilidade de pólen foi do híbrido de A. valida V 13514 x A. valida V 15096 (genoma B x genoma B) com 98,4% de viabilidade de pólen. As porcentagens de viabilidade de pólen mais altas foram encontradas nos híbridos resultantes de cruzamentos entre espécies com genoma B indicando que essas espécies são mais próximas geneticamente. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this study the relationships of crossability of Arachis valida with species that represent A, AB, B, D, F, G and K genomes and A. aff. hoehnei and A. vallsii of Arachis section were investigated. Forty-four crossing combinations were made between K 30147 and V 13514 accessions of A. valida and 28 Arachis section species. One thousand two hundred eighty three pollinations were made and 179 hybrid plants were obtained in 37 crossing combinations. Arachis valida formed hybrids with all genomes found in the Arachis section, except A. glandulifera, which has the D genome. In this cross only segments of fruits with aborted embryos were obtained. Arachis valida is in the group of species characterized as B genome because hybrids between A. valida and all species with that genome were obtained: A. gregoryi, ipaënsis, A. magna and A. williamsii that belong to the same gene pool. The obtaining hybrids between A. valida (2n=2x=20) and A. hypogaea (2n=4x=40) confirms the premise that to belong to Arachis section, species must cross with A. hypogaea. Hybrids with 2n=2x=19 were obtained from the A. valida V 13514 (2n=2x=20) x A. praecox (2n=2x=18) crossing combination. Arachis valida formed hybrids with A genome species which opens the possibility of creation new synthetic amphidiploids, AABB. In the hybrids, the lowest pollen viability was A. valida V 13514 x A. cardenasii G 13514 10017 hybrid (B genome x A “chiquitano” genome) with 0.2% pollen viability. The highest pollen viability was A. valida V 13514 X A. valida V 15096 hybrid (BB genome) with 98.4% of pollen viability. The higher percentage of pollen viability was observed in the hybrids resulting from crosses between B genome species indicating that these species are genetically closely related.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-06-06T12:38:12Z No. of bitstreams: 1 2013_SuziHelenaSantana.pdf: 4768790 bytes, checksum: 36b4bd667df26f7931ae37ff8e587bf6 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-06T13:18:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_SuziHelenaSantana.pdf: 4768790 bytes, checksum: 36b4bd667df26f7931ae37ff8e587bf6 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-06T13:18:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_SuziHelenaSantana.pdf: 4768790 bytes, checksum: 36b4bd667df26f7931ae37ff8e587bf6 (MD5) / Com 80 espécies, Arachis é dividido em nove secções taxonômicas. Duas, Heteranthae, com seis espécies anuais do Nordeste do Brasil, Minas Gerais, Goiás e Tocantins, e Triseminatae, com uma espécie perene de Minas Gerais, Bahia e Pernambuco, são aqui tratadas. Espécies destas secções mostram potencial forrageiro e adaptações estratégicas para sobrevivência em solos pobres e sob seca periódica. Suas plântulas têm caracteres exclusivos para a família e úteis para a distinção das espécies. A análise de tipos e de informação da literatura indicou que a morfologia dos acessos listados sob A. sylvestris não corresponde à descrição original e ao material tipo deste táxon, exigindo sua descrição sob nova espécie. Concluiu-se que o tipo de A. sylvestris corresponde ao nome anterior A. pusilla e foi designado um tipo para a espécie distinta indevidamente identificada como A. sylvestris, e elaborada sua descrição formal. Devido à alta variação encontrada a campo, à publicação de novas espécies, à descoberta de novos caracteres diagnósticos e a dúvidas sobre a circunscrição de alguns táxons, foi necessário elaborar novas chaves para distinguir as espécies e complementar suas descrições. A morfologia de cada espécie e das respectivas plântulas foi analisada em detalhes, para elaboração de chaves para plântulas e plantas adultas. O estudo taxonômico e morfológico foi baseado na análise de tipos e exemplares adicionais disponíveis em herbários brasileiros (CEN, CGMS, EAC, HUEFS, MOSS, UFRN) e de outros países (P, K). Novas coletas foram realizadas em distintos ecossistemas do Nordeste e de Minas Gerais. Foram observadas populações a campo e plantas individuais cultivadas ex situ no Banco Ativo de Germoplasma de Espécies Silvestres de Arachis da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, com análise de cinco plântulas de cada acesso. O número de populações estudadas variou entre espécies, de uma a 27. Foram aplicados 23 descritores morfológicos para plântulas e 58 para plantas adultas. A ausência de cerdas em certas plantas é citada por primeira vez para A. giacomettii. Foi confirmada a concaulescência das gemas cotiledonares em todas as populações de A. pusilla e A. seridoënsis. Arachis pusilla mostrou a maior variação no estudo morfológico de plantas adultas. O maior número de espécies com endemismo potencial, e extremos morfológicos de outras espécies, foi encontrado no norte de Minas Gerais e sul da Bahia. As chaves, descrições e pranchas ilustrativas englobam sete espécies nativas, endêmicas do Brasil. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / With 80 species, Arachis has nine taxonomic sections. Two of them, Heteranthae, with six annual species from the Brazilian Northeast, Minas Gerais, Goiás and Tocantins states, and Triseminatae, with a perennial species from Pernambuco, Bahia and Minas Gerais, are treated here. Species of these sections show forage potential and strategic adaptations to thrive in poor soils, and under periodic drought. Their seedlings have features that are exclusive in the family and useful for distinction of species. Analysis of type materials and literature information lead to the conclusion that the accessions filed under A. sylvestris do not correspond to the original description and to the holotype of this taxon, requiring the description of a new species. In fact, the type of A. sylvestris corresponds to the previous name A. pusilla. So, a type has been designated for the distinct species incorrectely identified as A. sylvestris and its formal description was prepared. Due to morphological variation found in nature, to the publication of new species, to the finding of new characters, and to doubts on the circumscription of some taxa, providing new analytical keys and complementing descriptions became necessary. Morphology of each species and respective seedlings was analysed in detail, to prepare dichotomous keys for seedlings and adult plants, with expanded descriptions. The taxonomic and morphological study was based on the analysis of types and additional specimens available in Brazilian (CEN, CGMS, EAC, HUEFS, MOSS, UFRN) and foreign herbaria (P, K). New field collections were conducted over distinct ecosystems of the Northeast Region and Minas Gerais State. Field populations were observed, as well as individual plants cultivated ex situ in the Wild Arachis Genebank of Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, analyzing five seedlings/accession. The number of populations studied varied between species (1-27). Twenty three morphological descriptors were applied to seedlings and 58 to adult plants. Absence of bristles in some plants is cited for first time for A. giacomettii. Concaulescence of buds of cotyledonary branches was confirmed in all populations of A. pusilla and A. seridoënsis. In the morphological study of adult plants, A. pusilla has been the most variable species. The greatest number of potentially endemic species, and morphological extremes of other species, has been found in northern Minas Gerais and southern Bahia states. The keys, descriptions and illustrative plates cover seven native species, endemic to Brazil.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária. 2010. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-04-15T14:49:43Z No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoFurtadoSantos.pdf: 1034414 bytes, checksum: f186632bcc074dbdfed58cdead0f3ab1 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2011-05-13T13:43:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoFurtadoSantos.pdf: 1034414 bytes, checksum: f186632bcc074dbdfed58cdead0f3ab1 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-05-13T13:43:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoFurtadoSantos.pdf: 1034414 bytes, checksum: f186632bcc074dbdfed58cdead0f3ab1 (MD5) / O gênero Arachis possui 80 espécies descritas. A espécie cultivada comercialmente para a produção de grãos de amendoim (A. hypogaea) é dispersa e cultivada ao redor do mundo. Ferramentas genéticas e genômicas, como mapeamento genético e obtenção de populações de retrocruzamento, vêm sendo desenvolvidas visando auxiliar programas de melhoramento genético de amendoim, principalmente para introgressão de genes de resistência das espécies silvestres na espécie cultivada. Primeiramente um mapa genético de ligação foi construído em uma população F2 resultante do cruzamento entre A. hypogaea e um anfidiplóide sintético obtido do cruzamento de duas espécies silvestres diplóides, cujos cromossomos foram duplicados com colchicina (Runner IAC 886 – genoma AB x [A. duranensis – genoma A x A. ipaënsis – genoma B]c). Foram testados 636 marcadores microssatélites, dos quais 173 mostraram-se polimórficos. Desses 69% foram polimórficos para o genoma A e 31% polimórficos para o genoma B. Apenas 113 marcadores foram genotipados na população F2, dos quais apenas 6 desviaram da proporção 1:2:1 esperada (p<0,05). Os marcadores não distorcidos foram utilizados para definição dos grupos de ligação, usando o LOD mínimo de 4 e fração de recombinação máxima de 0,35. O mapa gerado apresentou 74 locos mapeados no genoma A, distribuídos em 10 grupos de ligação e com tamanho total de 868,6 cM. No genoma B, 23 locos foram mapeados em 6 grupos de ligação, com distância total de 387,6 cM. O mapa apresentou grupos de ligação com tamanhos que variaram de 8,7 cM a 135,9 cM e os 16 grupos totalizaram um comprimento total de mapa de 1256,2 cM. Linhagens de introgressão foram desenvolvidas por gerações de retrocruzamentos a partir do híbrido F1 (Runner IAC 886 x [A. duranensis x A. ipaënsis]c) e caracterizadas geneticamente com marcadores microssatélites selecionados do mapa genético desenvolvido. Na geração RC1 foram identificados 43 híbridos, e com o retrocruzamento desses com a cultivar Runner IAC 886, foram obtidos 38 híbridos na geração RC2. Para a caracterização genômica das linhagens de introgressão, foram utilizados 36 marcadores microssatélites, distribuídos em 11 grupos de ligação do mapa tetraplóide obtido. A análise de introgressão revelou que, na geração RC1, a porcentagem média dos segmentos genômicos heterozigotos foi de 41,96%. Na geração RC2, a porcentagem média diminuiu para 11,79%, variando entre 2,78% e 36,11% entre as 37 linhagens identificadas como híbridas. Observa-se, portanto, uma diminuição relativa entre as gerações de 71,9% do conteúdo genômico heterozigoto (doador). Nas gerações RC1 e RC2, foi observada, nos locos amostrados, a completa cobertura do genoma silvestre, distribuído no “background” da variedade elite Runner IAC 886. O desenvolvimento das linhagens de introgressão será de grande utilidade para o melhoramento da cultura, por possibilitar a descoberta, a localização e a avaliação de genes silvestres de interesse no background da variedade cultivada.A implementação de seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento poderá acelerar consideravelmente, além de tornar mais eficiente, o processo de introgressão desses genes silvestres no amendoim cultivado. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The genus Arachis has 80 described species. The commercially cultivated species for peanut grain production (A. hypogaea) is dispersed and cultivated throughout the world. Genetic and genomic tools, such as genetic mapping and backcross populations, have been developed to assist peanut breeding programs, especially for introgression of resistance genes from wild species into the cultivated species. Firstly a genetic linkage map was constructed in an F2 population resulting from a crossbetween A. hypogaea and a synthetic amphidiploid, obtained by crossing two wild diploid species whose chromosomes have been duplicated with colchicine (Runner IAC 886 - genome AB x [A. duranensis - genome A x A. ipaënsis - B genome]c). A total of 636 microsatellite markers were tested, of which 173 showed polymorphism, being 69% for A genome and 31.2% polymorphic for the B genome. Only 113 markers were genotyped in the F2 population, where only six deviated from the 1:2:1 expected proportion (p <0.05). Non-distorted markers were used to establish the linkage groups using a minimum LOD score of 4 and maximum recombination fraction value of 0.35. This map had 74 loci mapped in the genome A, distributed in 10 linkage groups and total size of 868.6 cM. In the B genome, 23 loci were mapped into six linkage groups, with total distance of 387.6 cM. The map showed linkage groups ranging in size from 8.7 cM to 135.9 cM and 16 groups with a total map length of 1256.2 cM. Introgression lines were developed by backcrosses of the F1 hybrid (Runner IAC 886 x [A. duranensis x A. ipaënsis]c) and genetically characterized with microsatellite markers selected from the genetic map obtained. In the BC1 generation 43 hybrids were identified, and with their backcross to the Runner IAC 886 cultivar, 38 hybrids were obtained in BC2 generation. For genetic characterization of the introgression lines, 36 microsatellite markers were used, distributed through 11 linkage groups from the tetraploid F2 map. Introgression analysis revealed that, in the BC1 generation, the mean percentage of heterozygous genomic segments was 41.96%. In RC2 generation, the mean percentage decreased to 11.79%, ranging from 2.78% to 36.11% among the 37 plants identified as hybrids. It was observed therefore a relative decrease of heterozygous (donor) genomic content between generations of 71.9%. In the BC1 and BC2 generations a complete coverage of the wild genome distributed in the background of the Runner IAC 886 elite variety was obtained. The use of microsatellite markers allowed the construction of a genetic map for the Arachis tetraploid genome through an interspecific population. The development of introgression lines will be very useful for crop breeding by enabling the discovery, location and evaluation of wild genes of interest in the cultivated variety background.The implementation of marker-assisted selection in breeding programswill accelerate considerably, and making more efficient, the process of introgression of wild genes into cultivated peanut.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-07-24T20:28:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danúbia Rita de Sá Leal.pdf: 3041554 bytes, checksum: fb42fec10e5dd01e384e93705c93adf5 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-27T21:29:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danúbia Rita de Sá Leal.pdf: 3041554 bytes, checksum: fb42fec10e5dd01e384e93705c93adf5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-27T21:29:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danúbia Rita de Sá Leal.pdf: 3041554 bytes, checksum: fb42fec10e5dd01e384e93705c93adf5 (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / O amendoim (Arachis hypogaea L.) está entre as cinco oleaginosas mais cultivadas no mundo e apresenta importância econômica, sobretudo para a indústria alimentícia, devido a seu alto teor de óleos e proteínas. Sua produtividade é negativamente afetada pela seca. Espécies silvestres do gênero Arachis apresentam ampla variabilidade genética em caracteres de interesse agronômico e são potenciais fontes de genes de resistência e adaptação a condições ambientais desfavoráveis. O presente trabalho objetivou caracterizar mecanismos fisiológicos, bioquímicos e genéticos de espécies de Arachis, em resposta à deficiência hídrica. Para a caracterização fisiológica, foram avaliados, em folhas, teor relativo de água (TRAf), trocas gasosas, extravasamento de eletrólitos (EL) e teores de aldeído malônico (MDA), de pigmentos fotossintéticos e de prolina, em plantas mantidas a 20%, 45% e 75% da capacidade de pote, por cinco dias. Foi possível constatar a sensibilidade de todos os parâmetros avaliados à deficiência hídrica em Arachis spp. pelas variações significativas dos resultados entre os níveis de hidratação impostos. O TRAf, o MDA e o EL não foram úteis como indicativos de tolerância. A análise conjunta dos dados de trocas gasosas e fluorescência da clorofila sugere limitações não estomáticas à fotossíntese, relacionadas negativamente ao aumento dos danos à integridade de membranas nas espécies analisadas, além de evidenciar susceptibilidade à seca em Arachis duranensis (Krapov. & W. C. Greg.). Valores superiores de condutância estomática e TRAf, sob déficit hídrico, sugerem a presença de mecanismo de aclimatação particular em Arachis triseminata (Krapov. & W. C. Greg.). O maior valor de prolina observado em A. hypogaea cv. Havana sugere mecanismos diferentes de ajuste osmótico entre essa cultivar e as espécies silvestres analisadas. Para a caracterização genética, fatores de transcrição (FT) foram identificados, classificados em famílias e putativamente relacionados à reposta ao déficit hídrico, por meio de análises in silico do proteoma teórico de A. duranensis e de Arachis ipaensis e de sequências de aminoácidos geradas a partir de dados preliminares de sequenciamento de RNA de A. hypogaea e Arachis stenosperma (Krapov. & W. C. Greg.) sob déficit hídrico. Foi observada conservação dos tipos e frequências de famílias de FT, indicando semelhanças de vias regulatórias entre essas espécies. As análises de ortologia de genes responsivos ao déficit hídrico de Arachis spp. e Arabidopsis indicaram a conservação de vias reguladas por FT nessas duas espécies. Adicionalmente, a modulação da expressão de oito genes que codificam FT diferiu nas espécies de Arachis analisadas sob déficit hídrico, sugerindo diferenças na regulação transcricional de genes de FT, o que pode gerar mecanismos diversificados de aclimatação a estresses abióticos. / Peanut (Arachis hypogaea L.) is among the five most cultivated oilseed crops in the world, and is economically important, particularly for food industry, due to its high content of oils and proteins. Its productivity is affected by drought. Wild Arachis species show a wide variability for agronomic traits, and are potential sources of genes for breeding to resistance and adaptation of plants to environmental stresses. The present work aimed at characterizing physiological, biochemical and genetic mechanisms of Arachis species in response to water deficit. For physiological characterization, the parameters evaluated were leaf relative water content (RWC), gas exchanges, electrolytic leakage (EL), and its content of malondialdehyde (MDA), photosynthetic pigments and proline, in plants maintained at 20%, 45% and 75% of pot capacity, for five days. All these parameters were impacted by water deficit. RWC, EL, and MDA measures were not useful as indicators of drought tolerance in Arachis spp. Results of gas exchanges and chlorophyll fluorescence pointed to non-stomatic photosynthesis limitation, negatively related to the increasing of membrane integrity damage, in all species analyzed, and evidenced drought susceptibility in Arachis duranensis Krapov. & W. C. Greg. Higher values of stomatic conductance and leaf RWC suggested a unique mechanism of adaptation to drought stress in Arachis triseminata Krapov. & W. C. Greg. The higher proline content in A. hypogaea cv. Havana pointed to a different mechanism of osmotic adjustment in this cultivar, in comparison to the wild species analyzed. For genetic characterization, transcription factors (TF) were identified, characterized, and putatively related to water deficit response through in silico analyses of the theoretical proteomes of A. duranensis and Arachis ipaensis Krapov. & W. C. Greg., and amino acid sequences generated from preliminary RNA sequencing data of A. hypogaea and Arachis stenosperma Krapov. & W. C. Greg., under drought stress. The observed conservation of types and frequencies of TF families indicated similarities of regulatory pathways between these species. Orthology analyses of drought-responsive genes revealed the conservation of TF regulatory pathways between Arachis spp. and Arabidopsis. Additionally, the expression modulation of eight TF genes differed between the Arachis species analyzed under drought stress, suggesting differences in the transcriptional regulation of TF genes, which might lead to diverse acclimatization mechanisms to abiotic stress.

Orientador: João Domingos Biagi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-21T17:50:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alves_DeniseGomes_M.pdf: 1921540 bytes, checksum: 2a2b6fbe175ff45f5c6575f7b8839b69 (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Devido aos graves problemas que o amendoim enfrenta, com relação ao desenvolvimento de fungos, e visto que o produto só pode ser exportado se obedecer os limites aceitáveis de aflatoxina, este trabalho teve por finalidade controlar o aparecimento do fungo Aspergil/us flavus, através do processo de secagem e a produção da aflatoxina durante o período de armazenamento. Os tratamentos utilizados para o projeto de pesquisa foram: secagem artificial- 1 nível de temperatura (400C), 2 fluxos de ar (12.5 e 25 m3 de ar! mino m2), 2 alturas de camada para secagem de camada estática (0,5 e i,o m), 1 altura de camada para secagem de camada em movimento (0,25 m), secagem natural e o armazenamento foi feito com 2 tipos de embalagem (sacos plásticos e sacos de aniagem).Foi utilizado o método de SOARES & RODRIGUEZ-AMAYA (1989) para a determinação"de aflatoxina e o método ASAE S410T para determinar a umidade. As amostras foram armazenadas em prateleiras durante oito meses e analisadas mensalmente com a determinação de umidade e quantidade de aflatoxina. Pela observação dos dados concluiu-se que: a secagem artificial foi mais eficiente que a secagem natural; o fluxo de ar maior toma o processo de secagem mais rápido; a embalagem de plástico mantém o produto mais úmido; os tratamentos que não apresentavam nível de aflatoxina antes do processo de secagem, mantiveram-se isentos de toxina durante o armazenamento, tanto nas embalagens de plástico, quanto nas de aniagem; nos tratamentos que apresentaram aflatoxina desde o processo de secagem, a embalagem não foi capaz de impedir a produção de aflatoxina; a secagem também não impediu a produção de aflatoxina; o produto armazenado em embalagem plástica sotTe menor influência do ambiente / Abstract: Due to the serious problems that the peanut meets because fungus growth and the product can only be exported if it follows the acceptable limits of aflatoxin. The objectives of this work were to analyse the influence of the drying process on the AspergiJ/us flavus L. appearing and the aflatoxin production during the storage period. The treatments utilized were: I level of temperature (400 C), 2 air flows (12,5 e 25 m3 of air/min.m2), 2 drying bed depths for static drying ( 0,5 e 1,0 m), 1 drying bed depths for continuous drying (0,25 m) and the storage was done with 2 types of package (plastic and burlap bags). There was utilized the SOARES & RODRIGUEZ-AMAYA's method (1989) to determinate the aflatoxin and the ASAE S41OT's method to determinate the moisture contento The samples were stored during eight months and the moisture content and aflatoxin quantity were analysed month1y. The results indicated that the artificial drying was more efficient than natural drying; the drying time was lower for the higher air flow, plastic package suffers less influence of the environrnent. The peanut that didn't present aflatoxin before the drying process, were kept ftee of toxin during the storage, for both plastic and burlap bags. For the treatments that presented aflatoxin before the drying process, neither drying nor package type prevented the aflatoxin production. It is important to dry peanut as soon as it is harvested to get a better quality product / Mestrado / Pre-Processamento de Produtos Agropecuarios / Mestre em Engenharia Agrícola

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:15:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo7538_1.pdf: 1045403 bytes, checksum: 13f1a6f7bcb2164ae06dbd7daa583249 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os cuidados no armazenamento de alimentos, como controle de umidade e temperatura, auxiliam na prevenção das doenças fúngicas nas sementes do amendoim. O desenvolvimento de fungos filamentosos em alimentos e rações pode resultar na produção de toxinas, conhecidas como micotoxinas, provocando resposta tóxica mesmo quando ingeridos em baixa concentração. A radiação ionizante pode ser utilizada como método preventivo de segurança alimentar, promovendo a inibição de brotamentos, retardo na maturação, redução da carga microbiana, eliminação de microorganismos patogênicos, esterilização, desinfecção em grãos, cereais, frutas e especiarias. Este trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos da radiação gama na composição nutricional e inibição do crescimento de Aspergillus aflatoxigênicos em amostras de amendoim. Foram coletadas amostras diretamente do produtor (Petrolândia-PE) e da Central de Abastecimento de PE (CEASA) e em seguida embaladas dentro/fora da vagem e submetidas à irradiação por bomba de cobalto-60 nas doses de 0, 6, 9, 12 e 15 kGy, em triplicatas. O material foi dividido em duas partes: a) para realizar a análise nutricional do material irradiado e não irradiado; e b) para a análise fúngica, antes e após a irradiação. Os resultados mostraram que as amostras originadas da CEASA-PE apresentaram as maiores taxas de contaminação, não apenas com amendoim não submetido à irradiação, como também para aquelas amostras submetidas às doses de 6, 9 e 12 kGy. A dose de 15 kGy foi a mais eficiente no controle do Aspergillus aflatoxigênicos, para ambas as procedências, conseguindo eliminar a ação dos fungos, independentemente dos tratamentos utilizados. Apenas uma amostra não irradiada, originada da CEASA-PE, apresentou produção positiva de aflatoxinas em meio LCA. Não ocorreram diferenças nos valores dos parâmetros nutricionais observados, com o aumento da dose de radiação a que as amostras foram submetidas. A irradiação mostrou-se um processo eficaz para conservação de amendoins, pois previne o crescimento de fungos, principalmente Aspergillus aflatoxigênicos, evitando também a presença da aflatoxina no alimento, tornando-o mais seguro para consumo, sem provocar alterações na composição nutricional do amendoim

Orientador: Maria de Fatima D. A. Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-13T22:57:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Suda_CeciliaNahomiKawagoe_M.pdf: 4685253 bytes, checksum: 96ffb5eb27aa8984992efabf3f6c7104 (MD5) Previous issue date: 1991 / Resumo: As sementes de E. heterophylla foram agrupadas em escuras, marrom-claras e brancas. Os 3 tipos de sementes, provenientes de frutos maduros, apresentam características morfológicas internas distintas entre si. As sementes escuras são morfologicamente perfeitas e germinam prontamente se colocadas em condições favoráveis à ocorrência da germinação. As sementes marrom-claras e brancas apresentam má-formação do embrião e do tecido de reserva, e praticamente não germinam. A frequência com que ocorrem as sementes escuras é elevada (cerca de 80%., no mínimo) . As sementes marrom-claras e brancas é de ocorrência extremamente rara (respectivamente cerca de 2%. e 10%., no máximo). A frequência com que ocorre cada um dos tipos de sementes não foi alterada drasticamente por diferentes épocas de coleta, nem pelo sombreamento e diferentes fotoperíodos a que foram submetidas as plantas parentais. A proporção de cada um dos tipos de sementes foi alterada quando os frutos imaturos foram examinados. Em frutos verdes a proporção de sementes escuras, marrom-claras e brancas foi de cerca de 40%, 30% e 30% respectivamente. Estes resultados sugerem que diferentes colorações da testa indicam diferentes fases de desenvolvimento da semente; e as sementes marrom-claras e brancas presentes nos frutos maduros correspondem às sementes que não se desenvolveram normalmente e não adquiriram a coloração escura. As sementes de E. heterophylla apresentam fotoblastismo positivo a 25 e a '30 GRAUS¿ C e são indiferentes à luz a 35 e a '40 GRAUS¿ C, quando recém-colhidas. Após estocagem à temperatura ambiente ou a '5 GRAUS¿ C, as sementes escuras tornam-se indiferentes à luz a ¿30 GRAUS¿ C a '25 GRAUS¿ C e permanecem fotoblásticas positivas mas o nível de germinação no escuro aumentou significativamente após 3 meses de estocagem a '5 GRAUS¿ C. A remoção do tegumento tornou a sementes fotoblásticas positivas de E. heterophylla indiferentes à luz. A fotorresposta a '25 GRAUS¿ C foi afetada pelo fotoperíodo e época, nos quais ocorreu o cultivo da planta parental, e pela idade da planta parental. O sombreamento da planta parental não afetou a fotorresposta, a '25 GRAUS¿ C, das sementes produzidas. O envolvimento do etileno endógeno na indução da germinação e pouco provável, uma vez que a produção deste gás foi detectado tardiamente, mais notadamente quando já havia ocorrido alguma germinação. O nitrato de prata promoveu a germinação de sementes de E. heterophylla, na luz, nas concentrações de 10 e 50 ppm assim como o perclorato de mercúrio na concentração de 0,25M. É provável que haja uma interação entre luz e etileno a ¿25 GRAUS¿ C e a '35 GRAUS¿ C. Possivelmente a '25 GRAUS¿ C o etileno inibe e a '35 GRAUS¿ C promove a germinação de sementes de E. heterophylla / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador : Jose Tadeu Jorge / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-17T22:50:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Benedetti_BeneditoCarlos_M.pdf: 3895123 bytes, checksum: 449536aed92d977c640e142c633c2dff (MD5) Previous issue date: 1987 / Mestrado / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador: Rouverson Pereira da Silva / Coorientador: Cristiano Zerbato / Banca: Carlos Eduardo Angeli Furlani / Banca: Murilo Aparecido Voltarelli / Resumo: A eficiência das operações agrícolas mecanizadas é um fator que afeta a qualidade das operações e tem grande influência nos custos de produção, sendo dependente dos formatos dos talhões e do planejamento das operações dos mesmos. Sendo assim, objetivou-se por meio deste trabalho avaliar os tempos e movimentos para ambas as etapas da colheita mecanizada de amendoim, arranquio e recolhimento, em quatro glebas no município de Jaboticabal, interior de São Paulo, com formatos de talhões distintos. Foram selecionados talhões nos formatos trapezoidal e paralelogramo e coletados os dados para realizar os cálculos das capacidades e eficiências operacionais de arranquio e recolhimento, sendo registrados os tempos de operação, manobras e problema para as etapas de arranquio e recolhimento, adicionando também o tempo de descarga para a operação de recolhimento. O delineamento experimental seguiu as premissas do Controle Estatístico de Processos, por meio do uso de cartas de controle de valores individuais, além de análise descritiva para cada indicador de qualidade. Os formatos dos talhões afetam as eficiências de tempos e movimentos na operação de colheita mecanizada do amendoim. Sob a óptica do Controle Estatístico de Processos, as eficiências de campo, gerencial e global no arranquio mecanizado do amendoim, apresentaram melhor qualidade no decorrer do processo para o talhão 4. Com exceção do talhão 1 (trapezoidal), os demais talhões retrataram valores aceitáveis para eficiência de cam... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The efficiency of mechanized agricultural operations is a factor that affects a quality of operations and has a great influence on the production costs, being dependent on the formats of the plots and the management of the operations of the same ones. Thus, this work aim to evaluate the times and movements in the peanuts mechanized harvesting, in four production fields in the municipality of Jaboticabal, SP, Brazil, with trapezoidal, parallelogram and rectangular formats. Were selected and collected data to perform operational capacities and efficiencies of the digging and harvesting operations, launching the operating, maneuvers and problem times for the digging and harvesting, also, adding the discharge time to a combine machine. The experimental design followed the premises of Statistical Process Control, using control charts of individual values, as well as descriptive analysis for each quality indicator. The formats of the plots affect how efficient of times and movements in the peanut mechanized harvesting operation. From the point of view of Statistical Process Control, the field, managerial and global efficiencies in peanut mechanization were better in the process for the field 4. With the exception of field 1, the remaining fields showed acceptable values for field efficiency at harvesting operation. / Mestre