Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-08-22T20:44:34Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO LAÍS BENTES DE ALMEIDA.pdf: 1329940 bytes, checksum: a81526a00244527556b74aba58812323 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T20:44:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO LAÍS BENTES DE ALMEIDA.pdf: 1329940 bytes, checksum: a81526a00244527556b74aba58812323 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Colletotrichum species of the genus are widely distributed in temperate, tropical and subtrotropicais regions and cause a disease known as anthracnose in numerous genres of host plants. It is common to find several Colletotrichum species pathogenic to the same host, as it is a species common cause disease symptoms in various host plants. The cultivation of chillies and peppers are often attacked by several species of Colletotrichum and registers high losses in economic output due to damage caused by the disease. Thus, the correct identification of the causative agent is essential for defining control strategies and integrated management, so that the development of an effective management strategy depends, among other factors, the understanding of the etiology of disease, genetic diversity and structure the population of the pathogen. In order to identify the species of Colletotrichum responsible for causing anthracnose in the Capsicum plant fruits in the State of Amazonas, this study analyzed 94 isolates from fruits pepper, pepper and fragrant murupi pepper. The identification was based on multilocus sequencing and analysis of partial regions of the ACT gene, CHS, GAPDH, HIS and GS and allowed the identification of seven different species of Colletotrichum associated with anthracnose lesions in fruits of Capsicum plants (C. scovillei C. truncatum, C. brevisporum, C. siamense, C. fruticola, C. theobromicola and C. gloeosporioides). It was possible to confirm the predominance of C. scovillei in the municipalities of Presidente Figueiredo and Rio Preto da Eva, C. siamense in the city of Manacapuru, C. brevisporum in Manacapuru and C. truncatum exclusively in the municipality of Iranduba. The pathogenic species of Colletotrichum are widespread in the State of Amazonas affecting the health of plantations and causing economic losses to producers, confirming the cosmopolitan distribution, low pathogenic specificity and high evolutionary potential of the species belonging to this genre. / Espécies do gênero Colletotrichum são amplamente distribuídas por regiões temperadas, tropicais e subtrotropicais e causam uma doença conhecida como antracnose em numerosos gêneros de plantas hospedeiras. É comum encontrar várias espécies de Colletotrichum patogênicas a um mesmo hospedeiro, assim como é comum uma mesma espécie causar sintomas da doença em diversas plantas hospedeiras. O cultivo de pimentões e pimentas é frequentemente atacado por várias espécies de Colletotrichum e registra altas perdas no rendimento econômico devido aos danos gerados pela doença. Assim, a correta identificação do agente causal é primordial para definir as estratégias de controle e manejo integrado, de modo que o desenvolvimento de uma estratégia de gestão eficaz depende, entre outros fatores, do conhecimento sobre a etiologia da doença, da diversidade genética e estrutura da população do patógeno. Com o intuito de identificar as espécies de Colletotrichum responsáveis por causar antracnose em frutos de plantas do gênero Capsicum no Estado do Amazonas, neste trabalho foram analisados 94 isolados obtidos de frutos de pimentão, pimenta cheirosa e pimenta murupi. A identificação foi realizada com base no sequenciamento e análise multilocus de regiões parciais dos genes ACT, CHS, GAPDH, HIS e GS e permitiu a identificação de sete diferentes espécies de Colletotrichum associadas à lesões de antracnose em frutos de plantas de Capsicum (C. scovillei, C. truncatum, C. brevisporum, C. siamense, C. fruticola, C. theobromicola e C. gloeosporioides). Foi possível verificar a predominância de C. scovillei nos municípios de Presidente Figueiredo e Rio Preto da Eva, C. siamense no município de Manacapuru, C. brevisporum em Manacapuru e C. truncatum exclusivamente no município de Iranduba. As espécies patogênicas de Colletotrichum encontram-se amplamente difundidas no Estado do Amazonas afetando a sanidade dos plantios e causando prejuízos econômicos aos produtores, confirmando a distribuição cosmopolita, baixa especificidade patogênica e alto potencial evolutivo das espécies pertencentes a esse gênero.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4084.pdf: 6015722 bytes, checksum: 35112ba46f0915602cf01b2a6f292699 (MD5) Previous issue date: 2011-12-19 / Universidade Federal de Minas Gerais / The Tephritidae includes approximately 4500 species described to date and many of these species make up the main genera of economic importance: Anastrepha, Bactrocera and Ceratitis. The genus Anastrepha is among the Tephritidae with greatest diversity in the Americas including 230 described species, among which some species with great economic importance because they represent important fruit pests. There is evidence that species in the fraterculus group have diverged recently, even having some cryptic species. Because of this, species in the fraterculus group are a great system for evolutionary studies. For evolutionary studies, it is necessary to evaluate the rates of molecular evolution and their role in identifying rates of gene flow and population differentiation, the construction of tree species and a possible separation for the species. Seeking a better understanding of the fraterculus group, we chose three species of this group, Anastrepha obliqua, A. fraterculus and A. sororcula as models for this study and five genes isolated from a cDNA library of reproductive tissues of Anastrepha. Several genes that are expressed in reproductive tissues have a higher divergence rate THAN those expressed in non-reproductive tissues, may thus give evidence of reproductive isolation. In this work, we found evidence of positive diversifying and positive selection for a couple of genes (CG11912 and CG10031), and high levels of polymorphism, although they failed to meet statistical significance for positive selection, in other genes here studied, such as ,Lcp65Ac and CG16712, whereas Df31 was more conserved. An analysis of molecular variance found that levels of genetic polymorphism are best explained by differences between species THAN between geographic regions. Haplotype networks for each gene failed to differentiate the species here studied and showed high levels of shared polymorphism among the species, with some rare exceptions. On the other hand, a joint analysis of these data to try to infer a species tree indicate a strong cohesion for populations of A. obliqua from the Brazilian Northeast and Southeast while for A. fraterculus and A. sororcula we observed a substructure that separated Southeeast populations of A. sororcula, which was well defined, from Northeast populations, which may be hybridizing with populations of A. fraterculus from the Northeast, due to great number of shared polymorphisms. Other THAN populations in the Brazilian northeast, A. fraterculus also forms a separate, though short, lineage. Considering these findings, a broader sampling is needed, especially in areas not yet collected particularly in the Northeast, seeking to untangle the phylogenetic relationships not only among these species, but also other species of the fraterculus group. / Os Tephritidae incluem aproximadamente 4500 espécies já descritas e muitas destas espécies compõem os principais gêneros de importância econômica: Anastrepha, Bactrocera e Ceratitis. O gênero Anastrepha é, entre Tephritidae, o que possui maior diversidade nas Américas incluindo 230 espécies descritas, dentre as quais algumas espécies apresentam grande importância econômica por representarem importantes pestes da fruticultura. Há evidências de espécies que constituem o grupo fraterculus terem divergido há pouco tempo apresentando ainda algumas espécies crípticas. Devido a esta característica em particular, espécies do grupo fraterculus apresentam uma grande vantagem para estudos evolutivos. Para realizar estudos evolutivos torna-se necessário avaliar as taxas de evolução molecular bem como seu papel na identificação de taxas de fluxo gênico e diferenciação populacional, a construção de árvores de espécie e uma possível separação das espécies. Buscando um melhor entendimento do grupo fraterculus, escolhemos três espécies constituintes desse grupo, Anastrepha obliqua, Anastrepha. fraterculus e Anastrepha. sororcula, como modelos para este estudo e cinco genes isolados de biblioteca de cDNA de tecidos reprodutivos de espécies de Anastrepha. Diversos genes que são expressos em tecidos reprodutivos apresentam uma taxa de divergência maior do que os expressos em tecidos não reprodutivos, podendo assim dar indícios de isolamento reprodutivo. Neste trabalho encontramos essas características em genes que indicam seleção positiva (CG11912 e CG10031), e os demais genes que embora não tenham apresentado significância estatística para serem considerados possuidores de seleção positiva, no entanto apresentam terem regiões potencialmente sob seleção positiva direcional para Df31 e Lcp65Ac e seleção positiva diversificadora para os genes Df31 e CG16712. Na análise de variância molecular encontramos que a diferenciação espacial é mais bem explicada pelas diferenças entre as espécies do que entre regiões geográficas. As redes haplotípicas e árvores de espécies indicam uma forte coesão entre as populações de A. obliqua do Nordeste e Sudeste indicando ausência de estruturação genética para esta espécie enquanto para A. fraterculus e A. sororcula foi encontrado uma sub estruturação que separa A. sororcula do Nordeste e A. sororcula do Sudeste, sendo que A. sororcula do nordeste pode estar hibridizando com A. fraterculus do Nordeste. As análises de migração encontraram migrações diferenciais para estas espécies, colocando A. obliqua mais isolada das demais e uma relação mais próxima entre A. fraterculus e A. sororcula. De frente aos resultados encontrados neste trabalho fica claro a necessidade de uma maior amostragem, principalmente em áreas ainda não coletadas entre as regiões amostradas na tentativa de buscar entender não apenas quais são as possíveis relações entre A. fraterculus e A. sororcula mas também entre outras espécies do grupo fraterculus.